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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-07 |
Synthetic Biology Strategies for the Development of Live Attenuated Influenza Viruses: Recent Advances and Applications
2026-Jun-29, Viruses
DOI:10.3390/v18070715
PMID:42515567
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综述 | 本文系统总结了基于合成生物学策略开发下一代减毒流感病毒的方法,包括基因组重编码、miRNA靶向、提前终止密码子和蛋白酶靶向重组病毒等,并讨论了这些策略在癌症治疗和病毒载体疫苗开发中的应用与挑战。 | 整合了多种合成生物学策略用于流感病毒减毒的创新方法,并针对各策略的优势与局限进行了系统比较分析,为构建更安全稳定的流感病毒工程平台提供了新视角。 | 作为综述,未提供实验数据,对各策略的实际效果评价依赖于现有文献,可能存在偏倚;未深入探讨临床转化中的具体障碍。 | 系统总结合成生物学策略在减毒流感病毒开发中的最新进展,分析其优缺点,并为癌症治疗和病毒载体疫苗开发提供理论依据和新见解。 | 流感病毒及其减毒株,包括冷适应株、基因组重编码病毒、miRNA靶向病毒、含提前终止密码子的病毒和蛋白酶靶向重组病毒。 | 合成生物学 | 癌症、流感病毒感染 | 反向遗传学、基因组重编码、miRNA靶向、密码子去优化、蛋白酶靶向 | NA | 文献资料 | NA | NA | 流感病毒 | 减毒病毒工程平台,涉及基因组重编码、miRNA靶向、提前终止密码子和蛋白酶靶向设计 | 医学、生物技术 |
| 2 | 2026-08-06 |
Modular Scalable Synthetic Gene Circuits for Complex Functions Within Minimal Computational Layers in Human Cells
2026-Jun-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74408-y
PMID:42303993
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研究论文 | 本文介绍了一种用于人类细胞中基因电路工程的模块化可扩展设计框架,通过整合正交剪接型AND门、天然-合成混合启动子和合成microRNA,在更少的计算层内实现复杂功能 | 提出了一种模块化设计框架,能在最少的计算层内实现复杂基因电路功能,减少了正交部件需求、遗传负担和细胞资源消耗,提高了可扩展性 | 摘要中未明确提及局限性 | 旨在解决合成基因电路中可扩展性障碍,通过最小化计算层数来执行复杂遗传程序,并扩展在生物医学、生物技术和基础生物学中的应用 | 人类细胞中的合成基因电路 | 合成生物学 | 不适用 | 合成基因电路设计(包括剪接型AND门、混合启动子和合成microRNA) | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 人类细胞 | 三输入组合逻辑门、半加器、全加器和动态3对1多路选择器,包含选择器过载状态输出 | 生物医学, 生物技术, 基础生物学 |
| 3 | 2026-07-30 |
Artificial Intelligence in Bacteriophage Science: A Comprehensive Narrative Review of Applications, Challenges, and Translational Opportunities
2026-Jun-25, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics15070635
PMID:42505598
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综述 | 系统回顾人工智能在噬菌体科学中的应用,涵盖发现、工程、制造和治疗应用全流程 | 首次全面整合AI在噬菌体全流程中的潜力,包括个性化选择、鸡尾酒优化和可扩展制造 | 数据碎片化、分类偏倚、外部验证有限、可解释性不足、隐私和生物安全监管挑战 | 评估AI加速噬菌体疗法从个体化干预向可扩展抗菌平台转化的可能性 | 噬菌体发现、基因组注释、宿主互作预测、治疗匹配、制造优化等环节 | 机器学习 | 耐药菌感染、生物膜相关感染 | NA | NA | 元基因组数据、基因组注释数据、生物过程数据 | NA | CRISPR | 噬菌体 | 受体结合蛋白重设计、CRISPR工程、生成式基因组设计、生物安全筛查 | 医学、工业生物技术 |
| 4 | 2026-07-30 |
Flaxseed gum-reinforced sodium alginate semi-interpenetrating polymer network W1/O/W2 emulgels for targeted co-delivery of prebiotics and engineered "living factory": a novel next-generation synbiotic system for anoxia-triggered synergistic inulin metabolism
2026-Jun-24, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.153201
PMID:42342179
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研究论文 | 通过合成生物学与生物大分子组装,开发了一种新型工程化合生元平台,实现靶向共递送益生元和工程化“活体工厂”,用于缺氧触发协同菊粉代谢 | 首次将合成生物学与W1/O/W2乳凝胶系统结合,构建半互穿聚合物网络,实现益生元和工程菌的同步递送及缺氧响应性菊粉酶分泌 | NA | 设计一个不依赖宿主微生物异质性的确定性合生元平台,实现精准菌群调控 | 工程化大肠杆菌Nissle1917、菊粉、亚麻籽胶、海藻酸钠 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、乳凝胶制备、钙交联凝胶化、半互穿聚合物网络 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle1917 | 缺氧响应性菊粉酶分泌系统 | 医学 |
| 5 | 2026-07-30 |
Bioconjugation Strategies for Revealing the Roles of Glycerophospholipids in Cells
2026-Jun-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70428
PMID:42287618
|
综述 | 总结用于揭示甘油磷脂在细胞中作用的生物共轭策略 | 融合合成生物学、活细胞成像和生物正交反应等多学科方法,设计精确脂质类似物和探针 | NA | 探索甘油磷脂的代谢、运输和相互作用,推动功能研究和治疗创新 | 甘油磷脂及其在细胞中的生物学功能 | 合成生物学 | NA | 化学全合成、生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 6 | 2026-07-30 |
Adaptive evolution of oxidosqualene cyclases has driven diversification of triterpene scaffolds for limonoid biosynthesis in Melia toosendan
2026-Jun-15, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101965
PMID:42289993
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研究论文 | 通过染色体级基因组组装和功能分析,揭示了楝树中氧化鲨烯环化酶的适应性进化驱动柠檬苦素生物合成中三萜骨架多样化的分子机制 | 发现了四个关键氨基酸替换(W258L、T413S、M730Y和L735H)就能将底物特异性从tirucalla-7,24-dien-3β-ol转变为eupha-7,24-dien-3β-ol,揭示了一条潜在替代柠檬苦素生物合成途径 | 对OSC基因进化与正选择信号的相关性分析主要基于序列和系统发育,功能验证主要在烟草中瞬时表达,缺乏在天然植物中的完整体内验证 | 理解植物中三萜骨架多样化的分子机制,并为通过合成生物学工程植物源杀虫剂奠定基础 | 楝树(Melia toosendan)中的氧化鲨烯环化酶(OSCs)及其催化产生的三萜骨架 | 植物生物学 | NA | 染色体级基因组组装、瞬时表达、系统发育分析、祖先序列重建 | NA | 基因组序列、表达数据 | 1个楝树基因组,14个OSC基因在烟草中瞬时表达 | NA | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | NA | 农业, 合成生物学 |
| 7 | 2026-07-30 |
Recognition of non-standard base pairs by triplex-forming oligonucleotides containing an expanded genetic alphabet
2026-Jun-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74375-4
PMID:42286010
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研究论文 | 利用扩展遗传字母表的三链形成寡核苷酸识别非标准碱基对,实现中性pH下对双链DNA的高亲和力靶向 | 首次使用人工扩展遗传信息系统(AEGIS)的核碱基扩展三链体识别空间,鉴定12种可互换组合的三元组,在中性pH下以纳摩尔亲和力靶向含有标准、损伤或合成碱基对的双链DNA | 未提及具体局限性 | 扩展三链形成寡核苷酸(TFO)的识别空间,实现对非标准碱基对的序列特异性识别 | 双链DNA中的标准、损伤和合成碱基对 | 分子医学 | NA | 三链形成寡核苷酸(TFO)、Hoogsteen碱基配对、酶促合成 | NA | NA | 120种碱基三元组组合 | NA | NA | NA | 医学、合成生物学、核酸纳米技术 |
| 8 | 2026-07-29 |
Programmable Nucleic Acid Sensing in Human Cells Using Circularizable ssDNA
2026-Jun-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73990-5
PMID:42248894
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研究论文 | 开发了一种名为SONAR的平台,利用可环化单链DNA传感器在人类细胞中检测目标核酸序列并触发可控基因表达 | 首次利用可环化单链DNA传感器在人类细胞中实现程序化核酸感知,并通过细胞连接酶依赖的环化驱动基因表达 | 未提及明显的局限性 | 开发能够在活细胞中感知核酸信号并触发细胞功能的可编程技术 | 人类细胞中的DNA和RNA序列 | 合成生物学 | NA | 可环化单链DNA传感器、反义寡核苷酸、逆转录 | NA | 核酸序列 | NA | NA | 人类细胞 | 核酸传感器电路,通过可环化单链DNA与互补核酸杂交后经细胞连接酶环化驱动基因表达 | 医学, 诊断, 治疗, 合成生物学 |
| 9 | 2026-07-29 |
Synthetic Mirror Bacteria as a Frontier for Chiral Synthetic Biology and Biocontainment
2026-06, MicrobiologyOpen
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/mbo3.70356
PMID:42338029
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综述 | 本文综述了镜像细菌的理论发展,探讨其分子基础、工程策略、生物安全及生态影响 | 系统总结了镜像生物学体系在分子倒置手性下的构建前景,强调了手性层次结构与立体化学约束,并分析了从理论到实验可行性的关键挑战 | 镜像细菌仍停留在理论阶段,尚未实现自我复制的镜像细胞系统,且缺乏实验验证 | 评估镜像细菌的理论可行性及相关生物安全与生态风险 | 镜像细菌及镜像生物分子(镜像蛋白质和镜像核酸) | 合成生物学 | NA | 化学合成(镜像蛋白质和镜像核酸) | NA | NA | NA | NA | NA | 镜像生物系统(手性倒置的生化框架) | 生物安全、生态评估 |
| 10 | 2026-07-27 |
Recombinant Alphaherpesvirus Vectors in Veterinary Vaccinology: Platforms, Applications, and Translational Challenges
2026-Jun-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27135686
PMID:42449959
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综述 | 全面分析用于兽医疫苗学的五种阿尔法疱疹病毒载体平台、应用及转化挑战 | 系统比较了五种阿尔法疱疹病毒载体与传统疫苗平台,重点阐述了从概念验证到多价构型构建的研发进展 | 未提及具体转化障碍分析 | 评估疱疹病毒载体疫苗在动物传染病防控中的潜力 | 五种阿尔法疱疹病毒(牛疱疹病毒1型、伪狂犬病毒、马立克病病毒、马疱疹病毒1型、鸭肠炎病毒) | 机器学习 | 口蹄疫、猪繁殖与呼吸综合征、禽流感、传染性法氏囊病、西尼罗河热 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业 |
| 11 | 2026-07-24 |
Microscopic Fungi as Sources of Natural UV-Protective Compounds
2026-Jun-18, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-026-05005-x
PMID:42310121
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综述 | 综述了2014至2025年间微观真菌产生的具有光保护潜力的代谢物研究,包括黑色素、类菌孢素氨基酸、类胡萝卜素、醌类、呫吨酮和生物碱等 | 强调了微观真菌在光保护代谢物开发中相较于藻类和细菌被忽视的潜力,并整合了真菌代谢物在防晒和皮肤健康方面的多方面功能 | 产量优化、制剂稳定性和监管验证方面仍存在挑战 | 探索微观真菌作为天然紫外防护化合物的可持续和生物相容性来源 | 微观真菌及其产生的光保护代谢物 | 微生物学、生物技术 | 皮肤疾病 | 提取、发酵、合成生物学 | NA | 文本、实验数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 极端真菌、工程酵母 | 光保护代谢物生物合成途径 | 医药、化妆品 |
| 12 | 2026-07-21 |
Enabling Clinical Translation of Oral Probiotics Through Formulation Engineering and Scalable Manufacturing
2026-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70253
PMID:42226613
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综述 | 系统综述了口服益生菌的配方工程和可扩展制造技术,旨在推动其临床转化 | 强调配方工程中功能输出替代单纯结构保护,并整合合成生物学驱动菌株工程与规模化制造平台 | 各技术的临床可行性评估缺乏具体动物或人体数据支持,且综述未涉及剂量优化和长期安全性分析 | 推动口服益生菌从基础研究向临床应用转化,实现精准医疗中安全有效的个性化治疗 | 口服益生菌的配方策略和制造平台技术 | NA | 结直肠癌、炎症性肠病、代谢紊乱、神经炎症疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 口服益生菌 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 13 | 2026-07-21 |
Butyrate-Producing Bacteria in Intestinal Disease Therapy: Potential and Challenges
2026-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70260
PMID:42307077
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综述 | 综述了产丁酸细菌在肠道疾病治疗中的潜在作用和面临的挑战 | 系统整合了产丁酸细菌通过多种机制维持肠道健康的最新认识,并评估了丁酸疗法从炎症性肠病到结直肠癌及新兴应用的转化路径 | 丁酸疗法的转化面临极端氧敏感性、跨界营养网络复杂性以及宿主环境依赖性等关键瓶颈 | 探讨产丁酸细菌在肠道疾病治疗中的应用潜力与挑战 | 产丁酸细菌(包括普拉梭菌、罗斯氏菌属和直肠真杆菌) | 微生物组学 | 炎症性肠病、结直肠癌、辐射损伤、感染、移植物抗宿主病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 人类肠道 | NA | 医学 |
| 14 | 2026-07-21 |
Metabolic and Synthetic Biology Strategies for Enhancing Single-Cell Protein Production in Saccharomyces cerevisiae
2026-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70273
PMID:42345366
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综述 | 本文综述了以酿酒酵母为底盘细胞,利用代谢和合成生物学策略提高单细胞蛋白产量和细胞生物量的方法 | 系统总结了通过代谢工程与合成生物学手段提升酿酒酵母单细胞蛋白含量的最新策略,并强调其在全球粮食安全和碳中和目标中的应用前景 | 未涉及大规模生产的实际成本和产业化挑战评估 | 提高酿酒酵母单细胞蛋白产量以实现可持续规模化生产 | 酿酒酵母作为单细胞蛋白生产的底盘细胞 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | NA | 饲料、食品 |
| 15 | 2026-07-18 |
Exploration of multifunctional characteristics and regulatory mechanism of promoter G-quadruplexes
2026-Jun-26, Pharmacological reviews
IF:19.3Q1
DOI:10.1016/j.pharmr.2026.100151
PMID:42462488
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综述 | 综述启动子G-四链体的多功能特征与调控机制 | 首次提出启动子G-四链体的8大特征(广泛分布、位置特异性、结构多样性、精确调控、遗传可修饰性、动态可逆性、信号响应性及协同调控),并系统总结了其调控因子和表征方法 | 未明确提及局限性 | 系统梳理启动子G-四链体的特性、调控因子、表征方法及其在疾病诊断、生物成像、合成生物学、靶向治疗和抗病毒等方面的应用潜力 | 启动子G-四链体及其调控因子(天然产物、转录因子、小分子配体、核酸等) | 分子生物学, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物成像, 合成生物学 |
| 16 | 2026-07-17 |
Overcoming cellular secretion bottlenecks: advanced secretion engineering and molecular tailoring for next-generation microbial α-amylases with enhanced industrial performance
2026-Jun-22, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05053-2
PMID:42329468
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综述 | 综述了微生物α-淀粉酶重组生产中克服细胞分泌瓶颈的策略,包括信号肽优化、分子伴侣共表达和CRISPR-Cas技术的应用 | 将传统克隆转向设计参数框架,利用人工智能和分子动力学模拟进行理性设计,并结合CRISPR-Cas技术实现精确基因组编辑,达到创纪录的酶产量 | 未明确讨论当前方法的实际工业应用局限,如长期稳定性或成本效益 | 系统分析通过先进分泌工程和分子修饰提升微生物α-淀粉酶工业性能的策略 | α-淀粉酶及其重组生产中涉及的宿主(枯草芽孢杆菌、毕赤酵母、黑曲霉、大肠杆菌) | 合成生物学,蛋白质工程 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌,毕赤酵母,黑曲霉,大肠杆菌 | 信号肽优化,分子伴侣共表达,碳水化合物结合模块融合,代谢途径重构 | 工业生物技术,医药,食品,能源 |
| 17 | 2026-07-17 |
Engineering peroxisomal cofactor systems in Saccharomyces cerevisiae for enhanced biosynthesis of α-humulene
2026-Jun-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05060-3
PMID:42257761
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研究论文 | 通过工程化酿酒酵母过氧化物酶体辅因子系统,实现α-葎草烯的高效生物合成 | 首次系统性地工程化酿酒酵母过氧化物酶体中的辅因子平衡,并通过细胞质-过氧化物酶体双区室工程策略优化合成途径,显著提高了α-葎草烯的产量 | 研究主要关注α-葎草烯的合成,未探讨该策略在其他萜类化合物生物合成中的通用性及放大生产中的稳定性 | 利用合成生物学和代谢工程技术,在酿酒酵母中实现α-葎草烯的高效生物合成 | 酿酒酵母BY4741菌株及工程化菌株产α-葎草烯的过程 | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, ScPEX5*-oPTS1*正交转运系统 | 酿酒酵母 | 过氧化物酶体区室化的甲羟戊酸途径、辅因子代谢循环(CoA循环),通过基因过表达和敲除优化乙酰-CoA供应、NADH可用性及CoA转运 | 工业生物技术 |
| 18 | 2026-07-17 |
Development of Bacillus subtilis cell factories for nutraceuticals production
2026-Jun-06, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05068-9
PMID:42250015
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综述 | 系统总结了利用枯草芽孢杆菌细胞工厂生产营养保健品的研究进展 | 详细比较了合成生物学工具和代谢工程策略在枯草芽孢杆菌中应用的局限性和优势 | 讨论当前挑战和未来研究方向 | 综述枯草芽孢杆菌在营养保健品生物合成中的应用 | 枯草芽孢杆菌细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具、代谢工程策略 | NA | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌 | 营养保健品生物合成途径 | 食品、医药 |
| 19 | 2026-07-17 |
Microbial innovations for climate-resilient agriculture: mechanisms, applications, and emerging technologies
2026-Jun-06, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05031-8
PMID:42250135
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综述 | 综述微生物技术在气候适应型农业中的应用、机制及新兴技术 | 系统整合微生物组工程、合成生物学与人工智能工具,提出精准微生物干预策略 | 未详细讨论微生物技术在实际推广中的技术、生态和社会经济障碍的量化分析 | 探讨微生物创新如何助力建造气候适应型农业,减少农业环境足迹 | 微生物(如菌根真菌)、生物肥料、生物农药及土壤-植物微生物组 | 机器学习 | NA | 宏基因组学, 微生物组工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | 微生物组工程, 合成生物学 | 微生物(如菌根真菌) | 微生物传感器, 代谢通路设计 | 农业, 环境 |
| 20 | 2026-07-15 |
Microbial and synthetic biology solutions for waste management and biomanufacturing off Earth
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103491
PMID:41930789
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综述 | 探讨利用微生物和合成生物学策略将太空废物转化为有价值的资源,以支持可持续发展和减少对地球依赖 | 创新点在于利用工程极端微生物在微重力环境下实现废物分解、生物采矿和生物制造,为建立自给自足的地外栖息地奠定基础 | 未提及具体实验验证或实际应用中的挑战与局限性 | 研究在太空中通过微生物和合成生物学解决废物管理并实现生物制造的可持续方案 | 国际空间站中的废物(包括有机废物、电子废物)以及利用的工程极端微生物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 极端微生物 | 废物分解电路、生物采矿通路、生物制造平台 | 环境, 工业生物技术 |