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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-03-19 |
Construct design for precise DNA insertion in plants
2026-Mar-17, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.01.005
PMID:41846181
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综述 | 本文深入综述了植物中构建体设计原则和靶向DNA插入(敲入)策略,为合成生物学、遗传学和作物改良提供实用指导 | 系统评估了当前敲入方法在短片段、大片段和多片段插入中的优缺点,并探讨了非植物先进技术在提高植物敲入效率和精度方面的潜力 | NA | 为促进敲入技术在作物遗传改良中的有效应用,减少脱靶效应 | 植物基因组中的DNA插入构建体设计 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 82 | 2026-03-19 |
Friedelane-type oxidosqualene cyclases in friedelin production: Advances in biosynthesis, functional characterization, structure-function relationships, and engineering strategies
2026-Mar-09, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151349
PMID:41812943
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综述 | 本文综述了friedelane型氧化鲨烯环化酶在friedelin生物合成中的研究进展,包括功能表征、结构-功能关系及工程策略 | 首次报道植物OSC的冷冻电镜结构,揭示了独特的“阳离子穿梭运行”机制,并整合多组学技术识别了18种friedelane型OSC酶 | 未明确提及具体实验数据或样本规模的限制,主要基于现有文献综述 | 探讨friedelin的生物合成、酶功能及工程化生产策略,以实现其可持续生物制造 | friedelane型氧化鲨烯环化酶(OSCs)及friedelin生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 多组学整合技术、冷冻电镜(cryo-EM)、代谢途径工程、蛋白质工程 | NA | NA | NA | 代谢途径工程、蛋白质工程、亚细胞区室化 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | friedelin生物合成途径的重建 | 医药、工业生物技术 |
| 83 | 2026-03-18 |
p-Benzoyl-l-phenylalanine as a Multifunctional Noncanonical Amino Acid in Synthetic Biology: Photoprobing, Photocatalysis, and Structural Programming for Biocontainment
2026-Mar-16, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202525502
PMID:41664298
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综述 | 本文综述了对苯甲酰-L-苯丙氨酸(pBzF)作为一种多功能非经典氨基酸在合成生物学中的应用,涵盖光探针、光催化和结构编程等领域 | 确立pBzF作为一种多功能光化学和结构基元,用于构建具有非天然、光响应和催化功能的蛋白质 | NA | 探讨pBzF在合成生物学中的多功能应用,包括光化学、结构编程和生物控制 | pBzF作为一种非经典氨基酸及其在蛋白质工程中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传编码、定向进化、光化学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 84 | 2026-03-18 |
RNA Aptamers and Epitranscriptomics: Charting Unexplored Territories in RNA Biology
2026-Mar-16, Molecular diagnosis & therapy
IF:4.1Q1
DOI:10.1007/s40291-026-00841-w
PMID:41838348
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perspective | 本文探讨了RNA适配体与表观转录组学在RNA生物学中的交叉领域,聚焦于RNA修饰如何影响适配体折叠或结合,以及适配体如何用于检测或调控表观转录组状态 | 首次系统性地探索RNA适配体与表观转录组学之间的概念和机制重叠,提出其潜在融合作为创新前沿 | 这些领域之间的直接调控联系尚未完全阐明,需要未来研究进一步探索 | 激发RNA适配体和表观转录组学研究社区之间的讨论,并吸引对未来研究前沿的关注 | RNA适配体(通过SELEX等方法体外选择的单链RNA寡核苷酸)和表观转录组修饰(如m6A、Ψ、m5C) | RNA生物学 | NA | SELEX(系统进化配体指数富集)及相关方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 诊断学、治疗学、分子传感、合成生物学、转录后调控、RNA基础治疗 |
| 85 | 2026-03-18 |
CRISPR-Cas9: Genome Engineering and Future Vaccine Applications
2026-Mar-16, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-026-01563-4
PMID:41840308
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas9系统及其衍生平台在疫苗设计中的应用,探讨了其从基因治疗工具向疫苗学关键资产转变的潜力与挑战 | 系统性地将CRISPR-Cas9技术从传统基因编辑领域拓展到疫苗设计领域,提出了结合合成生物学实现精准、可编程疫苗的新范式 | 存在脱靶编辑风险、体内递送效率低以及转基因疫苗监管路径不明确等技术转化障碍 | 探讨CRISPR-Cas9技术在疫苗开发中的应用前景与挑战 | CRISPR-Cas9系统及其衍生平台(碱基编辑、先导编辑、CRISPRi/a) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9、碱基编辑、先导编辑、CRISPRi/a | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 86 | 2026-03-17 |
Stability and Reactivity of Alternative Nucleobases in Concentrated Sulfuric Acid
2026-Mar-03, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31050845
PMID:41828832
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研究论文 | 本研究评估了14种商业可得的替代核碱基在浓硫酸中的稳定性,以探索其在该溶剂中形成DNA类似聚合物的潜力 | 首次系统研究了替代核碱基在浓硫酸中的稳定性,并识别出多个稳定且可溶的候选碱基,为在极端酸性环境中设计遗传类似聚合物提供了新方向 | 研究仅限于实验室条件下的短期稳定性评估,未验证这些碱基在浓硫酸中实际形成聚合物或进行碱基配对的能力 | 探索在浓硫酸等极端酸性溶剂中稳定存在的替代核碱基,以支持DNA类似聚合物的设计 | 14种商业可得的替代核碱基 | 合成生物学 | NA | 核磁共振光谱(H和C NMR) | NA | 光谱数据 | 14种化合物,在98%和81%浓硫酸中孵育3周 | NA | NA | NA | 天体生物学、行星科学、合成生物学 |
| 87 | 2026-03-17 |
Application of Enzyme Engineering and Synthetic Biology for Modulated Transformation of Fructooligosaccharides (FOSs) to Elucidate the Catalytic Mechanism of Fructofuranosidases
2026-Mar-03, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15050843
PMID:41829116
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研究论文 | 本研究通过酶工程和合成生物学方法改造果呋喃糖苷酶,以提高果寡糖的转化效率并阐明其催化机制 | 构建了突变酶142P-242K,将果寡糖转化效率从29%提升至52%,并揭示了催化口袋修饰和底物亲和力变化是提高产量的主要因素 | 活性位点的疏水性和强氢键阻碍了从GF2合成nystose (GF3) | 提高果寡糖的酶法生产效率和阐明果呋喃糖苷酶的催化机制 | 果呋喃糖苷酶突变体142P-242K及其催化产物果寡糖 | 合成生物学 | NA | 酶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 制药 |
| 88 | 2026-03-16 |
Decoding Cdk1 control: from mitotic thresholds to meiotic specificity
2026-Mar-12, Chromosome research : an international journal on the molecular, supramolecular and evolutionary aspects of chromosome biology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10577-026-09796-4
PMID:41817770
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综述 | 本文回顾了Cdk1在细胞周期控制中的定量与定性模型,并探讨了通过合成生物学和磷酸化蛋白质组学技术解码其调控逻辑的进展 | 整合了Shokat系统的Cdk1等位基因开发,结合化学遗传学和质谱技术,实现了对Cdk1活性的高时空分辨率控制与底物鉴定 | 研究主要基于芽殖酵母和裂殖酵母等单Cdk模型,可能无法完全反映多Cdk高等真核生物的复杂性 | 解析Cdk1在细胞周期调控中的定量与定性作用机制,并探讨其在有丝分裂和减数分裂中的特异性 | 真核细胞周期调控蛋白激酶Cdk1及其底物 | NA | NA | 化学遗传学、质谱分析、磷酸化蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 芽殖酵母、裂殖酵母 | NA | NA |
| 89 | 2026-03-16 |
Sustainable bioenergy manufacturing in plants
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101711
PMID:41517869
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综述 | 本文综述了如何通过合成生物学、基因组学、人工智能和化学等多学科融合,克服传统生物质转化的效率、成本和多功能性限制,以推动可持续生物能源制造,并以自发光植物为例进行了深入探讨 | 提出利用多学科融合(合成生物学、基因组学、AI、化学)革新生物能源生产,并重点介绍了基于真菌生物发光途径(FBP)的自发光植物这一前沿应用,其利用内源性代谢物咖啡酸实现可持续自主生物照明 | 作为一篇综述文章,未报告原始实验数据或具体技术细节,主要基于现有文献进行总结和展望 | 探讨如何通过多学科方法克服传统生物能源制造的局限性,推动可持续植物基能源生产的发展 | 生物能源制造过程、能源作物、生物精炼厂、自发光植物 | NA | NA | 基因组编辑、组学技术、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(可能用于基因组编辑,文中提及但未明确指定) | 植物(能源作物) | 真菌生物发光途径(FBP),利用内源性咖啡酸代谢物将光合作用能量转化为可见光发射的生物传感器/照明系统 | 能源, 环境 |
| 90 | 2026-03-16 |
Editing and synthetic engineering of chloroplast genomes
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101783
PMID:41761616
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综述 | 本文综述了叶绿体基因组编辑与合成工程的最新进展,包括基因组最小化、高效编辑和代谢途径重设计 | 整合了叶绿体基因组最小化、精确编辑工具和代谢途径动态调控,为下一代叶绿体工程提供综合方法 | NA | 优化叶绿体功能,促进高价值化合物的从头生物合成和作物性状改良 | 植物和藻类的叶绿体 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、敲入、碱基替换、多重修饰 | NA | NA | NA | NA | 植物、藻类 | 代谢途径重设计 | 生物技术、农业 |
| 91 | 2026-03-16 |
Biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids and its evolution in plants
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101786
PMID:41776991
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综述 | 本文系统综述了植物中苄基异喹啉生物碱(BIAs)的生物合成途径、关键酶及其进化机制,并展望了未来研究方向 | 整合了BIAs生物合成途径的系统知识,并提出了通过多组学数据与合成生物学结合来可持续生产高价值BIAs的新策略 | 仍存在途径空白、酶的多功能性以及调控网络尚未完全阐明等挑战 | 阐明苄基异喹啉生物碱(BIAs)的生物合成途径及其在植物中的进化机制 | 苄基异喹啉生物碱(BIAs)及其生物合成途径与关键酶 | NA | NA | 多组学数据整合、蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、农业 |
| 92 | 2026-03-16 |
Pelecyphora chihuahuensis (Britton & Rose) D. Aquino & Dan. Sánchez: A Review on Its Taxonomy, Ecology and Conservation of an Endemic Mexican Cactus Species with Biotechnological Perspectives
2026-Mar-03, Biology
DOI:10.3390/biology15050413
PMID:41823840
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综述 | 本文综述了墨西哥特有仙人掌物种Pelecyphora chihuahuensis的分类学、生态学、保护现状及其生物技术应用前景 | 首次系统整合传统分类学与现代生物技术工具(如分子标记、NGS、CRISPR-Cas和合成生物学)来解决该特有仙人掌物种的保护问题 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,且对CRISPR-Cas和合成生物学在仙人掌保护中的具体应用仍处于讨论阶段 | 通过整合生物技术、生态学和分类学知识,促进该特有仙人掌物种及其相关濒危仙人掌的可持续管理和保护 | 墨西哥特有仙人掌物种Pelecyphora chihuahuensis | NA | NA | 分子标记、下一代测序(NGS)、基于GIS的物种分布模型、组织培养、低温保存 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 环境, 农业 |
| 93 | 2026-03-14 |
Chromosome-Level Genome Assembly of the Allotetraploid Gynostemma pentaphyllum Provides Novel Insights Into the Biosynthesis of Ginsenoside and Gypenoside LVI
2026-Mar-13, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70598
PMID:41821502
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研究论文 | 本研究通过组装绞股蓝染色体级别基因组,揭示了其皂苷类成分生物合成差异的机制,并鉴定了一个关键的双功能P450酶 | 首次组装了绞股蓝的染色体级别基因组,揭示了其异源四倍体起源,并鉴定了一个在绞股蓝和五加科植物中独立进化、具有双功能(C-12和C-2羟基化)的关键P450酶GpCYP88AB3 | NA | 阐明绞股蓝不同地理种群间达玛烷型人参皂苷和绞股蓝皂苷LVI积累差异的分子机制 | 绞股蓝(Gynostemma pentaphyllum),特别是来自遂宁(SN)和南宁(NN)的种群 | 基因组学与合成生物学 | NA | 染色体级别基因组组装、多组学分析(基因组、转录组、代谢组)、系统发育分析、染色体进化分析、体内外酶功能验证 | NA | 基因组序列数据、多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、合成生物学 |
| 94 | 2026-03-14 |
The disputed identity of Pseudomonas putida KT2440: when taxonomists rename your favorite microbe
2026-Mar-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03390-25
PMID:41589905
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评论 | 本文讨论了假单胞菌KT2440菌株的分类学重命名问题,强调社区实践和历史连贯性应优先于不断变化的分类学正统 | 提出在微生物命名中,对于标志性菌株如KT2440,应基于社区共识和实际效用而非单纯系统发育分析来决定名称 | NA | 探讨微生物分类学重命名对科学社区和实践的负面影响,并倡导社区参与命名决策 | 假单胞菌KT2440菌株及其分类学身份 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 假单胞菌KT2440 | NA | 环境微生物学, 生物技术, 合成生物学 |
| 95 | 2026-03-14 |
Synthetic overlapping genes stabilize genetic systems
2026-Mar-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02725-25
PMID:41649272
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研究论文 | 本文提出了一种名为OAFI的新方法,用于创建合成重叠基因,以稳定基因系统并限制抗生素抗性基因的水平转移 | 开发了OAFI(重叠、交替框架插入)方法,通过将编码在交替框架中的“内部”基因插入“外部”基因的灵活区域,创建合成重叠基因对 | 未明确说明该方法在不同宿主或复杂基因系统中的普适性,也未讨论长期进化稳定性 | 开发一种创建合成重叠基因的方法,以稳定工程基因并限制抗生素抗性基因的水平转移 | 基因报告因子、细菌毒素和抗生素抗性基因 | 合成生物学 | NA | OAFI(重叠、交替框架插入)方法 | NA | NA | NA | OAFI | 细菌(未指定具体种类) | 合成重叠基因对,其中内部基因(如毒素)编码在抗生素抗性基因的交替阅读框架中 | 工业生物技术, 环境 |
| 96 | 2026-03-14 |
Overcoming hydrophobicity-driven aggregation: An integrated expression strategy enables high-yield soluble production of recalcitrant starch synthases in Escherichia coli
2026-Mar-10, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2026.106917
PMID:41819303
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研究论文 | 本研究开发了一种整合表达策略,用于提高疏水性淀粉合成酶在大肠杆菌中的可溶性表达产量 | 结合结构分析、MBP融合标签、优化诱导条件和密码子优化,系统性解决了疏水性酶的可溶性表达难题,并验证了该策略对多种不同来源淀粉合成酶的普适性 | 研究主要针对原核表达系统,未在真核宿主中验证;酶活性提升的具体分子机制有待进一步阐明 | 提高疏水性淀粉合成酶在大肠杆菌中的可溶性表达产量,以支持无细胞化学酶法淀粉合成 | 嗜热绿菌门细菌的淀粉合成酶(CtSS)及其他四种植物来源的淀粉生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白质异源表达、结构分析、MBP融合标签技术、密码子优化 | NA | 蛋白质序列与结构数据、酶活性数据 | 5种淀粉合成酶(CtSS、GmPGM、ZmAGP、OsSS、MeSS) | MBP融合表达系统 | 大肠杆菌 | 淀粉生物合成途径的异源表达优化 | 工业生物技术 |
| 97 | 2026-03-13 |
Adenosine Triphosphate-Producing Artificial Cells: Biomimetic Construction Strategies and Applications
2026-Mar-13, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500934
PMID:41773731
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综述 | 本文综述了ATP生产人工细胞的仿生构建策略及其应用,重点关注模型膜、质子泵和ATP酶的协同整合 | 系统整合了三种构建策略的最新进展,包括绕过膜蛋白组装挑战的直接封装完整细胞器或构建非经典系统,为从基础研究转向实际应用提供指导 | NA | 探索ATP生产人工细胞的构建策略及其在合成生物学、靶向药物递送、再生疗法和生物混合能量转换设备等工程应用中的潜力 | 人工细胞,特别是基于脂质体、聚合物体、融合液滴、油包水胶束和金属有机框架等自下而上模型构建的ATP生产系统 | 合成生物学 | NA | 自下而上构建策略,包括封装完整线粒体、类囊体或构建非经典系统如精氨酸降解途径 | NA | NA | NA | NA | NA | 模拟氧化/光合磷酸化以维持ATP合成的仿生能量转换系统,包括质子泵和ATP酶的级联能量转换 | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 工业生物技术 |
| 98 | 2026-03-13 |
Hybrid seed production: new paradigms and challenges in the twenty-first century
2026-Mar-11, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04959-3
PMID:41811507
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综述 | 本文综述了二十一世纪杂交种子生产的新范式与挑战,重点探讨了先进基因组学、人工智能育种与政策整合对可持续生产气候适应性杂交种子的影响 | 系统整合了CRISPR/Cas、基因组选择等现代基因组工具与人工智能/机器学习、表观遗传学等新兴技术,提出通过多领域协作解决杂交技术可扩展性与可及性瓶颈的创新框架 | 未提供具体作物的量化对比数据,对小型农户采纳障碍的解决方案探讨较为宏观,缺乏区域性政策差异的深度分析 | 探讨整合先进技术与政策以可持续生产气候适应性杂交种子的路径 | 杂交种子生产技术体系及其相关作物案例 | 农业生物技术 | NA | CRISPR/Cas, 标记辅助选择, 基因组选择, 人工智能/机器学习, 表观遗传学 | NA | 基因组数据, 表型数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物植物 | NA | 农业 |
| 99 | 2026-03-13 |
Microbial computing: Review and Perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108766
PMID:41317976
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综述 | 本文回顾了微生物计算领域的发展历程,概述了现有策略及其局限性,并提出了基于储层计算的新视角 | 引入了基于储层计算的自上而下新框架,利用生物系统固有的动态计算能力解决复杂任务 | 现有的自下而上策略仍不足以模拟细胞信号处理系统的计算复杂性 | 探讨微生物计算的发展策略与未来方向 | 微生物计算机(生物计算机) | 合成生物学 | NA | NA | 储层计算、模拟计算、神经形态架构 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌(E. coli)、酿酒酵母(S. cerevisiae)、枯草芽孢杆菌(B. subtilis)、哺乳动物细胞、植物 | 数字逻辑门、切换开关、振荡器、生物传感器、代谢通路 | 生物生产、生物修复、生物医学 |
| 100 | 2026-03-13 |
Microbial electrochemical synergy: A mechanistic framework for enhanced bioelectrochemical remediation of halogenated organic pollutant in soil-water matrices
2026-Mar-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.141415
PMID:41690271
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综述 | 本文提出了一个名为“微生物电化学协同作用”的概念框架,用于系统解析生物电化学系统在土壤-水基质中修复卤代有机污染物的性能,并探讨了通过整合机器学习、多组学和合成生物学工具来设计和调控下一代BES技术的潜力 | 提出了一个整合性的“微生物电化学协同作用”机制框架,该框架从电子流效率、功能微生物生态位分配和界面微环境特征三个维度系统解析BES性能,并首次倡导协同利用机器学习、多组学和合成生物学工具进行理性设计 | 本文是一篇综述,未提供具体的实验数据或案例验证所提框架的有效性 | 旨在通过提出一个整合性机制框架,提升基于生物电化学系统的卤代有机污染物修复策略的可扩展性和可持续性 | 生物电化学系统及其在土壤-水基质中修复卤代有机污染物的应用 | 环境生物技术 | NA | 机器学习, 多组学, 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |