合成生物学相关文章
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当前共找到 3783 篇文献，本页显示第 901 - 920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2025-10-05 |
Efficient Simulation of Viral Transduction and Propagation for Biomanufacturing
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00227
PMID:39315883
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研究论文 | 开发了用于优化病毒转导和扩增生物制造平台的vitraPro软件工具包 | 提出了包含多尺度模型和高效数值技术的软件工具包，可同时模拟两种病毒的感染传播过程 | 模型验证仅限于杆状病毒表达载体系统和甲型流感悬浮培养案例 | 优化基于病毒转导的生物制造平台和病毒扩增过程 | 病毒转导和传播过程 | 合成生物学 | NA | 多尺度建模、数值模拟 | 多尺度模型 | NA | NA | NA | 悬浮培养细胞 | 病毒转导系统、病毒扩增过程 | 工业生物技术 |
| 902 | 2025-10-05 |
An Automated Cell-Free Workflow for Transcription Factor Engineering
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00471
PMID:39373325
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研究论文 | 开发了一种自动化无细胞工作流程用于转录因子工程 | 创建了基于Echo声波液体处理器的通用化无细胞基因表达工作流程，可在48小时内完成数千种转录因子变体的高通量筛选 | NA | 优化自动化无细胞基因表达工作流程以加速合成生物学设计周期 | MerR和CadR转录因子变体 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达(CFE) | NA | 生物传感器响应数据 | 127个MerR变体和134个CadR变体，共3682个无细胞反应 | Echo Acoustic Liquid Handler | 无细胞系统 | 转录因子生物传感器，用于汞和镉检测 | 环境监测 |
| 903 | 2025-10-05 |
Characterizing and Engineering Rhamnose-Inducible Regulatory Systems for Dynamic Control of Metabolic Pathways in Streptomyces
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00626
PMID:39377938
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研究论文 | 本研究表征并构建了鼠李糖诱导型调控系统，用于在链霉菌中实现代谢途径的动态控制 | 通过生物信息学分析发现鼠李糖代谢途径，构建了无泄漏表达的鼠李糖诱导型调控系统RhaREG1和RhaREG2 | NA | 开发有效的基因诱导系统用于合成生物技术应用 | 链霉菌属及其天然产物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析，电泳迁移率变动分析(EMSA)，多序列比对 | NA | 基因组序列，蛋白质序列，启动子活性数据 | NA | 合成生物学策略 | 链霉菌 | 鼠李糖诱导型调控系统，通过将阻遏蛋白/操作子对RhaR/RhaO与组成型启动子组装构建 | 工业生物技术 |
| 904 | 2025-10-05 |
A Synthetic Biology Approach to Transgene Expression in Insects
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00250
PMID:39198266
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研究论文 | 开发了一种系统方法来表征转基因翻译起始序列和3'非翻译区的修饰，创建了用于蚊子和昆虫基因表达调控的工具箱 | 通过系统表征TIS和3'UTR修饰，实现了跨细胞系和5'调控序列的高度可预测基因表达变化 | 主要针对蚊子和非模式昆虫物种，在其他昆虫中的应用潜力尚未完全验证 | 开发合成生物学方法调控昆虫中转基因表达水平 | 蚊子和非模式昆虫物种 | 合成生物学 | NA | 转基因技术，基因表达调控 | NA | 基因表达数据 | 多种细胞系 | 转基因方法 | 蚊子，昆虫 | 基因表达调控工具箱，包含翻译起始序列和3'非翻译区修饰 | 农业，环境 |
| 905 | 2025-10-05 |
Computational Synthetic Biology Enabled through JAX: A Showcase
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00307
PMID:39230510
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研究论文 | 本文展示了JAX计算框架在计算合成生物学中的应用价值 | 首次系统展示JAX在计算合成生物学中的多功能应用，包括灵活的GPU扩展、快速运行时间和自动微分等数学增强功能 | JAX在计算生物学领域仍处于探索不足的状态，应用案例有限 | 促进数学建模在合成生物学中的更广泛应用，展示现代计算框架的潜力 | 合成生物学和定向进化中的计算建模问题 | 计算生物学 | NA | 数学建模，GPU加速计算，自动微分 | 机制模型，随机模型，数据驱动模型，AI模型 | 模拟数据 | NA | NA | NA | 基因网络优化，细胞内动力学模拟 | 工业生物技术 |
