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当前共找到 153 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-09-10
Coupled intracellular redox and extracellular respiration sensing for quantitative oxidative stress profiling
2026-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出一种结合基因编码氧化还原生物传感器和光学氧传感器的双荧光平台,用于定量检测工业酵母细胞内的氧化还原状态和细胞外呼吸活性 首次集成细胞内氧化还原感应与细胞外呼吸测量,实现非侵入性、动态、多尺度的氧化应激定量分析,并揭示不同酵母物种间的氧化还原-呼吸表型差异 平台主要针对工业酵母系统验证,且依赖特定传感器和微孔板设置,可能限制其在不同细胞类型或大规模应用中的普遍适用性 通过同时测量细胞内氧化还原状态和细胞外呼吸活动,定量评估细胞氧化应激,以应用于生物制造和合成生物学中的细胞适应性评估 两个工业酵母物种:Crabtree阳性的酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)和专性呼吸酵母解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica) 生物传感器、合成生物学 NA 基因编码荧光生物传感器、光学氧传感器、荧光显微镜、微孔板读数仪 NA 荧光信号、氧消耗速率、图像数据 两种酵母菌株(酿酒酵母和解脂耶氏酵母),可能涉及多个培养条件(如葡萄糖、甘油)和药物处理(抗霉素A)下的测量,具体样本数量未提供 基因工程(用于稳定表达roGFP2 Tsa2ΔC传感器),具体工具如CRISPR等未提及 酿酒酵母(S. cerevisiae)、解脂耶氏酵母(Y. lipolytica) 基因编码氧化还原生物传感器(roGFP2 Tsa2ΔC)与光学氧传感器集成的双荧光传感系统 生物制造、合成生物学
2 2026-09-08
Streptomyces Autoregulator Biosensors from Natural Product Cluster-Situated Regulators
2026-Jun-19, ACS chemical biology IF:3.5Q2
研究论文 本研究开发了八种基于簇定位调控因子的链霉菌自诱导物生物传感器,并探讨了其配体合成、交叉反应、正交性及共培养应用 首次将生物信息预测的链霉菌群体感应系统转化为具有不同激活倍数、配体亲和力和选择性的八种生物传感器,并实现了十二个正交信号系统 尚未在全文细节中明确讨论局限,但可能包括配体合成路线复杂及体内动态范围有限等 开发并验证基于CSR的链霉菌自诱导物生物传感器,用于解析天然产物调控中的群体感应并构建正交遗传电路 链霉菌属中基于簇定位调控因子(如TetR样阻遏物)的自诱导物生物传感器及其配体 合成生物学, 生物传感器 NA 生物传感器构建, 配体化学合成 NA 实验数据(生物活性、亲和力等) 八种生物传感器及十二个正交信号系统 NA 链霉菌属 基于群体感应的生物传感器及多输入遗传电路 工业生物技术, 药物发现
3 2026-09-08
Engineering Protein Stability with Small Molecules: A Review of the ecDHFR Destabilizing Domain System
2026-Jun-19, ACS chemical biology IF:3.5Q2
综述 本文综述了ecDHFR去稳定域系统通过配体诱导稳定化实现对蛋白质丰度条件性控制的机制、性能及优化,并评估其相对于其他条件基因表达系统的优势与局限。 系统性地总结了ecDHFR-DD系统在多个生物体中的应用,并探讨了其在害虫和媒介管理中的应用潜力,拓宽了该系统的应用范围。 主要局限性在于对条件性蛋白控制系统的全面比较可能受限于已有文献的覆盖面,且对于新兴应用领域的探讨可能缺乏实证支持。 综合现有知识,评估ecDHFR-DD系统作为条件性蛋白质稳定工具的机制、性能和优化策略,并展望其在多学科中的应用前景。 ecDHFR去稳定域系统及其在不同生物体(如酵母、无脊椎动物模型、哺乳动物细胞)中的应用。 合成生物学 NA 蛋白质工程 NA 文献 不适用 NA 酿酒酵母, 无脊椎动物, 哺乳动物细胞 去稳定域系统 医学, 农业, 工业生物技术
