合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
241	2025-04-01	Comparative transcriptome analyses of different orthosiphon aristatus tissues reveal differentially expressed genes associated with flavonoid biosynthesis 2025-01-07, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-85266-x PMID:39775135	研究论文	通过比较分析猫须草不同组织的转录组，揭示了与黄酮类生物合成相关的差异表达基因	首次全面比较猫须草各组织中黄酮类化合物的合成机制，并鉴定出与根部黄酮积累相关的212个差异表达基因	研究仅关注转录组水平，未涉及蛋白质或代谢物水平的验证	探究猫须草各组织中黄酮类化合物的生物合成机制	猫须草的不同组织（根、茎、叶）	合成生物学	肾脏疾病	HPLC分析、转录组分析、qRT-PCR	NA	转录组数据	猫须草的根、茎、叶组织样本
242	2025-03-30	Exploration and mutagenesis of the germacrene A synthase from Solidago canadensis to enhance germacrene A production in E. coli 2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.015 PMID:40151792	研究论文	本研究通过探索和诱变加拿大一枝黄花中的germacrene A合酶（GAS），以增强大肠杆菌中germacrene A的生产	结合分子对接和系统发育分析，对ScGAS进行关键残基诱变，显著提高了germacrene A的产量	研究依赖于大肠杆菌作为宿主，可能不适用于其他生产系统	提高germacrene A的产量，以满足β-榄香烯的临床需求	加拿大一枝黄花中的germacrene A合酶（ScGAS）	合成生物学	癌症	分子对接、系统发育分析、诱变	NA	NA	NA
243	2025-03-30	Examining interactions of animal cells with chloroplasts and their light-induced responses in in vitro cell culture systems 2025-Apr-12, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151622 PMID:40117974	研究论文	本研究探讨了动物细胞与叶绿体的相互作用及其在体外细胞培养系统中的光诱导反应	揭示了人类宫颈癌HeLa细胞和小鼠巨噬细胞样J774.1细胞与叶绿体相互作用的三种不同模式，并强调了光诱导ROS生成在细胞毒性中的重要性	缺乏完善的体外实验系统来研究叶绿体-动物细胞相互作用	研究动物细胞与叶绿体的相互作用及其光诱导反应	人类宫颈癌HeLa细胞、小鼠巨噬细胞样J774.1细胞和Elysia marginata海蛞蝓的分离细胞	合成生物学	宫颈癌	体外细胞培养	NA	细胞反应数据	HeLa细胞、J774.1细胞和Elysia marginata海蛞蝓的分离细胞
244	2025-03-30	A novel geminivirus-derived 3' flanking sequence of terminator mediates the gene expression enhancement 2025-Apr, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1 DOI:10.1111/pbi.14561 PMID:39723813	研究论文	本研究探讨了一种来自甜薯卷叶病毒的SBG51 deltasatellite DNA序列，该序列在终止子下游时能显著增强基因表达	发现SBG51序列能显著增强基因表达，并鉴定出一个123 bp的AT富集序列及其中的'ATAAA'/'TTAAA'元件具有增强效应	未明确说明该技术在更广泛宿主中的适用性及长期稳定性	探索合成生物学中基因表达元件的新设计	SBG51 deltasatellite DNA序列及其衍生的AT富集序列	合成生物学	NA	基因表达分析	NA	基因表达数据	本氏烟草叶片和转基因拟南芥植物
245	2025-03-30	Xenotopic synthetic biology: Prospective tools for delaying aging and age-related diseases 2025-Mar-28, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adu1710 PMID:40153513	综述	本文探讨了利用来自低等生物的一组酶来逆转与年龄相关的代谢变化，以延缓衰老和年龄相关疾病	提出利用非哺乳动物酶作为延缓衰老和年龄相关疾病的未开发资源	NA	探讨通过异源合成生物学工具延缓衰老和年龄相关疾病的策略	来自低等生物的一组酶，包括氨基酸稳态调节剂、氧化还原电位调节剂等	合成生物学	老年病	NA	NA	NA	NA
246	2025-03-30	Anti-Cancer Strategies Using Anaerobic Spore-Forming Bacteria Clostridium: Advances and Synergistic Approaches 2025-Mar-14, Life (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/life15030465 PMID:40141809	综述	本文综述了利用厌氧孢子形成细菌梭菌（Clostridium）进行抗癌策略的最新进展及协同治疗方法	探讨了梭菌在癌症治疗中的直接肿瘤溶解、免疫调节及与现有癌症疗法的协同效应，并介绍了通过合成生物学进行的基因改造	尽管临床前和临床研究表明梭菌疗法与其他疗法结合具有潜力，但仍存在挑战	研究梭菌在癌症治疗中的应用及其与其他疗法的协同效应	厌氧孢子形成细菌梭菌（Clostridium）	癌症治疗	癌症	合成生物学、基因改造	NA	NA	NA
247	2025-03-30	Engineering Useful Microbial Species for Pharmaceutical Applications 2025-Mar-05, Microorganisms IF:4.1Q2 DOI:10.3390/microorganisms13030599 PMID:40142492	综述	本文综述了微生物工程在制药生物技术中的最新进展，包括基因工程、合成生物学和自适应进化在优化微生物菌株中的应用	整合了CRISPR-Cas系统、合成生物学方法以及AI和ML技术来优化微生物工程，加速新药开发	代谢途径的高效优化、可持续的工业规模生产以及满足国际监管要求仍是关键挑战	探讨微生物工程在制药领域的应用及其技术进展	微生物菌株及其在制药中的应用	合成生物学	NA	CRISPR-Cas系统、合成生物学、AI和ML	NA	NA	NA
248	2025-03-30	Where Biology Meets Engineering: Scaling Up Microbial Nutraceuticals to Bridge Nutrition, Therapeutics, and Global Impact 2025-Mar-02, Microorganisms IF:4.1Q2 DOI:10.3390/microorganisms13030566 PMID:40142459	综述	本文探讨了微生物平台在营养保健品生产中的变革性作用，强调了先进的发酵技术、合成生物学和代谢工程	微生物生物技术作为一种可持续替代方案，利用微生物细胞作为生物工厂，高效合成生物活性化合物	优化微生物菌株、确保产品质量和规模化生产仍面临挑战	探讨微生物平台在营养保健品生产中的应用及其全球健康影响	微生物细胞及其合成的生物活性化合物	生物技术	肥胖、糖尿病、心血管疾病、癌症	CRISPR/Cas9基因组编辑、适应性进化、生物反应器创新	NA	NA	NA
249	2025-03-30	Alien Chromosome Serves as a Novel Platform for Multiple Gene Expression in Kluyveromyces marxianus 2025-Feb-25, Microorganisms IF:4.1Q2 DOI:10.3390/microorganisms13030509 PMID:40142402	研究论文	本研究探索了利用外来染色体R1作为克鲁维酵母中多基因稳定整合和表达的新平台	首次利用外来染色体R1作为多基因表达的稳定平台，并展示了其在代谢工程和合成生物学中的应用潜力	目前对克鲁维酵母中调控元件和插入位点的了解有限	开发克鲁维酵母中多基因稳定表达的新方法	克鲁维酵母KS-R1菌株及其外来染色体R1	合成生物学	NA	基因删除、基因替换、异源基因表达	NA	基因表达数据	多个克鲁维酵母菌株及其基因改造变体
250	2025-03-30	Distinct phases of cellular signaling revealed by time-resolved protein synthesis 2024-Oct, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-024-01677-3 PMID:38977789	research paper	该研究利用邻近触发的蛋白质反式剪接技术，实现了从预制部件中时间分辨合成目标蛋白质，并应用于多种蛋白质的研究	开发了一种模块化的蛋白质反式剪接技术，能够时间分辨地合成目标蛋白质，并区分起始材料和产物的细胞定位和/或活性状态	NA	开发合成生物学工具以操纵细胞状态，并研究蛋白质的翻译后调控	多种蛋白质，包括激酶癌融合蛋白BCR-ABL和DNAJ-PKAc	合成生物学	癌症	邻近触发的蛋白质反式剪接技术	NA	蛋白质合成数据	NA
251	2025-03-30	Transcriptional regulation of living materials via extracellular electron transfer 2024-Oct, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-024-01628-y PMID:38783133	研究论文	该研究展示了细胞外电子传递（EET）如何作为活细胞代谢与合成材料特性之间的可调桥梁，用于调控活体材料的转录	利用EET作为桥梁，通过遗传电路设计调控活体材料的机械性能，实现了对材料特性的程序化控制	NA	探索活体材料中遗传和代谢编程对材料特性的控制	Shewanella oneidensis菌株和合成聚合物网络	合成生物学	NA	细胞外电子传递（EET）	布尔逻辑门	NA	NA
252	2025-03-29	Expression of Fluorescence Reporters and Natural Products in Native Gut Escherichia coli 2025-Mar-26, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00835 PMID:40138712	research paper	该研究利用CRAGE技术对肠道原生大肠杆菌EcAZ-1和益生菌EcN进行基因工程改造，成功表达了多种异源基因并优化了荧光蛋白的表达条件，同时实现了生物活性化合物的生物合成	首次在原生肠道大肠杆菌中应用CRAGE技术进行基因工程改造，并成功表达多种荧光报告基因和生物活性化合物	仅测试了两种大肠杆菌菌株，可能无法代表所有肠道菌株的特性	探索原生肠道大肠杆菌作为合成生物学平台的潜力	肠道原生大肠杆菌EcAZ-1和益生菌EcN	合成生物学	NA	CRAGE技术	NA	基因表达数据	两种大肠杆菌菌株（EcAZ-1和EcN）
253	2025-03-29	Integrated metabolome and transcriptome analyses revealed key cytochrome P450 genes involved in the biosynthesis of oleanane-type saponins in Hedera helix L 2025-Mar-21, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109818 PMID:40147328	研究论文	本研究通过整合代谢组和转录组分析，揭示了常春藤中参与齐墩果烷型皂苷生物合成的关键细胞色素P450基因	鉴定了6个CYP450候选基因，并验证了它们在齐墩果烷型三萜皂苷生物合成中的关键作用，特别是HhCYP716A409和HhCYP716S11在β-香树脂醇C-28位氧化中的作用，以及HhCYP72D57、HhCYP72A1140和HhCYP72A1141在齐墩果酸C-23位羟基化中的作用	研究仍处于初步阶段，对CYP450基因在五环三萜骨架修饰阶段的功能表征尚不深入	探究常春藤中齐墩果烷型皂苷生物合成的分子机制	常春藤（Hedera helix L）及其代谢产物	植物代谢工程	NA	转录组分析、代谢组分析、RT-qPCR、体外和体内验证	NA	转录组数据、代谢组数据	NA
254	2025-03-29	Last Decade Insights in Exploiting Marine Microorganisms as Sources of New Bioactive Natural Products 2025-Mar-07, Marine drugs IF:4.9Q1 DOI:10.3390/md23030116 PMID:40137302	综述	回顾了过去十年在利用海洋微生物作为新型生物活性天然产物来源方面的主要进展	强调了基因组学、代谢组学和生物信息学技术创新在发现和表征海洋微生物生物活性化合物中的作用	未具体提及研究中存在的具体限制或挑战	探索海洋微生物作为新型生物活性天然产物的来源及其潜在应用	海洋细菌、真菌和微藻	生物技术	NA	基因组学、代谢组学、生物信息学、合成生物学、代谢工程	NA	NA	NA
255	2025-03-29	Advancements in Escherichia coli secretion systems for enhanced recombinant protein production 2025-Mar-03, World journal of microbiology & biotechnology IF:4.0Q2 DOI:10.1007/s11274-025-04302-0 PMID:40025370	综述	本文综述了大肠杆菌分泌系统在增强重组蛋白生产方面的进展	探讨了天然和工程化的大肠杆菌分泌系统，以及通过基因工程、诱变和合成生物学方法提高蛋白产量、折叠和分泌效率的最新进展	大肠杆菌的细胞能力有限，蛋白聚集问题仍未完全解决	提高重组蛋白的产量和分泌效率	大肠杆菌及其分泌系统	微生物学	NA	基因工程、诱变、合成生物学	NA	NA	NA
256	2025-03-29	Triblock Proteins with Weakly Dimerizing Terminal Blocks and an Intrinsically Disordered Region for Rational Design of Condensate Properties 2024-03, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) DOI:10.1002/smll.202306817 PMID:37964343	research paper	该研究通过蛋白质工程构建了一种具有可变末端块和三段式结构的蛋白质，用于理性设计冷凝物的性质	利用弱二聚化末端块和内在无序区域的可调性，实现了冷凝物形成的可预测和理性设计	物理性质（如扩散速率）与二聚化强度无直接相关性，需进一步研究	研究冷凝物形成的理性设计及其在生物合成材料、合成生物学等领域的应用	具有可变末端块和三段式结构的蛋白质	合成生物学	NA	蛋白质工程	NA	NA	一组适合作为末端块的蛋白质
257	2025-03-28	Extracellular Bacterial Production of DNA Hydrogels-Toward Engineered Living Materials 2025-Mar-27, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) DOI:10.1002/smll.202502199 PMID:40143682	研究论文	该研究首次利用外电细菌Shewanella oneidensis生产DNA水凝胶，为工程化活材料（ELMs）的开发奠定了基础	首次在活细菌环境中开发DNA水凝胶，并利用SpyCatcher/SpyTag技术实现外源聚合酶的细胞表面锚定	研究仅使用了Shewanella oneidensis一种细菌，未探索其他微生物系统的适用性	开发具有导电性和代谢活性的动态生物混合材料系统	外电细菌Shewanella oneidensis和DNA水凝胶	合成生物学	NA	SpyCatcher/SpyTag技术	NA	NA	NA
258	2025-03-28	Orthogonal Host-Guest Interactions Enable Programming of Protocell Membranes for Cellular High-Order Assembly and Enhanced Immunogenicity 2025-Mar-26, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1 DOI:10.1021/acsami.4c20476 PMID:40067075	研究论文	本文提出了一种通过正交主客体相互作用编程原生细胞膜的方法，用于细胞高阶组装和增强免疫原性	利用β-环糊精（β-CD）作为宿主实体，通过主客体相互作用在微囊膜上对接功能分子，实现了细胞样膜表面的可编程性	未提及该方法在大规模生产中的可行性和成本效益	开发一种可编程的治疗性原生细胞平台，模拟真实的细胞间相互作用	多糖基微囊（P-somes）和巨噬细胞	合成生物学与生物工程	NA	主客体相互作用	NA	NA	NA
259	2025-03-28	Metabolite-Responsive Control of Transcription by Phase Separation-Based Synthetic Organelles 2025-Mar-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00633 PMID:39954260	研究论文	该研究通过基于液-液相分离的合成细胞器，将代谢信号转化为基因转录调控	利用液-液相分离技术构建合成细胞器，实现代谢信号对基因转录的可逆调控	目前仅验证了丙酮酸代谢信号的特异性响应，未测试其他代谢物的广泛适用性	开发具有生命体感知和适应能力的合成生物材料	基于PdhR阻遏蛋白的合成细胞器系统	合成生物学	NA	液-液相分离技术	NA	生物分子相互作用数据	NA
260	2025-03-28	CnRed: Efficient, Marker-free Genome Engineering of Cupriavidus necator H16 by Adapted Lambda Red Recombineering 2025-Mar-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00757 PMID:39989320	研究论文	本研究建立了一种适用于Cupriavidus necator H16的lambda Red重组系统，结合电穿孔技术，实现了高效快速的基因删除和稳定基因组整合	首次在线性PCR产物上应用lambda Red重组系统，并开发了高效的标记回收方法	研究仅验证了三个基因组位点的修改，未进行大规模应用测试	开发高效的基因组编辑方法以优化Cupriavidus necator H16的生产菌株	Cupriavidus necator H16细菌	合成生物学	NA	lambda Red重组系统、电穿孔技术、Cre/loxP系统	NA	基因组数据	三个不同的基因组位点