合成生物学相关文章
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当前共找到 3783 篇文献，本页显示第 961 - 980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2025-10-05 |
Bioinformatic Prediction and High Throughput In Vivo Screening to Identify Cis-Regulatory Elements for the Development of Algal Synthetic Promoters
2024-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00199
PMID:38986010
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研究论文 | 本研究通过生物信息学预测和高通量体内筛选方法，开发了适用于藻类的合成启动子 | 结合POWRS、STREME和PhyloGibbs算法预测顺式调控元件，并通过高通量筛选验证合成启动子活性 | 需要目标藻类物种具有测序的基因组和转录组数据集 | 开发适用于藻类生物技术的合成生物学工具 | 六种不同藻类物种的启动子区域和顺式调控元件 | 合成生物学 | NA | 下一代测序、荧光激活细胞分选、生物信息学分析 | NA | 基因组序列、转录组数据 | 4533个合成启动子，数百个转基因株系 | 合成生物学方法 | 藻类 | 合成启动子设计，包含1-3个顺式调控元件拷贝 | 工业生物技术,能源 |
| 962 | 2025-10-05 |
Directed Evolution of Acoustic Reporter Genes Using High-Throughput Acoustic Screening
2024-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00283
PMID:38981096
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研究论文 | 本研究通过定向进化方法开发具有增强非线性超声散射信号的声学报告基因 | 建立了高通量半自动化声学筛选平台，首次将定向进化应用于声学报告基因的优化 | 研究主要针对细菌培养体系，在哺乳动物系统中的适用性需要进一步验证 | 开发性能更优的声学报告基因用于生物成像 | 气体囊泡(GVs)蛋白纳米结构及其编码基因 | 合成生物学 | NA | 定向进化、高通量声学筛选、非线性超声散射 | NA | 声学信号数据、蛋白质序列数据 | GvpA/B同源蛋白的扫描位点饱和突变库 | 定向进化 | 细菌 | 声学报告基因系统，基于气体囊泡的超声对比剂 | 医学成像、合成生物学 |
| 963 | 2025-10-05 |
Variant Library Annotation Tool (VaLiAnT): an oligonucleotide library design and annotation tool for saturation genome editing and other deep mutational scanning experiments
2022-01-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab776
PMID:34791067
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研究论文 | 开发了一个用于设计饱和基因组编辑实验的寡核苷酸文库工具VaLiAnT | 提供了一种新颖的基因组序列检索、突变和注释方法，支持cDNA和prime编辑文库生成 | NA | 开发用于饱和基因组编辑和深度突变扫描实验的寡核苷酸文库设计工具 | 基因组序列和遗传变异 | 生物信息学 | NA | CRISPR/Cas9, 饱和基因组编辑, 深度突变扫描 | NA | 基因组序列, 转录本注释 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 合成生物学, 进化遗传学, 宿主-病原体相互作用 |
| 964 | 2025-10-05 |
Bioluminescence-Driven Optogenetics
2020-Nov-28, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life10120318
PMID:33260589
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综述 | 本文综述了生物发光作为生物光源在触发生理事件和控制细胞行为方面的新兴应用方法 | 探索了生物发光超越传统报告技术的潜力，将其作为控制细胞行为的生物光源 | NA | 探讨生物发光在合成生物学中的潜在应用 | 细胞和生物体水平的生理过程 | 合成生物学 | NA | 生物发光技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 生物发光驱动的光遗传学系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 965 | 2025-10-05 |
Judging synthetic biology risks
2015-Jan-09, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaa5253
PMID:25573995
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 966 | 2025-10-05 |
Synthetic biology of multicellular systems: new platforms and applications for animal cells and organisms
2014-Dec-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb500358y
PMID:25524091
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 967 | 2025-10-05 |
Biofabrication of microstructured bacterial ecosystems using chaotic bioprinting: advancingin vitroresearch for microbial engineering
2025-May-29, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/add568
PMID:40334674
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研究论文 | 本文开发了一种混沌3D生物打印技术，用于制造具有微观结构的细菌生态系统，模拟自然微生物群落的空间组织 | 首次将混沌3D打印技术应用于细菌共培养系统的构建，实现了微米级精度的空间控制 | 研究仅使用了简化的肠道微生物模型，尚未在更复杂的自然微生物群落中验证 | 开发能够模拟自然微生物生态系统空间结构的体外研究平台 | 细菌共培养系统，特别是人类肠道微生物模型 | 合成生物学 | NA | 混沌3D生物打印，荧光显微镜，菌落计数，定量PCR | NA | 图像数据，微生物生长数据 | NA | 3D生物打印，Kenics静态混合器打印喷嘴 | 多种细菌菌株（包括严格厌氧菌） | 多层微观结构共培养系统，模拟自然微生物生态系统的部分隔离 | 医学，环境，合成生物学 |
| 968 | 2025-10-05 |
dTAT1: An Unnatural Nucleoside Exhibiting Low Photocytotoxicity for Genetic Code Expansion
2025-May-29, The journal of physical chemistry letters
IF:4.8Q1
DOI:10.1021/acs.jpclett.5c00763
PMID:40401918
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研究论文 | 本研究评估了非天然核苷dTAT1在紫外光下的光物理特性和细胞毒性，发现其具有较低的光细胞毒性 | 首次系统研究dTAT1在紫外光激发下的三重态特性和活性氧产生机制，揭示其相比dTPT3具有更短的三重态寿命和更低的光细胞毒性 | 研究主要聚焦于光细胞毒性评估，对dTAT1在其他生理条件下的长期安全性研究不足 | 评估dTAT1非天然核苷的光细胞毒性特性，为安全遗传密码扩展提供依据 | dTAT1非天然核苷及其与dNaM形成的非天然碱基对 | 合成生物学 | NA | 紫外光激发、活性氧检测、光物理特性分析 | NA | 光谱数据、细胞毒性数据、量子产率数据 | NA | 遗传密码扩展技术 | 细胞培养系统 | 非天然碱基对dTAT1-dNaM，用于遗传信息存储和检索扩展 | 医学, 生物技术 |
| 969 | 2025-07-07 |
Diverse lineages and adaptations of oxygen-adapted hydrogenases
2025-May-27, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2025.04.006
PMID:40436686
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research paper | 本文探讨了微生物中适应氧气的镍铁氢化酶的多样性和适应性 | 揭示了镍铁氢化酶在含氧环境中通过多种独立进化策略抵御氧气抑制的机制 | 未提及具体实验数据或样本量来支持这些适应性机制的普遍性 | 研究微生物氢化酶在含氧环境中的适应机制和进化历程 | 细菌和古菌中的镍铁氢化酶 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 970 | 2025-10-05 |
Multi-Layer Autocatalytic Feedback Enables Integral Control Amidst Resource Competition and Across Scales
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00575
PMID:40116396
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研究论文 | 提出一种多层自催化反馈策略，解决资源竞争和上下文依赖耦合对积分反馈控制的限制 | 开发多层自催化控制器实现群体水平积分反馈和多细胞积分器，控制功能通过多细胞群体间的协调相互作用涌现 | NA | 设计能够在资源竞争环境下实现鲁棒适应的合成生物控制系统 | 自催化积分反馈控制器、多细胞群体、工程微生物生态系统 | 合成生物学 | NA | 多层反馈策略、数学建模 | 积分反馈控制器 | NA | NA | NA | 微生物 | 自催化积分反馈控制器、多层反馈、群体水平控制电路 | 工业生物技术 |
| 971 | 2025-10-05 |
Development of a Transposon-Based Genome Engineering Toolkit for Efficient and Adaptable Genetic Modifications in Wolfiporia cocos
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00766
PMID:40173021
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研究论文 | 开发了一种基于转座子的基因组工程工具包，用于在茯苓中实现高效且适应性强的遗传修饰 | 创建了专门针对茯苓优化的转座子工程工具包，通过鸡尾酒式组装多基因转座子实现高效多重基因整合，无需复杂遗传电路组装 | NA | 开发适用于真菌系统的高效基因组工程工具 | 茯苓(Wolfiporia cocos)真菌 | 合成生物学 | NA | 转座子工程、转录组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | 转座子 | 茯苓(Wolfiporia cocos) | 多重基因整合系统 | 工业生物技术 |
| 972 | 2025-10-05 |
Fundamental Trade-Offs in the Robustness of Biological Systems with Feedback Regulation
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00704
PMID:40198741
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研究论文 | 本研究通过分析五种生物反馈电路，探讨生物系统中反馈调节的鲁棒性及其基本性能权衡 | 首次系统量化生物反馈回路的灵敏度，并提出多目标优化框架研究其性能权衡 | 仅分析了五种典型反馈电路，未覆盖所有可能的生物反馈机制 | 建立研究生物反馈调节的理论框架，提高对生物系统鲁棒性的理解 | 五种生物反馈电路：正自调节、负自调节、双正反馈、正负反馈和双负反馈（切换开关） | 系统生物学 | NA | 多目标优化 | NA | 理论分析 | NA | NA | NA | 正自调节、负自调节、双正反馈、正负反馈、双负反馈（切换开关） | 合成生物学, 系统生物学 |
| 973 | 2025-10-05 |
Concentration-Dependent CsrA Regulation of the uxuB Transcript Leads to Development of a Post-Transcriptional Bandpass Filter
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00668
PMID:40202123
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研究论文 | 本研究利用CsrA蛋白与uxuB mRNA的浓度依赖性相互作用开发了一种合成生物学中的转录后带通滤波器 | 首次利用CsrA蛋白对uxuB mRNA的异质性调控特性（浓度依赖性激活和抑制）设计生物带通滤波器，采用5' UTR + 100 nt CDS序列作为支架实现分级结合策略 | NA | 开发基于RNA-蛋白质相互作用的合成生物学电路 | uxuB mRNA转录本（5' UTR + 100 nt CDS）与CsrA蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | 转录后调控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 转录后带通滤波器，基于mRNA 5' UTR支架的分级结合策略，可根据CsrA浓度在ON/OFF状态间切换 | 合成生物学 |
| 974 | 2025-10-05 |
Establishing a High-Yield Bacillus subtilis-Based Cell-Free Protein Synthesis System for In Vitro Prototyping and Natural Product Biosynthesis
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00021
PMID:40203238
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研究论文 | 本研究开发了一种基于枯草芽孢杆菌的高产无细胞蛋白质合成系统 | 通过基因组整合T7 RNA聚合酶基因的工程菌株开发高产CFPS系统，无需额外添加T7 RNA聚合酶 | NA | 建立高产无细胞蛋白质合成系统用于体外原型设计和天然产物生物合成 | 枯草芽孢杆菌无细胞系统、核糖体结合位点元件、天然产物生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成、基因组工程 | NA | 蛋白质产量数据、酶活性数据 | NA | 基因组整合 | 枯草芽孢杆菌 | T7启动子系统、核糖体结合位点原型设计、天然产物生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 975 | 2025-10-05 |
Designing and encoding models for synthetic biology
2009-Aug-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2009.0035.focus
PMID:19364720
|
综述 | 本文综述了合成生物学中定量模型的设计、编码与应用过程 | 系统性地介绍了合成生物学模型构建的全流程，包括组件挖掘、关系模型集成、公式化与参数化等关键步骤 | 未涉及具体实验验证案例，主要聚焦于方法论层面的概述 | 为合成生物学研究提供定量建模的方法论指导 | 基因调控网络和反应网络的动力学模型 | 合成生物学 | NA | 动力学建模，标记语言编码 | 定量模型，关系模型 | 模型参数，网络结构数据 | NA | NA | NA | 基因调控网络，反应网络 | 工业生物技术 |
| 976 | 2025-10-05 |
An internal reaction chamber in dimethylglycine oxidase provides efficient protection from exposure to toxic formaldehyde
2009-Jun-26, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.M109.006262
PMID:19369258
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法揭示了二甲甘氨酸氧化酶中不寻常的底物通道机制，该机制能有效保护细胞免受有毒甲醛的暴露 | 发现二甲甘氨酸氧化酶通过内部反应室实现底物通道，这是首次在该类双功能黄素蛋白中证实这种保护机制 | NA | 研究二甲甘氨酸氧化酶的底物通道机制及其在细胞保护中的作用 | 二甲甘氨酸氧化酶及其催化反应 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、体内报告系统、定点诱变 | NA | 生物化学数据 | NA | 合成生物学方法 | 细胞系统 | 底物通道机制、反应室设计 | 医学, 工业生物技术 |
| 977 | 2025-10-05 |
PCR amplification of DNA containing non-standard base pairs by variants of reverse transcriptase from Human Immunodeficiency Virus-1
2004, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkh241
PMID:14757837
|
研究论文 | 本研究通过改造HIV逆转录酶变体，首次实现了含非标准碱基对的DNA通过完整PCR进行扩增 | 首次利用改造的HIV逆转录酶变体成功扩增含非标准氢键模式碱基对的DNA，实现了完整PCR扩增 | 未明确说明非标准碱基对扩增的具体效率和数据准确性 | 开发能够处理人工遗传信息系统的合成生物学工具 | HIV逆转录酶变体及其对非标准碱基对的识别能力 | 合成生物学 | HIV感染 | PCR，定点突变 | NA | 分子生物学实验数据 | NA | 定点突变 | NA | NA | 医学，生物技术 |
| 978 | 2025-10-05 |
Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets
2025-May-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00149h
PMID:40302460
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研究论文 | 开发了一种利用激光诱导微射流穿透含脂油相来生成细胞尺寸脂质体的新方法 | 首次采用高速激光诱导微射流技术实现细胞尺寸脂质体的可靠重复生成 | NA | 开发按需生产细胞尺寸脂质体的新技术 | 细胞尺寸脂质体的生成过程 | 合成生物学 | NA | 激光诱导微射流技术、高速摄像、数值分析 | NA | 视频数据、数值模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、生物化学研究 |
| 979 | 2025-10-05 |
Metabolite-Responsive Control of Transcription by Phase Separation-Based Synthetic Organelles
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00633
PMID:39954260
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研究论文 | 开发了一种基于液液相分离的合成细胞器，能够将代谢信号转化为基因转录调控 | 首次将液液相分离原理应用于构建代谢物响应型合成细胞器，实现了代谢信号与转录调控的可逆连接 | NA | 构建具有生命感知和适应能力的合成生物材料 | 基于液液相分离的合成细胞器 | 合成生物学 | NA | 液液相分离技术 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | NA | 代谢物响应型转录调控回路，基于丙酮酸依赖性阻遏蛋白PdhR的相分离行为 | 传感器材料, 工业生物技术 |
| 980 | 2025-10-05 |
Engineering a New Generation of Gene Editors: Integrating Synthetic Biology and AI Innovations
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00686
PMID:39999982
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综述 | 本文探讨如何整合合成生物学与人工智能技术开发新一代基因编辑器 | 将人工智能和机器学习技术应用于基因编辑酶的发现与设计，通过计算策略优化传统蛋白质工程方法 | 未提及具体实验验证数据和应用案例 | 开发更安全高效的基因组编辑工具并推动其临床转化 | 基因编辑酶（如CRISPR-Cas系统） | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas技术、理性设计、诱变筛选、定向进化 | AI/ML模型 | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学 |