合成生物学相关文章
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当前共找到 2531 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-12-14 |
Genetically Engineered Liposwitch-Based Nanomaterials
2024-Dec-09, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.4c01388
PMID:39495202
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研究论文 | 本文探讨了使用基因工程脂开关调控无序蛋白驱动的纳米组装 | 提出了“脂开关”概念，通过结合别构效应和翻译后修饰来调控融合蛋白的组装 | NA | 开发一种新的策略来控制无序蛋白驱动的纳米组装 | 无序蛋白和球状蛋白的融合纳米材料 | 合成生物学 | NA | 动态光散射、冷冻透射电子显微镜 | NA | 蛋白质 | NA |
| 82 | 2024-12-14 |
Interchromosomal contacts between regulatory regions trigger stable transgenerational epigenetic inheritance in Drosophila
2024-Dec-03, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.11.021
PMID:39667935
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研究论文 | 本文研究了果蝇中通过染色体间接触在不同世代间传递表观遗传信息的过程 | 首次展示了pleiohomeotic和GAGA因子在建立和维持跨代表观遗传继承中的作用，并证明了染色质接触本身可以建立跨代表观遗传继承 | NA | 探讨跨代表观遗传继承的机制 | 果蝇中的Fab-7调控元件和H3K27me3组蛋白标记 | 表观遗传学 | NA | 合成生物学系统 | NA | 染色质接触 | NA |
| 83 | 2024-12-14 |
Towards AI-designed genomes using a variational autoencoder
2024-Dec, Proceedings. Biological sciences
DOI:10.1098/rspb.2024.1457
PMID:39657811
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研究论文 | 本文开发了一个概念验证框架，利用变分自编码器训练机器学习算法来建模细菌基因组组成 | 提出了DeepGenomeVector模型，能够有效捕捉基因组网络中的复杂依赖关系，并通过定性和定量指标验证了其性能 | 本文仅展示了概念验证，尚未实现AI设计完整基因组的能力 | 探索机器学习在合成生物学中的应用，展示AI设计基因组的可能性 | 细菌基因组及其编码的基因网络 | 机器学习 | NA | 变分自编码器 | 变分自编码器 | 基因组数据 | NA |
| 84 | 2024-12-14 |
Deciphering substrate promiscuity and specificity of indolethylamine N-methyltransferase family enzymes from amphibian toads
2024-Dec, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107950
PMID:39522428
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研究论文 | 研究从蟾蜍中鉴定出的七种吲哚乙胺N-甲基转移酶家族酶的底物多样性和特异性 | 通过分子对接和关键氨基酸突变，解释了这些酶的底物多样性和特异性机制 | NA | 探讨蟾蜍中吲哚乙胺N-甲基转移酶家族酶的催化机制 | 蟾蜍中的七种吲哚乙胺N-甲基转移酶家族酶 | 生物化学 | NA | 分子对接，氨基酸突变 | NA | 蛋白质 | 七种酶 |
| 85 | 2024-12-14 |
A directed enolization strategy enables by-product-free construction of contiguous stereocentres en route to complex amino acids
2024-Jul, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01473-5
PMID:38565976
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研究论文 | 本文展示了一种铱催化策略，通过直接上转换简单烯烃和甘氨酸衍生物，合成具有β-立体中心的α-氨基酸 | 该方法利用甘氨酸衍生的N-H单元的天然导向能力，促进铱催化的邻近羰基的烯醇化，从而实现高水平的区域和立体控制，且具有完全的原子经济性 | NA | 开发一种高效的合成方法，用于合成具有β-立体中心的α-氨基酸 | 具有β-立体中心的α-氨基酸 | NA | NA | 铱催化 | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-12-13 |
Harnessing the polysaccharide production potential to optimize and expand the application of probiotics
2025-Feb-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2024.122951
PMID:39643409
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综述 | 本文综述了利用益生菌生产多糖的潜力，优化和扩展其在食品、制药和医疗领域的应用 | 本文总结了益生菌底盘和用于多糖生产的遗传工具，并介绍了通过调整代谢途径和整合表达元件来制备高产、可控分子量或非天然多糖的策略 | NA | 探讨益生菌在多糖生产中的潜力及其在工业和生物医学领域的应用 | 益生菌及其多糖生产机制 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-12-13 |
Network for knowledge Organization (NEKO): An AI knowledge mining workflow for synthetic biology research
2025-Jan, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.11.006
PMID:39580108
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研究论文 | 介绍了一种名为NEKO的工作流程，利用大型语言模型Qwen从科学文献中提取知识，生成知识图谱并提供全面的文献总结 | NEKO增强了大型语言模型的能力，提供更具体、可操作的知识，并支持灵活的本地部署，使科学基础模型更易于访问 | NA | 开发一种能够从科学文献中提取知识并生成知识图谱的工作流程，以增强大型语言模型的能力 | 科学文献中的知识提取和知识图谱生成 | 机器学习 | NA | 大型语言模型（LLM） | LLM Qwen | 文本 | NA |
| 88 | 2024-12-13 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2024-Dec-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
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研究论文 | 本文开发了位点特异性交联探针，用于约束和解析载体蛋白与其酶域之间的相互作用，揭示了非核糖体肽生物合成中的模块间凝聚现象 | 首次应用四嗪点击化学捕获了酪胺酸生物合成中两个载体蛋白在缩合域活性位点的凝聚过程，并报告了该复合物的高分辨率冷冻电镜结构 | NA | 揭示非核糖体肽合成酶的分子细节，并为未来合成生物学设计提供关键信息 | 非核糖体肽合成酶中的载体蛋白与酶域之间的相互作用 | NA | NA | 四嗪点击化学，冷冻电镜（cryo-EM），X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA |
| 89 | 2024-12-13 |
Dynamic processes of fate decision in inducible bistable systems
2024-Dec-03, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.10.015
PMID:39478343
|
研究论文 | 本文研究了诱导型双稳态系统中命运决定的动态过程 | 本文提出了稳态参数决定命运决定景观的观点，并强调了动态过程在命运决定中的重要性 | 本文主要关注理论模型，未涉及实验验证 | 探讨基因调控网络中命运决定的动态过程 | 诱导型双稳态系统中的命运决定过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-12-13 |
Multiplex Expression Cassette Assembly: A flexible and versatile method for building complex genetic circuits in conventional vectors
2024-Dec, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14454
PMID:39175411
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Multiplex Expression Cassette Assembly (MECA)的方法，用于在常规载体中构建复杂的遗传电路 | MECA方法通过修改与Golden Gate Assembly兼容的载体，使用嵌入连接语法的引物放大功能元件，能够在不需要专用载体和标准化模块库的情况下，通过两轮Golden Gate组装反应构建复杂结构 | NA | 开发一种灵活且通用的方法来构建复杂的遗传电路，以在合成生物学中实现多种功能，并在作物育种中提高生产力和整体性能 | 复杂的遗传电路构建，以及在烟草和番茄中的基因编辑和代谢产物生产 | 合成生物学 | NA | Golden Gate Assembly | NA | NA | 涉及烟草、番茄和Escherichia coli等多种植物和微生物样本 |
| 91 | 2024-12-13 |
Securing Commercial Nucleic Acid Synthesis
2024-Dec, Rand health quarterly
PMID:39664983
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综述 | 本文综述了商业核酸合成的安全问题，评估了当前的筛查状态，并提出了加强筛查的建议 | 本文提出了加强商业核酸合成筛查的建议，扩展并强化了政府沟通、行业联盟规则和最佳实践 | 本文主要基于现有文献和政策建议，缺乏实证研究 | 评估当前商业基因合成筛查的现状，并提出加强筛查的建议 | 商业核酸合成的安全问题 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
| 92 | 2024-12-13 |
Harnessing regulatory networks in Actinobacteria for natural product discovery
2024-Jan-09, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuae011
PMID:38569653
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综述 | 本文综述了放线菌中调控网络在天然产物发现中的应用 | 提出了基于调控指导的基因组挖掘方法，以激活生物合成基因簇（BGCs）的表达，并优先选择特定BGCs进行表达 | 当前随机筛选生物活性化合物的投资回报率低，且难以预测哪些BGCs应优先考虑 | 探讨如何优先选择和激活放线菌中的生物合成基因簇，以促进天然产物的发现 | 放线菌中的生物合成基因簇及其调控网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-12-13 |
Expanding the synthetic biology toolbox of Cupriavidus necator for establishing fatty acid production
2024-Jan-09, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuae008
PMID:38366943
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研究论文 | 本文开发并优化了Cupriavidus necator的基因表达和基因组工程工具箱，以促进脂肪酸生产 | 验证并表征了一组诱导性和组成性启动子，设计并测试了RBS库，研究了密码子优化对基因表达的影响 | 仍需克服一些障碍，使C. necator广泛用于生物合成过程 | 开发和优化Cupriavidus necator的基因表达和基因组工程工具箱 | Cupriavidus necator中的启动子、RBS和密码子优化 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | 基因表达数据 | 一组诱导性和组成性启动子，一个RBS库，gfp和mCherry基因的密码子优化变体 |
| 94 | 2024-12-13 |
Using Euf1 transcription factor as a titrator of erythritol-inducible promoters in Yarrowia lipolytica; insight into the structure, splicing, and regulation mechanism
2024-Jan-09, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foae027
PMID:39169472
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研究论文 | 本研究使用Euf1转录因子作为调节因子，探索其在Yarrowia lipolytica中对赤藓糖醇诱导型启动子的调控机制 | 通过使用Euf1转录因子作为启动子调节因子，扩展了合成启动子的可调性，并提出了Euf1调控启动子作用的新机制 | 研究中Euf1的过表达导致启动子的赤藓糖醇诱导特性丧失 | 探索合成生物学中可控调节元件的调控机制 | Euf1转录因子及其在Yarrowia lipolytica中的调控作用 | 合成生物学 | NA | 转录因子调控 | NA | 转录组数据 | NA |
| 95 | 2024-12-13 |
Metabolic engineering for the production of plant isoquinoline alkaloids
2016-06, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.12494
PMID:26503307
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研究论文 | 本文综述了通过代谢工程提高植物异喹啉生物碱（PIA）生产的研究进展 | 利用系统生物学和合成生物学方法，通过代谢工程和异源微生物培养提高PIA的生产 | 目前对PIA代谢途径的了解有限，限制了生产改进的努力 | 提高植物异喹啉生物碱的生产 | 植物异喹啉生物碱及其代谢途径 | 生物化学 | NA | 下一代测序技术，高通量蛋白质组学和代谢组学分析，生物信息学 | NA | 代谢数据 | NA |
| 96 | 2024-12-13 |
Transcript profiling of jasmonate-elicited Taxus cells reveals a β-phenylalanine-CoA ligase
2016-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.12359
PMID:25899320
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研究论文 | 研究通过cDNA-AFLP技术分析茉莉酸诱导的紫杉细胞转录组，揭示了与紫杉醇侧链合成相关的β-苯丙氨酸-CoA连接酶基因 | 首次鉴定了与紫杉醇侧链合成相关的TB768基因，并验证了其在紫杉醇生物合成途径中的功能 | 研究主要集中在细胞培养水平，尚未在植物体内验证该基因的功能 | 揭示紫杉醇生物合成途径中未知步骤的相关基因 | 茉莉酸诱导的紫杉细胞及紫杉醇生物合成途径 | 代谢工程 | 癌症 | cDNA-AFLP | NA | 基因表达数据 | 紫杉细胞培养物 |
| 97 | 2024-12-12 |
Blue-Purple evaluation: Chromoproteins facilitate the identification of BioBrick compatibility
2025-Jan, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28862
PMID:39402779
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研究论文 | 本文介绍了一种利用色蛋白（chromoproteins）在单锅反应中评估BioBrick兼容性的新方法BP（Blue/Purple, Ban/Pick） | 提出了BP评估方法，通过可视化和量化蓝紫色大肠杆菌菌落的比率来验证BioBrick构建的兼容性 | NA | 开发一种简单、快速且可靠的方法来评估BioBrick的兼容性 | BioBrick的兼容性评估 | 合成生物学 | NA | 色蛋白（chromoproteins） | NA | 菌落图像 | 使用了包含抗毒素-毒素对ccdA-ccdB、裂解蛋白E或异源蛋白sfGFP的BioBrick组装体进行验证 |
| 98 | 2024-12-12 |
Sphingomonas arvum sp. nov.: A promising microbial chassis for high-yield and sustainable zeaxanthin biomanufacturing
2025-Jan, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127938
PMID:39509922
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研究论文 | 本研究通过基因组挖掘和液相色谱/质谱分析，鉴定了新型类胡萝卜素玉米黄质产生菌Sphingomonas sp. strain BN140010的生物合成基因簇，并验证了其高产玉米黄质的能力 | 首次报道了Sphingomonas arvum strain BN140010这一新型菌株，其玉米黄质产量在Sphingomonas属中最高，为可持续的玉米黄质生物制造提供了新的微生物底盘 | NA | 寻找新的微生物和遗传底盘，以满足全球对高附加值玉米黄质的快速增长需求 | 新型玉米黄质产生菌Sphingomonas sp. strain BN140010及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、液相色谱/质谱分析 | NA | 基因组数据、质谱数据 | 1株新型玉米黄质产生菌Sphingomonas sp. strain BN140010 |
| 99 | 2024-12-12 |
Microbial chemotaxis in degradation of xenobiotics: Current trends and opportunities
2025-Jan, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127935
PMID:39476517
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综述 | 本文综述了微生物趋化性在降解异生物质中的作用，重点介绍了基于趋化性的细菌和微流控生物传感器在环境监测中的应用 | 本文探讨了基因组学、蛋白质组学和合成生物学在理解和控制微生物趋化性降解异生物质过程中的新趋势，并提出了开发具有定制趋化反应和降解能力的工程微生物的潜力 | 尽管在解码细菌趋化性调控机制方面取得了显著突破，但仍存在一些知识空白需要解决，以充分利用其在环境中的污染物感知和降解潜力 | 探讨微生物趋化性在降解异生物质中的作用及其在环境监测中的应用 | 微生物趋化性在降解农药、工业化学品和药品等异生物质中的作用 | NA | NA | 基因组学、蛋白质组学、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-12-12 |
Scaling up for success: from bioactive natural products to new medicines
2024-Dec-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00022f
PMID:39129507
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观点文章 | 本文介绍了诺华公司在天然产物药物发现方面的历史和成功经验，并讨论了从早期研究到开发及超越过程中使用的工具和面临的挑战 | 本文利用90,000种微生物菌株和20,000种分离的天然产物，采用跨学科方法，结合微生物学、计算生物学、合成生物学、化学和工艺开发等多领域专业知识，加速药物发现并促进可持续化合物供应 | NA | 探讨如何利用天然产物开发新药物，并展望其在未来的应用 | 天然产物及其在药物开发中的应用 | 药物发现 | NA | 基因工程、数据科学 | NA | 微生物菌株、天然产物 | 90,000种微生物菌株和20,000种分离的天然产物 |