合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2481	2024-08-07	Yeast synthetic biology platform generates novel chemical structures as scaffolds for drug discovery 2014-May-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/sb400177x PMID:24742115	research paper	本文首次报道了使用面包酵母通过组合遗传学方法生成74种新型化合物，这些化合物作为药物发现的支架结构	本文引入了一种新的合成生物学方法，通过与目标蛋白质的“共进化”生成新型化合物，这些化合物具有良好的生物活性，且结构复杂性高于合成片段	NA	开发一种新的合成生物学平台，用于生成新型化学结构作为药物发现的支架	74种新型化合物及其生物活性和结构特性	合成生物学	NA	组合遗传学方法	NA	化合物	74种新型化合物
2482	2024-08-07	Genetically engineered transvestites reveal novel mating genes in budding yeast 2013-Dec, Genetics IF:3.3Q2 DOI:10.1534/genetics.113.155846 PMID:24121774	研究论文	通过基因工程改造的“变装”酵母细胞揭示了新的交配基因	发现了新的MATα特异性蛋白Afb1，该蛋白干扰a因子（MATa细胞分泌的pheromone），并证明了强烈的pheromone分泌对有效交配至关重要	变装细胞的交配效率较低，且在所有潜在伙伴都分泌较少pheromone的情况下交配更弱	研究酵母交配过程中的效率控制因子	酵母细胞的交配类型特异性蛋白	NA	NA	基因工程	NA	转录组	NA
2483	2024-08-07	Design and analysis of a tunable synchronized oscillator 2013-Nov-18, Journal of biological engineering IF:5.7Q1 DOI:10.1186/1754-1611-7-26 PMID:24245660	研究论文	本文设计并分析了一种可调谐的同步振荡器遗传电路，用于研究同步转录反馈环路	通过引入化学诱导的抑制因子，扩大了振荡发生的条件范围，并允许调节振荡频率	NA	研究同步转录反馈环路在不同条件和实验设置下的行为	设计了两种遗传电路，能够在小规模的大肠杆菌细胞群体中展示同步振荡的绿色荧光蛋白表达	合成生物学	NA	NA	NA	图像	小规模的大肠杆菌细胞群体
2484	2024-08-07	Tuning response curves for synthetic biology 2013-Oct-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/sb4000564 PMID:23905721	研究论文	本文探讨了合成生物学中系统响应曲线的调整问题	提出了一个数学公式来捕捉广泛的生物响应曲线，并定义了一系列调整变体	NA	研究如何通过实验改变系统的响应曲线形状	细胞系统的响应速率调整	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
2485	2024-08-07	A survey of enabling technologies in synthetic biology 2013-May-10, Journal of biological engineering IF:5.7Q1 DOI:10.1186/1754-1611-7-13 PMID:23663447	综述	本文综述了合成生物学领域的关键技术，并探讨了这些技术如何促进该领域的创新和发展	本文通过调查合成生物学实践者的意见和经验，总结了支持生物系统工程的关键技术，并强调了这些技术对合成生物学创新的重要性	文章主要基于调查结果，可能未涵盖所有合成生物学领域的关键技术，且对技术的未来发展趋势和挑战讨论有限	旨在探讨合成生物学中的关键技术及其对创新的影响，并提出相应的政策和管理建议	合成生物学领域的关键技术和实践者	合成生物学	NA	DNA合成和测序技术，生物部件的公共和私有注册库，DNA构建体的物理组装标准方法，基因组数据库，DNA序列搜索、比对、分析和编辑的软件工具	NA	文本	自认参与合成生物学研究的实践者社区
2486	2024-08-07	Microbial synthetic biology for human therapeutics 2012-Jun, Systems and synthetic biology DOI:10.1007/s11693-012-9092-0 PMID:23730360	研究论文	本文讨论了通过微生物途径利用合成生物学开发新型人类治疗药物的潜力	本文提出了利用合成生物学工具在微生物系统中表达基于植物的药物化合物，并探讨了传统医学知识在微生物系统中开发新药物的价值	NA	探讨合成生物学在人类治疗学中的应用，特别是通过微生物途径	微生物合成细胞和现有微生物的再工程化，用于合成治疗产品	合成生物学	NA	合成生物学工具	NA	NA	NA
2487	2024-08-07	Landscape and global stability of nonadiabatic and adiabatic oscillations in a gene network 2012-Mar-07, Biophysical journal IF:3.2Q2 DOI:10.1016/j.bpj.2012.02.002 PMID:22404922	研究论文	本文通过量化潜在景观来确定生物振荡的全局稳定性和相干性，研究了两个相互抑制和激活对方的基因网络模体，发现了两种重要的波动类型，并探讨了绝热和非绝热两种振荡机制。	本文发现了两种新的振荡机制：绝热机制通过平均基因状态的有效相互作用产生稳定振荡，非绝热机制通过慢速绑定/解绑到启动子的时间延迟产生稳定振荡。	NA	研究生物振荡的全局稳定性和相干性	基因网络中的相互抑制和激活的基因	生物学	NA	NA	NA	NA	NA
2488	2024-08-07	Deterministic Function Computation with Chemical Reaction Networks 2012, Natural computing IF:1.7Q2 DOI:10.1007/s11047-013-9393-6 PMID:25383068	研究论文	本文介绍了化学反应网络（CRNs）在确定性函数计算中的应用，并展示了CRNs如何通过分子种类的计数来表示函数的输出。	本文首次提出了通过CRNs进行确定性函数计算的概念，并证明了函数图是半线性集时，CRN可以确定性地计算该函数。	CRNs只能计算图是半线性集的函数，这限制了其计算能力的范围。	探讨化学反应网络在确定性函数计算中的应用及其计算能力。	化学反应网络（CRNs）及其在函数计算中的应用。	NA	NA	化学反应网络（CRNs）	NA	NA	NA
2489	2024-08-07	Synthetic biology: ethical ramifications 2009 2009-Dec, Systems and synthetic biology DOI:10.1007/s11693-009-9042-7 PMID:19816805	研究论文	本文探讨了合成生物学从宣言阶段到研究项目的转变，并分析了其伦理影响	合成生物学从单一研究方向分化出多个不同的研究轨迹	NA	探讨合成生物学的伦理影响及其在可再生能源、廉价药物生产和环境修复等领域的应用	合成生物学的设计和构建新生物部件、设备和系统，以及重新设计自然生物系统	NA	NA	NA	NA	NA	NA
2490	2024-08-07	EcoGenoRisk: Developing a computational ecological risk assessment tool for synthetic biology 2024-Apr-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987) DOI:10.1016/j.envpol.2024.123647 PMID:38402941	研究论文	本文介绍了EcoGenoRisk，一个用于合成生物学生物入侵风险评估的新型计算工具	EcoGenoRisk通过筛选与合成生物微生物基因相似的微生物栖息地，预测合成生物微生物可能建立种群的位置	NA	开发一个计算工具，用于评估合成生物学中修改微生物对非预期环境的潜在风险	合成生物学中的修改微生物及其对环境的潜在影响	合成生物学	NA	生物信息学	NA	基因组数据	520个古菌和32,828个细菌的完整基因组
2491	2024-08-07	Automated high-throughput DNA synthesis and assembly 2024-Mar-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26967 PMID:38500977	综述	本文综述了DNA合成与组装技术的最新进展，重点介绍了自动化和高通量技术的发展及其在合成生物学中的应用	介绍了自动化液体处理工作站和集成实验设备的使用，提高了合成生物学领域的效率	NA	探讨DNA合成与组装技术的创新和改进	DNA合成与组装技术	合成生物学	NA	自动化液体处理	NA	DNA序列	NA
2492	2024-08-07	Engineered mRNA-ribosome fusions for facile biosynthesis of selenoproteins 2024-Mar-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2321700121 PMID:38442159	研究论文	本研究通过将核糖体RNA（rRNA）与信使RNA（mRNA）进行功能性融合，开发了一种新型策略来改进核糖体工程，以促进硒蛋白的生物合成	本研究首次提出了一种基于mRNA-rRNA融合的新型核糖体工程策略，即RiboU，通过将16S rRNA与硒半胱氨酸插入序列（SECIS）共价结合，实现了硒半胱氨酸（Sec）在蛋白质中的特定位点插入	NA	开发一种新型核糖体工程策略，以促进硒蛋白的生物合成	核糖体RNA（rRNA）与信使RNA（mRNA）的功能性融合	合成生物学	NA	mRNA-rRNA融合技术	NA	RNA	三种功能性目标硒蛋白
2493	2024-08-07	Design and optimization of ε-poly-l-lysine with specific functions for diverse applications 2024-Mar, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.129513 PMID:38262828	综述	本文综述了ε-聚-L-赖氨酸（ε-PL）的生产及其分子结构修饰的最新进展，重点讨论了提高ε-PL生产效率和多样性的挑战与解决方案	强调了ε-PL在食品保鲜和生物医学领域的应用潜力，并展望了通过合成生物学定制ε-PL分子结构的可能性	目前微生物合成ε-PL的效率受限于遗传工程和分子结构修饰的低效性	探讨ε-PL的生产优化及其在多领域应用中的分子结构修饰	ε-聚-L-赖氨酸及其衍生物	NA	NA	合成生物学	NA	NA	NA
2494	2024-08-07	DNA methylases for site-selective inhibition of type IIS restriction enzyme activity 2024-Jan-25, Applied microbiology and biotechnology IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s00253-024-13015-7 PMID:38270650	研究论文	本文研究了通过重组DNA甲基化酶来抑制IIS型限制酶活性的方法	开发了可用于合成生物学和DNA组装技术的重组DNA甲基化酶	NA	生产能够体外抑制IIS型限制酶的重组DNA甲基化酶	DNA甲基化酶及其在抑制IIS型限制酶活性中的应用	合成生物学	NA	DNA甲基化	NA	DNA	十种甲基化酶
2495	2024-08-07	Protein and peptide engineering for chemical exchange saturation transfer imaging in the age of synthetic biology 2023-06, NMR in biomedicine IF:2.7Q1 DOI:10.1002/nbm.4712 PMID:35150021	综述	本文综述了化学交换饱和转移（CEST）成像中基于蛋白质的对比剂的发展历程，并讨论了合成生物学对其未来发展的影响	介绍了基于多肽的CEST对比剂的设计和工程化，以及酶-底物对作为CEST对比增强剂的合理化	NA	探讨如何提高多肽的选择性、特异性及CEST对比度，并讨论合成生物学对下一代基于蛋白质的CEST对比剂开发的影响	基于蛋白质的CEST对比剂及其在成像中的应用	生物技术	NA	化学交换饱和转移成像（CEST）	NA	NA	NA
2496	2024-08-07	Computer-aided design of biological circuits using TinkerCell 2010 Jul-Aug, Bioengineered bugs DOI:10.4161/bbug.1.4.12506 PMID:21327060	研究论文	本文介绍了一种用于合成生物学中生物电路设计的计算机辅助设计工具TinkerCell	TinkerCell是一个灵活且可扩展的应用程序，能够适应合成生物学领域中的变化	由于合成生物学网络的建模和构建最佳实践尚未确立，TinkerCell的设计需要不断调整	开发一种有效的计算机辅助设计工具，用于合成生物学中的生物网络设计、分析和构建	合成生物学中的生物网络设计	合成生物学	NA	计算机辅助设计 (CAD)	NA	生物网络	NA
2497	2024-08-07	Bioelectricity and CO2-to-butyrate production using photobioelectrochemical cells with bio-hydrogel 2024-Apr, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2024.130530 PMID:38447619	研究论文	本文介绍了一种利用光生物电化学电池（BPEC）通过生物水凝胶将太阳能转化为电能或化学物质的新技术	使用电活性细菌（Shewanella loihica PV-4）减少氧化石墨烯（rGO）纳米片并生产共装配的rGO/Shewanella生物水凝胶作为基本电极，结合合成生物学和纳米技术，提高了电子交换效率	NA	探索光生物电化学电池中高效生物电能和有价值化学物质的生产	光生物电化学电池中的生物水凝胶电极及其在CO2还原为丁酸中的应用	生物技术	NA	光生物电化学技术	NA	生物水凝胶	使用Shewanella loihica PV-4和基因编辑的Clostridium ljungdahlii进行共培养系统
2498	2024-08-07	Advancing the scale of synthetic biology via cross-species transfer of cellular functions enabled by iModulon engraftment 2024-Mar-15, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-46486-3 PMID:38490991	研究论文	本研究通过机器学习分析大量转录组数据，识别出独立调节的基因集（iModulons），并展示了通过iModulon移植实现跨物种细胞功能的转移	首次通过iModulon移植实现了跨物种细胞功能的精确转移，包括生物转化和抗菌抵抗等复杂功能	NA	探索通过iModulon移植实现跨物种细胞功能转移的方法，并优化合成生物学中的菌株设计	细菌转录组数据和细胞功能转移	合成生物学	NA	机器学习	NA	转录组数据	涉及多种Pseudomonas物种和Escherichia coli
2499	2024-08-07	Creating new-to-nature carbon fixation: A guide 2024-Mar, Metabolic engineering IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.ymben.2023.12.012 PMID:38160747	综述	本文提供了一种关于设计和实现新型自然碳固定途径的实用指南	介绍了合成CO固定途径，这些途径比自然途径（如CBB循环）更有效地捕获和转化CO	NA	旨在设计新的生物功能并扩展自然解决方案空间	新型自然碳固定途径	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
2500	2024-08-07	Engineering mammalian cell growth dynamics for biomanufacturing 2024-Mar, Metabolic engineering IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.ymben.2024.01.006 PMID:38325641	研究论文	本文介绍了一种多层次的细胞工程策略，用于可调节的哺乳动物细胞生长阶段的控制	开发了一种结合“油门”和“刹车”系统的双可控系统，实现了哺乳动物细胞生长动态的动态和精确协调	NA	精确控制哺乳动物细胞生长动态，以提高生物制药制造	哺乳动物细胞	生物工程	NA	CRISPR/Cas9	NA	NA	NA