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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-06-10 |
Modular Assembly of Higher-Order DNA Nanotube Tile Nanostructures Using DNA Annular Scaffolds
2026-Jun-03, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c04434
PMID:42139459
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研究论文 | 提出一种基于DNA环形支架的模块化组装策略,利用DNA纳米管砖块构建高阶纳米结构 | 首次将DNA环形支架与短DNA基序结合,实现具有高稳定性和可编程性的模块化组装,组装效率超过99%,并成功构建布尔逻辑门电路 | 高阶结构模块化潜力尚未完全实现,现有DNA组装策略的模块化能力有限 | 开发一种整合DNA砖块和DNA折纸优点的组装策略,克服高阶结构制造限制 | DNA纳米管砖块及其环形支架结构 | 纳米技术 | NA | DNA纳米管组装、DNA折纸 | NA | NA | NA | DNA环形支架、分支连接基序 | NA | 布尔逻辑门和逻辑电路 | 医药 |
| 122 | 2026-06-09 |
Integrative frameworks for plastic biodegradation in insect-microbiome systems: mechanistic insights, emerging multi-omics and enzyme engineering perspectives
2026-Jun-08, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10316-8
PMID:42257753
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综述 | 该综述整合了昆虫-微生物组系统中塑料生物降解的机制、多组学和酶工程研究进展 | 通过分析宿主与肠道微生物的协同作用,提出了昆虫幼虫中塑料降解的多步骤模型,并总结了酶工程与合成生物学策略的潜在应用 | 多组学数据主要提供相关性证据,特定酶功能的直接实验验证仍然有限 | 理解昆虫-微生物组系统中塑料降解的复杂机制,并指导酶基可持续塑料废物管理策略的开发 | 昆虫幼虫(如蜡螟)及其肠道微生物组 | 环境科学、合成生物学 | NA | 多组学(宏基因组学、宏转录组学、代谢组学)、酶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 酶工程、合成生物学 | 昆虫幼虫(蜡螟科等) | 多步降解通路(包括机械破碎、氧化修饰、微生物解聚和中间代谢处理) | 环境、工业生物技术 |
| 123 | 2026-06-09 |
Insights into the Fucoidan and Mannitol Biosynthetic Pathways in the Brown Seaweed Padina Tetrastromatica Based on Draft Genome and Transcriptome Analysis
2026-Jun-04, Marine biotechnology (New York, N.Y.)
DOI:10.1007/s10126-026-10649-8
PMID:42240916
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研究论文 | 本研究通过基因组和转录组分析揭示了褐藻Padina tetrastromatica中岩藻多糖和甘露醇生物合成途径 | 首次对P. tetrastromatica进行互补基因组和转录组组装,鉴定了参与岩藻多糖和甘露醇生物合成的关键酶编码基因,为褐藻功能性糖类代谢提供了分子框架 | 基因组覆盖度不足20%,限制了完整基因组的获取 | 阐明褐藻中岩藻多糖和甘露醇的生物合成分子机制,为未来代谢工程和合成生物学应用奠定基础 | 褐藻Padina tetrastromatica | 生物信息学 | NA | NGS, 转录组测序, 基因组组装 | NA | 基因组序列, 转录本序列 | 单个褐藻样本(Padina tetrastromatica) | NA | NA | NA | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 124 | 2026-06-09 |
Unlocking plant abiotic stress resilience through biostimulants and omics-driven innovations
2026-Jun, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70205
PMID:41782210
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综述 | 探讨生物刺激素与组学驱动创新在提升植物非生物胁迫适应性中的作用 | 整合生物刺激素技术、小RNA、肽和激素作为新兴分子调节因子,以及AI驱动的早期预警系统,为合理设计生物刺激素提供路线图 | 未明确讨论生物刺激素在实际应用中的规模化挑战或潜在生态影响 | 阐明生物刺激素增强植物非生物胁迫耐受性的机制,并构建气候适应性农业的路线图 | 植物(作物)及其对干旱、温度、盐分、涝渍和重金属等胁迫的响应 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | 生物刺激素代谢途径设计 | 农业 |
| 125 | 2026-06-09 |
A yeast-based platform for etoposide production via yatein bioconversion
2026-Jun, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2026.e00280
PMID:42255528
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研究论文 | 建立基于酵母的依托泊苷生产平台,通过亚铁素生物转化实现可持续生产 | 首次在酵母中重构完整的亚铁素到(-)-4'-去甲基表鬼臼毒素的异源途径,结合途径重构、基因拷贝数优化和辅酶匹配性改造,并成功将生物生产与下游半合成转化衔接 | 依赖植物资源提供前体亚铁素,且酵母生产效率和规模化仍需进一步优化 | 开发依托泊苷中间体的可持续生物制造路径,替代传统植物提取方法 | 酿酒酵母细胞工厂、鬼臼类植物中的亚铁素前体 | 合成生物学 | 固体肿瘤、血液恶性肿瘤 | 途径重构、基因拷贝数优化、辅酶匹配性改造、发酵工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 亚铁素到(-)-4'-去甲基表鬼臼毒素的异源代谢途径 | 医药 |
| 126 | 2026-06-08 |
Engineering a PD-L1-sensing synthetic receptor for programmable macrophage response
2026-Jun-06, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00708-y
PMID:42251359
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研究论文 | 描述了一种基于合成Notch的受体(SNIPR),能检测PD-L1并触发巨噬细胞的可编程吞噬程序 | 将PD-L1从治疗终点靶点重新定义为可编程输入信号,实现了配体响应式巨噬细胞行为控制 | 目前仅在体外验证了THP-1来源巨噬细胞对SKOV-3卵巢癌细胞的吞噬增强效应 | 设计合成受体实现巨噬细胞对免疫调节配体的感知和条件性激活 | PD-L1配体及THP-1单核细胞来源的巨噬细胞 | 合成生物学 | 卵巢癌 | 合成Notch受体工程 | NA | NA | 体外细胞实验,涉及SKOV-3卵巢癌细胞和THP-1巨噬细胞 | 合成生物学受体工程 | 人类细胞(THP-1单核细胞) | PD-L1感应合成Notch受体(SNIPR)电路,调控荧光报告基因或CV1-Fc效应器表达 | 医学 |
| 127 | 2026-06-07 |
Automated, modular assembly of reconstituted cell-free systems from in vitro-produced components
2026-Jun-05, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.05.002
PMID:42248716
|
研究论文 | 开发了一种基于体外生产组分的模块化无细胞蛋白合成系统i-POPFLEX,通过自动化液体处理实现快速组装 | 首次实现将34种翻译因子和分裂T7 RNA聚合酶分别体外合成并自动化组装成无细胞系统,大幅降低成本并提高产量 | 目前仅测试了有限数量的翻译因子和RNA聚合酶组合,系统对复杂蛋白表达的支持能力仍需验证 | 构建一种低成本、可定制且可扩展的无细胞蛋白合成平台,以推动合成生物学应用 | 无细胞蛋白合成系统i-POPFLEX及其组成因子 | 合成生物学 | NA | 体外蛋白合成、自动化液体处理 | NA | 蛋白产量数据、成本分析数据 | 无具体样本数量,涉及34种翻译因子和T7 RNA聚合酶的体外合成与组装 | 自动化液体处理系统 | 大肠杆菌(用于体外合成组分) | 无细胞蛋白表达系统(模块化组装) | 生物制造、合成生物学 |
| 128 | 2026-06-07 |
Synthetic Biology for Next-Generation Lactic Acid Bacteria: Engineering the Future of Food
2026-Jun-03, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c00333
PMID:42183823
|
综述 | 回顾乳酸菌在食品工业中的传统应用与当前限制,重点介绍合成生物学驱动的基因编辑、代谢工程和基因回路等策略,以精确设计和扩展乳酸菌功能 | 系统阐述了利用合成生物学工具(如基因编辑、定向进化)优化乳酸菌基因表达效率和代谢通路的创新方法,并展望其在个性化食品开发中的应用前景 | 当前乳酸菌菌株仍面临质粒不稳定、基因表达效率低和代谢通量调控复杂等挑战,限制了其广泛应用 | 探讨如何通过合成生物学策略改进乳酸菌以推动下一代发酵食品发展 | 乳酸菌 | NA | NA | 基因编辑、代谢工程、合成基因回路、定向进化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 乳酸菌 | 代谢通路、基因回路 | 食品 |
| 129 | 2026-06-06 |
Discovering what is possible: How synthetic biology illuminates development
2026-Jun-04, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101619
PMID:42242210
|
综述 | 探讨合成生物学如何通过自下而上的方法阐明胚胎发育的一般原理和因果机制 | 强调合成系统虽简化但能测试发育潜力极限、厘清因果关系并为预测模型提供依据 | 未明确讨论合成系统与自然系统的差异及简化带来的潜在偏差 | 理解多细胞组织如何从细胞间相互作用中涌现 | 合成生物学重建的发育过程(干细胞与合成生物学重建的类胚胎系统) | 合成生物学、发育生物学 | NA | 基因工程、成像技术、计算建模 | NA | NA | NA | 基因组工程 | NA | NA | 医学、发育生物学研究 |
| 130 | 2026-06-06 |
Living buildings with living electronics: towards biologically intelligent biohybrids
2026-Jun-04, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.05.015
PMID:42242980
|
观点文章 | 探讨将电活性生物膜作为生物智能组件融入建筑,实现从实验室原型到集成架构的转型 | 提出将电活性生物膜编程为生物晶体管和逻辑处理器等生物智能组件,而非简单生物催化剂,实现建筑功能化 | 未明确提及局限,可能涉及从实验室原型到实际建筑集成的技术挑战和规模化问题 | 规划电活性生物膜混合生物-人工系统从实验室原型向分布式资源回收集成架构的转型路线 | 电活性生物膜及其在建筑中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 电活性生物膜 | 生物晶体管、逻辑处理器 | 建筑、环境、工业生物技术 |
| 131 | 2026-06-06 |
Genetic encoding of multiple distinct noncanonical amino acids
2026-Jun, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.03.006
PMID:42034479
|
综述 | 本文综述了在遗传编码中同时引入多种非规范氨基酸的研究进展 | 介绍了利用相互正交的翻译系统和扩展密码子库实现多种非规范氨基酸同时编码的突破性技术,特别是哺乳动物系统中稀有密码子重新编码与终止密码子抑制的整合实现了五种不同非规范氨基酸的遗传编码 | 未明确阐述当前技术的局限性 | 总结在遗传编码中同时编码多种不同非规范氨基酸的变革性进展 | 多种非规范氨基酸及其遗传编码系统 | 合成生物学 | NA | 遗传编码, 非规范氨基酸(ncAA)引入, 密码子重新编码, 终止密码子抑制 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医药, 合成生物学 |
| 132 | 2026-06-06 |
Antimicrobial discovery from underexplored environments: unlocking specialized metabolism
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102745
PMID:41880737
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综述 | 探讨从未充分探索环境中发现抗生素的新策略,重点介绍先进培养技术、多组学、合成生物学和人工智能如何解锁隐秘的微生物代谢途径以应对抗生素耐药性危机 | 整合生态学、组学、合成生物学和人工智能等新兴方向,覆盖从稀有微生物群落到古菌及古代蛋白质组挖掘的跨维度创新方法 | 未具体讨论这些新策略在实际应用中的可扩展性、成本效益及潜在生态环境影响 | 总结和推进从新环境中发现抗生素的研究方向,填补抗生素发现创新缺口 | 常规土壤微生物以外的未被充分探索的微生物资源(稀有分类群、古菌、未培养微生物、古代蛋白质组) | 机器学习 | 抗微生物耐药性相关疾病 | 多组学、合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 133 | 2026-06-05 |
Programmable, multiplexed and orthogonal gene control in bacteria with attenuated Cas13d systems
2026-Jun-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03160-x
PMID:42230991
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研究论文 | 提出一种通过蛋白质工程策略生成减毒Cas13d变体的方法,实现细菌中可编程、多重且正交的基因调控 | 通过定向截短Cas13d柔性区域生成具有可调RNase活性的减毒变体,引入CRISPR RNA间隔区5'端近端错配实现翻译抑制、多顺反子mRNA降解和IF3融合翻译级CRISPR激活的功能切换 | 未详细说明该策略在其他细菌宿主中的通用性及长期稳定性评估 | 开发适用于细菌的RNA调控工具包,实现可编程、多重和正交的基因控制 | 大肠杆菌中的基因调控及番茄红素生物合成优化 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas13d、蛋白质工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas13d | 大肠杆菌 | 基于减毒Cas13d的RNA调控回路,包括翻译抑制、多顺反子mRNA降解和IF3融合翻译级CRISPR激活 | 工业生物技术、合成生物学 |
| 134 | 2026-06-05 |
Design and engineering of photorespiratory bypasses in plants
2026-Jun, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.02.007
PMID:41687960
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综述 | 对植物光呼吸旁路的设计与工程化进行综述,分为三种主要类型并分析其机制和应用 | 首次将光呼吸旁路系统性地分为碳释放型、碳中性和碳正性三类,并强调通过重编程乙醇酸代谢提高光合效率的潜力 | 未提供具体的实验数据或定量比较各种旁路的实际效率,且主要基于模型植物和作物,实际应用效果需进一步验证 | 总结当前抑制C3植物光呼吸的遗传策略,指导未来光呼吸旁路的优化与合理设计 | C3植物中的光呼吸旁路 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 光呼吸旁路(包括碳释放型、碳中性型和碳正性型) | 农业 |
| 135 | 2026-06-05 |
Nanomedicine carrier-based combined antitumor strategy integrating phototherapy and immunotherapy
2026-Jun, Immunopharmacology and immunotoxicology
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/08923973.2026.2671715
PMID:42153947
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综述 | 系统分析纳米载体介导的光疗与免疫疗法联合抗肿瘤策略的原理、机制及最新进展 | 总结了纳米载体在时空协同递送、刺激响应释放以及将“冷”肿瘤转化为“热”肿瘤方面的创新应用,并探讨了多响应纳米平台、仿生设计和克服缺氧策略等新兴趋势 | 临床转化仍面临制造可扩展性、人类肿瘤异质性和最佳治疗排序等挑战 | 分析纳米载体如何实现光疗与免疫疗法的精准时空协同递送,以增强抗肿瘤免疫反应 | 纳米药物载体、光治疗剂、免疫检查点抑制剂、原位疫苗、免疫调节剂及过继细胞疗法(包括CAR-T细胞) | 纳米医学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 136 | 2026-06-04 |
Biosynthesized Silk-Amyloid-Mussel Proteins as Dissolution Recyclable Materials With Tunable Supercontraction
2026-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.73200
PMID:42051062
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研究论文 | 本文通过蛋白质工程和合成生物学设计了一种可溶解回收的丝-淀粉样蛋白-贻贝融合蛋白材料,兼具高机械性能和完全可回收性 | 首次通过理性设计平衡相互作用力与溶剂可及性,实现了高强韧蛋白材料的完全溶解回收,并发现回收后材料仍保持优异性能且可再加工成水下粘附水凝胶 | 未详细阐述材料在极端环境(如强酸强碱、高温)下的长期稳定性以及规模化生产的可行性 | 设计一种可溶解回收、高性能且可持续的蛋白质基材料 | 丝-淀粉样蛋白-贻贝(SAM)融合蛋白及其纤维和水凝胶 | 合成生物学 | NA | NGS | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 材料科学,环境工程 |
| 137 | 2026-06-04 |
High-resolution melting analysis for rapid and cost-effective detection of unnatural base pairs
2026-Jun, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2026.100090
PMID:42233153
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研究论文 | 建立高分辨率熔解分析作为快速低成本检测非天然碱基对的方法 | 首次将高分辨率熔解分析应用于非天然碱基对的检测,基于短扩增子的熔解温度差异,可直接整合到标准PCR流程中,使用常见qPCR仪器实现快速筛选 | 未明确说明,但可能涉及对特定非天然碱基对(NaM-TPT3)的优化,通用性需进一步验证 | 开发一种快速、可及且成本有效的非天然碱基对检测方法,以支持合成生物学和基因字母扩展研究 | 非天然碱基对NaM-TPT3在DNA中的掺入和稳定性 | 合成生物学、生物技术 | NA | 高分辨率熔解分析(HRM)、聚合酶链反应(PCR)、液相色谱-质谱联用(LC-MS) | NA | 熔解曲线数据 | 未明确说明,涉及非扩增DNA对照和定义变异混合物 | NA | NA | NA | 合成生物学、蛋白质工程、生物防护 |
| 138 | 2026-06-03 |
Essential Proteins Prediction Using Features Synergy Model and GO Pure Centrality
2026-Jun-01, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3698655
PMID:42224331
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研究论文 | 提出一种基于特征协同模型和GO纯中心性的必需蛋白预测方法FSM,以提升识别率 | 创新性地融合特征协同模型与GO纯中心性,构建纯PPI网络并设计新中心性度量GPC,有效降低PPI数据噪声并增强特征关系整合 | 方法依赖GO注释和基因表达数据质量,可能在不同物种或数据稀疏场景下性能受限 | 提高必需蛋白预测的准确率,推动合成生物学和疾病治疗发展 | 酵母数据集中的必需蛋白 | 机器学习 | NA | 基因表达分析、GO注释分析 | 特征协同模型 | 蛋白质相互作用数据、基因表达数据、GO注释数据、亚细胞定位和直系同源蛋白数据 | 三个不同的酵母数据集 | NA | 酿酒酵母 | NA | 合成生物学、医学 |
| 139 | 2026-06-01 |
Dual-promoter control of gene expression: from transcriptional fine-tuning to antibiotic resistance
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102747
PMID:41903510
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综述 | 综述微生物中双启动子调控基因表达的策略及其在抗生素耐药性预测和合成生物学中的应用 | 系统总结了双启动子结构在微生物中的组合调控机制,并探讨其在抗生素应激传感及耐药性机制预测中的新应用 | 未提供具体的实验数据或定量分析,主要基于文献综述,缺乏对直接因果关系验证的深入讨论 | 阐明双启动子调控基因表达的机制及其在微生物中作为生物传感器和合成生物学工具的应用价值 | 微生物(包括细菌和真菌)中的双启动子调控系统 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 双启动子逻辑门、生物传感器、合成基因回路 | 医学, 工业生物技术 |
| 140 | 2026-06-01 |
Evolutionary insights and guidelines to achieve effective and high-yield non-ribosomal peptide and polyketide engineering
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102755
PMID:41967291
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综述 | 综述了基于进化原理和数据集进行非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程改造的指导原则,以实现高效高产的产物生成 | 从依赖结构数据的工程策略转向融合进化见解和数据集,优化重组边界选择并提高工程通量,为抗生素发现和生产提供新指导 | 没有一种工程策略在减少产量损失方面显著最优,且重组装配线普遍存在产量受损问题 | 探索通过进化原理指导酶工程改造以实现高产且有效的非核糖体肽和聚酮化合物生产 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶装配线 | 合成生物学 | NA | NRPS和PKS工程改造,meta-analysis | NA | 已发表的研究结果 | 综述了多项已发表的工程改造研究结果,未具体说明样本数量 | NA | NA | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶装配线重组 | 药物,工业生物技术 |