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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-03-16 |
Decoding Cdk1 control: from mitotic thresholds to meiotic specificity
2026-Mar-12, Chromosome research : an international journal on the molecular, supramolecular and evolutionary aspects of chromosome biology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10577-026-09796-4
PMID:41817770
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综述 | 本文回顾了Cdk1在细胞周期控制中的定量与定性模型,并探讨了通过合成生物学和磷酸化蛋白质组学技术解码其调控逻辑的进展 | 整合了Shokat系统的Cdk1等位基因开发,结合化学遗传学和质谱技术,实现了对Cdk1活性的高时空分辨率控制与底物鉴定 | 研究主要基于芽殖酵母和裂殖酵母等单Cdk模型,可能无法完全反映多Cdk高等真核生物的复杂性 | 解析Cdk1在细胞周期调控中的定量与定性作用机制,并探讨其在有丝分裂和减数分裂中的特异性 | 真核细胞周期调控蛋白激酶Cdk1及其底物 | NA | NA | 化学遗传学、质谱分析、磷酸化蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 芽殖酵母、裂殖酵母 | NA | NA |
| 42 | 2026-03-16 |
Engineering chaperone/usher pathway pili for surface display: Structural constraints, design principles, and biotechnological potential
2026-Mar-10, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108865
PMID:41819295
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综述 | 本文综述了利用伴侣蛋白/分泌蛋白(CU)途径菌毛作为细菌表面展示平台的结构约束、设计原理及生物技术潜力 | 基于近年积累的原子级或近原子级分辨率结构信息,系统分析了CU菌毛展示的结构约束,重新诠释了先前的展示策略,提炼了通用的设计原则,并提出了实用的工程化方法 | NA | 评估并指导CU菌毛展示系统在合成生物学工具箱中的理性设计与应用 | 大肠杆菌、沙门氏菌和鼠疫耶尔森菌中结构特征明确的CU菌毛 | 合成生物学 | NA | 蛋白结构预测、高分辨率结构解析 | NA | 结构数据 | NA | NA | 革兰氏阴性细菌(如大肠杆菌、沙门氏菌、鼠疫耶尔森菌) | 细菌表面展示平台 | 生物技术、合成生物学 |
| 43 | 2026-03-16 |
Sustainable bioenergy manufacturing in plants
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101711
PMID:41517869
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综述 | 本文综述了如何通过合成生物学、基因组学、人工智能和化学等多学科融合,克服传统生物质转化的效率、成本和多功能性限制,以推动可持续生物能源制造,并以自发光植物为例进行了深入探讨 | 提出利用多学科融合(合成生物学、基因组学、AI、化学)革新生物能源生产,并重点介绍了基于真菌生物发光途径(FBP)的自发光植物这一前沿应用,其利用内源性代谢物咖啡酸实现可持续自主生物照明 | 作为一篇综述文章,未报告原始实验数据或具体技术细节,主要基于现有文献进行总结和展望 | 探讨如何通过多学科方法克服传统生物能源制造的局限性,推动可持续植物基能源生产的发展 | 生物能源制造过程、能源作物、生物精炼厂、自发光植物 | NA | NA | 基因组编辑、组学技术、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(可能用于基因组编辑,文中提及但未明确指定) | 植物(能源作物) | 真菌生物发光途径(FBP),利用内源性咖啡酸代谢物将光合作用能量转化为可见光发射的生物传感器/照明系统 | 能源, 环境 |
| 44 | 2026-03-16 |
Plant non-canonical peptides: From identification to mechanisms
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101739
PMID:41580897
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综述 | 本文全面概述了植物肽的分类、生物合成及其在调控多种生物过程中的功能机制,并系统总结了植物肽鉴定的历史发展与最新策略 | 系统总结了植物非经典肽的鉴定策略进展,并提出了整合高通量技术、功能基因组学和合成生物学以挖掘植物肽在作物改良中潜力的新方向 | 肽的发现和功能注释仍然面临挑战,现有技术尚未完全解析植物肽组的复杂性 | 阐明植物肽(特别是非经典肽)的鉴定方法、生物合成机制及其在植物生长、发育和抗逆中的调控功能 | 植物肽,包括经典肽、非经典肽和非核糖体肽 | 植物分子生物学 | NA | 肽组学、质谱分析、高通量技术、功能基因组学 | NA | 基因组数据、质谱数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | NA | 农业 |
| 45 | 2026-03-16 |
Editing and synthetic engineering of chloroplast genomes
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101783
PMID:41761616
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综述 | 本文综述了叶绿体基因组编辑与合成工程的最新进展,包括基因组最小化、高效编辑和代谢途径重设计 | 整合了叶绿体基因组最小化、精确编辑工具和代谢途径动态调控,为下一代叶绿体工程提供综合方法 | NA | 优化叶绿体功能,促进高价值化合物的从头生物合成和作物性状改良 | 植物和藻类的叶绿体 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、敲入、碱基替换、多重修饰 | NA | NA | NA | NA | 植物、藻类 | 代谢途径重设计 | 生物技术、农业 |
| 46 | 2026-03-16 |
Biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids and its evolution in plants
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101786
PMID:41776991
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综述 | 本文系统综述了植物中苄基异喹啉生物碱(BIAs)的生物合成途径、关键酶及其进化机制,并展望了未来研究方向 | 整合了BIAs生物合成途径的系统知识,并提出了通过多组学数据与合成生物学结合来可持续生产高价值BIAs的新策略 | 仍存在途径空白、酶的多功能性以及调控网络尚未完全阐明等挑战 | 阐明苄基异喹啉生物碱(BIAs)的生物合成途径及其在植物中的进化机制 | 苄基异喹啉生物碱(BIAs)及其生物合成途径与关键酶 | NA | NA | 多组学数据整合、蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、农业 |
| 47 | 2026-03-16 |
Pelecyphora chihuahuensis (Britton & Rose) D. Aquino & Dan. Sánchez: A Review on Its Taxonomy, Ecology and Conservation of an Endemic Mexican Cactus Species with Biotechnological Perspectives
2026-Mar-03, Biology
DOI:10.3390/biology15050413
PMID:41823840
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综述 | 本文综述了墨西哥特有仙人掌物种Pelecyphora chihuahuensis的分类学、生态学、保护现状及其生物技术应用前景 | 首次系统整合传统分类学与现代生物技术工具(如分子标记、NGS、CRISPR-Cas和合成生物学)来解决该特有仙人掌物种的保护问题 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,且对CRISPR-Cas和合成生物学在仙人掌保护中的具体应用仍处于讨论阶段 | 通过整合生物技术、生态学和分类学知识,促进该特有仙人掌物种及其相关濒危仙人掌的可持续管理和保护 | 墨西哥特有仙人掌物种Pelecyphora chihuahuensis | NA | NA | 分子标记、下一代测序(NGS)、基于GIS的物种分布模型、组织培养、低温保存 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 环境, 农业 |
| 48 | 2026-03-15 |
Recoding multiple rare codons enables the simultaneous incorporation of up to five distinct noncanonical amino acids
2026-Mar-13, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-026-02084-y
PMID:41826677
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研究论文 | 本文提出了一种多类型稀有密码子重编码策略,实现了在哺乳动物细胞中高效、多位点同时引入多种非经典氨基酸 | 通过系统评估和重新利用稀有密码子,并结合工程化的正交氨酰-tRNA合成酶/tRNA对,首次实现了在哺乳动物细胞中单个蛋白内同时引入多达五种不同非经典氨基酸 | NA | 扩展遗传密码,实现哺乳动物细胞中多位点、多类型非经典氨基酸的高效同时引入 | 非经典氨基酸、哺乳动物细胞、蛋白质 | 合成生物学 | NA | 稀有密码子重编码、正交氨酰-tRNA合成酶/tRNA对工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 多类型非经典氨基酸同时引入的翻译系统 | 生物医学, 合成生物学 |
| 49 | 2026-03-14 |
Chromosome-Level Genome Assembly of the Allotetraploid Gynostemma pentaphyllum Provides Novel Insights Into the Biosynthesis of Ginsenoside and Gypenoside LVI
2026-Mar-13, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70598
PMID:41821502
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研究论文 | 本研究通过组装绞股蓝染色体级别基因组,揭示了其皂苷类成分生物合成差异的机制,并鉴定了一个关键的双功能P450酶 | 首次组装了绞股蓝的染色体级别基因组,揭示了其异源四倍体起源,并鉴定了一个在绞股蓝和五加科植物中独立进化、具有双功能(C-12和C-2羟基化)的关键P450酶GpCYP88AB3 | NA | 阐明绞股蓝不同地理种群间达玛烷型人参皂苷和绞股蓝皂苷LVI积累差异的分子机制 | 绞股蓝(Gynostemma pentaphyllum),特别是来自遂宁(SN)和南宁(NN)的种群 | 基因组学与合成生物学 | NA | 染色体级别基因组组装、多组学分析(基因组、转录组、代谢组)、系统发育分析、染色体进化分析、体内外酶功能验证 | NA | 基因组序列数据、多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、合成生物学 |
| 50 | 2026-03-14 |
The disputed identity of Pseudomonas putida KT2440: when taxonomists rename your favorite microbe
2026-Mar-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03390-25
PMID:41589905
|
评论 | 本文讨论了假单胞菌KT2440菌株的分类学重命名问题,强调社区实践和历史连贯性应优先于不断变化的分类学正统 | 提出在微生物命名中,对于标志性菌株如KT2440,应基于社区共识和实际效用而非单纯系统发育分析来决定名称 | NA | 探讨微生物分类学重命名对科学社区和实践的负面影响,并倡导社区参与命名决策 | 假单胞菌KT2440菌株及其分类学身份 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 假单胞菌KT2440 | NA | 环境微生物学, 生物技术, 合成生物学 |
| 51 | 2026-03-14 |
Synthetic overlapping genes stabilize genetic systems
2026-Mar-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02725-25
PMID:41649272
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研究论文 | 本文提出了一种名为OAFI的新方法,用于创建合成重叠基因,以稳定基因系统并限制抗生素抗性基因的水平转移 | 开发了OAFI(重叠、交替框架插入)方法,通过将编码在交替框架中的“内部”基因插入“外部”基因的灵活区域,创建合成重叠基因对 | 未明确说明该方法在不同宿主或复杂基因系统中的普适性,也未讨论长期进化稳定性 | 开发一种创建合成重叠基因的方法,以稳定工程基因并限制抗生素抗性基因的水平转移 | 基因报告因子、细菌毒素和抗生素抗性基因 | 合成生物学 | NA | OAFI(重叠、交替框架插入)方法 | NA | NA | NA | OAFI | 细菌(未指定具体种类) | 合成重叠基因对,其中内部基因(如毒素)编码在抗生素抗性基因的交替阅读框架中 | 工业生物技术, 环境 |
| 52 | 2026-03-14 |
Overcoming hydrophobicity-driven aggregation: An integrated expression strategy enables high-yield soluble production of recalcitrant starch synthases in Escherichia coli
2026-Mar-10, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2026.106917
PMID:41819303
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研究论文 | 本研究开发了一种整合表达策略,用于提高疏水性淀粉合成酶在大肠杆菌中的可溶性表达产量 | 结合结构分析、MBP融合标签、优化诱导条件和密码子优化,系统性解决了疏水性酶的可溶性表达难题,并验证了该策略对多种不同来源淀粉合成酶的普适性 | 研究主要针对原核表达系统,未在真核宿主中验证;酶活性提升的具体分子机制有待进一步阐明 | 提高疏水性淀粉合成酶在大肠杆菌中的可溶性表达产量,以支持无细胞化学酶法淀粉合成 | 嗜热绿菌门细菌的淀粉合成酶(CtSS)及其他四种植物来源的淀粉生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白质异源表达、结构分析、MBP融合标签技术、密码子优化 | NA | 蛋白质序列与结构数据、酶活性数据 | 5种淀粉合成酶(CtSS、GmPGM、ZmAGP、OsSS、MeSS) | MBP融合表达系统 | 大肠杆菌 | 淀粉生物合成途径的异源表达优化 | 工业生物技术 |
| 53 | 2026-03-14 |
Post-translational modifications of silk proteins
2026-Mar-05, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d6cb00012f
PMID:41822872
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综述 | 本文综述了丝蛋白的翻译后修饰(PTMs)如何赋予其化学多样性,影响高级组装、水合和共价连接,并探讨了这些修饰对蛋白质结构稳定性和机械性能的贡献 | 整合了蛋白质组学、合成生物学和生物正交化学的最新进展,揭示了低丰度PTMs,并实现了可编程修饰以调控物理化学性质,为下一代蛋白质基材料的预测性设计提供了基础 | NA | 探讨丝蛋白的翻译后修饰及其在化学生物学和材料科学交叉界面中的应用,以设计新型蛋白质基材料 | 丝蛋白及其翻译后修饰,包括羟基化、糖基化、磷酸化和共价交联 | 材料科学 | NA | 蛋白质组学、合成生物学、生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 材料 |
| 54 | 2026-03-13 |
Adenosine Triphosphate-Producing Artificial Cells: Biomimetic Construction Strategies and Applications
2026-Mar-13, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500934
PMID:41773731
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综述 | 本文综述了ATP生产人工细胞的仿生构建策略及其应用,重点关注模型膜、质子泵和ATP酶的协同整合 | 系统整合了三种构建策略的最新进展,包括绕过膜蛋白组装挑战的直接封装完整细胞器或构建非经典系统,为从基础研究转向实际应用提供指导 | NA | 探索ATP生产人工细胞的构建策略及其在合成生物学、靶向药物递送、再生疗法和生物混合能量转换设备等工程应用中的潜力 | 人工细胞,特别是基于脂质体、聚合物体、融合液滴、油包水胶束和金属有机框架等自下而上模型构建的ATP生产系统 | 合成生物学 | NA | 自下而上构建策略,包括封装完整线粒体、类囊体或构建非经典系统如精氨酸降解途径 | NA | NA | NA | NA | NA | 模拟氧化/光合磷酸化以维持ATP合成的仿生能量转换系统,包括质子泵和ATP酶的级联能量转换 | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 工业生物技术 |
| 55 | 2026-03-13 |
Hybrid seed production: new paradigms and challenges in the twenty-first century
2026-Mar-11, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04959-3
PMID:41811507
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综述 | 本文综述了二十一世纪杂交种子生产的新范式与挑战,重点探讨了先进基因组学、人工智能育种与政策整合对可持续生产气候适应性杂交种子的影响 | 系统整合了CRISPR/Cas、基因组选择等现代基因组工具与人工智能/机器学习、表观遗传学等新兴技术,提出通过多领域协作解决杂交技术可扩展性与可及性瓶颈的创新框架 | 未提供具体作物的量化对比数据,对小型农户采纳障碍的解决方案探讨较为宏观,缺乏区域性政策差异的深度分析 | 探讨整合先进技术与政策以可持续生产气候适应性杂交种子的路径 | 杂交种子生产技术体系及其相关作物案例 | 农业生物技术 | NA | CRISPR/Cas, 标记辅助选择, 基因组选择, 人工智能/机器学习, 表观遗传学 | NA | 基因组数据, 表型数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物植物 | NA | 农业 |
| 56 | 2026-03-13 |
Exploring the chemical diversity of Dictyostelium secondary metabolites and their biological implications
2026-Mar-10, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04742-8
PMID:41805866
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综述 | 本文详细综述了盘基网柄菌次级代谢产物的化学多样性、生物合成途径、分离鉴定方法及其生物学功能与药理潜力 | 系统梳理了盘基网柄菌中罕见骨架的次级代谢产物(如聚酮、萜类、生物碱等),并展望了多组学技术与合成生物学结合在天然药物发现中的前沿应用 | NA | 探索盘基网柄菌次级代谢产物的化学多样性及其生物学与药理学意义 | 盘基网柄菌(Dictyostelium)产生的次级代谢产物 | NA | NA | 色谱分离技术、光谱学方法、化学合成、基因组挖掘、多组学技术 | NA | 化学结构数据、基因组数据、生物活性数据 | NA | 合成生物学 | 盘基网柄菌(Dictyostelium) | NA | 医药(天然药物发现) |
