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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-07-12 |
Hydrazinoacetic acid is a biosynthetic precursor of the bacterially produced nitramine, N-nitroglycine
2026-06-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00631-26
PMID:42159495
|
研究论文 | 本研究揭示了肼基乙酸是细菌产生的硝胺——N-硝基甘氨酸的生物合成前体 | 首次阐明天然产物N-硝基甘氨酸的生物合成途径,发现肼基乙酸是其关键前体,并验证了赖氨酸为硝基氮的来源,通过基因簇重建和同位素标记实验确认了合成路线 | 研究未完全阐明硝胺生物合成的全部步骤,且生物合成途径在工业生产中的可持续性尚需进一步开发 | 阐明细菌产生的硝胺天然产物N-硝基甘氨酸的生物合成机制 | 链霉菌属细菌(Streptomyces)及N-硝基甘氨酸 | 合成生物学 | NA | 稳定同位素标记、液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)、生物信息学分析、基因簇重建 | NA | 同位素标记数据、蛋白质组学数据、晶体结构数据 | 使用多种同位素标记前体(L-赖氨酸、甘氨酸、肼基乙酸)进行培养实验,样本数量未明确说明 | NA | 链霉菌属细菌(Streptomyces) | N-硝基甘氨酸的生物合成途径,涉及肼基乙酸的生成及硝胺中间体 | 工业生物技术、能源(含能材料) |
| 122 | 2026-07-12 |
Membrane-Based Assembly and Interactions in Immune Receptors
2026-Apr-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00993
PMID:41865294
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综述 | 综述了免疫受体的膜基组装与相互作用,重点关注其模块化结构及跨膜结构域在信号转导中的作用 | 系统总结了免疫受体在脂双层中组织的分子原理和结构基序,揭示了跨膜结构域特异性相互作用的重复模式及其在合成生物学中的应用潜力 | NA | 理解免疫受体的构建机制及膜内分子相互作用对其结构与功能的影响 | 免疫受体(如配体结合模块和信号模块组成的跨膜蛋白)及其跨膜结构域 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 123 | 2026-07-12 |
Protein-free membrane fusion: A refined view of the delicate fusogenic properties of calcium
2026-Apr-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.03.040
PMID:41863074
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研究论文 | 直接量化了钙离子介导的巨型单层囊泡融合,揭示了其在无蛋白条件下作为融合剂的有效性和局限性 | 使用微流体捕获平台结合共聚焦显微镜,首次在单个囊泡水平上系统测量钙离子介导的膜融合效率,澄清了以往小泡和大泡实验中存在的矛盾 | 钙离子驱动的膜融合对膜成分和张力高度敏感,参数空间狭窄,限制了其在人工细胞构建中的广泛应用 | 量化无蛋白条件下钙离子作为膜融合剂的有效性,并建立设计规则以用于合成生物学和膜重构研究 | 巨型单层囊泡(GUVs)和用于比较的小型单层囊泡(LUVs) | 合成生物学 | NA | 微流体捕获平台、共聚焦显微镜 | NA | 图像 | 数百个单个巨型单层囊泡 | NA | NA | NA | 合成生物学、膜重构研究 |
| 124 | 2026-07-12 |
Vacuum and Sonication Treatment Enable Efficient Transient Gene Expression in Various Monocot and Eudicot Plant Seedlings
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00855
PMID:41865287
|
研究论文 | 介绍VAST方法,通过真空和超声处理显著提高单子叶和双子叶植物幼苗的瞬时基因表达效率 | 通过系统优化植物生长条件并整合真空浸润和超声预处理,在最小化组织损伤的同时大幅提升基因表达效率,并成功转化多种重要作物 | 未提及 | 开发高效、通用且简单的植物瞬时转化方法以加速功能基因组学和合成生物学研究 | 多种单子叶和双子叶植物幼苗,包括番茄、狗尾草、柳枝稷、玉米和小麦 | 数字病理学 | NA | 真空浸润、超声处理、根癌农杆菌共培养 | NA | NA | 多种植物幼苗(具体数量未提供) | NA | 烟草、番茄、狗尾草、柳枝稷、玉米、小麦 | NA | 农业、生物技术 |
| 125 | 2026-07-12 |
The cancer-microbiome axis: Mechanisms and emerging therapeutic strategies
2026-04-16, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-026-01072-1
PMID:41989595
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综述 | 总结癌症-微生物组轴的机制及新兴治疗策略 | 系统综述了从粪便微生物群移植到减量策略(包括单个菌株、定义菌群和工程微生物)的进展,并探讨了微生物调节与传统癌症治疗的交互作用 | 存在变异性、标准化和机制不确定性等挑战,技术性和生物性障碍仍然显著 | 探索微生物组在癌症发展、进展和治疗反应中的作用及基于微生物的治疗策略 | 人类微生物组(特别是细菌)与宿主免疫和代谢途径的相互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 测序和功能分析 | NA | 文本 | NA | 工程微生物 | 人体微生物组 | 免疫调节因子递送电路 | 医学 |
| 126 | 2026-07-12 |
Next-generation strategies for PLA degradation: microbial consortia, metagenomics, enzyme engineering and AI-guided approaches
2026-Mar-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04726-8
PMID:41863619
|
综述 | 本文综述了增强聚乳酸(PLA)在多种生态系统中生物降解的微生物和生物技术策略的最新进展,包括昆虫肠道微生物群筛选、真菌分离、宏基因组学及人工智能辅助酶工程等方法 | 首次系统整合了合成生物学、定向进化和人工智能在PLA降解酶工程中的应用,提出了多学科策略加速工业堆肥、废水处理和生物修复中PLA降解的路线图 | 未涵盖具体实验验证数据或定量比较不同策略的效率,且对实际应用中的经济性和规模化挑战讨论有限 | 探索并总结利用微生物群、宏基因组学、酶工程和人工智能技术加速PLA生物降解的策略 | PLA降解相关的微生物群落、真菌物种、降解酶(如解聚酶)以及AI模型 | 机器学习 | NA | 宏基因组学、环境DNA(eDNA)、人工智能、机器学习、定向进化 | 机器学习模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 哺乳动物细胞, 植物 | 合成生物回路(如切换开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢通路) | 环境, 工业生物技术 |
| 127 | 2026-07-12 |
Engineering and Evaluation of Sinorhizobium meliloti Nodulation (nod) Gene Reporter Systems in Rhizobia and Non-Rhizobia
2026-Mar, Environmental microbiology
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/1462-2920.70284
PMID:41858307
|
研究论文 | 开发并评估了一种基于结瘤基因报告系统,用于筛选能够表达苜蓿中华根瘤菌结瘤基因的根瘤菌和非根瘤菌 | 构建了基于超折叠GFP和mScarlet-I的双荧光报告系统,可高通量筛选能响应植物信号并表达结瘤基因的新型细菌 | 未明确说明局限性 | 开发有效工具以识别可工程化的相容微生物伙伴,增强非豆科植物的生物固氮能力 | 苜蓿中华根瘤菌结瘤基因报告系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 生物荧光图像 | 多种根瘤菌和非根瘤菌菌株 | NA | 根瘤菌和非根瘤菌 | nod基因报告系统(包含nodD1-PnodA和nodD2-PnodA双荧光标记) | 农业, 环境 |
| 128 | 2026-07-12 |
Synthetic soils for ecological and synthetic biology applications
2026-Jan-02, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuag012
PMID:41860425
|
综述 | 本文综述了合成土壤在生态学和合成生物学中的应用,探讨其优势、局限性及未来发展 | 提出了‘合成土壤’作为标准化可控实验平台的概念,系统总结其在模拟自然土壤理化特性并研究生物响应方面的应用 | 合成土壤可能无法完全复制自然土壤的复杂性和异质性,且现有研究尚未充分验证其生态相关性 | 探索合成土壤在生态学和合成生物学研究中的优势、局限及未来发展方向 | 合成土壤系统及其对微生物、植物、土壤动物等生物组分的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生态学, 合成生物学 |
| 129 | 2026-07-12 |
The Cross-Species Implantable ATP Battery Inspired by Photosynthesis for Application in Diseases
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S569114
PMID:41858590
|
综述 | 探索受光合作用启发的跨物种植入式ATP电池在疾病中的应用 | 提出一种人工光合系统,能在人体细胞内自主再生ATP,直接对抗疾病进展中的代谢缺陷,整合合成生物学、材料科学和靶向递送策略 | 未提及具体实验验证或临床数据,可能处于理论或概念阶段 | 评估基于光合作用原理的植入式ATP电池在多种疾病中的治疗可行性 | 人体细胞中的ATP再生系统,包括光氧化模块、光磷酸化模块和封装系统 | 合成生物学 | 肿瘤、组织损伤、神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 人体细胞 | 人工光合系统,包括光氧化模块、光磷酸化模块和封装系统 | 医学 |
| 130 | 2026-07-12 |
Systems biology can provide guidance to synthetic biology in the pursuit of new drug targets
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1770107
PMID:41971098
|
研究论文 | 通过案例分析,展示系统生物学分析如何引导药物靶点发现,并分析生理反馈回路对直觉的误导 | 结合系统生物学动态建模揭示生理反馈回路的反直觉特性,为合成生物学在药物干预设计中的应用提供新视角 | 仅基于简化线性代谢途径模型,未涉及完整体内实验验证或临床数据 | 为合成生物学在寻找新药物靶点过程中提供系统生物学指导 | 涉及NQO1(NAD(P)H:醌氧化还原酶1)的癌症相关氧化还原回路 | 系统生物学 | 癌症 | 系统生物学分析 | 动态建模 | NA | NA | NA | NA | 正反馈回路 | 医学 |
| 131 | 2026-07-12 |
Programmable saponin biosynthesis from gene networks to predictive biomanufacturing
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1800149
PMID:41971552
|
综述 | 本文综述了皂苷生物合成从通路解析到可预测与可编程生物制造的最新进展,重点介绍了基于基因网络的合成生物学工具、酶工程和AI辅助设计在多平台生产中的应用 | 将皂苷研究从传统的路径描述转向预测性和可编程生物制造,提出了结合基因调控网络、合成生物学工具和AI辅助蛋白设计的通用框架,并强调通过设计-构建-测试-学习循环实现迭代优化 | 综述性文章,未提供具体实验数据或比较不同方法的优劣,且可能未涵盖所有最新进展 | 系统梳理皂苷生物合成的最新概念和技术进展,将其作为连接基因网络、调控逻辑和工业生物制造的模型系统,为复杂植物天然产物的可预测设计和规模化生产提供参考框架 | 皂苷类植物糖苷 | 机器学习, 合成生物学 | NA | 多组学分析, CRISPR, AI辅助蛋白设计 | NA | 基因组、多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成启动子, 转录因子重编程 | 工程微生物, 植物悬浮细胞, 毛状根, 不定根系统 | 代谢通路调控网络, 生物传感器 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 132 | 2026-07-12 |
Automated Genetic Engineering in the Laboratory
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5320-3_19
PMID:42423905
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研究论文 | 描述了一种用于构建大型多样化遗传设计文库的自动化DNA组装协议 | 将实验室自动化硬件软件平台与合成生物学工具相结合,实现高通量、可重复性和组合优化,支撑生物铸造厂概念 | NA | 提高实验通量和可重复性,探索多维生物设计空间 | 自动化DNA组装协议及遗传设计文库 | 合成生物学 | NA | DNA组装 | NA | NA | NA | 自动化平台 | NA | 遗传设计文库 | 生物工程 |
| 133 | 2026-07-12 |
Advances in phage therapy for Acinetobacter baumannii: mechanisms and applications
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1839739
PMID:42428312
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综述 | 探讨噬菌体疗法对抗多重耐药鲍曼不动杆菌的机制与应用进展 | 系统总结了噬菌体疗法的最新机制,包括受体介导的适应性代价使耐药菌株对抗生素恢复敏感性,以及PEGylation递送、光敏剂偶联噬菌体和嵌合裂解酶等前沿工程策略 | 临床试验仍以同情使用病例为主,存在噬菌体耐药性发展和患者反应异质性等挑战 | 评估噬菌体疗法作为多重耐药鲍曼不动杆菌感染替代治疗方案的潜力 | 多重耐药鲍曼不动杆菌及其噬菌体 | 数字病理学 | 感染性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 134 | 2026-02-06 |
Corrigendum to "Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications" [Biotechnology Advances 86 (2026) 108748]
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108816
PMID:41611037
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2026-07-10 |
From fragmented workflows to integrated pipelines: Bridging enzymatic DNA synthesis, assembly, and MutS-based error correction
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108941
PMID:42225240
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综述 | 本文回顾了酶促DNA合成、组装和基于MutS的纠错技术的集成方法,提出构建从片段化工作流到集成管线的基因合成流程 | 强调上游选择对下游结果的约束关系,提出基于MutS的酶促错配清除策略具有更优的纠错效率和流程兼容性,并论证酶促DNA合成与下游酶促过程的水相兼容性为构建连续自动化工作流创造了机会 | 未提供具体的实验验证或定量比较不同纠错策略的性能数据 | 探讨如何将酶促DNA合成、片段组装和MutS纠错整合为连续自动化工作流,以实现高保真、高通量和可扩展的基因与通路级DNA序列构建 | 酶促DNA合成、片段组装、基于MutS的纠错技术以及基因构建流程的集成 | 合成生物学 | NA | 酶促DNA合成、MutS酶促错配清除、基因组装 | NA | NA | NA | MutS | NA | NA | 合成生物学、生物技术 |
| 136 | 2026-07-10 |
Liquid-liquid phase separation in metabolic engineering: Mechanistic insights, emerging applications, and future challenges
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108931
PMID:42225537
|
综述 | 系统总结液-液相分离在代谢工程中的设计原理、分子决定因素和调控策略,及其在代谢通道、基因表达控制和可编程细胞功能模块构建中的应用 | 首次系统整合液-液相分离与人工智能/深度学习在代谢工程中的应用,建立序列-相行为定量关系,推动从经验设计向预测性工程框架转变 | 凝聚体老化及与宿主细胞环境的兼容性等关键挑战尚未完全解决,限制了下一代稳定可调凝聚体的开发 | 为合成生物学和代谢工程领域提供集成理论框架和前瞻性视角,促进基于液-液相分离的下一代可编程微生物细胞工厂平台开发 | 基于液-液相分离的人工凝聚体及其在代谢工程中的应用 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | NA | 深度学习 | 序列数据 | NA | NA | 微生物细胞 | 人工凝聚体(代谢通道、基因表达调控、可编程功能模块) | 工业生物技术, 医学 |
| 137 | 2026-07-10 |
Recent advances in microbial production of S-adenosyl-L-methionine and its high-value derivatives
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108948
PMID:42288128
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综述 | 综述了利用微生物生产S-腺苷-L-甲硫氨酸及其高价值衍生物的最新进展 | 重点总结了系统代谢工程和合成生物学在提高微生物系统中SAM生物合成、利用和循环方面的策略,特别是SAM在合成阿魏酸、麦角硫因、肌酸、亚精胺和β-甲基苯丙氨酸等代表性衍生物中的作用 | 当前挑战包括工业生产仍依赖化学合成,环境负担和可持续性问题尚未完全解决 | 推动微生物平台实现SAM及其高价值衍生物的可持续生物制造 | 微生物系统中的SAM及其衍生物(如阿魏酸、麦角硫因、肌酸、亚精胺和β-甲基苯丙氨酸) | 数字生物学 | NA | 系统代谢工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物(具体种类未提及) | SAM生物合成和循环途径 | 工业生物技术 |
| 138 | 2026-07-10 |
Breaking the photosynthetic monopoly on carbohydrate production through artificial synthesis
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108952
PMID:42303061
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综述 | 批判性审视超越光合作用限制的人工碳水化合物合成途径策略 | 提出通过人工智能驱动的催化剂设计、模块化合成生物学平台和可再生能源整合来突破光合作用局限的创新思路 | 辅因子再生效率低、催化剂选择性权衡和经济竞争力不足是当前实际应用的主要障碍 | 建立人工碳水化合物合成途径以超越光合作用的效率、空间和时间限制 | 三种人工碳水化合物合成途径:直接电化学CO₂还原、合成酶级联反应和杂合生物人工系统 | 合成生物学 | NA | 电化学还原、酶工程、生物人工系统 | NA | NA | NA | 模块化合成生物学平台 | NA | 人工碳水化合物合成途径 | 农业,能源,环境,工业生物技术 |
| 139 | 2026-07-10 |
Codon compression and novel codon creation for multiplex non-canonical amino acid incorporation
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108961
PMID:42342169
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综述文章 | 系统分类了用于多重非规范氨基酸整合的两种主要策略框架:自然密码子压缩和新型密码子创建 | 首次将多重非规范氨基酸整合策略系统分为密码子压缩和新型密码子创建两大框架,并提出结合部分密码子压缩、适应性实验室进化和人工智能辅助设计的集成未来流程 | 依赖于宿主适应性、编码容量和整合效率的多重约束因素分析,但未提供具体的实验验证数据 | 推进合成生物学中多重非规范氨基酸同时整合的关键前沿技术 | 非规范氨基酸的遗传编码系统及多重整合策略 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术、全基因组重编码、非天然碱基对技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白质工程、合成生物学 |
| 140 | 2026-07-10 |
Engineered microorganisms unlock a new era of diterpenoid biomanufacturing: recent advances and future perspectives
2026-Jul-09, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01094-5
PMID:42420691
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综述 | 总结了通过工程微生物生产二萜类化合物的最新进展,并展望了未来方向 | 系统综述了二萜类化合物在微生物细胞工厂中的生物合成途径构建和工程策略,强调了工业规模应用的潜力 | 未提供具体的实验数据或定量比较,可能缺乏对特定挑战的深入分析 | 探讨二萜类化合物微生物合成的进展、挑战和未来前景 | 二萜类化合物的生物合成途径和工程微生物菌株 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 解脂耶氏酵母, 圆红冬孢酵母 | 二萜类化合物生物合成途径 | 医药, 化妆品, 食品添加剂, 工业生物技术 |