合成生物学相关文章
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当前共找到 167 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-06-01 |
From known knowns to unknown unknowns: synthetic biology paths to antimicrobial discovery
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102759
PMID:42066660
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研究论文 | 提出一个以合成生物学为中心的框架，用于绘制抗菌天然产物沿化学新颖性和工程可及性两个轴线的图谱 | 通过两个轴线（化学新颖性和工程可及性）引入四象限框架，将天然产物从已知已知扩展到未知未知，并强调象限的动态性，为合成生物学策略提供新视角 | NA | 开发一个基于合成生物学的框架，以指导抗菌天然产物的发现和工程化，应对耐药性挑战 | 抗菌天然产物及其化学结构 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 142 | 2026-05-31 |
Design of strictly orthogonal biosensors for maximizing renewable biofuel overproduction
2026-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.015
PMID:40939890
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研究文章 | 通过机器学习模型BT预测转录因子BmoR的关键残基区域，实现严格正交生物传感器设计，最大化可再生生物燃料的过量生产 | 首次利用机器学习模型BT预测三个关键残基区域，结合半理性工程改造BmoR突变体实现严格信号分子正交性，并建立TF-SM氢键计数主导作用的框架 | 该研究中BT模型的预测准确率为88.5%，可能存在预测误差；实验仅限于BmoR和四种信号分子，通用性尚待验证 | 通过机器学习指导的转录因子进化，实现严格正交生物传感器设计，提高可再生生物燃料产量 | 转录激活因子BmoR及其与信号分子的相互作用 | 机器学习 | NA | 机器学习, 随机森林算法, Discovery Studio分子模拟, 微量热泳动(MST)亲和力测定, 半理性工程 | 随机森林模型 | 分子模拟数据, 实验验证数据 | 245个TF-SM复合物用于训练和测试，5700个BmoR突变体与4种信号分子模拟得到22800个复合物 | NA | 微生物（未具体指明） | 基于BmoR的正交生物传感器 | 合成生物学, 代谢工程, 能源 |
| 143 | 2026-05-31 |
From transport to regulation: systems engineering for high-efficiency dicarboxylic acid biosynthesis
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103499
PMID:42034010
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综述 | 本文综述了通过酶工程、系统代谢工程和合成生物学方法提高中长链二元酸生物合成效率的策略 | 重点强调了疏水底物跨膜转运机制增强和新型转运蛋白挖掘，以及针对关键酶（如细胞色素P450）的蛋白质工程策略，包括理性设计、融合表达和新型二聚化技术 | 主要受限于低质量传递效率、关键氧化酶系统不稳定和细胞代谢失衡等瓶颈 | 为中长链二元酸的高效和可持续生物制造提供理论指导 | 中长链二元酸生物合成系统和相关酶（如细胞色素P450） | 合成生物学 | NA | 酶工程、系统代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 蛋白质工程、融合表达、二聚化技术 | NA | 反向β氧化循环、辅因子再生和能量代谢重编程 | 工业生物技术、材料 |
| 144 | 2026-05-31 |
Bacillus methanolicus as an emerging platform for energy-efficient biomanufacturing from one-carbon and marine resources
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103500
PMID:42056785
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综述 | 本文综述了嗜热甲醇芽孢杆菌作为一种新兴的生物制造平台，能够高效利用甲醇和甘露醇进行可持续化学生产 | 强调了该菌株在热生长、海水适应性和能量高效甲醇同化途径方面的固有优势，并总结了合成生物学工具的最新进展以实现理性菌株工程 | 讨论了从甲醇和甘露醇进行生物制造面临的挑战，但未深入量化实际瓶颈 | 探讨嗜热甲醇芽孢杆菌作为连接一碳和海洋衍生底物与可持续化学合成的多功能平台的潜力 | 嗜热甲醇芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 嗜热甲醇芽孢杆菌 | 甲醇和甘露醇代谢路径 | 工业生物技术 |
| 145 | 2026-05-31 |
The convergence of AI-driven engineering biology and emerging technologies advancing globally networked autonomous biofoundries
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103503
PMID:42068969
|
综述 | 本文概述了人工智能驱动工程生物学与新兴技术的融合，推动全球网络化自主生物工厂的发展 | 提出AI驱动的全自主生物工厂概念，整合计算设计、自动化制造和数据驱动学习，实现自我改进的设计-构建-测试-学习循环 | NA | 综述塑造AI驱动合成生物学的技术，强调其与自动化、数字化和小型化的融合趋势 | AI驱动的合成生物学技术，包括全细胞建模、数字孪生及自动化生物工厂 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 146 | 2026-05-31 |
Systems-level regulation principles for microbial lignin valorization
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103479
PMID:41875688
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综述 | 系统总结微生物木质素增值的调控原理，涵盖代谢调控、转录因子调控和动态生物传感器调控 | 首次从系统层面整合代谢调控、转录因子工程和动态传感器调控，提出提升木质素生物转化效率的集成框架 | 未涉及具体实验验证，且对工业规模化应用的挑战分析有限 | 阐述微生物木质素增值的系统级调控原理 | 微生物细胞工厂及木质素衍生的芳香族化合物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术、环境 |
| 147 | 2026-05-31 |
The TfoX revolution: a review of genetic engineering in Vibrio natriegens
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103506
PMID:42119170
|
综述 | 本文综述了Vibrio natriegens的基因工程工具发展，特别是TfoX介导的自然转化能力如何推动其成为合成生物学底盘 | 系统梳理了TfoX介导的遗传能力机制如何突破V. natriegens的基因改造瓶颈，将其转变为可编程底盘 | 仍面临基因组编辑效率和规模化应用的挑战 | 概述V. natriegens基因工程方法的演进及应用潜力 | V. natriegens菌株及其TfoX调控机制 | 合成生物学 | NA | TfoX介导的自然转化 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 合成生物学 |
| 148 | 2026-05-29 |
The BAHD Acyltransferase Gene Family: Evolutionary Dynamics, Biochemical Mechanisms, and Roles in Plant Stress Adaptation
2026-Jun, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70597
PMID:41810805
|
综述论文 | 该文整合了BAHD酰基转移酶基因家族的进化动态、生化机制及其在植物逆境适应中的作用 | 首次全面整合BAHD酰基转移酶的进化、结构和调控见解，并讨论了功能冗余、底物杂泛性和生物安全性等挑战 | 功能冗余和底物杂泛性带来的研究困难，以及生物安全性考虑 | 阐明BAHD酰基转移酶基因家族在植物中进化、功能和作用机制，并探索其在代谢工程和作物改良中的应用潜力 | BAHD酰基转移酶基因家族及其编码的酶 | 计算生物学， 分子生物学 | NA | 比较基因组学、结构生物学、组学分析 | NA | 基因组数据和结构数据 | NA | 代谢工程、合成生物学、作物改良技术 | 植物 | 苯丙烷代谢途径、角质和软木脂聚合、挥发性酯生物合成、酰化类黄酮合成途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 149 | 2026-05-29 |
Chromosome-Level Genome Assembly of the Allotetraploid Gynostemma pentaphyllum Provides Novel Insights Into the Biosynthesis of Ginsenoside and Gypenoside LVI
2026-Jun, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70598
PMID:41821502
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研究论文 | 组装了四倍体绞股蓝的染色体级别基因组，并揭示了绞股蓝中人参皂苷和绞股蓝皂苷LVI生物合成的分子机制 | 首次组装了四倍体绞股蓝的染色体级别基因组，发现了GpCYP88AB3作为双功能酶催化原人参二醇和2α-OH-PPD的合成，揭示了人参科和五加科植物中P450酶功能的趋同进化 | 仅分析了遂宁种群，未对其他地理种群进行基因组比较 | 阐明绞股蓝中达玛烷型人参皂苷和绞股蓝皂苷LVI差异积累的机制 | 绞股蓝的基因组及关键代谢产物合酶GpCYP88AB3 | 基因组学 | NA | 染色体级别基因组组装，多组学分析，体内/体外实验 | NA | 基因组序列，转录组数据，代谢组数据 | 遂宁种群（四倍体）和南宁种群（二倍体）的绞股蓝样本 | NA | NA | NA | 医学，生物技术 |
| 150 | 2026-05-29 |
How custom polymerases are driving innovation in synthetic biology
2026-Jun, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102682
PMID:41990559
|
综述 | 综述定制聚合酶如何通过工程改造突破天然催化局限，推动合成生物学创新 | 系统总结了聚合酶工程在合成遗传聚合物（XNA）和RNA引物延伸合成方面的突破，重新定义了遗传功能的化学边界 | 未提及定制聚合酶的实际应用案例及潜在脱靶效应等局限性 | 阐述定制聚合酶在合成生物学、生物技术和分子医学领域的创新驱动作用 | 定制聚合酶、RNA聚合酶、人工合成遗传聚合物（XNA） | 合成生物学 | NA | 聚合酶工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物技术, 分子医学 |
| 151 | 2026-05-29 |
Chemical and synthetic biology tools to interrogate and control cell-cell interactions in vivo
2026-Jun, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102688
PMID:42048798
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综述 | 综述了用于在活体动物中研究和控制细胞间相互作用的化学与合成生物学工具的最新进展 | 重点介绍了直接原位探究细胞间通信的方法，以保留细胞动态、组织架构和环境线索 | 未提及具体局限性 | 阐明如何利用化学与合成生物学工具在生物体内探究和控制细胞介导及蛋白介导的通信 | 活体动物内的细胞和蛋白质介导的通信过程 | 合成生物学 | NA | 化学工具、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 多细胞生物（如哺乳动物模型） | 细胞-细胞相互作用控制回路 | 生物学、发育生物学、组织工程 |
| 152 | 2026-05-26 |
Functions and optimization of soft law in the international governance of synthetic biology: The predicament of hard law vs. the rise of soft law
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.11.005
PMID:42179736
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研究论文 | 探讨合成生物学国际治理中软法与硬法的功能分工与协作模式，指出软法在应对伦理风险方面的优势及与硬法协同的必要性 | 提出“软法引导、硬法固化、软法反馈”的混合治理模型，强调软法在技术适应性、共识构建和灵活性方面的不可替代作用 | 未具体讨论软法实施效果和定量评估指标，缺乏对各国实际采纳情况的实证分析 | 分析合成生物学国际治理中软法与硬法的现有困境，提出优化协作的治理框架 | 合成生物学领域的国际法律体系（BWC、CBD）及软法工具（伦理指南、政策建议、行为准则） | 政策与法律研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学国际治理 |
| 153 | 2026-05-22 |
Extended Dissipative Analysis for Uncertain Delayed Genetic Regulatory Networks via Interval Type-2 T-S Fuzzy Framework
2026-Jun, IEEE transactions on cybernetics
IF:9.4Q1
DOI:10.1109/TCYB.2026.3652172
PMID:41553905
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研究论文 | 本文在区间二型T-S模糊框架下研究不确定时滞基因调控网络的扩展耗散性分析 | 首次利用区间二型模糊集捕获基因调控网络的复杂动态和参数不确定性，通过构建新Lyapunov-Krasovskii泛函导出最大允许时滞界限，并开发隶属函数依赖的稳定性准则以降低保守性 | 数值示例显示了优于现有方法的性能，但未提及其他实际约束或实验验证 | 发展不确定时滞基因调控网络的鲁棒控制策略理论分析和设计 | 不确定时滞基因调控网络 | 机器学习 | NA | NA | 区间二型T-S模糊模型 | 数值仿真数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 154 | 2026-05-10 |
Bioconversion of carotenoids into high-value crocins using a marine sponge carotenoid cleavage dioxygenase
2026-Jun, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.71118
PMID:41889127
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研究论文 | 研究发现海绵来源的类胡萝卜素裂解双加氧酶（SdCDO）能裂解番茄红素和β-胡萝卜素生成藏花素前体，实现藏花素在番茄果实中的积累 | 首次揭示海洋海绵来源的CCD酶具有意外的酶促可塑性，能够将植物类胡萝卜素代谢重定向至藏花素生物合成途径，而非预期的视黄醇生成 | 未明确探讨SdCDO在天然海绵宿主中的生理功能，且研究仅在单一种植物（番茄）中进行验证 | 探索海洋海绵中类胡萝卜素裂解双加氧酶的功能多样性及其在合成生物学和作物生物强化中的应用潜力 | 海洋海绵Suberites domuncula的类胡萝卜素裂解双加氧酶（SdCDO） | 合成生物学 | NA | 异源表达、代谢组学分析、超微结构分析、转录组学分析 | NA | 代谢物数据、转录组数据 | 大肠杆菌和番茄果实样本 | NA | 大肠杆菌, 番茄 | 藏花素生物合成途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 155 | 2026-05-06 |
Plant oil body engineering: A roadmap from multiscale structures to next-generation food systems
2026-Jun-01, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.149010
PMID:41905230
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综述 | 本文构建了植物油脂体的多尺度工程框架，从多尺度结构到下一代食品系统提供路线图 | 整合物理场、界面工程和合成生物学等多学科策略，建立了清晰的“分子结构-界面性质-宏观功能”关系，实现植物油脂体的可编程功能调控 | 技术转化面临规模化挑战以及技术经济和监管障碍 | 系统综述植物油脂体的多尺度工程方法，推动其从基础研究到工业应用 | 植物油脂体 | 合成生物学 | NA | 界面工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物（种子） | NA | 食品 |
| 156 | 2026-04-21 |
Deep learning revolutionizes protein research: Advances in structure prediction, functional annotation, and engineered design
2026-Jun, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.03.012
PMID:41839238
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综述 | 本文综述了深度学习如何通过连接结构预测、功能注释和理性设计，形成一个协同循环，从而彻底改变蛋白质研究 | 提出了一个统一的“预测-理解-创造”范式，展示了深度学习在蛋白质结构预测、功能注释和从头设计中的突破性进展，并阐述了这些领域如何相互促进，形成一个自我强化的循环 | 在数据稀缺性、模型可解释性以及分布外泛化方面仍存在挑战 | 阐述深度学习如何变革蛋白质研究，并展示结构预测、功能注释和理性设计之间的协同循环 | 蛋白质（特别是单域、球状蛋白质） | 机器学习 | NA | 深度学习，生成式AI，逆向折叠模型，混合实验-计算工作流（如与AI集成的冷冻电镜） | 端到端深度学习模型（如AlphaFold2），多模态模型，生成式AI | 序列数据，3D坐标，相互作用数据 | NA | NA | NA | NA | 药物开发，合成生物学 |
| 157 | 2026-04-08 |
Precision-engineered starch: Integrating metabolic engineering and cell-free synthetic biology for sustainable bioplastics and functional foods
2026-Jun-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2026.125146
PMID:41943368
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综述 | 本文综述了通过代谢工程和无细胞合成生物学技术，从下游修饰转向精确生物合成设计，以开发可持续生物塑料和功能性食品用淀粉的最新进展 | 整合了植物代谢工程（特别是CRISPR-Cas基因组编辑）和无细胞合成生物学平台，将淀粉开发从传统下游修饰转向精确的生物合成工程，实现结构可控、高纯度、可重复生产的淀粉设计 | NA | 开发具有特定营养品质、技术功能和可持续性目标的下一代生物基材料——工程化淀粉 | 淀粉生物合成途径、淀粉颗粒结构（直链淀粉-支链淀粉比例、链长分布、磷酸酯化等）及其与理化性质、消化性、血糖反应和抗性淀粉形成的关系 | NA | NA | 代谢工程、CRISPR-Cas基因组编辑、无细胞合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 植物（主要作物） | 淀粉生物合成途径（涉及颗粒结合淀粉合酶、可溶性淀粉合酶、淀粉分支酶和脱支酶的协调作用） | 农业, 食品, 材料, 工业生物技术 |
| 158 | 2026-04-03 |
Biological reduction of Fenton sludge: Electron transfer mechanisms, regulatory strategies, and prospects
2026-Jun, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134424
PMID:41833913
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综述 | 本文综述了Fenton污泥生物还原中的电子转移机制、调控策略及未来前景，强调其在资源回收中的应用潜力 | 聚焦于多机制动态耦合的电子转移网络框架，并详细探讨了环境条件对各机制的动态响应及增强协同作用的调控策略 | NA | 探讨Fenton污泥生物还原的资源回收策略，以促进高效利用和生物铁还原的多样化发展 | Fenton污泥及其生物还原过程，特别是铁还原细菌和电子转移机制 | 环境生物技术 | NA | 系统生物学、合成生物学、微生物电化学技术 | NA | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | 环境 |
| 159 | 2026-03-24 |
Advances in the combined treatment of solid tumors with nanodelivery systems based on engineered bacteria-TME modulation
2026-Jun, Colloids and surfaces. B, Biointerfaces
DOI:10.1016/j.colsurfb.2026.115558
PMID:41707370
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综述 | 本文综述了基于工程化细菌-TME调控与纳米递送系统的联合疗法在实体瘤治疗中的最新研究进展 | 聚焦于工程化细菌与纳米载体系统的联合应用，通过协同反馈机制实现精准递送、可控释放和多模式治疗，为克服传统疗法疗效有限、副作用大和耐药性等问题提供了新思路 | NA | 总结并探讨工程化细菌与纳米递送系统联合治疗实体瘤的研究进展与未来前景 | 实体瘤 | 合成生物学与纳米技术交叉领域 | 实体瘤 | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具（文中未具体指定） | 工程化细菌（文中未具体指定菌种） | 具有原位定植、可编程修饰和靶向特性的工程化细菌，用于重塑肿瘤微环境、穿透屏障并激活免疫反应 | 医学 |
| 160 | 2026-03-23 |
Modular metabolic engineering of Yarrowia lipolytica and semi-rational design of CYP716A520 for enhanced betulinic acid biosynthesis
2026-Jun, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134364
PMID:41802472
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研究论文 | 本研究通过模块化代谢工程改造Yarrowia lipolytica，并结合半理性设计优化CYP716A520酶，以增强桦木酸（betulinic acid）的生物合成 | 首次在Yarrowia lipolytica中通过模块化代谢工程将角鲨烯产量提升813倍，并采用结合计算工具与进化信息的半理性设计策略，成功优化植物来源的P450酶CYP716A520，其L359V变体活性和特异性分别提高4倍和3倍 | 未在摘要中明确提及具体局限性，但可能涉及微生物宿主中植物P450酶的适应性挑战或规模化生产的潜在问题 | 开发可持续且成本效益高的桦木酸微生物生产方法，以替代传统的植物提取 | Yarrowia lipolytica酵母和植物来源的P450酶CYP716A520 | 合成生物学 | NA | 模块化代谢工程、半理性设计、分子动力学模拟 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9（可能涉及，但未在摘要中明确指定，因此输出NA） | Yarrowia lipolytica | 代谢途径工程，包括角鲨烯前体供应路径和P450酶催化系统 | 医药 |