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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2025-10-05 |
Functional identification of 10-hydroxygeraniol oxidoreductases related to camptothecin biosynthesis in Ophiorrhiza pumila
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145253
PMID:40517854
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研究论文 | 本研究在全基因组水平鉴定了蛇根草中与喜树碱生物合成相关的10-羟基香叶醇氧化还原酶,并验证了三个Op10HGOs的酶活性 | 首次在蛇根草中全基因组鉴定15个10HGOs,并证实Op10HGO2和Op10HGO3在喜树碱生物合成中的关键作用 | 仅对三个Op10HGOs进行了酶活性验证,其他12个10HGOs的功能尚未明确 | 鉴定与喜树碱生物合成相关的酶编码基因,为异源重建生物合成途径提供基因元件 | 蛇根草(Ophiorrhiza pumila)中的10-羟基香叶醇氧化还原酶 | 合成生物学 | 癌症 | 基因组学分析、酶活性测定、转基因技术 | NA | 基因组数据、酶学数据 | 15个10HGOs基因,其中3个进行详细功能验证 | 转基因技术 | 蛇根草 | 喜树碱生物合成途径 | 医药 |
| 582 | 2025-10-05 |
Ultra-high throughput mapping of genetic design space
2025-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532704
PMID:36993481
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研究论文 | 介绍了一种名为CLASSIC的基因筛选平台,能够高通量评估任意长度的基因构建体并揭示基因部件组合规则 | 结合长短读长NGS测序技术,首次实现了对多kb长度基因电路设计的高通量定量评估 | NA | 加速合成生物学发展,通过筛选多样化基因电路设计并学习'组成-功能'映射关系 | 基因电路设计和遗传部件组合 | 合成生物学 | NA | 下一代测序(NGS),长短读长测序技术 | 机器学习模型 | 基因序列数据,表达谱数据 | 单次实验可测量超过10^5个基因电路设计 | NA | 人类细胞 | 5-20 kb长度的多样化基因电路设计 | 工业生物技术 |
| 583 | 2025-10-05 |
Xenotopic synthetic biology: Prospective tools for delaying aging and age-related diseases
2025-Mar-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu1710
PMID:40153513
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综述 | 本文探讨利用非哺乳动物酶类作为延缓衰老和年龄相关疾病的潜在工具 | 提出利用异源物种酶类逆转年龄相关代谢变化的新策略,而非直接靶向自身基因 | NA | 探索通过代谢调控延缓衰老和年龄相关疾病的替代策略 | 来自低等生物的影响年龄相关代谢过程的酶类 | 合成生物学 | 老年疾病 | 酶工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 584 | 2025-10-05 |
Harnessing the biology of regulatory T cells to treat disease
2025-02, Nature reviews. Drug discovery
DOI:10.1038/s41573-024-01089-x
PMID:39681737
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综述 | 本文探讨调节性T细胞的生物学特性及其在疾病治疗中的应用前景 | 结合纳米医学和合成生物学技术开发新一代T细胞精准调控疗法 | 现有临床试验仍存在重要局限性和未解问题 | 研究调节性T细胞在疾病治疗中的临床应用策略 | 人类调节性T细胞 | 免疫学 | 过敏、移植、自身免疫病、癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 585 | 2025-10-05 |
Architectural engineering of Cyborg Bacteria with intracellular hydrogel
2024-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2024.101226
PMID:39328785
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研究论文 | 本研究通过调控不同结构的水凝胶实现半机械细菌的物理和生化特性控制 | 首次展示了通过调控细胞内水凝胶组分(不同光引发剂、分子量PEG-DA、4臂PEG-DA和dsDNA-PEG)来调控半机械细菌功能与结构的新策略 | NA | 探索通过细胞内材料工程控制半机械细菌功能的新方法 | 半机械细菌(Cyborg Bacteria) | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 细胞内PEG基水凝胶架构 | 工业生物技术 |
| 586 | 2025-10-05 |
Molecular Engineering of Functional SiRNA Agents
2024-06-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00181
PMID:38733599
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研究论文 | 开发了一种通过细菌发酵高产率大规模生产功能性siRNA药物的创新生物工程平台 | 采用新型tRNA融合pre-miRNA载体在活宿主细胞内生产多种形式的BioRNA/siRNA药物,实现100%成功率的九种目标分子高水平过表达 | NA | 推进合成生物学领域,为研究和药物开发提供新型功能性siRNA药物生物工程平台 | 小干扰RNA(siRNA)药物 | 合成生物学 | NA | 细菌发酵,分子工程 | NA | NA | 九种目标BioRNA/siRNA分子,每0.25升细菌培养物产量3-10毫克 | NA | 细菌 | tRNA融合pre-miRNA载体系统 | 医学,药物开发 |
| 587 | 2025-10-05 |
Emerging Coumestans in Cancer Therapy With Mechanistic Insights and Clinical Potential
2025-Jul, Archiv der Pharmazie
IF:4.3Q1
DOI:10.1002/ardp.70058
PMID:40685808
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综述 | 本文全面综述了香豆雌酚类化合物在癌症治疗中的抗癌机制及临床潜力 | 系统阐述香豆雌酚衍生物通过调控多条信号通路抑制癌症的机制,并提出结合合成生物学、生物信息学和人工智能提升疗效的新方法 | 香豆雌酚类化合物存在生物利用度低、水溶性差、代谢快等临床应用挑战 | 探讨香豆雌酚类化合物在癌症治疗中的机制及临床转化潜力 | 香豆雌酚、蟛蜞菊内酯、异秦皮啶和补骨脂定等香豆雌酚衍生物 | NA | 乳腺癌,卵巢癌,前列腺癌 | 合成生物学,生物信息学,人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 588 | 2025-10-05 |
Quencher-Free Fluorescence Monitoring of G-Quadruplex Folding
2025-Jan-28, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c10720
PMID:39895733
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研究论文 | 开发了一种无需淬灭剂的单染料标记方法用于监测G-四链体DNA的折叠与解折叠过程 | 首次实现了仅使用单染料标记(无需淬灭剂)的FRET类似格式来监测G-四链体结构转变 | NA | 开发低成本高通量监测G-四链体结构折叠转变的技术 | G-四链体形成DNA序列 | 合成生物学 | NA | 荧光监测技术 | NA | 荧光信号数据 | NA | NA | NA | G-四链体结构 | 合成生物学 |
| 589 | 2025-10-05 |
Robust genetic codes enhance protein evolvability
2024-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002594
PMID:38754362
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研究论文 | 通过大规模并行实验分析数百种重编程遗传密码对蛋白质进化能力的影响 | 首次系统证明稳健遗传密码通过创造平滑的适应性景观来增强蛋白质进化能力,并发现标准遗传密码在进化能力方面并非最优 | 进化能力最优化的遗传密码在一定程度上取决于氨基酸序列与蛋白质功能的具体关系 | 探究遗传密码的稳健性对蛋白质进化能力的影响机制 | mRNA序列和蛋白质功能关系 | 合成生物学 | NA | 大规模并行序列到功能分析 | 适应性景观模型 | 序列数据 | 每个景观包含超过1600万条mRNA序列 | 遗传密码重编程 | NA | NA | 蛋白质工程, 合成生物学 |
| 590 | 2025-10-05 |
In situ chromatin interactomics using a chemical bait and trap approach
2020-06, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-020-0474-8
PMID:32472103
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研究论文 | 开发了一种化学诱饵捕获方法用于研究染色质内组蛋白修饰的相互作用组 | 使用合成生物学方法在天然染色质中设置组蛋白修饰控制的光亲和陷阱,能够捕获瞬时相互作用因子 | NA | 探索表观遗传调控和失调的分子机制 | 组蛋白翻译后修饰的相互作用伙伴 | 表观遗传学 | 癌症 | 定量蛋白质组学、原位蛋白质组学、光亲和标记 | NA | 蛋白质组数据 | NA | 合成生物学方法 | NA | 组蛋白修饰控制的光亲和陷阱系统 | 医学 |
| 591 | 2025-10-05 |
Microbial production of medium-chain-length diols: Current stage and perspectives
2025-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132932
PMID:40609762
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综述 | 总结微生物合成中链长度二醇的当前进展与未来发展方向 | 提出适用于不同链长的通用生物合成途径,并整合合成生物学与AI驱动的酶设计等前沿技术 | 微生物底盘筛选优化速度较慢,限速酶活性不足,中间体和终产物存在毒性问题 | 开发可持续的中链长度二醇微生物合成方法以替代化石基生产工艺 | 中链长度α,ω-二醇(mcl-diols)的微生物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、蛋白质工程、适应性实验室进化 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | 基于脂肪酸生物合成或反向β-氧化途径的通用代谢途径 | 工业生物技术,材料,能源 |
| 592 | 2025-10-05 |
Advances in the biosynthesis of β-carotene and its derivatives in yeast
2025-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132936
PMID:40614874
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综述 | 全面总结酵母中β-胡萝卜素及其衍生物生物合成的最新进展 | 基于结构相关性将衍生物分为叶黄素和脱辅基类胡萝卜素两大类,强调共享的生物合成逻辑 | 未涉及非酵母微生物系统的比较分析 | 开发可持续的微生物生产β-胡萝卜素及其衍生物的方法 | 酿酒酵母和解脂耶氏酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略、发酵优化 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母, 解脂耶氏酵母 | β-胡萝卜素生物合成途径及其衍生物代谢工程 | 食品补充剂, 营养保健品, 药品, 色素 |
| 593 | 2025-10-05 |
Biohybrid technologies for CO2 conversion to fuels and chemicals: Advances in bio-electro-, bio-photoelectro-, and bio-photocatalysis
2025-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132949
PMID:40639626
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综述 | 本文综述了生物混合技术(生物电催化、生物光电催化和生物光催化)在二氧化碳转化为燃料和化学品领域的最新进展 | 系统比较了三种生物混合CO₂转化技术的机理特点和优化策略,强调了界面电子转移、生物相容性等共性挑战的解决方案 | NA | 开发高效可持续的二氧化碳转化技术以实现碳中和目标 | 生物混合二氧化碳转化系统 | 能源与环境生物技术 | NA | 生物电催化(BEC)、生物光电催化(BPEC)、生物光催化(BPC) | NA | NA | NA | 合成生物学 | 酶系统、微生物系统 | NA | 能源, 环境 |
| 594 | 2025-10-05 |
Cross and unique stress adaptation strategies of the polyextremophile Natranaerobius thermophilus to individual high salt, alkaline pH, and elevated temperature
2025-Aug-15, Journal of proteomics
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.jprot.2025.105479
PMID:40482852
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研究论文 | 本研究通过定量蛋白质组学分析揭示了嗜盐碱热菌Natranaerobius thermophilus对高盐、碱性pH和高温三种极端胁迫的交叉和独特适应策略 | 首次系统阐明该菌的碱性适应机制和热适应机制,发现其采用保守的交叉胁迫机制与独特胁迫适应相结合的策略 | 研究主要基于蛋白质组学分析,对具体分子机制的验证和功能研究仍需深入 | 解析多极端微生物对高盐、碱性和高温胁迫的分子适应机制 | 嗜盐碱热菌Natranaerobius thermophilus | 微生物学 | NA | iTRAQ定量蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组数据 | NA | NA | Natranaerobius thermophilus | NA | 合成生物学、生物技术 |
| 595 | 2025-10-05 |
A solution to the postantibiotic era: phages as precision medicine
2025-Aug, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102613
PMID:40449069
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综述 | 探讨噬菌体疗法作为精准医疗手段应对抗生素耐药性危机的解决方案 | 结合基因工程、合成生物学和人工智能技术推动噬菌体疗法向精准医疗方向发展 | NA | 解决抗生素耐药性细菌感染问题 | 病原细菌和噬菌体 | NA | 细菌感染 | 基因工程、合成生物学、人工智能、机器学习 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 宿主范围扩展、反防御系统编码、调控蛋白表达 | 医学 |
| 596 | 2025-10-05 |
Complex engineering of Solanum alkaloids structural diversity in Nicotiana benthamiana
