合成生物学相关文章
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当前共找到 3041 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2025-02-28 |
GenomeOcean: An Efficient Genome Foundation Model Trained on Large-Scale Metagenomic Assemblies
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.635558
PMID:39975405
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GenomeOcean的高效基因组基础模型，该模型在大规模宏基因组组装数据上进行训练，旨在提升对稀有微生物物种的表征能力 | GenomeOcean直接在宏基因组样本的大规模共组装上进行训练，增强了对稀有微生物物种的表征能力，并改进了超越基因组中心方法的泛化能力 | NA | 开发一种高效的基因组基础模型，以提升对稀有微生物物种的表征能力，并推动精准医学、药物发现和复杂生物系统的理解 | 宏基因组数据集中的微生物物种 | 基因组学 | NA | 宏基因组测序 | 生成式基因组基础模型 | 基因组序列 | 220 TB的宏基因组数据集，包含600 Gbp的高质量重叠群 |
| 402 | 2025-02-28 |
Identification and Characterization of Two Se6OMTs from Stephania epigaea Offer Novel Insights into the Biosynthetic Pathway of Cepharanthine
2025-Feb-03, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo15020092
PMID:39997717
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研究论文 | 本研究从千金藤属植物Stephania epigaea中克隆并功能表征了三种O-甲基转移酶（OMTs），重点研究了其中两种Se6OMTs在头花千金藤碱生物合成途径中的作用 | 首次鉴定了参与头花千金藤碱生物合成途径的Se6OMTs，并阐明了这些酶在(R)-和(S)-立体异构体生物碱生成中的作用 | 未探讨Se6OMTs在其他生物碱生物合成途径中的潜在作用 | 阐明头花千金藤碱生物合成途径中关键酶的作用机制 | Stephania epigaea植物中的O-甲基转移酶 | 合成生物学 | NA | 基因克隆、酶功能表征 | NA | 生物化学数据 | 三种OMTs，九种1-BIAs底物 |
| 403 | 2025-02-28 |
Recent advances in the synthesis and application of biomolecular condensates
2025-Feb, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108188
PMID:39814227
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综述 | 本文综述了生物分子凝聚体（BMCs）的合成和应用的最新进展，特别是通过相分离诱导的合成BMCs（SBMCs）在基础和应用研究中的潜力 | 介绍了合成生物学等新方法在BMCs从头合成中的应用，以及SBMCs在染色体结构、发病机制、生物制造、人工细胞设计和药物递送等领域的科学应用 | 对BMCs的内部组织和外部调控的理解仍处于早期阶段 | 探讨BMCs的合成方法及其在生物材料、生物技术和生物医学中的应用 | 生物分子凝聚体（BMCs）及其合成版本（SBMCs） | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 404 | 2025-02-28 |
Harnessing Gut Microbiota for Biomimetic Innovations in Health and Biotechnology
2025-Jan-24, Biomimetics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/biomimetics10020073
PMID:39997096
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综述 | 本文探讨了肠道微生物群在健康和生物技术中的仿生创新潜力 | 利用肠道微生物群的生物机制，开发个性化益生菌、人工微生物群、仿生生物传感器和生物修复系统等创新应用 | 在人工环境中复制微生物复杂性、基因工程微生物的伦理问题以及公平获取先进疗法的挑战 | 探索基于微生物群的仿生创新在医疗和生物技术中的潜力 | 肠道微生物群及其生物机制 | 生物技术 | NA | 人工智能、生物工程、多组学方法 | NA | NA | NA |
| 405 | 2025-02-28 |
Macroscopic Assembly of Materials with Engineered Bacterial Spores via Coiled-Coil Interaction
2024-Nov-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00468
PMID:39393788
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研究论文 | 本文报道了通过工程化细菌孢子组装形成的宏观材料 | 利用T7驱动的表达系统在孢子表面展示高密度的pH响应自结合蛋白，实现了pH依赖的蛋白质水平结合和颗粒材料的组装 | 机械性能在pH变化时基本保持不变，但侵蚀稳定性与工程化表面蛋白之间的pH依赖相互作用一致，存在pH依赖性 | 设计宏观材料并研究卷曲螺旋相互作用在不同长度尺度上的影响 | 工程化细菌孢子 | 合成生物学 | NA | T7驱动的表达系统 | NA | NA | NA |
| 406 | 2025-02-27 |
A concise enzyme cascade enables the manufacture of natural and halogenated protoberberine alkaloids
2025-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57280-0
PMID:39988594
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研究论文 | 本文设计了一种简洁的酶级联反应，用于高效生产天然和非天然的普罗托贝碱类生物碱，展示了其在药物开发中的工业潜力 | 通过酶发现和工程化，以及系统优化普罗托贝碱类生物碱生物合成中的制造挑战，实现了药物Rotundine的高产量生产，并展示了其在工业上的潜力 | NA | 克服植物源性生物碱高效生物合成中的长期挑战，并通过合成生物学引入结构复杂性和多样性 | 天然和非天然的普罗托贝碱类生物碱 | 合成生物学 | NA | 酶级联反应 | NA | NA | NA |
| 407 | 2025-02-27 |
Innovations and challenges in collagen and gelatin production through precision fermentation
2025-Feb-06, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04276-z
PMID:39910024
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综述 | 本文综述了通过精确发酵技术生产胶原蛋白和明胶的创新与挑战 | 介绍了精确发酵技术作为一种可持续且伦理的生产方法，替代传统的动物组织提取方式 | 讨论了生产规模化、成本效益和市场整合等挑战 | 探索精确发酵技术在食品行业中生产胶原蛋白和明胶的应用 | 胶原蛋白和明胶 | 生物技术 | NA | 精确发酵（PF） | NA | NA | NA |
| 408 | 2025-02-27 |
DNAdesign: feature-aware in silico design of synthetic DNA through mutation
2025-02-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf052
PMID:39891349
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研究论文 | DNAdesign是一个基于网络的工具，用于基于DNA序列和形状特征比较和设计突变 | DNAdesign能够同时考虑序列突变引起的不同读取模式的改变，提供基于DNA序列和形状特征的突变设计 | NA | 研究基因调控和合成生物学应用，如设计合成增强子和转录因子结合位点 | DNA序列和形状特征 | 生物信息学 | NA | Deep DNAshape | NA | DNA序列 | NA |
| 409 | 2025-02-27 |
Suppression of amber stop codons impairs pathogenicity in Salmonella
2025-Feb, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.15075
PMID:39666825
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研究论文 | 本文研究了UAG（琥珀）终止密码子的抑制如何影响沙门氏菌的致病性 | 揭示了UAG终止密码子抑制对沙门氏菌致病性的选择性影响，特别是对SPI-1基因表达的减弱作用 | 未探讨UGA和UAA终止密码子抑制对沙门氏菌致病性的影响 | 探讨终止密码子抑制对细菌致病性的影响 | 沙门氏菌 | 合成生物学 | 细菌感染 | 系统遗传和生化分析 | NA | NA | NA |
| 410 | 2025-02-27 |
Harnessing the biology of regulatory T cells to treat disease
2025-02, Nature reviews. Drug discovery
DOI:10.1038/s41573-024-01089-x
PMID:39681737
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综述 | 本文综述了调节性T细胞（Treg细胞）在治疗疾病中的潜力，包括增强或抑制Treg细胞活性的临床试验进展 | 探讨了利用纳米医学和合成生物学进展来精确调控Treg细胞功能的新一代临床试验 | 现有临床试验仍存在重要局限性和未解答的问题 | 探讨调节性T细胞在治疗多种疾病中的应用 | 调节性T细胞（Treg细胞） | 免疫学 | 过敏、移植、自身免疫疾病、癌症 | NA | NA | NA | NA |
| 411 | 2025-02-27 |
Recent advances in engineering non-native microorganisms for poly(3-hydroxybutyrate) production
2025-Jan-24, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04261-6
PMID:39849243
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review | 本文综述了非天然微生物在聚(3-羟基丁酸酯)(PHB)生产中的工程应用进展 | 总结了所有用于PHB生物合成的非天然微生物宿主，并讨论了通过代谢工程增强PHB生产的不同策略 | 需要进一步的基因工程方法以使非天然微生物宿主更适合大规模PHB生产 | 探讨非天然微生物在PHB生产中的应用及其优化策略 | 非天然微生物 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 412 | 2025-02-27 |
Synthetic biology meets Aspergillus: engineering strategies for next-generation organic acid production
2025-Jan-13, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-04246-x
PMID:39800796
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综述 | 本文综述了利用基因工程技术提高曲霉属真菌有机酸产量的最新进展和未来方向 | 特别强调了在重建代谢途径、消除副产物、修改调控途径和工程化菌丝形态方面的成就，以及CRISPR生物传感器在有机酸发酵中的潜在应用和挑战 | NA | 提高曲霉属真菌在工业有机酸生产中的效率 | 曲霉属真菌 | 合成生物学 | NA | 基因工程技术，CRISPR生物传感器 | NA | NA | NA |
| 413 | 2025-02-27 |
Glucose 6-phosphate dehydrogenase variants increase NADPH pools for yeast isoprenoid production
2024-Mar, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13755
PMID:38124687
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研究论文 | 本研究通过提高NADPH生成酶的效率，增强酵母中异戊二烯类化合物的产量 | 不同于以往通过增加戊糖磷酸途径流量或过量生产NADPH生成酶的方法，本研究专注于提高NADPH生成酶的效率，并通过基因融合和理性突变策略成功提高了G6PD酶的活性 | NA | 提高酵母中异戊二烯类化合物的产量 | 酵母 | 合成生物学 | NA | 基因融合、理性突变 | NA | NA | NA |
| 414 | 2025-02-26 |
Living Fiber Dispersions from Mycelium as a New Sustainable Platform for Advanced Materials
2025-Feb-25, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202418464
PMID:39998258
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研究论文 | 本文提出了一种从菌丝体生成活纤维分散体（LFD）的可持续方法，结合了生物聚合物纤维的优异材料形成特性和活材料的高度动态特性 | 提出了一种新的可持续方法，通过工业可用的液体培养和机械解纤方法生成分散良好的活菌丝体纤维，展示了在无需添加营养的情况下通过生长利用动态特性的能力 | 未明确提及具体限制 | 开发可持续的先进材料平台 | 菌丝体纤维 | 材料科学 | NA | 液体培养和机械解纤方法 | NA | NA | NA |
| 415 | 2025-02-26 |
A tunable affinity fusion tag for protein self-assembly
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633037
PMID:39868245
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研究论文 | 本文介绍了一种基于可调淀粉样蛋白的基因编码工具，用于精确控制细胞中蛋白质浓度阈值 | 通过系统筛选二肽重复序列，发现聚苏氨酸丙氨酸（poly-TA）能够形成淀粉样蛋白样组装体，并在任意选择的浓度阈值下具有可忽略的成核障碍 | NA | 研究蛋白质浓度与活性之间的关系，并开发一种工具来操纵这种关系 | 蛋白质浓度阈值 | 合成生物学 | NA | 基因编码工具 | NA | NA | NA |
| 416 | 2025-02-26 |
Utilizing microbial metabolite in catalytic cascade synthesis of conjugated oligomers for In-Situ regulation of biological activity
2024-04, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107188
PMID:38377815
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研究论文 | 本文结合微生物代谢途径和钯催化过程，用于原位生成具有生物活性的共轭寡聚物 | 将微生物代谢途径与钯催化过程结合，实现生物活性共轭寡聚物的原位合成 | NA | 研究生物代谢与化学催化反应的结合，以实现非天然分子的生物合成和生物活性的原位调控 | 工程化大肠杆菌及其代谢产物 | 合成生物学 | NA | 钯催化的Heck反应 | NA | NA | NA |
| 417 | 2025-02-26 |
Chaos in synthetic microbial communities
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010548
PMID:36215322
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研究论文 | 本文探讨了合成微生物群落中混沌行为的可能性及其控制方法 | 首次在合成微生物群落中查询混沌行为的存在，并提供了控制此类系统的见解 | 研究主要关注小型微生物群落，可能不适用于更大或更复杂的系统 | 理解并控制合成微生物群落中的混沌行为 | 小型合成微生物群落 | 合成生物学 | NA | 近似贝叶斯计算 | NA | NA | NA |
| 418 | 2025-02-25 |
Interfacing bacterial microcompartment shell proteins with genetically encoded condensates
2025-Mar, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70061
PMID:39969154
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研究论文 | 本文展示了细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体相结合，形成涂层，用于合成细胞和细胞器的开发 | 首次展示了细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体相结合，形成稳定的涂层，并展示了其在合成生物学中的应用 | 涂层的形成依赖于pH和蛋白质浓度，且一旦形成后不与稀释相交换 | 研究细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体结合，以控制液-液相分离区室的特性 | 细菌微区室壳蛋白（BMC-H）和由RGG-RGG结构域形成的蛋白质凝聚体 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | 蛋白质数据 | NA |
| 419 | 2025-02-25 |
Information Transmission through Biotic-Abiotic Interfaces to Restore or Enhance Human Function
2024-06-17, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.4c00435
PMID:38729914
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综述 | 本文综述了通过生物-非生物界面进行信息传输以恢复或增强人类功能的最新进展 | 提出了一个模块化框架，用于定义和描述生物和非生物组件的工程以及界面设计，以促进使用光或电的生物-非生物信息传输 | NA | 探讨如何通过生物-非生物界面进行信息传输，以恢复或增强人类功能 | 神经元细胞与电子设备之间的通信，视网膜疾病患者，脊髓损伤患者 | 生物医学工程 | 视网膜疾病，脊髓损伤 | 光敏蛋白工程，脑机接口，刺激植入物，有机晶体管 | NA | NA | NA |
| 420 | 2025-02-24 |
Interchromosomal contacts between regulatory regions trigger stable transgenerational epigenetic inheritance in Drosophila
2025-Feb-20, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.11.021
PMID:39667935
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研究论文 | 本文研究了果蝇中跨代表观遗传的机制，特别是通过染色质接触建立的表观遗传记忆 | 揭示了转录因子结合位点突变对跨代表观遗传的影响，以及染色质接触在建立跨代表观遗传记忆中的作用 | 研究仅限于果蝇模型，未涉及其他生物或更复杂的遗传背景 | 探讨果蝇中跨代表观遗传的分子机制 | 果蝇的Fab-7调控元件及其同源位点 | 遗传学 | NA | 合成生物学系统 | NA | 遗传和表观遗传数据 | NA |