| 906 | 2025-10-05 |
SeqImprove: Machine-Learning-Assisted Curation of Genetic Circuit Sequence Information
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00392
PMID:39230953
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研究论文 | 开发了一种名为SeqImprove的机器学习辅助工具，用于改进遗传电路序列信息的整理过程 | 结合命名实体识别、实体规范化和序列匹配技术，创建了作者可审查编辑的机器可访问序列数据和元数据注释系统 | NA | 解决合成生物学中文献研究和复制记录不完整工作时面临的困难 | 遗传电路序列信息 | 机器学习 | NA | 命名实体识别, 实体规范化, 序列匹配 | NA | 序列数据, 元数据 | NA | NA | NA | 遗传电路 | 工业生物技术 |
| 907 | 2025-10-05 |
Orthogonal Serine Integrases Enable Scalable Gene Storage Cascades in Bacterial Genome
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00505
PMID:39238421
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研究论文 | 开发基于正交丝氨酸整合酶的迭代基因组整合方法，实现细菌染色体中多基因的稳定存储 | 首次利用正交丝氨酸整合酶系统实现可扩展的基因存储级联，支持长达13 kb DNA片段的标记自由高效整合 | 未明确说明整合效率的具体量化数据和系统在不同宿主中的普适性验证 | 开发可扩展的基因组整合工具用于合成生物学应用 | 大肠杆菌MG1655菌株 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶介导的基因组整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 工程化整合载体 | 大肠杆菌 | 基因存储级联系统，多基因表达通路 | 工业生物技术, 医学 |
| 908 | 2025-10-05 |
Technologies for the discovery of G protein-coupled receptor-targeting biologics
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103138
PMID:38728825
|
综述 | 本文综述了靶向G蛋白偶联受体的生物制剂发现技术及其发展前景 | 系统总结了最先进的GPCR靶向生物制剂工程技术，并前瞻性地指出DNA合成和合成生物学技术将推动该领域发展 | NA | 回顾GPCR靶向生物制剂发现的技术现状并展望未来发展方向 | G蛋白偶联受体及其靶向生物制剂 | 生物医药技术 | 代谢性疾病、神经系统疾病、心血管疾病 | DNA合成、展示技术、功能筛选 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 909 | 2025-10-05 |
Engineering Whole-Cell Biosensors for Enhanced Detection of Environmental Antibiotics Using a Synthetic Biology Approach
2024-Jun, Indian journal of microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s12088-024-01259-w
PMID:39010990
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法改造双组分系统开发生物传感器用于环境抗生素检测 | 探索基于EMeRALD的生物传感器，通过合成生物学方法重新利用微生物双组分系统的传感模块 | NA | 开发用于环境抗生素检测的合成生物学工具 | 细菌双组分系统和EMeRALD生物传感器 | 合成生物学 | 抗生素耐药性 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | EMeRALD | 细菌 | 双组分调控系统合成调控回路 | 环境监测 |
| 910 | 2025-10-05 |
Synthetic biology-based bacterial extracellular vesicles displaying BMP-2 and CXCR4 to ameliorate osteoporosis
2024-Apr, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12429
PMID:38576241
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研究论文 | 本研究通过合成生物学技术构建了展示BMP-2和CXCR4的细菌胞外囊泡，用于改善骨质疏松症 | 首次将骨形态发生蛋白BMP-2和趋化因子受体CXCR4与细菌胞外囊泡表面蛋白ClyA融合表达，实现一步法构建兼具骨靶向和骨形成功能的治疗系统 | 研究仅在小鼠模型中进行验证，尚未进行临床前安全性和有效性评估 | 开发基于合成生物学的骨质疏松症治疗新策略 | 骨质疏松症小鼠模型和骨髓间充质干细胞BMSCs | 合成生物学 | 骨质疏松症 | 细菌胞外囊泡工程、蛋白融合表达 | NA | 体内外实验数据 | 卵巢切除小鼠模型 | PET28a载体系统 | 大肠杆菌Nissle 1917 | ClyA-BMP-2-CXCR4融合蛋白表达系统，用于细菌胞外囊泡表面展示 | 医药 |
| 911 | 2025-10-05 |
