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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2025-10-05 |
Recent progress on glucose dehydrogenase: multifaceted applications in industrial biocatalysis, cofactor regeneration, glucose sensors, and biofuel cells
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143842
PMID:40319965
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综述 | 本文总结了葡萄糖脱氢酶在分子工程、固定化策略及生物传感器、生物催化和生物燃料电池等领域的最新研究进展 | 重点关注通过分子工程和新型固定化技术提升酶性能,并拓展其在生物传感、生物催化和生物能源等领域的应用 | NA | 总结葡萄糖脱氢酶的最新研究进展和应用前景 | 葡萄糖脱氢酶及其应用 | 合成生物学 | NA | 分子工程、固定化技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学,工业生物技术,能源 |
| 942 | 2025-10-05 |
Towards establishing functional nitrogenase activities within plants
2025-May-28, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.020
PMID:40441921
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研究论文 | 探讨在植物中建立功能性固氮酶活性的挑战与前景 | 利用合成生物学和人工智能设计在非豆科植物中重构固氮酶,并探索在酵母线粒体低氧环境下工程化固氮酶 | 固氮酶的氧敏感性、金属簇组装复杂性及高能量需求尚未完全解决 | 开发具有自主固氮能力的非豆科作物以减少化肥依赖 | 固氮酶在植物体系中的功能重建 | 合成生物学 | NA | 合成生物学, 人工智能驱动设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌, 酵母 | 固氮酶重构, 线粒体低氧表达系统 | 农业 |
| 943 | 2025-10-05 |
Deep mutational scanning and CRISPR-engineered viruses: tools for evolutionary and functional genomics studies
2025-May-27, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00508-24
PMID:40272173
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综述 | 本文综述了深度突变扫描和CRISPR基因编辑技术在病毒基因组研究中的应用 | 整合深度突变扫描与CRISPR技术,实现对病毒基因组的精准操作和功能表征 | NA | 探讨病毒进化分子机制及疫苗和治疗策略开发 | 病毒基因组和病毒蛋白 | NA | NA | 深度突变扫描, CRISPR基因编辑, 测序技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 944 | 2025-10-05 |
Innovations, Challenges and Future Directions of T7RNA Polymerase in Microbial Cell Factories
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00139
PMID:40209062
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综述 | 全面探讨T7RNA聚合酶在微生物细胞工厂中的应用、挑战与未来发展方向 | 突破以往仅关注分子结构与功能的研究局限,提供T7RNAP变体的综合应用指南并强调工程化改造的最新进展 | NA | 优化微生物细胞工厂的转录系统并推动可持续生物生产 | T7RNA聚合酶及其工程化变体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 精细调控的电路设计 | 工业生物技术 |
| 945 | 2025-10-05 |
Streamlining tRNA-Synthetase Evolution for Genetic Code Expansion and Deep Sequencing Analyses of Its Evolved Variants
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00117
PMID:40231936
|
研究论文 | 本研究开发了一种简化的定向进化系统,用于提高吡咯赖氨酰-tRNA合成酶的活性,以促进遗传密码扩展 | 开发了仅需基础实验室设备的简化定向进化系统,通过串联密码子随机化策略发现PylRS的叠加突变效应 | NA | 提高非经典氨基酸掺入效率,优化遗传密码扩展技术 | 吡咯赖氨酰-tRNA合成酶及其定向进化变体 | 合成生物学 | NA | 定向进化,深度测序,串联密码子随机化 | NA | 测序数据,酶活性数据 | 针对三种不同底物进化的PylRS变体 | 定向进化 | NA | 正交tRNA和氨基酸酰-tRNA合成酶对 | 医学,工业生物技术 |
| 946 | 2025-10-05 |
RT-EZ: A Golden Gate Assembly Toolkit for Streamlined Genetic Engineering of Rhodotorula toruloides
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00848
PMID:40232996
|
研究论文 | 开发了基于Golden Gate组装技术的RT-EZ工具包,用于简化圆红冬孢酵母的基因工程操作 | 首次开发了专门针对圆红冬孢酵母的Golden Gate组装工具包,包含双向启动子、2A肽、RFP颜色筛选等新特性,可单次组装反应构建四基因表达盒 | NA | 解决圆红冬孢酵母因高GC含量和缺乏复制型质粒导致的基因操作困难 | 圆红冬孢酵母 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | Rhodotorula toruloides | 多基因表达盒,包含脂肪酸延伸酶和去饱和酶共表达系统 | 工业生物技术, 医药, 能源 |
| 947 | 2025-10-05 |
Genome Reduction Improves Recombinant Benzoxazole Production in Myxococcus xanthus
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00114
PMID:40257411
|
研究论文 | 本研究通过基因组缩减策略提高粘球菌中重组苯并噁唑类天然产物的产量 | 首次证明在粘球菌中连续移除生物合成基因簇可显著提高重组天然产物产量,并发现某些BGC组合删除会导致细胞不可存活 | 未明确说明具体删除了哪些BGC及其对细胞生理的全面影响 | 研究基因组缩减对粘球菌生物技术性能的影响 | 粘球菌(Myxococcus xanthus) | 合成生物学 | NA | 基因组工程 | NA | NA | NA | 基因组删除 | 粘球菌(Myxococcus xanthus) | 重组苯并噁唑生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 948 | 2025-10-05 |
Insight into Optogenetics for Diabetes Management
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00549
PMID:40279455
|
综述 | 本文概述了光遗传学在糖尿病管理中的应用,重点探讨了通过光控技术实现胰岛素分泌的方法 | 将光遗传学作为合成生物学方法应用于糖尿病管理,实现用户通过光控远程调节激素分泌 | 需要进一步研究照射参数、红移视蛋白和宿主细胞相互作用 | 探索光遗传学在糖尿病治疗中的应用潜力 | 胰腺细胞、非胰腺细胞、小鼠模型 | 合成生物学 | 糖尿病 | 光遗传学、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 基因工程 | 小鼠、高等动物细胞 | 光敏蛋白表达系统、胰岛素分泌通路调控 | 医学 |
| 949 | 2025-10-05 |
A Robust and Orthogonal Far-Red Light Sensor for Gene Expression Control in Escherichia coli
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00044
PMID:40327816
|
研究论文 | 本研究基于蓝藻远红光光适应系统开发了一种用于大肠杆菌的远红光传感器 | 首次在细菌中建立了动态范围超过230倍的正交远红光传感器系统 | NA | 开发用于合成生物学的远红光调控工具 | 蓝藻RfpABC信号系统和大肠杆菌基因表达调控 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌,蓝藻 | 远红光生物传感器,基因表达调控回路 | 工业生物技术 |
| 950 | 2025-10-05 |
Automated Construction of a Yeast-Based Multigene Library via Homologous Recombination in a Biofoundry Workflow
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00812
PMID:40331904
|
研究论文 | 开发了一种基于体内同源重组的自动化一步多基因组装方法,用于构建表达可调文库 | 利用体内同源重组实现自动化一步多基因组装,相比体外方法更高效 | NA | 开发高效的多基因组装方法以构建表达可调文库 | 酵母表达系统和多基因文库 | 合成生物学 | NA | 体内同源重组 | NA | NA | NA | 生物铸造厂工作流程 | 酵母 | 代谢途径,表达可调多基因文库 | 工业生物技术 |
| 951 | 2025-10-05 |
Preventing Multimer Formation in Commonly Used Synthetic Biology Plasmids
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00508
PMID:40101192
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研究论文 | 调查常用合成生物学质粒中多聚体形成现象及其对电路可靠性的影响 | 首次系统评估四种常用质粒骨架在多聚体形成方面的差异,并开发出能避免多聚体形成的大肠杆菌MG1655基因敲除株 | 仅测试了两种大肠杆菌菌株和四种质粒骨架,未涵盖更广泛的宿主-质粒组合 | 优化质粒基础电路的完整性,防止多聚体形成对合成生物学电路的影响 | 四种常用合成生物学质粒骨架及其在大肠杆菌JM109和MG1655中的行为 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、基因敲除、菌株转化 | NA | 分子生物学实验数据 | 四种质粒骨架在两种大肠杆菌菌株(JM109和MG1655)中的测试 | 基因敲除 | 大肠杆菌JM109, 大肠杆菌MG1655 | 质粒基础合成生物学电路 | 工业生物技术 |
| 952 | 2025-10-05 |
dFLASH; dual FLuorescent transcription factor activity sensor for histone integrated live-cell reporting and high-content screening
2025-Apr-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58488-w
PMID:40195317
|
研究论文 | 开发了一种名为dFLASH的双荧光转录因子活性传感器,用于活细胞报告和高通量筛选 | 开发了首个组蛋白整合的双荧光活细胞转录因子活性传感器系统,具有模块化设计和基因组整合特性 | NA | 开发用于活细胞转录因子活性检测和筛选的工具平台 | 缺氧诱导因子(HIF)、孕酮受体(PGR)和合成转录因子 | 合成生物学 | NA | 双荧光报告系统、高通量成像、CRISPRoff、全基因组CRISPR KO筛选 | NA | 荧光图像 | 1600种化合物的天然产物库 | CRISPRoff, CRISPR KO | 哺乳动物细胞 | 转录因子活性生物传感器 | 药物发现, 功能基因组学, 合成生物学 |
| 953 | 2025-10-05 |
Advanced Strategies for Ultrasound Control and Applications in Sonogenetics and Gas Vesicle-Based Technologies: A Review
2025, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S507322
PMID:40433121
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综述 | 本文综述了基于合成生物学的超声控制系统在声遗传学和气囊泡技术中的最新进展与应用 | 系统总结了超声热效应和机械效应作为主要触发源,实现工程化细胞在靶向组织中进行声热或声机械遗传修饰的新策略 | NA | 深入理解超声效应与工程化细胞技术设计、组成和应用之间的关系 | 声遗传学技术和气囊泡技术 | 生物医学工程 | 癌症 | 超声控制技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 工程化细胞 | 声热启动子开关、声热瞬时受体电位通道、声机械激活 | 医学 |
| 954 | 2025-10-05 |
Construction of a Calibration Curve for Lycopene on a Liquid-Handling Platform─Wider Lessons for the Development of Automated Dilution Protocols
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00031
PMID:39096303
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研究论文 | 本研究通过构建番茄红素在二甲基亚砜中的校准曲线,开发了自动化液体处理平台的稀释方案 | 开发了基于回归的实用框架来识别、评估和监控液体转移误差,并创建了可推广到其他自动化应用的灵活液体处理方法 | NA | 开发可靠的自动化液体处理方案,提高合成生物学实验的吞吐量和可重复性 | 番茄红素在二甲基亚砜中的校准曲线构建 | 合成生物学 | NA | 液体处理自动化 | 回归分析 | 实验数据 | NA | 液体处理平台 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 955 | 2025-10-05 |
Towards Self-regeneration: Exploring the Limits of Protein Synthesis in the Protein Synthesis Using Recombinant Elements (PURE) Cell-free Transcription-Translation System
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00304
PMID:39066734
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研究论文 | 本研究通过优化PURE无细胞转录翻译系统,显著降低非核糖体蛋白浓度并提高蛋白质合成效率,实现了向蛋白质自我再生的重要突破 | 将非核糖体PURE蛋白浓度降低97.3%的同时提高蛋白质合成效率,并发现6%葡聚糖在高度稀释配方中能显著提升蛋白质合成速率和总产量 | 原始PURE配方中拥挤剂效果不佳,研究主要关注非核糖体蛋白的自我再生 | 探索PURE无细胞系统中蛋白质自我再生的极限,推动通用生化构建器和活体合成细胞的开发 | PURE无细胞转录翻译系统中的蛋白质合成过程 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译系统 | NA | 生化实验数据 | NA | PURE系统 | 无细胞系统 | 蛋白质自我再生系统 | 工业生物技术,医药 |
| 956 | 2025-10-05 |
Artificial Intelligence Methods and Models for Retro-Biosynthesis: A Scoping Review
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00091
PMID:39047143
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综述 | 总结人工智能在逆生物合成路径设计中的方法和模型应用进展 | 系统梳理AI在逆生物合成领域的最新进展,涵盖基于反应模板和生成模型的多种技术路径 | 未明确说明具体数据规模或模型验证的局限性 | 促进符合绿色化学理念的生物生产路径规划 | 逆生物合成路径设计方法 | 合成生物学 | NA | 逆生物合成分析 | 生成模型 | 化学反应数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 957 | 2025-10-05 |
Toward Practical Applications of Engineered Living Materials with Advanced Fabrication Techniques
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00259
PMID:39002162
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综述 | 本文综述了工程活性材料(ELMs)的先进制造技术及其实际应用前景 | 系统整合了自下而上和自上而下的ELMs构建方法,强调合成生物学与材料科学的交叉融合 | NA | 探讨ELMs的制备方法、特性及其在医疗和环境保护等领域的实际应用 | 工程活性材料(ELMs)及其构建技术 | NA | NA | 3D生物打印、静电纺丝、内源性和外源性支架技术、活体组装 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 工程化活细胞 | 具有环境响应能力的生物传感系统,能够响应压力、pH、湿度、温度和光照等刺激 | 医学, 环境保护, 制造业 |
| 958 | 2025-10-05 |
Development of a Recombineering System for the Acetogen Eubacterium limosum with Cas9 Counterselection for Markerless Genome Engineering
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00253
PMID:39033464
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研究论文 | 本研究开发了一种基于RecT重组酶和Cas9反选择的无标记基因组工程系统,用于乙酸杆菌Eubacterium limosum的精确基因编辑 | 开发了高效的寡核苷酸重组系统,结合Cas9反选择实现无疤痕、无标记的基因组点突变,解决了该菌株基因工程的主要瓶颈 | NA | 开发快速精确的基因组修饰工具,促进Eubacterium limosum的合成生物学和代谢工程应用 | 乙酸杆菌Eubacterium limosum及其基因组 | 合成生物学 | NA | 重组工程、Cas9反选择、基因组编辑 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9, RecT重组酶 | Eubacterium limosum | 重组酶系统与Cas9反选择系统的组合设计 | 能源, 环境, 医学 |
| 959 | 2025-10-05 |
Chloroplast Cell-Free Systems from Different Plant Species as a Rapid Prototyping Platform
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00117
PMID:39028299
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研究论文 | 开发了一种从多种植物物种制备高活性叶绿体无细胞基因表达系统的通用方案 | 建立了首个源自多种植物物种的叶绿体无细胞表达系统,可同时使用T7 RNA聚合酶和内源性叶绿体聚合酶 | NA | 开发快速原型平台以加速植物合成生物学和叶绿体工程研究 | 小麦、菠菜和杨树等不同植物物种的叶绿体 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达(CFE) | NA | 基因表达数据 | 23个5'UTR、10个3'UTR和6个叶绿体启动子 | NA | 小麦、菠菜、杨树 | 基因表达调控序列(启动子、UTR)的表征和原型设计 | 农业 |
| 960 | 2025-10-05 |
Engineering a Novel Probiotic Toolkit in Escherichia coli Nissle 1917 for Sensing and Mitigating Gut Inflammatory Diseases
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00036
PMID:39115381
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研究论文 | 本研究开发了一种基于大肠杆菌Nissle 1917的模块化系统,用于检测和缓解肠道炎症疾病 | 首次在EcN中构建了包含NO传感器、分泌系统和抗TNFα纳米抗体库的集成系统,并建立了评估工程益生菌系统关键参数的数学模型 | 系统灵敏度有所降低 | 开发靶向特异性系统治疗炎症性肠病 | 工程化益生菌大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 酶联免疫吸附试验、体外试验 | 数学模型 | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 基于转录因子的NO生物传感器、1型溶血素分泌系统、抗TNFα纳米抗体治疗载体 | 医学 |