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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-04-10 |
Chemistry and biology of imidazole, oxazole and thiazole alkaloids
2026, The Alkaloids. Chemistry and biology
DOI:10.1016/bs.alkal.2025.12.002
PMID:41951284
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综述 | 总结了含咪唑、噁唑和噻唑环的五元氮杂环天然产物的最新研究进展,包括其来源、分离、结构表征、生物活性、化学合成及合成生物学应用 | 系统性地将相关生物碱按共同结构特征或生物来源进行分类,并涵盖了最新的合成生物学研究进展 | NA | 综述含咪唑、噁唑和噻唑环的天然生物碱的化学与生物学研究 | 含咪唑、噁唑和噻唑环的天然生物碱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现 |
| 122 | 2026-04-10 |
Advancements and expanding applications of CAR-T cell therapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1802718
PMID:41953032
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综述 | 本文综述了CAR-T细胞疗法在肿瘤学及免疫介导疾病中的进展与应用,包括其机制基础、工程策略、安全控制系统及面临的挑战 | 探讨了CAR-T疗法从血液恶性肿瘤扩展到自身免疫疾病和慢性病毒感染的新应用领域,并分析了通用型、同种异体工程策略及新型基因递送平台等前沿技术 | 存在可扩展性、制造标准化和长期免疫持久性等转化障碍,以及生物学和物流方面的重大挑战 | 评估CAR-T细胞疗法在肿瘤学和免疫介导疾病中的进展、应用潜力及未来发展方向 | CAR-T细胞疗法,包括其工程策略、安全控制系统和基因递送平台 | NA | 血液恶性肿瘤,自身免疫疾病(如多发性硬化症、系统性红斑狼疮),慢性病毒感染(如HIV、乙型肝炎) | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞 | 逻辑门控和可诱导系统 | 医学 |
| 123 | 2026-04-10 |
Deep learning on protein language model embeddings unlocks accurate prediction of protein solubility
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1716930
PMID:41953440
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研究论文 | 本文提出了一种名为DeepSolNet的深度学习模型,利用蛋白质语言模型嵌入来准确预测蛋白质溶解度 | 首次将先进的蛋白质语言模型ESM Cambrian与双向LSTM、CNN和注意力机制相结合,构建多模块架构用于溶解度预测,在独立测试集上达到最先进性能 | 模型在独立测试集上的准确率为0.53,仍有提升空间;未明确说明训练数据的具体来源和规模限制 | 开发准确预测蛋白质溶解度的工具,以解决原核表达系统中蛋白质错误折叠的问题 | 异源蛋白质,特别是大肠杆菌表达系统中的蛋白质 | 机器学习 | NA | 深度学习,蛋白质语言模型 | 双向LSTM,CNN,注意力机制 | 蛋白质序列 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学,蛋白质工程 |
| 124 | 2026-04-10 |
Decoding the Minimal Translation System of the Plasmodium falciparum Apicoplast: Essential tRNA-modifying Enzymes and Their Roles in Organelle Maintenance
2025-Aug-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169156
PMID:40335414
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研究论文 | 本研究通过鉴定恶性疟原虫顶质体必需的tRNA修饰酶,揭示了其最小翻译系统的组成与功能 | 首次系统鉴定了顶质体定位的tRNA修饰酶,并证明其中6个催化反密码子环修饰的酶对寄生虫生存和细胞器维持至关重要 | 有两个基因无法被敲除,其中一个可能具有顶质体外的必需功能,另一个的作用机制尚未完全阐明 | 阐明恶性疟原虫顶质体最小翻译系统中tRNA修饰酶的作用及其对细胞器维持的影响 | 恶性疟原虫顶质体中的tRNA修饰酶 | 合成生物学 | 疟疾 | 比较基因组学、蛋白质定位预测、基因敲除技术 | NA | 基因组数据、蛋白质定位数据 | NA | 基因敲除工具 | 恶性疟原虫 | NA | 医学 |
| 125 | 2026-04-10 |
A roadmap to understanding and anticipating microbial gene transfer in soil communities
2025-Jun-25, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00225-24
PMID:40197024
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综述 | 本文探讨了土壤微生物群落中基因转移的预测与理解,旨在为合成生物学技术在土壤应用中的风险评估提供路线图 | 提出通过建立土壤标准和利用新兴技术测量基因转移宿主范围,以构建社区尺度、环境特异性模型来预测生物技术风险 | NA | 提高对土壤微生物群落中基因转移过程的理解,以评估合成DNA在环境中的无意转移风险 | 土壤微生物群落和工程微生物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境微生物 | NA | 环境, 农业, 能源, 食品安全 |
| 126 | 2026-04-10 |
Genetic Engineering Approaches for the Microbial Production of Vanillin
2024-11-06, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111413
PMID:39595589
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综述 | 本文综述了利用基因工程和合成生物学方法提高微生物生产香兰素的研究进展 | 总结了通过基因工程和合成生物学在微生物中增强或构建香兰素生物合成途径的创新策略 | NA | 开发生物技术方法以替代化学合成,满足对天然香兰素的需求 | 香兰素生物合成途径、相关基因与酶、微生物底盘 | 合成生物学 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 天然产香兰素微生物、微生物底盘 | 香兰素生物合成途径 | 食品、工业生物技术 |
| 127 | 2026-04-10 |
Identification, Design, and Application of Noncoding Cis-Regulatory Elements
2024-08-05, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14080945
PMID:39199333
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综述 | 本文综述了非编码顺式调控元件的识别、设计与应用,强调了其在生物功能调控中的核心作用及技术进展 | 整合了ENCODE项目、高通量检测技术(如大规模并行报告基因分析)和深度学习算法(特别是大型语言模型),用于顺式调控元件的预测与从头设计 | NA | 探讨顺式调控元件的识别、功能解析及其在基因治疗、育种和合成生物学中的应用 | 顺式调控元件及其与转录因子、RNA结合蛋白和非编码RNA的相互作用 | 计算生物学 | NA | 大规模并行报告基因分析、深度学习算法、大型语言模型 | 大型语言模型 | 功能基因组数据、核苷酸序列 | NA | NA | NA | NA | 医学、农业、工业生物技术 |
| 128 | 2026-04-10 |
Utilizing Plant Synthetic Biology to Improve Human Health and Wellness
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.691462
PMID:34504505
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综述 | 本文综述了植物合成生物学在改善人类健康和福祉方面的潜力,包括生产药物、营养素和营养保健品,并讨论了相关技术挑战 | 利用植物合成生物学工具将代谢途径转移到更易培养的植物中,以增强复杂药物的生产能力,并强化作物的营养和营养保健品含量 | 存在技术挑战,阻碍了植物生产促进健康的小分子化合物的能力 | 探讨植物合成生物学如何通过生成生产药物、营养素和营养保健品的植物来改善人类健康 | 植物及其代谢途径,用于生产生物活性化学品 | 合成生物学 | NA | 植物合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 代谢途径转移 | 医学, 农业 |
| 129 | 2026-04-09 |
Protein coacervation-driven active forces power protocell dynamics
2026-Apr-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71593-8
PMID:41946707
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研究论文 | 本文通过工程化温度响应性弹性蛋白基原型细胞模型,探索了蛋白质凝聚体作为主动力生成器的机制及其在合成生物学中的应用潜力 | 首次展示了蛋白质凝聚体如何通过温度调控的收缩性放大皮牛顿级力,实现大规模机械功,并建立了数学模型框架 | 研究主要基于工程化原型细胞模型,实际生物系统中的协调性和力缩放机制仍需进一步探索 | 研究蛋白质凝聚体驱动的主动力生成机制及其在合成生物学和软机器人领域的应用 | 温度响应性弹性蛋白基原型细胞模型及其蛋白质凝聚体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质液-液相分离(LLPS)、温度调控实验 | 数学模型 | 实验数据、模型模拟数据 | NA | 工程化原型细胞设计 | 原型细胞(非自然生物体) | 温度响应性弹性蛋白膜系统,用于调控收缩和膜出芽动态 | 合成生物学、生物材料、软机器人 |
| 130 | 2026-04-09 |
Coevolution of plant-microbe interactions, friend-foe continuum, and microbiome engineering for a sustainable future
2026-Apr-06, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.01.010
PMID:41618562
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综述 | 本文综述了植物与微生物在约4.5亿年间的协同进化关系,提出了一个基于深度时间、三大支柱的框架,并探讨了如何利用协同进化原理指导作物改良与可持续农业 | 提出了一个整合深度时间(器官发生、根系进化、免疫守门)与当代全息组表型的协同进化框架,并围绕成本效益与临界点框架组织“友敌连续体”,将协同进化原理转化为可操作的微生物组工程设计规则 | NA | 理解植物-微生物协同进化关系,并利用这些原理指导作物改良与可持续农业发展 | 植物-微生物互作关系,包括共生、共栖与致病关系 | NA | NA | 基因组编辑,合成生物学,人工智能,微生物组工程 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 131 | 2026-04-09 |
Microbial lipases: Catalyzing sustainable solutions for industrial innovations
2026-Apr-03, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2026.110869
PMID:41946009
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综述 | 本文综述了微生物脂肪酶作为多功能生物催化剂在工业创新中的关键作用,涵盖其来源、筛选、生产、表征及工业应用 | 强调了合成生物学、宏基因组学、CRISPR-Cas技术、酶工程和AI辅助建模相结合的革命性策略,用于识别和定制具有特定特性的脂肪酶 | NA | 探讨微生物脂肪酶在可持续工业解决方案和绿色化学中的应用潜力 | 微生物脂肪酶(来自细菌、真菌和酵母) | NA | NA | 合成生物学、宏基因组学、CRISPR-Cas技术、酶工程、AI辅助建模 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 细菌(如芽孢杆菌属、无色杆菌属、产碱杆菌属、节杆菌属、假单胞菌属)、真菌(如青霉菌属) | NA | 生物燃料、食品饮料、洗涤剂、纺织、皮革、制药、医疗 |
| 132 | 2026-04-09 |
Yeast-based green nanoparticle synthesis: past, present and future in nanomedicine
2026-Apr, Nanomedicine (London, England)
DOI:10.1080/17435889.2026.2642296
PMID:41797356
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综述 | 本文综述了酵母作为生物平台在绿色合成纳米颗粒方面的历史进展、当前生物医学应用及未来在纳米医学中的潜力 | 系统阐述了酵母合成纳米颗粒的独特优势(如稳健性、遗传可操作性、可扩展性和安全性),并展望了合成生物学和生物过程工程在未来推动其成为生产医疗级纳米材料可行策略中的作用 | 临床转化仍受限于缺乏标准化的GMP合规生产、全面的毒性和免疫原性评估以及明确的监管框架 | 探讨酵母衍生纳米颗粒在纳米医学中的应用潜力与挑战 | 酵母合成的纳米颗粒(如银、金、硒纳米颗粒) | NA | 癌症 | 遗传工程、生物合成 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 医学 |
| 133 | 2026-04-09 |
Protein-free membrane fusion: A refined view of the delicate fusogenic properties of calcium
2026-Mar-19, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.03.040
PMID:41863074
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研究论文 | 本文通过微流控捕获平台和共聚焦显微镜,量化了钙离子介导的巨型单层囊泡融合,揭示了其无蛋白质条件下的精细融合特性 | 首次直接量化钙离子诱导的巨型单层囊泡融合,系统映射融合效率与钙浓度、膜组成和机械张力的关系,澄清了基于不同囊泡尺寸的钙融合测定之间的长期差异 | 钙诱导的融合在无蛋白质条件下极其不稳定且对组成敏感,需要囊泡在稳定性和不稳定性之间达到微妙平衡,限制了其广泛应用 | 研究钙离子作为独立融合剂在细胞尺寸膜中的融合能力,为合成生物学和膜重构研究提供定量设计规则 | 巨型单层囊泡(GUVs),特别是含高比例DOPE的带负电荷囊泡 | 合成生物学 | NA | 微流控捕获平台、共聚焦显微镜 | NA | 图像数据(来自显微镜) | 数百个单囊泡 | NA | NA | NA | 合成生物学、膜重构研究 |
| 134 | 2026-04-09 |
CO2-driven biosurfactant synthesis by bacteria within CCUS
2026-Feb-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13761-w
PMID:41741775
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综述 | 本文综述了微生物在CCUS框架内通过CO2捕获驱动生物表面活性剂合成的代谢与工程方面,探讨了其工业应用及合成生物学进展 | 整合了CO2利用、生物技术和数字创新,提出了通过合成生物学将碳固定模块与生物表面活性剂途径连接的新策略 | 面临技术和经济挑战,具体实施细节和规模化可行性未详细讨论 | 探讨微生物CO2捕获与生物表面活性剂生产相结合的策略,以实现温室气体减排和可持续生物制造 | 微生物(细菌)在CCUS系统中的代谢过程及生物表面活性剂合成 | 合成生物学 | NA | 基因工程、合成生物学、系统级建模、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌(具体种类未指定) | 碳固定模块与生物表面活性剂生物合成途径的连接 | 环境, 工业生物技术 |
| 135 | 2026-04-09 |
Causes and consequences of experimental variation in Nicotiana benthamiana transient expression
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69458-1
PMID:41690913
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研究论文 | 本研究系统分析了本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源,并建立了变异模型以指导实验设计 | 首次对本氏烟草农杆菌浸润瞬时表达系统的实验变异进行全面建模分析,并基于三年纵向数据提出降低变异性的实用指南 | 研究主要针对本氏烟草系统,结论可能不完全适用于其他植物瞬时表达体系 | 探究本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源及其影响,建立减少变异性的实验设计框架 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana)农杆菌浸润瞬时表达系统 | 合成生物学 | NA | 农杆菌浸润瞬时表达技术 | 变异统计模型 | 植物基因表达数据 | 1915株植物(三年纵向数据) | 农杆菌介导的基因递送 | 本氏烟草 | 瞬时基因表达系统 | 农业, 工业生物技术 |
| 136 | 2026-04-09 |
Bacteriophage research in India and its implications for human health: A scoping review
2026-Feb, The Indian journal of medical research
DOI:10.25259/IJMR_2923_2025
PMID:41949138
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综述 | 本文通过范围综述系统调查和分类了印度开展的噬菌体研究,重点关注其对人类健康的明确意义 | 首次对印度噬菌体研究进行全面范围综述,系统识别了研究现状、应用领域及关键差距 | 纳入研究以实验室环境为主,临床和转化研究极少,缺乏人类受试者或临床试验设计的研究 | 系统调查印度噬菌体研究的现状,评估其对人类健康的潜在影响及转化差距 | 印度开展的噬菌体或噬菌体疗法相关原始研究(涉及人类、动物或环境) | NA | NA | NA | NA | NA | 从4756项研究中最终纳入111项研究 | NA | NA | NA | 医学 |
| 137 | 2026-04-09 |
Engineered bacteria for cancer therapy: Advancements, challenges, and future directions
2025-Dec-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003807
PMID:41243447
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综述 | 本文综述了工程化细菌在癌症治疗中的最新进展、挑战和未来方向,重点探讨了其作为新型治疗平台的潜力 | 利用工程化细菌选择性定植肿瘤微环境,作为局部递送治疗剂和激发抗肿瘤免疫反应的创新平台 | NA | 探讨工程化细菌在癌症治疗中的应用,以克服传统疗法的局限性 | 工程化细菌及其在癌症治疗中的设计和应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 可编程生产抗癌有效载荷的合成生物电路 | 医学 |
| 138 | 2026-04-09 |
Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics
2024-12-27, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67659
PMID:39803963
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于开源硬件的微流控工作流程,用于分析质粒保留,通过培养单细胞于凝胶微滴中并使用荧光显微镜量化微菌落 | 采用开源硬件微流控技术,结合荧光蛋白表达和非特异性DNA染色,实现高通量质粒稳定性分析,相比传统平板计数具有更高统计能力 | 研究主要聚焦于大肠杆菌作为实验模型,方法虽具通用性但需进一步验证于其他生物体 | 开发一种开源微流控工作流程,用于分析质粒在无抗生素选择下的保留情况 | 质粒在单细胞中的表达和保留,以及微菌落的量化 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、荧光显微镜、DNA染色 | NA | 图像数据 | NA | 开源硬件 | 大肠杆菌 | 质粒表达荧光蛋白,用于构建生物传感器或标记系统 | 工业生物技术、环境、医学 |
| 139 | 2026-04-09 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 本文介绍了一种通过可编程基因可用性时序控制,利用位点特异性重组酶在合成生物传感器电路中实现数字切换的方法,显著降低了泄漏并提高了动态范围 | 利用位点特异性重组酶对多基因电路中的基因可用性进行可编程时序控制,以纠正瞬态传递中的非稳态过程,从而减少泄漏并增强电路性能 | NA | 开发一种通过时序控制基因可用性来改善合成生物传感器电路性能的方法 | 内源性microRNA(miRNA)的比例传感器和细胞类型分类 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA | 位点特异性重组酶 | NA | 比例传感器电路,涉及抑制器组件及其抑制目标的去同步化设计 | 医学 |
| 140 | 2026-04-08 |
Precision-engineered starch: Integrating metabolic engineering and cell-free synthetic biology for sustainable bioplastics and functional foods
2026-Jun-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2026.125146
PMID:41943368
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综述 | 本文综述了通过代谢工程和无细胞合成生物学技术,从下游修饰转向精确生物合成设计,以开发可持续生物塑料和功能性食品用淀粉的最新进展 | 整合了植物代谢工程(特别是CRISPR-Cas基因组编辑)和无细胞合成生物学平台,将淀粉开发从传统下游修饰转向精确的生物合成工程,实现结构可控、高纯度、可重复生产的淀粉设计 | NA | 开发具有特定营养品质、技术功能和可持续性目标的下一代生物基材料——工程化淀粉 | 淀粉生物合成途径、淀粉颗粒结构(直链淀粉-支链淀粉比例、链长分布、磷酸酯化等)及其与理化性质、消化性、血糖反应和抗性淀粉形成的关系 | NA | NA | 代谢工程、CRISPR-Cas基因组编辑、无细胞合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 植物(主要作物) | 淀粉生物合成途径(涉及颗粒结合淀粉合酶、可溶性淀粉合酶、淀粉分支酶和脱支酶的协调作用) | 农业, 食品, 材料, 工业生物技术 |