合成生物学相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
81 2026-06-20
Diterpene Synthases as Gatekeepers of Bioactive Diterpenoids: A Resource for Discovery and Engineering toward Efficient Synthesis
2026-Jun-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
综述 该文章综述了二萜合酶在生物活性二萜类化合物合成中的关键作用,并建立了一个包含562个功能表征二萜合酶的数据库,为通过合成生物学和代谢工程高效生产二萜类化合物提供了资源 首次建立了一个包含562个功能表征二萜合酶的综合性功能数据库,并通过整合生物信息学分析阐明了不同功能类别二萜合酶的催化机制、产物多样性及系统发育分布,为二萜合酶作为合成生物学核心功能元件的开发提供了新方向 未提及具体局限性,但可能包括数据库的更新频率、部分二萜合酶功能验证的局限性以及实际工业生产中面临的产量和纯度挑战 总结代表性二萜类化合物的生物活性和应用,建立功能二萜合酶数据库,并探讨二萜合酶作为合成生物学核心功能元件的未来发展方向 二萜合酶和二萜类化合物 机器学习和数字病理学之外的合成生物学与代谢工程领域 不适用 合成生物学、代谢工程、生物信息学分析 不适用 序列和功能数据(562个功能表征的二萜合酶) 562个功能表征的二萜合酶 不适用 微生物细胞工厂(具体未指定,如大肠杆菌、酿酒酵母等) 二萜类化合物生物合成途径 医药、农业、化妆品、食品
82 2026-06-20
Evaluating DNA Function Understanding in Genomic Language Models Using Evolutionarily Implausible Sequences
2026-Jun-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 提出Nullsettes评估框架,测试基因组语言模型对合成表达盒中功能丧失突变的预测能力 通过进化上不可信的序列设计,区分模型对序列功能的理解与对天然基因组模式的记忆 未能检测到强功能丧失突变,预测准确性严重依赖进化模式匹配而非基因表达机制理解 评估基因组语言模型对DNA序列功能的理解程度 合成表达盒中的功能丧失突变序列 机器学习 NA 基因组语言模型 Transformer DNA序列 NA NA NA NA 合成生物学
83 2026-06-20
Engineering Protein Stability with Small Molecules: A Review of the ecDHFR Destabilizing Domain System
2026-Jun-19, ACS chemical biology IF:3.5Q2
综述 综述了大肠杆菌二氢叶酸还原酶去稳定域系统通过配体诱导稳定化实现条件性蛋白控制的机制与应用 从翻译后调控层面系统总结了ecDHFR-DD系统的机制、性能及跨物种优化,并提出了在害虫及媒介控制等应用生物学中的新方向 未提及具体实验验证或定量比较与其他系统的性能差异 综合评估ecDHFR-DD系统在条件性蛋白调控中的优势与局限,并展望其跨学科应用潜力 ecDHFR去稳定域系统及其在酵母、无脊椎动物模型和哺乳动物细胞中的应用 合成生物学 NA ecDHFR-DD系统 NA NA NA Trimethoprim, 大肠杆菌二氢叶酸还原酶去稳定域 酵母、无脊椎动物、哺乳动物细胞 配体诱导稳定化的去稳定域电路 功能基因组学、合成生物学、生物医学研究、害虫及媒介管理
84 2026-06-20
Engineered Probiotics Protect against Pseudomonas aeruginosa Post Antibiotic Exposure
2026-Jun-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 开发基于工程化大肠杆菌Nissle 1917的模块化可编程益生菌策略,整合代谢物补充与抗原特异性黏膜免疫,在抗生素暴露后预防铜绿假单胞菌感染 首次将代谢物补充(丁酸)与抗原特异性黏膜免疫模块整合于同一益生菌平台,实现独立模块的灵活组合与协同保护 仅在抗生素暴露后的小鼠模型中验证,尚未评估在无菌动物或人类中的效果 开发一种抗生素暴露后恢复微生物稳态并激发黏膜免疫的益生菌策略,用于预防铜绿假单胞菌感染 抗生素暴露后的小鼠模型 合成生物学 铜绿假单胞菌感染 NA NA NA 小鼠模型(具体数量未说明) CRISPR-Cas9 大肠杆菌Nissle 1917 (EcN) 丁酸过量生产模块、外膜囊泡展示PcrV或OprL抗原模块 医学
85 2026-06-20
Special Issue on Mammalian Cell Synthetic Biology
2026-Jun-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
86 2026-06-20
ROS-responsive bio-hybrid probiotics for synergistic acute lung injury therapy
2026-Jun-11, Colloids and surfaces. B, Biointerfaces
研究论文 报道一种双功能工程化副干酪乳杆菌,通过合成生物学和响应性材料修饰,实现急性肺损伤的协同治疗 首次将细胞因子免疫调节与微环境响应性抗氧化功能结合于单一益生菌平台,并通过合成生物学与材料工程的协同设计提升治疗效果 尚缺乏长期安全性评估及在人源模型中的验证 开发一种针对急性肺损伤的工程益生菌治疗策略,实现靶向递送、免疫调节和氧化应激缓解 急性肺损伤小鼠模型及人肺相关细胞 合成生物学 急性肺损伤 合成生物学、材料表面修饰、代谢组学 NA 代谢组学数据 LPS和铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤小鼠模型(具体数量未说明) NA 副干酪乳杆菌 分泌白细胞介素-4的基因回路,及ROS响应性表面修饰 医学
87 2026-06-19
Bacterial Laccase: Recent Advances in Production, Engineering Strategies, and Diagnostic Applications
2026-Jun-18, Biotechnology and bioengineering IF:3.5Q2
综述 综述了细菌漆酶在近十年内的生产技术、工程策略及诊断应用方面的研究进展 系统分析了合成生物学如何克服异源表达的历史限制,并探讨了定向进化、理性设计、翻译后修饰及计算建模增强漆酶催化性能的方法 NA 评估细菌漆酶从实验室研究向实际生物催化剂转化的进展,并指出剩余挑战和未来研究方向 细菌漆酶 NA NA 定向进化,理性设计,翻译后修饰,计算建模 NA NA 超过120篇同行评审论文 合成生物学,异源表达 大肠杆菌,枯草芽孢杆菌 NA 环境监测,工业加工,医学诊断
88 2026-06-19
Bacteria as anticancer agents: bioactive metabolites, engineered platforms, and translational mechanisms
2026-Jun-12, Letters in applied microbiology IF:2.0Q4
综述 本文综述了细菌作为抗癌剂的潜力,包括其产生的生物活性代谢物、工程化平台及转化机制 系统总结了细菌来源的多种生物活性代谢物及其抗癌机制,并结合宏基因组学、基因组挖掘和合成生物学技术,突出了工程化细菌平台在肿瘤靶向治疗中的创新应用 尽管具有前景,但细菌衍生物在毒性、产量、选择性和临床转化方面仍存在挑战 探讨细菌衍生物在抗癌治疗中的现状与未来发展方向 细菌及其产生的生物活性代谢物和相关工程化平台 NA 癌症 宏基因组学, 基因组挖掘, 合成生物学 NA NA NA NA 细菌(放线菌、芽孢杆菌、假单胞菌、海洋来源菌等) 工程化细菌平台(选择性定植肿瘤、递送治疗分子、激活前药疗法) 医学
89 2026-06-19
Engineered suppressor tRNAs enable precise translational control of genetic circuits in E. coli
2026-Jun-08, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 通过工程化携带标准氨基酸的抑制性tRNA,在大肠杆菌中实现遗传电路的精确翻译调控 首次系统筛选了20种抑制性tRNA变体,明确了tRNA反密码子与琥珀终止密码子相似性决定翻译通读效率的设计规律,并展示了其在生物传感器和代谢工程中的应用 未探讨在多种宿主或复杂环境中的普适性;长期稳定性及脱靶效应未被评估 开发用于遗传电路精确正交翻译调控的工程化抑制性tRNA工具 大肠杆菌中的抑制性tRNA及其对遗传电路的调控效果 合成生物学 NA 抑制性tRNA工程化、糖酵解通量动态平衡 NA NA 20种tRNA变体;涉及LacI生物传感器和代谢工程菌株 抑制性tRNA 大肠杆菌 LacI生物传感器、代谢通路(pykA/pykF调控)用于N-乙酰神经氨酸增产 工业生物技术、医学
90 2026-06-19
Untapped microbial factories for next-generation therapeutics: Endophytic fungi of medicinal plants
2026-Jun-04, Microbial cell factories IF:4.3Q1
综述 本文综述了药用植物内生真菌作为下一代治疗药物可持续来源的潜力 强调了多组学技术、合成生物学与生物技术工具在解锁内生真菌生物合成潜力中的整合应用 低产量、沉默基因簇及大规模生产困难仍是主要障碍 探索药用植物内生真菌作为下一代治疗药物生物工厂的潜力 药用植物内生真菌及其产生的次生代谢产物 NA NA OSMAC, 共培养, 表观遗传修饰, 基因组学, 转录组学, 代谢组学 NA NA NA NA 药用植物 NA 医药
91 2026-06-19
Beyond Tanacetum cinerariifolium: Advances in Pyrethrins Biosynthesis and Prospects for Engineered Cell Factories
2026-Jun, Molecular biotechnology IF:2.4Q3
综述 本文综述了除虫菊酯生物合成的最新进展,并探讨了利用合成生物学和代谢工程构建工程细胞工厂以实现其可持续生产的可能性 将除虫菊酯生产从传统花卉种植转向工程细胞工厂的新思路,总结了关键酶的发现与异源合成进展 异源合成仍面临代谢路径瓶颈和工程技术挑战,具体解决方略尚需进一步验证 探索除虫菊酯的异源生物合成途径,并利用工程细胞工厂实现规模化、可持续生产 除虫菊酯及其生物合成途径中的关键酶和代谢路径 合成生物学 NA 合成生物学、代谢工程 NA NA NA CRISPR-Cas9 工程微生物、酵母 除虫菊酯生物合成途径 农业、环境
92 2026-06-19
A review on Mitragyna alkaloids pharmacology, biosynthesis and biotechnological insights
2026-Jun, Journal, genetic engineering & biotechnology
综述 综述九种帽柱木属植物的民族植物学、药理特性、植物化学组成及生物技术方法 更新了2022至2024年间九种帽柱木属植物的研究,并全面回顾了其植物生物技术方法及吲哚生物碱的代谢工程和合成生物学进展 NA 总结帽柱木属植物的药理特性、生物合成途径及生物技术应用,以促进可持续的药用化合物生产 九种帽柱木属植物(美丽帽柱木、多裂帽柱木、托叶帽柱木等)及其次生代谢产物如帽柱木碱、钩藤碱和异钩藤碱 NA 心血管疾病、神经系统疾病、消化系统疾病 植物生物技术(培养基操控、前体喂饲、植物生长调节、诱导),代谢工程,合成生物学 NA 文献综述数据 NA 代谢工程, 合成生物学 帽柱木属植物 吲哚生物碱生物合成途径 医药
93 2026-06-18
Superfolder Green Fluorescent Protein (sfGFP): A Versatile Tool for Biotechnology Research
2026-Jun-17, Applied biochemistry and biotechnology IF:3.1Q2
综述 综述超折叠绿色荧光蛋白(sfGFP)作为生物技术研究通用工具的特性、优势及局限性 指出sfGFP的核心价值不在于亮度和光稳定性普遍优越,而在于能在传统GFP变体折叠或性能受损的条件下维持荧光 荧光对pH敏感、单体行为依赖背景、光稳定性未优化,需根据应用需求选择并与其他新型GFP比较 评估sfGFP在生物技术研究中的多功能应用潜力及其适用场景 超折叠绿色荧光蛋白(sfGFP)及其在不同生物技术系统中的应用 生物技术 NA 蛋白质工程, 荧光蛋白工程 NA NA NA NA NA NA 生物技术, 合成生物学, 蛋白质设计
94 2026-06-18
Assembling a True "Olympic Gel" From over 16 000 Combinatorial DNA Rings
2026-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
研究论文 报告从超过16 000个组合DNA环成功组装真正的奥运凝胶,并表征其遗传、机械和结构特性 首次从大规模组合DNA环库成功组装具有独特力学和溶胀特性的奥运凝胶,结合聚合物物理、合成生物学和DNA纳米技术创建新型材料平台 未明确提及,但可能涉及奥运凝胶的实际应用规模化挑战 实现从DNA环组装真正的奥运凝胶并研究其网络拓扑对宏观材料性质的影响 超过16 000个不同序列的DNA环 合成生物学 NA 下一代测序, 振荡流变学, 原子力显微镜, 冷冻电子显微镜, 大规模计算模拟 NA 序列数据, 图像, 机械特性数据 超过16 000个独特DNA环分子 酶促活化, 分子内环化 NA DNA环库, 网络拓扑设计 生物材料, 仿生系统, 软物质物理
95 2026-06-17
Empirical evaluation of all unique Cas9 protospacers in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA design
2026-Jun-08, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 系统评估大肠杆菌中463,000个独特gRNA的Cas9活性,发现93%以上功能正常,仅0.3%无效 首次大规模实证验证大肠杆菌中几乎所有独特gRNA均具有功能性,并揭示无效gRNA的间隔区自相互作用规律,提出简单设计规则和修复方法 研究仅限于大肠杆菌K12 MG1655菌株,未扩展至其他细菌种类 评估大肠杆菌中Cas9 gRNA的特异性与功能性,解决现有研究中关于无效gRNA比例的争议 463,000个独特gRNA在大肠杆菌K12 MG1655基因组上的活性 计算生物学 NA CRISPR-Cas9 NA 序列数据 463,000个独特gRNA CRISPR-Cas9 大肠杆菌 NA 合成生物学
96 2026-06-17
Rare functional groups and unique scaffolds in Streptomyces natural products
2026-Jun-08, Natural product reports IF:10.2Q1
综述 综述链霉菌天然产物中罕见官能团、独特骨架和非典型修饰的结构特征及其生物合成机制 将稀有结构特征(如罕见官能团、独特分子骨架、非典型修饰)与合成生物学应用及高效细胞工厂设计相联系 仅涵盖截至2025年12月的数据,可能遗漏近期文献 探讨链霉菌天然产物的结构多样性如何为合成生物学和药物发现提供灵感 链霉菌天然产物及其生物合成酶 NA NA NA NA NA NA NA 链霉菌 NA 医学, 工业生物技术
97 2026-06-17
Synthetic biology as a game-changer for endangered medicinal orchids: biosynthesis, engineering and conservation
2026-Jun-02, Natural product reports IF:10.2Q1
综述 本文综述了合成生物学如何通过模块化设计、异源重构和代谢工程等手段,推动濒危药用兰花的可持续利用与保护 创新性地将合成生物学引入濒危药用兰花保护领域,通过解耦供应与生态提取实现可持续生产,并整合多组学、人工智能和基因编辑加速工程化循环 未明确讨论合成生物学应用的潜在生态风险或大规模生产的经济可行性 探讨合成生物学在濒危药用兰花生物合成、工程化及保护中的变革性作用 濒危药用兰花及其高价值代谢物(如天麻素、石斛碱) 合成生物学 NA 代谢工程、异源表达、定向进化、多组学、基因编辑、人工智能 NA 多组学数据 NA CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick 微生物(如大肠杆菌、酿酒酵母)、植物底盘 生物合成途径模块化设计、振荡器、生物传感器、代谢途径 医药、农业、工业生物技术
98 2026-06-17
The division of vesicles requires the fission of closed membrane necks but does not require active processes
2026-Jun-02, Soft matter IF:2.9Q2
研究论文 通过理论、实验和模拟分析,证明囊泡分裂需要闭合膜颈的裂变,但不需要主动过程 首次明确表明囊泡分裂不需要化学机械耦合的主动过程(如核苷酸水解),仅需闭合膜颈的形成与裂变,并提出了由自发曲率或应力不对称控制收缩力的机制 主要基于作者团队的研究结果,可能未涵盖所有类型的囊泡分裂机制;主动过程在自然界中的角色未被完全排除 阐明囊泡分裂的物理机制,并验证其是否依赖于主动过程 巨型囊泡和纳米囊泡的膜分裂过程 软物质科学、合成生物学 NA NA 理论模型、计算机模拟 实验数据、模拟数据 NA NA NA NA 合成生物学、软物质工程
99 2026-06-16
Substrate Specificity of B12-Depedent Ribonucleotide Reductases: Biotechnology and Metabolic Implications
2026-Jun-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology IF:2.6Q3
研究论文 研究了两类热稳定性核糖核苷酸还原酶对多种天然和非天然核苷酸的底物特异性,评估其生物技术应用潜力 首次系统性地研究了核糖核苷酸还原酶对非经典核苷酸的底物特异性,发现酶倾向于转化带有修饰官能团的核苷碱基底物,揭示了生物技术和合成生物学应用中的潜力与限制 仅聚焦于两种热稳定性RNR,未涵盖其他来源或类型的RNR;对非天然核苷酸的转化效率及体内应用验证不足 探索核糖核苷酸还原酶的底物混杂性及其在生物技术中的应用潜力,同时增进对天然核苷酸代谢的理解 两种热稳定性核糖核苷酸还原酶及其对多种天然和非天然核苷酸的转化 合成生物学 NA 酶活性测定、底物特异性分析 NA 实验数据(酶动力学参数) 两种热稳定性核糖核苷酸还原酶,测试了多种核苷酸底物 NA NA NA 生物技术、合成生物学
100 2026-06-16
A Modular PLUG-IN Photosynthetic Chassis With Tunable Thermal Control for Mammalian Systems
2026-Jun-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 开发一种热调控的模块化“即插即用”光合底盘,实现微藻代谢输出与细胞完整性的可编程控制 首次实现跨真核生物界的热调控模块化合成生物学底盘,在微藻和哺乳动物宿主中均保持功能,并耦合代谢工程与细胞壁工程实现无研磨脂质回收 未明确讨论热诱导系统在长期培养中的稳定性及可能的代谢负担,未评估大规模工业应用中的热控制成本 开发一种与哺乳动物系统兼容的热调控光合底盘,同步控制生长、生产与细胞壁重构 海洋微藻(Nannochloropsis oceanica)和哺乳动物宿主 合成生物学 NA 转录组学比较分析、热诱导启动子工程、基因沉默 NA 转录组数据 NA 热激活基因扩增系统、基因沉默 Nannochloropsis oceanica, 哺乳动物细胞 热调控代谢模块(AtWRI1表达增强三酰甘油和EPA积累)与细胞壁模块(CesA1沉默导致细胞壁弱化)耦合 工业生物技术, 医药
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