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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-10-05 |
Data-driven synthetic microbes for sustainable future
2025-Jul-07, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00556-4
PMID:40624030
|
观点文章 | 提出数据驱动合成微生物(DDSM)作为应对环境危机的生物技术解决方案 | 整合组学、机器学习和系统生物学设计工程微生物的创新方法 | NA | 开发可持续且可扩展的生物技术解决方案应对环境挑战 | 工程微生物 | 合成生物学 | NA | 组学技术, 机器学习, 系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 662 | 2025-10-05 |
Research progress and development prospects of microbial synthesis of ergothioneine
2025-May-26, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04415-6
PMID:40415044
|
综述 | 系统综述微生物合成麦角硫因的研究进展与发展前景 | 系统整合麦角硫因应用、代谢途径和微生物合成策略,展望未来研究方向 | NA | 提升麦角硫因生物合成效率以满足市场需求 | 麦角硫因的微生物合成 | 合成生物学 | NA | 基因工程、发酵优化 | NA | NA | NA | NA | 微生物底盘细胞 | 麦角硫因代谢途径 | 食品, 制药, 化妆品 |
| 663 | 2025-10-05 |
Molecular mechanisms and applications of natural transformation in bacteria
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1578813
PMID:40630188
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综述 | 本文系统概述了细菌自然转化的分子机制及其在基因编辑中的应用 | 全面比较了革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌的自然转化机制,并深入探讨了其在合成生物学中的新兴应用 | NA | 阐明细菌自然转化的基本原理以增强其生物技术应用 | 细菌自然转化过程及其分子机制 | 合成生物学 | NA | 自然转化 | NA | NA | NA | 自然转化 | 革兰氏阳性菌, 革兰氏阴性菌 | NA | 工业生物技术 |
| 664 | 2025-10-05 |
Magnesium-Free Assembly of Cationic Peptide/DNA Nanostructures with Defined Geometries for Anticancer Drug Delivery
2025-Jul-09, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c07816
PMID:40560802
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研究论文 | 本研究开发了一种无镁离子条件下通过阳离子肽组装DNA纳米结构的新方法,用于抗癌药物递送 | 采用RGD-TAT阳离子肽替代传统镁离子促进DNA纳米结构自组装,提高了结构稳定性和靶向递送效率 | 仅在免疫缺陷小鼠肿瘤模型中验证,缺乏其他动物模型验证 | 开发新型DNA纳米结构药物递送系统以提高抗癌治疗效果 | DNA纳米结构、阳离子肽、抗癌药物(多柔比星和KRAS siRNA) | 合成生物学 | 癌症 | DNA纳米技术、肽自组装 | NA | 实验数据 | 免疫缺陷小鼠肿瘤模型 | NA | NA | DNA纳米管结构 | 医药 |
| 665 | 2025-10-05 |
Application of Sensor Based on Circularly Permuted Fluorescent Protein in Molecular Biology, Metabolism, and Cellular Imaging
2025-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70071
PMID:40630016
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综述 | 本文综述了基于环状置换荧光蛋白的传感器在分子生物学、代谢和细胞成像中的应用 | 系统总结了环状置换荧光蛋白通过改变末端相对位置来增强环境信号敏感度的创新传感机制 | NA | 总结环状置换荧光蛋白传感器的形成机制、结构优化及生物医学应用 | 环状置换荧光蛋白及其传感器 | 分子生物学 | NA | 环状置换技术、荧光成像 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学、合成生物学 |
| 666 | 2025-10-05 |
Synthetic biology of metabolic cycles for Enhanced CO2 capture and Sequestration
2024-12, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107774
PMID:39260160
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研究论文 | 本文描述了一种名为THETA循环的改良三羧酸循环系统在大肠杆菌中用于碳固定和氨基酸合成 | 开发了名为THETA循环的新型代谢循环系统,将传统单向TCA循环改造为可用于碳固定的双向循环 | NA | 开发合成生物学代谢循环系统以增强二氧化碳捕获和封存能力 | 大肠杆菌代谢系统和THETA循环模块 | 合成生物学 | NA | 酶优化、路径重新设计、异源表达 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | THETA代谢循环,包含三个模块:丙酮酸到琥珀酸转化、琥珀酸到巴豆酰辅酶A转化、巴豆酰辅酶A到乙酰辅酶A和丙酮酸转化 | 环境, 能源 |
| 667 | 2025-10-05 |
Recent progress in stimuli-responsive DNA-based logic gates: Design, working principles and biological applications
2024-Mar, Smart molecules : open access
DOI:10.1002/smo.20230023
PMID:40625523
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综述 | 本文综述了刺激响应型DNA逻辑门的设计原理、工作机制及生物应用的最新进展 | 系统总结了由金属离子、pH、寡核苷酸、小分子、蛋白质和光等多种刺激触发的DNA逻辑门设计 | NA | 探讨刺激响应型DNA逻辑门在合成生物学和纳米技术领域的应用前景 | 基于DNA分子的刺激响应型逻辑门 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | 逻辑门 | NA | NA | NA | NA | 刺激响应型逻辑门(包括与门、或门、非门等逻辑运算单元) | 医学, 合成生物学, 纳米技术 |
| 668 | 2025-10-05 |
Microbial production of torulene and its potential applications: a review
2025-Jul, Food science and biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10068-024-01780-0
PMID:40492047
|
综述 | 本文综述了圆红酵母素(torulene)的微生物生产策略、生物特性及其在食品、化妆品和医药领域的应用潜力 | 系统总结了通过上游和下游工艺提高圆红酵母素产量的策略,并探讨了其在多领域的应用前景 | 圆红酵母素研究仍有限,商业化潜力尚未充分开发,微生物生产面临技术挑战 | 评估圆红酵母素的微生物生产方法和应用前景 | 圆红酵母素及其生产菌株(红酵母) | 工业生物技术 | NA | 系统生物学、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | 红酵母 | NA | 食品,化妆品,医药 |
| 669 | 2025-10-05 |
A roadmap to understanding and anticipating microbial gene transfer in soil communities
2025-Jun-25, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00225-24
PMID:40197024
|
综述 | 提出理解土壤微生物群落中基因转移过程的路线图,以评估合成生物学技术应用时的生物安全风险 | 首次系统阐述土壤微生物基因转移的知识缺口,提出建立土壤标准体系和利用新兴技术测量基因转移宿主范围的新策略 | 目前无法预测土壤中基因转移频率,土壤复杂异质性增加了评估难度 | 提高对土壤微生物群落基因转移过程的理解,设计更安全的生物技术 | 土壤微生物群落和工程微生物 | 合成生物学 | NA | 基因转移测量技术 | 群落尺度环境特异性模型 | NA | 多种土壤类型 | 合成DNA | 环境微生物 | 生物防护措施 | 环境, 农业, 能源 |
| 670 | 2025-10-05 |
FoldMark: Safeguarding Protein Structure Generative Models with Distributional and Evolutionary Watermarking
2025-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619960
PMID:39554012
|
研究论文 | 提出一种名为FoldMark的蛋白质结构生成模型水印策略,用于保护AI驱动的蛋白质研究安全 | 首个利用分布和进化原理的蛋白质生成模型水印策略,平衡水印容量和结构质量 | NA | 开发蛋白质生成模型的安全保护方法,防止恶意使用 | 蛋白质结构生成模型 | 计算生物学 | NA | 分布和进化水印技术 | AlphaFold3, ESMFold, RFDiffusion, RFDiffusionAA | 蛋白质结构数据 | NA | CRISPR-Cas13 | NA | NA | 生物安全, 药物发现, 合成生物学 |
| 671 | 2025-10-05 |
Emerging ultrafast technologies in biotechnology
2025-May, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04309-2
PMID:40292246
|
综述 | 本综述探讨超快技术在生物技术中的变革性应用,重点关注其实时可视化和精确操控生物分子过程的能力 | 整合飞秒激光与阿秒光谱技术实现基因编辑精确定位和电子动力学观测,结合人工智能与纳米技术推动诊断和合成生物学发展 | 存在光损伤风险、与复杂生物系统整合困难及伦理考量等挑战 | 探索超快技术在生物分子过程研究和医疗应用中的潜力 | 生物分子过程(蛋白质折叠、酶催化、能量转移)、细胞动力学、基因编辑系统 | 生物技术 | 错误折叠疾病 | 飞秒激光、超快光谱、阿秒光谱、泵浦-探测显微镜、相干反斯托克斯拉曼散射 | NA | 光谱数据、显微图像 | NA | CRISPR | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 672 | 2025-10-05 |
A comprehensive review on electrically modulated transport of soft, multiphase systems in microflow: Perspectives on drops and vesicles
2025-May, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0254950
PMID:40488123
|
综述 | 系统回顾电场调控微流控系统中软物质多相体系(液滴和囊泡)输运行为的研究进展 | 深入分析囊泡双层脂膜特有的膜张力与弯曲刚度等动力学特性对电流体动力学行为的独特影响 | NA | 研究电场调控下软物质多相体系在微流控系统中的输运动力学 | 液滴和囊泡等软物质多相体系 | 微流控技术 | NA | 高精度成像、微操作、计算建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物递送、合成生物学、材料制造、芯片实验室、生物分析工具 |
| 673 | 2025-10-05 |
Prevention of ribozyme catalysis through cDNA synthesis enables accurate RT-qPCR measurements of context-dependent ribozyme activity
2025-Apr-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080243.124
PMID:40050070
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研究论文 | 开发了一种通过抑制核酶催化作用来准确测量环境依赖性核酶活性的RT-qPCR方法 | 在样品制备流程中引入寡核苷酸抑制剂来防止RNA提取和逆转录过程中的核酶切割,从而恢复RT-qPCR测量的准确性 | 方法主要针对已知体外环境依赖性切割的自切割RNA进行验证,在其他核酶类型中的适用性需进一步验证 | 开发能够准确测量不同环境中核酶活性的方法 | 自切割核酶 | 合成生物学 | NA | RT-qPCR, RNA提取, 逆转录 | NA | RNA, DNA | NA | NA | NA | 自切割核酶 | 合成生物学, 生物制造, 核酸治疗 |
| 674 | 2025-10-05 |
Examining interactions of animal cells with chloroplasts and their light-induced responses in in vitro cell culture systems
2025-04-12, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151622
PMID:40117974
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研究论文 | 本研究通过体外实验系统探究动物细胞与叶绿体的相互作用及其光诱导反应 | 首次系统比较人类癌细胞、小鼠巨噬细胞和天然含叶绿体海蛞蝓细胞与叶绿体的相互作用模式 | 仅使用特定细胞系进行研究,未涵盖更广泛的动物细胞类型 | 探究动物细胞与叶绿体相互作用的机制及光诱导反应 | 人类宫颈癌HeLa细胞、小鼠巨噬样J774.1细胞和Elysia marginata海蛞蝓分离细胞 | 合成生物学 | NA | 体外细胞培养、叶绿体共孵育、光照射实验 | NA | 细胞行为观察、细胞死亡率、活性氧检测 | 三种不同类型细胞系(HeLa、J774.1、E. marginata分离细胞) | NA | 人类细胞, 小鼠细胞, 海蛞蝓细胞 | NA | 医学, 基础研究 |
| 675 | 2025-10-05 |
Designing biological network motif-based controllers by reverse engineering Hill function-type models from linear models
2025-Apr, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0811
PMID:40262636
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研究论文 | 提出一种从线性模型反推非线性Hill函数型模型的反向工程方法,用于设计实现完美适应的生物网络基序控制器 | 将线性系统理论与非线性建模相结合的反向工程方法,解决了非线性模型理论分析困难而线性模型无法捕捉基因表达系统非线性动态的问题 | 仅通过仿真验证方法有效性,缺乏实验验证 | 设计能够实现完美适应能力的生物控制器 | 生物网络基序控制器和基因回路 | 合成生物学 | NA | 反向工程方法,Hill函数建模 | 线性模型,非线性Hill函数模型 | 仿真数据 | 三个生物网络基序控制器 | NA | NA | 生物网络基序控制器,完美适应基因回路 | 合成生物学,系统生物学 |
| 676 | 2025-10-05 |
Designing with Printed Responsive Biomaterials: A Review
2025-Apr, 3D printing and additive manufacturing
IF:2.3Q3
DOI:10.1089/3dp.2024.0004
PMID:40308656
|
综述 | 探讨跨学科增材制造策略在响应性生物材料设计中的应用及其在日常物品和建筑中的整合前景 | 提出将印刷响应性生物材料整合到日常物品和建筑中以增强环境和人类健康的创新愿景 | NA | 综述响应性生物材料的增材制造策略及其在环境和人类健康领域的应用潜力 | 生物基环境交互材料、生物聚合物复合材料、电化学和电阻器件、活性分子、生物传感器、活细胞、孢子或无细胞位点 | 生物材料科学 | NA | 增材制造 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 医疗, 建筑, 能源 |
| 677 | 2025-10-05 |
Interfacing bacterial microcompartment shell proteins with genetically encoded condensates
2025-Mar, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70061
PMID:39969154
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研究论文 | 本研究展示了如何将细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚物界面结合,形成稳定的涂层结构 | 首次实现细菌微区室壳蛋白在蛋白质凝聚物表面形成可控涂层,并能防止液滴融合 | 涂层形成依赖于pH值和蛋白质浓度等特定条件 | 开发合成细胞和细胞器的界面控制方法 | 细菌微区室壳蛋白和蛋白质凝聚物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程,液液相分离 | NA | 实验数据 | NA | 蛋白质工程 | Haliangium ochraceum | 细菌微区室壳蛋白涂层系统,蛋白质凝聚物界面工程 | 合成生物学,生物医学工程 |
| 678 | 2025-10-05 |
Enhancing lipid production in plant cells through automated high-throughput genome engineering and phenotyping
2025-Feb-13, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf026
PMID:39899469
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研究论文 | 开发了一种用于植物生物工程的快速自动化高通量管道FAST-PB,用于增强植物细胞中的脂质生产 | 整合自动化生物铸造厂与单细胞MALDI-MS技术,实现了基因组编辑和产品表征的高通量自动化流程 | NA | 提高植物生物工程的效率和通量,增强植物细胞脂质生产 | 玉米和本氏烟草的愈伤组织和原生质体细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑、单细胞MALDI-MS、Golden Gate克隆 | NA | 质谱数据、代谢组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | Zea mays, Nicotiana benthamiana | 脂质控制基因的CRISPR激活、多基因盒 | 能源, 工业生物技术 |
| 679 | 2025-10-05 |
Molecular insights into the elevator-type mechanism of the cyanobacterial bicarbonate transporter BicA
2025-Jan-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.12.013
PMID:39674889
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研究论文 | 通过分子动力学模拟揭示蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的电梯式转运机制 | 首次通过毫秒级全原子分子动力学模拟阐明BicA二聚体的构象动态变化机制 | NA | 阐明蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的转运机制 | 蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA | 结构生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 分子模拟数据 | 超过1毫秒的分子动力学模拟数据 | NA | 蓝藻 | NA | 能源安全, 粮食生产, 气候变化 |
| 680 | 2025-10-05 |
Artificial miRNAs and target-mimics as potential tools for crop improvement
2025-Jan, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01550-0
PMID:39901962
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综述 | 本文综述了人工miRNA和靶标模拟物作为作物改良工具的潜力与应用进展 | 系统总结了利用合成生物学方法设计人工miRNA和靶标模拟物调控基因表达的最新进展,提出了工程化作物性状的新策略 | NA | 探讨人工miRNA和靶标模拟物在作物改良中的应用潜力 | 植物microRNA及其人工调控工具 | 合成生物学 | NA | 人工miRNA技术、靶标模拟技术 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 合成回路编程 | 农业 |