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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-10-05 |
[Advances in the regulation of microbial cell metabolism and environmental adaptation]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240937
PMID:40170316
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综述 | 本文系统综述了细胞感知代谢与环境变化及适应性调控的机制与应用前景 | 首次从跨膜/传感器蛋白、适应性调控机制和应用场景三个维度对细胞代谢与环境适应调控进行系统梳理 | NA | 探讨细胞感知代谢变化和环境适应的调控机制及其在合成生物学中的应用 | 微生物细胞的代谢调控与环境适应机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 542 | 2025-10-05 |
Organization of an Artificial Multicellular System with a Tunable DNA Patch on a Membrane Surface
2024-01-10, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.3c04249
PMID:38112415
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研究论文 | 开发了一种基于DNA贴片的策略,通过调控膜表面DNA杂交链式反应构建具有高阶结构的人工多细胞系统 | 利用膜表面DNA杂交链式反应开发DNA贴片策略,首次实现通过调控异质性粘附直接构建高阶结构人工多细胞系统 | NA | 开发构建具有可控排列的人工多细胞系统的简便策略 | 人工囊泡和活细胞组成的混合系统 | 合成生物学 | NA | DNA杂交链式反应 | NA | NA | NA | DNA杂交链式反应 | 人工囊泡, 活细胞 | 基于DNA贴片的异质性粘附系统,用于调控囊泡间连接和高阶结构组装 | 合成生物学, 细胞工程 |
| 543 | 2025-10-05 |
Marine bioactives: Pioneering sustainable solutions for advanced cosmetics and therapeutics
2025-Aug, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107868
PMID:40684894
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综述 | 本文综述海洋生物活性化合物在化妆品和药物领域的应用潜力及可持续发展解决方案 | 系统阐述海洋生物活性化合物的创新提取方法(酶辅助和超临界流体提取)、合成生物学可持续生产稀有化合物、以及海洋细胞培养实现50倍产量提升等技术突破 | NA | 探索海洋来源生物活性化合物在化妆品和制药领域的应用前景及可持续发展路径 | 海洋来源的多糖、肽类、脂质和色素等生物活性化合物 | NA | NA | 酶辅助提取、超临界流体提取、合成生物学、海洋细胞培养、生命周期评估 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 海洋藻类、无脊椎动物、微生物 | NA | 医药, 化妆品 |
| 544 | 2025-10-05 |
Protein-glycan engineering in vaccine design: merging immune mechanisms with biotechnological innovation
2025-Jul-24, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.06.022
PMID:40713219
|
综述 | 本文综述了蛋白质-聚糖工程技术在疫苗设计中的应用及其免疫机制 | 整合CRISPR糖基编辑、合成生物学和糖修饰纳米颗粒等前沿生物技术实现聚糖结构的精准控制 | NA | 探讨蛋白质-聚糖工程如何提升疫苗效力并推动下一代糖工程疫苗开发 | 聚糖介导的免疫识别机制及其在疫苗设计中的应用 | 合成生物学 | 传染病、癌症、自身免疫性疾病 | CRISPR糖基编辑、合成生物学、纳米颗粒技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 545 | 2025-10-05 |
A Review of DNA Restriction-Free Overlapping Sequence Cloning Techniques for Synthetic Biology
2025-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70084
PMID:40713804
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综述 | 系统总结合成生物学中主要使用的无限制性酶重叠序列克隆技术及其发展与应用 | 首次系统比较各类RFOSC技术的效率、实用性和应用场景,提出方法选择应基于项目规模与需求的创新观点 | 未涉及传统限制性内切酶克隆方法的对比分析 | 评估合成生物学中DNA无酶克隆技术的发展现状与未来趋势 | 体外组装方法(Gibson Assembly、CPEC等)和体内重组方法(YHR、TAR等) | 合成生物学 | NA | DNA克隆技术 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, In-Fusion, LIC, SLIC, TEDA, YHR, IVA, TAR, PEDA | 酵母, 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 546 | 2025-10-05 |
Exploring pigment-producing Streptomyces as an alternative source to synthetic pigments: diversity, biosynthesis, and biotechnological applications. A review
2025-Jun-25, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04379-7
PMID:40555885
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综述 | 探讨色素产生链霉菌作为合成色素替代来源的多样性、生物合成途径及生物技术应用 | 系统整合链霉菌色素研究的生态多样性、生物合成机制及CRISPR/Cas基因编辑技术在激活沉默基因簇中的应用 | 存在毒理学评估不足、工业条件下色素稳定性问题、未探索菌株高通量筛选缺乏以及AI预测工具整合不充分等研究缺口 | 开发链霉菌天然色素作为合成色素的可持续替代品 | 色素产生链霉菌及其次级代谢产物 | 工业生物技术 | NA | CRISPR/Cas基因编辑、发酵优化、高通量筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 链霉菌 | 沉默生物合成基因簇激活 | 食品,制药,化妆品,纺织,环境 |
| 547 | 2025-10-05 |
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.05.651767
PMID:40654943
|
研究论文 | 本研究利用合成生物学方法改造BCG疫苗,通过增强HMBPP产量来激活Vγ9Vδ2 T细胞 | 首次尝试在BCG中重新设计MEP途径以改善疫苗效力,通过HMBPP感知利用宿主自我-非我识别机制 | 表达多个MEP基因可能导致途径反馈抑制,仍需进一步开发更有效的疫苗 | 测试提高BCG免疫原性是否能改善疫苗有效性同时保持其安全性 | BCG疫苗菌株和Vγ9Vδ2 T细胞 | 合成生物学 | 结核病 | 合成生物学方法,同线性分析,刺激试验 | NA | 基因组数据,实验数据 | 356个调查基因组,63种分枝杆菌物种 | 合成生物学方法 | BCG(牛分枝杆菌) | 合成MEP基因座,HMBPP合成酶GcpE过表达 | 医学 |
| 548 | 2025-10-05 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
|
研究论文 | 本研究开发了一种主动学习方法,用于训练能够区分增强子和沉默子的深度学习模型 | 结合合成生物学和不确定性采样,通过多轮大规模平行报告实验迭代训练模型 | 模型主要针对CRX结合位点,可能不适用于其他转录因子 | 解决相同转录因子在不同背景下激活或抑制转录的机制问题 | 光感受器转录因子锥杆同源框(CRX)的结合位点 | 机器学习 | NA | 深度学习, 大规模平行报告实验 | 深度学习模型 | 基因组序列 | 几乎所有基因组中结合的CRX位点 | 合成生物学 | NA | NA | 基础研究 |
| 549 | 2025-10-05 |
LIM-domain-only 4 (LMO4) enhances CD8+ T-cell stemness and tumor rejection by boosting IL-21-STAT3 signaling
2024-08-09, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01915-z
PMID:39117617
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR激活筛选发现LMO4能增强CD8+ T细胞的干性特征和抗肿瘤能力,并通过合成生物学方法验证其作用机制 | 首次发现LMO4通过增强IL-21-STAT3信号通路来促进CD8+ T细胞干性,并开发了新的合成生物学工具 | 研究主要基于动物模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索增强CD8+ T细胞干性特征以改善T细胞免疫疗法效果的策略 | CD8+ T细胞及其干细胞样记忆T细胞亚群 | 合成生物学 | 肿瘤 | CRISPR激活筛选, CRISPR/Cas9基因编辑, 合成生物学方法 | NA | 基因表达数据, 细胞功能实验数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 哺乳动物细胞 | LMO4过表达系统 | 医学 |
| 550 | 2025-10-05 |
Reconstitution of the Bacterial Glutamate Receptor Channel by Encapsulation of a Cell-Free Expression System
2024-Mar-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66595
PMID:38526087
|
研究论文 | 开发了一种在合成细胞中重构细菌谷氨酸受体通道的方法 | 通过封装无细胞表达系统在巨型单层囊泡中实现膜蛋白重构,并展示信号肽替换对共翻译转运的影响 | 仅使用细菌谷氨酸受体作为模型膜蛋白进行验证 | 开发在合成细胞中重构膜蛋白的方法 | 细菌谷氨酸受体(GluR0)和巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统(CFE) | NA | NA | NA | NA | NA | 膜蛋白重构系统 | 合成生物学,生物传感 |
| 551 | 2025-10-05 |
Activation domains can decouple the mean and noise of gene expression
2022-07-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111118
PMID:35858548
|
研究论文 | 本研究揭示了转录激活域强度与核浓度如何调控基因表达噪声的机制 | 首次证明在固定平均表达水平下,激活域的强度与丰度可独立调控基因表达噪声 | 未涉及不同类别激活域之间的差异比较 | 探索调控基因表达噪声的分子机制 | 转录激活域(ADs)与基因表达波动 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 552 | 2025-10-05 |
Crucial roles of intracellular cyclic di-GMP in impacting the genes important for extracellular electron transfer by Geobacter metallireducens
2025-Jul-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00727-25
PMID:40464557
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法构建不同c-di-GMP水平的菌株,探究该分子对地杆菌胞外电子传递的调控机制 | 首次系统揭示c-di-GMP通过调控多血红素c型细胞色素和菌毛蛋白基因表达影响地杆菌胞外电子传递全过程 | c-di-GMP如何调控这些基因表达的具体机制尚不明确 | 探究细胞内c-di-GMP在细菌胞外电子传递中的调控作用 | Geobacter metallireducens细菌及其胞外电子传递相关基因 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、基因表达分析、基因敲除 | NA | 基因表达数据、电化学数据、生物膜形成数据 | 三种工程菌株(Gme-H、Gme-C、Gme-L) | 合成生物学方法 | Geobacter metallireducens | 通过调控c-di-GMP水平构建不同表型菌株 | 环境,能源 |
| 553 | 2025-10-05 |
Extracellular Peptide-Ligand Dimerization Actuator Receptor Design for Reversible and Spatially Dosed 3D Cell-Material Communication
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00482
PMID:39705005
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研究论文 | 本研究开发了一种可逆响应生物材料配体的合成跨膜受体平台EPDA,实现三维细胞-材料通讯 | 开发了新型EPDA受体平台,通过胞外肽配体二聚化可逆激活细胞响应,并创建了计算算法PETEI筛选配体-受体对 | NA | 连接合成生物学与生物材料领域,开发可感知和响应生物材料结合配体的跨膜受体 | 哺乳动物细胞、合成受体、肽配体 | 合成生物学 | NA | 硫醇-降冰片烯化学、肽配体图案化、计算算法设计 | NA | 荧光成像数据、结合亲和力预测数据 | 测试了基于预测结合亲和力排名前30的单体抗体 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 哺乳动物细胞 | 刺激性和抑制性受体对、肽配体二聚化激活系统、可逆蛋白合并/分离开关 | 医学, 再生医学 |
| 554 | 2025-10-05 |
Bacterial Therapeutics: Addressing the Affordability Gap in Cancer Therapy
2025-Jul-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0870
PMID:40660814
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综述 | 探讨细菌疗法作为低成本癌症免疫治疗替代方案的潜力 | 提出利用合成生物学和人工智能开发下一代细菌疗法,实现超过3万倍的成本节约 | NA | 解决癌症治疗中日益增长的经济负担问题 | 细菌免疫疗法 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 555 | 2025-10-05 |
Three cytochrome P450 88A subfamily enzymes, CYP88A108, CYP88A164, and CYP88A222, act as β-amyrin 11-oxidases involved in triterpenoid biosynthesis in Melia azedarach L
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145362
PMID:40541870
|
研究论文 | 本研究鉴定并功能表征了苦楝中三个CYP88A亚家族细胞色素P450基因作为β-香树脂醇11-氧化酶参与三萜类化合物生物合成 | 发现CYP88A108和CYP88A164具有双重功能,既能参与五环三萜合成也能参与柠檬苦素类合成,揭示了植物CYP88A P450s独特的催化多功能性 | NA | 阐明苦楝中五环三萜类化合物生物合成的酶学机制 | 苦楝(Melia azedarach L)中的CYP88A亚家族细胞色素P450基因 | 合成生物学 | NA | 转录组挖掘、瞬时表达系统、酵母微粒体功能表征、系统发育重建、结构建模 | NA | 基因序列、蛋白质结构、酶活性数据 | NA | NA | 本氏烟(Nicotiana benthamiana)、酵母 | 三萜类化合物生物合成途径 | 医药、工业生物技术 |
| 556 | 2025-10-05 |
Plant-Derived Natural Products Ameliorating Hypertension via Signaling Pathways: A Review
2025, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X2550051X
PMID:40626404
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综述 | 本文综述了2019-2024年间具有降压潜力的植物源天然产物及其通过信号通路改善高血压的作用机制 | 系统评估了70种具有降压活性的天然产物,并按黄酮类、萜类、生物碱和植物提取物进行分类,提出未来应优先研究兼具抗氧化/抗炎双重特性的天然产物 | 仅涵盖2019-2024年间的文献,未包括更早期的研究,且为综述性分析而非原始实验研究 | 评估植物源天然产物通过信号通路改善高血压的治疗潜力 | 70种植物源天然产物,包括20种黄酮类、24种萜类、17种生物碱和9种植物提取物 | 药理学 | 心血管疾病 | 文献检索分析 | NA | 文献数据 | 70种天然产物 | NA | NA | NA | 医药 |
| 557 | 2025-10-05 |
Synthetic Circuit-Driven Expression of Heterologous Enzymes for Disease Detection
2021-09-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00133
PMID:34464083
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研究论文 | 本研究开发了一种合成基因电路与纳米技术结合的疾病检测系统,通过癌细胞特异性表达异源酶并利用纳米传感器实现信号放大检测 | 首次将合成生物学基因电路与纳米技术传感器整合,创建了能够对癌症状态产生放大检测信号的工程化生物传感器系统 | 目前仅在卵巢癌小鼠模型中验证,尚未在人类临床试验中测试 | 开发新型工程化生物传感器用于疾病检测 | 卵巢癌细胞、小鼠模型 | 合成生物学、纳米技术 | 卵巢癌 | 基因电路设计、纳米传感器技术 | AND逻辑门基因电路 | 酶活性检测信号 | NA | 合成生物学基因电路设计 | 哺乳动物细胞 | AND逻辑门基因电路,整合两个卵巢癌特异性合成启动子驱动TEV蛋白酶表达 | 医学诊断 |
| 558 | 2025-10-05 |
The Future of Virology is Synthetic
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00770-21
PMID:34463577
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评论 | 本文探讨合成生物学在病毒学研究中的应用前景及其对改善人类健康和可持续农业的潜在贡献 | 提出合成生物学可作为解锁全球病毒基因库的关键工具,并探讨合成病毒在理解微生物生态系统和应对耐药微生物威胁中的创新应用 | NA | 讨论当前合成操纵病毒的技术及其在人类健康和农业可持续发展中的应用 | 病毒圈(全球病毒组)和合成病毒 | 合成生物学 | 耐药微生物感染 | 合成生物学工程原理 | NA | NA | NA | NA | 微生物生态系统 | NA | 医学, 农业 |
| 559 | 2025-10-05 |
Metrics for regulated biochemical pathway systems
2019-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty942
PMID:30428007
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研究论文 | 提出适用于静态网络和动态系统的调整后度量指标,用于量化生化途径系统中调控的重要性 | 引入考虑调控信号的调整后度量指标,弥补了传统图度量忽略调控信息的不足 | NA | 开发能够量化生化途径系统中调控重要性的度量方法 | 生化途径系统和生物网络 | 计算生物学 | NA | 网络分析 | NA | 网络数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程 |
| 560 | 2025-10-05 |
In Vivo Multicellular Feedback Control in Synthetic Microbial Consortia
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00862
PMID:40499137
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研究论文 | 本文提出了一种能够在合成微生物群落中实现稳定精确基因表达调控的生物分子控制架构 | 通过两个菌株间的分布式多细胞反馈回路实现分工合作,突破了传统单细胞生物分子控制的局限性 | NA | 开发能够保证基因表达稳定精确调控的生物分子控制架构 | 合成微生物群落中的两个细胞群体 | 合成生物学 | NA | 生物分子工程 | NA | 实验数据 | NA | NA | 微生物 | 分布式多细胞反馈回路 | 工业生物技术 |