合成生物学相关文章
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当前共找到 4691 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-02-02 |
PanForest: predicting genes in genomes using random forests
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag005
PMID:41512299
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研究论文 | 本文介绍了PanForest，一种使用随机森林分类器根据基因组中其他基因的存在情况来预测基因存在或缺失的软件工具 | 开发了首个基于随机森林的基因共现与互斥模式预测工具，能够大规模分析泛基因组并量化每个基因对预测其他基因的重要性 | 未明确说明模型在非细菌基因组或其他复杂真核生物中的泛化能力，且分析依赖于现有基因注释的准确性 | 研究基因共现与互斥模式，以揭示基因组组织的基本原理，并应用于进化重建和合成基因组设计 | 大肠杆菌（Escherichia coli）基因组中的12,741个附属基因 | 生物信息学 | NA | 随机森林分类器 | 随机森林 | 基因存在/缺失数据 | 1000个大肠杆菌基因组 | NA | NA | NA | 生物医学科学、合成生物学、分子生态学 |
| 562 | 2026-02-02 |
Protein engineering strategies to optimise recombinant product synthesis and accumulation in Nicotiana benthamiana
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70232
PMID:40577356
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综述 | 本文综述了在植物分子农业中，通过蛋白质工程和亚细胞工程策略优化本氏烟草中重组产品合成与积累的方法 | 讨论了蛋白质工程与亚细胞工程策略的创新结合，以定制本氏烟草用于重组蛋白质、肽和小分子的生产，包括信号序列融合、多功能结构域应用和异源酶共表达 | NA | 优化本氏烟草中重组产品的合成与积累，提高植物分子农业的生产效率 | 本氏烟草中的重组蛋白质、肽和小分子 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、亚细胞工程、异源酶共表达 | NA | NA | NA | NA | 本氏烟草 | 合成细胞器、正交翻译后修饰途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 563 | 2026-02-02 |
Complex engineering of Solanum alkaloids structural diversity in Nicotiana benthamiana
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70213
PMID:40684353
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研究论文 | 本研究通过瞬时表达在Nicotiana benthamiana中工程化Solanum家族甾体生物碱和皂苷的生物合成途径，成功生产了多种高价值代谢物 | 发现并利用SlGAME2-NEW木糖基转移酶，首次在异源植物宿主中完整重构了番茄和茄子的甾体生物碱及皂苷生物合成途径 | NA | 应用合成生物学在异源植物宿主中生产高价值的甾体代谢物 | 番茄和茄子的甾体生物碱及皂苷，包括α-番茄碱、脱氢番茄碱及其立体异构体 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、基因工程 | NA | NA | NA | 基因组合表达 | Nicotiana benthamiana | 甾体生物碱和皂苷的生物合成途径，涉及9至15个基因的组合表达 | 医药 |
| 564 | 2026-02-02 |
Engineering Conditional Transgene Expression in Nicotiana benthamiana
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70350
PMID:40937882
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综述 | 本文综述了在烟草中构建条件性转基因表达系统的合成生物学策略，以提升其作为生物工厂的潜力 | 整合了化学/电磁信号传感器、可编程转录因子合成启动子、病毒复制子扩增系统及重组酶处理器等前沿技术，提出植物细胞包和自持生物发光系统等快速原型平台 | 未提供具体实验数据验证所述技术的实际效率与稳定性 | 开发可控制转基因表达的系统以克服烟草生物工厂的规模化限制 | 本氏烟草（Nicotiana benthamiana） | 合成生物学 | NA | CRISPR系统、重组酶技术、病毒复制子技术 | NA | NA | NA | CRISPR, 重组酶系统 | 本氏烟草 | 条件性基因表达电路、信号传感器、合成启动子、转录信号放大系统、细胞记忆模块 | 农业, 工业生物技术 |
| 565 | 2026-02-02 |
A Comprehensive Multiomics Approach Illuminates the Biosynthetic Mechanism of Scoparone in Artemisia capillaris
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70398
PMID:41078345
