合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
441	2025-02-22	Cleavable donor-assisted CRISPR/Cas9 system significantly improves the efficiency of large DNA insertion in Physcomitrium patens 2025-Feb, The Plant journal : for cell and molecular biology DOI:10.1111/tpj.70020 PMID:39981890	研究论文	本研究开发了一种体内可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统，显著提高了在苔藓植物Physcomitrium patens中插入大片段DNA的效率	开发了体内可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统，显著提高了大片段DNA插入的效率	研究主要针对苔藓植物Physcomitrium patens，尚未在其他作物中验证其适用性	提高CRISPR/Cas9系统在大片段DNA插入中的效率	苔藓植物Physcomitrium patens	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9	NA	DNA序列	两种不同的sgRNA和四种不同的DNA插入片段
442	2025-02-22	DAPE cloning with modified primers for producing designated lengths of 3' single-stranded ends in PCR products 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0318015 PMID:39946422	研究论文	本文介绍了一种名为DAPE的新型DNA克隆方法，通过使用修饰引物在PCR产物中产生指定长度的3'单链末端	DAPE方法能够在DNA片段的两端生成精确长度的3'突出端，克服了传统SLIC技术在克隆小于50bp的DNA片段时的局限性	NA	开发一种更高效的DNA克隆和合成生物学工具	DNA片段	合成生物学	NA	PCR, DNA克隆	NA	DNA序列	NA
443	2025-02-21	Construction and characterization of a mutant library for the P23 constitutive promoter in lactic acid bacteria 2025-Mar, Journal of biotechnology IF:4.1Q2 DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.01.015 PMID:39848497	研究论文	本研究构建并表征了乳酸菌中P23组成型启动子的突变体库，以丰富乳酸菌启动子库	首次提供了一组显著不同的P组成型启动子突变体元素，为乳酸菌的代谢工程和合成生物学应用奠定了基础	突变体库在乳酸菌中表现出特异性，但在大肠杆菌中表现出显著差异，可能限制了其跨物种应用的广泛性	丰富乳酸菌启动子库，为代谢工程和合成生物学应用提供基础	乳酸菌中的P23组成型启动子	合成生物学	NA	错误倾向PCR和dNTP类似物诱导的随机突变	NA	荧光强度数据	247个P启动子突变体
444	2025-02-21	Questions and Consequences of Omics in Genetically Engineered Crop Regulation 2025-Feb, Plant-environment interactions (Hoboken, N.J.) DOI:10.1002/pei3.70033 PMID:39967832	研究论文	本文探讨了将组学技术整合到基因编辑和合成生物学作物监管系统中的问题和后果	提出了需要回答的一系列问题，以将组学实验和数据整合到作物监管系统中，并强调了这些问题的科学有效性和监管负担	未具体说明组学技术在监管系统中应用的具体技术挑战或数据限制	探讨组学技术在基因编辑和合成生物学作物监管中的应用	基因编辑和合成生物学作物	生物技术	NA	组学技术	NA	组学数据	NA
445	2025-02-21	Applied photosynthesis: An idea whose time has come 2025-Jan-01, Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics DOI:10.1016/j.bbabio.2024.149525 PMID:39571881	研究论文	本文介绍了生物混合能源系统的最新研究，利用光合作用机制开发环保、高效的太阳能技术替代方案	通过合成生物学和纳米材料工程的结合，优化了蛋白质功能和设备稳定性，探索了独特的光活性色素	NA	开发可持续能源技术，利用光合作用机制提高能源转换效率	生物混合设备，包括蓝藻、藻类、紫色细菌和古菌等光合生物	可再生能源技术	NA	合成生物学、纳米材料工程	NA	NA	NA
446	2025-02-20	Systematic molecular dissection of key intermediates in xanthones biosynthesis in Cudrania tricuspidata and establishment of a viable heterologous expression system 2025-Mar, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109524 PMID:39869995	研究论文	本研究系统解析了柘树中黄酮类化合物生物合成的关键中间体，并建立了一个可行的异源表达系统	首次克隆并表征了柘树中参与黄酮类化合物生物合成的关键酶基因，并成功在酵母和烟草中进行了异源表达	研究中仅初步建立了2,3',4,6-四羟基苯甲酮的异源合成系统，尚未实现完整黄酮类化合物的异源生产	解析柘树中黄酮类化合物的生物合成途径，并建立其异源生产系统	柘树中的黄酮类化合物及其生物合成关键酶	合成生物学	NA	基因克隆、异源表达	NA	基因序列、酶活性数据	柘树根组织、酵母和烟草作为异源表达宿主
447	2025-02-20	Chemistry and biology of natural stilbenes: an update 2025-Feb-19, Natural product reports IF:10.2Q1 DOI:10.1039/d4np00033a PMID:39711130	综述	本文更新了关于天然二苯乙烯类化合物的化学和生物学研究，特别关注了寡聚二苯乙烯的结构多样性和生物活性	系统综述了2009年至2023年间新发现的409种二苯乙烯类化合物，特别是寡聚二苯乙烯的结构多样性和生物活性，并探讨了其作为新药研究先导化合物的潜力	主要集中于2009年至2023年的研究，可能未涵盖更早期的重要发现	探讨天然二苯乙烯类化合物，特别是寡聚二苯乙烯的结构多样性和生物活性，以寻找新药研究的先导化合物	天然二苯乙烯类化合物，特别是寡聚二苯乙烯	化学与生物学	NA	合成生物学方法	NA	化学结构数据	409种新二苯乙烯类化合物
448	2025-02-20	A synthetic platform for developing recombinant adeno-associated virus type 8 producer cell lines 2025-Feb-19, Biotechnology progress IF:2.5Q3 DOI:10.1002/btpr.70009 PMID:39968660	研究论文	本研究建立了一个基于合成生物学的平台，用于构建稳定的重组腺相关病毒8型（rAAV8）生产细胞系	将rAAV2细胞系构建管道扩展到rAAV8，并成功生成四个rAAV8生产细胞系，通过调整诱导条件提高病毒颗粒产量	rAAV8生产细胞系的产量仍低于传统的三重质粒转染方法，Cap蛋白生产和衣壳形成是潜在的限制因素	开发适用于不同AAV血清型的rAAV生产细胞系平台	重组腺相关病毒8型（rAAV8）生产细胞系	合成生物学	NA	合成生物学技术	NA	NA	四个rAAV8生产细胞系（VH1-4）
449	2025-02-20	Efficient expression of recombinant proteins in Bacillus subtilis using a rewired gene circuit of quorum sensing 2025-Feb-19, Biotechnology progress IF:2.5Q3 DOI:10.1002/btpr.70007 PMID:39968680	研究论文	本研究在枯草芽孢杆菌中重构了来自Aliivibrio fischeri的LuxRI群体感应系统，以实现与细胞生长协调的蛋白质过量生产	通过重构LuxRI群体感应系统并优化启动子，实现了在枯草芽孢杆菌中细胞密度依赖的蛋白质过量生产，超越了常用的启动子系统	研究中未提及该系统在不同环境条件下的稳定性和适应性	提高枯草芽孢杆菌中重组蛋白的生产效率	枯草芽孢杆菌	合成生物学	NA	群体感应系统重构、启动子工程	NA	NA	NA
450	2025-02-20	Morphology remodelling and membrane channel formation in synthetic cells via reconfigurable DNA nanorafts 2025-Feb, Nature materials IF:37.2Q1 DOI:10.1038/s41563-024-02075-9 PMID:39805958	研究论文	本文构建了一个由信号响应性DNA纳米筏、生物孔和巨型单层囊泡（GUVs）组成的合成细胞模型，展示了纳米尺度上DNA筏的重塑如何与微尺度上GUVs的重塑相耦合	通过可重构的DNA纳米筏实现了合成细胞形态的重塑和膜通道的形成，扩展了DNA纳米技术在合成生物学中的应用潜力	NA	探索DNA纳米结构在合成细胞形态重塑和膜通道形成中的应用	合成细胞模型，包括DNA纳米筏、生物孔和巨型单层囊泡（GUVs）	合成生物学	NA	DNA纳米技术	NA	NA	NA
451	2025-02-19	Development of a Cell-Free, Toehold Switch-Based Biosensor for Rapid and Sensitive Zika Virus Detection 2025-Feb-18, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.4c05808 PMID:39924741	研究论文	本研究开发了一种基于toehold开关技术的无细胞生物传感器，结合核酸序列扩增技术（NASBA），用于快速、灵敏地检测寨卡病毒	该研究创新性地将toehold开关技术与NASBA技术结合，显著提高了检测灵敏度，达到了2.9 aM的检测限，解决了toehold开关在检测低丰度目标时的固有局限性	研究中未提及该检测系统在实际临床样本中的应用效果，可能需要在更广泛的样本中进行验证	开发一种快速、灵敏的寨卡病毒检测工具	寨卡病毒	合成生物学	传染病	toehold开关技术，核酸序列扩增技术（NASBA）	NA	核酸序列	未提及具体样本数量
452	2025-02-19	A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules 2025-Feb-12, Cell host & microbe IF:20.6Q1 DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002 PMID:39947133	meta-analysis	本文通过对炎症性肠病（IBD）患者和健康对照组的肠道微生物组进行元分析，识别出与克罗恩病（CD）显著相关的两种梭菌衍生的小分子生物合成基因簇（BGCs），并发现这些基因簇产生的六种脂肪酸酰胺在IBD患者的粪便样本中检测到	首次通过元分析识别出与克罗恩病相关的特定微生物组小分子，并揭示了这些分子在肠道通透性和疾病恶化中的作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证这些分子的具体作用机制	探索肠道微生物组小分子在炎症性肠病（IBD）中的分子和功能作用	炎症性肠病（IBD）患者和健康对照组的肠道微生物组	微生物组学	炎症性肠病	元分析、合成生物学	NA	宏基因组数据	IBD患者和健康对照组的肠道微生物组样本
453	2025-02-19	A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules 2024-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.02.07.579278 PMID:38370680	meta-analysis	本文通过对5306个肠道微生物组样本的元基因组分析，识别出与炎症性肠病（IBD）显著相关的Clostridia衍生的小分子生物合成基因簇（BGCs），并发现了六种脂肪酸酰胺作为这些BGCs的产物	首次通过合成生物学方法发现并解析了六种与IBD相关的脂肪酸酰胺结构，并验证了这些分子在小鼠结肠炎模型中对肠道通透性和炎症的影响	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证这些发现的临床相关性	探索肠道微生物组中小分子在炎症性肠病（IBD）中的分子和功能作用	2033名IBD患者和833名健康对照的肠道微生物组样本	微生物组学	炎症性肠病	元基因组分析，合成生物学	小鼠结肠炎模型	元基因组数据	5306个肠道微生物组样本（2033名IBD患者和833名健康对照）
454	2025-02-18	Regulating Protein Immobilization During Cell-Free Protein Synthesis in Hyaluronan Microgels 2025-Feb-17, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202400668 PMID:39957478	研究论文	本文研究了在透明质酸微凝胶中无细胞蛋白质合成（CFPS）和原位蛋白质积累的相互作用	首次使用双功能微凝胶作为实验平台，研究蛋白质合成的时间和空间调控	研究仍处于初步阶段，需要进一步验证和优化	研究无细胞蛋白质合成和蛋白质在微凝胶中的积累	透明质酸微凝胶和His标签修饰的GFP	合成生物学	NA	无细胞蛋白质合成（CFPS）	NA	NA	NA
455	2025-02-18	In vivo self-assembled siRNAs within small extracellular vesicles attenuate LRRK2-induced neurodegeneration in Parkinson's disease models 2025-Feb-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1 DOI:10.1016/j.jconrel.2024.12.045 PMID:39722304	研究论文	本研究开发了一种合成生物学策略，通过小细胞外囊泡（sEVs）将LRRK2的小干扰RNA（siRNAs）自组装并递送至黑质，以减轻帕金森病（PD）模型中的神经退行性变	利用遗传电路（裸DNA质粒形式）实现siRNA的自组装和递送，通过sEVs将siRNA靶向递送至黑质，为PD治疗提供了新的策略	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	开发一种通过sEVs递送siRNA以减轻PD模型中LRRK2诱导的神经退行性变的治疗策略	LRRK2R1441G小鼠模型	合成生物学	帕金森病	siRNA自组装和递送	遗传电路	NA	两种小鼠模型
456	2025-02-18	Bacterial and bacterial derivatives-based drug delivery systems: a novel approach for treating central nervous system disorders 2025-Feb, Expert opinion on drug delivery IF:5.0Q1 DOI:10.1080/17425247.2024.2444364 PMID:39688950	综述	本文综述了基于细菌及其衍生物的药物递送系统在治疗中枢神经系统疾病中的最新研究进展	利用细菌及其衍生物作为药物递送系统，通过其独特的趋化性、生物相容性和靶向能力，克服传统方法的限制，实现精确药物递送	生物安全性、免疫排斥和规模化生产等挑战仍需解决	探索细菌及其衍生物作为药物递送系统在中枢神经系统疾病治疗中的应用	缺血性脑损伤、神经退行性疾病和胶质瘤	生物医学工程	中枢神经系统疾病	基因工程、合成生物学和纳米技术	NA	NA	NA
457	2025-02-17	Mechanisms and applications of bacterial luciferase and its auxiliary enzymes 2025-Mar, Archives of biochemistry and biophysics IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.abb.2025.110307 PMID:39824239	研究论文	本文探讨了细菌荧光素酶（LuxAB）及其辅助酶的机制和应用	最近的研究阐明了C4a-氢过氧黄素形成的机制，并识别了关键催化残基如His44，这些残基促进了光生成中重要的黄素中间体的生成	实现红移发射、优化信号强度以及识别与发光物种生成相关的机制等挑战性问题仍有待探索	研究目的是更好地理解LuxAB反应，并探索其在生物技术和生物医学应用中的潜力	细菌荧光素酶（LuxAB）及其辅助酶	生物技术	NA	蛋白质工程和合成生物学	NA	NA	NA
458	2025-02-17	Genetic retargeting of E3 ligases to enhance CAR T cell therapy 2024-Feb-15, Cell chemical biology IF:6.6Q1 DOI:10.1016/j.chembiol.2023.10.024 PMID:37989314	研究论文	本文开发了一种双功能融合蛋白，通过将目标蛋白与E3连接酶复合物桥接，强制目标泛素化和降解，以增强CAR T细胞疗法的抗肿瘤效力	开发了条件性降解策略，包括可诱导的降解转基因表达或小分子依赖的E3招募，并设计了针对SMAD2和SMAD3的降解剂，以阻断TGFβ信号传导	NA	增强CAR T细胞疗法的抗肿瘤效力	CAR T细胞	合成生物学	癌症	E3连接酶复合物	NA	NA	NA
459	2025-02-17	Noncanonical Streptococcus sanguinis ComCDE circuitry integrates environmental cues in transformation outcome decision 2024-Feb-15, Cell chemical biology IF:6.6Q1 DOI:10.1016/j.chembiol.2023.09.007 PMID:37832551	研究论文	本文研究了血链球菌中一种新型的竞争-捕食协调机制，揭示了其ComCDE电路在环境信号整合中的作用	发现了血链球菌中不同于其他链球菌的ComCDE电路，揭示了其独特的CSP前体切割模式和ABC转运蛋白的作用，并发现了一个ComCDE依赖的细菌素基因座	NA	探索血链球菌中自然竞争状态的调控机制及其在进化中的作用	血链球菌（Streptococcus sanguinis）	合成生物学	NA	合成生物学设备	NA	NA	NA
460	2025-02-16	Advancing cellulose utilization and engineering consolidated bioprocessing yeasts: current state and perspectives 2025-Feb-13, Applied microbiology and biotechnology IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s00253-025-13426-0 PMID:39939397	综述	本文综述了在酿酒酵母中表达纤维素酶的策略，并探讨了通过现代合成生物学工具优化CBP酵母菌株的潜力	总结了在酿酒酵母中表达纤维素酶的最新进展，并探讨了通过现代合成生物学工具优化CBP酵母菌株的潜力	尽管已经报道了将纤维素底物一步转化为乙醇的方法，但其产量和生产率远低于工业要求	探讨将木质纤维素生物质转化为生物燃料和绿色化学品的生物转化策略	酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）	合成生物学	NA	纤维素酶表达系统	NA	NA	NA