合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
121	2025-03-21	Modulating ion channels with nanobodies 2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.005 PMID:40103710	综述	本文综述了纳米抗体在离子通道研究和调控中的应用进展	纳米抗体因其小尺寸、高特异性和识别难以接近的表位的能力，为离子通道的结构-功能关系研究提供了新的机会，并有望克服传统药物的脱靶效应和毒性问题	NA	探讨纳米抗体在离子通道研究和治疗中的潜力	离子通道	合成生物学	NA	纳米抗体技术	NA	NA	NA
122	2025-03-21	Metabolic Engineering of Yarrowia lipolytica for Enhanced De Novo Biosynthesis of Icaritin 2025-Mar-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00754 PMID:40106718	研究论文	本研究利用合成生物学技术构建了一种微生物细胞工厂，用于从头合成具有抗癌特性的天然黄酮类化合物icaritin（ICT）	通过优化代谢途径，包括通过甲羟戊酸途径修饰增强DMAPP供应，以及通过截断策略微调EsPT的表达和催化效率，显著提高了ICT产量至247.02 mg/L，这是迄今为止报道的最高微生物ICT滴度	NA	提高icaritin（ICT）的产量，以支持其大规模工业生产	Yarrowia lipolytica酵母	合成生物学	肝癌	合成生物学技术	NA	NA	NA
123	2025-03-21	Recent advances in biological synthesis of food additive succinate 2025-Mar-19, Critical reviews in biotechnology IF:8.1Q1 DOI:10.1080/07388551.2025.2472636 PMID:40107767	综述	本文综述了生物合成食品添加剂琥珀酸的最新进展，重点介绍了代谢工程策略在增强琥珀酸生物合成中的应用	本文通过先进的合成生物学技术，强调了开发强大的微生物细胞工厂的潜力，并塑造了微生物在工业应用中整合的未来方向	尽管在优化发酵过程和下游操作方面做出了大量努力，但仍需提高成本效益和竞争力，同时考虑环境问题	提高琥珀酸生物合成的效率和经济效益，同时考虑环境问题	琥珀酸	合成生物学	NA	代谢工程策略，包括发酵调控、代谢调控、细胞调控和模型指导	NA	NA	NA
124	2025-03-21	Microalgae in health care and functional foods: β-glucan applications, innovations in drug delivery and synthetic biology 2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2025.1557298 PMID:40103595	综述	本文综述了微藻在医疗保健和功能性食品中的应用，特别是β-葡聚糖的治疗潜力、药物递送创新和合成生物学应用	强调了微藻在免疫调节和抗癌治疗中的潜力，以及合成生物学和生物工艺工程在提高微藻治疗和营养价值方面的创新应用	需要进一步研究和开发以解决可扩展性、法规一致性和消费者接受度问题	探讨微藻在医疗保健和功能性食品中的应用潜力	微藻及其衍生的生物活性化合物，如β-葡聚糖	生物技术	癌症	合成生物学、生物工艺工程	NA	NA	NA
125	2025-03-21	Structure-Based Engineering of a Sesquiterpene Cyclase to Generate an Alcohol Product: Conversion of epi-Isozizaene Synthase into α-Bisabolol Synthase 2024-03-19, Biochemistry IF:2.9Q3 DOI:10.1021/acs.biochem.3c00681 PMID:38420671	研究论文	本文通过结构基础的工程改造，将一种倍半萜环化酶转化为α-红没药醇合酶，展示了其作为合成生物学应用平台的潜力	通过突变活性位点轮廓，重新设计EIZS以生成倍半萜醇产物，而非倍半萜烃产物，扩展了EIZS作为设计环化酶平台的潜力	突变后的酶在生成α-红没药醇时的保真度仅为65%至74%，表明仍有改进空间	研究目的是通过结构基础的工程改造，将EIZS转化为α-红没药醇合酶，以扩展其在合成生物学中的应用	研究对象是EIZS酶及其突变体，特别是F95S-F198S双突变体	合成生物学	NA	X射线晶体学、生化表征	NA	晶体结构数据、生化数据	NA
126	2025-03-21	Small RNAs Turn Over a New Leaf as Morphogens 2017-11-06, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2017.10.025 PMID:29112845	研究论文	本文探讨了移动小RNA梯度通过基于阈值的读取机制创建基因表达尖锐边界的可能性	通过操纵参与叶片上下模式的小RNA和一种新颖的合成生物学方法，支持了这一假设	NA	研究小RNA梯度在基因表达边界形成中的作用	叶片模式形成中的小RNA	发育生物学	NA	合成生物学方法	NA	NA	NA
127	2025-03-20	Combining diffusion and transformer models for enhanced promoter synthesis and strength prediction in deep learning 2025-Mar-19, mSystems IF:5.0Q1 DOI:10.1128/msystems.00183-25 PMID:40105319	研究论文	本研究结合扩散模型和Transformer模型，用于增强合成启动子的设计和强度预测	首次将扩散模型应用于合成启动子设计，并结合Transformer模型进行强度预测，展示了比传统方法更好的性能	研究主要针对模型细菌和蓝细菌，未涉及其他生物体	优化外源基因表达和代谢途径效率，设计性能优于天然启动子的合成启动子	合成启动子	合成生物学	NA	扩散模型, Transformer模型	扩散模型, Transformer模型, 卷积神经网络	启动子序列数据	NA
128	2025-03-20	Preventing Multimer Formation in Commonly Used Synthetic Biology Plasmids 2025-Mar-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00508 PMID:40101192	研究论文	本文调查了四种常用质粒骨架在克隆和野生型大肠杆菌菌株中多聚体的形成情况，并提出了避免多聚体产生的单基因敲除方法	首次系统地调查了常用质粒骨架在多聚体形成方面的差异，并提出了通过单基因敲除避免多聚体产生的方法	仅在大肠杆菌的两种菌株中进行了实验，未在其他宿主或质粒系统中验证	优化基于质粒的合成生物学电路的设计和可靠性	四种常用质粒骨架及其在大肠杆菌菌株JM109和MG1655中的多聚体形成情况	合成生物学	NA	质粒克隆、单基因敲除	NA	NA	四种质粒骨架在两种大肠杆菌菌株中的实验
129	2025-03-20	Analysis of the Alkaline Resistance Mechanism of Halomonas alkalicola CICC 11012 s by Proteomics and Metabolomics 2025-Feb-13, Current microbiology IF:2.3Q3 DOI:10.1007/s00284-024-04056-2 PMID:39945829	研究论文	本研究通过蛋白质组学和代谢组学分析，探讨了Halomonas alkalicola CICC 11012s对碱性胁迫的响应分子机制	首次结合蛋白质组学和代谢组学技术，深入解析了Halomonas alkalicola CICC 11012s的碱性抗性机制，并验证了tonb基因在该机制中的重要作用	研究仅针对Halomonas alkalicola CICC 11012s的碱性抗性机制，未涉及其他极端环境的耐受性	研究Halomonas alkalicola CICC 11012s对碱性胁迫的响应分子机制，以促进其在工业污染控制和合成生物学底盘细胞中的应用	Halomonas alkalicola CICC 11012s及其突变体	合成生物学	NA	CRISPR技术、蛋白质组学、代谢组学	NA	蛋白质组数据、代谢组数据	野生型和突变体Halomonas alkalicola CICC 11012s
130	2025-03-20	A cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling 2025-Jan-13, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-024-01816-w PMID:39806069	研究论文	本文介绍了一种名为聚合酶链回收（PSR）的无细胞生物传感器信号放大电路，该电路利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录在DNA链置换电路中回收核酸输入	开发了一种新型的无细胞生物传感器信号放大电路PSR，通过T7 RNA聚合酶的脱靶转录实现核酸输入的回收，显著提高了生物传感器的灵敏度	未提及具体的局限性	扩展无细胞生物传感器的功能，提高其检测小分子的灵敏度	无细胞系统中的基因表达和传感	合成生物学	NA	聚合酶链回收（PSR）	NA	核酸	NA
131	2025-03-20	Fused radical SAM and αKG-HExxH domain proteins contain a distinct structural fold and catalyse cyclophane formation and β-hydroxylation 2024-Nov, Nature chemistry IF:19.2Q1 DOI:10.1038/s41557-024-01596-9 PMID:39294420	研究论文	本文揭示了一种包含N端自由基S-腺苷甲硫氨酸结构域和C端2-His-1-羧酸盐（HExxH）结构域的单一翻译后修饰酶的结构和功能	首次展示了自由基SAM结构域和HExxH结构域在单一酶中的融合，并揭示了这种酶催化三残基环芳烃形成和β-羟基化的功能	NA	研究一种新型翻译后修饰酶的结构和功能	包含N端自由基SAM结构域和C端HExxH结构域的酶	酶学	NA	晶体结构分析	NA	晶体结构数据	NA
132	2025-03-20	Modified Tn7 transposon vectors for controlled chromosomal gene expression 2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2 DOI:10.1128/aem.01556-24 PMID:39291982	研究论文	本文介绍了一种改进的Tn7转座子载体，用于控制染色体基因的表达	通过添加诱导型和组成型启动子，增强了mini-Tn插入载体的功能，实现了染色体上基因的差异转录控制	研究主要针对革兰氏阴性菌，未涉及其他类型细菌或真核生物	开发一种更灵活的染色体基因表达控制系统，以替代质粒在基因互补中的应用	K-12菌株MG1655的染色体	合成生物学	NA	染色体整合技术	NA	NA	NA
133	2025-03-19	Development of CRISPR-Cas9-based genome editing tools for non-model microorganism Erwinia persicina 2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.006 PMID:40092160	研究论文	本研究开发了基于CRISPR-Cas9的基因组编辑工具，用于非模式微生物Erwinia persicina的基因操作	成功应用CRISPR-Cas9系统于Erwinia persicina，通过优化gRNA设计和单质粒系统实现高效基因组编辑，并展示了其在合成生物学中的应用潜力	研究主要针对Erwinia persicina，未涉及其他非模式微生物的适用性验证	开发适用于非模式微生物Erwinia persicina的基因组编辑工具	Erwinia persicina细菌	合成生物学	NA	CRISPR-Cas9	NA	基因组数据	NA
134	2025-03-19	A dual light-controlled co-culture system enables the regulation of population composition 2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.012 PMID:40092159	研究论文	本研究开发了一种双光控共培养系统，能够动态调节种群比例，为代谢工程和合成生物学提供通用工具包	利用优化的色适应传感器/调节器（CcaS/R）系统和蓝光激活的YF1-FixJ-PhlF系统作为诱导模块，结合正交群体感应系统和毒素-抗毒素系统，实现了种群比例的动态调控	NA	开发一种能够动态调节种群比例的双光控共培养系统，以优化生物生产性能	微生物共培养系统	合成生物学	NA	光遗传学系统，群体感应系统，毒素-抗毒素系统	NA	NA	NA
135	2025-03-19	Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines 2025-May-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305 PMID:39854990	研究论文	本研究通过工程化改造P450BM3单加氧酶的活性位点，开发出新型人工生物催化剂，用于高效降解五种氯苯胺类环境污染物	通过将P450BM3中高度保守的苏氨酸268替换为天冬氨酸，成功诱导了过氧化物酶活性，显著提高了催化效率，且无需NAD(P)H或双功能小分子	NA	开发高效降解氯苯胺类污染物的生物催化剂	五种氯苯胺（4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺）	合成生物学	NA	UPLC-MS	NA	化学数据	五种氯苯胺
136	2025-03-19	A novel NAC36-MYB18-TAT2 model regulates the synthesis of phenolic acid in Salvia miltiorrhiza Bunge 2025-Apr, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140987 PMID:39952526	研究论文	本文揭示了丹参中NAC36-MYB18-TAT2分子模型调控酚酸合成的分子机制	首次报道了SmTAT2在丹参中的生物学功能及其调控机制，并揭示了NAC36-MYB18-TAT2分子模型在酚酸合成中的作用	NA	研究丹参中酚酸合成的分子机制	丹参（Salvia miltiorrhiza Bunge）	合成生物学	NA	转基因实验（过表达和CRISPR/Cas9）、分子相互作用实验（酵母单杂交、双荧光素酶报告基因实验和电泳迁移率实验）	NAC36-MYB18-TAT2模型	分子生物学数据	NA
137	2025-03-19	Natural, modified and conjugated carbohydrates in nucleic acids 2025-Mar-17, Chemical Society reviews IF:40.4Q1 DOI:10.1039/d4cs00799a PMID:39936337	review	本文综述了核酸中天然、修饰和共轭碳水化合物的研究进展，特别强调了在治疗应用、异源核酸（XNAs）开发以及核酸病因学探究方面的最新进展	强调了糖修饰在核酸中的重要性，特别是在治疗应用和异源核酸开发方面的创新	主要集中于糖修饰的综述，未涉及其他类型的核酸修饰	探讨核酸中糖修饰的主要动机及其在治疗、生物技术和合成生物学中的应用	核酸中的糖修饰	生物化学	NA	NA	NA	NA	NA
138	2025-03-19	Genetic encoding and expression of RNA origami cytoskeletons in synthetic cells 2025-Mar-17, Nature nanotechnology IF:38.1Q1 DOI:10.1038/s41565-025-01879-3 PMID:40097648	研究论文	本文介绍了在合成细胞中直接表达RNA折纸细胞骨架模拟物的方法，以替代依赖化学合成和热退火的DNA纳米结构	使用RNA折纸技术直接在合成细胞中表达细胞骨架模拟物，实现了在等温条件下自组装成微米级三维RNA折纸纳米管	NA	探索基于RNA的活性、可进化的合成细胞	合成细胞中的RNA折纸细胞骨架模拟物	合成生物学	NA	RNA折纸技术	NA	分子动力学模拟数据	NA
139	2025-03-19	Live-cell synthesis of biocompatible quantum dots 2025-Mar-17, Nature protocols IF:13.1Q1 DOI:10.1038/s41596-024-01133-5 PMID:40097832	研究论文	本文开发了一种在活细胞中合成量子点（QDs）的方法，并验证了其在多种细胞中的可行性	通过耦合细胞内代谢途径，实现了在活细胞中精确时空序列下合成量子点，解决了传统有机溶剂中合成的量子点生物相容性差的问题	需要具备化学、生物学、材料科学和合成生物学专业知识的用户才能完成该过程	开发一种生物相容性更好的量子点合成方法，以扩展其在生物医学领域的应用	酵母（Saccharomyces cerevisiae）、金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）、MCF-7细胞和MDCK细胞	材料科学	NA	活细胞合成、准生物合成	NA	NA	多种细胞类型（酵母、金黄色葡萄球菌、MCF-7细胞和MDCK细胞）
140	2025-03-19	Coacervates as enzymatic microreactors 2025-Mar-14, Chemical Society reviews IF:40.4Q1 DOI:10.1039/d4cs01203h PMID:40084439	综述	本文探讨了基于共聚物的微反应器在酶促反应中的应用及其机制	综述了共聚物微反应器在加速酶促反应中的创新机制，包括增强底物和酶浓度、稳定中间产物和提供分子拥挤环境	讨论了在共聚物中监测反应的挑战，并回顾了现有技术	探讨共聚物微反应器在生物催化、合成生物学和纳米技术中的潜力	共聚物微反应器及其在酶促反应中的应用	合成生物学	NA	荧光技术、色谱法、NMR光谱	NA	NA	NA