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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-05-17 |
Growth versus decline: root aging and plant performance
2026-May-05, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag115
PMID:41990352
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综述 | 综述根老化对植物生长的影响及延迟根老化的潜在策略 | 首次从概念上桥接根系生长调节与根老化过程,并提出利用遗传学和合成生物学方法延迟根老化以提升作物生产力 | 由于技术挑战,对老根采样和分析的研究有限 | 探讨根老化机制及其对植物生长的影响,并评估延迟根老化的策略在提高作物产量和应对气候变化中的潜力 | 根系 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 植物 | 延迟根老化或再激活老根生长的遗传和合成生物学回路 | 农业, 环境 |
| 242 | 2026-05-17 |
RNA Aptamers and Epitranscriptomics: Charting Unexplored Territories in RNA Biology
2026-May, Molecular diagnosis & therapy
IF:4.1Q1
DOI:10.1007/s40291-026-00841-w
PMID:41838348
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评论文章 | 探讨RNA适配体与表观转录组学在RNA生物学中的交叉领域及其潜在应用 | 首次系统性地提出RNA适配体与表观转录组学之间的相互作用,包括RNA修饰如何影响适配体折叠或结合,以及适配体如何用于检测或调节表观转录组状态 | 这两个领域之间的直接调控联系尚未完全阐明,内容主要基于概念性探讨而非实验验证 | 激发RNA适配体和表观转录组学领域之间的跨学科讨论,并吸引对这些交叉领域进行未来研究 | RNA适配体和表观转录组学修饰(如N6-甲基腺苷、假尿苷和5-甲基胞嘧啶) | 分子生物学, 合成生物学 | NA | SELEX | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 诊断, 合成生物学 |
| 243 | 2026-05-17 |
Plant-derived indole alkaloids in chronic inflammatory diseases: molecular mechanisms, therapeutic potential and translational challenges
2026-May, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-026-02244-z
PMID:42009998
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综述 | 整合植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的化学、来源、机制通路及治疗潜力证据 | 系统总结了单萜和色氨酸衍生吲哚生物碱通过整合AhR与NF-κB/STAT3通路实现器官选择性治疗的前景 | 主要基于临床前证据,转化医学面临合成生物学、代谢组学和合理杂合设计等挑战 | 评估植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的分子机制、治疗潜力及转化障碍 | 植物来源吲哚生物碱及其在慢性炎症性疾病中的作用 | 机器学习 | 慢性炎症性疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 244 | 2026-05-17 |
Engineering ligands for theophylline riboswitches expands its regulatory dynamic range in prokaryotic and eukaryotic systems
2026-Mar-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70870-w
PMID:41872214
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研究论文 | 通过结构设计合成4-喹唑啉酮衍生物,显著提升茶碱核糖开关在原核和真核系统中的调控动态范围 | 首次通过结构导向方法设计合成4-喹唑啉酮衍生物,使茶碱适配体结合亲和力提升30倍,基因表达动态范围在细菌中达到380倍 | 未说明 | 提升茶碱核糖开关的调控动态范围,以增强生物技术应用中基因调控的精确性 | 茶碱核糖开关及其在细菌、分枝杆菌和真核系统中的调控性能 | 合成生物学 | 未适用 | 结构导向配体设计、核糖开关调控 | 未适用 | 未适用 | 未适用 | CRISPR-Cas9 | 细菌、分枝杆菌、真核细胞 | 核糖开关介导的条件性基因表达 | 生物医学工程 |
| 245 | 2026-05-17 |
Reprogramming the SARS-CoV-1 Neutralizing Antibody S230 to SARS-CoV-2 via Directed Evolution and Molecular Docking-Based Binding Mode Analysis
2025-12-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00425
PMID:41236374
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研究论文 | 结合定向进化和分子对接分析,将SARS-CoV-1中和抗体S230重新编程为靶向SARS-CoV-2的抗体 | 通过少量协同突变即可在进化上分化但结构保守的靶标间重建抗原识别,建立了基于合成生物学原理的模块化可进化抗体重编程平台 | 未提及抗体在体内的稳定性和免疫原性评估 | 将SARS-CoV-1中和抗体S230的抗原特异性重编程至SARS-CoV-2 | SARS-CoV-1中和抗体S230及其突变体 | 合成生物学 | COVID-19 | 定向进化、分子对接、细菌展示 | NA | 蛋白质序列和结构数据 | 一个突变文库和少数筛选出的克隆 | NA | 大肠杆菌 | NA | 医学 |
| 246 | 2026-05-17 |
CTRL Enables Gene-Specific RNA Regulation Using CRISPR-Cas7-11
2025-11-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00658
PMID:41202215
|
研究论文 | 利用CRISPR-Cas7-11效应器开发了一种名为CTRL的基因特异性RNA调控工具,实现对mRNA和蛋白质表达的高效、可调抑制 | 首次利用CRISPR-Cas7-11的直接重复序列加工活性开发基因抑制工具,实现可调控的基因特异性RNA调控,并在多种模式系统中展示广泛适用性 | NA | 开发一种新型基因表达调控工具以实现精确的RNA靶向抑制 | 合成mRNA分子及Cas7-11效应器的多种变异体 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas7-11 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas7-11 | 多种模式系统 | CRISPR-Cas转基因可抑制元件,用于靶向合成mRNA | 医学, 生物技术 |
| 247 | 2026-05-17 |
Harnessing Fungal Secretion Systems for Precision Fermentation of Food Proteins
2025-11-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00521
PMID:41220338
|
综述 | 探讨利用真菌分泌系统进行食品蛋白质精密发酵的策略与挑战 | 系统阐述了酵母和丝状真菌分泌途径在精密发酵生产食品蛋白质中的作用,并强调数据驱动的分泌效率工程是从小规模生产向工业化制造的关键 | 未提供具体实验数据支持,仅基于现有研究提出观点和未来方向 | 分析如何通过修饰分泌途径提高蛋白质分泌效率,以实现精密发酵食品蛋白质的成本效益和规模化生产 | 酵母和丝状真菌等微生物宿主及其蛋白质分泌途径 | 合成生物学, 蛋白质工程, 生物加工优化 | NA | 精密发酵, 蛋白质分泌工程 | NA | NA | NA | NA | 酵母, 丝状真菌 | 蛋白质分泌途径修饰 | 食品工业, 替代蛋白质生产 |
| 248 | 2026-05-17 |
Advanced Large DNA Manipulation Technologies for Constructing Microbial Cell Factories
2025-11-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00539
PMID:41105858
|
综述 | 系统总结大DNA操作技术四类核心原理及其在构建微生物细胞工厂中的应用进展 | 首次从克隆、组装、递送和重排四类技术角度系统归纳大DNA操作技术,并探讨其在复杂生物合成基因簇获取、多基因途径构建及代谢网络优化中的关键作用 | 未提及具体技术细节的比较或局限性分析 | 为构建高性能微生物细胞工厂提供大DNA操作技术参考 | 微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 大DNA操作技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 生物制造 |
| 249 | 2026-05-17 |
Application of Rational and Irrational Strategies in the Construction of Prokaryotic Cell Factories for the Bioproduction of Aromatic Amino Acid-Derived Chemicals
2025-11-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00711
PMID:41137187
|
综述 | 综述了利用合理与非理性策略构建原核细胞工厂生产芳香族氨基酸衍生物的研究进展 | 重点总结了合理与非理性策略在构建原核细胞工厂中的应用,并探讨了未来发展方向 | 未具体提及研究局限,但可能涉及当前发酵生产面临的高滴度和产率挑战 | 为生产芳香族氨基酸衍生物的原核细胞工厂的构建和优化提供见解和指导 | 原核细胞工厂 | 代谢工程与合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 原核生物 | NA | 工业生物技术 |
| 250 | 2026-05-17 |
Programmable Biointerfaces and Adaptive Functionality in Next-Generation Green Nanomaterials
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00620
PMID:40999683
|
综述 | 探讨合成生物学、DNA纳米技术、人工智能和先进制造等融合创新如何为开发具有环境响应功能的可编程纳米材料创造机遇 | 提出生物相容性从静态特性向动态可编程特性的根本性重新概念化,实现纳米材料像复杂生物实体而非传统治疗剂运行 | 在稳定性、灵敏度和制造可扩展性方面仍存在显著挑战 | 综述下一代绿色纳米材料中可编程生物界面与自适应功能性的研究进展 | 绿色纳米材料 | 纳米技术 | NA | DNA纳米技术, 4D生物打印 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学 | 工程微生物系统 | 基因电路驱动的响应系统, DNA刺激响应结构, 分子逻辑门 | 医学 |
| 251 | 2026-05-17 |
A Decade of SBOL Visual: Growing Adoption of a Diagram Standard for Engineering Biology
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00417
PMID:41016059
|
综述 | 回顾SBOL Visual标准过去十年的发展历程,从最初的21个图形符号演变为全面的生物设计图解语言,并分析其采纳情况与未来展望 | 系统梳理了SBOL Visual标准从1.0到3.0版本的演变过程,并首次评估了其在科学出版物、可视化工具开发及遗传设计信息交流中的采纳趋势 | 尽管采纳率稳步增长,但实现完全合规和最佳实践的广泛应用仍需额外努力 | 回顾SBOL Visual标准十年发展并评估其采纳情况,为合成生物学图形标准优化提供参考 | SBOL Visual标准及其在合成生物学领域的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本和图形数据 | NA | SBOL Visual, SBOL | NA | 遗传设计图解语言 | 工业生物技术 |
| 252 | 2026-05-17 |
Automated Strain Construction for Biosynthetic Pathway Screening in Yeast
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00554
PMID:41063332
|
研究论文 | 本文提出了一个自动化菌株构建工作流程,用于在酵母中筛选生物合成途径 | 通过Hamilton Microlab VANTAGE机器人集成离线硬件,实现了构建步骤的自动化,提高了通量至每周2000次转化,并开发了用户界面支持参数定制 | 未提及,但从技术说明性质看,可能缺乏大规模验证或通用性测试 | 自动化合成生物学中的菌株构建流程,加速途径发现与优化 | 工程酵母菌株中生产维拉嗪(一种甾体生物碱生物合成关键中间体)的基因库 | 合成生物学 | NA | 自动化菌株构建、基因库筛选 | NA | 基因序列数据 | 每周2000次转化(通量数据) | NA | 酿酒酵母 | 生物合成途径(维拉嗪生产) | 工业生物技术、医药 |
| 253 | 2026-05-17 |
Engineering Fibroblast Growth Factor-2 (FGF2) Production in Cyanobacteria
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00388
PMID:41045549
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research paper | 本研究通过将成纤维细胞生长因子2(FGF2)与藻蓝蛋白CpcB亚基融合,在蓝细菌中实现了FGF2的稳定表达和生物活性保持 | 首次通过融合藻蓝蛋白CpcB亚基的方法,克服了FGF2因仅含β-折叠结构而在异源系统中难以稳定表达的问题,并保持了融合蛋白的双重生物活性 | 研究仅测试了单一种类的蓝细菌(集胞藻PCC 6803),且未探讨融合蛋白的规模化生产或长期稳定性 | 实现对难于表达的FGF2蛋白在蓝细菌中的稳定重组表达 | 成纤维细胞生长因子2(FGF2)和集胞藻PCC 6803 | synthetic biology | NA | 基因融合、密码子优化 | NA | NA | NA | NA | 集胞藻PCC 6803 | FGF2与藻蓝蛋白CpcB亚基的融合基因构建 | 医学、生物技术 |
| 254 | 2026-05-17 |
Biomolecular Condensate-Based Artificial Organelle for Driving Compartmentalized Flux Control
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00871
PMID:40339164
|
研究论文 | 利用工程化生物分子凝聚体构建人工细胞器,实现代谢途径的区室化通量控制 | 首次设计FUSLCD-GCN4融合蛋白系统创建可编程人工细胞器,通过空间组织关键酶来增强代谢途径效率 | 该研究仅以2'-岩藻糖基乳糖合成途径为模型,未验证在其他代谢途径中的通用性 | 建立基于生物分子凝聚体的合成生物学平台,实现通量区室化控制以提高微生物细胞工厂的生物合成效率 | 工程化大肠杆菌及其中的人工细胞器 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | 蛋白质融合设计 | 大肠杆菌 | 人工细胞器(基于FUSLCD-GCN4的区室化途径) | 工业生物技术 |
| 255 | 2026-05-17 |
Microfluidic Fluorescence-Activated Cell Sorting of Convolutional Neural Network-Designed Synthetic Yeast Promoter
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00025
PMID:40368332
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研究论文 | 结合分支卷积神经网络设计和高通量微流控荧光激活细胞分选,筛选增强型合成酵母启动子 | 首次将分支卷积神经网络(B-CNN)与遗传算法结合,用于预测和重新设计酵母启动子核心区域,并集成微流控荧光激活细胞分选(μFACS)系统实现高吞吐量单细胞分选 | 未提及大规模验证或其他酵母菌株的通用性 | 实现合成酵母启动子的理性设计和高效高通量筛选,提升基因表达和代谢物生物合成性能 | 酵母酒精氧化酶1启动子(P_AOX1)及其突变体 | 机器学习 | NA | 微流控荧光激活细胞分选(μFACS)、分支卷积神经网络(B-CNN)、遗传算法 | 分支卷积神经网络(B-CNN) | 序列数据和荧光图像 | GFP表达文库,具体数量未给出;细胞吞吐量7000个/秒 | NA | 酵母(毕赤酵母) | 合成启动子(P_AOX1核心区重新设计)及GFP报告基因表达电路 | 工业生物技术、医药 |
| 256 | 2026-05-17 |
De Novo Synthesis of Friedelin in Saccharomyces cerevisiae via Combination of Metabolic and Lipid Droplet Engineering
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00047
PMID:40373267
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研究论文 | 在酿酒酵母中通过代谢与脂滴工程联合策略实现弗里德林的全新合成 | 首次在酿酒酵母中构建弗里德林的全新生物合成途径,并结合脂滴工程技术极大提高产量至1500 mg/L | 仅进行了摇瓶发酵,尚未进行中试或大规模生产验证 | 开发高效、可持续的弗里德林微生物生产方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、脂滴工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 弗里德林生物合成途径 | 医药 |
| 257 | 2026-05-17 |
Genetic Toggle Switch in Plants
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00777
PMID:40387045
|
研究论文 | 本文利用定量表征的植物遗传元件和计算机模型,设计并验证了一种在稳定转基因植物中功能可预测的遗传双稳态开关 | 首次在稳定遗传工程化植物中实现可预测的遗传双稳态开关,并通过计算模型指导元件选择和电路迭代优化,克服了植物生命周期长、环境影响大的挑战 | 未讨论该遗传开关在不同植物物种或环境条件下的通用性,且长期稳定性尚未验证 | 开发可编程、可预测的植物遗传电路,特别是双稳态开关,以推动植物合成生物学应用 | 植物遗传元件(如启动子、转录因子)及其组装成的双稳态开关电路 | 合成生物学 | NA | NA | 计算机模型(in silico model) | 定量功能数据 | 稳定转基因植物(具体数量未提及) | NA | 植物(具体种类未提及) | 双稳态开关(mutually inhibitory gene-regulatory device) | 农业、环境 |
| 258 | 2026-05-17 |
Synthetic Phosphorylation Networks with Fluorescence and Luminescence Expansion
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00814
PMID:40476587
|
研究论文 | 提出一种名为SPN-FLUX的合成磷酸化网络平台,集成分裂荧光素酶或发光蛋白,实现快速可调的细胞过程报告 | 首次实现完全翻译后水平的合成磷酸化网络,能够在1小时内响应胞外刺激,克服了传统转录介导报告过程无法快速实时监测的局限 | 目前仅基于哺乳动物细胞模型验证,可能在其他系统(如细菌或植物)中的效果未知;且局限于缺氧等少数环境刺激的检测 | 开发一种基于翻译后修饰的快速、可调控的合成受体平台,用于实时监测细胞信号事件 | 哺乳动物细胞(如HEK293细胞) | 合成生物学 | NA | 合成生物学、分裂荧光素酶/发光蛋白、配体诱导二聚化 | NA | 荧光/发光信号 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 合成磷酸化网络,包括膜结合受体(配体诱导二聚化激活)和组成型活性细胞内生物传感器 | 生物医学研究,环境监测 |
| 259 | 2026-05-17 |
Standardized Quorum Sensing Tools for Gram-Negative Bacteria
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00036
PMID:40476774
|
研究论文 | 开发了一套标准化的群体感应工具,用于革兰氏阴性菌的合成生物学应用 | 基于SEVA载体库构建标准化、可互换的群体感应收发模块,并提供数学模型和参数以支持工程设计 | NA | 为革兰氏阴性菌提供标准化的群体感应工具,实现可预测的多细胞功能工程 | 群体感应系统及其收发模块 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统的标准化构建与表征 | 数学模型 | NA | NA | SEVA载体库 | 革兰氏阴性菌 | 群体感应收发模块 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 260 | 2026-05-17 |
Robust Synthetic Biology Toolkit to Advance Carboxysome Study and Redesign
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00144
PMID:40488673
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研究论文 | 设计和验证了pXpressome工具包,用于稳健表达和重新设计α-羧酶体 | 开发了pXpressome工具包,实现α-羧酶体的稳健表达、纯化后保持完整和功能,并通过基因缺失实验揭示蛋白质比例可理性影响形态 | 未提及,但可能涉及工具包在复杂环境或不同宿主中的适用性限制 | 促进羧酶体的研究和重新设计,以增强碳固定或作为纳米封装平台 | α-羧酶体及其组成蛋白(Rubisco、碳酸酐酶、顶点蛋白、面形成蛋白) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | pXpressome工具包,Gibson Assembly | 大肠杆菌(E. coli) | 羧酶体表达系统,包括荧光标记构建体 | 环境,工业生物技术 |