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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2025-10-05 |
Leveraging artificial intelligence in the fight against infectious diseases
2023-07-14, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adh1114
PMID:37440620
|
综述 | 探讨人工智能在传染病检测、治疗和理解方面的应用进展 | 系统阐述人工智能与系统生物学、合成生物学结合在抗感染领域的创新应用 | NA | 分析人工智能在传染病防控中的应用潜力与发展方向 | 传染病病原体及防控技术 | 机器学习 | 传染病 | 人工智能 | NA | 多模态数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 602 | 2025-10-05 |
The secret life of RNA and lipids
2025-Dec, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2025.2526903
PMID:40613519
|
综述 | 探讨RNA与脂质之间的相互作用及其在合成生物学和生命起源中的意义 | 提出RNA可通过序列特异性方式选择性结合脂质膜,为工程化RNA传感器和调控元件提供新机制 | NA | 探索RNA与脂质相互作用的化学基础及其在合成生物学、RNA世界假说和现代细胞生物学中的应用 | RNA分子与脂质膜的相互作用机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | RNA传感器、调控元件 | 医学, 合成生物学 |
| 603 | 2025-10-05 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2025-Feb-12, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002
PMID:39947133
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荟萃分析 | 通过分析炎症性肠病患者肠道微生物组的小分子生物合成基因簇,发现与疾病相关的脂肪酸酰胺类分子及其致病机制 | 首次通过合成生物学方法鉴定出克罗恩病相关的微生物源小分子,并揭示其通过破坏肠道通透性加剧疾病的机制 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的直接致病性需要进一步验证 | 探索肠道微生物组来源的小分子在炎症性肠病发病机制中的作用 | 炎症性肠病患者的肠道微生物组样本和疾病相关小分子 | 微生物组学 | 炎症性肠病 | 宏基因组学,合成生物学 | NA | 宏基因组数据,质谱数据 | 炎症性肠病患者和健康对照的肠道微生物组样本 | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 604 | 2025-10-05 |
Deconstructing synthetic biology across scales: a conceptual approach for training synthetic biologists
2024-Jun-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49626-x
PMID:38926339
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研究论文 | 提出一个跨尺度的合成生物学培训框架,用于培养合成生物学人才 | 开发了从分子到社会层面的多尺度解构方法,提供跨学科概念整合工具 | NA | 建立合成生物学教育培训框架 | 合成生物学学生和教育工作者 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 教育 |
| 605 | 2025-10-05 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2024-Apr-22, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00424-5
PMID:38649904
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研究论文 | 本研究证明水通道蛋白Aqp1可作为安全的遗传报告基因,在多种细胞类型中产生磁共振信号且不影响细胞生理功能 | 首次系统证明Aqp1过表达不会引起内质网应激,且不影响多种天然生物活性,解决了其作为深层组织报告基因的安全性问题 | 研究仅限于小鼠和人类细胞系,尚未在活体动物模型中进行验证 | 评估Aqp1作为遗传报告基因在磁共振成像中的安全性和有效性 | 小鼠和人类来源的多种细胞系 | 合成生物学 | NA | 磁共振成像 | NA | 成像数据 | 多种小鼠和人类细胞系 | 遗传编码 | 小鼠细胞, 人类细胞 | 水通道蛋白生物传感器 | 医学 |
| 606 | 2025-10-05 |
From Natural Microbe Screening to Sustained Chitinase Activity in Exogenous Hosts
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00637
PMID:38587290
|
研究论文 | 本研究开发了从天然微生物筛选到异源宿主中实现持续几丁质酶活性的完整流程 | 建立了从天然微生物发现到异源宿主稳定表达的系统性方法,并发现了在胶体几丁质存在时能上调表达的感应响应型启动子 | 未明确说明在非标准宿主中实现长期活性的具体挑战和解决方案细节 | 实现异源宿主中持续几丁质酶活性的稳定表达 | 海洋微生物来源的几丁质酶基因及异源宿主系统 | 合成生物学 | NA | 全基因组测序、异源表达、核糖体结合位点优化 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | 海洋水样筛选的微生物 | Gibson Assembly, iGEM | 标准宿主, 非标准宿主 | 感应响应型生物传感器、代谢通路 | 工业生物技术, 环境 |
| 607 | 2025-10-05 |
Characterization of intracellular membrane structures derived from a massive expansion of endoplasmic reticulum (ER) membrane due to synthetic ER-membrane-resident polyproteins
2024-01-01, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erad364
PMID:37715992
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研究论文 | 本研究通过合成内质网膜驻留多蛋白诱导内质网大规模扩张,系统表征了由此形成的膜结构及其特性 | 首次详细表征了由合成多蛋白诱导的内质网衍生膜区室,揭示了胞质面寡聚化结构域的关键作用及区室与内质网间的扩散屏障 | 研究主要局限于烟草和拟南芥两种模式植物,尚未在其他植物物种中验证 | 探索合成生物学方法改造植物内质网膜结构的可行性及其应用潜力 | 烟草和拟南芥植物细胞中的内质网衍生膜区室 | 合成生物学 | NA | 荧光漂白恢复技术、定量图像分析 | NA | 荧光显微镜图像 | 转基因烟草和拟南芥植株 | 重组蛋白表达 | 烟草, 拟南芥 | 内质网膜驻留多蛋白系统,包含胞质面寡聚化结构域 | 农业, 工业生物技术 |
| 608 | 2025-10-05 |
Chimeric Antigen Receptor T-Cell Therapy for Solid Tumors
2023-12, Hematology/oncology clinics of North America
DOI:10.1016/j.hoc.2023.05.009
PMID:37353377
|
综述 | 本文综述了嵌合抗原受体T细胞疗法在实体瘤治疗中的应用、挑战及临床进展 | 系统总结了合成生物学和细胞工程新技术在实体瘤CAR-T疗法中的应用前景 | NA | 探讨CAR-T疗法在实体瘤治疗中的临床应用现状与发展方向 | 实体瘤患者及CAR-T细胞疗法 | NA | 实体瘤 | 嵌合抗原受体T细胞疗法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 609 | 2025-10-05 |
Molecular Imaging with Aquaporin-Based Reporter Genes: Quantitative Considerations from Monte Carlo Diffusion Simulations
2023-10-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00372
PMID:37793076
|
研究论文 | 本研究通过蒙特卡罗扩散模拟分析水通道蛋白作为报告基因在分子成像中的定量特性 | 开发了基于双扩散时间差分成像的方法特异性分离水通道蛋白信号,并建立了表达水通道蛋白细胞体积分数的定量映射关系 | 水通道蛋白信号易受细胞大小和堆积密度等结构因素干扰 | 建立水通道蛋白报告基因在深层组织分子成像中的定量分析框架 | 水通道蛋白报告基因在活体动物中的扩散信号 | 分子成像 | NA | 蒙特卡罗模拟、扩散加权磁共振成像 | 蒙特卡罗扩散模型 | 模拟扩散数据 | NA | NA | 活体动物 | 水通道蛋白报告基因系统 | 医学、生物医学合成生物学 |
| 610 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology in the Engineering of CAR-T and CAR-NK Cell Therapies: Facts and Hopes
2023-04-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1491
PMID:36454122
|
综述 | 探讨合成生物学工具在CAR-T和CAR-NK细胞疗法开发中的应用现状与前景 | 系统总结合成生物学策略在克服细胞疗法障碍方面的最新进展,特别关注NK细胞作为T细胞替代疗法的潜力 | 主要聚焦于策略讨论,缺乏原始实验数据支持 | 综述合成生物学在抗癌免疫细胞疗法中的应用 | CAR-T细胞和CAR-NK细胞疗法 | 合成生物学 | 血液系统恶性肿瘤 | 细胞工程、免疫疗法 | NA | 文献综述 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | T细胞, NK细胞 | 嵌合抗原受体(CAR)、生物传感器、逻辑门电路 | 医学 |
| 611 | 2025-10-05 |
Advances in Approaches to Study Chromatin-Mediated Epigenetic Memory
2022-01-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00394
PMID:34965084
|
综述 | 本文综述了染色质介导的表观遗传记忆研究的最新进展,重点关注组蛋白修饰的遗传机制和合成生物学方法 | 总结了新型合成生物学方法用于分析表观遗传组分,并讨论了工程化调控元件在构建合成表观遗传系统中的应用潜力 | NA | 探讨表观遗传修饰建立和维持的机制,以及亲代组蛋白回收对异染色质介导的转录沉默遗传的影响 | 真菌模型和哺乳动物系统中的表观遗传系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 真菌, 哺乳动物细胞 | 合成表观遗传系统 | 医学, 基础研究 |
| 612 | 2025-10-05 |
Protein manipulation using single copies of short peptide tags in cultured cells and in Drosophila melanogaster
2021-03-16, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.191700
PMID:33593816
|
研究论文 | 本研究开发了一种利用短肽标签在活细胞和果蝇体内直接操纵目标蛋白的方法 | 使用单拷贝短肽标签实现活细胞内目标蛋白的高效结合与操作 | NA | 开发直接操纵目标蛋白的新方法以研究动态细胞过程 | 培养细胞和黑腹果蝇中的目标蛋白 | 合成生物学 | NA | 蛋白质结合剂技术 | NA | NA | NA | NA | 黑腹果蝇, 培养细胞 | NA | 医学研究 |
| 613 | 2025-10-05 |
Development and application of a highly specific whole-cell biosensor for supersulfide detection in environmental samples
2025-Nov-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117731
PMID:40592263
|
研究论文 | 开发了一种基于AtBigR的高特异性全细胞生物传感器,用于环境样品中超硫化物的检测 | 首个用于超硫化物特异性检测的全细胞生物传感器,具有极低背景泄漏和高灵敏度 | NA | 开发能够准确检测超硫化物的生物传感平台 | 超硫化物(包括元素硫、无机多硫化物和有机多硫化物) | 合成生物学 | NA | 全细胞生物传感器技术 | NA | 环境样品数据 | 来自不同海底地形的海洋沉积物和锂硫电池电解质 | AtBigR调控系统 | NA | 基于超硫化物感应阻遏蛋白AtBigR的生物传感器系统 | 环境,能源 |
| 614 | 2025-10-05 |
Bioinformatics analysis and molecular cloning of squalene synthase from Simaroubaceae
2025-Oct, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2025.106751
PMID:40451315
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和分子克隆技术研究了苦木科植物中角鲨烯合酶(SQS)的特征与功能 | 首次从苦木科植物转录组数据中筛选分析多种SQS,鉴定关键催化残基并通过突变分析验证其功能 | 仅对苦木科部分物种的SQS进行了研究,未涉及其他植物家族的比较 | 研究苦木科植物中角鲨烯合酶的特征及其在苦木素生物合成途径中的功能 | 苦木科植物中的角鲨烯合酶(AaSQS, BjSQS, AeSQS, QaSQS, ElSQS, SaSQS) | 生物信息学 | NA | 转录组分析,分子克隆,蛋白表达,分子对接,突变分析 | NA | 序列数据,结构数据 | 6种苦木科植物的SQS基因 | 分子克隆,定点突变 | 大肠杆菌 | NA | 医药,工业生物技术 |
| 615 | 2025-10-05 |
Efficient De Novo Assembly of 100 kb-Scale Human Functional Immunoglobulin Heavy Variable (IGHV) Gene Fragments In Vitro
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00011
PMID:40135783
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研究论文 | 开发了一种高效的无疤痕体外组装方法,成功构建了百kb级别的人类功能性免疫球蛋白重链可变区基因片段 | 首次实现百kb级别复杂人类基因组片段的体外无疤痕组装,解决了高度重复区域的技术难题 | NA | 开发大规模人类基因组片段的高效组装方法 | 人类免疫球蛋白重链可变区基因片段 | 合成生物学 | NA | Gibson等温组装 | NA | DNA序列 | NA | Gibson Assembly | NA | 功能性免疫球蛋白基因片段 | 医学, 基础研究 |
| 616 | 2025-10-05 |
A Tn5 Transposase-Based System for High-Efficiency Genome-Wide Gene Activation in Escherichia coli
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00170
PMID:40527878
|
研究论文 | 开发了一种基于Tn5转座酶的系统,用于在大肠杆菌中实现高效全基因组基因激活 | 利用Tn5转座酶构建了首个近随机整合的全基因组基因激活系统,能够同时实现选择性生长和条件性基因激活 | NA | 开发高效的全基因组基因激活工具以促进细菌工程和功能基因组学研究 | 大肠杆菌基因组 | 合成生物学 | NA | Tn5转座酶介导的转座 | NA | 基因组数据 | NA | Tn5转座酶 | 大肠杆菌 | 四环素诱导型启动子Ptet控制的基因激活系统 | 工业生物技术 |
| 617 | 2025-10-05 |
Establishment of a Visible Reporter System in Zymomonas mobilis through Random Mutagenesis and Rational Design of a Chromoprotein eforRed
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00872
PMID:40590208
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研究论文 | 本研究在运动发酵单胞菌中通过随机诱变和理性设计建立了可见报告基因系统 | 通过随机易错PCR和蛋白质理性设计增强eforRed色蛋白的光谱特性,特别是在非模式微生物中建立可见报告系统 | 研究局限于单一菌株和特定色蛋白,未在其他非模式微生物中验证通用性 | 开发用于生物制造和合成生物学的可见报告基因系统 | 运动发酵单胞菌和eforRed色蛋白 | 合成生物学 | NA | 随机易错PCR、蛋白质理性设计、光谱分析 | NA | 光谱数据、蛋白质表达数据 | NA | 随机诱变、理性设计 | 运动发酵单胞菌 | 可见报告系统,使用强启动子P-4S或P驱动突变eforRed表达 | 工业生物技术, 生物制造 |
| 618 | 2025-10-05 |
Biofortified Bacteria: The Role of Selenium-Enriched Microorganisms in Enhancing Animal Selenium Uptake-A Review
2025-Jul-17, Journal of animal physiology and animal nutrition
IF:2.2Q1
DOI:10.1111/jpn.70001
PMID:40674621
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综述 | 探讨富硒微生物(特别是细菌)作为新型有机硒补充策略在畜禽营养中的应用潜力 | 利用基因工程和合成生物学开发能够增强硒吸收、转化和积累的工程菌株 | 需要优化菌株选择、发酵工艺、生物安全性,并通过长期饲养试验验证效果 | 研究富硒微生物在改善动物硒营养状况中的应用 | 家禽和反刍动物 | NA | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 模块化遗传电路、硒响应生物传感器、可控生物转化途径 | 农业、生物医学、环境修复 |
| 619 | 2025-10-05 |
Computational Strategies to Enhance Vitamin B12 Biosynthesis Potential of Microbes
2025-Jul-04, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04325-8
PMID:40615742
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综述 | 讨论利用计算生物学方法增强微生物维生素B12生物合成能力的策略 | 整合CRISPR-Cas9基因组编辑、人工智能驱动的途径优化和多组学数据融合等最新技术 | NA | 提高微生物维生素B12的生物合成能力以满足全球营养和治疗需求 | 微生物维生素B12生物合成系统 | 计算生物学 | 营养缺乏症 | 代谢工程、合成生物学、比较基因组学、分子对接、多组学数据分析 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 维生素B12生物合成途径优化 | 医药, 工业生物技术 |
| 620 | 2025-10-05 |
Regulation and induction of fungal secondary metabolites: a comprehensive review
2025-Jul-01, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04386-0
PMID:40590991
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综述 | 全面分析真菌次级代谢产物的调控机制、鉴定方法和增产策略 | 整合组学技术与计算模型优化发酵过程,倡导合成生物学与AI驱动代谢工程的跨学科创新 | 未明确提及具体研究局限性(综述文章特性) | 解析真菌次级代谢产物的生物合成调控机制并提升其产量 | 真菌次级代谢产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 组学技术、响应面方法、人工神经网络 | 人工神经网络 | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 农业, 工业生物技术 |