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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-01-04 |
Bioengineering hybrid artificial life
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1676359
PMID:41477590
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综述 | 本文探讨了生物工程与人工生命(ALife)的融合,旨在通过标准化生物部件设计适应性、进化性的人工生命系统,以解决实际问题 | 提出了一种混合合成人工生命设计方法论,结合数字和生物进化设计方法,以克服当前合成人工生命在进化适应性和任务适应性方面的限制 | 当前合成人工生命在定向进化、适应度景观映射和适应度近似方面存在显著不足,导致其无法持续进化并适应变化的任务和环境 | 旨在解决合成人工生命在定向进化中的开放挑战,推动生物工程化问题解决型人工生命的实现 | 人工生命系统,特别是通过生物工程和合成生物学方法设计的适应性、进化性系统 | 合成生物学 | NA | 定向进化、遗传多样性生成、适应度映射、适应度估计 | NA | NA | NA | 标准化生物部件(如启动子、核糖体) | 微生物(如用于环境清理或抗体生产的工程微生物) | 问题解决型人工生命系统,可能涉及逻辑门、生物传感器或代谢途径 | 环境、医学、工业生物技术 |
| 122 | 2026-01-03 |
Programmable bacteria-driven biohybrid triggers spatiotemporal-controlled STING activation to potentiate cuproptosis-based cancer therapy
2026-May, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本研究提出了一种创新的生物杂交系统DB@CSCN,通过工程化大肠杆菌和CuS纳米颗粒协同诱导铜死亡并激活STING通路,用于高效肿瘤靶向精准免疫治疗 | 利用合成生物学方法构建了可时空控制释放STING激动剂的工程菌-纳米颗粒生物杂交系统,首次揭示了STING激活通过破坏肿瘤糖酵解代谢来增强铜死亡的协同机制 | 研究未明确说明动物模型的具体类型及样本量细节,且激光照射的临床转化可行性有待进一步验证 | 开发协同诱导铜死亡和激活STING通路的肿瘤靶向精准免疫治疗新策略 | 工程化大肠杆菌(DacA-Bac菌株)、CuS纳米颗粒及其构建的生物杂交系统DB@CSCN | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、基因工程、纳米技术、激光控制释放 | 生物杂交系统(工程菌-纳米颗粒复合体系) | 实验数据(包括体外细胞实验和体内动物模型数据) | NA | 合成生物学方法(具体工具未明确说明) | 大肠杆菌(Escherichia coli) | 基因编程工程菌生产STING激动剂cDA,并与CuS纳米颗粒功能化构建靶向释放系统 | 医学(肿瘤免疫治疗) |
| 123 | 2026-01-03 |
The cell biologist's guide to detecting and modulating membrane phospholipids
2026-Feb-02, The Journal of cell biology
IF:7.4Q1
DOI:10.1083/jcb.202508058
PMID:41481227
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综述 | 本文为细胞生物学家提供了检测和调控膜磷脂的实用工具指南 | 将脂质生物学工具系统化地整合到主流细胞生物学实验方法中,使原本技术难度较高的脂质可视化与操作变得广泛可及 | 部分方法仍存在技术要求较高的挑战 | 为分子细胞生物学家提供检测和调控细胞膜磷脂的实用实验框架 | 膜磷脂 | 分子细胞生物学 | NA | 免疫荧光、活细胞成像、药理学抑制、合成生物学平台、光遗传学系统 | NA | NA | NA | 合成生物学平台 | NA | 诱导性脂质生成或降解平台 | 基础生物学研究 |
| 124 | 2026-01-03 |
From Cellular Organization to Synthetic Platforms: Liquid-Liquid Phase Separation as a Framework for Functional Biomolecular Condensates
2026-Jan-02, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c20923
PMID:41480717
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综述 | 本文综述了液-液相分离(LLPS)在形成功能性生物分子凝聚体中的作用,并探讨了其在合成平台设计中的应用前景 | 利用LLPS原理设计具有可控组成、性质和活性的合成凝聚体,结合结构洞察、定量相行为和合成生物学工具,推动细胞生物物理学与生物工程学的交叉探索 | NA | 总结LLPS介导的凝聚体的分子机制、设计策略和转化前景,为细胞生物物理学与生物工程学接口的未来探索铺平道路 | 液-液相分离(LLPS)驱动的动态生物分子凝聚体及其合成设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 125 | 2026-01-03 |
Advances in the engineering of living probiotics for cancer immunotherapy
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.125301
PMID:41355950
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综述 | 本文综述了工程化活益生菌在癌症免疫治疗中的应用进展,包括细菌与肿瘤的复杂关系、细菌修饰的工程方法及其在增强癌症疗法中的应用 | 探讨了利用合成生物学等工程方法改造细菌以创建先进的基于细菌的药物递送系统,并展望了组合疗法、个性化医疗和微生物组在提高治疗效果中的潜力 | NA | 概述工程化活益生菌在癌症免疫治疗中的发展,以增强治疗疗效和安全性 | 细菌(特别是活益生菌)及其与肿瘤微环境和免疫系统的相互作用 | 合成生物学 | 癌症 | 测序技术、物理化学方法、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 细菌(如益生菌) | 基于细菌的药物递送系统 | 医学 |
| 126 | 2026-01-03 |
Biosensors for Cancer and Inflammation: Whole-Cell Biosensors for Soluble Molecules
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4901-5_25
PMID:41478986
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综述 | 本章节介绍了利用合成转录因子构建全细胞生物传感器,用于检测炎症和癌症生物标志物(如唾液中的神经氨酸)的流程 | 提出了一种基于定制转录因子的原核生物传感器菌株构建方法,以神经氨酸作为口腔癌生物标志物检测为例 | NA | 开发用于检测可溶性小分子(如癌症和炎症生物标志物)的全细胞生物传感器 | 全细胞生物传感器(WCBs),特别是基于合成转录因子的原核生物传感器菌株 | 合成生物学 | 口腔癌 | 合成生物学方法,包括遗传电路设计和转录因子工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 大肠杆菌(Escherichia coli MG1655) | 集成定制转录因子的遗传电路,用于检测神经氨酸 | 医学 |
| 127 | 2026-01-03 |
Identification of a group of UDP-glycosyltransferases catalyze emodin glycosylation in Rheum officinale with substrates promiscuity
2025-Dec-27, Phytochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.phytochem.2025.114763
PMID:41461342
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研究论文 | 本研究从药用植物掌叶大黄中鉴定并功能表征了六个催化大黄素糖基化的UDP-糖基转移酶,揭示了其底物混杂性及关键催化残基 | 首次系统鉴定掌叶大黄中催化大黄素糖基化的UGT酶群,通过分子对接与定点突变揭示了底物识别的关键氨基酸残基 | 未在活体植物或工程微生物中验证这些酶的代谢工程应用效果 | 解析掌叶大黄中蒽醌苷类活性成分的生物合成途径 | 掌叶大黄(Rheum officinale)中的UDP-糖基转移酶(UGTs) | 合成生物学 | NA | 生化分析、分子对接、定点诱变 | NA | 酶学数据、分子结构数据 | 六个鉴定出的UGT酶(RoUGT1,2,4,5,6,8) | 定点诱变 | NA | NA | 医药 |
| 128 | 2026-01-03 |
Temperature-Dependent Recombinase-Based Genetic Circuits
2025-Dec-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262412055
PMID:41465482
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研究论文 | 本文设计并表征了一套基于温度依赖的DNA重组酶遗传电路,通过整合RNA温度计实现基因表达的精确、不可逆控制 | 首次将RNA温度计与位点特异性DNA重组酶整合,实现了温度依赖的不可逆基因表达控制,并展示了空间图案生成、温度梯度记录和可控细胞裂解等创新应用 | 未明确说明电路的长期稳定性、在不同宿主中的普适性以及大规模应用时的能耗问题 | 开发温度调控的遗传电路以实现可编程、空间分辨且不可逆的基因表达控制 | 基于Bxb1丝氨酸重组酶和FourU RNA温度计的遗传电路系统 | 合成生物学 | NA | RNA温度计技术、位点特异性DNA重组技术 | NA | 基因表达数据、空间图案数据 | NA | CRISPR-Cas9(隐含于重组酶系统) | 大肠杆菌(根据合成生物学常规推断) | 温度敏感型重组开关电路,包含RNA温度计调控的重组酶表达模块 | 合成生物学, 生物传感, 生物生产 |
| 129 | 2026-01-03 |
Synthetic Pentatricopeptide Repeat Proteins: Building a Toolkit for Precise RNA Control
2025-Dec-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262412033
PMID:41465458
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综述 | 本文综述了合成五肽重复(synPPR)蛋白作为可编程RNA工程工具的最新进展,包括其设计原理、应用及在生物医学领域的潜力 | 利用可预测的氨基酸-核苷酸识别密码理性设计合成PPR蛋白,并将其与催化结构域融合,创建可在多种生物系统中实现精确碱基编辑的可定制酶 | NA | 总结PPR介导的RNA编辑的结构与机制原理,并探讨合成PPR蛋白在RNA工程中的应用前景 | 合成五肽重复(PPR)蛋白及其作为RNA结合因子和编辑工具的特性 | 合成生物学 | RNA介导的疾病 | 理性蛋白质设计、结构域融合 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌, 植物, 人类细胞 | 可编程RNA稳定器、翻译调节器、靶向C-to-U或U-to-C编辑器 | 基础研究, 生物技术, 生物医学 |
| 130 | 2026-01-03 |
Development of the Efficient Electroporation Protocol for Leuconostoc mesenteroides
2025-Dec-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262411933
PMID:41465360
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种适用于肠膜明串珠菌H32-02 Ksu菌株的高效、可重复的电穿孔转化方案 | 首次为该菌株建立了稳定可重复的转化方法,通过顺序优化细胞壁处理、电刺激参数和恢复条件,并结合质粒甲基化模式匹配,使转化效率提升约40倍 | 方法具有菌株特异性,可能不完全适用于其他乳酸菌,且未在更广泛的工业菌株中进行验证 | 克服肠膜明串珠菌的遗传操作障碍,为其代谢工程和合成生物学应用建立高效的基因转移技术 | 肠膜明串珠菌H32-02 Ksu菌株 | NA | NA | 电穿孔转化 | NA | NA | NA | 电穿孔 | 肠膜明串珠菌 | NA | 食品工业, 工业生物技术 |
| 131 | 2026-01-03 |
From Ancient Fermentations to Modern Biotechnology: Historical Evolution, Microbial Mechanisms, and the Role of Natural and Commercial Starter Cultures in Shaping Organic and Sustainable Food Systems
2025-Dec-10, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods14244240
PMID:41464947
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综述 | 本文回顾了天然发酵剂从古代自发发酵到现代生物技术的历史演变,探讨了其微生物机制、全球应用,并与商业发酵剂进行了对比,同时分析了其在有机和可持续食品系统中的角色与未来创新方向 | 系统性地将天然发酵剂的历史演变、微生物机制、全球应用与有机食品生产及可持续发展原则相结合,并探讨了组学技术、合成生物学等新兴创新如何在不损害其真实性的前提下提升其安全性、稳定性和功能性 | 当前监管框架主要集中于酵母,对更广泛的认证构成了挑战和机遇,且天然发酵剂的高微生物多样性虽带来功能韧性,但也引入了可变性和安全性挑战 | 探讨天然发酵剂在塑造有机和可持续食品系统中的作用,并分析其历史发展、微生物机制、应用现状及未来创新路径 | 天然发酵剂(由乳酸菌、酵母和丝状真菌组成的复杂微生物群落)及其在全球各类食品(谷物、豆类、乳制品、蔬菜、饮料、海鲜和肉类)中的应用 | NA | NA | 组学驱动的菌株选择、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 农业, 工业生物技术 |
| 132 | 2026-01-03 |
Autophagy-Mediated Adaptation: Revealing the Role of Autophagy in Plant Responses to Abiotic Stress
2025-Dec-07, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16121461
PMID:41465134
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综述 | 本文综述了自噬在植物响应干旱、盐分、极端温度和重金属毒性等多种非生物胁迫中的作用及其调控机制 | 系统整合了自噬在非生物胁迫下超越传统营养回收功能的新角色,包括作为胁迫信号传导、激素互作和代谢重编程的核心调控因子,并提出了利用基因组编辑、多组学整合分析和合成生物学等创新策略培育高抗逆作物的新方向 | NA | 阐明自噬在植物适应非生物胁迫中的调控网络,为设计在气候胁迫下保持高产和抗逆性的新一代作物提供理论基础 | 植物自噬过程及其在非生物胁迫响应中的功能 | NA | NA | 基因组编辑、多组学整合分析、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 133 | 2026-01-03 |
Microbial Valorization of Agricultural and Agro-Industrial Waste into Bacterial Cellulose: Innovations for Circular Bioeconomy Integration
2025-Nov-25, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13122686
PMID:41471891
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综述 | 本文综述了利用农业及农工业废弃物通过微生物发酵生产细菌纤维素(BC)的最新进展,并探讨其在循环生物经济中的整合潜力 | 系统总结了利用多样化农业废弃物作为低成本碳源生产细菌纤维素的技术路径,并整合了合成生物学、组学优化和过程创新等前沿方法以提高产量与功能化 | NA | 探讨农业废弃物微生物增值转化为细菌纤维素的技术创新及其在循环生物经济中的应用 | 农业及农工业废弃物(如果皮、甘蔗渣、谷物秸秆等)及其微生物转化过程 | NA | NA | 静态与动态发酵、共培养、分步营养供给、基因工程、组学指导优化 | NA | NA | NA | 基因工程, 合成生物学 | 细菌(具体菌种未明确列出) | NA | 食品包装, 生物医学, 化妆品, 先进生物复合材料 |
| 134 | 2026-01-03 |
Magneto-Photonic Gene Circuit for Minimally Invasive Control of Gene Expression in Mammalian Cells
2025-Nov-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.21.688514
PMID:41332601
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研究论文 | 开发了一种结合磁刺激和生物发光的基因回路,用于在哺乳动物细胞中无创控制基因表达 | 首次报道了由光和磁刺激共同激活的基因回路,利用磁敏感蛋白工程化改造了分裂型发光酶,实现了无需外部光源的光控系统 | 未在深层组织或活体动物中进行验证,磁刺激强度(50mT)的具体生物相容性和穿透性未详细讨论 | 开发无需外部光源、能精确控制基因表达的新型合成生物学工具 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、分子生物学、光遗传学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 光敏转录因子结合生物发光酶(分裂型,磁控重组)的基因回路,实现光与磁双刺激激活的逻辑门 | 医学(基因治疗、诊断) |
| 135 | 2026-01-03 |
Light-controlled synthetic communication networks via paired connexon nanopores
2025-Nov-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66621-y
PMID:41274894
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研究论文 | 本文通过工程化连接蛋白通道,在脂质体合成细胞中构建了光控合成通信网络 | 利用正交连接蛋白(连接蛋白43和连接蛋白32)设计UV和近红外响应通道,实现合成细胞间正交信号分子传输 | NA | 模拟生物细胞间通信网络,构建合成细胞通信系统 | 脂质体合成细胞和工程化连接蛋白通道 | 合成生物学 | NA | 连接蛋白工程、脂质体组装 | NA | NA | NA | 连接蛋白工程 | 脂质体合成细胞 | 光控合成通信网络,基于连接蛋白通道的正交信号传输 | 合成生物学、生物工程 |
| 136 | 2026-01-03 |
Extremophile-Derived Bioactives in Cosmeceuticals: Bridging Nutraceuticals and Skincare for Holistic Wellness
2025-Nov-21, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life15121787
PMID:41465727
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综述 | 本文综述了极端微生物来源的生物活性物质在药妆品和营养化妆品中的应用,探讨了其通过局部和系统途径改善皮肤健康的潜力 | 将极端微生物来源的独特化合物(如极端酶、类胡萝卜素、胞外多糖、类菌孢素氨基酸)整合到药妆品中,并系统阐述了其局部外用与口服营养补充相结合的全方位护肤策略 | NA | 分析极端微生物来源的生物活性物质在护肤领域的应用潜力及其生产策略 | 极端微生物及其产生的生物活性化合物(极端酶、类胡萝卜素、胞外多糖、类菌孢素氨基酸等) | NA | NA | 微生物发酵、合成生物学、绿色提取 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 极端微生物 | NA | 医药, 工业生物技术 |
| 137 | 2026-01-03 |
Alternating Cellular Functions by Optogenetic Control of Organelles
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4047-0_13
PMID:39724352
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研究论文 | 本文介绍了一种通过光遗传学调控线粒体-溶酶体接触(MLCs)的方法,以动态控制细胞器功能 | 利用光遗传学技术实现对活细胞中细胞器功能的动态调控,为细胞工程和合成生物学提供创新范式 | NA | 开发一种光遗传学方法来调控细胞器功能,特别是线粒体-溶酶体接触 | 真核细胞中的细胞器,特别是线粒体和溶酶体 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光遗传学 | 真核细胞 | 光遗传学调控的线粒体-溶酶体接触(MLCs) | 医学 |
| 138 | 2026-01-03 |
Artificial miRNAs and target-mimics as potential tools for crop improvement
2025-Jan, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01550-0
PMID:39901962
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综述 | 本文综述了人工miRNA和靶标模拟物作为作物改良潜在工具的最新进展 | 系统总结了利用合成生物学方法设计人工miRNA和靶标模拟物调控基因表达以增强作物抗逆性和抗病性的生物技术策略 | NA | 探讨人工miRNA和靶标模拟物在作物改良中的应用潜力 | 植物中的microRNA及其人工调控工具 | NA | NA | 人工miRNA设计、靶标模拟物技术、短串联靶标模拟物 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 植物 | 利用miRNA生物合成途径编程合成回路 | 农业 |
| 139 | 2026-01-02 |
Bioelectrochemical energy conversion and wastewater treatment in microbial fuel cells: a review of progress, limitations, and future developments
2025-Dec-29, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133903
PMID:41475609
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综述 | 本文综述了微生物燃料电池(MFC)在生物电化学能量转换和废水处理方面的最新进展、局限性及未来发展 | 系统总结了合成生物学和微生物工程在增强生物膜稳定性、改善胞外电子传递方面的最新进展,以及纳米结构电极相较于传统碳电极在提升电流输出方面的优势 | 材料成本高、电极污染、长期稳定性有限以及规模化问题阻碍了工业部署 | 探讨MFC技术在环境可持续性和可再生能源生成框架下的应用前景 | 微生物燃料电池(MFC) | NA | NA | 生物电化学能量转换 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 能源 |
| 140 | 2026-01-02 |
Synthetic biology for sustainable food colourant production: Innovations and opportunities
2025-Dec-24, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2025.147749
PMID:41475255
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术可持续生产天然食品着色剂的创新方法与机遇 | 提出通过整合AI辅助生物设计、系统生物学和菌株工程工作流等多学科平台,并建立创新的经济与法律机制,以加速可持续天然食品着色剂的产业化 | NA | 探讨利用合成生物学解决天然食品着色剂供应限制、促进可持续生产的途径 | 天然食品着色剂及其生产方法 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、精准发酵、AI辅助设计、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂、植物品种 | 颜色富集植物品种、高产微生物细胞工厂 | 食品、工业生物技术 |