Development of a chemically induced dissociation system via phage surface-displayed nanobody screening
2025-May-31, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70084
PMID:40448527
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研究论文 | 开发了一种通过噬菌体表面展示纳米抗体筛选的化学诱导解离系统 | 首次利用噬菌体展示技术筛选出可被FDA批准小分子药物破坏的纳米抗体，建立化学诱导蛋白相互作用的解离系统 | NA | 开发能够可诱导调控蛋白质功能的后翻译化学方法 | 丙型肝炎病毒蛋白酶NS3a与纳米抗体的相互作用 | 合成生物学 | 丙型肝炎 | 噬菌体展示技术 | NA | NA | NA | 噬菌体展示 | 人类细胞 | 化学诱导解离系统 | 医学 |
| 912 | 2025-10-05 |
Recent Advances in Multiple Strategies for the Biosynthesis of Sesquiterpenols
2025-May-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050664
PMID:40427558
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综述 | 本文综述了倍半萜醇生物合成的最新合成生物学策略与进展 | 系统总结了微生物合成倍半萜醇的多种创新策略，包括酶筛选、通路调控和区室化表达 | 未提及具体实验数据验证策略效果，主要基于文献综述 | 推动倍半萜醇生物合成研究发展 | 倍半萜醇化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物系统 | 倍半萜醇合成通路 | 医药,食品,化妆品 |
| 913 | 2025-10-05 |
The Application of Multiple Strategies to Enhance Methylparaben Synthesis Using the Engineered Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-25, Biology
DOI:10.3390/biology14050469
PMID:40427658
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研究论文 | 本研究通过多种代谢工程策略改造酿酒酵母以增强对羟基苯甲酸甲酯的生物合成 | 通过调控内源莽草酸途径限速步骤、增强中心碳通量及改进外源酶表达等多种策略组合，实现了酿酒酵母合成对羟基苯甲酸甲酯的最高产量 | 摇瓶产量为68.59 mg/L，尚未进行大规模发酵验证 | 开发环境友好的对羟基苯甲酸甲酯生物合成方法 | 工程化酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、启动子工程 | NA | NA | NA | 启动子工程 | 酿酒酵母 | 对羟基苯甲酸甲酯生物合成途径，包括莽草酸途径调控、竞争途径敲除和前体合成促进 | 工业生物技术,材料 |
| 914 | 2025-10-05 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
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研究论文 | 本研究开发了位点选择性交联探针来解析非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域的相互作用机制 | 首次利用四嗪点击化学捕获载体蛋白在缩合结构域活性位点的相互作用，并通过冷冻电镜获得高分辨率结构 | NA | 阐明非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域相互作用的分子机制 | 酪酪肽生物合成途径中的载体蛋白和缩合结构域 | 结构生物学 | NA | 位点选择性交联、四嗪点击化学、冷冻电镜、X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 915 | 2025-10-05 |
Cleavable donor-assisted CRISPR/Cas9 system significantly improves the efficiency of large DNA insertion in Physcomitrium patens
2025-Feb, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70020
PMID:39981890
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研究论文 | 开发了一种可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统，显著提高了小立碗藓中大片段DNA插入的效率 | 设计了包含两个Cas9核酸酶识别位点的IVC供体，可在体内释放线性模板用于同源定向修复 | 主要在小立碗藓中验证，对其他作物的适用性需要进一步验证 | 提高CRISPR/Cas9介导的大片段DNA插入效率 | 小立碗藓(P. patens)原生质体 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | NA | 评估了两种不同的sgRNA和四种不同的DNA插入片段 | CRISPR-Cas9 | 小立碗藓(Physcomitrium patens) | 同源定向修复(HDR)系统 | 农业,工业生物技术 |
| 916 | 2025-10-05 |
Kinetic modules are sources of concentration robustness in biochemical networks
2025-May-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ads7269
PMID:40435256
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研究论文 | 本文揭示了动力学模块作为生化网络中浓度鲁棒性来源的机制 | 无需参数值即可基于稳态反应速率耦合识别大规模生化网络中的动力学模块，并发现有序结合酶机制比随机结合具有更高的浓度鲁棒性 | 研究基于34个代谢网络模型，可能未覆盖所有生物系统类型 | 探索生化网络中动力学模块与浓度鲁棒性的关系 | 26个生物的34个代谢网络模型 | 系统生物学 | NA | 质量作用动力学分析 | 代谢网络模型 | 生化网络数据 | 34个代谢网络模型（来自26个生物） | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 917 | 2025-10-05 |
Structural Homology Fails to Predict Secretion Efficiency in Pichia pastoris: Divergent Responses of Architecturally Similar scFvs to Multi-Parametric Genetic Engineering
2025-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26104922
PMID:40430062
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研究论文 | 本研究通过多参数遗传工程优化毕赤酵母中scFv抗体的分泌效率，发现结构同源蛋白对优化策略存在不同响应 | 挑战了结构同源性可预测优化效果的假设，揭示了蛋白特异性阈值对遗传工程策略的影响 | 仅研究两种scFv变体，样本量有限 | 优化毕赤酵母系统中单链抗体片段的分泌效率 | 两种结构同源的scFv变体（PR961和PR953） | 合成生物学 | NA | 基因剂量优化、表达盒设计、内质网分泌通路重编程 | NA | 蛋白分泌效率数据 | 两种scFv变体 | 基因敲除、过表达 | 毕赤酵母 | 分泌通路重编程（涉及21个基因的三个功能模块） | 工业生物技术 |
| 918 | 2025-10-05 |
Multi-Omics and Functional Insights into Triterpenoid Biosynthesis Pathways in Neopicrorhiza scrophulariiflora (Pennell) D.Y.Hong
2025-May-21, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14101562
PMID:40431127
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研究论文 | 通过转录组学和代谢组学分析揭示胡黄连中三萜类化合物生物合成途径的关键基因与分子机制 | 首次鉴定出NsOSC2双功能酶能催化2,3-氧化角鲨烯转化为α-香树脂醇和β-香树脂醇，并建立了高效的再生系统和稳定遗传转化体系 | NA | 阐明胡黄连三萜类化合物生物合成的分子机制 | 胡黄连(Neopicrorhiza scrophulariiflora)的不同组织部位 | 合成生物学 | NA | 转录组学, 代谢组学, 遗传转化 | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 胡黄连 | 三萜类化合物生物合成途径 | 医药 |
| 919 | 2025-10-05 |
The Transformation Experiment of Frederick Griffith II: Inclusion of Cellular Heredity for the Creation of Novel Microorganisms
2025-May-15, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12050532
PMID:40428151
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研究论文 | 提出基于格里菲斯转化实验的合成生物学新方法，用于创建具有显著表型差异的杂交微生物 | 提出格里菲斯转化实验2.0设计，能够同时交换DNA和非DNA结构与调控信息 | 目前仅限于密切相关的细菌物种，供体与受体细胞间代谢通量和周转的调控匹配仍具挑战 | 开发能够整合多种遗传信息的合成生物学方法以创建新型微生物 | 细菌细胞及其遗传物质交换机制 | 合成生物学 | NA | 细菌转化实验、水平基因转移、体细胞核移植 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | DNA、大分子、拓扑、控制论和细胞遗传信息的整合系统 | 工业生物技术 |
| 920 | 2025-10-05 |
Biosimilars Targeting Pathogens: A Comprehensive Review of Their Role in Bacterial, Fungal, Parasitic, and Viral Infections
2025-Apr-28, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics17050581
PMID:40430873
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综述 | 本文全面综述了生物类似物在细菌、真菌、寄生虫和病毒感染治疗中的作用及其发展前景 | 系统探讨了抗体工程、合成生物学和无细胞蛋白合成等创新技术在提升生物类似物效力和生产效率方面的潜力 | NA | 分析生物类似物在传染病治疗领域的应用价值和发展挑战 | 针对病原体的生物类似物（包括治疗性蛋白、单克隆抗体、抗菌肽等） | NA | 传染病 | 抗体工程、合成生物学、无细胞蛋白合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |