合成生物学相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
621 2026-01-27
Cell-free systems for development of biosensors
2026, Progress in molecular biology and translational science
综述 本章深入探讨了无细胞系统在生物传感器开发中的设计、功能与应用 强调了无细胞生物传感器在即时检测和资源匮乏环境中的独特价值,并展望了其与物联网、分布式制造等智能技术的融合前景 讨论了当前无细胞生物传感器在储存寿命、灵敏度和可扩展性方面的限制 综述无细胞系统在生物传感器开发中的应用潜力与技术进展 无细胞系统及其构建的生物传感器 合成生物学 NA 体外转录与翻译 NA NA NA NA NA 遗传电路(包括信号输出策略) 医疗保健, 环境科学, 农业, 食品质量保障
622 2026-01-27
Cell-free systems for automation and robotics
2026, Progress in molecular biology and translational science
综述 本章探讨了无细胞系统与自动化和机器人技术的融合,及其在生物技术和生物工程领域的应用 将无细胞系统的可编程性与自动化和机器人技术的精确性和可扩展性相结合,以加速发现和创新生物材料的开发 标准化、创建更稳健且经济的无细胞提取物,以及整合人工智能和机器学习以优化实验设计和过程 研究无细胞系统在自动化和机器人技术中的应用,以推动生物技术和生物工程的发展 无细胞蛋白质合成(CFPS)和其他可编程的无细胞生物机制 生物工程 NA 无细胞蛋白质合成(CFPS)、微流体设备、液体处理机器人、集成分析平台 NA NA NA NA NA 合成生物学电路的快速原型设计 生物技术、生物工程、高通量筛选、按需生物制造、即时诊断
623 2026-01-27
High-throughput screening of biomolecules using cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
综述 本文探讨了基于无细胞系统的高通量筛选在生物分子鉴定与评估中的原理、平台及应用 系统阐述了无细胞系统作为传统活细胞筛选的替代方案,克服了细胞毒性、代谢干扰等限制,并整合了微流控、自动化与机器学习等前沿技术 存在试剂成本较高、翻译后修饰功能有限等挑战 推动合成生物学、药物发现、诊断和蛋白质工程领域的下一代生物分子筛选与治疗开发 生物分子(化合物、核酸、蛋白质) 合成生物学 NA 高通量筛选、无细胞转录翻译系统、微流控、数字PCR、质谱分析 NA 荧光、发光、质谱等生化输出数据 NA NA 大肠杆菌、小麦胚芽、兔网织红细胞 NA 医药、诊断、工业生物技术
624 2026-01-27
Cell-free systems for low-cost diagnostics
2026, Progress in molecular biology and translational science
综述 本章节全面概述了无细胞系统作为低成本诊断平台的基本原理、设计方法、技术突破及其在即时诊断中的应用 系统性地整合了无细胞诊断平台的生化基础、合成生物学工具(如基因电路、CRISPR-Cas、RNA适配体)以及新兴技术(纸基检测、微流控/可穿戴生物传感器),并探讨了AI辅助系统设计等前沿趋势 作为综述章节,未提供原始实验数据,且重点讨论技术原理与应用前景,对具体实施细节和商业化路径的覆盖可能有限 总结无细胞系统在低成本诊断领域的发展现状、技术原理与应用潜力,旨在推动该技术在医疗资源匮乏地区的普及 无细胞诊断系统(包括大肠杆菌裂解液、小麦胚芽提取物、PURE系统等平台)及其在即时诊断中的应用 合成生物学 NA 无细胞表达系统、CRISPR-Cas工具、RNA适配体技术、纸基检测、微流控生物传感、可穿戴生物传感 NA NA NA CRISPR-Cas, 基因电路 大肠杆菌, 小麦胚芽 用于提高诊断灵敏度与特异性的基因电路 医学
625 2026-01-27
Protocol for preparation of cell-free system
2026, Progress in molecular biology and translational science
研究论文 本文提供了无细胞蛋白质合成(CFPS)系统的完整制备协议,包括高活性细胞提取物的制备、蛋白质表达反应系统的优化以及蛋白质表达与功能的评估方法 详细介绍了宿主菌株选择、机械裂解、提取物澄清以及能量与离子平衡优化的逐步协议,并探讨了将机器学习与冻干格式CFPS结合的未来集成流程 协议可能面临mRNA降解、蛋白质错误折叠和污染等常见瓶颈,导致产量损失 开发高效的无细胞蛋白质合成系统,用于快速、模块化的蛋白质生产 无细胞蛋白质合成系统的制备与优化 合成生物学 NA 无细胞蛋白质合成(CFPS)、SDS-PAGE、Western印迹分析、荧光检测 NA 实验协议 NA NA NA NA 合成生物学、诊断领域、按需生物制造、食品、医疗保健、工业
626 2026-01-27
Development of cell-free transcription translation
2026, Progress in molecular biology and translational science
综述 本文综述了无细胞转录翻译系统的发展历程、优势、应用及面临的挑战与未来方向 系统总结了无细胞转录翻译系统从E. coli提取物到多物种提取物的演变,并强调了其在合成蛋白质方面的快速、高效和化学耐受性优势 高成本、蛋白质产量有限、缺乏复杂翻译后修饰以及提取物不稳定性 探讨无细胞转录翻译系统在分子生物学、合成生物学和生物技术中的应用潜力与改进方向 无细胞转录翻译系统及其在蛋白质合成中的应用 合成生物学 NA 无细胞转录翻译 NA NA NA NA E. coli, 细菌, 酵母, 真核生物 NA 生物技术, 生物制药
627 2026-01-27
Artificial intelligence for cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
综述 本章探讨了人工智能与无细胞系统的整合,重点关注其在合成生物学中的最新进展、工业应用及未来方向 利用人工智能(包括机器学习、深度学习和生成模型)优化无细胞系统,实现了抗菌肽的发现和蛋白质产量的显著提升 面临数据需求、模型可转移性和可扩展性等挑战 优化无细胞系统以加速生物过程测试和反应条件控制 无细胞系统中的蛋白质合成、代谢和反应条件 合成生物学 NA 细胞游离蛋白质合成 机器学习、深度学习、生成模型、贝叶斯优化、神经网络 实验数据 NA NA NA NA 生物制造、制药、诊断
628 2026-01-27
Cell free systems for biodesign
2026, Progress in molecular biology and translational science
综述 本文综述了无细胞系统在合成生物学中的发展、优势、应用及挑战 阐述了无细胞系统如何通过消除细胞膜限制,实现对生化条件的空前控制,并加速设计-构建-测试周期,代表了向去中心化、可编程生物技术的范式转变 面临试剂成本高、批次间差异和规模化等挑战 探讨无细胞系统作为合成生物学变革性工具的原理、进展与应用前景 无细胞系统及其相关技术与平台 合成生物学 NA 无细胞系统,PURE系统,冻干技术,可编程生物合成平台 NA NA NA BioBrick, iGEM NA 遗传电路,代谢途径,生物传感器 医学,环境,工业生物技术
629 2026-01-27
Specifications of Standards in Systems and Synthetic Biology
2015-Sep-04, Journal of integrative bioinformatics IF:1.5Q3
综述 本文介绍了系统与合成生物学中标准化的现状、重要性以及COMBINE倡议在协调和促进相关标准发展中的作用 首次提出通过特刊形式为系统与合成生物学标准提供集中、可访问和可引用的发布平台,并计划每年更新以促进标准发展 NA 促进系统与合成生物学领域的数据、信息和模型标准化,通过特刊提供标准的统一发布平台 系统与合成生物学领域的标准化文档、COMBINE倡议及相关社区标准 系统与合成生物学 NA NA NA NA NA NA NA NA NA
630 2026-01-27
Synthetic Biology Open Language (SBOL) Version 2.0.0
2015-Sep-04, Journal of integrative bioinformatics IF:1.5Q3
研究论文 本文详细介绍了合成生物学开放语言(SBOL)版本2.0.0,这是一个用于电子交换生物设计结构及功能信息的标准化格式 SBOL 2.0.0引入了一个标准化的数据模型,支持对生物设计进行明确且无歧义的描述,填补了现有标准的空白 NA 改善合成生物学中生物设计信息的交换,以缩短开发时间、降低失败率并提高可重复性 合成生物学中的生物系统设计信息 合成生物学 NA NA 数据模型 结构化设计信息 NA SBOL NA NA 工业生物技术
631 2026-01-26
Multi-gene Co-expression systems in E. coli: From single-vector designs to programmable expression platforms
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1
综述 本文综述了在大肠杆菌中实现多基因共表达的系统设计策略,从单载体构建到可编程表达平台的发展历程 系统性地比较了多种多基因共表达策略的机制原理、设计权衡与调控瓶颈,并探讨了整合模块化架构、表达建模与AI辅助设计的新兴可编程工具包 NA 为在大肠杆菌及其他微生物底盘中进行多基因系统工程的科研人员提供全面的策略路线图 大肠杆菌中的多基因共表达系统 合成生物学 NA 内部核糖体进入位点(IRES)、2A自切割肽、双启动子盒、多顺反子操纵子、多质粒配置 NA NA NA BioBrick, iGEM 大肠杆菌 多基因共表达系统,包括逻辑门、生物传感器、代谢途径等 工业生物技术
632 2026-01-26
Phage therapy in cancer treatment: Mechanisms, emerging innovations, and translational progress
2026-Feb, Critical reviews in oncology/hematology
综述 本文综述了噬菌体疗法在癌症治疗中的机制、新兴创新及转化进展 将噬菌体从传统的抗菌剂重新定位为可编程的生物系统,整合了微生物组调控、免疫激活和纳米载体介导的基因递送,并融合了AI、CRISPR和合成生物学技术 仍面临免疫清除、细菌耐药性和监管复杂性等挑战 探讨噬菌体疗法在癌症治疗中的应用潜力与转化前景 噬菌体及其工程化构建体在肿瘤治疗中的作用 NA 口腔鳞状细胞癌、结直肠癌、黑色素瘤、肝细胞癌 CRISPR-Cas、AI驱动选择流程、合成生物学 NA NA NA CRISPR-Cas NA NA 医学
633 2026-01-26
Transmembrane Transport of cAMP and AMP Using a Two Component Small Molecule Transport System
2026-Jan-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
研究论文 本文报道了一种中性双组分系统,首次在生理pH下实现了cAMP和AMP跨脂质体膜的促进运输 首次展示了使用中性双组分系统促进cAMP和AMP跨膜运输,通过合成阴离子载体与胸腺嘧啶衍生物配对提高运输效率 NA 研究核苷酸跨膜运输机制,探索小分子系统在药物递送和合成生物学中的应用潜力 cAMP和AMP核苷酸 合成生物学 NA 脂质体荧光实验、P NMR实验 NA 实验数据 NA NA NA NA 药物递送, 合成生物学
634 2026-01-26
Engineering bacteriophages for gut health: precision antimicrobials and beyond
2026-Jan-22, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
综述 本文综述了工程化噬菌体作为精准抗菌剂在肠道健康中的应用,涵盖合成生物学和纳米技术进展,并探讨其在炎症性肠病、结直肠癌和感染性肠炎中的治疗潜力 利用合成生物学和纳米技术重新设计噬菌体,增强其特异性、功能性和稳定性,作为微生物群中心疗法的多功能工具 面临长期稳定性、耐药性发展和规模化生产等挑战 探讨工程化噬菌体作为精准抗菌剂在肠道疾病治疗中的应用,以应对微生物失调、抗生素耐药性和宿主-微生物相互作用破坏 工程化噬菌体及其在炎症性肠病、结直肠癌和感染性肠炎中的应用 合成生物学 炎症性肠病、结直肠癌、感染性肠炎 合成生物学、纳米技术 NA NA NA 合成生物学 噬菌体 NA 医学
635 2026-01-26
YhfH functions as a tri-function RNA in Bacillus thuringiensis BMB171
2026-Jan-14, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本研究揭示了枯草芽孢杆菌BMB171菌株中的YhfH RNA具有三重功能:作为小RNA调控嘧啶生物合成、作为反义RNA调控LipR表达、以及作为mRNA编码抑制自身转录的肽YhfH-P 首次发现单个RNA分子(YhfH)同时具备小RNA、反义RNA和mRNA三重调控功能,并阐明其通过编码肽YhfH-P实现自我反馈抑制的新机制 研究局限于枯草芽孢杆菌BMB171菌株,尚未在其他细菌中验证YhfH功能的保守性;YhfH-P抑制ilv-leu操纵子的具体结构机制有待进一步解析 探究枯草芽孢杆菌中YhfH RNA的多重调控功能及其分子机制 枯草芽孢杆菌BMB171菌株的YhfH RNA及其编码肽YhfH-P 合成生物学 NA NA NA NA NA NA 枯草芽孢杆菌 三重功能RNA调控网络(包含自我抑制反馈环路、代谢途径交叉调控) 合成生物学
636 2026-01-26
A new frontier in synthetic biology: leveraging phase separation for robust gene circuits
2026-Jan-12, Science bulletin IF:18.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
637 2026-01-26
Contrasting genome composition and codon usage in Listeria monocytogenes temperate versus virulent phages
2026, Virus evolution IF:5.5Q1
研究论文 本研究比较了单核细胞增生李斯特菌温和噬菌体与烈性噬菌体的基因组组成和密码子使用模式 首次系统比较了单核细胞增生李斯特菌中温和与烈性噬菌体的基因组大小、基因长度及密码子使用偏好的差异,揭示了噬菌体生活方式对密码子使用的塑造作用 研究仅针对单核细胞增生李斯特菌噬菌体,结论在其他细菌噬菌体中的普适性有待验证 探究噬菌体生活方式(温和型 vs 烈性)对基因组结构和密码子使用模式的影响 单核细胞增生李斯特菌的温和噬菌体(686个)和烈性噬菌体(1516个)的编码序列 微生物基因组学 NA 基因组比较分析、密码子适应指数计算 NA 基因组序列数据 2202个噬菌体编码序列(686个温和型 + 1516个烈性型) NA 单核细胞增生李斯特菌 NA 生物技术、合成生物学、治疗应用、生物防治
638 2026-01-25
Prototissues: Assembly strategies, collective behaviors, and emerging applications
2026-May, Bioactive materials IF:18.0Q1
综述 本文综述了原组织的组装策略、集体行为及其新兴应用,提出了一个理解原组织设计的双维度框架 提出了一个双维度框架来理解原组织设计,包括原细胞间粘附策略和空间编程方法,并总结了由此启发的关键集体行为 主要挑战包括实现动态和选择性粘附、在保持分辨率的同时扩展空间架构、改善信号传输以及增强生物整合 推进自下而上的合成生物学,以构建更复杂的人工生命系统,并探索原组织在生物医学、生物传感和智能材料等领域的应用 原组织,即由相互连接的原细胞组装体形成的结构 合成生物学 NA NA NA NA NA NA NA NA 生物医学, 生物传感, 智能材料
639 2026-01-25
Systematic optimization of TF-based carboxylic acid biosensors in cell-free system
2026-Apr-01, Biosensors & bioelectronics IF:10.7Q1
研究论文 本文提出了一种在无细胞系统中系统优化基于转录因子的羧酸生物传感器的框架 通过整合控制转录因子可用性和启动子序列,建立了在无细胞系统中理性构建高性能生物传感器的模块化方法 NA 优化无细胞系统中的生物传感器性能,以支持合成生物学和代谢工程应用 基于转录因子的羧酸生物传感器,特别是衣康酸响应型生物传感器 合成生物学 NA 无细胞系统,启动子工程 NA NA NA NA 无细胞系统 生物传感器(衣康酸响应型,3-羟基丙酸响应型) 工业生物技术
640 2026-01-25
ACCU-RATES: A web tool for accurate enzyme kinetics and initial reaction rate measurements
2026-Jan-21, Journal of molecular biology IF:4.7Q1
研究论文 开发了一个名为ACCU-RATES的网络工具,用于精确分析酶动力学数据和测定初始反应速率 采用微分形式的米氏方程对反应进程曲线进行数值拟合,无需依赖线性反应阶段,在数据噪声和低采样率条件下仍能提供可靠参数估计 需要至少两个时间点的产物积累或底物消耗曲线数据 开发精确测定酶初始反应速率和动力学参数的工具 酶反应进程曲线 生物信息学 NA 数值拟合方法 微分形式的米氏方程 酶反应动力学数据 NA NA NA NA 合成生物学,医学(抑制剂发现和生物标志物检测)
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