4 2026-09-07
A genetic manipulation tool based on the GP35 recombinase for targeted gene editing in mycoplasmas of ruminants
2026-06, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本文介绍了一种基于GP35重组酶的质粒介导基因编辑工具,用于在牛支原体中实现精确的基因插入和缺失 首次将SPP1噬菌体的GP35重组酶应用于支原体基因组编辑,实现长单链DNA重组工程,阳性编辑率达77.78%-100%,且避免随机脱氨风险 未明确提及局限性,但可能限于支原体特定菌株及编辑窗口选择等 开发针对反刍动物支原体的高效基因编辑工具,以促进病原研究和疫苗开发 牛支原体(Mycoplasma bovis)及其他反刍动物支原体 合成生物学 牛支原体病 长单链DNA重组工程(recombineering) NA 基因序列数据 多个牛支原体突变体(具体数量未详) GP35重组酶 牛支原体(Mycoplasma bovis) NA 医学、农业
5 2026-09-02
Heterologous production of a plant biostimulant in Streptomyces albidoflavus
2026-Jun-20, Applied microbiology and biotechnology IF:3.9Q2
研究论文 本文建立了在白色链霉菌中异源生产植物生物刺激素pteridic acids F和H的平台,通过基因簇克隆、CRISPR-Cas9基因组整合和启动子工程,结合基因组规模代谢模型指导的培养基优化,实现了产量超过20倍的提升 首次建立了PTA生物合成的功能性异源生产平台,结合合成生物学和基因组规模代谢建模来优化复杂植物有益聚酮化合物的生产 初始异源表达未产生PTA,且工程化后产量仍低于定量限,需进一步优化 建立pteridic acids的异源生产平台,提高其产量以支持农业应用 pteridic acids F和H,以及白色链霉菌宿主 合成生物学 NA CAPTURE克隆、CRISPR-Cas9、基因组规模代谢模型 基因组规模代谢模型 基因组序列、发酵数据 NA CRISPR-Cas9、Cas12a、Cre-lox重组 白色链霉菌 PTA生物合成基因簇 农业
6 2026-08-29
Bioengineered bacteria in cancer immunotherapy: mechanistic advances, therapeutic strategies and clinical potential
2026-Jun-24, Archives of microbiology IF:2.3Q3
综述 本文综述了生物工程细菌在癌症免疫治疗中的进展,涵盖机制、治疗策略和临床潜力,并讨论了其面临的挑战。 系统总结了合成生物学、基因工程和理化修饰在细菌设计中的应用,强调了多模态协同治疗和下一代活体疗法的前景。 临床转化仍受限于免疫清除、遗传稳定性、毒性风险和肿瘤微环境变异性等问题。 探讨生物工程细菌在癌症免疫治疗中的设计原则和临床应用潜力。 生物工程细菌及其在肿瘤微环境中的免疫调节和治疗应用。 合成生物学 癌症 基因工程、合成生物学、理化修饰 NA 文本(综述性文献) NA CRISPR-Cas9、TALEN等(根据文本推断,未明确列出) 细菌(未具体指定) 群体感应电路、缺氧响应启动子等(未详细描述) 医学
7 2026-08-29
Integrative frameworks for plastic biodegradation in insect-microbiome systems: mechanistic insights, emerging multi-omics and enzyme engineering perspectives
2026-Jun-08, Biodegradation IF:3.1Q2
综述 本文综述了昆虫-微生物组系统中塑料生物降解的综合框架,重点探讨宿主与肠道微生物互作的机制、多组学进展及酶工程策略 将昆虫宿主生理与肠道微生物组整合为生物降解平台,提出多步骤降解机制并强调从相关性数据向酶工程验证的转化 现有数据多为相关性分析,缺乏对特定酶功能的直接实验验证,且真实生物降解程度与部分转化之间的界限尚未明确 总结昆虫-微生物组系统在塑料降解中的机制,并指导开发基于酶的可持续塑料废物管理策略 昆虫幼虫及其肠道微生物组,重点涉及聚乙烯和聚丙烯等聚烯烃塑料 生物降解 NA 多组学分析 NA 组学数据(如宏基因组、宏转录组等) NA 酶工程 昆虫幼虫 NA 环境
8 2026-08-25
Recognition of non-standard base pairs by triplex-forming oligonucleotides containing an expanded genetic alphabet
2026-Jun-12, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过扩展遗传字母表,利用人工扩展遗传信息系统中的核苷酸碱基,系统评估了120种碱基三联体组合,识别出至少12种模块化三联体,能够在中性pH下以纳摩尔亲和力靶向含有标准、损伤或合成碱基对的双链DNA,并展示了其在检测氧化损伤和AEGIS碱基对中的应用。 创新性地将人工扩展遗传信息系统(AEGIS)的非标准核苷酸碱基引入三链体形成寡核苷酸(TFO),显著扩展了三链体识别的靶序列范围,并在中性pH条件下实现了对含损伤或合成碱基对的DNA的稳定识别,突破了传统TFO对酸性条件和天然碱基的限制。 摘要未提及具体局限性,可能包括对靶序列的偏好性、TFO的化学稳定性或在复杂生物环境中的递送效率等未详细阐述的方面。 扩展三链体形成寡核苷酸(TFO)的识别空间,实现对含有标准、损伤或合成碱基对的双链DNA在中性pH下的序列特异性识别,并提供精准基因靶向、分子传感和核酸纳米技术的通用平台。 双链DNA中的标准、损伤(如氧化病变)和合成(AEGIS)碱基对,以及化学和酶学合成的三链体形成寡核苷酸(TFO)。 分子生物学, 合成生物学 NA 人工扩展遗传信息系统(AEGIS), 三链体形成寡核苷酸(TFO), 荧光检测, 酶学合成, 化学合成 NA 序列, 生化数据 120种碱基三联体组合 NA NA 三链体形成寡核苷酸(TFO)与双链DNA的Hoogsteen碱基配对识别系统 医学, 合成生物学, 纳米技术
9 2026-08-23
Genetic basis of phytoalexin-mediated chemical defense in plants
2026-Jun-25, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本文阐明了植物中植物抗毒素debneyol的生物合成途径、关键调控因子及其对多种病原体的防御作用 首次完整揭示了植物抗毒素debneyol的生物合成途径,并发现了调控因子MCD1通过增强EAS和EAE的相互作用及EAE活性来促进debneyol合成,从而赋予植物广谱抗性 未提及 阐明植物抗毒素介导的化学防御机制的遗传基础和调控机制,为工程化广谱抗性和工业规模生产debneyol提供途径 植物中的debneyol生物合成途径及其调控因子MCD1 植物生物学 植物病害 基因表达分析、蛋白质相互作用分析 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 NA NA NA NA 农业
10 2026-08-23
SynBio-DSP: an integrated synthetic biology platform with fed-batch fermentation and continuous downstream processing for sustainable production of thermostable cellulases
2026-Jun-14, Biotechnology for biofuels and bioproducts IF:3.3Q3
研究论文 开发了SynBio-DSP集成平台,结合合成生物学、机器学习引导的生物过程优化和连续下游处理,可持续生产热稳定纤维素酶。 创新性地将菌株工程、发酵和下游处理集成优化,引入Qubum-Lysis-Modulation系统、CRISPRi介导的细胞壁弱化、脉冲电场辅助裂解系统及多目标优化。 研究主要基于实验室规模,工业规模应用尚需验证,且sfGFP融合导致酶比活性下降8.3%。 开发一套可持续、经济可行的热稳定纤维素酶生产平台,提升酶产量并降低生产成本和环境影响。 工程改造的枯草芽孢杆菌菌株,表达热稳定纤维素酶CtCel9A。 合成生物学,生物过程工程 NA CRISPRi、重组蛋白表达、高斯过程回归、响应面法、脉冲电场辅助裂解、技术经济分析 高斯过程回归、NSGA-III多目标优化 发酵过程数据、酶活测定数据、技术经济数据 研究涉及实验室规模的发酵和下游处理,未明确样本数量;技术经济分析基于500公斤/年设施。 CRISPRi 枯草芽孢杆菌 Qubum-Lysis-Modulation自诱导系统、CRISPRi介导的细胞壁弱化 工业生物技术,能源
11 2026-08-20
Live-cell imaging of enhancer-promoter dynamics reveals transient contact-driven gene activation
2026-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用活细胞超分辨率成像技术,探究增强子与启动子之间的动态相互作用,揭示瞬时接触驱动基因激活的机制 构建了用于同时可视化增强子-启动子三维距离和新生成转录的合成生物学平台,结合五种互补方法整合成像、3D基因组和基因表达数据,在秒级时间尺度上估算转录激活由约25-42纳米的接触介导,支持瞬时接触机制 摘要中未明确提及局限性 阐明增强子-启动子相互作用在空间和时间上的机制及其与转录的关系 哺乳动物细胞中的增强子-启动子相互作用 合成生物学 NA 超级分辨率活细胞成像、3D基因组学 NA 图像、基因表达数据 多种细胞系(具体数量未提供) 合成生物学平台 哺乳动物细胞 增强子-启动子相互作用可视化系统 基础生物学
12 2026-08-14
Metabolic Pathways and Molecular Regulatory Mechanisms of Nervonic Acid Biosynthesis in Malania oleifera
2026-Jun-18, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文系统总结了马拉尼奥油藤中神经酸生物合成的代谢途径与分子调控机制,包括脂肪酸合成、极长链脂肪酸延伸和Δ15去饱和过程,并讨论了多组学数据、转录调控和表观遗传调控。 整合多组学数据,分析了KCS基因家族的系统发育和共线性分布,并讨论了转录调控网络及表观遗传调控在神经酸积累中的作用,提出了代谢工程和合成生物学应用的展望。 未提供具体的实验验证数据,主要基于已有研究进行综述和推测。 系统总结神经酸在马拉尼奥油藤中的生物合成途径和调控机制,为可持续神经酸生产的代谢工程和合成生物学提供理论基础。 马拉尼奥油藤(Malania oleifera)中的神经酸生物合成相关酶和调控因子。 植物分子生物学、代谢工程 NA 多组学数据分析 NA 基因组、转录组等组学数据 NA NA NA NA 生物技术、农业
13 2026-08-14
Next-Generation Bionic Sensors for Small Molecule Detection: Integrating Synthetic Biology, Nanomaterials, and Artificial Intelligence
2026-Jun-15, Micromachines IF:3.0Q2
综述 本文综述了结合合成生物学、纳米材料和人工智能的下一代仿生传感器在小分子检测中的最新进展,重点讨论了如何克服传统方法的局限性并实现复杂环境中的实时检测。 首次系统性地整合合成生物学、纳米材料和人工智能三个领域,提出了一种问题导向的视角来设计下一代仿生传感器,涵盖了从生物识别元件到信号处理的全流程创新。 讨论中提及了AI驱动系统在可扩展性、成本、数据可靠性和伦理方面面临的挑战,但未提供具体的解决方案或实验验证。 旨在提供一个全面的概述,展示下一代仿生传感器如何通过跨学科整合解决小分子检测中的关键难题,推动实际应用。 小分子检测中的生物识别元件(如酶、抗体、适配体、分子印迹聚合物)以及纳米材料(如石墨烯、碳纳米管、量子点、MXenes)和AI技术。 机器学习 NA NA NA NA NA NA NA NA 医学, 环境, 食品
14 2026-08-14
Global Probiotic Markets Meet Synthetic Biology: Translational Challenges and Escherichia coli Nissle 1917 as a Model Chassis
2026-Jun-11, Microorganisms IF:4.1Q2
综述 本文综述了全球益生菌市场扩张与合成生物学在活体生物治疗产品开发中的应用,重点讨论了以大肠杆菌Nissle 1917为模型底盘的工程化策略、治疗机遇及转化障碍 将益生菌市场扩张与活体生物治疗产品开发联系起来,并以大肠杆菌Nissle 1917作为模型底盘,探讨其外膜囊泡在治疗递送中的潜力 未提及具体实验数据或临床验证结果,可能缺乏实证支持 探讨合成生物学如何将益生菌转化为可编程微生物平台,以弥合市场扩张与临床转化之间的差距 全球益生菌市场、活体生物治疗产品、大肠杆菌Nissle 1917 合成生物学 肠道相关疾病 NA NA 综述文献 NA NA 大肠杆菌Nissle 1917 可编程微生物平台,用于感知疾病相关信号并产生治疗输出 医学
15 2026-08-14
Design and Implementation of a Blue-Light-Controlled Gene-Switch System
2026-Jun-10, Molecules (Basel, Switzerland)
研究论文 开发并优化了一种蓝光诱导的T7RNAP双输入调控基因开关系统,实现了精确的时空基因控制,并集成了苯甲酸响应模块以实现化学关闭功能 结合蓝光精确诱导与苯甲酸化学关闭的双输入调控,实现了非侵入性、按需激活及生态应用中的可控关闭 未提及 构建可预测、可编程的基因开关系统,用于生物制造、治疗和微生物工程中的精确基因控制 蓝光诱导的T7RNAP系统及其变体,包括RBS序列、串联T7启动子和split-T7RNAP变体 合成生物学 NA 基因表达调控 NA 荧光输出和实时生长曲线数据 未明确样本数量,涉及多种RBS变体、启动子构建和模块测试 NA 未明确 蓝光诱导的双输入基因开关,包含苯甲酸响应模块 医学、环境、工业生物技术
16 2026-08-13
Modular Assembly of Higher-Order DNA Nanotube Tile Nanostructures Using DNA Annular Scaffolds
2026-06-03, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1
研究论文 本文提出一种基于可编程DNA纳米管瓦片作为构建模块的模块化组装策略,通过多个DNA环形支架与短DNA基序互连构建高阶、模块化系统,实现了超过99%的组装产率,并构建了多种超结构和布尔逻辑门及电路 整合了DNA瓦片和DNA origami的优点,利用DNA环形支架连接DNA纳米管瓦片,实现了稳定、可预测且逻辑可控的高阶纳米结构模块化组装,并展示了快速拆卸和组件可重用性 摘要中未明确提及局限性,可能包括组装过程的复杂性和对特定条件的依赖性等未说明内容 开发一种模块化组装策略,以DNA纳米管瓦片为构建模块,构建可预测、稳定且逻辑可控的高阶DNA纳米结构,并扩展DNA纳米技术的应用空间 DNA纳米管瓦片、DNA环形支架、短DNA基序、DNA纳米结构聚合物和超结构 纳米技术、合成生物学 NA DNA纳米技术、DNA瓦片组装、DNA origami NA 结构数据(DNA纳米结构) 未提供具体样本数量,涉及多种不同直径的DNA环形支架和多种组装结构 DNA纳米技术 NA 布尔逻辑门和电路,基于DNA纳米管瓦片的模块化组件 纳米技术、合成生物学
17 2026-08-12
Engineering a PD-L1-sensing synthetic receptor for programmable macrophage response
2026-Jun-06, Journal of biological engineering IF:5.7Q1
研究论文 本文介绍了一种基于合成Notch受体的架构(SNIPR),使单核细胞样细胞能够感知PD-L1并条件性激活吞噬程序,从而实现对巨噬细胞行为的可编程控制 将PD-L1从末端治疗靶点重新定义为合成回路激活的可编程输入信号,并建立了配体响应控制工程化巨噬细胞行为的模块化框架 研究仅在体外进行,未涉及体内验证;CV1-Fc作为模型效应分子,其临床实用性需进一步探索 通过合成受体工程实现巨噬细胞对免疫调节配体的感应和程序化响应,以增强对肿瘤细胞的吞噬作用 表达PD-L1的SKOV-3卵巢癌细胞和THP-1来源的巨噬细胞 合成生物学 卵巢癌 合成受体工程 合成Notch受体(SNIPR) 体外实验数据 未明确指定样本数量,涉及SKOV-3细胞系和THP-1细胞系 NA 哺乳动物细胞(THP-1单核细胞样细胞、SKOV-3癌细胞) 基于合成Notch的受体(SNIPR),检测PD-L1并触发荧光报告基因或CV1-Fc表达 医学
18 2026-08-08
Modular Scalable Synthetic Gene Circuits for Complex Functions Within Minimal Computational Layers in Human Cells
2026-Jun-16, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出一种模块化可扩展的合成基因电路设计框架,通过较少的计算层在人类细胞中实现复杂功能。 采用正交反剪接AND门、天然-合成杂交启动子和合成microRNA的组合,在减少计算层数的同时实现复杂逻辑功能,提高了电路的可扩展性并降低了资源消耗。 未明确说明局限性。 开发能在人类细胞中执行复杂遗传程序且计算层数最少化的可扩展基因电路。 人类细胞中的合成基因电路。 合成生物学 不适用 基因电路工程 不适用 不适用 不适用 不适用 人类细胞 三输入组合逻辑门、半加器、全加器、动态3-1多路复用器 生物医学、生物技术、基础生物学
19 2026-08-07
Synthetic Biology Strategies for the Development of Live Attenuated Influenza Viruses: Recent Advances and Applications
2026-Jun-29, Viruses
综述 本文系统总结了基于合成生物学策略开发下一代减毒流感病毒的方法,包括基因组重编码、miRNA靶向、提前终止密码子和蛋白酶靶向重组病毒等,并讨论了这些策略在癌症治疗和病毒载体疫苗开发中的应用与挑战。 整合了多种合成生物学策略用于流感病毒减毒的创新方法,并针对各策略的优势与局限进行了系统比较分析,为构建更安全稳定的流感病毒工程平台提供了新视角。 作为综述,未提供实验数据,对各策略的实际效果评价依赖于现有文献,可能存在偏倚;未深入探讨临床转化中的具体障碍。 系统总结合成生物学策略在减毒流感病毒开发中的最新进展,分析其优缺点,并为癌症治疗和病毒载体疫苗开发提供理论依据和新见解。 流感病毒及其减毒株,包括冷适应株、基因组重编码病毒、miRNA靶向病毒、含提前终止密码子的病毒和蛋白酶靶向重组病毒。 合成生物学 癌症、流感病毒感染 反向遗传学、基因组重编码、miRNA靶向、密码子去优化、蛋白酶靶向 NA 文献资料 NA NA 流感病毒 减毒病毒工程平台,涉及基因组重编码、miRNA靶向、提前终止密码子和蛋白酶靶向设计 医学、生物技术
20 2026-07-30
Artificial Intelligence in Bacteriophage Science: A Comprehensive Narrative Review of Applications, Challenges, and Translational Opportunities
2026-Jun-25, Antibiotics (Basel, Switzerland)
综述 系统回顾人工智能在噬菌体科学中的应用,涵盖发现、工程、制造和治疗应用全流程 首次全面整合AI在噬菌体全流程中的潜力,包括个性化选择、鸡尾酒优化和可扩展制造 数据碎片化、分类偏倚、外部验证有限、可解释性不足、隐私和生物安全监管挑战 评估AI加速噬菌体疗法从个体化干预向可扩展抗菌平台转化的可能性 噬菌体发现、基因组注释、宿主互作预测、治疗匹配、制造优化等环节 机器学习 耐药菌感染、生物膜相关感染 NA NA 元基因组数据、基因组注释数据、生物过程数据 NA CRISPR 噬菌体 受体结合蛋白重设计、CRISPR工程、生成式基因组设计、生物安全筛查 医学、工业生物技术
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