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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-06-20 |
Special Issue on Mammalian Cell Synthetic Biology
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00447
PMID:42317055
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2026-06-19 |
Bacteria as anticancer agents: bioactive metabolites, engineered platforms, and translational mechanisms
2026-Jun-12, Letters in applied microbiology
IF:2.0Q4
DOI:10.1093/lambio/ovag050
PMID:42240519
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综述 | 本文综述了细菌作为抗癌剂的潜力,包括其产生的生物活性代谢物、工程化平台及转化机制 | 系统总结了细菌来源的多种生物活性代谢物及其抗癌机制,并结合宏基因组学、基因组挖掘和合成生物学技术,突出了工程化细菌平台在肿瘤靶向治疗中的创新应用 | 尽管具有前景,但细菌衍生物在毒性、产量、选择性和临床转化方面仍存在挑战 | 探讨细菌衍生物在抗癌治疗中的现状与未来发展方向 | 细菌及其产生的生物活性代谢物和相关工程化平台 | NA | 癌症 | 宏基因组学, 基因组挖掘, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌(放线菌、芽孢杆菌、假单胞菌、海洋来源菌等) | 工程化细菌平台(选择性定植肿瘤、递送治疗分子、激活前药疗法) | 医学 |
| 83 | 2026-06-19 |
Engineered suppressor tRNAs enable precise translational control of genetic circuits in E. coli
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag623
PMID:42312487
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研究论文 | 通过工程化携带标准氨基酸的抑制性tRNA,在大肠杆菌中实现遗传电路的精确翻译调控 | 首次系统筛选了20种抑制性tRNA变体,明确了tRNA反密码子与琥珀终止密码子相似性决定翻译通读效率的设计规律,并展示了其在生物传感器和代谢工程中的应用 | 未探讨在多种宿主或复杂环境中的普适性;长期稳定性及脱靶效应未被评估 | 开发用于遗传电路精确正交翻译调控的工程化抑制性tRNA工具 | 大肠杆菌中的抑制性tRNA及其对遗传电路的调控效果 | 合成生物学 | NA | 抑制性tRNA工程化、糖酵解通量动态平衡 | NA | NA | 20种tRNA变体;涉及LacI生物传感器和代谢工程菌株 | 抑制性tRNA | 大肠杆菌 | LacI生物传感器、代谢通路(pykA/pykF调控)用于N-乙酰神经氨酸增产 | 工业生物技术、医学 |
| 84 | 2026-06-19 |
Untapped microbial factories for next-generation therapeutics: Endophytic fungi of medicinal plants
2026-Jun-04, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03036-4
PMID:42243878
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综述 | 本文综述了药用植物内生真菌作为下一代治疗药物可持续来源的潜力 | 强调了多组学技术、合成生物学与生物技术工具在解锁内生真菌生物合成潜力中的整合应用 | 低产量、沉默基因簇及大规模生产困难仍是主要障碍 | 探索药用植物内生真菌作为下一代治疗药物生物工厂的潜力 | 药用植物内生真菌及其产生的次生代谢产物 | NA | NA | OSMAC, 共培养, 表观遗传修饰, 基因组学, 转录组学, 代谢组学 | NA | NA | NA | NA | 药用植物 | NA | 医药 |
| 85 | 2026-06-19 |
Beyond Tanacetum cinerariifolium: Advances in Pyrethrins Biosynthesis and Prospects for Engineered Cell Factories
2026-Jun, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01549-8
PMID:41485148
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综述 | 本文综述了除虫菊酯生物合成的最新进展,并探讨了利用合成生物学和代谢工程构建工程细胞工厂以实现其可持续生产的可能性 | 将除虫菊酯生产从传统花卉种植转向工程细胞工厂的新思路,总结了关键酶的发现与异源合成进展 | 异源合成仍面临代谢路径瓶颈和工程技术挑战,具体解决方略尚需进一步验证 | 探索除虫菊酯的异源生物合成途径,并利用工程细胞工厂实现规模化、可持续生产 | 除虫菊酯及其生物合成途径中的关键酶和代谢路径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 工程微生物、酵母 | 除虫菊酯生物合成途径 | 农业、环境 |
| 86 | 2026-06-19 |
A review on Mitragyna alkaloids pharmacology, biosynthesis and biotechnological insights
2026-Jun, Journal, genetic engineering & biotechnology
DOI:10.1016/j.jgeb.2026.100710
PMID:42309612
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综述 | 综述九种帽柱木属植物的民族植物学、药理特性、植物化学组成及生物技术方法 | 更新了2022至2024年间九种帽柱木属植物的研究,并全面回顾了其植物生物技术方法及吲哚生物碱的代谢工程和合成生物学进展 | NA | 总结帽柱木属植物的药理特性、生物合成途径及生物技术应用,以促进可持续的药用化合物生产 | 九种帽柱木属植物(美丽帽柱木、多裂帽柱木、托叶帽柱木等)及其次生代谢产物如帽柱木碱、钩藤碱和异钩藤碱 | NA | 心血管疾病、神经系统疾病、消化系统疾病 | 植物生物技术(培养基操控、前体喂饲、植物生长调节、诱导),代谢工程,合成生物学 | NA | 文献综述数据 | NA | 代谢工程, 合成生物学 | 帽柱木属植物 | 吲哚生物碱生物合成途径 | 医药 |
| 87 | 2026-06-18 |
Assembling a True "Olympic Gel" From over 16 000 Combinatorial DNA Rings
2026-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202520549
PMID:41789447
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研究论文 | 报告从超过16 000个组合DNA环成功组装真正的奥运凝胶,并表征其遗传、机械和结构特性 | 首次从大规模组合DNA环库成功组装具有独特力学和溶胀特性的奥运凝胶,结合聚合物物理、合成生物学和DNA纳米技术创建新型材料平台 | 未明确提及,但可能涉及奥运凝胶的实际应用规模化挑战 | 实现从DNA环组装真正的奥运凝胶并研究其网络拓扑对宏观材料性质的影响 | 超过16 000个不同序列的DNA环 | 合成生物学 | NA | 下一代测序, 振荡流变学, 原子力显微镜, 冷冻电子显微镜, 大规模计算模拟 | NA | 序列数据, 图像, 机械特性数据 | 超过16 000个独特DNA环分子 | 酶促活化, 分子内环化 | NA | DNA环库, 网络拓扑设计 | 生物材料, 仿生系统, 软物质物理 |
| 88 | 2026-06-17 |
Empirical evaluation of all unique Cas9 protospacers in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA design
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag548
PMID:42258532
|
研究论文 | 系统评估大肠杆菌中463,000个独特gRNA的Cas9活性,发现93%以上功能正常,仅0.3%无效 | 首次大规模实证验证大肠杆菌中几乎所有独特gRNA均具有功能性,并揭示无效gRNA的间隔区自相互作用规律,提出简单设计规则和修复方法 | 研究仅限于大肠杆菌K12 MG1655菌株,未扩展至其他细菌种类 | 评估大肠杆菌中Cas9 gRNA的特异性与功能性,解决现有研究中关于无效gRNA比例的争议 | 463,000个独特gRNA在大肠杆菌K12 MG1655基因组上的活性 | 计算生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 序列数据 | 463,000个独特gRNA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 89 | 2026-06-16 |
Substrate Specificity of B12-Depedent Ribonucleotide Reductases: Biotechnology and Metabolic Implications
2026-Jun-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500344
PMID:42290402
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研究论文 | 研究了两类热稳定性核糖核苷酸还原酶对多种天然和非天然核苷酸的底物特异性,评估其生物技术应用潜力 | 首次系统性地研究了核糖核苷酸还原酶对非经典核苷酸的底物特异性,发现酶倾向于转化带有修饰官能团的核苷碱基底物,揭示了生物技术和合成生物学应用中的潜力与限制 | 仅聚焦于两种热稳定性RNR,未涵盖其他来源或类型的RNR;对非天然核苷酸的转化效率及体内应用验证不足 | 探索核糖核苷酸还原酶的底物混杂性及其在生物技术中的应用潜力,同时增进对天然核苷酸代谢的理解 | 两种热稳定性核糖核苷酸还原酶及其对多种天然和非天然核苷酸的转化 | 合成生物学 | NA | 酶活性测定、底物特异性分析 | NA | 实验数据(酶动力学参数) | 两种热稳定性核糖核苷酸还原酶,测试了多种核苷酸底物 | NA | NA | NA | 生物技术、合成生物学 |
| 90 | 2026-06-16 |
Transplantation of encapsulated fecal microbiota: research progress and future trends
2026-Jun-13, World journal of pediatrics : WJP
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s12519-026-01056-z
PMID:42288685
|
综述 | 综述了封装粪便微生物群移植的研究进展与未来趋势,从经验性转移向工程化生物治疗转变 | 强调封装FMT作为活性生物治疗产品的关键制剂,推动从全群落微生物制剂向合成生物学创新的转变 | 缺乏大规模随机对照试验,尤其是儿科研究;监管定义不一致且国际指南尚未建立 | 总结封装FMT的研究进展和监管挑战,探索未来发展方向以提升标准化和个性化治疗 | 封装粪便微生物群移植的临床研究,包括成人和儿科患者 | NA | 肠道疾病,复发性艰难梭菌感染 | 封装技术 | NA | 文献和数据综合 | NA | NA | 人类肠道微生物群 | NA | 医学 |
| 91 | 2026-06-16 |
Enhancing small-molecule-mediated translational control through multivalent RNA aptamers
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag592
PMID:42273917
|
研究论文 | 提出一种基于多价RNA适配体的通用平台,通过剪接调控显著增强小分子介导的翻译控制 | 通过多价适配体设计,将弱适配体(如茶碱或四环素适配体)的诱导水平从不足10倍提升至超过100倍,实现超过一个数量级的改进,并实现多路复用和正交控制 | 未明确说明局限性,可能依赖特定配体-适配体对的优化 | 开发一种通用且可适应的RNA平台,扩展小分子调控蛋白表达的工具箱 | 小分子RNA开关及多价适配体设计 | 合成生物学 | NA | RNA适配体设计、替代剪接调控 | NA | NA | NA | NA | NA | 多价适配体电路,增强配体响应性蛋白表达 | 合成生物学, 医学 |
| 92 | 2026-06-16 |
Cascading recombinase memory switch for programmable and stable gene expression in Pseudomonas putida
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag589
PMID:42268684
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研究论文 | 在恶臭假单胞菌中构建基于整合酶的级联触发开关,实现稳定可控的基因表达 | 首次在非模式细菌恶臭假单胞菌中设计并验证整合酶级联记忆开关,通过串联正交T7 RNA聚合酶系统扩展输出模块性,并应用于连续生物工艺中的催化生物膜控制 | 研究未长期评估开关在复杂工业环境中的稳定性,且当前设计依赖特定诱导物鼠李糖 | 开发可在工业相关微生物中稳定工作的遗传记忆开关,用于生物过程调控 | 恶臭假单胞菌中的基因表达开关系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学遗传电路设计 | NA | NA | NA | Bxb1丝氨酸整合酶 | 恶臭假单胞菌 | 级联触发开关,包含鼠李糖诱导模块、Bxb1整合酶驱动的翻转开关、正交T7 RNA聚合酶基因及PT7驱动的目标模块 | 工业生物技术 |
| 93 | 2026-06-15 |
Programmable AND-gate strategy to reduce false positives in rolling circle amplification
2026-Jun-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118515
PMID:41707426
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研究论文 | 引入AND门布尔逻辑的多钥匙滚环扩增技术,通过检测多个核酸序列作为扩增前提来降低假阳性率 | 首次将AND门布尔逻辑策略应用于滚环扩增,通过多序列检测显著减少假阳性,并在单核苷酸多态性检测中实现高特异性 | 未明确提及,但可能涉及多输入AND门在复杂样本中的扩展性或长期稳定性验证不足 | 开发一种低假阳性率的核酸生物传感器,适用于即时检测场景 | 核酸序列(DNA和RNA)的检测与扩增 | 合成生物学 | NA | 滚环扩增 | NA | 核酸序列数据 | NA | NA | NA | AND门布尔逻辑电路 | 医学诊断 |
| 94 | 2026-06-15 |
Advances in biocontainment strategies of engineered microbes for use in humans
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102727
PMID:41780106
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综述 | 综述了用于人体的工程微生物的生物遏制策略进展 | 全面总结了多种生物遏制策略及其在临床中的应用与局限性,并强调了标准化测试的必要性 | 未提供具体实验数据或案例分析的细节,仅基于现有文献进行讨论 | 探讨用于生物医学应用的工程微生物的生物遏制策略的现状和未来方向 | 工程微生物及其生物遏制策略 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 毒素-抗毒素系统、自杀开关、营养缺陷型、基于CRISPR的靶向DNA降解、非标准氨基酸、物理屏障 | 医学 |
| 95 | 2026-06-15 |
Engineering a Virus-Derived X Family DNA Polymerase FvPolX for de novo DNA Synthesis
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75017
PMID:41915827
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研究论文 | 报道并理性工程化了一种病毒来源的X家族DNA聚合酶FvPolX,用于从头DNA合成 | 首次发现并改造了微生物来源的X家族DNA聚合酶FvPolX,显著提升其催化活性,并构建了最小功能化突变体s149FvPolX,拓宽了从头DNA合成的酶工具箱 | 当前研究仅局限于FvPolX酶活性优化,缺乏对更长片段合成、保真度及体内应用的深入验证 | 开发高效、多样化的从头DNA合成酶,克服现有动物来源TdT酶的限制 | Faustovirus来源的X家族DNA聚合酶FvPolX及其工程化变体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 从头DNA合成酶 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 96 | 2026-06-14 |
Exploiting conformational changes in a caffeine aptamer to engineer synthetic RNA devices
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag584
PMID:42273912
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研究论文 | 通过选择咖啡因结合适体并工程改造为合成RNA装置,克服了传统筛选方法在构象转换适体上的局限性 | 采用RNA Capture-SELEX和体内筛选选择了咖啡因结合适体,并通过新型光流控筛选和直接嫁接方法,实现了该适体在核糖开关、核酶和荧光适体传感器中的模块化整合 | 在哺乳动物细胞中,核酶筛选仍面临通量和序列-功能挑战 | 拓展构象转换适体的可用性,推动RNA装置在合成生物学中的应用 | 咖啡因结合适体及其在RNA装置中的模块化整合 | 合成生物学 | NA | RNA Capture-SELEX, 体内筛选, 光流控筛选 | NA | RNA序列 | 多个咖啡因结合适体候选分子 | NA | 酿酒酵母, 哺乳动物细胞 | 核糖开关, 核酶, 荧光iSpinach适体传感器 | 合成生物学, 分子传感, 细胞调控 |
| 97 | 2026-06-14 |
Deep Learning-Guided Reverse Translation Enhances Soluble Expression of Recombinant Proteins in Escherichia coli
2026-Jun-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27115131
PMID:42278656
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研究论文 | 开发了一个结合同义密码子生成模型和基因表达水平预测模型的深度学习框架,用于提高重组蛋白在大肠杆菌中的可溶性表达 | 提出了一种核心回避密码子优化策略,通过深度学习引导的反向翻译显著提升异源蛋白的可溶性表达 | NA | 设计DNA序列以保证高可溶性表达,并理解DNA序列与蛋白质表达之间的关系 | α-葡聚糖磷酸化酶和异淀粉酶两种工业酶 | 机器学习 | NA | 深度学习、基因表达预测 | SCG模型、GELP模型 | 基因组数据、基因表达数据 | 两种酶各进行多次实验(αGP 3次,IA 4次) | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 98 | 2026-06-13 |
Recent developments in intein-mediated protein splicing and their applications in bioengineering
2026-Jun-09, Current protein & peptide science
IF:1.9Q4
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综述 | 综述内含子介导的蛋白质剪接最新进展及其在生物工程中的应用 | 系统总结了内含子在结构多样性、催化机制和可控性方面的工程化改进,以及条件型内含子在合成生物学中的新兴应用,并指出了计算设计、高通量筛选和人工智能整合的未来方向 | 仍存在剪接不完全、外显子兼容性问题以及上下文依赖效率等限制其广泛应用的挑战 | 全面概述内含子生物学、分类和机制,并讨论其在生物技术和生物医学中的应用进展、挑战与未来机遇 | 内含子及其工程化变体 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 内含子工程改造 | NA | 条件型内含子、蛋白质剪接系统 | 生物技术、生物医学 |
| 99 | 2026-06-13 |
Small but Mighty: The Surprising Metabolic Range of a Bacterial Microcompartment
2026-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.05.730297
PMID:42282558
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研究论文 | 通过在大肠杆菌中异源表达丙二醇利用操纵子,研究细菌微区室的代谢多功能性,并展示其在底物利用和生物技术中的应用潜力 | 首次证实异源表达的Pdu细菌微区室具有底物杂泛性,可处理C2至C5的二醇和三醇,并通过酶工程将底物范围扩展至1,2-戊二醇,为塑料回收和高价值化合物合成提供新途径 | 氧气抑制1,2-丙二醇利用,虽在微氧条件下缓解,但可能限制某些需氧应用;目前主要在模式菌株大肠杆菌中验证,其他宿主适用性未评估 | 研究细菌微区室的代谢多功能性及其在合成生物学中的调控潜力 | 大肠杆菌中异源表达的Pdu细菌微区室 | 合成生物学,代谢工程 | NA | 分子动力学模拟,染色体整合,同源重组,诱变 | NA | 代谢数据,分子动力学模拟数据 | 单个大肠杆菌工程菌株及多种底物测试 | CRISPR-Cas9,同源重组 | 大肠杆菌 | Pdu细菌微区室代谢模块 | 工业生物技术,塑料回收 |
| 100 | 2026-06-13 |
Combining model-based and data-driven models: An application to synthetic biology resource competition
2026-Jun, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109649
PMID:41791590
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研究论文 | 探索机器学习与机理模型在合成生物学资源竞争问题中的融合,提出部分不确定模型结构和嵌入式物理信息神经网络方法 | 提出部分不确定模型结构概念以防机器学习忽略机理约束,引入嵌入式物理信息神经网络方法,无缝融合机器学习和机理模型组件 | 机理模型构建劳动密集且依赖简化假设,机器学习可能忽视机理信息导致过拟合或可解释性降低 | 通过融合机器学习和机理模型实现更鲁棒的预测、增强系统洞察并改进对稀疏或噪声数据的处理 | 合成生物学中因资源共享导致基因电路意外行为的基因网络模型 | 机器学习 | NA | NA | 物理信息神经网络 | NA | NA | NA | NA | 基因电路 | 合成生物学 |