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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-03-23 |
Next-generation strategies for PLA degradation: microbial consortia, metagenomics, enzyme engineering and AI-guided approaches
2026-Mar-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04726-8
PMID:41863619
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综述 | 本文综述了增强聚乳酸(PLA)生物降解的微生物和生物技术策略的最新进展,包括微生物群落筛选、宏基因组学、酶工程和人工智能引导方法 | 强调了将生态筛选与计算酶工程相结合的多学科策略,特别是利用人工智能进行结构预测和机器学习平台设计高性能PLA降解酶 | NA | 加速聚乳酸在工业堆肥、废水处理和生物修复中的降解,推动可持续的PLA废物管理 | 聚乳酸(PLA)及其在各种生态系统中的生物降解过程 | NA | NA | 宏基因组学、环境DNA(eDNA)工具、定向进化、人工智能(AI)结构预测、机器学习 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 62 | 2026-03-23 |
CRISPR-enhanced microalgae biosynthesis: a promising approach for future functional feed ingredients
2026-Mar-20, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-026-01367-1
PMID:41857689
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综述 | 本文综述了利用CRISPR系统增强微藻生物合成以生产功能性饲料成分的当前应用、构建策略及未来展望 | 重点探讨了基于CRISPR的基因组编辑技术在优化微藻营养特性方面的突破性进展 | NA | 通过合成生物学策略提升微藻细胞工厂的生产力,以满足日益增长的功能性饲料原料市场需求 | 微藻及其合成的高价值生物活性化合物(如优质蛋白质、多不饱和脂肪酸、色素和维生素) | 合成生物学 | NA | CRISPR系统、基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微藻 | 微藻细胞工厂中的关键通路节点优化 | 农业, 食品 |
| 63 | 2026-03-23 |
Repositioning the Leader Peptide in Graspetide Biosynthesis
2026-Mar-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c21135
PMID:41789461
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研究论文 | 本研究通过重新定位前导肽序列在graspetide生物合成中的位置,探索了合成生物学中组合酶法生成非天然产物的策略 | 通过将前导肽序列从N端重新定位到C端,保留了graspetide合成酶ThfB的底物选择性修饰能力,并实现了两种不同家族酶(套索肽和graspetide)对嵌合RiPP产物的共同修饰 | 前导肽重新定位后,酶修饰速率降低了约2倍,可能影响合成效率 | 旨在通过工程化前导肽序列,扩展核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs)的结构多样性,生成自然界中未见的机械互锁肽产物 | 以fuscimiditide前体肽为研究对象,聚焦其前导肽序列的重新定位及其对graspetide合成酶ThfB功能的影响 | 合成生物学 | NA | 酶法重组、前导肽工程、翻译后修饰分析 | NA | 生化实验数据 | NA | 前导肽工程策略 | NA | 通过重新定位前导肽序列,设计嵌合RiPP生物合成途径,实现套索肽和graspetide家族酶的共同修饰 | 工业生物技术 |
| 64 | 2026-03-23 |
A review on microbial lipids conversion from organic wastes: Adaptive laboratory evolution-driven strategies for enhanced biofuel precursor synthesis
2026-Mar-18, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.124312
PMID:41856232
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综述 | 本文综述了利用适应性实验室进化(ALE)技术驱动策略,将有机废物转化为微生物油脂以增强生物燃料前体合成的研究。 | 提出了将ALE技术与合成生物学、精准代谢工程、基因组编辑和机器学习相结合的新型整合策略,以拓展ALE技术在有机废物资源化利用中的应用边界。 | NA | 探讨如何利用ALE技术增强产油微生物对复杂发酵液中抑制成分的耐受性,从而提高从有机废物到微生物油脂的生物转化效率。 | 产油微生物及其在有机废物(发酵液)资源化转化过程中的适应性进化。 | NA | NA | 适应性实验室进化(ALE),合成生物学,精准代谢工程,基因组编辑,机器学习 | NA | NA | NA | NA | 产油微生物 | NA | 能源,环境 |
| 65 | 2026-03-23 |
Microplastic biodegradation and environmental safety: From microbial mechanisms to engineered systems and circular bio-based implementation
2026-Mar-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120016
PMID:41833249
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综述 | 本文综述了微塑料生物降解的微生物机制、工程系统及环境安全,并探讨了其在循环生物基实施中的可行性 | 对微塑料生物降解过程进行了机制整合分析,明确区分了表面改性、解聚、生物转化和完全矿化,并重点关注了环境安全考虑和循环生物基回收框架的整合 | 可控条件下解聚效率虽已提升,但规模化、法规遵从性及生态系统层面的风险评估仍是核心挑战 | 评估微塑料生物降解策略的环境安全性与循环生物基实施的可行性 | 微塑料(合成聚合物颗粒,尺寸小于5毫米) | 环境生物技术 | NA | 微生物降解、酶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 66 | 2026-03-22 |
Precision modulation of the gut microbiota-immune axis by natural products: a structure-activity relationship perspective in cancer immunotherapy
2026-Mar-20, Journal of Asian natural products research
IF:1.3Q3
DOI:10.1080/10286020.2026.2644307
PMID:41860786
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综述 | 本文从构效关系视角综述了天然产物如何通过精确调控肠道菌群-免疫轴来增强癌症免疫治疗效果 | 首次从多糖、萜类、多酚和生物碱等天然产物的特定结构决定簇出发,系统解构其如何驱动特定的微生物重塑和免疫调节结果,并提出未来结合人工智能多组学和合成生物学进行理性设计 | NA | 探讨天然产物通过调控肠道菌群-免疫轴来克服癌症免疫治疗耐药性的机制与策略 | 天然产物(多糖、萜类、多酚、生物碱)及其对肠道微生物群和宿主免疫系统的影响 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 67 | 2026-03-22 |
Advances in synthetic biology for engineering methylotrophic microbial cell factories
2026-Mar-19, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00383-25
PMID:41665342
|
综述 | 本文综述了合成生物学在工程化甲基营养型微生物细胞工厂方面的最新进展,包括构建高效甲醇利用途径、优化氧化效率和氧化还原平衡等策略 | 总结了通过合成生物学和代谢工程策略提升甲醇同化效率的创新方法,如工程化甲醇脱氢酶和优化辅因子利用 | NA | 促进工业甲醇利用和可持续发展,通过理性设计高性能微生物平台 | 甲基营养型微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、适应性实验室进化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌、哺乳动物细胞、植物 | 切换开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术、环境、能源 |
| 68 | 2026-03-21 |
Engineered E. coli Nissle 1917 Depletes Branched-Chain Amino Acids to Suppress Colorectal Tumorigenesis
2026-Mar-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00804
PMID:41712535
|
研究论文 | 本文通过工程化改造大肠杆菌Nissle 1917菌株,消耗肠道中的支链氨基酸,从而抑制结直肠癌的发生和发展 | 利用合成生物学方法改造益生菌,靶向支链氨基酸代谢,为癌症治疗提供了一种新的策略 | 研究基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证,且具体机制仍需进一步探索 | 探究工程化益生菌通过消耗支链氨基酸来抑制结直肠肿瘤发生的效果 | 结直肠癌小鼠模型及工程化大肠杆菌Nissle 1917菌株 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 工程化菌株构建、AOM/DSS诱导的CRC小鼠模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 基因工程 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 支链氨基酸降解或转运途径的工程化改造 | 医学 |
| 69 | 2026-03-21 |
Metabolic Engineering and Synthetic Biology-Driven Strategies to Harness Microbial Production of Adipic Acid: Current Status and Future Direction
2026-Mar-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00869
PMID:41790735
|
综述 | 本文综述了利用代谢工程和合成生物学策略驱动微生物生产己二酸的现状与未来方向 | 系统梳理了己二酸生物合成的当前进展,重点讨论了提高细胞工厂转化效率的先进代谢工程策略与工具,并识别了关键挑战与知识缺口 | 工业上可行的己二酸生物合成技术仍受限于原料利用不完全、菌株转化效率低、发酵过程复杂及下游分离成本高等挑战 | 开发可持续的己二酸生物合成技术,以应对市场需求增长及传统生产带来的环境问题 | 己二酸的生物合成途径、代谢工程策略、细胞工厂构建及发酵与下游分离技术 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成途径 | 工业生物技术, 材料 |
| 70 | 2026-03-21 |
Research Progress and Prospects of Open-Chain Flavonoid Biosynthesis
2026-Mar-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00926
PMID:41810537
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综述 | 本文综述了开链黄酮类化合物的结构特征、生物合成途径、代谢工程及微生物生产策略的研究进展与前景 | 系统总结了开链黄酮类化合物这一结构独特亚类的最新研究进展,并整合了代谢组学、结构酶学和合成生物学等多学科交叉成果 | NA | 阐明开链黄酮类化合物的生物合成逻辑、催化机制及调控特征,并展望其未来研究与生物技术应用 | 开链黄酮类化合物及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢组学、结构酶学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、生物技术 |
| 71 | 2026-03-21 |
Refactoring two-component systems for tunable gene expression regulation and upgraded bacterial sensing
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101504
PMID:41653915
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研究论文 | 本文通过重构双组分系统(TCSs),系统性地探索了响应调节器(RR)和组氨酸激酶(HK)作为浓度依赖性激活剂和抑制剂的功能特性,以优化基因表达调控和细菌传感性能 | 通过解耦HK表达与原生反馈回路,设计了具有可调检测阈值的超灵敏TCS传感器;利用RR作为转导器,结合单组分系统(OCS)和TCS创建了具有低检测限和高动态范围的协同传感系统(SSS);并证明RR可作为生物低噪声放大器(LNA),显著提升多种基因编码生物传感器的性能 | 未明确提及具体限制,但暗示TCS的可编程性先前未充分探索,可能限制了合成生物学中的广泛应用 | 探索TCS的可塑性和可编程性,以定制合成电路中的基因表达调控,并提供生物传感器优化的模块化工具包 | 双组分系统(TCSs),包括响应调节器(RR)和组氨酸激酶(HK),以及单组分系统(OCS) | 合成生物学 | NA | 基因工程、生物传感技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌(如大肠杆菌) | 双组分系统传感器、协同传感系统(SSS)、生物低噪声放大器(LNA) | 工业生物技术、环境监测 |
| 72 | 2026-03-21 |
Functional organization and regulatory logic of the ped gene cluster in Pseudomonas species
2026-Mar-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00046-26
PMID:41705821
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综述 | 本文综述了假单胞菌属中ped基因簇的功能组织、酶学功能和多层次调控机制,重点以恶臭假单胞菌KT2440和铜绿假单胞菌PAO1为例 | 整合了ped基因簇的功能与调控特征,提出了将其作为应用微生物学模块化平台的参考框架,并通过跨属比较揭示了基因簇的保守性与适应性差异 | 部分开放阅读框(如PP_2683、PP_2684、PP_2685)功能尚未明确,调控网络细节仍需进一步机制研究验证 | 阐明假单胞菌属中ped基因簇的遗传组织、酶学功能及调控逻辑,为酒精氧化研究提供基础 | 假单胞菌属(重点为恶臭假单胞菌KT2440和铜绿假单胞菌PAO1)的ped基因簇及其编码的PQQ依赖性脱氢酶 | 合成生物学 | NA | 比较基因组分析 | NA | 基因组数据与文献资料 | 假单胞菌属多个物种(以KT2440和PAO1为代表) | NA | Pseudomonas species(包括P. putida KT2440和P. aeruginosa PAO1) | 酒精氧化代谢通路(含PQQ依赖性脱氢酶、电子传递链及调控组件如YiaY脱氢酶和PP_2683组氨酸激酶) | 环境微生物学, 生物修复, 生物生产, 工业生物技术 |
| 73 | 2026-03-21 |
Biofilm engineering through c-di-GMP tuning boosts bioleaching efficiency and arsenic tolerance in Acidithiobacillus ferrooxidans
2026-Mar-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.02288-25
PMID:41705824
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研究论文 | 通过调控Acidithiobacillus ferrooxidans中的c-di-GMP信号增强生物膜形成、生物浸出效率和砷耐受性 | 通过靶向调控全局调控分子c-di-GMP,同时提升生物浸出效率和重金属抗性,克服了传统基因工程单次仅修饰单一性状的限制 | NA | 提高生物浸出效率和砷耐受性,以促进可持续金属生产 | Acidithiobacillus ferrooxidans(一种模型生物浸出微生物) | 合成生物学 | NA | 基因工程、转录组分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Acidithiobacillus ferrooxidans | 通过过表达diguanylate cyclase基因(如S-222、S-306、S-651)调控c-di-GMP水平,以编程生物膜基质组成 | 环境、工业生物技术 |
| 74 | 2026-03-21 |
Dynamics of genetic circuits in Pseudomonas protegens
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101513
PMID:41763221
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研究论文 | 本研究开发了一种实验-理论结合的流程,用于评估土壤细菌 Pseudomonas protegens Pf-5 中的 NOT 逻辑电路,并探索其作为合成生物学新宿主的潜力 | 首次在 Pseudomonas protegens Pf-5 中评估 NOT 逻辑电路,利用数学模型推断动态原理,并设计验证了串联兼容逆变器以实现 YES 逻辑响应 | 研究主要聚焦于 NOT 逻辑电路,可能未全面评估其他电路类型或更复杂系统在 Pf-5 中的表现 | 扩展合成生物学宿主选择,评估 Pseudomonas protegens Pf-5 作为环境合成生物学新宿主的适用性 | 土壤细菌 Pseudomonas protegens Pf-5 及其中的 NOT 逻辑电路(逆变器) | 合成生物学 | NA | 遗传电路工程、数学建模 | 数学模型 | 实验数据、模型参数 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | Pseudomonas protegens Pf-5 | NOT 逻辑电路(逆变器)、串联兼容逆变器以实现 YES 逻辑响应 | 环境 |
| 75 | 2026-03-21 |
The BAHD Acyltransferase Gene Family: Evolutionary Dynamics, Biochemical Mechanisms, and Roles in Plant Stress Adaptation
2026-Mar-11, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70597
PMID:41810805
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综述 | 本文综述了BAHD酰基转移酶基因家族的进化动态、生化机制及其在植物胁迫适应中的作用 | 整合了进化、结构和调控方面的见解,突出了BAHD酰基转移酶在植物适应中的核心作用及其在可持续农业和生物技术中的转化机遇 | 讨论了功能冗余、底物混杂性和生物安全性考虑相关的挑战 | 探讨BAHD酰基转移酶基因家族的进化、功能及其在植物胁迫适应和生物技术中的应用 | BAHD酰基转移酶基因家族 | NA | NA | 比较基因组分析、结构研究、生化研究、组学调查 | NA | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | 植物 | NA | 农业、生物技术 |
| 76 | 2026-03-21 |
Engineering Plant-Based Platforms for Saccharide Biosynthesis: Progress and Prospects
2026-Mar-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14582
PMID:41805344
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综述 | 本文综述了利用植物底盘系统进行糖类生物合成的关键技术进展、研究现状、技术挑战及优化策略 | 系统总结了植物底盘在糖类合成生物学中的独特优势,即结合光合固碳与天然糖类生物合成代谢,为可持续大规模生产提供新平台 | NA | 为合成生物学发展提供见解,并挖掘植物底盘在糖类生物合成中的商业潜力 | 植物底盘系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物系统 | 糖类生物合成与代谢途径 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 77 | 2026-03-21 |
