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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-02-08 |
Blue food proteins-derived immunomodulatory peptides: sources, preparation, identification techniques, mechanisms, and critical challenges of commercial application
2026-Mar-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.118136
PMID:41652731
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综述 | 本文系统综述了蓝色食品蛋白质来源的免疫调节肽(IMPs)的海洋来源、制备技术、鉴定方法、作用机制及商业化应用的关键挑战 | 首次系统总结了IMPs的免疫学通路(包括非特异性和特异性免疫)及关键信号级联(如NF-κB和MAPK),并批判性评估了其体内外免疫调节活性的证据 | IMPs面临胃肠道稳定性不足、长期安全性验证缺乏和工业可扩展性挑战 | 探讨蓝色食品蛋白质来源的免疫调节肽作为功能性生物活性物质在免疫营养和治疗应用中的潜力 | 蓝色食品(海洋来源)蛋白质衍生的免疫调节肽 | NA | NA | 提取、纯化、鉴定技术(如合成生物学、精准发酵、AI驱动的肽设计) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、食品(免疫营养) |
| 122 | 2026-02-08 |
Biotechnology meets AI: Accelerating next-generation of microbial breeding for food biomanufacturing
2026-Mar-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.118152
PMID:41652737
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综述 | 本文综述了结合先进生物技术与人工智能(AI)加速下一代微生物育种以促进食品生物制造的发展 | 提出了将大气室温等离子体(ARTP)诱变、空间诱变等生物技术与新兴AI模型(如蛋白质语言模型)整合到“设计-构建-测试-学习”循环中,以实现更高效、精准和智能的微生物育种 | NA | 加速下一代微生物育种,以应对全球人口增长和环境压力,实现高效、可持续的食品生物制造 | 用于食品生物制造的微生物 | 机器学习 | NA | ARTP诱变, 空间诱变, 合成生物学 | 蛋白质语言模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 123 | 2026-02-07 |
Engineering strategies for microbial synthesis, customized modification, and application of hemoglobin
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108752
PMID:41242508
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综述 | 本文综述了血红蛋白的微生物合成、定制化功能修饰及其在多个领域的应用策略与前景 | 重点探讨了利用人工智能算法定制血红蛋白功能修饰,并整合帕累托最优与迭代生物工程框架、深度学习及合成生物学等先进技术以克服应用挑战 | NA | 探讨血红蛋白的微生物合成、功能优化及多领域应用所面临的关键挑战与解决方案 | 血红蛋白 | 合成生物学 | NA | 微生物合成、人工智能算法、深度学习、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医学, 生物技术, 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 124 | 2026-02-07 |
Biosynthesis of high-value chorismate derivatives in Escherichia coli: Recent advances and perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108762
PMID:41274425
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综述 | 本文综述了利用代谢工程和合成生物学策略在大肠杆菌中生物合成高价值分支酸衍生物的最新进展与前景 | 系统总结了大肠杆菌作为微生物平台生产分支酸衍生物的代谢工程与合成生物学最新策略,并讨论了工业化规模生产的挑战与机遇 | NA | 实现分支酸衍生物的绿色高效生物合成,替代传统植物提取和化学合成方法 | 分支酸衍生物(芳香族化合物) | 合成生物学 | NA | 系统代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 分支酸生物合成途径 | 医药、化妆品、特种化学品 |
| 125 | 2026-02-07 |
Optogenetic tools for optimizing key signalling nodes in synthetic biology
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108770
PMID:41317977
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综述 | 本文综述了光遗传学工具在合成生物学中优化关键信号节点的应用,包括微生物代谢、植物科学和疾病治疗等领域 | 将光遗传学工具分为五类,基于不同应用场景,提供时空调控酶活性或基因表达的新策略,超越传统化学诱导方法 | NA | 探讨光遗传学工具在合成生物学中调控关键信号节点的潜力,以促进基础研究和生物产业发展 | 光遗传学工具及其在微生物、植物和动物系统中的调控应用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光遗传学工具 | 微生物, 植物, 动物 | 光诱导基因表达调度、光触发液-液相分离模块、光诱导亚细胞定位光感受器、光调控酶、光门控离子通道和泵 | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 126 | 2026-02-07 |
Engineering lignin pathway, plant cell wall modification, and genome editing for advanced renewable bioenergy and material applications
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108772
PMID:41325824
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综述 | 本文综述了木质素生物合成、调控与工程化研究的最新进展,重点关注其在可再生生物能源和可持续生物材料应用中的潜力 | 整合了CRISPR/Cas基因组编辑、合成启动子、代谢重布线等新兴工具,并提出了结合多组学、单细胞技术、机器学习和田间验证的未来研究方向 | 从实验室到田间的转化应用仍然有限,且存在单木质醇运输、代谢通量控制和物种特异性调控差异等未解决的挑战 | 通过工程化木质素途径和植物细胞壁修饰,开发先进的生物能源和生物材料,推动循环生物经济发展 | 木质素生物合成途径、植物细胞壁、相关遗传与代谢网络 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、合成启动子、代谢工程、多组学分析、单细胞技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成启动子 | 植物 | 木质素生物合成途径工程、代谢重布线 | 能源, 材料, 医药, 环境 |
| 127 | 2026-02-07 |
Geminivirus vectors: From gene silencing to synthetic biology
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108771
PMID:41325825
|
综述 | 本文综述了双生病毒作为载体在基因沉默和合成生物学中的应用,包括其基因组结构、复制蛋白功能、历史应用及未来展望 | 强调双生病毒载体在病毒诱导基因沉默(VIGS)和合成生物学中的突出作用,如通过自主复制促进高水平蛋白表达和增强CRISPR/Cas基因组编辑效率,并展望其跨王国应用潜力 | NA | 探讨双生病毒载体在植物基因工程、作物改良和生物制造中的实用创新 | 双生病毒(双生病毒科植物DNA病毒)及其衍生的功能复制子(GVRs) | 合成生物学 | NA | 病毒诱导基因沉默(VIGS)、CRISPR/Cas基因组编辑、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas | 植物 | 双生病毒复制子(GVRs)作为类质粒DNA,支持植物合成生物学中的多样化设计,包括组织特异性启动子和基因表达增强序列 | 农业, 工业生物技术 |
| 128 | 2026-02-07 |
Building an expanded bio-based economy through synthetic biology
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108775
PMID:41360191
|
综述 | 本文探讨了合成生物学在扩展生物基经济中的作用,包括资源利用、底盘生物开发以及相关技术挑战与机遇 | 系统性地提出了构建未来生物基经济的综合框架,整合了微生物与植物合成生物学的协同发展路径 | NA | 探讨如何通过合成生物学技术推动生物基经济的扩展与发展 | 生物基经济的资源、底盘生物及合成生物学技术 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物, 植物 | NA | 能源, 工业生物技术, 环境 |
| 129 | 2026-02-07 |
Synthetic biology strategies for engineering probiotics and commensal bacteria for diagnostics and therapeutics
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108782
PMID:41421426
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综述 | 本文综述了利用合成生物学工具和策略改造益生菌和共生细菌,用于人类疾病诊断和治疗的最新进展 | 系统总结了合成遗传回路如何显著提高疾病诊断和治疗的精确性与可靠性,实现实时监测、治疗甚至预防性干预 | NA | 开发用于人类疾病诊断和治疗的工程化益生菌和共生细菌 | 益生菌和共生细菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 益生菌, 共生细菌 | 生物传感器, 逻辑门, 振荡器, 切换开关 | 医学 |
| 130 | 2026-02-07 |
Geometric deep learning assists protein engineering. Opportunities and Challenges
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108790
PMID:41456696
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综述 | 本文全面评述了几何深度学习在蛋白质工程中的应用、机遇与挑战 | 系统整合了GDL在蛋白质工程中的方法论原理、架构多样性和性能趋势,强调了其在增强可解释性和泛化能力方面的作用,并提出了将可解释AI与结构验证结合的统一框架 | NA | 探讨几何深度学习如何变革蛋白质工程的计算设计流程 | 蛋白质工程中的稳定性预测、功能注释、分子相互作用建模及从头设计 | 机器学习 | NA | 几何深度学习 | 几何深度学习模型 | 非欧几里得域数据(空间、拓扑、物理化学特征) | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 131 | 2026-02-07 |
A review on squalene production by engineered yeasts: Current advances and perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108792
PMID:41475586
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综述 | 本文综述了工程酵母生产角鲨烯的当前进展与前景,包括生物合成途径、代谢策略、基因工程工具及新兴酵母潜力 | 首次系统总结工程酵母生产角鲨烯的综合策略,涵盖代谢工程、先进遗传工具和新兴酵母宿主 | NA | 探索通过合成生物学策略利用工程酵母生产角鲨烯的替代方法 | 工程酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 角鲨烯生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 132 | 2026-02-07 |
Spatial engineering for biocatalytic cascade control through biomolecular compartmentalization
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108786
PMID:41475588
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综述 | 本文系统评估了通过生物分子区室化实现生物催化级联控制的空间工程平台,包括支架化区室和无支架组装体 | 提出了一个理解不同空间控制原则的框架,用于调控途径效率和通量再分配,并展望了多功能空间组织工具和仿生平台的未来发展 | 当前在机制阐明、动态调控和跨系统兼容性方面存在局限性 | 探讨空间工程在生物催化过程控制中的应用,以优化代谢通量和途径效率 | 支架化区室(如脂质体、DNA折纸、聚合物囊泡和细菌微区室)和无支架组装体(如无膜细胞器和凝聚层) | 合成生物学 | NA | 生物分子区室化、空间工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、细胞工程 |
| 133 | 2026-02-07 |
Vanadium-dependent haloperoxidases: Recent advances and perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108797
PMID:41506498
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综述 | 本文综述了钒依赖性卤过氧化物酶(VHPOs)的最新进展与前景,涵盖其发现、结构功能、机制阐明及合成应用 | 挑战了长期存在的可扩散HOX模型,并实现了理性酶工程,推动选择性卤化和可持续合成 | NA | 综述VHPOs在合成化学和生物技术领域的最新研究进展与未来应用潜力 | 钒依赖性卤过氧化物酶(VHPOs) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 材料科学, 环境生物技术 |
| 134 | 2026-02-06 |
Adaptive laboratory evolution optimizes an engineered phosphite utilization pathway in Synechococcus elongatus PCC 7942
2026-Mar, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2025.11.006
PMID:41390308
|
研究论文 | 本研究通过长期传代培养优化了在Synechococcus elongatus PCC 7942中构建的磷酸盐利用途径,提高了工程菌株的生长和磷酸盐消耗速率 | 发现长期传代培养可诱导htxBCDE转运蛋白基因发生点突变,从而增强磷酸盐转运活性,优化工程代谢途径而不改变其底物特异性 | 研究仅针对单一菌株和特定代谢系统,未评估在其他宿主或代谢途径中的普适性 | 优化工程微生物的磷酸盐依赖代谢系统,以平衡代谢负担与生物安全控制能力 | Synechococcus elongatus PCC 7942工程菌株RH714及其传代演化群体 | 合成生物学 | NA | 适应性实验室演化、长期传代培养、基因序列分析、基因敲除 | NA | 生长曲线数据、磷酸盐消耗速率数据、基因序列数据 | 原始工程菌株RH714及其传代演化群体 | CRISPR-Cas9 | Synechococcus elongatus PCC 7942 | 磷酸盐依赖代谢系统,包含htxBCDE转运蛋白基因和ptxD基因簇 | 环境、工业生物技术 |
| 135 | 2026-02-06 |
Automated strain-to-peptide conversion: a high-throughput proteome analysis platform empowering rational design of microbial cell factories
2026-Mar, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134010
PMID:41539624
|
研究论文 | 开发了一种名为'菌株到肽段转换'的高通量蛋白质组分析平台,用于微生物细胞工厂的理性设计 | 通过自动化工作流程整合细菌裂解、磁性固相烷基化蛋白富集、污染物去除和快速消化,将96个样本处理时间缩短至1小时,相比SP3方法减少94%处理时间,并提高膜蛋白定量28% | NA | 克服微生物工程菌株蛋白质组分析中的样本制备瓶颈,实现高通量蛋白质组分析 | 工程化微生物菌株(如大肠杆菌)的蛋白质组 | 合成生物学 | NA | 质谱蛋白质组学、磁性固相烷基化 | NA | 蛋白质组数据 | 96个大肠杆菌样本 | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 136 | 2026-02-05 |
The Prebiotic and Techno-Functional Potential of Microbial Exopolysaccharides for Human Health and Food Systems
2026-Mar, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70406
PMID:41619217
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综述 | 本文综述了微生物胞外多糖作为益生元候选物和食品技术功能添加剂的双重功能,探讨了其对人类健康和食品系统的潜在影响 | 系统分析了微生物胞外多糖在“EPS-微生物群-宿主轴”中的作用机制,并探讨了合成生物学在定制化多糖设计中的应用潜力 | 未提供具体的实验数据支持,且未详细讨论不同微生物来源EPS的功能差异 | 阐明微生物胞外多糖作为可持续多功能成分在下一代健康食品开发中的精确作用 | 微生物胞外多糖 | NA | 糖尿病, 肥胖症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 食品, 医药 |
| 137 | 2026-01-24 |
Pseudomonas putida JM37 as a novel bacterial chassis for ethylene glycol upcycling
2026-Mar, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133884
PMID:41453527
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研究论文 | 本研究报道了恶臭假单胞菌JM37作为新型细菌底盘用于乙二醇升级回收的代谢和生物技术潜力 | 首次发现恶臭假单胞菌JM37能高效利用乙二醇作为唯一碳源和能源,并揭示其乙二醇代谢稳健性源于乙醛酸同化途径的遗传冗余 | NA | 开发用于乙二醇可持续升级回收的新型合成生物学底盘 | 恶臭假单胞菌JM37菌株 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、定向诱变、异源生物合成途径表达 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 恶臭假单胞菌JM37 | 乙醛酸同化途径、中链聚羟基脂肪酸酯生物合成途径、紫色杆菌素生物合成操纵子、PET水解酶分泌系统 | 环境,工业生物技术 |
| 138 | 2026-01-24 |
Bioelectrochemical energy conversion and wastewater treatment in microbial fuel cells: a review of progress, limitations, and future developments
2026-Mar, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133903
PMID:41475609
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综述 | 本文综述了微生物燃料电池(MFC)在生物电化学能量转换和废水处理方面的最新进展、局限性与未来发展 | 系统总结了合成生物学与微生物工程在增强生物膜稳定性及促进胞外电子传递方面的最新进展,并分析了纳米结构电极相较于传统碳电极在提升电流输出方面的优势 | 面临材料成本高、电极污染、长期稳定性有限及规模化困难等挑战,阻碍了其工业化应用 | 探讨MFC在环境可持续性与可再生能源生产框架下的技术进展、挑战与应用前景 | 微生物燃料电池(MFC) | NA | NA | 生物电化学能量转换、废水处理 | NA | NA | NA | 合成生物学、微生物工程 | 微生物(具体种类未指定) | NA | 环境, 能源 |
| 139 | 2026-01-24 |
Pheromone-mediated quorum sensing enables dynamic regulation of cordycepin biosynthesis in Cordyceps militaris
2026-Mar, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133915
PMID:41478417
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研究论文 | 本研究在蛹虫草中重构了信息素介导的群体感应系统,实现了对虫草素生物合成的动态调控 | 首次在蛹虫草中构建了基于信息素群体感应的动态调控系统,实现了细胞密度依赖的虫草素合成调控 | NA | 开发高效的虫草素生物合成动态调控策略 | 蛹虫草(Cordyceps militaris)及其虫草素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 系统发育分析、保守结构域分析、2A肽介导的多基因共表达 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | 蛹虫草(Cordyceps militaris) | 信息素响应型合成回路:α-信息素(mfα1)受色氨酸响应启动子P控制,激活关键生物合成基因cns1和cns2 | 医药 |
| 140 | 2026-01-18 |
Reprogramming AraC-type transcriptional factor to respond to new ligands 1,3-propanediol and 1,4-butanediol via directed evolution
2026-Mar-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118359
PMID:41485247
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研究论文 | 本研究通过定向进化改造AraC家族转录因子PocR,使其能够响应新配体1,3-丙二醇和1,4-丁二醇,并开发了基于生长偶联筛选和流式细胞分选的高通量生物传感器筛选平台 | 开发了结合生长偶联筛选与流式细胞分选的生物传感器筛选平台,并通过定向进化成功重编程了AraC家族转录因子的配体特异性,实现了对非天然二醇类化合物的响应 | NA | 开发可响应新配体的生物传感器,用于代谢工程和高产菌株筛选 | 肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)中的AraC家族转录调控因子PocR | 合成生物学 | NA | 定向进化、结构分析、动力学引导的半理性设计、非理性方法、流式细胞分选、微流控共培养系统 | NA | NA | 160万个微滴 | 定向进化 | 肺炎克雷伯菌 | 二醇类生物传感器 | 工业生物技术 |