合成生物学相关文章
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当前共找到 157 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-06-04 |
Expanding the genetic toolset: Using serine recombinases to integrate riboregulatory elements into industrially relevant microbial chassis
2026-Jun-02, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuag015
PMID:42228948
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研究论文 | 本研究展示了将核糖调控元件通过丝氨酸重组酶整合到工业相关微生物底盘中的方法 | 同时利用顺式抑制子和丝氨酸重组酶辅助基因组工程两种合成生物学工具，实现多个宿主的通用基因组操作和精确基因表达 | 未明确说明局限性 | 扩展工业微生物在生物制造中的应用工具集 | 顺式抑制子和丝氨酸重组酶辅助基因组工程在荧光报告系统中的功能 | 合成生物学 | NA | SAGE, 丝氨酸重组酶 | NA | 荧光强度数据 | 三种工业相关宿主：恶臭假单胞菌、谷氨酸棒杆菌、嗜氢贪铜菌 | 丝氨酸重组酶, SAGE | 恶臭假单胞菌, 谷氨酸棒杆菌, 嗜氢贪铜菌 | 顺式抑制子调控元件与荧光报告基因的整合系统 | 工业生物技术, 生物制造 |
| 122 | 2026-06-04 |
Biosynthesized Silk-Amyloid-Mussel Proteins as Dissolution Recyclable Materials With Tunable Supercontraction
2026-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.73200
PMID:42051062
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研究论文 | 本文通过蛋白质工程和合成生物学设计了一种可溶解回收的丝-淀粉样蛋白-贻贝融合蛋白材料，兼具高机械性能和完全可回收性 | 首次通过理性设计平衡相互作用力与溶剂可及性，实现了高强韧蛋白材料的完全溶解回收，并发现回收后材料仍保持优异性能且可再加工成水下粘附水凝胶 | 未详细阐述材料在极端环境（如强酸强碱、高温）下的长期稳定性以及规模化生产的可行性 | 设计一种可溶解回收、高性能且可持续的蛋白质基材料 | 丝-淀粉样蛋白-贻贝（SAM）融合蛋白及其纤维和水凝胶 | 合成生物学 | NA | NGS | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 材料科学，环境工程 |
| 123 | 2026-06-04 |
Enabling Clinical Translation of Oral Probiotics Through Formulation Engineering and Scalable Manufacturing
2026-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70253
PMID:42226613
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综述 | 系统综述了口服益生菌在配方工程和可规模化制造方面的进展，以推动其临床转化 | 强调益生菌配方的功能输出（而非单纯结构保护）作为核心治疗驱动力，并评估了多种前沿技术（如合成生物学驱动菌株工程、微流控封装）在临床相关疾病中的应用 | 综述性质，未提供实验数据；各技术平台的优缺点仅基于文献评估，缺乏直接比较 | 推动口服益生菌在精准医学中的临床应用 | 口服益生菌配方及相关工程技术 | 机器学习和数字病理信息不足，主要涉及微生物学和生物工程，可选“合成生物学” | 结直肠癌，炎症性肠病，代谢紊乱，神经炎症性疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学，微流控封装，高密度发酵 | NA（益生菌泛指，未特指具体宿主） | NA（未描述具体生物电路） | 医学 |
| 124 | 2026-06-04 |
High-resolution melting analysis for rapid and cost-effective detection of unnatural base pairs
2026-Jun, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2026.100090
PMID:42233153
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研究论文 | 建立高分辨率熔解分析作为快速低成本检测非天然碱基对的方法 | 首次将高分辨率熔解分析应用于非天然碱基对的检测，基于短扩增子的熔解温度差异，可直接整合到标准PCR流程中，使用常见qPCR仪器实现快速筛选 | 未明确说明，但可能涉及对特定非天然碱基对（NaM-TPT3）的优化，通用性需进一步验证 | 开发一种快速、可及且成本有效的非天然碱基对检测方法，以支持合成生物学和基因字母扩展研究 | 非天然碱基对NaM-TPT3在DNA中的掺入和稳定性 | 合成生物学、生物技术 | NA | 高分辨率熔解分析（HRM）、聚合酶链反应（PCR）、液相色谱-质谱联用（LC-MS） | NA | 熔解曲线数据 | 未明确说明，涉及非扩增DNA对照和定义变异混合物 | NA | NA | NA | 合成生物学、蛋白质工程、生物防护 |
| 125 | 2026-06-03 |
Liquid-liquid phase separation in metabolic engineering: Mechanistic insights, emerging applications, and future challenges
2026-Jun-02, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108931
PMID:42225537
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综述 | 系统总结了液-液相分离在代谢工程中的设计原理、分子决定因素和调控策略，并探讨了人工智能与深度学习如何推动该领域的理性设计 | 首次将人工智能和深度学习应用于内在无序区数据库构建和数据驱动的合成IDR理性设计，建立了定量序列-相行为关系，推动经验设计向预测性工程框架转变 | 冷凝物的老化和与宿主细胞环境的兼容性仍是关键挑战 | 为合成生物学和代谢工程领域提供液-液相分离的集成理论框架和前瞻性视角，以开发下一代稳定、可编程的基于LLPS的微生物细胞工厂平台 | 液-液相分离形成的人工冷凝物及其在代谢通道、基因表达控制和复杂可编程细胞功能模块中的应用 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 液-液相分离, 人工智能, 深度学习 | 深度学习 | 内在无序区序列数据 | NA | NA | 微生物细胞 | 人工冷凝物（代谢通道、基因表达控制、可编程细胞功能模块） | 工业生物技术 |
| 126 | 2026-06-03 |
Essential Proteins Prediction Using Features Synergy Model and GO Pure Centrality
2026-Jun-01, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3698655
PMID:42224331
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研究论文 | 提出一种基于特征协同模型和GO纯中心性的必需蛋白预测方法FSM，以提升识别率 | 创新性地融合特征协同模型与GO纯中心性，构建纯PPI网络并设计新中心性度量GPC，有效降低PPI数据噪声并增强特征关系整合 | 方法依赖GO注释和基因表达数据质量，可能在不同物种或数据稀疏场景下性能受限 | 提高必需蛋白预测的准确率，推动合成生物学和疾病治疗发展 | 酵母数据集中的必需蛋白 | 机器学习 | NA | 基因表达分析、GO注释分析 | 特征协同模型 | 蛋白质相互作用数据、基因表达数据、GO注释数据、亚细胞定位和直系同源蛋白数据 | 三个不同的酵母数据集 | NA | 酿酒酵母 | NA | 合成生物学、医学 |
| 127 | 2026-06-01 |
Dual-promoter control of gene expression: from transcriptional fine-tuning to antibiotic resistance
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102747
PMID:41903510
|
综述 | 综述微生物中双启动子调控基因表达的策略及其在抗生素耐药性预测和合成生物学中的应用 | 系统总结了双启动子结构在微生物中的组合调控机制，并探讨其在抗生素应激传感及耐药性机制预测中的新应用 | 未提供具体的实验数据或定量分析，主要基于文献综述，缺乏对直接因果关系验证的深入讨论 | 阐明双启动子调控基因表达的机制及其在微生物中作为生物传感器和合成生物学工具的应用价值 | 微生物（包括细菌和真菌）中的双启动子调控系统 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 双启动子逻辑门、生物传感器、合成基因回路 | 医学, 工业生物技术 |
| 128 | 2026-06-01 |
Evolutionary insights and guidelines to achieve effective and high-yield non-ribosomal peptide and polyketide engineering
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102755
PMID:41967291
|
综述 | 综述了基于进化原理和数据集进行非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程改造的指导原则，以实现高效高产的产物生成 | 从依赖结构数据的工程策略转向融合进化见解和数据集，优化重组边界选择并提高工程通量，为抗生素发现和生产提供新指导 | 没有一种工程策略在减少产量损失方面显著最优，且重组装配线普遍存在产量受损问题 | 探索通过进化原理指导酶工程改造以实现高产且有效的非核糖体肽和聚酮化合物生产 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶装配线 | 合成生物学 | NA | NRPS和PKS工程改造，meta-analysis | NA | 已发表的研究结果 | 综述了多项已发表的工程改造研究结果，未具体说明样本数量 | NA | NA | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶装配线重组 | 药物，工业生物技术 |
| 129 | 2026-06-01 |
From known knowns to unknown unknowns: synthetic biology paths to antimicrobial discovery
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102759
PMID:42066660
|
研究论文 | 提出一个以合成生物学为中心的框架，用于绘制抗菌天然产物沿化学新颖性和工程可及性两个轴线的图谱 | 通过两个轴线（化学新颖性和工程可及性）引入四象限框架，将天然产物从已知已知扩展到未知未知，并强调象限的动态性，为合成生物学策略提供新视角 | NA | 开发一个基于合成生物学的框架，以指导抗菌天然产物的发现和工程化，应对耐药性挑战 | 抗菌天然产物及其化学结构 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 130 | 2026-05-31 |
Design of strictly orthogonal biosensors for maximizing renewable biofuel overproduction
2026-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.015
PMID:40939890
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研究文章 | 通过机器学习模型BT预测转录因子BmoR的关键残基区域，实现严格正交生物传感器设计，最大化可再生生物燃料的过量生产 | 首次利用机器学习模型BT预测三个关键残基区域，结合半理性工程改造BmoR突变体实现严格信号分子正交性，并建立TF-SM氢键计数主导作用的框架 | 该研究中BT模型的预测准确率为88.5%，可能存在预测误差；实验仅限于BmoR和四种信号分子，通用性尚待验证 | 通过机器学习指导的转录因子进化，实现严格正交生物传感器设计，提高可再生生物燃料产量 | 转录激活因子BmoR及其与信号分子的相互作用 | 机器学习 | NA | 机器学习, 随机森林算法, Discovery Studio分子模拟, 微量热泳动(MST)亲和力测定, 半理性工程 | 随机森林模型 | 分子模拟数据, 实验验证数据 | 245个TF-SM复合物用于训练和测试，5700个BmoR突变体与4种信号分子模拟得到22800个复合物 | NA | 微生物（未具体指明） | 基于BmoR的正交生物传感器 | 合成生物学, 代谢工程, 能源 |
| 131 | 2026-05-31 |
Microbial and synthetic biology solutions for waste management and biomanufacturing off Earth
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103491
PMID:41930789
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综述 | 探索利用微生物和合成生物学技术解决国际空间站废物管理问题，并将废物转化为有价值资源的策略 | 提出利用微生物和合成生物学方法在太空中实现废物资源化、再生生命支持系统和可持续生物制造，为长期地外居住和火星任务提供物质闭环的解决方案 | 未提及 | 研究微生物和合成生物学解决方案用于地球外的废物管理和生物制造 | 微生物和合成生物学策略在太空废物处理中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、生物采矿、极端微生物工程 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 极端微生物 | 废物转化和生物制造通路 | 环境、工业生物技术 |
| 132 | 2026-05-31 |
From transport to regulation: systems engineering for high-efficiency dicarboxylic acid biosynthesis
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103499
PMID:42034010
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综述 | 本文综述了通过酶工程、系统代谢工程和合成生物学方法提高中长链二元酸生物合成效率的策略 | 重点强调了疏水底物跨膜转运机制增强和新型转运蛋白挖掘，以及针对关键酶（如细胞色素P450）的蛋白质工程策略，包括理性设计、融合表达和新型二聚化技术 | 主要受限于低质量传递效率、关键氧化酶系统不稳定和细胞代谢失衡等瓶颈 | 为中长链二元酸的高效和可持续生物制造提供理论指导 | 中长链二元酸生物合成系统和相关酶（如细胞色素P450） | 合成生物学 | NA | 酶工程、系统代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 蛋白质工程、融合表达、二聚化技术 | NA | 反向β氧化循环、辅因子再生和能量代谢重编程 | 工业生物技术、材料 |
| 133 | 2026-05-31 |
Bacillus methanolicus as an emerging platform for energy-efficient biomanufacturing from one-carbon and marine resources
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103500
PMID:42056785
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综述 | 本文综述了嗜热甲醇芽孢杆菌作为一种新兴的生物制造平台，能够高效利用甲醇和甘露醇进行可持续化学生产 | 强调了该菌株在热生长、海水适应性和能量高效甲醇同化途径方面的固有优势，并总结了合成生物学工具的最新进展以实现理性菌株工程 | 讨论了从甲醇和甘露醇进行生物制造面临的挑战，但未深入量化实际瓶颈 | 探讨嗜热甲醇芽孢杆菌作为连接一碳和海洋衍生底物与可持续化学合成的多功能平台的潜力 | 嗜热甲醇芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 嗜热甲醇芽孢杆菌 | 甲醇和甘露醇代谢路径 | 工业生物技术 |
| 134 | 2026-05-31 |
The convergence of AI-driven engineering biology and emerging technologies advancing globally networked autonomous biofoundries
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103503
PMID:42068969
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综述 | 本文概述了人工智能驱动工程生物学与新兴技术的融合，推动全球网络化自主生物工厂的发展 | 提出AI驱动的全自主生物工厂概念，整合计算设计、自动化制造和数据驱动学习，实现自我改进的设计-构建-测试-学习循环 | NA | 综述塑造AI驱动合成生物学的技术，强调其与自动化、数字化和小型化的融合趋势 | AI驱动的合成生物学技术，包括全细胞建模、数字孪生及自动化生物工厂 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 135 | 2026-05-31 |
Systems-level regulation principles for microbial lignin valorization
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103479
PMID:41875688
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综述 | 系统总结微生物木质素增值的调控原理，涵盖代谢调控、转录因子调控和动态生物传感器调控 | 首次从系统层面整合代谢调控、转录因子工程和动态传感器调控，提出提升木质素生物转化效率的集成框架 | 未涉及具体实验验证，且对工业规模化应用的挑战分析有限 | 阐述微生物木质素增值的系统级调控原理 | 微生物细胞工厂及木质素衍生的芳香族化合物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术、环境 |
| 136 | 2026-05-31 |
The TfoX revolution: a review of genetic engineering in Vibrio natriegens
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103506
PMID:42119170
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综述 | 本文综述了Vibrio natriegens的基因工程工具发展，特别是TfoX介导的自然转化能力如何推动其成为合成生物学底盘 | 系统梳理了TfoX介导的遗传能力机制如何突破V. natriegens的基因改造瓶颈，将其转变为可编程底盘 | 仍面临基因组编辑效率和规模化应用的挑战 | 概述V. natriegens基因工程方法的演进及应用潜力 | V. natriegens菌株及其TfoX调控机制 | 合成生物学 | NA | TfoX介导的自然转化 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 合成生物学 |
| 137 | 2026-05-29 |
The BAHD Acyltransferase Gene Family: Evolutionary Dynamics, Biochemical Mechanisms, and Roles in Plant Stress Adaptation
2026-Jun, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70597
PMID:41810805
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综述论文 | 该文整合了BAHD酰基转移酶基因家族的进化动态、生化机制及其在植物逆境适应中的作用 | 首次全面整合BAHD酰基转移酶的进化、结构和调控见解，并讨论了功能冗余、底物杂泛性和生物安全性等挑战 | 功能冗余和底物杂泛性带来的研究困难，以及生物安全性考虑 | 阐明BAHD酰基转移酶基因家族在植物中进化、功能和作用机制，并探索其在代谢工程和作物改良中的应用潜力 | BAHD酰基转移酶基因家族及其编码的酶 | 计算生物学， 分子生物学 | NA | 比较基因组学、结构生物学、组学分析 | NA | 基因组数据和结构数据 | NA | 代谢工程、合成生物学、作物改良技术 | 植物 | 苯丙烷代谢途径、角质和软木脂聚合、挥发性酯生物合成、酰化类黄酮合成途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 138 | 2026-05-29 |
Chromosome-Level Genome Assembly of the Allotetraploid Gynostemma pentaphyllum Provides Novel Insights Into the Biosynthesis of Ginsenoside and Gypenoside LVI
2026-Jun, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70598
PMID:41821502
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研究论文 | 组装了四倍体绞股蓝的染色体级别基因组，并揭示了绞股蓝中人参皂苷和绞股蓝皂苷LVI生物合成的分子机制 | 首次组装了四倍体绞股蓝的染色体级别基因组，发现了GpCYP88AB3作为双功能酶催化原人参二醇和2α-OH-PPD的合成，揭示了人参科和五加科植物中P450酶功能的趋同进化 | 仅分析了遂宁种群，未对其他地理种群进行基因组比较 | 阐明绞股蓝中达玛烷型人参皂苷和绞股蓝皂苷LVI差异积累的机制 | 绞股蓝的基因组及关键代谢产物合酶GpCYP88AB3 | 基因组学 | NA | 染色体级别基因组组装，多组学分析，体内/体外实验 | NA | 基因组序列，转录组数据，代谢组数据 | 遂宁种群（四倍体）和南宁种群（二倍体）的绞股蓝样本 | NA | NA | NA | 医学，生物技术 |
| 139 | 2026-05-29 |
How custom polymerases are driving innovation in synthetic biology
2026-Jun, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102682
PMID:41990559
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综述 | 综述定制聚合酶如何通过工程改造突破天然催化局限，推动合成生物学创新 | 系统总结了聚合酶工程在合成遗传聚合物（XNA）和RNA引物延伸合成方面的突破，重新定义了遗传功能的化学边界 | 未提及定制聚合酶的实际应用案例及潜在脱靶效应等局限性 | 阐述定制聚合酶在合成生物学、生物技术和分子医学领域的创新驱动作用 | 定制聚合酶、RNA聚合酶、人工合成遗传聚合物（XNA） | 合成生物学 | NA | 聚合酶工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物技术, 分子医学 |
| 140 | 2026-05-29 |
Chemical and synthetic biology tools to interrogate and control cell-cell interactions in vivo
2026-Jun, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102688
PMID:42048798
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综述 | 综述了用于在活体动物中研究和控制细胞间相互作用的化学与合成生物学工具的最新进展 | 重点介绍了直接原位探究细胞间通信的方法，以保留细胞动态、组织架构和环境线索 | 未提及具体局限性 | 阐明如何利用化学与合成生物学工具在生物体内探究和控制细胞介导及蛋白介导的通信 | 活体动物内的细胞和蛋白质介导的通信过程 | 合成生物学 | NA | 化学工具、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 多细胞生物（如哺乳动物模型） | 细胞-细胞相互作用控制回路 | 生物学、发育生物学、组织工程 |