合成生物学相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
21 2026-03-21
Engineering and Evaluation of Sinorhizobium meliloti Nodulation (nod) Gene Reporter Systems in Rhizobia and Non-Rhizobia
2026-Mar, Environmental microbiology IF:4.3Q2
研究论文 本研究开发了基于Sinorhizobium meliloti nod基因的报告系统,用于筛选能表达nod基因的根瘤菌和非根瘤菌,以促进非豆科植物的生物固氮 开发了包含可诱导nod box启动子、植物信号依赖性激活因子和组成型标记的nod基因报告系统,首次实现在根瘤菌和非根瘤菌中高通量筛选能识别豆科植物信号分子的细菌 NA 增强非豆科植物的生物固氮能力,减少对合成肥料的依赖 根瘤菌和非根瘤菌微生物 合成生物学 NA 基因报告系统构建、体外和植物内诱导实验 NA NA NA CRISPR-Cas9, Gibson Assembly Sinorhizobium meliloti, 根瘤菌, 非根瘤菌 nod基因报告系统,包含PnodA启动子控制的超折叠GFP报告基因、nodD1和nodD2激活因子以及组成型mScarlet-I标记 农业, 环境
22 2026-03-20
Versatile 2-Oxoglutarate-Dependent Dioxygenases Catalyze Radical-Mediated Multifunctional Skeleton Reconstructions and Oxidation Modifications of Taxoids
2026-Mar-18, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1
研究论文 本文表征了两种新型2-氧戊二酸依赖性双加氧酶TcOGD1和TcOGD2,它们催化紫杉烷类化合物的骨架重构和氧化修饰,揭示了紫杉烷结构多样性的形成机制 首次报道了具有催化多功能性的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶,能够介导从6/8/6到5/7/6、-5/7/6和6/12框架的骨架重构,以及多种氧化修饰,通过自由基介导的C-C键断裂构建新骨架 NA 探索5/7/6紫杉烷类化合物的化学多样性和生物合成途径 紫杉烷二萜类化合物,特别是5/7/6框架的紫杉烷如taxuspine J NA NA 酶促反应、NMR光谱学、酶工程 NA NA NA 酶工程、合成生物学 NA NA 医药
23 2026-03-20
Repositioning the Leader Peptide in Graspetide Biosynthesis
2026-Mar-18, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1
研究论文 本研究通过重新定位前导肽序列在graspetide生物合成中的位置,探索了合成生物学中组合酶促修饰以创造新型核糖体合成与翻译后修饰肽(RiPPs)的策略 首次将fuscimiditide前体肽的前导序列从N端重新定位至C端,并证明graspetide合成酶ThfB仍能保持底物选择性修饰功能,同时实现了由两种不同家族酶(套索肽酶与graspetide酶)共同修饰的嵌合RiPP产物 前导序列重新定位后酶促修饰速率降低了约2倍,可能影响整体生物合成效率 开发合成生物学策略以扩展核糖体合成与翻译后修饰肽(RiPPs)的结构多样性,创造自然界不存在的新型机械互锁肽产物 graspetide生物合成途径中的前体肽(特别是fuscimiditide前体肽)及其修饰酶ThfB 合成生物学 NA 前导肽工程策略、酶促反应重构、嵌合肽合成 NA 生物化学实验数据 NA 前导肽序列重定位技术 NA 双前导序列引导的嵌合修饰系统(N端和C端各一个前导序列分别引导不同家族修饰酶) 工业生物技术
24 2026-03-20
Engineering smart bacteria for the next generation
2026-Mar-17, Cell reports. Medicine
综述 本文综述了智能细菌的理性设计进展,重点探讨了其在合成生物学中的时空精确传感与信号处理能力,以及作为诊断和治疗工具的临床应用潜力 通过整合复杂遗传电路,实现微生物对环境及疾病相关信号的高精度检测,推动了原位治疗递送和远程控制激活等创新应用 NA 总结智能细菌在遗传电路工程方面的最新进展,探索其跨疾病背景的临床应用,并讨论转化为下一代精准医学的关键挑战与未来方向 智能细菌(工程化微生物系统) 合成生物学 NA 遗传电路工程 NA NA NA CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM 细菌(如大肠杆菌等) 传感电路、信号处理电路、逻辑门、生物传感器、振荡器 医学
25 2026-03-20
Artificial intelligence revolutionizes cellular metabolic pathway reconstruction
2026-Mar-17, Trends in biochemical sciences IF:11.6Q1
综述 本文提出一个整合逆合成规划与生物约束的概念框架,以革新细胞代谢途径重建 通过结合逆合成规划和生物约束,实现个体与系统层面的建模,并利用大语言模型驱动代谢网络的理解、设计、评估和优化 NA 革新合成生物学中的细胞代谢途径重建方法 细胞代谢网络 合成生物学 NA 逆合成规划、大语言模型 大语言模型 代谢网络数据 NA NA NA 代谢途径重建 工业生物技术
26 2026-03-20
Exogenous biostimulants: mechanisms and innovations for enhancing seed germination and resilience under abiotic stress
2026-Mar-12, Journal of advanced research IF:11.4Q1
综述 本文综述了外源生物刺激剂在缓解非生物胁迫(如干旱、盐分和极端温度)对种子萌发抑制的生理生化机制,并探讨了利用纳米材料、植物激素、代谢物等外源物质增强种子耐受性的潜力与挑战 提出了一个整合合成生物学、可生物降解纳米材料和刺激响应型纳米递送系统的多学科策略路线图,旨在实现活性成分的靶向、按需释放,以跨越实验室研究与田间应用的鸿沟 从实验室成果到田间应用仍面临成本效益、环境安全性和作用周期短等重大障碍 增强种子在非生物胁迫下的萌发能力和恢复力,以应对气候变化对作物建植和粮食安全的威胁 种子萌发过程及其对干旱、盐分、极端温度等非生物胁迫的响应 NA NA NA NA NA NA 合成生物学 NA NA 农业
27 2026-03-19
Inter-species horizontal transfer of biosynthetic gene clusters: an evolutionary driver for chemical diversity in bacterial communities
2026-Mar-18, Essays in biochemistry IF:5.6Q1
综述 本文探讨了细菌间生物合成基因簇的水平转移机制及其对细菌群落化学多样性的进化驱动作用 挑战了传统以基因组为中心的次生代谢观点,提出模仿自然界模块化转移系统可为合成生物学提供可移植生物合成平台的设计灵感 未涉及具体实验验证数据,主要基于理论探讨和现有文献分析 研究生物合成基因簇在细菌种间水平转移的机制及其进化意义 细菌生物合成基因簇及其水平转移过程 合成生物学 NA NA NA 文献分析 NA NA 细菌 可移植生物合成平台 工业生物技术
28 2026-03-19
Nanoparticle-Based Membranes on Coacervates: From Interfacial Assembly to Biomimetic Applications
2026-Mar-18, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
综述 本文综述了基于纳米颗粒膜包覆的凝聚层体系,重点介绍了其界面组装机制、理化性质改善及在仿生应用中的潜力 系统归纳了纳米颗粒膜包覆凝聚层的三种主要组装驱动力(界面能驱动、静电作用主导、多机制协同),并阐明该技术如何突破无膜结构的动态不稳定性限制 当前纳米颗粒包覆凝聚层微滴的设计与调控仍存在局限性,如膜结构的精确动态控制与功能集成度有待提升 通过纳米颗粒膜包覆技术增强凝聚层的结构稳定性和功能可编程性,推动其在合成生物学和仿生材料领域的应用 由液-液相分离形成的凝聚层及其纳米颗粒包覆复合体系 合成生物学 NA 界面自组装技术、纳米颗粒包覆技术 NA NA NA NA NA 仿生功能模块(细胞代谢模拟、吞噬作用、运动性、信号转导) 材料, 工业生物技术
29 2026-03-19
Context-aware synthetic promoter design using neural networks enables rewiring of eukaryotic transcriptional networks
2026-Mar-17, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 本文提出了一种基于神经网络的上下文感知合成启动子设计框架,用于在酿酒酵母中重编程转录网络 开发了首个用于启动子-转录因子结合位点重组的神经网络工具,实现了无需实验表征的高效启动子工程 NA 通过合成启动子设计实现真核生物转录网络的重编程 酿酒酵母的启动子和转录因子结合位点 合成生物学 NA 人工神经网络 ANN 启动子序列数据 6,011个天然酵母启动子 NA 酿酒酵母 TetR和Mig1转录因子结合位点的启动子工程 工业生物技术
30 2026-03-19
Construct design for precise DNA insertion in plants
2026-Mar-17, Trends in plant science IF:17.3Q1
综述 本文深入综述了植物中构建体设计原则和靶向DNA插入(敲入)策略,为合成生物学、遗传学和作物改良提供实用指导 系统评估了当前敲入方法在短片段、大片段和多片段插入中的优缺点,并探讨了非植物先进技术在提高植物敲入效率和精度方面的潜力 NA 为促进敲入技术在作物遗传改良中的有效应用,减少脱靶效应 植物基因组中的DNA插入构建体设计 合成生物学 NA NA NA NA NA NA 植物 NA 农业
31 2026-03-19
Deep learning revolutionizes protein research: Advances in structure prediction, functional annotation, and engineered design
2026-Mar-14, Journal of biotechnology IF:4.1Q2
综述 本文综述了深度学习如何通过一个协同循环,从根本上改变了蛋白质研究,连接了结构预测、功能注释和理性设计 提出了一个统一的“预测-理解-创造”范式,将深度学习确立为蛋白质科学新时代的基石,将领域从描述性观察转变为有原则、可编程的生物分子功能工程 在数据稀缺性、模型可解释性和分布外泛化方面仍存在挑战 展示深度学习如何通过一个协同循环,连接蛋白质结构预测、功能注释和理性设计,从而加速药物开发和合成生物学领域的发现 蛋白质,特别是具有足够进化信息的单域、球状蛋白质 机器学习 NA 深度学习,生成式AI,逆折叠模型,冷冻电镜与AI集成 端到端深度学习模型(如AlphaFold2),多模态模型,生成式AI 3D坐标,序列数据,相互作用数据 NA NA NA NA 药物开发,合成生物学
32 2026-03-19
Biological reduction of Fenton sludge: Electron transfer mechanisms, regulatory strategies, and prospects
2026-Mar-13, Bioresource technology IF:9.7Q1
综述 本文综述了Fenton污泥生物还原中的电子转移机制、调控策略及未来展望,强调其在资源回收中的潜力 聚焦于电子转移网络框架的动态耦合机制,并详细阐述了调控策略如环境参数优化、基因工程和微生物电化学技术 NA 探讨Fenton污泥生物还原的资源回收策略及其电子转移机制 Fenton污泥及铁还原细菌 环境生物技术 NA 生物还原、基因工程、微生物电化学技术 NA NA NA 基因工程 铁还原细菌 NA 环境
33 2026-03-19
Friedelane-type oxidosqualene cyclases in friedelin production: Advances in biosynthesis, functional characterization, structure-function relationships, and engineering strategies
2026-Mar-09, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
综述 本文综述了friedelane型氧化鲨烯环化酶在friedelin生物合成中的研究进展,包括功能表征、结构-功能关系及工程策略 首次报道植物OSC的冷冻电镜结构,揭示了独特的“阳离子穿梭运行”机制,并整合多组学技术识别了18种friedelane型OSC酶 未明确提及具体实验数据或样本规模的限制,主要基于现有文献综述 探讨friedelin的生物合成、酶功能及工程化生产策略,以实现其可持续生物制造 friedelane型氧化鲨烯环化酶(OSCs)及friedelin生物合成途径 合成生物学 NA 多组学整合技术、冷冻电镜(cryo-EM)、代谢途径工程、蛋白质工程 NA NA NA 代谢途径工程、蛋白质工程、亚细胞区室化 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) friedelin生物合成途径的重建 医药、工业生物技术
34 2026-03-19
Improving the Skin-Conformability of Wearable Continuous Glucose Monitors With Synthetic Hydrogel Electrodes
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文介绍了一种通过合成生物电子策略开发的酶水凝胶电极(GelZymes),旨在克服传统酶电极的机械和界面限制,提升可穿戴连续血糖监测设备的皮肤贴合性 GelZymes提供了两个核心创新:一是采用单块可扩展的3D架构,统一了酶膜和电极,简化了制造过程并消除了界面不稳定性;二是实现了类似组织的粘弹性,结合了拉伸性和粘附性,这在刚性酶膜中很少能实现 NA 研究目的是开发一种改进的可穿戴连续血糖监测设备,通过合成生物电子策略提升其皮肤贴合性和生物电化学性能 研究对象是酶水凝胶电极(GelZymes),用于可穿戴生物传感器 生物电子学 糖尿病 合成生物电子策略、酶固定化技术 NA NA NA NA NA NA 医学
35 2026-03-18
p-Benzoyl-l-phenylalanine as a Multifunctional Noncanonical Amino Acid in Synthetic Biology: Photoprobing, Photocatalysis, and Structural Programming for Biocontainment
2026-Mar-16, Angewandte Chemie (International ed. in English)
综述 本文综述了对苯甲酰-L-苯丙氨酸(pBzF)作为一种多功能非经典氨基酸在合成生物学中的应用,涵盖光探针、光催化和结构编程等领域 确立pBzF作为一种多功能光化学和结构基元,用于构建具有非天然、光响应和催化功能的蛋白质 NA 探讨pBzF在合成生物学中的多功能应用,包括光化学、结构编程和生物控制 pBzF作为一种非经典氨基酸及其在蛋白质工程中的应用 合成生物学 NA 遗传编码、定向进化、光化学技术 NA NA NA NA NA NA 医学、工业生物技术
36 2026-03-18
RNA Aptamers and Epitranscriptomics: Charting Unexplored Territories in RNA Biology
2026-Mar-16, Molecular diagnosis & therapy IF:4.1Q1
perspective 本文探讨了RNA适配体与表观转录组学在RNA生物学中的交叉领域,聚焦于RNA修饰如何影响适配体折叠或结合,以及适配体如何用于检测或调控表观转录组状态 首次系统性地探索RNA适配体与表观转录组学之间的概念和机制重叠,提出其潜在融合作为创新前沿 这些领域之间的直接调控联系尚未完全阐明,需要未来研究进一步探索 激发RNA适配体和表观转录组学研究社区之间的讨论,并吸引对未来研究前沿的关注 RNA适配体(通过SELEX等方法体外选择的单链RNA寡核苷酸)和表观转录组修饰(如m6A、Ψ、m5C) RNA生物学 NA SELEX(系统进化配体指数富集)及相关方法 NA NA NA NA NA NA 诊断学、治疗学、分子传感、合成生物学、转录后调控、RNA基础治疗
37 2026-03-18
CRISPR-Cas9: Genome Engineering and Future Vaccine Applications
2026-Mar-16, Molecular biotechnology IF:2.4Q3
综述 本文综述了CRISPR-Cas9系统及其衍生平台在疫苗设计中的应用,探讨了其从基因治疗工具向疫苗学关键资产转变的潜力与挑战 系统性地将CRISPR-Cas9技术从传统基因编辑领域拓展到疫苗设计领域,提出了结合合成生物学实现精准、可编程疫苗的新范式 存在脱靶编辑风险、体内递送效率低以及转基因疫苗监管路径不明确等技术转化障碍 探讨CRISPR-Cas9技术在疫苗开发中的应用前景与挑战 CRISPR-Cas9系统及其衍生平台(碱基编辑、先导编辑、CRISPRi/a) 合成生物学 NA CRISPR-Cas9、碱基编辑、先导编辑、CRISPRi/a NA NA NA CRISPR-Cas9 NA NA 医学
38 2026-03-17
Microplastic biodegradation and environmental safety: From microbial mechanisms to engineered systems and circular bio-based implementation
2026-Mar-14, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
综述 本文综述了微塑料的生物降解机制,从微生物作用到工程系统,并探讨了其在循环生物基框架中的实施与环境安全性 对微塑料生物降解过程进行了机理整合分析,明确区分了表面改性、解聚、生物转化和完全矿化等不同阶段,并特别关注了环境安全考量与循环生物基回收框架的整合可行性 尽管酶工程和合成生物学在受控条件下显著提高了解聚效率,但规模化、法规遵从性和生态系统层面的风险评估仍是核心挑战 评估微塑料生物降解的微生物机制、工程系统及在循环生物基实施中的环境安全性 微塑料(小于5毫米的合成聚合物颗粒)及其生物降解过程 NA NA 微生物降解、酶降解、酶工程、合成生物学 NA NA NA 合成生物学 NA NA 环境
39 2026-03-17
Stability and Reactivity of Alternative Nucleobases in Concentrated Sulfuric Acid
2026-Mar-03, Molecules (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究评估了14种商业可得的替代核碱基在浓硫酸中的稳定性,以探索其在该溶剂中形成DNA类似聚合物的潜力 首次系统研究了替代核碱基在浓硫酸中的稳定性,并识别出多个稳定且可溶的候选碱基,为在极端酸性环境中设计遗传类似聚合物提供了新方向 研究仅限于实验室条件下的短期稳定性评估,未验证这些碱基在浓硫酸中实际形成聚合物或进行碱基配对的能力 探索在浓硫酸等极端酸性溶剂中稳定存在的替代核碱基,以支持DNA类似聚合物的设计 14种商业可得的替代核碱基 合成生物学 NA 核磁共振光谱(H和C NMR) NA 光谱数据 14种化合物,在98%和81%浓硫酸中孵育3周 NA NA NA 天体生物学、行星科学、合成生物学
40 2026-03-17
Application of Enzyme Engineering and Synthetic Biology for Modulated Transformation of Fructooligosaccharides (FOSs) to Elucidate the Catalytic Mechanism of Fructofuranosidases
2026-Mar-03, Foods (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究通过酶工程和合成生物学方法改造果呋喃糖苷酶,以提高果寡糖的转化效率并阐明其催化机制 构建了突变酶142P-242K,将果寡糖转化效率从29%提升至52%,并揭示了催化口袋修饰和底物亲和力变化是提高产量的主要因素 活性位点的疏水性和强氢键阻碍了从GF2合成nystose (GF3) 提高果寡糖的酶法生产效率和阐明果呋喃糖苷酶的催化机制 果呋喃糖苷酶突变体142P-242K及其催化产物果寡糖 合成生物学 NA 酶工程、合成生物学 NA NA NA NA NA NA 食品, 制药
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