Engineering and Evaluation of Sinorhizobium meliloti Nodulation (nod) Gene Reporter Systems in Rhizobia and Non-Rhizobia
2026-Mar, Environmental microbiology
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/1462-2920.70284
PMID:41858307
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研究论文 | 本研究开发了基于Sinorhizobium meliloti nod基因的报告系统,用于筛选能表达nod基因的根瘤菌和非根瘤菌,以促进非豆科植物的生物固氮 | 开发了包含可诱导nod box启动子、植物信号依赖性激活因子和组成型标记的nod基因报告系统,首次实现在根瘤菌和非根瘤菌中高通量筛选能识别豆科植物信号分子的细菌 | NA | 增强非豆科植物的生物固氮能力,减少对合成肥料的依赖 | 根瘤菌和非根瘤菌微生物 | 合成生物学 | NA | 基因报告系统构建、体外和植物内诱导实验 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | Sinorhizobium meliloti, 根瘤菌, 非根瘤菌 | nod基因报告系统,包含PnodA启动子控制的超折叠GFP报告基因、nodD1和nodD2激活因子以及组成型mScarlet-I标记 | 农业, 环境 |
| 78 | 2026-03-20 |
Versatile 2-Oxoglutarate-Dependent Dioxygenases Catalyze Radical-Mediated Multifunctional Skeleton Reconstructions and Oxidation Modifications of Taxoids
2026-Mar-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c01169
PMID:41746272
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研究论文 | 本文表征了两种新型2-氧戊二酸依赖性双加氧酶TcOGD1和TcOGD2,它们催化紫杉烷类化合物的骨架重构和氧化修饰,揭示了紫杉烷结构多样性的形成机制 | 首次报道了具有催化多功能性的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶,能够介导从6/8/6到5/7/6、-5/7/6和6/12框架的骨架重构,以及多种氧化修饰,通过自由基介导的C-C键断裂构建新骨架 | NA | 探索5/7/6紫杉烷类化合物的化学多样性和生物合成途径 | 紫杉烷二萜类化合物,特别是5/7/6框架的紫杉烷如taxuspine J | NA | NA | 酶促反应、NMR光谱学、酶工程 | NA | NA | NA | 酶工程、合成生物学 | NA | NA | 医药 |
| 79 | 2026-03-20 |
Exogenous biostimulants: mechanisms and innovations for enhancing seed germination and resilience under abiotic stress
2026-Mar-12, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.023
PMID:41831683
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综述 | 本文综述了外源生物刺激剂在缓解非生物胁迫(如干旱、盐分和极端温度)对种子萌发抑制的生理生化机制,并探讨了利用纳米材料、植物激素、代谢物等外源物质增强种子耐受性的潜力与挑战 | 提出了一个整合合成生物学、可生物降解纳米材料和刺激响应型纳米递送系统的多学科策略路线图,旨在实现活性成分的靶向、按需释放,以跨越实验室研究与田间应用的鸿沟 | 从实验室成果到田间应用仍面临成本效益、环境安全性和作用周期短等重大障碍 | 增强种子在非生物胁迫下的萌发能力和恢复力,以应对气候变化对作物建植和粮食安全的威胁 | 种子萌发过程及其对干旱、盐分、极端温度等非生物胁迫的响应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 农业 |
| 80 | 2026-03-19 |
Inter-species horizontal transfer of biosynthetic gene clusters: an evolutionary driver for chemical diversity in bacterial communities
2026-Mar-18, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20250014
PMID:41847751
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综述 | 本文探讨了细菌间生物合成基因簇的水平转移机制及其对细菌群落化学多样性的进化驱动作用 | 挑战了传统以基因组为中心的次生代谢观点,提出模仿自然界模块化转移系统可为合成生物学提供可移植生物合成平台的设计灵感 | 未涉及具体实验验证数据,主要基于理论探讨和现有文献分析 | 研究生物合成基因簇在细菌种间水平转移的机制及其进化意义 | 细菌生物合成基因簇及其水平转移过程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献分析 | NA | NA | 细菌 | 可移植生物合成平台 | 工业生物技术 |