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研究论文 | 本研究通过多组学方法阐明了茵陈蒿中主要活性成分滨蒿内酯的生物合成机制 | 首次生成了茵陈蒿的全长转录组和整合代谢组数据集，鉴定并表征了催化滨蒿内酯生物合成最后一步的新型O-甲基转移酶AcOMT1 | NA | 阐明茵陈蒿中滨蒿内酯的生物合成途径 | 茵陈蒿（Artemisia capillaris）及其活性成分滨蒿内酯 | 代谢组学 | 肝病 | 全长转录组学、整合代谢组学、加权基因共表达网络分析、系统发育分析、亚细胞定位分析、酶活性测定、分子对接、分子动力学模拟 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学、代谢工程 | 本氏烟草（Nicotiana benthamiana） | 滨蒿内酯生物合成途径 | 医药 |
| 566 | 2026-02-02 |
Intracellularly coupled oscillators for synthetic biology
2025-Dec-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67893-0
PMID:41423683
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研究论文 | 本文提出并建模了细胞内耦合振荡器作为合成生物学的高级构建模块，旨在指导未来细菌合成生物学实验 | 基于耦合强度对振荡器进行分类，并预测了包括混沌和同步在内的多种动态行为，为振荡器计算提供新方向 | NA | 工程化或重新设计生命系统以实现复杂功能 | 细胞内耦合振荡器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 基于振荡器的电路设计，包括独立、弱耦合、强耦合和深度耦合振荡器 | 工业生物技术 |
| 567 | 2026-02-02 |
Intratumoral microorganisms and artificial antitumor bacteria
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2023.06.002
PMID:41613448
|
综述 | 本文综述了肿瘤内微生物在癌症进展和治疗中的作用，并探讨了基于合成生物学技术编程的人工抗肿瘤细菌在精准癌症诊断和治疗中的应用前景 | 强调了通过合成生物学技术编程细菌以增强时空可控性，结合免疫疗法或其他强效抗肿瘤剂，可能开启下一代精准癌症诊断和治疗 | NA | 探讨肿瘤内微生物在癌症发展和治疗中的角色，以及基于活菌的新型治疗和诊断方法 | 肿瘤内微生物和人工编程的抗肿瘤细菌 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 568 | 2026-02-02 |
Gene circuit-based sensors
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.06.011
PMID:41613450
|
综述 | 本文综述了基于合成生物学基因回路构建的生物传感器的设计原理、工程化方法及其在多个领域的应用，并重点探讨了基于无细胞系统的生物传感器的研究进展 | 整合合成生物学基本概念，全面描述了基因回路的设计与工程化，并重点聚焦于基于无细胞系统的生物传感器的设计理念、构建原则及其在生物检测领域的新前沿 | NA | 综述基于合成生物学基因回路的生物传感器的设计、构建与应用，并讨论该领域的新前沿与待解决的挑战 | 基于合成生物学基因回路的生物传感器，特别是基于无细胞系统的生物传感器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物（泛指），无细胞系统 | 基因回路，包括具有不同响应机制、逻辑门和逻辑回路的传感器 | 生物制造过程监控, 环境监测, 食品安全, 医疗诊断与监测 |
| 569 | 2026-02-02 |
Nano-synthetic biology for disease diagnosis and treatment
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2025.07.002
PMID:41613477
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 570 | 2026-02-02 |
Nanoscale synthetic biology with innovative medicinal applications
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.11.006
PMID:41613444
|
综述 | 本文综述了纳米尺度合成生物学（NSB）在生物医学领域的应用，包括常见纳米载体、纳米生物组装系统及具体应用 | 整合合成生物学与纳米科学，通过纳米尺度操控实现更高效可控的生物工程，促进疾病治疗、生物成像、生物催化和生物传感的创新 | NA | 探讨NSB在生物医学中的应用，以推动科学技术进步并应对重大社会挑战 | 包括细胞、细菌和病毒在内的各种生物体 | 合成生物学 | NA | 基因调控系统（如CRISPR、mRNA、siRNA、质粒）、纳米酶、药物和特定纳米探针的递送 | NA | NA | NA | CRISPR, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细胞, 细菌, 病毒 | 生物传感器, 代谢途径 | 医学 |
| 571 | 2026-02-02 |
Intratumoral microbiota: synergistic reshaping of lung cancer microenvironment via inflammation and immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653727
PMID:41613126
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综述 | 本文综述了肺癌组织内微生物群的存在及其通过炎症和免疫途径重塑肿瘤微环境的机制，并探讨了其在临床预测和治疗中的应用前景 | 推翻了‘无菌肿瘤’的传统观念，系统阐述了肿瘤内微生物群主动调控肺癌进展的机制，并前瞻性地讨论了合成生物学工具（如工程菌和靶向纳米抗生素）在重塑免疫微环境中的应用潜力 | 肺癌组织微生物生物量低，测序数据易受试剂污染和批次效应影响；真菌、病毒等非细菌组分在肿瘤生态系统中的协同作用常被忽视 | 阐明肿瘤内微生物群影响肺癌细胞及肿瘤微环境的机制，探索其在肺癌进展中的作用及临床转化潜力 | 肺癌组织内的微生物群（包括细菌、真菌、病毒等）及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤微生物组学 | 肺癌 | 高通量测序、多组学技术 | NA | 测序数据、多组学数据 | NA | 合成生物学（涉及工程菌、靶向纳米抗生素设计） | NA | NA | 医学（癌症精准诊断与治疗） |
| 572 | 2026-01-30 |
Green biomineralization of magnetic metal ions: comparative mechanisms and emerging applications
2026-Jan-28, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d5tb02352a
PMID:41427805
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综述 | 本文系统比较了微生物介导的磁性金属离子生物矿化的三种主要机制，并综述了其在生物医学、环境修复和工业生产等领域的应用与挑战 | 首次系统性地比较和整合了生物控制矿化（BCM）、生物诱导矿化（BIM）和微生物影响矿化（MIM）三种机制，弥补了文献中长期以来对BCM过度关注而对BIM和MIM覆盖不足的失衡问题 | BIM机制的结构精确性较低，MIM机制仍处于早期发展阶段，且整个领域面临规模化、批次一致性和转化障碍等跨领域挑战 | 为微生物介导的磁性生物矿化的工业转化和跨学科发展提供一个全面的指导框架 | 磁性金属离子的微生物介导生物矿化机制 | NA | NA | 生物矿化 | NA | NA | NA | 合成生物学、基因工程 | 微生物 | NA | 生物医学, 环境, 工业生物技术 |
| 573 | 2026-01-30 |
Revolutionizing bio-hydrogen production: smart integration of nanotechnology, microbial engineering, and circular waste valorisation
2026-Jan-28, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-01001-4
PMID:41604032
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综述 | 本文全面综述了纳米技术、微生物工程和循环经济原则在生物制氢系统中的革命性整合 | 创新性地将纳米技术、先进微生物工程（包括CRISPR-Cas9合成生物学方法）与循环经济原则相结合，用于提升生物制氢效率和系统稳定性 | NA | 探索可持续能源替代方案，通过生物制氢实现碳中和能源生产并解决有机废物管理问题 | 生物制氢生产系统，包括可再生原料、微生物创新、纳米技术应用及纯化存储技术 | NA | NA | CRISPR-Cas9技术、纳米金属催化剂、酶固定化技术、等离子体纳米颗粒 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 能源、环境 |
| 574 | 2026-01-30 |
Isolation of Antigen-Specific Nanobodies From Synthetic Libraries Using a Protein Selection Strategy That Combines MACS-Based Screening of YSD and FLI-TRAP
2026-Jan-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5570
PMID:41607705
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研究论文 | 本文介绍了一种结合MACS酵母表面展示和FLI-TRAP细菌遗传选择系统的两阶段平台，用于高效筛选和优化抗原特异性纳米抗体 | 创新点在于整合了MACS酵母展示的高通量筛选与FLI-TRAP系统的胞内结合评估，通过Tat途径的共转运机制关联结合亲和力与抗生素抗性，提供了一种成本效益高且严格的胞内兼容性筛选方法 | NA | 研究目标是开发一种高效筛选和工程化高亲和力、特异性且功能表达的胞内蛋白质结合剂的方法 | 研究对象是抗原特异性纳米抗体，通过合成酵母展示库和细菌系统进行筛选 | 合成生物学 | NA | MACS酵母表面展示、FLI-TRAP细菌遗传选择系统、Tat途径共转运 | NA | NA | NA | 酵母表面展示、细菌遗传选择系统 | 酵母、细菌 | 利用Tat信号肽标记的蛋白质与β-内酰胺酶标记的抗原靶点共表达，设计基于共转运的筛选系统，仅高亲和力结合对能共转运至周质并赋予抗生素抗性 | 医学、合成生物学 |
| 575 | 2026-01-30 |
Development of a high-performance synthetic promoter for plant-based bioproduction
2026-Jan-19, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04925-z
PMID:41553553
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研究论文 | 本研究通过域改组策略开发了一种合成FM启动子，其在植物中的活性比传统CaMV35S启动子高4倍，并成功应用于抗病毒肽的生产 | 通过Figwort花叶病毒和Mirabilis花叶病毒启动子的关键调控区域进行域改组，创建了具有超强活性的紧凑型合成启动子，并验证了其与CRISPR-dCas9转录激活系统的兼容性 | 研究主要在三种植株模型中进行验证，尚未在更多作物品种或田间条件下测试 | 开发高性能植物合成启动子以提高重组蛋白产量 | 植物合成启动子及其在重组蛋白生产中的应用 | 合成生物学 | 基孔肯雅热 | 域改组、定量GUS检测、qRT-PCR、CRISPR-dCas9/VP64转录激活、体外抗病毒实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质产量数据、抗病毒活性数据 | 三种模型植物（烟草、本氏烟草、矮牵牛）的瞬时表达系统，以及转基因烟草和拟南芥的稳定株系 | CRISPR-dCas9/VP64 | Nicotiana tabacum, Nicotiana benthamiana, Petunia × atkinsiana, Arabidopsis thaliana | 合成启动子（含as-1、G-Box、ABRE顺式元件），用于驱动抗病毒肽scytovirin的表达 | 农业, 医药 |
| 576 | 2026-01-30 |
Research and Application of the Polyene Macrolide Antibiotic Nystatin
2026-Jan-19, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31020330
PMID:41599380
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综述 | 本文系统综述了多烯大环内酯类抗生素制霉菌素的化学特性、作用机制、临床应用、生物合成途径，并展望了通过基因编辑和合成生物学策略提升其安全性与疗效的未来发展方向 | 重点探讨了CRISPR/Cas9等基因编辑技术在靶向敲除有毒成分基因、优化生产菌株以提高制霉菌素产量和纯度方面的最新进展与潜力 | NA | 为制霉菌素的进一步研究和临床应用提供参考，并展望其通过结构优化、创新递送系统和合成生物学策略实现安全性与疗效提升的未来发展 | 多烯大环内酯类抗生素制霉菌素 | NA | 浅表真菌感染、口腔疾病、阴道炎、外耳炎 | CRISPR/Cas9基因编辑技术、I型聚酮合酶途径 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医药 |
| 577 | 2026-01-30 |
A Paradigm Shift in Microbial Protein Manufacturing
2026-Jan-14, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life16010129
PMID:41598284
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综述 | 本文系统分析了微生物作为结构材料在应对全球蛋白质危机中的三种关键策略：菌丝固态发酵、细菌纤维素支架和合成生物学设计功能蛋白 | 提出从结构模拟转向功能创造、建立去中心化生产网络以及发展动态4D打印食品的未来突破方向 | 规模化生产和风味优化方面仍存在挑战 | 探讨微生物作为多功能结构材料以解决全球蛋白质危机和替代蛋白质质地限制 | 微生物策略，包括菌丝固态发酵、细菌纤维素支架和合成生物学设计的功能蛋白 | NA | NA | 菌丝固态发酵、细菌纤维素支架技术、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物（如菌丝、细菌） | 定制功能蛋白的设计 | 食品、农业 |
| 578 | 2026-01-30 |
The Role of Genomics in Advancing and Standardising Bacteriophage Therapy
2026-Jan-04, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics15010055
PMID:41594091
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综述 | 本文综述了基因组学在推动噬菌体疗法标准化和个性化发展中的关键作用 | 系统阐述了全基因组测序技术如何将噬菌体疗法从经验性实践转变为基于科学证据的标准化治疗模式，并展望了合成生物学与人工智能整合的未来方向 | NA | 探讨基因组学在解决噬菌体疗法安全性、标准化和疗效预测等挑战中的作用 | 噬菌体疗法及其基因组学应用 | NA | 细菌感染 | 全基因组测序 | NA | 基因组数据 | NA | 合成生物学 | 噬菌体 | NA | 医学 |
| 579 | 2026-01-30 |
Role of proteins in phytoremediation and mycoremediation for heavy metal removal: a focus on protein-based remediation
2026, International journal of phytoremediation
IF:3.4Q2
DOI:10.1080/15226514.2025.2572308
PMID:41090394
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综述 | 本文综述了蛋白质和肽在植物修复和真菌修复重金属污染中的核心作用及其机制 | 强调蛋白质和肽在生物吸附、生物积累和生物转化中的机制性贡献，并整合合成生物学、纳米生物技术和组学驱动的蛋白质发现，提出基于设计的下一代修复框架 | 面临可扩展性、环境变异性和监管接受度方面的挑战 | 探讨植物修复和真菌修复中蛋白质和肽在重金属去除中的作用，并推动下一代修复技术的发展 | 重金属（如镉、铅、砷、铬、汞）污染的土壤、水体和生物体 | 环境生物技术 | NA | 蛋白质工程、合成生物学、纳米生物技术、组学技术 | NA | NA | NA | NA | 植物、真菌 | NA | 环境 |
| 580 | 2026-01-30 |
DNABERT2-CAMP: A Hybrid Transformer-CNN Model for E. coli Promoter Recognition
2025-Dec-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010027
PMID:41595447
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研究论文 | 提出了一种名为DNABERT2-CAMP的混合深度学习模型，用于准确识别大肠杆菌的启动子序列 | 首次将预训练的DNABERT-2 Transformer与定制的CAMP模块（CNN-注意力-平均池化）相结合，以同时建模长距离基因组依赖性和细粒度局部基序 | NA | 开发一个强大的、可推广的基因组注释和合成生物学应用工具 | 大肠杆菌的启动子序列 | 自然语言处理 | NA | 深度学习 | Transformer, CNN | DNA序列 | 8720个经过实验验证的81-bp序列（正负样本） | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |