合成生物学相关文章
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当前共找到 4537 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-02-27 |
Yeast Stress Response to Synthetic Constructs
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00715
PMID:41615018
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综述 | 本文综述了工程化酵母中由异源构建体引发的应激反应，并提出了应激感知的设计原则以提高其生物技术应用中的稳健性和产量 | 提出了“应激组”概念以整合多种应激通路对合成构建体的响应，并系统总结了减轻细胞负担的多种策略及新兴方法 | NA | 理解合成构建体如何与酵母应激通路相互作用，并开发更稳健、高产的工程酵母系统 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）作为合成生物学底盘生物 | 合成生物学 | NA | CRISPR、适应性实验室进化、数据驱动的菌株工程 | NA | NA | NA | CRISPR | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 合成细胞器构建、动态调控、通路区室化 | 工业生物技术 |
| 82 | 2026-02-27 |
Ultra-high-throughput mapping of genetic design space
2026-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09933-9
PMID:41535463
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台，通过结合长读长和短读长测序技术，能够高通量定量评估任意长度、包含多种遗传元件组合的构建体，从而加速合成生物学中基因电路的设计与优化 | 开发了CLASSIC平台，首次实现了对多kb长度尺度、包含多种遗传元件组合的构建体进行超高通量定量筛选，突破了传统方法只能分析短序列的限制 | NA | 建立高通量遗传筛选平台，揭示遗传元件的组合规则，实现复杂遗传系统的数据驱动设计 | 基因电路设计（长度5-20 kb） | 合成生物学 | NA | 长读长和短读长下一代测序（NGS） | 机器学习模型 | 测序数据 | 超过10^6种基因电路设计 | NA | 人类细胞 | 基因电路（包含多种遗传元件的组合） | 工业生物技术 |
| 83 | 2026-02-27 |
Synthetic Biology of Plants and Microbes for Agriculture, Environment, and Future Applications
2026-Jan-28, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00687
PMID:41609588
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综述 | 本文综述了合成生物学在植物和微生物工程中的最新进展，旨在推动农业革命并拓展植物工程在制造、传感和修复等新领域的应用 | 提出将植物及其共生微生物视为整体系统进行工程化设计，并整合基因组构建工具、计算机辅助设计和人工智能等新技术 | NA | 探讨合成生物学如何通过先进基因工程技术驱动农业革命并拓展植物工程的新应用领域 | 植物及其共生微生物（真菌、细菌、古菌） | NA | NA | 基因组构建工具、计算机辅助设计、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 植物、真菌、细菌、古菌 | 响应环境变化、改变形态或应对威胁的智能植物电路 | 农业, 环境, 制造业, 基础设施, 传感, 修复 |
| 84 | 2026-02-27 |
Advances and Future Perspectives of Synechocystis sp. as a Microbial Cell Factory for Biomanufacturing
2025-Nov, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70162
PMID:41311002
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综述 | 本文综述了集胞藻作为微生物细胞工厂在生物制造中的最新进展、面临的挑战及未来研究方向 | 整合了生物信息学概述与合成生物学应用的最新进展，并提出了规模化、工业化及组学策略整合的未来方向 | NA | 推动蓝藻在工业生物技术中的应用，促进可持续、低碳、高效的生物生产系统发展 | 集胞藻 | 工业生物技术 | NA | 组学策略 | NA | NA | NA | 合成生物学设计 | 集胞藻 | NA | 工业生物技术 |
| 85 | 2026-02-27 |
Computation-driven redesign of an NRPS-like carboxylic acid reductase improves activity and selectivity
2024-11-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp6775
PMID:39612335
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研究论文 | 本文通过计算驱动重新设计非核糖体肽合成酶样羧酸还原酶的腺苷化结构域，以提高其催化活性和选择性 | 采用基于近似机制的几何标准和Rosetta能量评分，对CARs的“守门员”腺苷化结构域进行重新设计，实现了高达101倍的催化效率提升和86倍的底物特异性增强 | NA | 提高非核糖体肽合成酶样羧酸还原酶的催化效率和底物选择性 | 羧酸还原酶（CARs）的腺苷化结构域 | 合成生物学 | NA | 计算重新设计、Rosetta能量评分 | NA | NA | NA | Rosetta | NA | NA | 工业生物技术 |
| 86 | 2026-02-27 |
Data-Driven Design of Triple-Targeted Protein Nanoprobes for Multiplexed Imaging of Cancer Lymphatic Metastasis
2024-09, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202405877
PMID:38889909
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研究论文 | 本文介绍了一种通过数据驱动设计和合成生物学组装策略开发的三靶向蛋白质纳米探针，用于癌症淋巴转移的多重成像 | 利用机器学习生物信息学分析结合患者组织检查，识别出CXCR4、TfR1和VEGFR3三个靶点组合，并设计出能特异性结合所有三个靶点的铁蛋白纳米笼探针，实现了对高度异质性淋巴转移的多重成像 | NA | 开发用于癌症淋巴转移成像的靶向纳米探针 | 癌症淋巴转移的异质性靶点及成像 | 数字病理学 | 胃癌 | 机器学习生物信息学分析、合成生物学组装 | NA | 组织样本数据、成像数据 | 19个新鲜切除的人类胃癌标本及患者淋巴组织 | 合成生物学方法 | NA | 基于基因工程铁蛋白亚基自组装的纳米笼探针 | 医学 |
| 87 | 2026-02-26 |
Streptomyces as a versatile host platform for heterologous production of microbial natural products
2026-Feb-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00036j
PMID:40923873
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综述 | 本文全面回顾了2004年至2024年间利用链霉菌作为异源表达平台生产微生物天然产物的研究进展 | 首次对过去20年超过450项相关研究进行了数据驱动的定量分析，总结了表达趋势、关键影响因素及技术进展 | 作为一篇综述文章，主要基于现有文献进行分析，未提出新的实验数据或技术突破 | 评估链霉菌作为异源表达平台在挖掘微生物天然产物生物合成基因簇方面的潜力和应用 | 链霉菌宿主及其异源表达的各类生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 异源表达、基因组工程、合成生物学工具、组合生物合成 | NA | 文献数据 | 超过450项同行评审研究 | 基因组工程 | 链霉菌 | 生物合成基因簇的异源表达与调控 | 药物发现 |
| 88 | 2026-02-26 |
Toward a unified pipeline for natural product discovery: tools and strategies for NRPS and PKS pathway exploration and engineering
2026-Feb-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00041f
PMID:40719200
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综述 | 本文综述了将非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统转化为可理性设计平台的最新进展，涵盖基因组挖掘、高通量筛选、合成生物学工具及计算建模等方法 | 强调计算建模（如同源建模、分子对接、分子动力学模拟）与深度学习策略如何与传统技术互补，加速定制化天然产物类似物的发现与组装 | NA | 探索和改造NRPS与PKS生物合成途径，以发现和设计新型天然产物 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统及其产生的天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、高通量筛选、去重复分析、同源建模、分子对接、分子动力学模拟、深度学习 | 深度学习模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 89 | 2026-02-26 |
Lactic Acid Bacteria Bacteriocins: Classification, Biosynthesis, Health Benefits, and Strategies for Enhanced Efficacy
2026-Feb-25, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14047
PMID:41700423
|
综述 | 本文综述了乳酸菌细菌素的分类、生物合成、健康益处及增强效能的策略 | 提供了更新的细菌素分类（I-III类），并分析了产量影响因素和增强效能的策略，如代谢工程和合成生物学 | 产量优化和临床转化方面仍存在挑战 | 综述乳酸菌细菌素的研究进展，以指导其治疗开发和规模化生产 | 乳酸菌细菌素 | NA | 感染和癌症 | NA | NA | NA | NA | 代谢工程, 合成生物学 | 乳酸菌 | NA | 食品, 生物医学 |
| 90 | 2026-02-26 |
A comprehensive ruminant microbial catalog (CRMC) reveals convergent selection for key vitamin-synthesizing pathways and genes across ruminants and human
2026-Feb-25, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag016
PMID:41738843
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研究论文 | 本研究基于反刍动物胃肠道宏基因组样本，构建了一个全面的反刍动物微生物基因组目录（CRMC），并系统揭示了维生素合成微生物的功能特征、生态角色及其在反刍动物与人类肠道中的趋同选择模式 | 构建了迄今为止最全面的反刍动物胃肠道微生物基因组目录（CRMC），并首次系统揭示了跨反刍动物宿主的维生素合成微生物在关键合成途径和基因节点上的趋同选择模式 | 研究主要基于宏基因组组装基因组（MAGs），可能无法完全覆盖低丰度或难培养的微生物类群 | 阐明反刍动物胃肠道维生素合成微生物的功能特征、生态角色及其跨宿主分布模式 | 反刍动物胃肠道微生物组，特别是维生素合成微生物 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组测序 | NA | 宏基因组序列数据 | 2,325个宏基因组样本，来自8种反刍动物宿主 | NA | 反刍动物（8种） | NA | 农业，工业生物技术 |
| 91 | 2026-02-26 |
Advancing codon language modeling with synonymous codon constrained masking
2026-Feb-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag166
PMID:41736545
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研究论文 | 本文介绍了SynCodonLM，一种通过同义密码子约束掩码来改进密码子语言建模的方法，以更好地捕捉DNA层面的生物学特征 | 引入同义密码子约束掩码，将密码子级与蛋白质级语义解耦，使模型能学习核苷酸特异性模式，并在DNA层面特征敏感的基准测试中表现优异 | NA | 改进密码子语言建模，以更准确地建模蛋白质编码DNA序列并捕捉DNA层面的生物学特征 | 蛋白质编码DNA序列 | 自然语言处理 | NA | 密码子语言建模 | 语言模型 | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 92 | 2026-02-26 |
SSB-mediated enhancement of argonaute activity triggers SOS filamentation in bacteria
2026-Feb-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag175
PMID:41736547
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研究论文 | 本文揭示了嗜热栖热菌Argonaute蛋白（TtAgo）在细菌生理中的作用，特别是其与TtSSB相互作用促进DNA损伤和细胞丝状化的机制 | 首次发现TtAgo过表达能通过破坏细胞分裂检查点触发细菌丝状化，并阐明TtSSB招募TtAgo至复制叉增强其DNA结合活性的新机制 | 研究主要基于嗜热栖热菌和大肠杆菌模型，在其他细菌中的普适性未验证 | 探究原核Argonaute蛋白在细菌细胞周期和DNA修复途径中的生理功能 | 嗜热栖热菌Argonaute蛋白（TtAgo）及其与单链DNA结合蛋白（TtSSB）的相互作用 | 合成生物学 | NA | 扫描电子显微镜、核DNA染色、截短蛋白变体分析 | NA | 图像数据、分子相互作用数据 | 使用嗜热栖热菌和大肠杆菌作为研究模型 | NA | 嗜热栖热菌, 大肠杆菌 | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 93 | 2026-02-26 |
Precision Fermentation Processes for Producing Novel Foods and Its Sustainable Applications
2026-Feb, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70160
PMID:41735245
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综述 | 本文对精准发酵技术在可持续食品生产中的应用进行了系统综述，整合了微生物菌株设计、生物工艺工程、技术经济可行性、环境绩效和监管准备度等多个方面 | 提供了一个整合微生物菌株设计、生物工艺工程、技术经济可行性、环境绩效和监管准备度的统一框架，弥补了以往仅关注产品或特定生物的综述的不足 | 面临高资本和能源成本、放大效率低、下游处理复杂、消费者接受度以及监管不确定性等挑战 | 评估精准发酵技术在可持续食品生产中的应用、技术经济可行性和环境影响 | 精准发酵过程及其在食品生产中的应用 | NA | NA | 精准发酵、代谢途径工程 | NA | 文献数据 | 37项符合纳入标准的研究（包括实验室研究、工业案例研究、技术经济分析和生命周期评估） | 合成生物学 | 微生物宿主 | 代谢途径工程 | 食品, 工业生物技术 |
| 94 | 2026-02-26 |
The rise and future of peptide-based antimicrobials
2026-Jan-30, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2510002
PMID:41736369
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综述 | 本文综述了肽类抗生素的兴起与未来，涵盖其发现、优化和应用的最新进展，包括结构分类、作用机制以及人工智能和合成生物学等新兴策略 | 整合了人工智能、合成生物学和现代递送技术等新兴策略，以应对抗菌素耐药性挑战，并系统分类肽类抗生素以指导其治疗潜力 | NA | 探讨肽类抗生素作为传统小分子药物替代品的潜力，以应对日益严重的抗菌素耐药性威胁 | 肽类抗生素，包括天然、半合成和全合成类型，以及其结构分类如α-螺旋、β-折叠、环状和延伸形式 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 95 | 2026-02-26 |
High-throughput yeast engineering in biofoundries: towards autonomous and scalable synthetic biology
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag003
PMID:41591451
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综述 | 本文综述了生物铸造厂如何通过整合自动化、人工智能和标准化工作流程，推动高通量酵母工程向自主化和规模化方向发展 | 探讨了从DBTL（设计-构建-测试-学习）循环向自主优化的“自动驾驶实验室”和Design-Build-Deploy（设计-构建-部署）循环的转变趋势 | 仍存在协议可变性、AI工具整合不足以及国际标准、数据治理和伦理保障需要协调等关键障碍 | 推动酵母工程的高通量、自主化和规模化发展，以实现经济、可持续的大规模生物制造 | 酵母工程、生物铸造厂及其在菌株开发中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、表型筛选、预测建模 | 预测模型（AI驱动） | NA | NA | CRISPR-Cas9（提及基因组编辑，但未明确指定工具） | 酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 96 | 2026-02-26 |
Structure and encapsulation of carbonic anhydrase within the α-carboxysome
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2523723122
PMID:41223214
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研究论文 | 本研究解析了α-羧化体内部碳酸酐酶的结构及其封装机制 | 首次揭示了CsoSCA的六聚体三聚体结构，证明其封装不依赖锌离子和连接蛋白CsoS2，并阐明了其在羧化体内部连接Rubisco与外壳的桥梁作用 | 研究主要基于合成微型外壳和细菌模型，体内完整羧化体的动态组装过程仍需进一步验证 | 阐明α-羧化体中碳酸酐酶的结构特征及其在微区室内的封装机制 | 化能自养细菌Halothiobacillus neapolitanus的α-羧化体碳酸酐酶CsoSCA | 结构生物学 | NA | 分子结构解析、合成微型外壳技术 | NA | 结构数据、生化实验数据 | NA | 合成生物学技术 | Halothiobacillus neapolitanus（化能自养细菌） | 羧化体微区室封装系统（包含Rubisco和碳酸酐酶的半透性蛋白质外壳） | 合成生物学、生物技术 |
| 97 | 2026-02-26 |
Regulatory helix plays a key role in genetic ON-OFF switching for the 2'-deoxyguanosine-sensing mRNA element
2025-07, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110282
PMID:40412519
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研究论文 | 本文通过化学探测和荧光淬灭实验，揭示了2'-脱氧鸟苷感应核糖开关在转录过程中的动态调控机制 | 发现核糖开关并非简单的二元开关，而是通过关键中间态在RNA合成过程中精细调控下游基因转录 | 研究主要基于体外实验，需要进一步在体内验证调控机制 | 阐明2'-脱氧鸟苷感应核糖开关的转录调控机制 | 2'-脱氧鸟苷感应核糖开关及其转录中间体 | 合成生物学 | NA | 化学探测、荧光淬灭实验 | NA | 结构探测数据、荧光信号数据 | NA | NA | NA | 核糖开关调控元件 | 医学, 合成生物学 |
| 98 | 2026-02-26 |
Compliant DNA Origami Nanoactuators as Size-Selective Nanopores
2024-09, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202405104
PMID:39014922
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研究论文 | 本文介绍了一种可重构的DNA折纸纳米孔，其孔径可通过分子触发器调节，实现了尺寸选择性跨膜运输 | 结合DNA折纸纳米技术、机械启发设计和合成生物学，创建了具有可调孔径和可逆构象变化的纳米孔，克服了传统生物纳米孔孔径固定的限制 | NA | 开发一种可调节孔径的纳米孔技术，以扩展其在生物物理学和生物技术中的应用 | DNA折纸纳米孔（MechanoPore）及其在脂质体膜中的重构与功能 | 合成生物学 | NA | DNA折纸纳米技术、3D-DNA-PAINT超分辨率成像、染料流入测定、倒置乳液cDICE技术、共聚焦成像 | NA | 图像数据（超分辨率和共聚焦成像） | NA | DNA折纸 | 脂质体（人工膜系统） | 可重构纳米孔（MechanoPore），具有三个稳定状态和可调孔径的机械开关 | 药物递送, 生物分子分选, 传感, 合成生物学 |
| 99 | 2026-02-26 |
Synthetic biology: at the crossroads of genetic engineering and human therapeutics-a Keystone Symposia report
2021-12, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.14710
PMID:34786712
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会议报告 | 本文总结了2021年5月3日至4日举行的Keystone eSymposium，探讨了合成生物学在细胞和基因疗法中的潜在应用 | 强调合成生物学在人类治疗中的临床应用，而非技术细节，并讨论了多种疗法（如T细胞、基因、病毒疗法和益生菌）的工程化改进 | NA | 探索合成生物学如何转化细胞和基因疗法以治疗多种疾病 | 真核和原核细胞，包括T细胞、基因疗法、病毒疗法和益生菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 真核细胞, 原核细胞 | 生物传感器, 逻辑门, 代谢途径 | 医学 |
| 100 | 2026-02-25 |
Exploring marine-derived compounds as potential anti-cancer agents: Mechanisms and therapeutic implications
2026-May, Cancer pathogenesis and therapy
DOI:10.1016/j.cpt.2025.08.004
PMID:41732213
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综述 | 本文全面综述了海洋来源化合物作为潜在抗癌剂的机制、治疗应用及临床发展 | 系统总结了海洋来源化合物的多样化抗癌机制，并强调了通过海洋生物技术、合成生物学及新型给药系统克服其应用限制的未来方向 | 海洋来源化合物存在产量低、结构复杂、水溶性差和生物利用度有限等挑战，阻碍了其更广泛的临床应用 | 探索海洋来源化合物作为抗癌剂的潜力，包括其作用机制、治疗应用及临床转化 | 海洋来源的化合物（如生物碱、多糖、肽类、萜类、聚酮类）及其抗癌活性 | NA | 癌症 | 基因组挖掘、合成生物学、发酵技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |