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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2441 | 2024-08-07 |
Piecing Together Cell-like Systems
2013-Aug, Current organic chemistry
IF:1.7Q3
DOI:10.2174/13852728113179990082
PMID:24348089
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研究论文 | 本文讨论了使用定义组件构建模拟生命关键特征的类细胞系统的进展 | 探索了从非生命组件开始模拟生命特定特征的方法,以及利用现有细胞赋予新行为的方法 | NA | 研究合成细胞系统的不同方法 | 类细胞系统的合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2442 | 2024-08-07 |
Frames and comparators: How might a debate on synthetic biology evolve?
2013-Apr, Futures
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.futures.2013.02.002
PMID:23805003
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research paper | 本文探讨了合成生物学(SB)早期公众辩论中框架和比较器的作用及其对辩论发展的影响 | 分析了三种不同技术(生物技术、纳米技术和信息技术)作为讨论合成生物学的框架,并探讨了这些框架如何影响公众对合成生物学的看法 | NA | 研究合成生物学早期公众辩论中框架和比较器的选择如何影响辩论的走向 | 合成生物学及其公众辩论的框架和比较器 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2443 | 2024-08-07 |
Using distal-site mutations and allosteric inhibition to tune, extend, and narrow the useful dynamic range of aptamer-based sensors
2012-Dec-26, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/ja310585e
PMID:23215257
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研究论文 | 本文展示了通过远端位点突变和变构控制来调整、扩展和缩小适配体传感器动态范围的多种互补方法 | 利用易设计的寡核苷酸抑制剂通过竞争适配体的折叠来实现变构控制,从而在目标浓度范围内更精确地调整适配体的亲和力 | NA | 研究如何通过远端位点突变和变构控制来调整适配体传感器的动态范围 | 适配体传感器的动态范围调整 | 合成生物学 | NA | 适配体传感器 | NA | NA | NA |
2444 | 2024-08-07 |
Employing the metabolic "branch point effect" to generate an all-or-none, digital-like response in enzymatic outputs and enzyme-based sensors
2012-Jan-17, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/ac202701c
PMID:22148353
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研究论文 | 本文展示了一种将未受调控酶的典型渐变Michaelis-Menten反应转换为尖锐的全有或全无反应的策略 | 利用代谢网络中的“分支点效应”机制,通过两个或多个酶竞争同一底物,实现了酶反应的尖锐化 | NA | 开发具有数字式输出的生物传感器,并提高合成生物学中酶基催化反应的效率 | 葡萄糖氧化酶(GOx)和己糖激酶(HK)的酶反应 | 生物化学 | NA | 酶反应 | NA | 酶反应数据 | NA |
2445 | 2024-08-07 |
Synthetic biology: an emerging research field in China
2011 Nov-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2011.06.008
PMID:21729747
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综述 | 本文综述了中国在合成生物学及其不同子领域的研究活动,包括遗传电路、最小基因组、化学合成生物学、原细胞和DNA合成等 | 合成生物学被认为是一个新兴的研究领域,将为生物技术带来新的机遇 | 合成生物学在中国仍处于早期发展阶段 | 探讨合成生物学在中国的研究现状及其未来发展潜力 | 遗传电路、最小基因组、化学合成生物学、原细胞和DNA合成等 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献综述和个人交流 | NA |
2446 | 2024-08-07 |
Chemistry of nucleic acids: impacts in multiple fields
2011-Jul-07, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/c1cc11021g
PMID:21483917
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review | 本文综述了过去十年中核酸研究在多个科学和技术领域的重要进展,特别强调了化学在这些发展中的作用和影响。 | NA | NA | 探讨化学在核酸研究中的影响及其在生物学、化学、生物技术、合成生物学、纳米结构和光学材料等领域的发展。 | DNA和RNA研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2447 | 2024-08-07 |
Introduction of customized inserts for s-treamlined assembly and optimization of BioBrick synthetic genetic circuits
2010-Dec-20, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/1754-1611-4-17
PMID:21172029
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研究论文 | 本文介绍了一种使用定制插入物快速生成合成生物电路的技术,并在大肠杆菌中展示了其应用 | 该技术使用了一种新型BioBrick部件(BioScaffold),可以在克隆载体中插入和切除,从而在克隆载体中留下一个间隙,用于放置其他DNA元素 | 标准组装过程不允许对已组装的生物电路进行修改,添加蛋白质标签到现有的BioBrick部件,或添加非BioBrick部件到组装中 | 简化并加速迭代设计-构建-测试过程,允许将不兼容BioBrick组装的序列整合到BioBrick电路中 | 合成生物电路的快速生成和优化 | 合成生物学 | NA | Type IIB限制酶 | NA | DNA序列 | 在大肠杆菌中进行了实验,表达绿色荧光蛋白(GFP)并添加N端标签 |
2448 | 2024-08-07 |
Engineered microorganisms: A new direction in kidney stone prevention and treatment
2024-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.02.005
PMID:38510204
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法改造微生物在预防和治疗肾结石中的研究现状 | 利用合成生物学方法使益生菌获得新的表型或异源蛋白表达能力,通过直接降解促进结石生成的代谢物或间接调节菌群稳态来有效抑制肾结石的发展 | 目前存在的天然益生菌有局限性 | 提供预防和治疗肾结石的新有效思路 | 肠道和尿路中的微生物 | 合成生物学 | 肾结石 | 微生物工程 | NA | NA | NA |
2449 | 2024-08-07 |
Empowering Protein Engineering through Recombination of Beneficial Substitutions
2024-Mar-15, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202303889
PMID:38288640
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综述 | 本文综述了通过重组有益替换来增强蛋白质工程潜力的实验和计算机辅助方法 | 强调了集成和机器学习引导策略在生成具有更好多样性、覆盖范围和大小的筛选库中的作用 | NA | 探讨如何通过重组方法实现单个有益替换的潜在增强 | 蛋白质工程中的重组方法 | 生物工程 | NA | NA | NA | NA | NA |
2450 | 2024-08-07 |
teemi: An open-source literate programming approach for iterative design-build-test-learn cycles in bioengineering
2024-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011929
PMID:38457467
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研究论文 | 本文介绍了一个名为teemi的开源计算机辅助设计和分析平台,该平台采用文学编程用户界面,支持生物工程中的迭代设计-构建-测试-学习循环。 | teemi平台遵循FAIR原则,支持用户友好的模拟、组织和指导,以及机器学习在代谢途径设计中的应用。 | NA | 开发一个支持生物工程迭代设计-构建-测试-学习循环的开源平台。 | 生物工程中的设计、模拟、数据集成和分析,以及代谢途径的机器学习设计。 | 生物工程 | NA | 机器学习 | NA | 多变量数据集 | NA |
2451 | 2024-08-07 |
Engineering stringent genetic biocontainment of yeast with a protein stability switch
2024-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-44988-8
PMID:38316765
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研究论文 | 本文描述了一种基于条件性稳定必需蛋白质的遗传编码生物遏制系统 | 该系统基于条件性蛋白质稳定性,机制上与先前报道的遗传生物遏制系统正交 | NA | 开发一种遗传编码的生物遏制系统,以确保工程微生物在开放环境应用中的安全性 | 酵母菌的遗传生物遏制系统 | 合成生物学 | NA | 遗传编码生物遏制系统 | NA | 基因数据 | 775个必需基因 |
2452 | 2024-08-07 |
Flapjack: Data Management and Analysis for Genetic Circuit Characterization
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_23
PMID:38468101
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research paper | Flapjack平台为合成基因电路工程的DBTL循环中的设计、构建、测试和学习阶段提供了一个全面的数据管理和分析解决方案 | Flapjack平台通过其用户友好的界面和与外部软件的兼容性,为合成生物学研究提供了一个实用的工具 | NA | 解决合成基因电路工程DBTL循环中的挑战,促进基因电路的表征和优化 | 合成基因电路的表征和优化 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据和相关元数据 | NA |
2453 | 2024-08-07 |
Metaphors in search of a target: the curious case of epigenetics
2015-Apr-03, New genetics and society
IF:1.3Q4
DOI:10.1080/14636778.2015.1034849
PMID:26064079
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研究论文 | 本文探讨了在表观遗传学背景下隐喻的产生,通过收集科学和流行写作中的隐喻例子以及对英国两家大报中使用的隐喻进行系统分析 | 分析了表观遗传学中隐喻的来源域和目标域的不确定性,揭示了科学界和社会对表观遗传学理解的挣扎 | 难以确定隐喻的目标域,这可能反映了科学界和社会对表观遗传学意义的争议 | 探讨表观遗传学中隐喻的产生及其在科学和公众沟通中的应用 | 表观遗传学中的隐喻及其在科学和公众沟通中的使用 | NA | NA | NA | NA | 文本 | 涉及两份英国大报中的隐喻使用 |
2454 | 2024-08-07 |
Conformational Study of an Artificial Metal-Dependent Regulation Site for Use in Designer Proteins
2013-Jul, Zeitschrift fur anorganische und allgemeine Chemie
IF:1.1Q4
DOI:10.1002/zaac.201300131
PMID:25995524
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2455 | 2024-08-07 |
Cooperativity to increase Turing pattern space for synthetic biology
2015-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb500233u
PMID:25122550
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研究论文 | 本文通过建模反应扩散系统,探讨了如何在合成生物学中增加图灵模式的参数空间 | 研究预测了陡峭的剂量-反应函数(由协同作用产生)对于图灵模式是必要的,这种陡峭性增加了参数空间并减少了激活剂和抑制剂之间差异扩散的需求 | 本文主要探讨了线性场景在反应扩散系统中的局限性 | 旨在理解和工程化图灵模式网络,以应用于合成生物学 | 研究对象为反应扩散系统中的两种形态发生素 | 合成生物学 | NA | 反应扩散系统建模 | 反应扩散模型 | 参数空间分析 | NA |
2456 | 2024-08-07 |
Chassis organism from Corynebacterium glutamicum--a top-down approach to identify and delete irrelevant gene clusters
2015-Feb, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.201400041
PMID:25139579
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研究论文 | 本研究采用自上而下的方法,从谷氨酸棒杆菌ATCC 13032中构建底盘生物,旨在识别并删除与在定义培养基上快速生长无关的基因簇 | 研究引入了相关基因的新概念,并展示了构建适用于生物技术应用底盘的一般策略 | NA | 通过删除无关基因簇,减少谷氨酸棒杆菌的基因组大小,以构建适用于生物技术应用的底盘生物 | 谷氨酸棒杆菌ATCC 13032的基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因敲除 | NA | 基因组数据 | 41个基因簇,其中36个成功删除,10个基因组减少的菌株显示出生长速率受损 |
2457 | 2024-08-07 |
Engineering living functional materials
2015-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb500113b
PMID:25592034
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研究论文 | 本文提出并验证了通过合成生物学工具,将活细胞与无机组件结合,创造出具有新型功能的'活功能材料'和'活材料合成平台'的概念 | 本文首次展示了通过合成基因电路在E. coli生物膜中实现化学诱导响应的电开关,并动态组织生物-无机材料,模板化金纳米棒、金纳米线和金属/半导体异质结构,以及合成半导体纳米颗粒 | NA | 探索通过合成生物学工具创造新型活功能材料和活材料合成平台的可能性 | E. coli生物膜与无机材料的结合 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路 | NA | 生物膜 | NA |
2458 | 2024-08-07 |
When plants produce not enough or at all: metabolic engineering of flavonoids in microbial hosts
2015, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2015.00007
PMID:25688249
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综述 | 本文综述了通过生物技术生产天然或非天然黄酮类化合物的合理方法,分析了异源生物中农业/医药化合物组合生物合成的意义 | 利用微生物细胞培养作为生物工厂,通过代谢工程方法强化自然代谢途径,发现新的天然和非天然植物黄酮类化合物的生产方式 | NA | 探讨通过代谢工程和合成生物学方法优化黄酮类化合物的生产 | 黄酮类化合物的代谢工程和合成生物学应用 | 化学生物工程 | NA | 代谢工程 | NA | 基因组数据 | NA |
2459 | 2024-08-07 |
Core concept: Synthetic biology-change, accelerated
2014-Dec-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1419688111
PMID:25468948
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2460 | 2024-08-07 |
Effective use of a horizontally-transferred pathway for dichloromethane catabolism requires post-transfer refinement
2014-Nov-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.04279
PMID:25418043
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研究论文 | 研究通过实验室进化模拟水平基因转移和精炼过程,展示了引入的二氯甲烷降解途径的有效使用需要细菌宿主发生特定的突变 | 构建了一个携带降解途径和氯离子出口蛋白的合成移动遗传元件,直接促进了在多种Methylobacterium环境分离株中有效降解二氯甲烷 | NA | 探讨水平基因转移后精炼过程的重要性及其在生物修复和合成生物学中的应用 | 水平基因转移后的基因和途径在微生物中的功能及进化精炼 | NA | NA | 实验室进化 | NA | 遗传元件 | 两种自然降解二氯甲烷的菌株及多种Methylobacterium环境分离株 |