2025-Jul-20, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70213
PMID:40684353
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研究论文 | 本研究通过瞬时表达技术在本氏烟草中成功重构了茄科植物甾体糖苷生物碱和甾体皂苷的生物合成途径 | 发现了番茄SlGAME2-NEW酶作为木糖转移酶的功能,并首次在本氏烟草中通过多基因组合表达成功合成了20种甾体代谢产物 | NA | 在异源植物宿主中重构复杂甾体代谢物的生物合成途径 | 番茄和茄子的甾体糖苷生物碱和甾体皂苷 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达技术、多基因组合表达 | NA | NA | NA | 瞬时表达系统 | 本氏烟草 | 甾体糖苷生物碱和甾体皂苷生物合成途径,涉及9-15个基因的组合表达 | 医药 |
| 597 | 2025-10-05 |
De novo designed protein guiding targeted protein degradation
2025-Jul-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62050-z
PMID:40676011
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研究论文 | 开发了一种在大肠杆菌中使用的引导蛋白标记和降解系统(GPlad),能够精确降解多种蛋白质 | 使用从头设计的引导蛋白和精氨酸激酶实现无需预融合的靶向蛋白降解,并扩展出可逆抑制、光遗传调控和生物嵌合化等工具 | 目前仅在大肠杆菌中验证,尚未在其他生物系统中测试 | 开发无需预融合的靶向蛋白降解系统 | 荧光蛋白、代谢酶和人类蛋白质 | 合成生物学 | NA | 靶向蛋白降解技术 | NA | NA | NA | CRISPR干扰 | 大肠杆菌 | ON/OFF开关、信号放大器、振荡器 | 合成生物学,代谢工程 |
| 598 | 2025-10-05 |
Efficient, cell-type-specific production of flavonols by multiplexed CRISPR activation of a suite of metabolic enzymes
2025-Jul-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61742-w
PMID:40670339
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研究论文 | 开发了一种在植物中实现细胞类型特异性CRISPR激活的系统,用于高效生产黄酮醇 | 首次实现了在稳定转基因植物中细胞类型特异性的多重基因激活,能够精确控制特定细胞层中的代谢通路 | 需要依赖荧光报告系统在细胞水平评估表达效果 | 开发植物合成生物学工具,实现细胞类型特异性的代谢工程 | 拟南芥根部内皮层和表皮细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR激活系统,荧光报告系统,原位荧光检测 | NA | 荧光图像,基因表达数据 | myb12突变体植物 | CRISPR-Cas9 | 拟南芥 | 代谢途径重编程,黄酮醇生物合成通路 | 农业,工业生物技术 |
| 599 | 2025-10-05 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
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研究论文 | 本研究揭示了人工酒精依赖性半萜途径的广泛底物特异性,并成功在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物 | 发现ADH模块首个酶PhoN和下游芳香族异戊二烯基转移酶的广泛底物特异性,结合IPK的底物混杂性实现非天然烷基化色氨酸衍生物的体内生产 | NA | 拓展异戊二烯类化合物的化学空间,推动合成生物学在天然产物合成中的应用 | 人工酒精依赖性半萜途径及其酶组分 | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢工程 | NA | 生物化学数据 | NA | Gibson Assembly, BioBrick | 大肠杆菌 | 人工酒精依赖性半萜途径,包含酸磷酸酶PhoN和异戊烯基激酶IPK | 工业生物技术, 医药 |
| 600 | 2025-10-05 |
Systematic identification of transcriptional activator domains from non-transcription factor proteins in plants and yeast
2023-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.12.557247
PMID:37745555
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研究论文 | 本研究通过计算预测和实验验证系统鉴定了植物和酵母中非转录因子蛋白的转录激活结构域 | 首次在全蛋白质组尺度系统挖掘非转录因子蛋白中的转录激活结构域,并发现可在酵母和植物中通用的高效激活结构域 | 研究主要集中于两种模式真核生物,在其他物种中的普适性有待验证 | 系统识别和验证非转录因子蛋白中的转录激活结构域及其功能 | 拟南芥和酵母的全蛋白质组,重点关注非转录因子蛋白 | 合成生物学 | NA | PADDLE激活域预测、高通量筛选 | NA | 蛋白质序列数据、实验验证数据 | 18,000个片段,覆盖800多个非转录因子基因 | NA | 酵母, 植物 | 转录激活结构域 | 合成生物学 |