合成生物学相关文章
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当前共找到 5053 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-05-22 |
Recurrent neural chemical reaction networks that approximate arbitrary dynamics
2026-May-20, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101572
PMID:42025162
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研究论文 | 提出一种名为“递归神经化学反应网络”（RNCRN）的模块化分子架构，用于逼近任意动力学行为 | 首次将递归人工神经网络的概念引入化学反应网络，并证明其可以系统训练以模拟任意动力学，且具有DNA链置换技术的实验可行性 | 需要足够多的化学神经元和快速反应才能实现精确逼近，且实际训练中只能使用少量神经元和中等反应速率范围 | 解决合成生物学和分子纳米技术中构建具有丰富动力学特性的新型化学系统的难题 | 递归神经化学反应网络的分子实现和动力学近似能力 | 机器学习 | NA | DNA链置换技术 | 递归神经网络 | NA | NA | DNA链置换技术 | NA | 递归神经化学反应网络（类似合成神经电路） | 合成生物学, 分子纳米技术 |
| 142 | 2026-05-22 |
Functional diversity, evolution, and translational potential of isoprenoids in eukaryotic membranes
2026-May-20, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.04.014
PMID:42161681
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综述 | 本文综述了真核生物膜中类异戊二烯的功能多样性、进化及合成生物学应用潜力 | 系统总结了类异戊二烯在真核生物膜中的结构多样性及其对膜流动性、稳定性、渗透性和组织性的调控作用，并探讨了合成生物学在相关化合物生产中的最新进展与挑战 | 合成生物学方法生产膜相关类异戊二烯仍存在产率低、调控复杂等限制 | 探讨类异戊二烯在真核生物膜中的进化、多样性及其在合成生物学中的应用前景 | 真核生物膜中的类异戊二烯及其衍生化合物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学相关技术 | 植物、真菌、动物 | 膜相关类异戊二烯的代谢通路设计 | 工业生物技术, 医学, 农业 |
| 143 | 2026-05-22 |
Xeno nucleic acids (XNAs): advances in synthesis, diagnostics, and therapeutics
2026-May-17, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2026.110000
PMID:42160832
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综述 | 全面综述异源核酸（XNA）的合成方法、结构特性及生物医学应用 | 系统归纳了XNA的化学修饰类型、合成策略及表征技术，强调其超越DNA/RNA的稳定性和功能多样性，并展望AI引导设计与合成生物学应用 | 当前面临的挑战包括可规模化合成、高效递送系统及完善的结构-功能关系理解 | 总结XNA在诊断和治疗领域的研究进展，推动精准医学和生物技术发展 | 异源核酸（XNA），包括锁核酸（LNA）、肽核酸（PNA）、己糖醇核酸（HNA）、氟阿拉伯糖核酸（FANA）和吗啉代寡聚体（MO） | 分子生物学、生物医学工程 | NA | 磷酰胺化学法、工程聚合酶酶法、热熔解分析、圆二色光谱、核磁共振、质谱、测序方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物技术 |
| 144 | 2026-05-22 |
PHYCUT: Scalable Multiplex CRISPR/Cas9 Editing for Genome Engineering in the Diatom Phaeodactylum tricornutum
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00843
PMID:41979903
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研究论文 | 开发了一种名为PHYCUT的多重CRISPR/Cas9编辑工具，用于硅藻基因工程，特别是减少免疫原性岩藻糖基化 | 首次在硅藻中实现基于质粒的多重CRISPR/Cas9编辑系统，利用Csy4核糖核酸酶处理多导向RNA阵列，可同时编辑多个基因 | 文章未明确讨论长期遗传稳定性或脱靶效应，且系统在非模式硅藻中的适用性尚未验证 | 解决硅藻多重基因组编辑效率低的问题，并实现人源化糖基化修饰以支持生物制药应用 | 三角褐指藻（Phaeodactylum tricornutum）及其α(1,3)-岩藻糖基转移酶基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, Csy4核糖核酸酶处理, 多重基因编辑 | NA | NA | 三个α(1,3)-岩藻糖基转移酶基因的编辑, 多个菌株获得低岩藻糖基化 | CRISPR-Cas9 | 三角褐指藻（Phaeodactylum tricornutum） | 多导向RNA阵列处理系统，基于Csy4核糖核酸酶 | 生物制药, 藻类生物技术 |
| 145 | 2026-05-22 |
Yeast MoClo Secretion and Surface Display Toolkit 2.0: Improvements and Applications for Analysis of protein-protein Interactions and Whole-Cell Biocatalysis
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00085
PMID:42025218
|
研究论文 | 介绍了酵母MoClo分泌和表面展示工具包2.0的改进及其在蛋白质相互作用分析和全细胞生物催化中的应用 | 通过添加基于截短Aga1的N端融合和Aga2的C端融合的锚蛋白新部件，以及GFP荧光互补检测和分泌增强蛋白部件，实现了高通量检测和表达优化 | 未提及具体局限性 | 改进和扩展酵母MoClo分泌和表面展示工具包，用于蛋白质相互作用分析和全细胞生物催化 | 酵母细胞、异源蛋白、抗GFP纳米抗体、PET降解酶、疏水蛋白1、MHETase | 合成生物学 | NA | 模块化克隆(MoClo)、流式细胞术、酵母免疫共沉淀 | NA | 蛋白质相互作用数据、酶活性数据 | NA | MoClo | 酿酒酵母 | 分泌和表面展示系统、荧光互补系统 | 工业生物技术、环境科学 |
| 146 | 2026-05-22 |
Systematic Evaluation of Different Ribonucleoprotein Complexes as Posttranscriptional Biosensors in Cell-Free TX-TL Systems
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00170
PMID:42086502
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研究论文 | 系统评估了三种不同核糖核蛋白复合物在无细胞转录翻译系统中作为转录后生物传感器的性能 | 首次系统比较了三种RNP电路（RISC、MS2-CNOT7和L7Ae）在不同无细胞平台（真核、原核和重组）中的表现，并展示了L7Ae电路在蛋白酶响应性病毒检测中的潜力 | IVT RNA基miRNA传感器中报告基因基线表达水平的可靠量化存在瓶颈；MS2-CNOT7电路在真核裂解液中受裂解液依赖性限制，降低了其可编程性 | 评估RNP复合物作为无细胞转录后生物传感器的可行性及平台通用性 | 三种核糖核蛋白电路（RISC、MS2-CNOT7和L7Ae）在不同无细胞转录翻译系统（真核、原核和重组）中的性能 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 转录后生物传感器电路（RISC、MS2-CNOT7和L7Ae） | 医学, 环境 |
| 147 | 2026-05-22 |
AHR: The Overlooked Mediator in SkincareBridging Environmental Sensing and Skin Physiology
2026-May-15, Environment & health (Washington, D.C.)
DOI:10.1021/envhealth.5c00424
PMID:42164887
|
综述 | 本文综述了芳香烃受体（AHR）在护肤品中作为环境传感与皮肤生理学桥梁的媒介作用，及其在化妆品生物活性物质效应中的新角色 | 挑战了AHR仅作为外源物传感器的传统观点，将其重新定义为整合环境与生物活性信号的转录因子，并探讨了AI驱动建模和合成生物学等新兴工具在AHR研究中的应用潜力 | 基于现有研究的综述性质，可能受限于已发表研究的范围；缺乏直接的实验验证；未详细讨论AHR激活的潜在副作用或个体差异 | 建立AHR在皮肤功能调节中的整合枢纽作用，并展望未来研究方向以制定更精准的护肤策略 | AHR及其在皮肤生理中的调控机制 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 148 | 2026-05-22 |
Stimulus-responsive engineered oncolytic bacteria
2026-May-14, Biomaterials
IF:12.8Q1
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综述 | 总结刺激响应性工程化溶瘤细菌的最新进展，重点介绍可编程基因回路的设计原则与性能权衡 | 系统整合了合成生物学工具与肿瘤微环境特征，构建了受外源触发或内源肿瘤信号调控的基因回路，实现治疗基因的时空精准控制 | 未涵盖临床转化中的安全性评估、免疫原性及长期毒性数据，缺乏对多种细菌平台横向比较 | 推动溶瘤细菌发展为可编程的活体治疗剂用于精准癌症治疗 | 刺激响应性工程化溶瘤细菌及其基因回路设计 | 合成生物学, 癌症治疗 | 肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 溶瘤细菌 | 刺激响应性基因回路（包括外源触发因子或内源肿瘤相关信号调控的遗传程序） | 医药 |
| 149 | 2026-05-22 |
Incorporation of Cryptic Plasmid Energetics Improves Genome-Scale Metabolic Predictions in Probiotic E. coli Nissle 1917
2026-May, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70361
PMID:42152457
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研究论文 | 本研究将隐性质粒能量代谢整合进益生菌大肠杆菌Nissle 1917的基因组规模代谢模型，以提高代谢预测的准确性 | 首次在基因组规模代谢模型中考虑隐性质粒相关的能量成本，并系统比较不同模型细化深度与预测性能之间的权衡 | 未详细说明模型在复杂体外或体内环境下验证的局限性，且依赖单一菌株和特定实验条件 | 提高益生菌大肠杆菌Nissle 1917代谢预测的定量可靠性和生理相关性，支持益生菌工程和合成生物学 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917（EcN）及其隐性质粒 | 机器学习 | NA | 代谢组学分析 | 基因组规模代谢模型（GEM）、可能性代谢通量分析 | 代谢组学数据 | 一种菌株（EcN）在模拟肠道培养基和厌氧条件下的代谢组学分析 | NA | 大肠杆菌（E. coli Nissle 1917） | 隐性质粒能量代谢模块 | 医学、生物技术、合成生物学 |
| 150 | 2026-05-22 |
Transforming a fragile protein helix into an ultrastable scaffold via a hierarchical AI and chemistry framework
2026-Apr-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.109753
PMID:41925723
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研究论文 | 提出一种结合AI引导设计与基础化学原理的分层框架，将脆弱的α-螺旋结构域转化为超稳定支架 | 首次将AI工具（如AlphaFold3）与化学原理（盐桥、金属配位）系统结合，实现多层级稳定化设计，使α-螺旋蛋白在热、机械和化学应力下具有前所未有的多轴稳定性 | 未说明 | 设计在同时热、机械和化学应力下保持结构完整性的蛋白质 | α-螺旋结构域 | 蛋白质工程 | NA | AI引导设计、分子动力学模拟 | AlphaFold3 | NA | 数百万个设计被筛选至最小候选集，具体样本量未说明 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 151 | 2026-05-22 |
Flavonoids in Medicine and Food Homology Substances: Structure-Activity Relationship, Application Challenges, and Cutting-Edge Technological Breakthroughs
2026-02-11, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15040658
PMID:41750850
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综述 | 本文综述了药食同源物质中黄酮类化合物的构效关系、应用挑战及前沿技术突破 | 整合人工智能、合成生物学和材料科学，提出黄酮类化合物在精准营养和个性化医疗中的应用方向 | 未具体探讨不同黄酮类化合物的定量比较及实际临床转化案例 | 为药食同源物质中黄酮类化合物的基础研究和应用开发提供参考 | 药食同源物质中的黄酮类化合物 | NA | NA | 超声/微波辅助提取、超临界CO2萃取、UHPLC-MS | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、食品 |
| 152 | 2026-05-22 |
Using transcription and translation regulators to improve recombinant protein expression in CHO cells
2025-Sep-18, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025160
PMID:40963405
|
综述 | 总结通过转录和翻译调控因子提高中国仓鼠卵巢（CHO）细胞中重组蛋白表达的策略 | 系统综述了转录因子和翻译调控因子在CHO细胞重组治疗蛋白生产中的应用，并提出了结合基因组学和合成生物学进展优化表达的新方法 | 未具体说明实验验证数据或量化不同策略的效果对比 | 提高CHO细胞中重组治疗蛋白的表达效率并降低生产成本 | CHO细胞中的转录因子和翻译调控因子 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法，基因组学 | NA | 综述文献 | NA | NA | CHO细胞 | NA | 医学 |
| 153 | 2026-05-22 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2024-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.30.630778
PMID:39803539
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研究论文 | 提出使用线性混合效应模型评估合成基因电路性能，并验证固定效应β作为布尔逻辑门行为的统计描述符 | 首次将线性混合效应模型系统应用于合成基因电路的统计分析，引入固定效应β作为量化布尔逻辑门性能的通用指标，并结合蒙特卡洛模拟推荐实验样本量 | 未提及 | 标准化合成基因电路性能评估的统计方法，建立可预测的布尔逻辑门性能指标 | 已发表的144个布尔逻辑门及设计的嵌套抑制子OR门 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型，无监督机器学习（k-means聚类），蒙特卡洛模拟 | 线性混合效应模型 | 基因表达数据 | 144个布尔逻辑门数据及模拟样本量 | NA | NA | 合成基因电路，布尔逻辑门（OR门等） | 计算、生物传感、人类健康 |
| 154 | 2026-05-22 |
Easy efficient HDR-based targeted knock-in in Saccharomyces cerevisiae genome using CRISPR-Cas9 system
2022-06, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2022.2162667
PMID:36602175
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研究论文 | 基于CRISPR-Cas9系统在酿酒酵母基因组中进行高效HDR导向的靶向敲入 | 优化方法实现了CRISPR-Cas9介导的染色体靶向整合，效率高达74%，且15 bp微同源臂在最小敲入构建体浓度下即可达到50%的靶向敲入率，全基因组测序无脱靶效应 | 未在文中明确提及 | 开发一种高效、特异的CRISPR-Cas9策略，用于酿酒酵母基因组中靶向染色体整合和异源基因的框内表达 | 酿酒酵母基因组中的外源基因靶向敲入 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 多个靶向位点，效率基于74%的整合率评估 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 靶向敲入框架用于外源基因的框内表达，基于同源依赖重组 | 工业生物技术，合成生物学 |
| 155 | 2026-05-22 |
New Set of Yeast Vectors for Shuttle Expression in Escherichia coli
2021-Mar-16, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.1c00339
PMID:33748631
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研究论文 | 该研究发现了酿酒酵母的GAL1/10双向启动子可用于大肠杆菌中的穿梭表达，并开发了一套用于原核和真核宿主间穿梭表达的Golden Gate组装载体 | 首次发现GAL1/10双向启动子在大肠杆菌中具有穿梭表达能力，并构建了适用于原核和真核宿主间快速表型分析的穿梭载体系统 | 未提及启动子在不同宿主间的表达效率差异及长期稳定性 | 开发具有广泛宿主特性的启动子以实现不同宿主间的遗传构建快速表型分析 | 酿酒酵母GAL1/10双向启动子及大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 高通量DNA测序, Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate组装 | 酿酒酵母, 大肠杆菌 | 穿梭表达载体系统 | 工业生物技术 |
| 156 | 2026-05-22 |
The amino acid alphabet and the architecture of the protein sequence-structure map. I. Binary alphabets
2014-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1003946
PMID:25473967
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研究论文 | 探索二元氨基酸字母表序列-结构映射的架构及势能函数相对力的影响 | 采用图论视角和简单精确蛋白质模型，系统分析势能中吸引、中性和排斥力的相对比例如何定义不同类型的势能，并揭示它们对序列-结构映射架构的差异化影响 | 基于简化精确模型及随机采样，可能无法完全捕捉天然蛋白质的复杂性；未涉及实际蛋白质动力学或进化过程中的动态因素 | 阐明势能函数相对力对蛋白质序列-结构映射架构的影响，并探讨其对天然蛋白质折叠码、随机肽库构建及早期字母表演化的启示 | 二元氨基酸字母表的潜在能量函数空间及简单精确蛋白质模型 | 生物信息学 | NA | NA | 简单精确模型（图论视角） | 模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、进化生物学 |
| 157 | 2026-05-21 |
Beyond tiny aquatic plants: how duckweeds serve the world as revolutionary crops for alleviating resource and energy crises
2026-Jul-01, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.149330
PMID:42048806
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review | 本文综述了浮萍作为革命性作物在缓解资源和能源危机方面的潜力与应用 | 全面分析了浮萍在替代蛋白、可持续生物燃料、合成生物学底盘和空间生命支持系统中的多样化应用，并进行了生命周期和技术经济评估 | NA | 评估浮萍在确保粮食安全、发展能源替代、促进生物制造和推动生态可持续性方面的核心优势与可行性 | 浮萍（水生植物） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 浮萍 | 合成生物学底盘 | 农业, 能源, 环境, 生物制造 |
| 158 | 2026-05-21 |
Hydrazinoacetic acid is a biosynthetic precursor of the bacterially produced nitramine, N-nitroglycine
2026-May-20, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00631-26
PMID:42159495
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研究论文 | 通过稳定同位素标记和生物信息学分析，揭示肼乙酸是细菌产生的硝胺类天然产物N-硝基甘氨酸的生物合成前体 | 首次阐明了细菌中硝胺类天然产物N-硝基甘氨酸的生物合成途径，发现肼乙酸是其关键前体，并通过同位素标记实验和基因簇分析验证了该途径 | 研究仅基于单一细菌菌株，且硝胺类化合物的生物合成路径在细菌中是否普遍存在尚不明确 | 阐明细菌中硝胺类天然产物N-硝基甘氨酸的生物合成机制 | 细菌、N-硝基甘氨酸、肼乙酸、赖氨酸、甘氨酸 | 合成生物学 | NA | 稳定同位素标记、液相色谱串联质谱、生物信息学分析、蛋白质组学 | NA | 质谱数据、基因组序列、晶体结构数据 | NA | NA | 细菌 | N-硝基甘氨酸生物合成途径（涉及肼乙酸作为前体的代谢通路） | 能源、材料、工业生物技术 |
| 159 | 2026-05-21 |
PlantGFM: A Genomic Foundation Model for Discovery and Creation of Plant Genes
2026-May-20, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75772
PMID:42160034
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research paper | 提出PlantGFM，一种基于Hyena算子的植物基因组基础模型，支持长上下文预测和序列生成，并成功设计出有转录活性的新植物基因 | 首次在植物中展示了大型语言模型生成序列的DNA-RNA-蛋白质表达，并实现从头设计具有转录活性的植物基因，包括NLR基因的生成 | NA | 开发人工智能驱动的植物基因发现和生成方法 | 植物基因序列 | 机器学习 | NA | NA | Hyena算子 | 基因组序列 | 从12个植物物种的108.4亿个核苷酸进行预训练，并在10个注释植物基因组上微调 | NA | 本氏烟草 | NA | 农业, 合成生物学 |
| 160 | 2026-05-19 |
Betacyanin biofortification in wheat via synthetic biology for nutritional enhancement
2026-May-06, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag266
PMID:42148553
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |