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当前共找到 155 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-06 |
Harnessing engineered cyanobacteria for next-generation therapeutics
2026-Mar-17, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04790-0
PMID:41842959
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综述 | 本文综述了利用工程化蓝藻进行下一代治疗药物生产的最新进展，涵盖代谢产物多样性、途径工程、调控优化及系统级优化等方面 | 整合蓝藻代谢物多样性与合成生物学工具（如CRISPR、模块化克隆、光遗传学）的最新发展，提出蓝藻作为可编程平台用于可持续、精准治疗制造的互补性优势 | 蓝藻作为生产宿主存在技术、生物安全和监管障碍，且不能普遍替代异养系统，需进一步整合工程工具和生物工艺优化 | 探讨合成生物学和代谢工程如何将蓝藻转化为可编程的治疗药物生产平台，并评估其应用前景和挑战 | 蓝藻及其生物合成基因簇、代谢产物和工程化改造系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因调控、模块化克隆、光遗传控制、异源表达 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 蓝藻 | 生物合成途径调控、光遗传控制系统 | 医学、工业生物技术 |
| 2 | 2026-07-28 |
The disputed identity of Pseudomonas putida KT2440: when taxonomists rename your favorite microbe
2026-03-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03390-25
PMID:41589905
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评论 | 讨论恶臭假单胞菌KT2440因分类学重新命名引发的争议，呼吁保留传统名称以维护科学实践和社区共识 | 首次系统评估微生物分类学重新命名对长期研究实践的负面影响，强调命名应兼顾实用性和社区认同 | 未提供具体的替代命名方案或量化分析命名变更对研究成果的直接影响 | 探讨微生物命名中分类学严谨性与科学实践连续性之间的平衡问题 | 恶臭假单胞菌KT2440菌株的命名争议 | 微生物学 | NA | 系统发育分析 | NA | 文本数据 | 单一菌株KT2440 | NA | 恶臭假单胞菌 | NA | 环境微生物学、生物技术、合成生物学 |
| 3 | 2026-07-28 |
Synthetic overlapping genes stabilize genetic systems
2026-03-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02725-25
PMID:41649272
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研究论文 | 提出了一种名为OAFI的新方法，用于在抗生素抗性基因中创建合成重叠基因对，从而稳定基因系统 | 首次提出OAFI方法，通过将内部基因插入外部基因的柔性区域，实现重叠基因对的简单构建，并展示了限制抗生素抗性基因水平转移的能力 | 内部基因翻译效率受其在外基因中重叠位置的影响，部分重设计可能在功能保留上有局限性 | 开发合成重叠基因的方法，用于基因稳定和生物遏制 | 抗生素抗性基因、细菌毒素、遗传报告基因 | 合成生物学 | NA | OAFI | NA | NA | NA | OAFI | 细菌 | 合成重叠基因对，包括遗传报告基因和细菌毒素的嵌入 | 基因稳定、生物遏制 |
| 4 | 2026-03-16 |
Sustainable bioenergy manufacturing in plants
2026-03-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101711
PMID:41517869
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综述 | 本文综述了如何通过合成生物学、基因组学、人工智能和化学等多学科融合，克服传统生物质转化的效率、成本和多功能性限制，以推动可持续生物能源制造，并以自发光植物为例进行了深入探讨 | 提出利用多学科融合（合成生物学、基因组学、AI、化学）革新生物能源生产，并重点介绍了基于真菌生物发光途径（FBP）的自发光植物这一前沿应用，其利用内源性代谢物咖啡酸实现可持续自主生物照明 | 作为一篇综述文章，未报告原始实验数据或具体技术细节，主要基于现有文献进行总结和展望 | 探讨如何通过多学科方法克服传统生物能源制造的局限性，推动可持续植物基能源生产的发展 | 生物能源制造过程、能源作物、生物精炼厂、自发光植物 | NA | NA | 基因组编辑、组学技术、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9（可能用于基因组编辑，文中提及但未明确指定） | 植物（能源作物） | 真菌生物发光途径（FBP），利用内源性咖啡酸代谢物将光合作用能量转化为可见光发射的生物传感器/照明系统 | 能源, 环境 |
| 5 | 2026-03-28 |
Plant non-canonical peptides: From identification to mechanisms
2026-03-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101739
PMID:41580897
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综述 | 本文全面概述了植物肽的分类、生物合成及其在调控多种生物过程中的功能机制，并系统总结了植物肽鉴定的历史发展和最新进展 | 整合高通量技术、功能基因组学和合成生物学，以挖掘植物肽在作物改良和跨学科创新中的潜力 | 肽的发现和功能注释仍然具有挑战性 | 探索植物肽在植物生长、发育、免疫和环境适应中的调控作用及其应用潜力 | 植物肽，包括典型肽、非典型肽和非核糖体肽 | NA | NA | 肽组基因组学和质谱分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 6 | 2026-06-13 |
Editing and synthetic engineering of chloroplast genomes
2026-03-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101783
PMID:41761616
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综述 | 本文综述了叶绿体基因组最小化、高效基因组编辑及代谢途径重新设计的最新进展，旨在优化叶绿体功能并推动合成生物学发展 | 系统整合了叶绿体基因转移、精密编辑工具（如基因敲除、敲入、碱基替换和多靶点修饰）以及能量代谢动态调控和代谢通路重新设计等创新策略 | 未提及当前技术在植物转化效率、脱靶效应或不同物种中的适应性限制 | 探索通过叶绿体基因组工程提升作物性状和高效生产高价值化合物的方法 | 叶绿体基因组及相关代谢途径 | 合成生物学 | NA | 叶绿体基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 植物, 藻类 | 代谢通路重新设计, 能量代谢动态调控 | 生物技术, 农业 |
| 7 | 2026-06-13 |
Biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids and its evolution in plants
2026-03-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101786
PMID:41776991
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综述 | 系统综述了苄基异喹啉生物碱（BIAs）的生物合成途径、关键酶及其进化机制 | 整合了BIAs结构多样化的酶促机制与进化驱动力（基因重复、新功能化、基因簇组装） | 仍存在途径空白、酶底物混杂性及调控网络未完全表征的挑战 | 阐明BIAs生物合成途径及其在植物中的进化规律 | 苄基异喹啉生物碱及其关键酶（甲基转移酶、细胞色素P450单加氧酶、小檗碱桥酶、去甲基酶、酰基转移酶） | 植物生物学、生物化学 | NA | 多组学、蛋白质工程、合成生物学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 植物 | 代谢途径 | 医学、农业、工业生物技术 |
| 8 | 2026-07-21 |
Repositioning the Leader Peptide in Graspetide Biosynthesis
2026-03-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c21135
PMID:41789461
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research paper | 通过重新定位前体肽的引导序列，展示了在Graspetide生物合成中保持底物选择性修饰的可能性，并构建了嵌合RiPP产物 | 首次将fuscimiditide前体肽的N末端引导序列重新定位至核心肽C末端，仍能保持ThfB介导的翻译后修饰活性，并通过双引导序列策略生成包含套索肽和Graspetide家族酶修饰的机械互锁肽产物 | 重新定位引导序列后酶促修饰速率降低约2倍，可能限制在高通量应用中的效率 | 探索通过重新定位引导序列扩展核糖体合成及翻译后修饰肽（RiPPs）结构多样性的策略 | fuscimiditide前体肽及其引导序列、ThfB合成酶、套索肽和Graspetide家族修饰酶 | 合成生物学 | NA | 核糖体合成及翻译后修饰（RiPPs）生物合成途径重构 | NA | NA | 多个前体肽变体用于酶动力学和嵌合产物分析 | NA | NA | 嵌合RiPP生物合成途径（含N端和C端双重引导序列） | 工业生物技术、药物开发 |
| 9 | 2026-07-21 |
An Easy-To-Use and Field-Deployable Cell-Free Bioreporter for Environmental Detection of Tetracyclines and Macrolides
2026-03-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04800
PMID:41693084
|
研究论文 | 报告一种基于合成生物学的无细胞生物报告器，用于环境中的四环素和大环内酯类抗生素检测 | 开发了一种无需活细胞的无细胞生物报告系统，消除了生物安全问题，具有高灵敏度、特异性和准确性，且可通过冻干长期保存，适用于现场部署 | 未提及具体局限性 | 开发一种便携、易用且适合现场部署的抗生素检测工具，用于环境监测 | 四环素和大环内酯类抗生素 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录反应，抗生素响应转录因子，RNA聚合酶，工程DNA转录模板 | NA | 荧光信号 | 真实水样（具体数量未提及） | NA | NA | 抗生素响应转录因子、RNA聚合酶和工程DNA转录模板组成的无细胞生物报告电路 | 环境 |
| 10 | 2026-07-19 |
Self-assembled cell-scale containers made from DNA origami membranes
2026-03, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-025-02418-0
PMID:41315785
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研究论文 | 利用DNA折纸膜自组装形成细胞尺度的容器 | 模仿脂质结构和相互作用，设计径向对称的DNA折纸亚基，形成可编程的DNA折纸单层膜，并能自组装成囊泡或中空管，尺寸范围从100纳米到1微米以上 | 未提及具体局限性 | 在自下而上的合成生物学中实现新型的区室化方法 | DNA折纸亚基及其自组装形成的膜结构 | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术 | NA | NA | NA | DNA折纸 | NA | DNA折纸单层膜 | 生物学、软体机器人 |
| 11 | 2026-07-14 |
Versatile 2-Oxoglutarate-Dependent Dioxygenases Catalyze Radical-Mediated Multifunctional Skeleton Reconstructions and Oxidation Modifications of Taxoids
2026-03-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c01169
PMID:41746272
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研究论文 | 本研究鉴定了两种新型2-酮戊二酸依赖性双加氧酶，它们能够催化紫杉烷类化合物从6/8/6骨架到5/7/6等骨架的重排及氧化修饰，并揭示了其自由基介导的催化机制 | 发现并表征了两种具有高度催化多样性的双加氧酶（TcOGD1和TcOGD2），它们能催化多种骨架重排和氧化反应，包括首次阐明5/7/6紫杉烷骨架形成的自由基介导C-C键断裂机制 | 紫杉烷类化合物在植物中的产量有限，且部分新骨架化合物的生物合成途径尚未完全阐明 | 探索紫杉烷二萜类化合物结构多样性的形成机制，并开发用于构建独特紫杉烷骨架的生物催化工具 | 两种新型2-酮戊二酸依赖性双加氧酶（TcOGD1和TcOGD2）及紫杉烷类底物 | 合成生物学 | 癌症 | NMR波谱学 | NA | NA | 5种新型-5/7/6紫杉烷化合物从中国红豆杉植物中分离 | NA | NA | NA | 药物 |
| 12 | 2026-07-14 |
Next generation CAR-T cells to tackle solid tumors
2026-03-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114650
PMID:41570863
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综述 | 本文综述了新一代CAR-T细胞疗法应对实体瘤的挑战和创新设计 | 系统性比较了克服实体瘤障碍的先进合成生物学策略，包括逻辑门控系统、多输入CAR设计、共表达细胞因子受体和耐药性改造 | 仅讨论了体外和临床前研究，缺乏大规模临床试验验证 | 探讨提高CAR-T细胞在实体瘤中疗效的结构性和生物学障碍及创新解决方案 | CAR-T细胞设计及其在实体瘤微环境中的相互作用 | NA | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | 逻辑门控系统、嵌合开关受体、显性负受体 | 人类T细胞 | 逻辑门控CAR、多输入CAR、装甲CAR、共表达细胞因子受体 | 医学 |
| 13 | 2026-07-12 |
Next-generation strategies for PLA degradation: microbial consortia, metagenomics, enzyme engineering and AI-guided approaches
2026-Mar-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04726-8
PMID:41863619
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综述 | 本文综述了增强聚乳酸（PLA）在多种生态系统中生物降解的微生物和生物技术策略的最新进展，包括昆虫肠道微生物群筛选、真菌分离、宏基因组学及人工智能辅助酶工程等方法 | 首次系统整合了合成生物学、定向进化和人工智能在PLA降解酶工程中的应用，提出了多学科策略加速工业堆肥、废水处理和生物修复中PLA降解的路线图 | 未涵盖具体实验验证数据或定量比较不同策略的效率，且对实际应用中的经济性和规模化挑战讨论有限 | 探索并总结利用微生物群、宏基因组学、酶工程和人工智能技术加速PLA生物降解的策略 | PLA降解相关的微生物群落、真菌物种、降解酶（如解聚酶）以及AI模型 | 机器学习 | NA | 宏基因组学、环境DNA（eDNA）、人工智能、机器学习、定向进化 | 机器学习模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 哺乳动物细胞, 植物 | 合成生物回路（如切换开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢通路） | 环境, 工业生物技术 |
| 14 | 2026-07-12 |
Engineering and Evaluation of Sinorhizobium meliloti Nodulation (nod) Gene Reporter Systems in Rhizobia and Non-Rhizobia
2026-Mar, Environmental microbiology
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/1462-2920.70284
PMID:41858307
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研究论文 | 开发并评估了一种基于结瘤基因报告系统，用于筛选能够表达苜蓿中华根瘤菌结瘤基因的根瘤菌和非根瘤菌 | 构建了基于超折叠GFP和mScarlet-I的双荧光报告系统，可高通量筛选能响应植物信号并表达结瘤基因的新型细菌 | 未明确说明局限性 | 开发有效工具以识别可工程化的相容微生物伙伴，增强非豆科植物的生物固氮能力 | 苜蓿中华根瘤菌结瘤基因报告系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 生物荧光图像 | 多种根瘤菌和非根瘤菌菌株 | NA | 根瘤菌和非根瘤菌 | nod基因报告系统（包含nodD1-PnodA和nodD2-PnodA双荧光标记） | 农业, 环境 |
| 15 | 2026-07-10 |
Context-aware synthetic promoter design using neural networks enables rewiring of eukaryotic transcriptional networks
2026-03-17, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00684-5
PMID:41844670
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研究论文 | 提出一种基于人工神经网络的框架，用于在酿酒酵母中实现上下文感知的合成启动子设计，从而重编程真核转录网络 | 首次开发了可预测最优转录因子结合位点插入位置及启动子重写程度的神经网络工具，无需前期实验表征即可实现高达98.4%的抑制率 | 研究仅在本模式生物酿酒酵母中验证，且依赖已知转录因子结合位点数据，通用性及跨物种应用需进一步探索 | 开发可扩展的计算方法用于人工启动子工程，实现转录网络的精确重编程 | 酿酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae) 的天然启动子及TetR、Mig1转录因子结合位点 | 合成生物学 | NA | 人工神经网络、启动子工程、转录因子结合位点重组 | ANN (人工神经网络) | DNA序列数据 | 分析6,011个天然酵母启动子，实验验证了部分设计启动子 | NA | 酿酒酵母 | 合成启动子-转录因子结合位点重组电路，包含TetR和Mig1响应元件 | 生物技术 |
| 16 | 2026-07-09 |
Decoding Cdk1 control: from mitotic thresholds to meiotic specificity
2026-03-12, Chromosome research : an international journal on the molecular, supramolecular and evolutionary aspects of chromosome biology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10577-026-09796-4
PMID:41817770
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综述 | 综述了Cdk1在细胞周期控制中的定量与定性模型，以及通过Shokat系统和磷酸化蛋白质组学等工具解析有丝分裂阈值和减数分裂特异性的研究进展 | 结合化学生物学、合成生物学和磷酸化蛋白质组学方法，系统阐述了Cdk1活性调控的定量与定性机制，并拓展到减数分裂的特异性调控 | 主要基于酵母模型（芽殖酵母和裂殖酵母）的研究，对脊椎动物等更复杂体系的整合有限，且未涉及哺乳动物中的细节机制 | 阐明Cdk1活性调控的定量阈值与定性功能在细胞周期进程（有丝分裂和减数分裂）中的作用机制 | 酵母模型（芽殖酵母和裂殖酵母）以及脊椎动物相关研究 | 细胞生物学 | NA | Shokat系统（类似物敏感性等位基因）、质谱分析、合成生物学、磷酸化蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据 | NA | NA | 芽殖酵母、裂殖酵母、脊椎动物细胞 | NA | 基础生物学 |
| 17 | 2026-07-07 |
Vanadium-dependent haloperoxidases: Recent advances and perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108797
PMID:41506498
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综述 | 本文综述了钒依赖卤过氧化物酶（VHPOs）在发现、结构功能关系、机制阐明及各种合成应用方面的最新进展 | 重点介绍了对VHPOs卤离子和底物特异性的最新突破，包括底物通道识别和酶结合卤化机制，这些发现挑战了传统的扩散性HOX模型并实现了理性酶工程 | NA | 总结VHPOs在有机合成中的快速进展，并展望其在合成生物学、材料科学和环境生物技术中的应用前景 | 钒依赖卤过氧化物酶（VHPOs） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酶工程 | NA | NA | 合成生物学, 材料科学, 环境生物技术 |
| 18 | 2026-07-02 |
Stable Coacervate Microdroplets as Robust Microreactors for Enhanced Enzymatic Catalysis
2026-Mar, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202514871
PMID:41615238
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研究论文 | 开发了由聚乙烯亚胺和硫辛酸钠构成的高稳定凝聚层微滴，作为增强酶催化反应的微反应器 | 通过静电和疏水相互作用构建具有动态分子招募能力的高稳定凝聚层微滴，无需额外稳定剂即可保持结构完整性超过35天，并实现高达53倍的酶催化反应加速 | 未提及具体限制，但可能包括对特定酶或反应条件的依赖性及长期应用中的潜在问题 | 研究凝聚层微滴的稳定机制及其作为高效酶微反应器的应用 | 凝聚层微滴的稳定性、分子招募效率和酶催化反应增强效果 | 合成生物学 | 不适用 | 液-液相分离 | 不适用 | 实验数据 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 合成生物学, 生物催化 |
| 19 | 2026-06-29 |
Advances in metabolic engineering of Bacillus subtilis towards high-efficiency cytidine biosynthesis
2026-Mar-30, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04924-y
PMID:41910824
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综述 | 综述了通过代谢工程改造枯草芽孢杆菌高效合成胞苷的进展 | 提出了宿主特异性动态热力学平衡的新概念框架，强调从单一遗传编辑转向系统性整合枯草芽孢杆菌特有的调控逻辑 | 未详述具体实验验证，仅提出概念性框架 | 提高枯草芽孢杆菌合成胞苷的效率 | 枯草芽孢杆菌的代谢工程 | 合成生物学 | NA | 代谢工程，合成生物学，基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌 | 嘧啶生物合成途径，中心碳代谢途径 | 医药，食品 |
| 20 | 2026-06-29 |
From hidden allies to precision symbionts: unleashing endophytes for sustainable agroecosystems
2026-Mar-30, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04896-z
PMID:41910822
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综述 | 本文综述了十个交叉领域如何重塑对内生菌的研究与应用，旨在将其从隐蔽的盟友转变为精准的共生体，以构建可持续的农业生态系统 | 提出了一个前瞻性框架，强调标准菌株基准测试、因果多组学工作流、合成群落设计和多地点田间试验的重要性，将内生菌定位为可扩展且气候适应性的生物技术平台 | 主要挑战包括多数内生菌尚未被培养、共生与致病性之间的背景依赖性转变、有限的田间验证以及不断演变的生物安全框架 | 探讨利用内生菌促进可持续农业和生态修复的方法 | 内生菌（植物内生微生物） | 机器学习 | NA | 基因组学、宏基因组学、功能基因组学、系统生物学、合成生物学、CRISPR、多组学整合、生物信息学 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | NA | CRISPR | 植物 | 合成微生物群落 | 农业, 环境 |