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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2461 | 2024-08-07 |
Synthetic biology outside the cell: linking computational tools to cell-free systems
2014, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2014.00066
PMID:25538941
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综述 | 本文探讨了生物化学网络的体内外模型,特别关注可应用于无细胞表达系统构建的工具 | 本文强调了将数学模型与无细胞系统结合的新一代仿生系统的开发 | NA | 探索生物化学网络模型,并应用于无细胞表达系统的构建 | 生物化学网络的体内外模型及无细胞表达系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2462 | 2024-08-07 |
Synthetic biology of phenotypic adaptation in vertebrates: the next frontier
2013-Jul, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/mst075
PMID:23603936
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研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学方法研究脊椎动物表型适应性的新前沿 | 提出通过合成和操纵“适当”的祖先表型来建立基因型与表型之间的关系,并通过研究适应性突变的化学作用来学习其功能 | 目前大多数正选择氨基酸位点的统计结果尚未经过实验验证 | 通过实验测试正选择氨基酸位点的统计结果,并建立基因型与表型之间的关系 | 脊椎动物的表型适应性及其与环境行为变化的关系 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2463 | 2024-08-07 |
A synthetic biology approach to understanding cellular information processing
2012-Sep-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb300044r
PMID:23411668
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综述 | 本文综述了合成生物学在理解细胞信息处理中的应用和发展 | 合成生物学方法揭示了网络基序的新动态,如简单基序组合产生的自主动态和转录翻译噪声对基序动态的影响 | NA | 增加对细胞信息处理的理解 | 细胞网络的动态特性和网络基序的行为 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路构建与分析 | NA | NA | NA |
2464 | 2024-08-07 |
Targeting duplex DNA with chimeric α,β-triplex-forming oligonucleotides
2012-Sep, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gks410
PMID:22641847
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研究论文 | 研究设计了一系列短的嵌合α,β-三链形成寡核苷酸(TFOs),并研究了它们与荧光标记的二链发夹的相互作用 | 首次报道了嵌合TFOs能够识别双链DNA中的碱基对反转 | NA | 解决三链DNA识别严格受限于多嘌呤序列的问题 | 嵌合α,β-三链形成寡核苷酸(TFOs)与荧光标记的二链发夹的相互作用 | NA | NA | 原生凝胶电泳、阵列热变性和荧光淬灭实验 | NA | DNA | NA |
2465 | 2024-08-07 |
Microfluidic technologies for synthetic biology
2011, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms12063576
PMID:21747695
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综述 | 本文综述了微流控技术在合成生物学中的最新应用,强调其在基因表达/调控动态分析、代谢物的高灵敏度芯片内外检测以及全细胞分析中的潜力 | 微流控技术能够提供前所未有的手段,加速合成生物学的发展,特别是在高分辨率动态基因表达/调控分析和代谢物的高灵敏度检测方面 | NA | 探讨微流控技术如何加速合成生物学的发展,并提供新的生物部件和系统 | 微流控技术在合成生物学中的应用,包括基因表达/调控的动态分析、代谢物的检测和全细胞分析 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | 生物和生化样本 | NA |
2466 | 2024-08-07 |
Synthetic biology of minimal living cells: primitive cell models and semi-synthetic cells
2010-Sep, Systems and synthetic biology
DOI:10.1007/s11693-010-9054-3
PMID:21886680
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研究论文 | 本文总结了2009年ESF合成生物学会议上关于生命最小需求和生物学研究中建设性(合成)方法的概念贡献 | 定义了半合成最小细胞,这些人工制造的基于囊泡的系统由最少数量的基因、蛋白质和生物大分子组成,并可被定义为活的 | NA | 探讨生命最小需求和生物学研究中的合成方法 | 最小生命细胞模型和半合成细胞 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2467 | 2024-08-07 |
Professionalization as a governance strategy for synthetic biology
2009-Dec, Systems and synthetic biology
DOI:10.1007/s11693-009-9037-4
PMID:19816804
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研究论文 | 本文探讨了将专业化作为合成生物学治理策略的问题,并通过与科学家、科学期刊编辑、科学咨询委员会成员及非政府政策报告作者的访谈,分析了专业化的优缺点及其在合成生物学治理中的应用。 | 本文提出专业化作为一种治理策略,能够克服当前合成生物学治理辩论中的二分法,如“自上而下”与“自下而上”的治理模式以及科学事实与公众价值观的对立。 | 专业化作为一种治理选项,存在局限性,特别是在战争与和平问题上。 | 探讨专业化作为合成生物学治理策略的有效性及其潜在影响。 | 科学家、科学期刊编辑、科学咨询委员会成员及非政府政策报告作者的观点和经验。 | NA | NA | NA | NA | 访谈数据 | 涉及多位科学家、编辑、咨询委员会成员及政策报告作者 |
2468 | 2024-08-07 |
On the origin of systems. Systems biology, synthetic biology and the origin of life
2009-Aug, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/embor.2009.117
PMID:19636296
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2469 | 2024-08-07 |
Mid-Long Chain Dicarboxylic Acid Production via Systems Metabolic Engineering: Progress and Prospects
2024-Mar-20, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c00002
PMID:38442481
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研究论文 | 本文探讨了通过系统代谢工程策略在不同底盘中合成中长链二羧酸的方法 | 利用系统生物学、合成生物学和进化工程的新工具,实现能源密集型生物燃料的可持续生产 | NA | 探索中长链二羧酸的可持续生产方法,并讨论该领域的未来挑战 | 中长链二羧酸的生产 | 合成生物学 | NA | 系统代谢工程 | NA | NA | NA |
2470 | 2024-08-07 |
Engineering living materials by synthetic biology
2023-Mar, Biophysics reviews
IF:2.9Q2
DOI:10.1063/5.0115645
PMID:38505813
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综述 | 本文综述了通过合成生物学工程化活体材料的研究进展,并讨论了面临的挑战和未来的机遇 | 受自然生物材料系统的启发,本文探讨了模仿其复杂精细制造过程和功能的新兴领域 | NA | 探讨合成生物学与材料科学交叉领域的活体材料工程 | 活体材料及其在环境刺激响应和与无机物质耦合中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2471 | 2024-08-07 |
Interfacing Living and Synthetic Cells as an Emerging Frontier in Synthetic Biology
2021-Mar-08, Angewandte Chemie (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/ange.202006941
PMID:38505493
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研究论文 | 本文讨论了将生物细胞与人工细胞结合以创建混合系统的可能性,并介绍了该领域的现状及三种通用的混合模式 | 提出了一种新的细胞仿生学方法,通过结合自上而下和自下而上的合成生物学,模糊了生物与非生物之间的界限 | 目前人工细胞无法与生物细胞的强大功能和行为复杂性相匹配 | 探讨生物细胞与人工细胞结合的可能性,以利用两者的优势 | 生物细胞与人工细胞的混合系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2472 | 2024-08-07 |
Model-guided metabolic rewiring to bypass pyruvate oxidation for pyruvate derivative synthesis by minimizing carbon loss
2024-Mar-19, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00839-23
PMID:38315666
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研究论文 | 本文通过基因组规模的代谢模型和约束基流平衡分析、几何流平衡分析及流变量分析,设计了一种微生物宿主,通过引入双歧分流途径,绕过丙酮酸氧化,从而提高丙酮酸衍生物的合成效率。 | 本研究通过动态控制流分布和适应性实验室进化,建立了一种新的葡萄糖培养细菌的代谢模式,以在有氧条件下最小化碳损失,并为生产丙酮酸衍生物的细胞设计提供了有价值的见解。 | NA | 旨在通过代谢重编程,提高微生物宿主合成丙酮酸衍生物的效率,同时最小化碳损失。 | 微生物宿主的代谢途径和基因表达调控。 | 合成生物学 | NA | 基因组规模代谢模型、约束基流平衡分析、几何流平衡分析、流变量分析 | NA | 代谢数据 | 约3,000个基因编码库 |
2473 | 2024-08-07 |
Rule-based design of synthetic transcription factors in eukaryotes
2014-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb400134k
PMID:24933274
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研究论文 | 本文开发了一种用于设计真核细胞中合成转录因子(sTFs)的语法,并将其集成到GenoCAD软件中 | 提出了一个用于设计合成转录因子的语法,并将其应用于GenoCAD软件,以指导用户创建预期的设计转录因子 | NA | 开发一种语法来指导合成转录因子的设计,以实现更可靠、高效和自动化的合成细胞设计 | 合成转录因子(sTFs)的设计 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2474 | 2024-08-07 |
Synthetic biology and metabolic engineering for marine carotenoids: new opportunities and future prospects
2014-Sep-17, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md12094810
PMID:25233369
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综述 | 本文综述了海洋类胡萝卜素合成途径、酶以及多种海洋类胡萝卜素的修饰方法,并讨论了代谢工程和合成生物学在类胡萝卜素生产中的进展 | NA | NA | 促进海洋类胡萝卜素的应用探索 | 海洋类胡萝卜素及其合成途径和酶 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
2475 | 2024-08-07 |
Engineering microorganisms based on molecular evolutionary analysis: a succinate production case study
2014-Sep, Evolutionary applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/eva.12186
PMID:25469170
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研究论文 | 本文通过分子进化分析方法,研究了从不同物种中选择合适基因以优化代谢途径的能力,特别是针对琥珀酸生产的研究 | 本文首次探讨了通过分子进化分析来选择不同物种中的基因,以优化代谢工程和合成生物学中的代谢途径 | NA | 研究如何通过分子进化分析选择合适的基因,以优化代谢途径 | 研究对象包括来自糖酵解的九个基因以及参与琥珀酸前体供应的三种基因 | 合成生物学 | NA | 分子进化分析 | NA | 基因数据 | 研究涉及九个基因和三种基因类型 |
2476 | 2024-08-07 |
Protein localization analysis of essential genes in prokaryotes
2014-Aug-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep06001
PMID:25105358
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研究论文 | 本文对27种原核生物中的必需基因进行了全面的蛋白质定位分析 | 首次系统地从蛋白质定位的角度考察了必需基因 | NA | 深入理解必需基因的基本功能,并改进基因必需性预测 | 27种原核生物中的必需基因及其编码的蛋白质定位 | 生物信息学 | NA | 基因本体论(GO)分析 | NA | 基因组数据 | 27种原核生物,包括24种细菌、2种支原体和1种古菌 |
2477 | 2024-08-07 |
Computational approaches to metabolic engineering utilizing systems biology and synthetic biology
2014-Aug, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2014.08.005
PMID:25379141
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综述 | 本文综述了利用系统生物学和合成生物学工具进行代谢工程的计算方法 | 文章探讨了利用计算工具进行前瞻性预测设计以实现预期结果的方法,以及通过组合实验工具进行经验性探索和筛选所需特性的替代方法 | NA | 探讨代谢工程中系统生物学和合成生物学的计算工具应用 | 代谢工程中的细胞功能和生物化学应用 | 系统生物学 | NA | 计算工具 | NA | NA | NA |
2478 | 2024-08-07 |
Discovery of the lomaiviticin biosynthetic gene cluster in Salinispora pacifica
2014-Jul-08, Tetrahedron
IF:2.1Q2
DOI:10.1016/j.tet.2014.03.009
PMID:25045187
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研究论文 | 本文描述了在Salinispora pacifica菌株中鉴定出负责lomaiviticin生物合成的基因簇 | 通过分子方法和基因组测序鉴定了lomaiviticin生物合成的基因簇,并利用比较基因组学识别了几个不寻常的后修饰事件的候选酶 | NA | 阐明lomaiviticin的生物合成逻辑,并为生物催化合成生物学提供有用的分子工具 | lomaiviticin生物合成的基因簇及其相关酶 | 生物化学 | NA | 基因组测序 | NA | 基因组数据 | 涉及两个菌株DPJ-0016和DPJ-0019 |
2479 | 2024-08-07 |
Transient expressions of synthetic biology in plants
2014-Jun, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2014.02.003
PMID:24631883
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研究论文 | 本文探讨了植物中合成生物学瞬时表达方法的最新进展及其在生产大分子复合物和代谢途径分析与调控中的应用 | 瞬时表达方法使得在几天内高效传递和表达多个基因成为可能,并且可以微调载体以实现不同基因的差异表达 | NA | 研究瞬时表达技术在植物合成生物学中的应用 | 植物细胞中的基因表达 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达方法 | NA | 基因表达数据 | 多种植物细胞 |
2480 | 2024-08-07 |
Bacteriophage-based synthetic biology for the study of infectious diseases
2014-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2014.05.022
PMID:24997401
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研究论文 | 本文讨论了基于噬菌体的技术及其在研究传染病中的应用 | 提出了新的基因组工程策略,有望加速新型噬菌体疗法、诊断和工具的设计 | NA | 探讨噬菌体技术在传染病研究中的应用 | 噬菌体及其在分子生物学、遗传工程和合成生物学中的应用 | 分子生物学 | 传染病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |