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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-02-22 |
A Bacteroides synthetic biology toolkit to build an in vivo malabsorption biosensor
2026-Feb-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.12.052
PMID:41610848
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研究论文 | 开发了针对Bacteroides thetaiotaomicron的合成生物学工具包,用于构建体内吸收不良生物传感器 | 首次为Bacteroides thetaiotaomicron开发了包含可抑制启动子、DNA调控系统、模块化转录报告电路和替代质粒整合模式的遗传工具包 | 工具包仅在体外和小鼠模型中验证,尚未在人体中测试 | 开发用于肠道环境监测的非侵入性生物传感器 | Bacteroides thetaiotaomicron细菌及其遗传调控系统 | 合成生物学 | 肠道疾病 | 遗传工程、荧光报告系统 | 生物传感器电路 | 荧光图像数据 | 小鼠模型 | 合成生物学工具包(包含启动子工程、DNA调控系统、报告电路设计) | Bacteroides thetaiotaomicron | 模块化荧光转录报告电路,用于检测肠道渗透压变化 | 医学(肠道健康监测) |
| 122 | 2026-02-22 |
Systems-level understanding of plant immune networks through single-cell and spatial omics
2026-Feb-19, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102870
PMID:41719893
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综述 | 本文综述了通过单细胞和空间组学技术系统理解植物免疫网络,包括受体激活、基因调控回路、蛋白质相互作用枢纽和染色质动态如何共同影响免疫结果 | 整合单细胞和空间组学揭示植物免疫激活的异质性,识别了专门的“PRIMER”细胞和“旁观者”细胞,并探讨了系统与合成生物学方法在作物抗病工程中的应用 | NA | 系统理解植物免疫网络,以指导作物更持久和广谱的抗病性工程 | 植物免疫系统,包括PTI、ETI、SAR、NLR受体、单细胞和空间组学数据 | NA | NA | 单细胞组学、空间组学、蛋白质组学、相互作用组学、结构分析 | NA | 组学数据(如单细胞、空间、蛋白质、相互作用数据) | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 123 | 2026-02-22 |
Super-enhancer-mediated transcriptional regulation of gene clusters in plants
2026-Feb-19, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102871
PMID:41719895
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研究论文 | 本文探讨了超增强子在植物基因簇(特别是生物合成基因簇)转录调控中的核心作用,及其在合成生物学和作物改良中的应用潜力 | 揭示了超增强子在协调植物生物合成基因簇共表达中的关键角色,并展示了通过CRISPR/Cas技术破坏超增强子可调控整个基因簇的表达 | NA | 研究超增强子如何介导植物基因簇的转录调控,以促进合成生物学、代谢工程和作物改良 | 植物基因组中的基因簇,包括同源基因簇和生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas诱导的缺失、T-DNA插入、染色质可及性数据集分析 | NA | 染色质可及性数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 拟南芥 | NA | 农业 |
| 124 | 2026-02-22 |
Xeno-nucleic acids support formation of Ag(I)-mediated duplexes and silver nanoclusters
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag132
PMID:41705510
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研究论文 | 本文研究了异源核酸(XNAs)在银离子介导下形成双链结构的能力及其对银纳米簇的光学性质调控作用 | 首次系统探索了不同骨架化学的XNAs与银离子的相互作用,揭示了骨架化学(而非仅碱基序列)可作为调控核酸-银纳米簇性质的新工具 | 未深入探讨XNAs-银纳米簇在生物体系中的实际应用性能,且未与其他金属离子进行系统性比较 | 探索异源核酸在金属介导的核酸结构和纳米材料领域的性质与应用潜力 | 具有不同骨架化学的异源核酸(XNAs)、银离子、银纳米簇 | 合成生物学、纳米材料 | NA | 圆二色光谱、质谱分析 | NA | 光谱数据、质谱数据 | 多种不同骨架组成的XNAs样本 | NA | NA | NA | 材料、纳米技术 |
| 125 | 2026-02-22 |
Recent advances in the synthesis and application of biomolecular condensates
2025-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108188
PMID:39814227
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综述 | 本文综述了通过相分离驱动的合成生物分子凝聚体(SBMCs)的最新进展,包括其构建原理、调控方法以及在基础与应用研究中的潜力 | 利用合成生物学方法从头合成生物分子凝聚体,并系统阐述其内在构建原理、调控方法及在染色体结构、疾病机制、生物制造等领域的应用 | 对生物分子凝聚体的内部组织和外部调控机制的理解仍处于早期阶段,未来在生物材料、生物技术和生物医学领域仍面临机遇与挑战 | 探讨合成生物分子凝聚体的构建方法、调控机制及其在基础科学与应用研究中的潜力 | 合成生物分子凝聚体(SBMCs) | 合成生物学 | 肿瘤发生、衰老 | 相分离、合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物材料、生物技术、生物医学、药物递送、人工细胞设计、生物制造 |
| 126 | 2026-02-21 |
Gene insertion and transcriptional regulation of Escherichia coli based on CRISPR-associated transposases
2026-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149850
PMID:41628878
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研究论文 | 本研究基于CRISPR相关转座酶开发了可编程工具MUSCULAR-CAST,实现了多顺反子表达盒的高效基因组整合,并开发了基因抑制工具Tn-CRISPRi,用于合成生物学中的底盘菌株工程 | 开发了基于IF型CRISPR相关转座酶系统Tn6677的可编程工具MUSCULAR-CAST,能够高效整合不同大小的多顺反子表达盒,并基于其靶向模块开发了具有广泛PAM序列适应性的基因抑制工具Tn-CRISPRi | 未明确说明工具在其他宿主生物中的适用性或大规模工业应用中的稳定性验证 | 开发高效的基因组整合和转录调控工具,以促进合成生物学中微生物细胞工厂的构建 | 大肠杆菌(Escherichia coli) | 合成生物学 | NA | CRISPR相关转座酶系统 | NA | NA | 涉及多种多顺反子表达盒(1-10K)及17个基因的抑制实验 | CRISPR-Cas9, CAST系统 | 大肠杆菌 | 多顺反子表达盒整合系统、基因抑制调控回路 | 工业生物技术 |
| 127 | 2026-02-21 |
Advancing Fast-Track Genome Engineering in Bacillus subtilis Phages
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00727
PMID:41538882
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研究论文 | 本文介绍了一种名为QuickPhage的快速、精确且成本效益高的噬菌体基因组工程方法,利用CRISPR-Cas9作为反选择系统,在Bacillus subtilis噬菌体SPP1中实现高效基因编辑 | 开发了QuickPhage方法,使用短至40个核苷酸的同源修复片段进行高效基因组编辑,能在一天内完成精确编辑,并成功应用于必需和非必需基因的删除及报告基因的插入 | NA | 加速噬菌体生物学研究、新功能发现和创新基因工程工具的开发 | Bacillus subtilis的模型裂解性siphovirus噬菌体SPP1 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Bacillus subtilis | 使用诱导系统合成调控蛋白质生产(如GFP),实现高达400倍的诱导水平 | 医学, 工业生物技术 |
| 128 | 2026-02-21 |
Biosynthesis of Indigoidine in Microorganisms: Strategies and Applications
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00800
PMID:41576205
|
综述 | 本文系统回顾了微生物中靛蓝苷的生物合成策略与应用,重点关注合成生物学技术在提高产量和拓展应用方面的进展 | 整合了微生物宿主系统、代谢与酶工程以及合成生物学技术,为靛蓝苷的工业化生产提供了全面的路线图 | 存在途径优化、产量提升和应用多样性方面的持续挑战 | 探讨微生物合成靛蓝苷的策略及其作为可持续蓝色染料替代品的应用 | 靛蓝苷及其在微生物中的生物合成 | 合成生物学 | NA | 非核糖体肽合成酶(NRPSs)介导的生物合成 | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | 微生物底盘菌株 | 靛蓝苷生物合成途径 | 纺织工业 |
| 129 | 2026-02-21 |
Miniaturized CRISPR: Ultra Compact Systems for In Vivo Delivery and Portable Diagnostics
2026-Feb-19, Annals of biomedical engineering
IF:3.0Q3
DOI:10.1007/s10439-026-04046-4
PMID:41712125
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综述 | 本文综述了小型化CRISPR系统(如Cas12f、CasX和迷你Cas9)在体内基因编辑和便携式诊断中的应用进展 | 总结了超紧凑CRISPR系统如何通过降低分子量和简化结构,克服传统SpCas9的递送和尺寸限制,并探讨AI辅助蛋白质设计和合成生物学带来的未来机遇 | NA | 综述小型化CRISPR系统在基因治疗和便携诊断中的进展与挑战 | 紧凑型Cas蛋白、引导RNA优化和小型化递送载体 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Cas12f, CasX | 哺乳动物细胞 | NA | 医学 |
| 130 | 2026-02-21 |
From fermentation to function: a critical review of lactic acid bacteria redesign for functional foods and precision nutrition
2026-Feb-19, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2026.2631641
PMID:41712255
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综述 | 本文全面综述了合成生物学、基因组编辑和人工智能如何推动乳酸菌从传统食品应用向功能性食品和精准营养领域发展 | 系统整合了CRISPR菌株改良、微流控高通量筛选、AI增强的精准设计以及连接微生物组特征与特定乳酸菌功能的个性化营养框架等创新策略 | 面临全球监管差异、基因工程乳酸菌的伦理问题、先进发酵技术规模化相关的技术挑战以及消费者接受度等重大障碍 | 探讨乳酸菌在提升发酵食品质量(包括质地、风味和营养益处)方面的贡献,并推动其在功能性食品和精准营养中的创新应用 | 乳酸菌 | 合成生物学与精准营养 | NA | CRISPR、微流控高通量筛选、人工智能、多组学平台 | NA | NA | NA | CRISPR | 乳酸菌 | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 131 | 2026-02-21 |
Generative AI for synthetic biology: Designing biological parts, circuits, and genomes
2026-Feb-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101533
PMID:41713401
|
综述 | 本文探讨了生成式人工智能与合成生物学的融合,重点关注其在生物部件、电路和基因组设计中的应用 | 利用生成式AI实现数据驱动的新型生物设计,具有可预测功能和上下文感知精度,标志着生物设计方法的根本性转变 | NA | 分析生成式AI如何推动合成生物学进入可预测、可编程系统的新时代 | 生物分子元件、遗传电路和基因组 | 合成生物学 | NA | 生成式人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | 逻辑门、生物传感器、代谢途径等 | 医学、农业、环境、能源、材料、食品、工业生物技术 |
| 132 | 2026-02-21 |
What problem do you hope bioengineering or synthetic biology approaches will enable us to tackle in the next decade?
2026-Feb-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101539
PMID:41713402
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2026-02-21 |
Macrophages: Redefining extracellular matrix architecture through phenotypic switches as therapeutic targets
2026-Feb-14, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
综述 | 本文综述了巨噬细胞在组织稳态和细胞外基质重塑中的核心作用,并探讨了靶向巨噬细胞表型转换的创新治疗策略 | 强调了巨噬细胞表型转换的时空精确调控是恢复组织稳态的基石,并提出了整合多组学、合成生物学和AI辅助生物材料开发“智能”治疗药物的未来方向 | 在实现时空精确调控以及平衡促修复与促纤维化结果方面仍存在挑战 | 阐明巨噬细胞生物学及其在细胞外基质重塑和疾病治疗中的转化潜力 | 巨噬细胞 | NA | NA | 多组学分析、合成生物学、AI辅助生物材料 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 134 | 2026-02-21 |
Multichannel genomic recording of biological information with ENGRAM
2026-Feb-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01322-w
PMID:41673323
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研究论文 | 本文提供了进行ENGRAM实验和分析数据的逐步协议,并讨论了其设计考虑、优势、局限性和应用 | ENGRAM利用prime编辑介导的插入来记录CRE活动,具有固有的多重化能力,例如四碱基对插入可代表多达256个不同CRE的活动,且与DNA Typewriter兼容以捕获信号顺序 | 需要用户具备分子生物学、哺乳动物细胞培养和DNA测序分析的基本技能,实验通常需5-6周完成 | 开发一种用于测量生物学时间动态的分子记录方法 | 顺式调控元件(CREs)的活动 | 合成生物学 | NA | DNA测序,prime编辑 | NA | DNA序列数据 | NA | CRISPR-Cas9(prime编辑),DNA Typewriter | 哺乳动物细胞 | 增强子介导的基因组记录电路,用于将CRE的瞬时活动转换为稳定的基因组记录 | 医学,工业生物技术 |
| 135 | 2026-02-21 |
Electron-Mediator-Free Microfluidic Photocatalytic Coenzyme Regeneration with 100% Conversion Efficiency within 126 S
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513720
PMID:41201076
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研究论文 | 本文设计了一种无电子介体的微流控光催化平台,用于高效再生辅酶NAD(P)H,实现了126秒内100%的转化效率和优异的生物活性选择性 | 开发了无电子介体的微流控光催化平台,通过直接电子-质子耦合机制,在超短时间内实现辅酶的高效、高选择性再生,并展现出卓越的长期运行稳定性 | NA | 开发高效、稳定的光催化辅酶再生系统,以推动生物催化、合成生物学和可再生能源领域的应用 | 辅酶NAD(P)H的再生 | NA | NA | 微流控技术、光催化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物催化, 合成生物学, 可再生能源 |
| 136 | 2026-02-21 |
Traceless Regulation of Genetic Circuitry
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202519848
PMID:41454732
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综述 | 本文综述了无痕物理诱导基因开关在合成生物学中的应用、挑战与前景 | 强调无痕物理信号(如光、热、声、磁、电和机械力)作为基因开关调控手段,相比化学诱导具有更高特异性、时空分辨率、灵活性和生物电子接口兼容性 | NA | 探讨物理诱导无痕基因开关在合成遗传电路调控中的影响、挑战及未来发展方向 | 物理诱导基因开关及其在合成生物学系统中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成遗传电路,包括基因开关作为调控元件 | 医学, 农业, 能源, 工业生物技术 |
| 137 | 2026-02-21 |
pH-Responsive Biomineralized Probiotic for Self-Amplifying Mucosal Vaccination: Gut-Engineered Antigen Factories Drive Targeted Cervical Tumor Regression
2026-Feb, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202510404
PMID:41482692
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研究论文 | 本文开发了一种口服生物杂交疫苗,利用pH响应性生物矿化枯草芽孢杆菌建立肠道抗原工厂,以持续产生HPV16 E7抗原,用于宫颈癌免疫治疗 | 通过pH响应性生物矿化技术增强益生菌的胃酸抗性和肠道滞留能力,实现持续抗原生产,并首次将合成生物学与刺激响应生物材料结合,开创自复制黏膜部署系统用于精准癌症免疫治疗 | 研究基于TC-1小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证,且长期安全性和免疫持久性需进一步评估 | 开发一种口服疫苗以增强宫颈癌免疫治疗效果,通过持续抗原暴露驱动靶向肿瘤消退 | HPV16 E7抗原、枯草芽孢杆菌、TC-1肿瘤模型小鼠 | 合成生物学 | 宫颈癌 | 生物矿化技术、免疫学分析 | NA | 实验数据 | TC-1小鼠模型 | 合成生物学 | 枯草芽孢杆菌 | 肠道抗原工厂设计,用于持续HPV16 E7抗原生产 | 医学 |
| 138 | 2026-02-21 |
Copper biosorption by Serratia plymuthica: crucial role of tightly bound extracellular polymeric substances in planktonic and biofilm systems
2026-Jan-16, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10245-6
PMID:41545695
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研究论文 | 本研究探讨了沙雷氏菌(Serratia plymuthica)菌株As3-5a(5)在浮游细胞和生物膜系统中对铜的生物吸附作用,重点关注紧密结合的胞外聚合物物质的关键角色 | 揭示了紧密结合的胞外聚合物物质(特别是蛋白质组分)在铜生物吸附中的关键作用,并证明了该菌株在真实电镀废水(pH 1.9)中仍能实现高效铜去除 | 未来研究需要通过合成生物学方法改进铜的螯合能力,并在真实工业废水条件下验证系统的可扩展性 | 开发高效的重金属生物去除系统,探索可持续的铜修复生物技术方法 | 沙雷氏菌(Serratia plymuthica)菌株As3-5a(5)及其胞外聚合物物质 | 环境生物技术 | NA | 生物吸附实验、电镀废水处理 | NA | 实验数据 | 使用烧结玻璃生物膜系统和浮游细胞系统进行测试 | NA | 沙雷氏菌(Serratia plymuthica) | NA | 环境、工业生物技术 |
| 139 | 2026-02-21 |
Live biotherapeutics: Emerging trends and future directions in microbial therapy
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.12.001
PMID:41714074
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综述 | 本章概述了活体生物治疗产品(LBPs)的定义、作用机制、临床应用、监管框架以及未来发展趋势 | 强调了LBPs与传统益生菌、益生元和合生元的区别,并展望了其在代谢、神经和免疫介导疾病等胃肠道以外领域的应用潜力,以及合成生物学、CRISPR基因组编辑和多组学技术如何推动其向更精准和个性化的疗法发展 | LBPs的临床开发面临菌株选择、复杂制造工艺、在脆弱共病人群中的活性和安全性问题,以及应对不断演变的监管框架等关键挑战 | 概述活体生物治疗产品(LBPs)的现状、作用机制、临床应用、监管环境及未来方向 | 活体生物治疗产品(LBPs) | NA | NA | 合成生物学、CRISPR基因组编辑、多组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 140 | 2026-02-21 |
Advancements in technology for developing recombinant live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.006
PMID:41714076
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综述 | 本章综述了重组活体生物治疗药物(rLBPs)开发的最新进展,包括利用合成生物学、基因工程、多组学和人工智能/机器学习方法设计用于恢复微生物平衡、调节免疫和治疗特定疾病的工程化微生物 | 整合了合成生物学、多组学和AI/ML等前沿技术来设计和优化重组活体生物治疗药物,强调通过局部作用或肠-体轴相互作用实现精准治疗 | 在可扩展性、安全性和临床应用方面仍面临重大挑战,需要持续的创新、严格的临床评估和转化策略 | 开发用于人类健康治疗的下一代重组活体生物治疗药物 | 基因和代谢工程化的微生物物种 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因工程、多组学、人工智能/机器学习 | NA | NA | NA | 基因工程 | 微生物物种 | 用于恢复微生物平衡、调节免疫和治疗特定疾病的工程化微生物 | 医学 |