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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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501 | 2025-05-06 |
Engineering artificial microbial consortia for personalized gut microbiome modulation and disease treatment
2025-May-05, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15352
PMID:40320966
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review | 本文提出了一种通过工程化人工微生物群落来个性化调节肠道微生物组并治疗疾病的新方法 | 整合合成生物学、系统生物学和先进培养技术,设计定制化微生物群落以执行特定功能 | 需要进一步的临床试验来评估其安全性、有效性和长期影响 | 通过精确调控肠道微生物组来治疗代谢紊乱、炎症性疾病和胃肠道感染等疾病 | 人工微生物群落及其在肠道微生物组中的应用 | 合成生物学 | 代谢紊乱、炎症性疾病、胃肠道感染 | 合成生物学、系统生物学、先进培养技术 | NA | NA | NA |
502 | 2025-05-06 |
Microbial Biosensor for Sensing and Treatment of Intestinal Inflammation
2025-May-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504364
PMID:40323169
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的钙卫蛋白生物传感器,用于检测和治疗肠道炎症 | 开发了一种结合锌摄取调节器(Zur)控制启动子和记忆电路的生物传感器,能够检测并记录体内肠道炎症,同时具备诊断和治疗功能 | 研究仅在两种独立的小鼠结肠炎模型中进行验证,尚未在人类临床试验中应用 | 开发用于肠道疾病诊断和治疗的合成生物体 | 肠道炎症及其生物标志物钙卫蛋白 | 合成生物学 | 肠道炎症 | 合成生物学技术、生物传感器技术 | NA | 生物标志物数据 | 两种独立的小鼠结肠炎模型 |
503 | 2025-05-06 |
Semantical and geometrical protein encoding toward enhanced bioactivity and thermostability
2025-May-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98033
PMID:40314227
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research paper | 提出了一种新的预训练框架,整合了蛋白质一级和三级结构的序列和几何编码器,以提高蛋白质工程的功能性和热稳定性预测 | 整合了序列和几何编码器,模拟自然选择指导突变方向,并在三个基准测试中展示了卓越性能 | 现有方法主要依赖蛋白质序列,难以高效编码氨基酸局部环境的几何方面,且缺乏对蛋白质热稳定性预测的基本评估 | 提高蛋白质工程的功能性和热稳定性预测的准确性和全面性 | 蛋白质序列和结构 | synthetic biology | NA | deep learning | pre-training framework with sequential and geometric encoders | protein sequence and structure data | over 300 deep mutational scanning assays |
504 | 2025-05-04 |
Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines
2025-May-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305
PMID:39854990
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研究论文 | 本研究通过工程化改造P450BM3单加氧酶的活性位点,开发出新型人工生物催化剂,用于高效降解五种氯苯胺类环境污染物 | 通过将P450BM3中高度保守的苏氨酸268替换为天冬氨酸,成功诱导了过氧化物酶活性,显著提升了催化效率 | NA | 开发无需NAD(P)H或双功能小分子辅助的高效生物催化剂,用于环境污染物降解 | 五种氯苯胺类化合物(4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺) | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、UPLC-MS分析 | NA | 化学分析数据 | 五种氯苯胺类化合物 |
505 | 2025-05-04 |
Microbially Derived P=S and P=Se Bond Formation
2025-Apr-28, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.5c00262
PMID:40313816
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研究论文 | 本文报道了多种细菌通过中心硫代谢和非酶化学形成P=S键(PhP到PhPS),并首次应用于微生物P=Se键(PhPSe)的形成 | 首次在微生物细胞中进行P=S键形成的生化和遗传研究,并首次将微生物代谢物用于化学合成中的P=Se键形成 | NA | 探索微生物代谢物在化学合成中的直接应用 | 细菌及其代谢物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
506 | 2025-05-04 |
Carbon cycle of polyhydroxyalkanoates (CCP): Biosynthesis and biodegradation
2025-Mar-15, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2025.120904
PMID:39842755
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综述 | 本文综述了聚羟基脂肪酸酯(PHAs)的碳循环过程,包括其生物合成、降解途径以及在环境和生物医学中的应用 | 提出了聚羟基脂肪酸酯碳循环(CCP)的概念,并详细描述了芳香族单体的生物合成途径、碳转化过程以及在不同环境中的降解机制 | 在实现经济高效的PHA生产和降解产物再利用方面仍存在挑战,对PHA合成和降解中的碳途径理解有限 | 探讨PHAs作为生物材料的可持续利用价值,支持全球绿色低碳发展 | 聚羟基脂肪酸酯(PHAs) | 生物材料 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
507 | 2025-05-04 |
Rational multienzyme architecture design with iMARS
2025-Mar-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.12.029
PMID:39855196
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research paper | 开发了一种名为iMARS的标准化框架,用于快速设计最优的多酶结构,以提高催化效率 | iMARS框架整合了高通量活性测试和结构分析,能够预测性地设计多酶结构,显著提高催化效率 | 未明确提及框架的适用范围或潜在的生物学限制 | 提高多酶结构的催化效率,应用于绿色化学、合成生物学和生物制造 | 多酶结构及其在代谢途径中的应用 | 合成生物学 | NA | 高通量活性测试和结构分析 | iMARS框架 | NA | NA |
508 | 2025-05-04 |
Construction and characterization of a mutant library for the P23 constitutive promoter in lactic acid bacteria
2025-Mar, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.01.015
PMID:39848497
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研究论文 | 本研究构建并表征了乳酸菌中P23组成型启动子的突变体文库,用于丰富乳酸菌启动子库并定量表征其活性 | 首次提供了一组显著不同的P组成型启动子突变体元件,为乳酸菌的代谢工程和合成生物学应用奠定了基础 | 突变体文库的特异性仅限于乳酸菌,在大肠杆菌中表现出显著差异 | 丰富乳酸菌启动子库并定量表征启动子活性,以促进代谢工程和合成生物学应用 | 乳酸菌中的P23组成型启动子 | 合成生物学 | NA | 易错PCR和dNTP类似物诱导的随机突变 | NA | 荧光强度数据 | 247个P启动子突变体 |
509 | 2025-05-04 |
Advances in magnetic nanoparticles for molecular medicine
2025-Feb-13, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc05167j
PMID:39846549
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综述 | 本文综述了磁性纳米粒子(MNPs)在分子医学中的最新进展及其多样化应用 | 探讨了MNPs在分子医学中的新兴应用,如基因组编辑、细胞疗法和神经科学,展示了其在细胞和分子水平上精确控制生物过程的独特能力 | NA | 总结MNPs在分子医学中的临床应用,并探索其在疾病治疗中的下一代平台开发 | 磁性纳米粒子(MNPs)及其在分子医学中的应用 | 分子医学 | NA | NA | NA | NA | NA |
510 | 2025-05-04 |
Towards microbial consortia in fermented foods for metabolic engineering and synthetic biology
2025-Feb, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.115677
PMID:39849795
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综述 | 本文综述了发酵食品中微生物群落的相互作用机制及其功能,并探讨了利用新型发酵剂与本地微生物群落结合开发功能性发酵食品的未来发展方向 | 总结了发酵食品中微生物相互作用的当前机制(拮抗、竞争、共生和互惠),并探讨了将这些稳定的微生物群落应用于代谢工程和合成生物学的潜力 | 未提及具体实验数据或案例研究来支持微生物相互作用机制的具体应用 | 探讨发酵食品中微生物群落的相互作用机制及其在代谢工程和合成生物学中的应用 | 发酵食品中的微生物群落 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
511 | 2025-05-04 |
[Research progress in the design and application of whole-cell biosensors for antibiotics]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240400
PMID:39855682
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综述 | 本文综述了抗生素全细胞生物传感器的设计和应用研究进展 | 总结了已报道的抗生素全细胞生物传感器,并将其分为特异性和通用性两类,详细阐述了两类抗生素生物传感器的设计原理和应用 | NA | 为其他抗生素全细胞生物传感器的构建和应用提供参考 | 抗生素全细胞生物传感器 | 合成生物学 | NA | 全细胞生物传感器 | NA | NA | NA |
512 | 2025-05-04 |
[Effects of exogenous additives on growth and high-value bioproducts accumulation of microalgae]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240335
PMID:39855687
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review | 综述了外源添加剂对微藻生长及高价值生物产物积累的影响 | 对外源添加剂的类型、应用、目标菌株及分子机制进行了分类和总结 | 对外源添加剂的分类和总结不够全面 | 提高微藻高价值生物产物的生产效率 | 微藻 | 合成生物学 | NA | 外源添加剂调控 | NA | NA | NA |
513 | 2025-05-04 |
[Regulatory roles of DGAT and PDAT genes in plant oil synthesis]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240376
PMID:39855689
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综述 | 本文全面综述了DGAT和PDAT基因在植物油脂合成中的生物学功能、分子机制及其在合成生物学背景下的应用 | 深入探讨DGAT和PDAT基因在植物油脂合成中的调控机制及其在合成生物学中的应用前景 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 深入理解植物油脂合成的分子机制并提高油料作物的质量和产量 | DGAT和PDAT基因 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
514 | 2025-05-04 |
[Enzymatic MBH reaction catalyzed by an artificial enzyme designed with the introduction of an unnatural tertiary amine cofactor]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240223
PMID:39855701
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研究论文 | 本文报道了一种通过引入非天然辅因子构建的人工酶,成功催化了不对称Morita-Baylis-Hillman (MBH)反应 | 通过引入4-二甲氨基吡啶(DMAP)辅因子作为催化中心,构建了一种新型人工酶,并成功催化了非天然的MBH反应 | 未提及具体的局限性 | 开发新型人工酶,为合成生物学提供丰富的工具箱 | 人工酶及其催化性能 | 合成生物学 | NA | 点击化学策略 | NA | NA | NA |
515 | 2025-05-04 |
[An efficient assembly method for a viral genome based on T7 endonuclease Ⅰ-mediated error correction]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240302
PMID:39855702
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研究论文 | 本研究开发了一种基于T7内切酶Ⅰ介导的纠错方法,用于高效组装约10 kb的病毒基因组 | 通过合理设计寡核苷酸序列、两步PCR和高保真聚合酶合成3.0 kb DNA片段,并利用T7内切酶Ⅰ进行纠错,显著降低了错误率并简化了合成步骤 | NA | 优化基因合成过程,降低错误率并简化病毒基因组的合成与组装步骤 | 约10 kb的病毒基因组 | 合成生物学 | NA | T7内切酶Ⅰ介导的纠错、两步PCR、高保真聚合酶 | NA | DNA序列 | 约10 kb的病毒基因组 |
516 | 2025-05-04 |
Recent advances in engineering non-native microorganisms for poly(3-hydroxybutyrate) production
2025-Jan-24, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04261-6
PMID:39849243
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综述 | 本文综述了非天然微生物在聚(3-羟基丁酸酯)(PHB)生产中的工程化进展 | 总结了代谢工程和合成生物学在非天然微生物中生产PHB的最新策略,包括CRISPR/Cas9基因编辑技术的应用 | 需要进一步的基因工程方法使非天然微生物更适合大规模PHB生产 | 探讨非天然微生物作为PHB生产宿主的潜力和优化策略 | 非天然微生物,特别是大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
517 | 2025-05-04 |
BAC-browser: the tool for synthetic biology
2025-Jan-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06049-9
PMID:39849360
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研究论文 | 介绍了一个名为BAC-browser v.2.1的图形界面程序,用于合成基因组学中的序列设计和DNA组装 | 开发了一个集成了多种工具的图形界面程序,使非生物信息学背景的研究者也能进行合成基因组学的任务 | 未提及程序的性能评估或与其他工具的对比 | 为合成基因组学领域提供易用的软件工具 | 合成基因组学中的序列设计和DNA组装 | 合成生物学 | NA | DNA序列设计和组装 | NA | 核苷酸序列 | NA |
518 | 2025-05-04 |
Physiology-informed use of Cupriavidus necator in biomanufacturing: a review of advances and challenges
2025-Jan-22, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02643-x
PMID:39844200
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综述 | 本文综述了在生物制造中利用Cupriavidus necator的生理学进展与挑战 | 讨论了C. necator作为生物制造底盘的最新进展,特别是在利用二氧化碳和氢气或甲酸盐作为碳和能源来源方面的应用 | 现有工具和应用常因未充分考虑C. necator独特的生理和代谢特征而受限 | 探讨如何更好地理解和利用C. necator的生理机制以优化其在生物制造中的应用 | Cupriavidus necator细菌及其在生物制造中的应用 | 生物制造 | NA | 合成生物学工具和建模 | NA | NA | NA |
519 | 2025-05-04 |
Development of a Komagataella phaffii cell factory for sustainable production of ( +)-valencene
2025-Jan-21, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02649-5
PMID:39838465
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研究论文 | 本研究开发了一种利用Komagataella phaffii细胞工厂可持续生产(+)-valencene的方法 | 首次在K. phaffii中通过CRISPR/Cas9系统引入(+)-valencene合成酶,并通过多种优化策略显著提高了产量 | 研究仅在摇瓶水平进行验证,尚未进行大规模发酵生产测试 | 开发可持续生产(+)-valencene的微生物细胞工厂 | Komagataella phaffii微生物细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术 | NA | NA | NA |
520 | 2025-05-04 |
Recent trends and advances in chloroplast engineering and transformation methods
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1526578
PMID:40313723
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综述 | 本文综述了叶绿体工程和转化方法的最新趋势和进展 | 讨论了合成生物学在叶绿体工程中的应用以及现代转化载体的构建要素 | 该技术目前主要局限于学术实验室的模式物种,尚未商业化 | 提高作物产量、营养品质、抗逆性以及工业酶和治疗蛋白的生产 | 叶绿体基因组和转基因植物 | 合成生物学 | NA | 叶绿体转化技术 | NA | NA | NA |