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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2026-02-06 |
Study on the framework of ATP energy cycle system in Escherichia coli
2025-Feb-12, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13350-9
PMID:39937288
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研究论文 | 本研究旨在开发一种用于大肠杆菌的快速、无标记、多位点、多拷贝基因组编辑系统,并探索构建AMP-ATP循环系统 | 鉴定出单个ppk基因(No.8)可完成AMP-ATP循环反应,并利用MUCICAT技术将其插入基因组不同位置和拷贝数,实现与质粒相当的表达水平 | 未明确说明实验规模或样本量,且研究主要聚焦于大肠杆菌,可能限制其直接应用于其他生物系统 | 开发高效的大肠杆菌基因组编辑系统,以降低ATP依赖反应的成本并推进合成生物学应用 | 大肠杆菌(Escherichia coli)及其ATP合成途径相关基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, MUCICAT技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌(Escherichia coli) | AMP-ATP循环系统 | 工业生物技术 |
| 542 | 2026-02-06 |
Precision tumor treatment utilizing bacteria: principles and future perspectives
2025-Jan-04, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13378-x
PMID:39754636
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综述 | 本文全面回顾了基于细菌的肿瘤治疗策略,包括其分类、机制、工程化方法以及临床转化挑战 | 系统整合了合成生物学与纳米医学于工程化细菌中,以增强治疗效果和可控性 | NA | 探讨利用细菌进行精准肿瘤治疗的原理和未来前景 | 工程化细菌及其与纳米材料的杂合系统 | NA | 肿瘤 | 基因工程、合成生物学、纳米医学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 肿瘤靶向、肿瘤细胞杀伤、抗肿瘤免疫激活的基因回路 | 医学 |
| 543 | 2026-02-06 |
Comprehensive Parameter Space Mapping of Cell Cycle Dynamics under Network Perturbations
2024-03-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00631
PMID:38420905
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研究论文 | 本文开发了一种基于液滴的合成细胞系统,用于在单细胞水平上多维、全动态范围地连续调节参数,以全面映射细胞周期振荡器在扰动下的周期景观 | 提出了一种实验框架,用于全局参数空间扫描,通过系统扰动Cdk1为中心的细胞周期振荡器,挑战并优化了现有模型,揭示了Cdk1正反馈抑制对细胞周期频率范围的限制以及PP2A抑制下的新细胞响应模式 | 模型可能简化了复杂生物系统,且参数缺乏实验验证,在扰动系统中的可靠性尚不明确 | 研究细胞周期动态在扰动下的参数空间映射,以探索复杂动态系统 | 细胞周期振荡器,特别是以Cdk1为中心的调控网络 | 合成生物学 | NA | 液滴基合成细胞系统 | NA | 实验数据 | NA | NA | 合成细胞系统 | 细胞周期振荡器 | 医学 |
| 544 | 2026-02-05 |
Advances in engineering and applications of synthetic phase-separated membraneless organelles in biotechnology
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.01.007
PMID:41624985
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综述 | 本文系统总结了合成无膜细胞器的设计策略、表征技术及应用进展,并讨论了当前挑战与未来研究方向 | 基于天然无膜细胞器的工作机制,设计并构建了多种合成无膜细胞器,应用于酶活性调控、代谢途径优化、基因表达调控、重组蛋白生产和功能生物材料开发等多个生物技术领域 | NA | 为液-液相分离驱动的合成无膜细胞器的设计与应用提供理论指导和实践参考,促进其在合成生物学和生物技术中的创新发展 | 合成无膜细胞器 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离(LLPS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术 |
| 545 | 2026-02-05 |
Facts and Hopes in Harnessing Macrophage-Mediated Antibody-Dependent Cellular Phagocytosis for Cancer Immunotherapy
2026-Feb-04, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0434
PMID:41329478
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综述 | 本文综述了巨噬细胞介导的抗体依赖性细胞吞噬作用在癌症免疫治疗中的作用、挑战与前景 | 系统性地探讨了肿瘤相关巨噬细胞在ADCP中的核心作用,并提出了通过FcγR分析、抗体工程和合成生物学等新兴策略来选择性增强ADCP的治疗潜力 | 肿瘤相关巨噬细胞的异质性以及不同肿瘤类型中FcγR表达模式的认知有限,制约了ADCP的治疗应用 | 探讨如何利用巨噬细胞介导的抗体依赖性细胞吞噬作用来改进癌症免疫治疗 | 肿瘤相关巨噬细胞、单克隆抗体、Fcγ受体、肿瘤微环境 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 546 | 2026-02-05 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-Jan-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
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综述 | 本文综述了人工智能在细胞生物学中的多样化应用,包括显微镜成像、药物发现和合成生物学等领域 | 全面探讨了AI在单细胞分辨率分析、细胞行为建模以及蛋白质结构预测中的创新应用,并强调了工具民主化的未来方向 | NA | 探索人工智能在细胞生物学研究中的转化潜力与应用前景 | 细胞生物学数据、显微镜图像、单细胞转录组学、蛋白质结构 | 机器学习 | NA | 深度学习、高通量技术 | 深度学习 | 图像、生物数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、基础研究 |
| 547 | 2026-02-05 |
Biological conversion of methane to organic molecules: towards a low-carbon bioeconomy
2026-Jan, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaf547
PMID:41623557
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综述 | 本文综述了将甲烷生物转化为有机分子的研究进展,旨在推动低碳生物经济的发展 | 提出了一个整合合成生物学、代谢工程和系统生物学的系统性框架,用于设计基于甲烷的生物制造,以开发高效的甲烷同化细胞工厂 | NA | 开发下一代甲烷氧化细胞工厂,克服天然甲烷氧化菌的生理限制,实现甲烷向高价值生物产品的可持续转化 | 甲烷氧化菌及其代谢途径 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 甲烷氧化菌 | 甲烷同化途径、中心碳代谢整合 | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 548 | 2026-02-05 |
Characterization of Rationally Designed CRISPR/Cas9-Based DNA Methyltransferases with Distinct Methyltransferase and Gene Silencing Activities in Human Cell Lines and Primary Human T Cells
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00569
PMID:39898483
|
研究论文 | 本研究通过理性设计CRISPR/Cas9基础的DNA甲基转移酶,在人类细胞系和原代T细胞中实现了可编程的DNA甲基化和基因沉默 | 在DNMT3A催化核心引入突变,稳定了dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白在Jurkat T细胞中的表达,同时保持DNA甲基化和基因沉默功能,并首次在原代人T细胞中验证了工程化dCas-DNMTs的功能 | 研究主要限于体外细胞实验,尚未在体内模型或更复杂的生理环境中验证 | 开发更稳定、高效的CRISPR/Cas9基础的表观遗传编辑工具,用于哺乳动物细胞的可编程DNA甲基化调控 | 人类细胞系(包括Jurkat T细胞)和供体来源的原代人T细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9表观遗传编辑、DNA甲基化分析 | dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白系统 | 表观遗传数据、基因表达数据 | 多种人类细胞系及供体来源的原代T细胞 | CRISPR-Cas9 | 人类细胞系、原代人T细胞 | dCas9与DNMT3A/3L甲基转移酶融合构建的表观遗传编辑系统 | 医学、基础研究 |
| 549 | 2026-02-05 |
Enhancing lipid production in plant cells through automated high-throughput genome engineering and phenotyping
2025-Feb-13, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf026
PMID:39899469
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于植物生物工程的快速、自动化、高通量管道FAST-PB,通过整合自动化生物铸造、基因组编辑和单细胞质谱分析,以增强玉米和本氏烟草中的脂质生产 | 开发了FAST-PB管道,整合了自动化生物铸造、Golden Gate克隆、CRISPR编辑和单细胞MALDI-MS分析,实现了高通量植物基因组工程和表型分析,显著提高了脂质产量 | NA | 开发一种自动化高通量管道,以加速植物生物工程过程,特别是增强脂质生产 | 玉米(Zea mays)和本氏烟草(Nicotiana benthamiana)的愈伤组织和原生质体细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR编辑、Golden Gate克隆、单细胞MALDI-MS、自动化生物铸造 | NA | 质谱数据、脂质组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | 玉米, 本氏烟草 | 通过CRISPR激活脂质控制基因来增强脂质生产,涉及多基因盒的引入 | 农业, 能源 |
| 550 | 2026-02-05 |
Beyond pigments and perfumes: engineering in the carotenoid and apocarotenoid spectrum, novel enzymes, and synthetic biology strategies
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1716709
PMID:41625067
|
综述 | 本文通过模块化视角,综述了类胡萝卜素和脱辅基类胡萝卜素的生物合成途径,包括新型酶、合成生物学工具及代谢控制策略 | 采用途径模块中心视角,整合多种酶源、宿主范围及途径模块性,强调新发现和工程化酶以及合成生物学工具 | NA | 综述类胡萝卜素和脱辅基类胡萝卜素生物合成的最新进展,为研究人员提供层次化理解以推动该领域发展 | 类胡萝卜素和脱辅基类胡萝卜素的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物, 真菌, 藻类, 酵母, 细菌 | NA | 生物医学, 农业, 环境, 食品 |
| 551 | 2026-02-05 |
A synthetic biology toolkit for rationally designing genetic circuits in Acinetobacter baumannii
2025, Frontiers in systems biology
DOI:10.3389/fsysb.2025.1668595
PMID:41626556
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研究论文 | 本研究开发了一个用于鲍曼不动杆菌的合成生物学工具包,包括BioBrick部件库和模块化CRISPRi平台,以对抗抗菌素耐药性 | 首次在鲍曼不动杆菌中系统表征BioBrick部件并开发模块化CRISPRi平台,为理性设计基因电路提供基础 | NA | 通过合成生物学方法对抗鲍曼不动杆菌的抗菌素耐药性 | 鲍曼不动杆菌及其基因电路 | 合成生物学 | 抗菌素耐药性感染 | CRISPR干扰 | NA | NA | NA | BioBrick, iGEM | 鲍曼不动杆菌 | 基因电路,包括诱导型和组成型启动子库以及CRISPRi介导的抑制系统 | 医学 |
| 552 | 2026-02-03 |
Identification of a group of UDP-glycosyltransferases catalyze emodin glycosylation in Rheum officinale with substrates promiscuity
2026-Apr, Phytochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.phytochem.2025.114763
PMID:41461342
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研究论文 | 本研究从药用植物掌叶大黄中鉴定并功能表征了六个催化大黄素糖基化的UDP-糖基转移酶,揭示了其底物混杂性及关键催化残基 | 首次系统鉴定并表征了掌叶大黄中负责大黄素糖基化的UGT酶家族,通过分子对接与定点突变揭示了底物识别的关键氨基酸残基 | 未在完整植物体系或代谢工程宿主中验证这些酶的体内功能,酶学特性研究局限于体外生化实验 | 解析掌叶大黄中蒽醌苷类活性成分的生物合成途径 | 掌叶大黄(Rheum officinale)中的UDP-糖基转移酶(UGTs) | 合成生物学 | NA | 生化分析、分子对接、定点突变 | NA | 酶学数据、分子结构数据 | 六个UGT酶(RoUGT1,2,4,5,6,8) | 定点突变 | NA | NA | 医药 |
| 553 | 2026-02-03 |
Wheat Plasma Membrane Receptors: Orchestrating Immunity and Bridging to Crop Improvement
2025-Dec-19, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48010002
PMID:41614833
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综述 | 本文综述了小麦质膜受体的多样性、分类、信号机制及其在植物免疫中的核心作用,并探讨了其在作物改良中的应用潜力 | 系统整合了小麦质膜受体在大型六倍体基因组背景下的功能特征化挑战,并首次详细阐述了其家族规模从10个到3424个成员的巨大差异,以及将基础研究与作物改良策略(如标记辅助选择、基因叠加和受体工程)相连接 | 小麦基因组庞大、基因重复和功能冗余阻碍了质膜受体的功能表征,且遗传冗余和多效性效应是主要障碍 | 阐明小麦质膜受体的功能、信号机制及其在免疫与作物抗病改良中的作用 | 小麦质膜受体,特别是受体样激酶家族 | 植物生物学/作物遗传改良 | 植物病害(如小麦叶锈病) | 多组学、系统生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 小麦 | NA | 农业 |
| 554 | 2026-02-03 |
Cancer Reversion Therapy: Prospects, Progress and Future Directions
2025-Dec-15, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47121049
PMID:41614813
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综述 | 本文综述了癌症逆转疗法的前景、进展和未来方向,这是一种通过重编程恶性细胞使其恢复为非恶性状态而非摧毁它们的新型治疗范式 | 系统性地整合了癌症逆转疗法的生物学基础、现有策略、新兴技术,并提出了未来发展的关键方向,强调从“摧毁”到“重编程”的范式转变 | 许多报道的“逆转”现象可能只是刺激依赖的可塑性或短暂生长停滞,而非稳定的表型正常化;真正的癌症逆转需要持久、可遗传的表型改变,这在实现上仍面临重大挑战 | 探讨将恶性细胞重编程为非恶性状态的癌症治疗新策略 | 癌症细胞及其微环境 | NA | 癌症 | 单细胞分析、CRISPR基因编辑、患者来源类器官、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 555 | 2026-02-03 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
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研究论文 | 本研究开发了位点选择性交联探针,用于解析非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域间的相互作用,并报告了高分辨率冷冻电镜结构 | 首次应用四嗪点击化学捕获载体蛋白底物在缩合结构域活性位点的交联,揭示了模块间识别事件和载体蛋白的进程性移动机制 | 研究聚焦于酪氨酸生物合成前两个模块的相互作用,可能未完全反映完整合成酶的动态特性 | 阐明非核糖体肽合成酶的分子作用机制,为合成生物学设计提供结构基础 | 酪氨酸生物合成途径中的载体蛋白与缩合结构域/差向异构化结构域复合物 | 结构生物学 | NA | 位点选择性交联、四嗪点击化学、冷冻电镜、X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医药生物技术 |
| 556 | 2026-02-03 |
From Knallgas Bacterium to Promising Biomanufacturing Host: The Evolution of Cupriavidus necator
2025, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_269
PMID:39363001
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综述 | 本文深入回顾了Cupriavidus necator在过去十年中在分子生物学工具、代谢工程和创新发酵策略方面的技术进步,并探讨了其作为可持续生物制造宿主的潜力 | 系统总结了C. necator从一种Knallgas细菌演变为有前景的生物制造宿主的过程,强调了其在推动可持续生物经济中的关键作用 | NA | 探讨C. necator作为多样化微生物底盘在合成生物学和可持续生物制造中的应用潜力 | Cupriavidus necator(一种多功能的微生物) | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、代谢工程、发酵策略 | NA | NA | NA | NA | Cupriavidus necator | NA | 工业生物技术 |
| 557 | 2026-02-03 |
Vibrio natriegens: Application of a Fast-Growing Halophilic Bacterium
2025, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_271
PMID:39527262
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综述 | 本文综述了快速生长的嗜盐细菌Vibrio natriegens在生物技术应用中的潜力,包括其生理学、合成生物学工具开发及代谢工程进展 | 总结了Vibrio natriegens作为非传统生物技术宿主的最新研究进展,包括其快速生长特性、遗传工程工具和代谢模型的应用 | NA | 探讨Vibrio natriegens在生物技术领域的应用潜力和未来挑战 | Vibrio natriegens细菌 | NA | NA | 遗传工程、代谢模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Vibrio natriegens | 代谢途径、生物传感器 | 工业生物技术 |
| 558 | 2026-02-03 |
Photosynthesis 2.0: Realizing New-to-Nature CO2-Fixation to Overcome the Limits of Natural Metabolism
2024-02-01, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041669
PMID:37848245
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综述 | 本文探讨了合成生物学如何通过实现新型CO2固定代谢途径来克服自然光合作用的限制 | 提出了两种策略:一是通过工程化植物实现碳中性或碳负性的光呼吸代谢(如TaCo途径),二是完全替代自然光合作用(如CETCH循环),以显著提升CO2吸收率 | NA | 克服自然光合作用的限制,开发高效的CO2固定代谢途径以应对气候变化 | 工程化植物及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 植物 | TaCo途径和CETCH循环 | 农业, 环境 |
| 559 | 2026-02-03 |
From Farms to Pharma: A "Natural" History of Vaccine Production and Vaccine Skepticism
2024-02, American journal of public health
IF:9.6Q1
DOI:10.2105/AJPH.2023.307508
PMID:38175968
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评论 | 本文从历史视角探讨疫苗与“自然”概念的关系,聚焦19世纪牛痘疫苗的农场生产方式及其对公众信任的影响 | 通过历史案例(19世纪农场生产牛痘疫苗)分析当代疫苗怀疑论中“自然”话语的根源,揭示技术信任构建的长期性 | 研究主要基于历史文献分析,缺乏对当代疫苗技术的直接实证研究 | 分析疫苗生产中“自然”概念的历史演变及其对公众信任的影响 | 19世纪牛痘疫苗的生产技术与公众认知 | NA | 天花 | NA | NA | 历史文献 | NA | NA | 牛 | NA | 医学 |
| 560 | 2026-02-02 |
Synthetic biology for heparin biomanufacturing
2026-Jan-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-00999-x
PMID:41588187
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综述 | 本文全面讨论了肝素生物制造技术的最新进展、挑战和未来前景 | 通过酶工程、代谢工程和合成生物学方法系统优化肝素生物合成途径,探索体内/体外组合策略和从头生物合成作为替代生产方法 | NA | 探索肝素生物制造技术以替代动物源提取方法 | 肝素生物合成途径 | 合成生物学 | 炎症、癌症 | 酶工程、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 肝素生物合成途径 | 医药 |