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当前共找到 157 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-23 |
RATEX: A Scalable RNA-Based Platform for Logical and Multi-Layered Cellular Programming
2026-Jun-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202520600
PMID:42083989
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研究论文 | 介绍了一种名为RATEX的基于RNA的可扩展平台，用于逻辑和多层细胞编程 | 将翻译到转录的转换器与合成RNA调控器集成，创建紧凑且可扩展的RNA编程电路架构，实现了多达6输入的OR逻辑门和混合3输入逻辑门，用于感知多样代谢物和小分子输入 | 尽管展示了广泛的应用，但文中未明确讨论潜在的局限性，如实际细胞环境中的稳定性或长期运行问题 | 开发可扩展的遗传电路，实现细胞内的复杂功能编程 | RNA调控器和RATEX平台在活细胞中的功能验证 | 合成生物学 | NA | RNA调控器、翻译到转录转换 | 逻辑门电路模型 | NA | NA | NA | 未明确指定，但可能涉及大肠杆菌等模式生物 | 逻辑门电路（包括OR门、AND门）、信号级联、代谢物感应电路 | 合成生物学、生物技术 |
| 2 | 2026-06-23 |
Emerging porous materials for cell encapsulation
2026-Jun-22, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00071d
PMID:42132741
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综述 | 从合成生物学和材料科学角度综述细胞@MOF、细胞@COF和细胞@HOF复合材料的最新进展 | 系统总结多孔框架材料封装细胞的合成策略，并整合细胞表面化学与活性评估方法 | 未深入讨论不同框架材料在长期稳定性与免疫原性方面的比较 | 探讨框架材料在合成细胞工程和增强细胞功能中的应用前景与挑战 | 细胞@MOF、细胞@COF、细胞@HOF复合材料 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 多孔框架封装系统（MOF、COF、HOF） | 医学, 工业生物技术, 环境 |
| 3 | 2026-06-23 |
Endogenous constitutive promoters with a broad range of transcriptional activities for plant synthetic biology
2026-Jun-22, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03885-8
PMID:42329465
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研究论文 | 从本氏烟草中鉴定出一系列内源性组成型启动子，它们具有不同强度的转录活性，可作为植物合成生物学中CaMV 35S启动子的可靠替代 | 首次系统表征本氏烟草内源性组成型启动子的定量转录强度，并在多个物种中验证其相对活性的跨物种保留性 | 跨物种分析仅采用原生质体瞬时表达系统，未在稳定转基因植株中验证；玉米中转录活性普遍降低，限制了单子叶植物的应用 | 为植物合成生物学提供具有定量定义的转录强度的内源性组成型启动子资源 | 本氏烟草内源性组成型启动子候选物及其在油菜、辣椒、玉米等异源物种中的活性 | 合成生物学 | NA | GFP报告基因检测，双荧光素酶报告基因检测 | NA | 荧光强度数据 | 多个启动子候选物，在烟草、油菜、辣椒和玉米的原生质体及植物中进行检测 | NA | 本氏烟草，油菜，辣椒，玉米 | 组成型启动子表达系统 | 农业，生物技术 |
| 4 | 2026-06-23 |
Overcoming cellular secretion bottlenecks: advanced secretion engineering and molecular tailoring for next-generation microbial α-amylases with enhanced industrial performance
2026-Jun-22, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05053-2
PMID:42329468
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综述 | 本文综述了克服微生物α-淀粉酶细胞分泌瓶颈的策略，包括信号肽优化、分子伴侣共表达和CRISPR-Cas基因编辑等技术 | 将传统克隆范式转向设计参数框架，结合人工智能和分子动力学模拟进行理性设计，并采用CRISPR-Cas技术实现精确基因组编辑以提升酶产量 | 未提及具体实验验证或比较不同策略的实际效果，缺乏定量分析 | 分析并解决微生物α-淀粉酶生产中的分泌瓶颈，提升其工业性能 | 微生物α-淀粉酶 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌, 毕赤酵母, 黑曲霉, 大肠杆菌 | 信号肽优化, 分子伴侣共表达, 碳水化合物结合模块融合 | 工业生物技术, 医药, 食品 |
| 5 | 2026-06-23 |
Heterologous production of a plant biostimulant in Streptomyces albidoflavus
2026-Jun-20, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13915-w
PMID:42322407
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研究论文 | 本研究通过异源生产平台在Streptomyces albidoflavus中生产植物生物刺激素pteridic acids F和H，并显著提高了产量 | 首次建立pteridic acids (PTA)的功能性异源生产平台，结合Cas12a辅助的精确靶向克隆、CRISPR-Cas9基因组整合和启动子工程，以及基因组规模代谢模型指导的培养基优化，实现超过20倍的产量提升 | 初始异源表达仅产生可检测的elaophylin而非PTA，且经过启动子工程后PTA产量仍低于定量限 | 建立Pteridic acids (PTA)的异源生产平台并优化产量，以开发植物生长促进剂应对非生物胁迫 | Pteridic acids F和H（植物生长促进聚酮化合物） | 合成生物学 | NA | Cas12a辅助精确靶向克隆（CAPTURE）, CRISPR-Cas9, 基因组规模代谢模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Cas12a, Cre-lox重组 | Streptomyces albidoflavus J1074, NBC1270 | PTA生物合成基因簇异源表达系统，包括kasOp*启动子工程 | 农业, 生物技术 |
| 6 | 2026-06-23 |
Chemical Synthesis of Mirror-Image Proteins Reveals Chirality-Dependent Cellular Uptake Mediated by a Cell-Penetrating Peptide
2026-Jun-17, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c03792
PMID:42307060
|
研究论文 | 通过化学合成镜像蛋白，揭示细胞穿透肽介导的手性依赖性细胞摄取 | 首次系统研究了在恒定递送载体下，货物手性对细胞摄取效率的影响 | 未完全阐明手性影响细胞摄取的具体分子机制 | 探究货物手性在细胞穿透肽介导的细胞内化中的作用 | L型和D型构型的三种模型货物，偶联至相同环十精氨酸细胞穿透肽 | 合成生物学 | NA | 化学合成，流式细胞术，凝胶分析，共聚焦显微镜 | NA | 图像，数值数据 | 多种哺乳动物细胞系 | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医学，合成生物学 |
| 7 | 2026-06-23 |
Strategies for enhancing specificity and efficacy of oncolytic viruses in cancer treatment
2026-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110708
PMID:41999961
|
综述 | 综述了增强溶瘤病毒在癌症治疗中特异性和功效的策略 | 系统总结了转录靶向、微小RNA去靶向、病毒进入重定向等多层次逻辑门调控系统，以及免疫调节、纳米包裹、载体细胞运输等最新工程技术进展 | 虽然综述了多种策略，但未讨论这些方法在临床试验中的实际转化障碍或长期安全性数据 | 分析当前溶瘤病毒工程化进展，以解决肿瘤选择性不足和治疗效果有限的问题 | 溶瘤病毒及其工程化改造策略 | 机器学, 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 哺乳动物细胞 | 逻辑门调控系统, 开关, 代谢通路 | 医学 |
| 8 | 2026-06-23 |
Engineering Lactobacillus for therapeutic delivery and biosensing: lessons from niche adaptation
2026-Jun, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2686558
PMID:42288957
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review | 综述了乳酸杆菌的工程化改造及其在治疗递送和生物传感中的应用，重点讨论了其生态位适应机制带来的启示 | 系统总结了乳酸杆菌通过合成生物学工具（如CRISPR-Cas系统）从传统益生菌向多功能治疗递送和生物传感平台转化的最新进展 | 工程化乳酸杆菌的稳定性和法规监管方面仍存在挑战 | 探讨乳酸杆菌作为活体生物治疗产品和生物传感器的工程化应用潜力 | 乳酸杆菌及其工程化改造产物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas, 基因工程, 包囊技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 乳酸杆菌 | 治疗递送系统（重组蛋白、疫苗、细胞因子、靶向酶、多肽），生物传感器（全细胞或无细胞平台检测病原体、毒素、临床生物标志物） | 医学, 食品安全, 环境监测, 诊断 |
| 9 | 2026-06-22 |
A Comprehensive Review on Metabolomics-Guided Metabolite Production in Plant Tissue Culture: Integrating Omics and Synthetic Biology for Enhanced Yields
2026-Jun-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00352
PMID:42301185
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综述 | 本文综述了在植物组织培养中，结合代谢组学与合成生物学及多组学框架，从试错实践转变为预测性系统工程，以提升高价值次生代谢物产量的方法 | 将代谢组学从分析工具提升为核心决策层，连接代谢表型与理性通路设计、遗传干预和过程调控，构建设计-构建-测试-学习循环范式 | 分析覆盖度、培养稳定性和代谢可预测性方面仍存在挑战 | 探讨如何通过代谢组学引导的合成生物学策略，在植物组织培养中实现高产、可扩展和可预测的代谢物生产 | 植物组织培养中的次生代谢产物及相关的代谢网络 | 数字病理学 | NA | 代谢组学, 合成生物学, 多组学整合 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物细胞 | 合成启动子, 模块化基因回路, 异源表达系统 | 医药, 工业生物技术 |
| 10 | 2026-06-22 |
Multilevel Metabolic Engineering of Probiotic Escherichia coli Nissle 1917 for Antibiotic-Free Production of β-Alanine
2026-Jun-10, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00228
PMID:42270566
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研究论文 | 通过对益生菌大肠杆菌Nissle 1917进行多层次的代谢工程改造，实现无抗生素条件下β-丙氨酸的高效生产 | 首次系统研究了TdcC、SstT、SdaC和RhaT四种转运蛋白在β-丙氨酸积累中的作用，并构建了无抗生素菌株，在5升生物反应器中达到60.55 g/L的产量，是目前益生菌生产β-丙氨酸的最高水平 | 尚未提及在工业放大或不同碳源条件下的性能评估 | 通过多层次代谢工程策略，实现益生菌大肠杆菌Nissle 1917无抗生素生产β-丙氨酸 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917中的代谢途径和转运系统 | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 单一菌株在5升生物反应器中多次发酵 | NA | 大肠杆菌Nissle 1917 | 异源关键酶引入、前体L-天冬氨酸双途径强化、竞争途径动态调控、中心代谢重编程、转运系统工程 | 工业生物技术 |
| 11 | 2026-06-21 |
SARGE: Serine Integrase-Assisted Rapid Genome Integration through Cassette Exchange in Escherichia coli
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00334
PMID:42319839
|
research paper | 报道了一种名为SARGE的丝氨酸整合酶辅助快速基因组整合平台，通过盒交换实现大肠杆菌中大型DNA片段的迭代插入 | 结合正交丝氨酸整合酶PhiC31和Bxb1与理性供体质粒设计，支持快速可编程整合循环，无需抗性标记切除；引入双荧光报告系统和绿红筛选策略，实现裸眼菌落直接选择 | 未明确说明，可能涉及宿主范围限制或对非常大型DNA片段效率的潜在下降 | 开发一种简单、可扩展的基因组整合平台，用于大肠杆菌及潜在其他微生物宿主的基因组工程和合成生物学 | 大肠杆菌基因组整合盒交换过程 | synthetic biology | NA | 丝氨酸整合酶辅助盒交换 | NA | NA | 实验中测试的菌落数量未具体说明 | PhiC31整合酶, Bxb1整合酶 | E. coli | 双荧光报告系统（sfGFP和mKate）用于筛选，正交整合酶PhiC31和Bxb1介导的盒交换 | synthetic biology, genome engineering |
| 12 | 2026-06-21 |
Tardigrade-Derived Strategy for Low-Cost Storage of Cell-Free Expression Lysates
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00281
PMID:42319881
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研究论文 | 提出一种利用缓步纲衍生蛋白保护无细胞表达系统在室温干燥条件下保存活性的策略 | 首次利用缓步纲来源的CAHS蛋白作为保护剂，实现无细胞表达系统在低成本室温干燥条件下的稳定储存，无需额外添加剂 | 未详细阐述CAHS蛋白保护机制及长期储存稳定性，且仅验证了单一来源的保护蛋白 | 开发低成本、便携式无细胞表达系统储存方法 | 无细胞表达系统及其生物合成机制 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术、医学 |
| 13 | 2026-06-21 |
The Big Kinship of Proline: Counting Saturated and Unsaturated Secondary Amino Acids of Different Ring Size
2026-Jun-19, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.06.010
PMID:42320729
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研究论文 | 本文对脯氨酸及其他环状二级氨基酸进行数学枚举，统计不同环大小的饱和与不饱和同系物数量 | 提出一种数学枚举程序，用于计算所有可能的环状二级α-氨基酸和亚氨基酸，并给出递推公式和显式公式，结果生成修正的卢卡斯序列 | 仅关注理论枚举，未深入探讨具体化合物的合成可行性或实际应用效果 | 通过数学和计算方法提供环状二级氨基酸的系统性分类和计数，辅助虚拟化合物库构建和化学合成计算机辅助设计 | 不同环大小的饱和与不饱和环状二级α-氨基酸和亚氨基酸 | NA | NA | 数学枚举 | 修正卢卡斯序列 | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术、合成生物学、药理学 |
| 14 | 2026-06-21 |
The critical patch size problem on networks
2026-Jun-19, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109749
PMID:42320745
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研究论文 | 研究强异质网络环境中种群存活的临界斑块大小问题 | 首次在一般图结构中系统研究临界斑块大小问题，推导出谱图参数界以确保线性化算子的主特征值为正 | 主要依赖理论分析和数值模拟，缺乏实际生态数据的验证 | 探究图拓扑结构和汇点分布对种群存活阈值的影响 | 离散格子、多链接格子以及随机网络上的种群动态 | 机器学习 | NA | 图拉普拉斯算子分析 | 非线性动态系统模型 | 图结构数据 | NA | NA | NA | NA | 生态网络、合成生物学、神经退行性疾病传播建模 |
| 15 | 2026-06-21 |
Efficient site-specific gene addition using R2 retrotransposons in tobacco and rice
2026-Jun-19, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03181-6
PMID:42321491
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研究论文 | 本文介绍了一种利用R2逆转录转座子在烟草和水稻中进行高效位点特异性基因添加的方法 | 首次在植物中重建非长末端重复R2逆转录转座子活性，实现无双链断裂的RNA模板化多位点基因整合，效率高达75% | 仅针对rDNA位点进行整合，可能存在位置效应，且转化效率在愈伤组织中最高仅为17% | 开发一种高效、精确的植物基因整合技术，用于作物改良和合成生物学 | 烟草（Nicotiana benthamiana）和水稻（Oryza sativa） | 合成生物学 | NA | R2逆转录转座子、重组RNA病毒介导的供体递送 | NA | NA | 烟草和水稻细胞及愈伤组织，具体数量未明确 | R2逆转录转座子 | 烟草（Nicotiana benthamiana），水稻（Oryza sativa） | 位点特异性基因整合系统（含R2逆转录转座酶和重组酶兼容着陆垫） | 农业, 合成生物学 |
| 16 | 2026-06-21 |
Synergistic dual ring-cleavage pathways enable efficient degradation of chlorobenzenes by Pseudomonas putida BS-1 in groundwater
2026-Jun-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142676
PMID:42320103
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研究论文 | 发现恶臭假单胞菌BS-1中一种新型协同双环裂解途径，可有效降解地下水中的氯苯类污染物 | 首次揭示一种由质粒携带的tod-clc基因簇介导的邻位和间位裂解途径协同作用机制，能够快速解毒中间代谢产物氯代儿茶酚 | 研究主要基于单一菌株和实验室条件，未评估长期现场应用中的稳定性和生态影响 | 阐明氯苯类化合物生物降解过程中氯代儿茶酚解毒的新机制，并提供用于地下水修复的微生物资源 | 恶臭假单胞菌BS-1菌株及其降解对二氯苯、氯苯和苯的代谢途径 | 环境微生物学 | NA | 基因敲除、异源表达、代谢产物分析 | NA | 实验数据 | 单一菌株BS-1，以及实际受污染地下水样本（含p-DCB 6.83 mg·L⁻¹和o-DCB 13.31 mg·L⁻¹） | NA | 恶臭假单胞菌 | 由tod-clc基因簇编码的邻位和间位双环裂解途径 | 环境修复 |
| 17 | 2026-06-20 |
Repurposing the Diatom Periplastidial Compartment for Heterologous Terpenoid Production
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00919
PMID:42101919
|
研究论文 | 通过系统分析硅藻中不同细胞区室的萜类合成能力，提出周质体腔（PPC）作为可工程化的细胞内空间用于异源萜类生产 | 首次系统评估硅藻周质体腔（PPC）作为工程化细胞区室的萜类合成潜力，揭示其与MVA和MEP途径的代谢交换界面 | 未提及大规模生产或工业应用验证，需进一步优化工程策略 | 探索硅藻周质体腔（PPC）用于异源萜类生产的可行性与工程化潜力 | 硅藻周质体腔（PPC）、细胞质、叶绿体中的萜类合酶靶向表达 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 代谢物定量数据 | 未明确样本数量 | NA | 硅藻 | 萜类合成代谢途径（包括半萜、单萜、倍半萜和四萜的合酶靶向表达） | 工业生物技术 |
| 18 | 2026-06-20 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00171
PMID:42112575
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research paper | 提出了一种用于评估合成基因电路性能的线性混合效应模型 | 首次应用线性混合效应模型来统计评估布尔逻辑门性能，并提供可量化的固定效应点估计β̂作为门行为的统一描述符 | 对多输入多输出逻辑的扩展验证尚需更多实验数据支撑 | 标准化合成基因电路统计评估方法 | 合成基因电路中的布尔逻辑门 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型, 蒙特卡洛模拟, k-means聚类 | 线性混合效应模型, k-means | 模拟数据与实验数据 | 144个已发表布尔逻辑门 | NA | NA | 布尔逻辑门（OR、AND等） | 合成生物学应用（计算、生物传感、人类健康） |
| 19 | 2026-06-20 |
Temporal Programming of Cell-Free Transcription Using Orthogonal Enzyme-Responsive DNA Blockers
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00147
PMID:42137991
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研究论文 | 设计正交的酶驱动DNA转录定时器，实现无细胞转录的时间延迟精确编程 | 利用正交酶响应性DNA阻断链，通过选择性酶切实现多个转录模板的独立时间控制，并展示下游Cas12a活性的时序调控 | 未明确提及，但可能涉及阻断链设计与酶特异性的进一步优化 | 建立无细胞合成生物学中时间分辨转录和基因表达的通用框架 | 正交酶响应性DNA阻断链、RNase H、尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG)和甲酰胺嘧啶DNA糖基化酶(Fpg)等酶 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录、酶切动力学调控 | NA | 转录时间曲线数据 | NA | DNA阻断链设计、酶驱动定时器 | 无细胞系统 | 基于DNA阻断链的转录定时器、Cas12a酶切活性调控回路 | 合成生物学、生物技术 |
| 20 | 2026-06-20 |
Streptomyces Autoregulator Biosensors from Natural Product Cluster-Situated Regulators
2026-Jun-19, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00061
PMID:42117380
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研究论文 | 开发了八种基于簇定位调节因子的自诱导物生物传感器，并探索其在合成生物学中的应用 | 首次将多个预测的群体感应自诱导物回路工程化为可诱导表达系统，并验证了生物传感器间的正交性和共培养能力 | 未提及 | 开发基于链霉菌自诱导物的生物传感器，用于天然产物调控机制研究和合成生物学应用 | 链霉菌中的簇定位调节因子及其自诱导物配体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 八种生物传感器，多种配体浓度测试 | NA | 链霉菌属 | 群体感应调控回路、正交信号系统、多输入遗传电路 | 工业生物技术 |