| 57 | 2026-03-13 |
Ornithine lipids and other acyloxyacyl amino lipids: the coming-of-age story of a group of non-canonical membrane lipids
2026-Mar-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13777-2
PMID:41794944
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综述 | 本文全面回顾了鸟氨酸脂及其他酰氧酰基氨基酸脂这类非典型膜脂的研究进展,包括其合成途径、调控条件、修饰方式及其在细菌应激抵抗和宿主互作中的作用 | 系统分析了鸟氨酸脂合成酶基因的分类分布,预测了具备合成能力的细菌,并探讨了其在合成生物学中的潜在应用 | NA | 综述鸟氨酸脂及其他酰氧酰基氨基酸脂的结构、合成、功能及其在合成生物学中的应用潜力 | 鸟氨酸脂及其他酰氧酰基氨基酸脂 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 58 | 2026-03-13 |
Microbial computing: Review and Perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108766
PMID:41317976
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综述 | 本文回顾了微生物计算领域的发展历程,概述了现有策略及其局限性,并提出了基于储层计算的新视角 | 引入了基于储层计算的自上而下新框架,利用生物系统固有的动态计算能力解决复杂任务 | 现有的自下而上策略仍不足以模拟细胞信号处理系统的计算复杂性 | 探讨微生物计算的发展策略与未来方向 | 微生物计算机(生物计算机) | 合成生物学 | NA | NA | 储层计算、模拟计算、神经形态架构 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌(E. coli)、酿酒酵母(S. cerevisiae)、枯草芽孢杆菌(B. subtilis)、哺乳动物细胞、植物 | 数字逻辑门、切换开关、振荡器、生物传感器、代谢通路 | 生物生产、生物修复、生物医学 |
| 59 | 2026-03-13 |
Microbial electrochemical synergy: A mechanistic framework for enhanced bioelectrochemical remediation of halogenated organic pollutant in soil-water matrices
2026-Mar-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.141415
PMID:41690271
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综述 | 本文提出了一个名为“微生物电化学协同作用”的概念框架,用于系统解析生物电化学系统在土壤-水基质中修复卤代有机污染物的性能,并探讨了通过整合机器学习、多组学和合成生物学工具来设计和调控下一代BES技术的潜力 | 提出了一个整合性的“微生物电化学协同作用”机制框架,该框架从电子流效率、功能微生物生态位分配和界面微环境特征三个维度系统解析BES性能,并首次倡导协同利用机器学习、多组学和合成生物学工具进行理性设计 | 本文是一篇综述,未提供具体的实验数据或案例验证所提框架的有效性 | 旨在通过提出一个整合性机制框架,提升基于生物电化学系统的卤代有机污染物修复策略的可扩展性和可持续性 | 生物电化学系统及其在土壤-水基质中修复卤代有机污染物的应用 | 环境生物技术 | NA | 机器学习, 多组学, 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 60 | 2026-03-13 |
A Scaffoldomics Platform for Modular In Vivo Enzyme Colocalisation and Its Application to Naringenin Biosynthesis
2026-Mar, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70328
PMID:41814496
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研究论文 | 本文开发了一个名为'支架组学'的平台,用于在体内模块化地共定位酶,并将其应用于柚皮素的生物合成 | 开发了一个通用的合成框架(支架组学平台),能够组合式地将生物合成途径的酶组装到蛋白质支架上,形成多样的多酶复合体,并通过整合染色体编码的生物传感器实现实时检测和途径评估 | NA | 提高微生物细胞工厂生产精细化学品的产量,通过酶共定位策略增强代谢效率 | 柚皮素(一种关键的类黄酮中间体)的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 体内酶共定位、组合式支架组装、染色体编码生物传感器 | NA | NA | NA | 合成支架、染色体编码生物传感器 | 大肠杆菌 | 多酶复合体组装系统(最多可将四种途径酶组装到蛋白质支架上),用于柚皮素生物合成的代谢途径 | 工业生物技术 |