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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2025-10-05 |
Investigating the Potential of Division of Labor in Synthetic Bacterial Communities for the Production of Violacein
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00120
PMID:40525226
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研究论文 | 本研究探索了在合成细菌群落中采用分工策略提高紫色杆菌素产量的潜力 | 通过将紫色杆菌素生物合成途径拆分到两个大肠杆菌亚群中,实现了2.5倍的产量提升 | 需要两个亚群具有相似的代谢负担水平和足够高的比例才能发挥优势 | 研究分工策略在合成微生物群落中提高代谢产物产量的效果 | 合成细菌群落和紫色杆菌素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 代谢途径分工设计,将紫色杆菌素合成途径拆分为VioABE和VioDC两个模块 | 工业生物技术, 医药 |
| 562 | 2025-10-05 |
Strategy for Generating Giant Unilamellar Vesicles with Tunable Size Using the Modified cDICE Method
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00026
PMID:40536055
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研究论文 | 本研究通过改进的连续液滴界面交叉封装方法,开发了一种可调控尺寸的巨型单层囊泡生成策略 | 通过系统调控腔室旋转时间、角频率和内溶液密度等关键参数,实现了对巨型单层囊泡尺寸分布的精确控制 | NA | 优化巨型单层囊泡的尺寸分布控制,为人工细胞构建提供技术支持 | 水包油乳液液滴生成的巨型单层囊泡 | 合成生物学 | NA | 改进的连续液滴界面交叉封装方法 | 物理模型 | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 563 | 2025-10-05 |
Engineered Membrane Vesicle Production via oprF or oprI Deletion Has Distinct Phenotypic Effects in Pseudomonas putida
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00171
PMID:40607986
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研究论文 | 本研究通过删除oprF或oprI基因在恶臭假单胞菌中诱导高囊泡化,评估了不同基因工程策略对膜囊泡产量和菌株表型的影响 | 首次系统比较oprF和oprI基因缺失在恶臭假单胞菌中产生的高囊泡化表型差异,并发现plsB过表达可改善膜完整性 | 研究仅限于恶臭假单胞菌KT2440平台,未在其他细菌系统中验证 | 开发用于工业生物过程的膜囊泡合成生物学工具 | 恶臭假单胞菌KT2440及其膜囊泡 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、膜囊泡分析 | NA | 生物学实验数据 | 恶臭假单胞菌野生型和基因工程菌株 | 基因敲除 | 恶臭假单胞菌 | 高囊泡化表型工程 | 工业生物技术 |
| 564 | 2025-10-05 |
Innovation in Swine Nutrition in China over the Past Decade
2025-Jun-24, The Journal of nutrition
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.tjnut.2025.06.009
PMID:40571101
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综述 | 系统回顾中国过去十年在猪营养领域的研究进展与创新策略 | 首次系统总结中国现代化猪营养标准体系,提出低碳高效国际化生产模式及精准饲喂等针对性解决方案 | NA | 应对猪产业面临的饲料短缺、肉质下降、抗生素滥用等挑战,推动可持续畜牧业发展 | 猪营养标准、饲料质量控制、养殖环境管理 | NA | NA | 合成生物学、分子技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 565 | 2025-10-05 |
From consultors to collaborators - An SOP for advancing ethics engagement in science
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.06.006
PMID:40689230
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研究论文 | 提出一种结构化标准操作程序,用于系统地将伦理学融入科学研究过程 | 开发了分阶段的标准操作程序框架,将伦理学从外部咨询角色转变为科学探究核心的协作伙伴 | NA | 解决合成生物学等领域的伦理关切,促进伦理学在科学研究中的系统整合 | 早期职业研究人员和伦理学家 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 可持续性, 食品生产 |
| 566 | 2025-10-05 |
Construction and phenotypic classification of synthetic dual-pole Escherichia coli cells
2025-Jul-20, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08495-w
PMID:40684034
|
研究论文 | 本研究构建了能够实现双极定位的合成大肠杆菌细胞,并开发了基于神经网络的表型分类方法 | 首次设计出能够在E. coli中实现两个不同支架蛋白在相对极定位的第二代合成遗传电路,并整合了PodJ片段和SpmX作为PopZ的直接嵌合体 | NA | 开发合成生物学工具包以实现可编程细胞分化 | 合成双极大肠杆菌细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程、神经网络分类 | 神经网络 | 细胞图像 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | E. coli | 双极定位遗传电路,包含PodJ支架蛋白和PopZ-SpmX嵌合体 | 工业生物技术 |
| 567 | 2025-10-05 |
A quorum sensing-controlled type I CRISPRi toolkit for dynamically regulating metabolic flux
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf693
PMID:40682826
|
研究论文 | 开发了一种群体感应控制的I型CRISPRi工具包,用于动态调控代谢通量 | 首次将群体感应系统与I型CRISPR干扰技术整合,实现细胞密度响应的动态基因调控 | NA | 开发动态代谢调控工具以促进可持续生物制造 | 枯草芽孢杆菌的代谢工程改造 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰、群体感应、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPRi, QS系统 | 枯草芽孢杆菌 | 群体感应控制的CRISPR干扰系统,用于动态调控代谢通路 | 工业生物技术 |
| 568 | 2025-10-05 |
Quantum bioelectrochemical (QBIOL) software based on point stochastic processes
2025-Jul-19, Communications chemistry
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s42004-025-01603-1
PMID:40683983
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研究论文 | 开发了基于点随机过程的量子生物电化学软件QBIOL,用于模拟生物电化学过程中的随机电子转移 | 首次整合分子动力学、应用数学、GPU编程和量子电荷传输,能够在皮秒到分钟时间尺度上模拟随机分子运动和电子转移 | NA | 解决当前模拟方法无法同时捕捉分子运动随机性和电子转移的问题 | 电极附着氧化还原标记DNA和纳米限制氧化还原物种产生的电流 | 计算生物学 | NA | 分子动力学、量子电荷传输、GPU编程 | 点随机过程模型 | 实验电流数据、电激励波形数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、医疗保健、催化、生物传感 |
| 569 | 2025-10-05 |
Engineering bi-directional chemically-modulated synthetic condensates for cellular control
2025-Jul-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61877-w
PMID:40675979
|
研究论文 | 开发了一种名为ARDrop的化学遗传平台,通过工程化雄激素受体及其药物实现生物分子凝聚物的可逆调控 | 首次利用雄激素受体和临床药物构建了能够双向化学调控合成凝聚物的平台,实现了凝聚物的形成与溶解的可逆控制 | 未明确说明该平台在所有蛋白质类型中的普适性及长期稳定性的具体数据 | 开发精确操控相分离凝聚物的工具,为合成生物学应用设计工程化凝聚物 | 雄激素受体(AR)及其配体药物,多种蛋白质的相分离行为 | 合成生物学 | NA | 理性工程方法,化学遗传平台 | NA | NA | NA | ARDrop平台 | 哺乳动物细胞 | 双向化学调控合成凝聚物系统,具有稳定液体样性质的相分离模块 | 医学, 合成生物学 |
| 570 | 2025-10-05 |
Iterative deep learning design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell-type specificity
2025-Jul-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101302
PMID:40472848
|
研究论文 | 本研究应用迭代深度学习设计具有细胞类型特异性的人类合成增强子 | 采用迭代深度学习策略设计合成增强子,在两种人类细胞系中实现强差异活性,并通过单细胞水平验证增强子活性与转录因子表达的相关性 | NA | 解决合成生物学中如何实现细胞类型特异性基因表达靶向的重要问题 | 人类合成增强子序列 | 机器学习 | NA | 深度学习,染色质可及性分析,转录因子结合位点分析,扰动实验 | 深度学习模型 | 基因组序列数据,增强子活性测量数据,染色质可及性数据 | NA | NA | 人类细胞系 | 合成增强子设计,具有细胞类型特异性调控功能 | 医学,合成生物学 |
| 571 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology-Based Strategy for Nanomedicine Design
2025-Jul, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401969
PMID:40025899
|
综述 | 介绍合成生物学纳米医学的基本概念及其与传统和仿生纳米医学的区别,综述合成生物学在纳米医学中的应用进展 | 提出合成生物学纳米医学新概念,采用基因工程策略设计纳米药物,融合自上而下和自下而上两种策略 | NA | 探讨合成生物学与纳米医学的融合及其在疾病诊断和治疗中的应用潜力 | 合成生物学纳米药物 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 572 | 2025-10-05 |
Living Biotherapeutics Using Nanoparticles-Armed Cyanobacteria for Boosting Photodynamic-Immunotherapy of Cancer
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502746
PMID:40344505
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研究论文 | 开发了一种结合蓝细菌与纳米颗粒的活体生物治疗平台,用于增强癌症的光动力免疫治疗 | 首次将自供氧蓝细菌与多功能前药纳米颗粒结合,创建能够自供应纳米颗粒和氧气的活体纳米治疗剂 | NA | 开发新型癌症光动力免疫治疗平台 | 癌症治疗中的光动力免疫疗法 | 合成生物学与纳米医学 | 癌症 | 共价自组装策略、静电吸附、660nm激光照射 | NA | NA | NA | NA | 蓝细菌 | 自供氧系统与药物递送系统 | 医学 |
| 573 | 2025-10-05 |
Understanding, inhibiting, and engineering membrane transporters with high-throughput mutational screens
2025-Apr-17, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2025.03.003
PMID:40168989
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综述 | 介绍利用高通量突变筛选技术理解、抑制和工程化膜转运蛋白的方法与潜力 | 提出将高通量筛选方法系统应用于研究多特异性转运蛋白,并探讨其在抑制剂设计和合成生物学中的应用前景 | NA | 阐明多特异性膜转运蛋白的功能机制并开发其工程化应用 | 多特异性膜转运蛋白 | 合成生物学 | NA | 高通量突变筛选 | NA | 遗传筛选数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 生物技术 |
| 574 | 2025-10-05 |
Functional Modification of Cyanobacterial Phycobiliprotein and Phycobilisomes through Bilin Metabolism Control
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00094
PMID:39038807
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研究论文 | 通过调控藻胆素代谢对蓝藻藻胆蛋白和藻胆体进行功能改造 | 构建了具有精细调控PEB生物合成能力的新型蓝藻菌株PEB1,首次实现可逆的PCB-to-PEB替换并形成稳定的嵌合藻胆体复合物 | 未详细评估工程菌株在自然环境中长期遗传稳定性 | 研究藻胆体在光适应中的结构功能关系及其在合成生物学中的应用 | 淡水蓝藻PCC 7942及其工程改造菌株PEB1 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、蛋白表达调控 | NA | 光谱数据、蛋白复合物分析 | 工程菌株PEB1及其对照 | 异源基因表达 | 蓝藻 | PEB生物合成通路(PebA和PebB酶的可控表达) | 可再生能源, 生物工程 |
| 575 | 2025-10-05 |
Leveraging yeast sequestration to study and engineer posttranslational modification enzymes
2024-03, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28621
PMID:38079116
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综述 | 本文综述了利用酿酒酵母细胞区室化技术研究和工程化翻译后修饰酶的方法 | 首次详细讨论了酵母内质网区室化技术,并系统比较了不同酵母区室化系统的特点 | 不同系统在测量和控制酶催化效率方面存在各自的局限性 | 开发高通量功能筛选方法以研究和改造翻译后修饰酶 | 翻译后修饰酶(蛋白酶、蛋白连接酶、氧化还原酶、激酶等转移酶) | 合成生物学 | NA | 酵母表面展示、酶介导的转录激活、细胞器区室化 | NA | NA | NA | 酵母表面展示 | 酿酒酵母 | 酶介导的转录激活系统 | 化学生物学, 合成生物学, 生物医学 |
| 576 | 2025-10-05 |
Multicolor optogenetics for regulating flux ratio of three glycolytic pathways using EL222 and CcaSR in Escherichia coli
2024-03, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28628
PMID:38116710
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研究论文 | 利用蓝光响应EL222和绿/红光响应CcaSR在大肠杆菌中通过多色光调控三种糖酵解途径的代谢通量比例 | 首次实现通过多色光调控三种糖酵解途径(EMP、PP和ED)的代谢通量比例 | NA | 开发合成生物学工具以精确控制代谢通量分布 | 大肠杆菌中的糖酵解途径 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 代谢通量数据 | NA | EL222, CcaSR | 大肠杆菌 | 光控基因表达系统,包括在启动子区域插入识别序列来调控gnd和edd基因表达 | 工业生物技术 |
| 577 | 2025-10-05 |
Synthetic Immunotherapy: Programming Immune Cells with Novel and Sophisticated Logic Capabilities
2022-09, Transplantation and cellular therapy
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jtct.2022.06.001
PMID:35691572
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综述 | 本文回顾了CAR-T细胞的现有逻辑功能及其局限性,并探讨了合成生物学工具如何推动合成免疫疗法这一新领域的发展 | 提出“合成免疫疗法”新概念,通过合成生物学技术为免疫细胞编程复杂逻辑功能 | 当前获批的CAR-T细胞仅具备简单逻辑功能,存在对正常组织的毒性和细胞因子毒性等问题 | 探讨如何通过合成生物学改进CAR-T细胞疗法,实现更精准的癌症免疫治疗 | 嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)及其合成生物学改造 | 合成生物学 | 癌症 | 细胞免疫疗法、合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN | T细胞 | 模块化受体、可定制传感器、布尔逻辑门、多抗原识别系统 | 医学 |
| 578 | 2025-10-05 |
Codes across (life)sciences
2025-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2025.105515
PMID:40490067
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综述 | 本文探讨了“代码”概念在不同科学领域的含义、形式化及其在生命科学中的核心作用 | 跨学科视角整合数学、计算机科学到心理文化领域的代码研究,提出基于代码的统一生命理论框架 | 代码概念在不同学科中存在形式化程度差异,部分定义仍显模糊 | 构建跨学科代码研究的整体框架,探索生命系统中代码的通用理论 | 从细胞过程到文化实践的各类生物和社会系统中的代码现象 | 跨学科研究 | NA | NA | NA | 概念分析 | NA | NA | NA | NA | 跨学科科学、合成生物学、人工智能 |
| 579 | 2025-10-05 |
Transformative protein scaffold designs for dual-modality cancer applications: Advances in therapeutic delivery and molecular imaging of tumor microenvironments
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144881
PMID:40473172
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综述 | 本文系统评述了工程化蛋白质支架在癌症免疫治疗中的双重应用:治疗递送和肿瘤微环境分子成像 | 开发能够同时解决肿瘤穿透性不足和提供实时监测能力的多功能蛋白质支架平台 | 在将这些有前景的平台转化为临床应用方面仍面临持续挑战 | 开发用于癌症免疫治疗的多功能蛋白质支架平台 | 工程化蛋白质支架及其在肿瘤微环境中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | AI驱动生成模型、强化学习算法、无细胞蛋白质合成系统、正交翻译机制 | 生成模型、强化学习 | 结构生物学数据、计算模型数据 | NA | 理性工程设计 | 重组表达系统 | 多功能蛋白质支架设计 | 医学 |
| 580 | 2025-10-05 |
Molecular engineering and biotechnological advancements in β-glucosidase for industrial impact: A review
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145133
PMID:40499858
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综述 | 本文综述了β-葡萄糖苷酶的分子工程和生物技术进展及其工业应用 | 系统总结了多种酶工程策略(包括异源表达、CRISPR-Cas9、组学方法和纳米固定化)在提升β-葡萄糖苷酶性能方面的创新应用 | 未明确说明现有策略在工业放大过程中的具体实施障碍和成本效益分析 | 改善β-葡萄糖苷酶的催化效率、热稳定性和葡萄糖耐受性以促进生物转化过程的工业应用 | β-葡萄糖苷酶及其工程化改造 | 工业生物技术 | NA | CRISPR-Cas9, 组学方法(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学), 酶固定化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 黑曲霉 | 使用里氏木霉Pcdna1启动子进行异源表达 | 能源, 食品, 医药 |