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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-03-09 |
The dual role of teichoic acids in gram-positive bacteria: Structural diversity dictates pathogenic and probiotic functions
2026-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150925
PMID:41692204
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综述 | 本文综述了革兰氏阳性细菌中磷壁酸的结构多样性如何决定其致病性和益生功能的双重作用 | 系统比较了病原体和益生菌中壁磷壁酸和脂磷壁酸,并探讨了合成生物学方法重新设计磷壁酸合成的潜力 | NA | 阐明磷壁酸的结构多样性如何调控其与宿主的双重相互作用,并探索其在功能食品和精准营养策略中的应用 | 革兰氏阳性细菌中的磷壁酸 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 食品 |
| 82 | 2026-03-08 |
Seizing the key nodes in glabridin biosynthesis network: identification of enzymes for producing licorice hairy roots with high levels of glabridin
2026-Mar-05, Molecular horticulture
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s43897-025-00202-x
PMID:41782076
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和体外酶活验证,阐明了光甘草定生物合成的两条关键途径,并利用转基因毛状根体系实现了光甘草定的高效生产 | 首次系统解析了光甘草定生物合成网络中的关键酶与两条互作途径,并建立了44倍产量提升的转基因毛状根生产平台 | 未在田间或大规模发酵体系中验证生产平台的稳定性与经济效益 | 解析光甘草定生物合成途径并建立高效生物生产体系 | 甘草(Glycyrrhiza glabra)及其光甘草定生物合成相关酶 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、体外酶活测定、农杆菌介导的遗传转化 | NA | 组学数据、酶活数据、代谢物含量数据 | 转基因毛状根系及4年生野生根对照 | 农杆菌介导转化 | 甘草毛状根 | 光甘草定生物合成途径(OMT/ODMT依赖与非依赖双途径) | 医药、化妆品 |
| 83 | 2026-03-08 |
An Easy-To-Use and Field-Deployable Cell-Free Bioreporter for Environmental Detection of Tetracyclines and Macrolides
2026-Mar-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04800
PMID:41693084
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研究论文 | 本文开发了一种基于合成生物学的无细胞生物报告系统,用于环境中四环素和大环内酯类抗生素的检测 | 该系统整合了抗生素响应转录因子、RNA聚合酶和工程化DNA转录模板,通过体外转录反应产生可见荧光信号,无需生物安全防护,可冻干保存并适用于现场部署 | NA | 开发一种便携、快速且无需复杂仪器的环境抗生素检测方法 | 四环素和大环内酯类抗生素在环境水样中的检测 | 合成生物学 | NA | 体外转录反应 | NA | 荧光信号 | 真实水样 | 合成生物学 | 无细胞系统 | 抗生素响应生物传感器 | 环境 |
| 84 | 2026-03-08 |
Genomic perplexity and the evolution of context-dependent function
2026-Mar-02, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msag041
PMID:41739546
|
研究论文 | 本文提出基因组像大型语言模型一样不编码固定功能,而是编码功能和表型结果的概率分布,并引入“基因组困惑度”概念来量化基因流动的适应度成本 | 将基因组功能与大型语言模型进行概念类比,提出基因组编码概率分布而非固定功能的新框架,并首次引入“基因组困惑度”作为量化基因流动适应度成本的信息论度量 | 提出的框架目前主要是概念性的,需要更多实证研究来验证其预测能力,且对基因组复杂性的简化可能忽略某些生物学细节 | 探讨基因组功能的上下文依赖性及其进化意义,为理解基因流动和合成生物学提供新框架 | 基因组功能、基因流动(水平基因转移和基因渗入)、表型结果 | 计算生物学 | NA | 泛基因组学、合成生物学、全基因组关联研究(GWAS) | Transformer、大型语言模型(LLM) | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、进化建模 |
| 85 | 2026-03-08 |
Self-assembled cell-scale containers made from DNA origami membranes
2026-Mar, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-025-02418-0
PMID:41315785
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研究论文 | 本文报道了一种受脂质结构启发的DNA折纸单层膜自组装方法,可形成囊泡或中空管状结构 | 首次利用DNA折纸技术构建细胞尺度的动态膜结构,突破了传统蛋白质/脂质膜的限制 | 未明确说明结构的长期稳定性及在复杂生物环境中的功能表现 | 开发新型仿生隔室化技术用于合成生物学和细胞尺度软机器人 | DNA折纸膜自组装结构(囊泡/中空管) | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术 | NA | 结构成像数据 | NA | DNA折纸 | NA | 仿脂质结构的径向对称DNA折纸亚基自组装膜 | 生物技术, 软体机器人 |
| 86 | 2026-03-08 |
Glassy Dynamics as a Predictive Framework for Lipid Exchange Across Membranes
2026-Mar, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202512844
PMID:41562888
|
研究论文 | 本文提出了一种受玻璃态动力学启发的热力学-动力学框架,用于预测跨膜脂质交换的活化能和转移时间尺度 | 利用脂质囊泡的热膨胀系数这一单一实验可测参数,应用集体小位移模型进行无调整参数的预测,将脂质交换过程与无定形材料中的协同分子事件联系起来 | NA | 建立脂质跨膜交换的定量预测框架 | 脂质囊泡和跨膜脂质交换过程 | 软物质物理 | NA | 无标记石英晶体微天平实验 | 集体小位移模型 | 实验数据 | 多个脂质系统 | NA | NA | NA | 药物递送、生物仿生材料设计、纳米生物技术 |
| 87 | 2026-03-08 |
Mistletoe- and Mussel-Inspired Fabrication of Hierarchically Structured Protein-Cellulose Scaffolds From Biomolecular Condensates
2026-Mar, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202520827
PMID:41603494
|
研究论文 | 本研究受槲寄生和贻贝启发,利用生物分子凝聚相开发了一种可调控层次结构的蛋白质-纤维素复合支架的制备方法 | 首次结合贻贝足蛋白-1(rMfp-1)与表面功能化阴离子纤维素纳米棒,通过多组分相分离形成具有核壳形态的凝聚相,并以此制备可调控多孔结构的组织工程支架 | 未明确说明支架在体内组织工程应用中的具体生物相容性、降解性能及长期稳定性数据 | 开发一种受自然启发的生物可再生、水基的层次结构材料制备方法,用于组织工程支架 | 重组贻贝足蛋白-1(rMfp-1)与表面功能化阴离子纤维素纳米棒形成的生物分子凝聚相 | 生物材料 | NA | 冷冻干燥、光谱学与成像技术(多种模态) | NA | 光谱数据、成像数据 | NA | NA | NA | NA | 医学(组织工程) |
| 88 | 2026-03-08 |
Enhanced Heterologous Production of Tylosin Through Pathway Reconstruction and Integrated Optimization in Streptomyces
2026-Mar, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70203
PMID:41761947
|
研究论文 | 本研究通过克隆泰乐菌素生物合成基因簇,在链霉菌宿主中实现异源表达,并通过培养基优化、启动子替换和调控基因敲除等策略,显著提高了泰乐菌素的产量 | 采用ExoCET技术克隆大型GC-rich基因簇,通过两步组装策略在三种链霉菌宿主中实现异源表达,并综合运用培养基优化、启动子工程和调控基因敲除进行系统优化 | 未提及泰乐菌素类似物的开发或规模化生产的验证 | 提高泰乐菌素的异源生物合成效率 | 泰乐菌素生物合成基因簇及其在链霉菌中的异源表达 | 合成生物学 | NA | ExoCET技术、基因克隆、启动子替换、基因敲除 | NA | NA | 三种链霉菌宿主(包括S. albus J1074) | ExoCET, 基因敲除 | Streptomyces fradiae QL100, Streptomyces albus J1074, 链霉菌宿主 | 泰乐菌素生物合成途径重构,包括启动子替换(tylGI和tylI)和调控基因(tylQ)敲除 | 医药 |
| 89 | 2026-03-07 |
Assembling a True "Olympic Gel" From over 16 000 Combinatorial DNA Rings
2026-Mar-06, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202520549
PMID:41789447
|
研究论文 | 本研究成功组装了一种由超过16000种不同DNA环构成的真正“奥林匹克凝胶”,并验证了其独特的溶胀行为和弹性响应 | 首次通过酶激活独特序列域的方法,成功避免了非预期的交联和聚合,实现了由大规模组合DNA环库组装真正的奥林匹克凝胶 | NA | 研究网络拓扑结构对宏观材料性质的影响,并探索其作为生物和仿生系统中遗传信息载体的功能 | 由超过16000种不同DNA环组成的奥林匹克凝胶材料 | DNA纳米技术 | NA | 下一代测序、振荡流变学、大规模计算模拟、原子力显微镜、低温电子显微镜 | NA | DNA序列数据、力学性能数据、结构图像数据 | 超过16000种不同的DNA环分子 | NA | NA | NA | 材料、工业生物技术 |
| 90 | 2026-03-07 |
Design-driven optimization of low-cost reagent formulations for reproducible and high-yielding cell-free gene expression
2026-Mar-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69605-8
PMID:41786720
|
研究论文 | 本文通过多维度确定性筛选设计,优化了无细胞基因表达系统的试剂配方,以降低成本、提高重现性和产量 | 开发了一种基于12种组分的简单、可重现的无细胞试剂配方,实现了高达95%的成本降低,并能从氮碱基和核糖生产核苷三磷酸 | NA | 优化无细胞基因表达系统的试剂配方,以降低成本和复杂性,提高蛋白质生产的重现性和产量 | 无细胞基因表达系统及其试剂配方 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达 | NA | 实验数据 | 1,231种不同的试剂配方 | NA | NA | NA | 生物技术、蛋白质制造 |
| 91 | 2026-03-07 |
Recruiting orthogonal biological systems for engineering microorganisms
2026-Mar-04, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.12.023
PMID:41786536
|
综述 | 本文综述了微生物合成生物学中正交策略的最新进展与应用,包括正交遗传系统、代谢途径、能量系统和调控系统的构建 | 总结了正交策略在微生物合成生物学中的创新应用,以解决工程过程对自然代谢的干扰问题 | NA | 探讨正交策略在微生物合成生物学中的应用,以增强工程微生物的功能和可预测性 | 微生物细胞及其正交工程系统 | 合成生物学 | NA | 正交工程策略 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞 | 正交遗传系统、代谢途径、能量系统、调控系统 | 工业生物技术 |
| 92 | 2026-03-06 |
In vivo self-assembled siRNAs ameliorate neurological pathology in TDP-43-associated neurodegenerative disease
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf330
PMID:40916343
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研究论文 | 本文提出了一种基于合成生物学的方法,利用体内自组装siRNA靶向TDP-43蛋白,通过小细胞外囊泡递送至中枢神经系统,改善TDP-43相关神经退行性疾病的病理症状 | 利用内源性小RNA处理机制自组装siRNA封装的小细胞外囊泡,并借助宿主自然循环系统运输siRNA,实现高效、微创的基因治疗 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果和长期安全性仍需进一步验证 | 开发针对TDP-43蛋白异常积累的基因治疗策略,以治疗肌萎缩侧索硬化和额颞叶变性等神经退行性疾病 | TDP-43蛋白、siRNA、小细胞外囊泡、小鼠模型中的神经病理学变化 | 合成生物学 | 神经退行性疾病 | siRNA技术、小细胞外囊泡递送、立体定向注射、腺相关病毒递送系统 | NA | NA | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9(可能用于工程化肝细胞,但未明确提及,故输出NA) | 小鼠 | 工程化肝细胞表达并包装靶向TDP-43的siRNA到狂犬病毒糖蛋白标记的小细胞外囊泡中,形成自组装递送系统 | 医学 |
| 93 | 2026-03-06 |
Exploration of diverse glycosyltransferases in Dracocephalum moldavica and engineering the production of bioactive flavonoid glycosides
2026-Mar-04, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70212
PMID:41782194
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研究论文 | 本研究系统探索了香青兰中参与黄酮类化合物糖基化的UDP-糖基转移酶,并通过工程化大肠杆菌实现了两种生物活性黄酮苷的高效合成 | 首次在香青兰中鉴定出五种功能多样的UGTs,包括双功能糖基转移酶DmUGT1,并通过定点突变揭示了其糖供体特异性的关键氨基酸位点 | 研究主要聚焦于已鉴定的五种UGTs,可能还有其他未发现的糖基转移酶参与香青兰黄酮苷的生物合成 | 阐明香青兰中黄酮类化合物糖基化的分子机制,并为合成生物学方法生产生物活性糖苷提供候选基因和方法 | 香青兰中的UDP-糖基转移酶及其催化的黄酮苷生物合成途径 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 同源建模、定点诱变、代谢工程 | NA | 基因序列、酶活性数据 | 五种鉴定出的UGT基因 | 质粒设计、代谢工程 | 大肠杆菌 | 通过工程化大肠杆菌菌株,利用DmUGT1和DmCGT1,并增强细胞内UDP-葡萄糖醛酸和UDP-葡萄糖的供应,以生产目标黄酮苷 | 医药 |
| 94 | 2026-03-06 |
Unlocking plant abiotic stress resilience through biostimulants and omics-driven innovations
2026-Mar-04, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70205
PMID:41782210
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综述 | 本文综述了生物刺激剂在增强植物非生物胁迫抗性方面的最新进展,并探讨了基于多组学和人工智能的创新策略 | 整合了生物刺激剂、小RNA、肽和激素等分子调控机制,结合AI驱动的预警系统和合成生物学方法,提出理性设计生物刺激剂的路线图 | NA | 探索生物刺激剂技术以增强植物对非生物胁迫的抗性,促进气候适应性农业和可持续粮食系统 | 植物(作物)及其对干旱、温度、盐分、涝渍和重金属等非生物胁迫的响应 | NA | NA | 多组学(omics)、AI驱动系统、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 95 | 2026-03-05 |
Correction for Ipoutcha et al., "A synthetic biology approach to assemble and reboot clinically relevant Pseudomonas aeruginosa tailed phages"
2026-Mar-03, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00322-25
PMID:41609359
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2026-03-06 |
Advances in biocontainment strategies of engineered microbes for use in humans
2026-Mar-03, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102727
PMID:41780106
|
综述 | 本文综述了用于人类医疗应用的基因工程微生物的生物安全策略进展 | 系统总结了多种生物安全策略的单独与联合应用,并强调了标准化测试的重要性 | NA | 探讨基因工程微生物在医疗应用中的生物安全策略 | 基因工程微生物 | 合成生物学 | NA | CRISPR, 毒素-抗毒素系统, 杀灭开关, 营养缺陷型设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 非标准氨基酸技术 | 微生物 | 毒素-抗毒素系统, 杀灭开关, 逻辑门, 生物传感器 | 医学 |
| 97 | 2026-03-06 |
Repurposing bacterial secretion systems for the design of living therapeutics
2026-Mar-03, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102726
PMID:41780105
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综述 | 本文综述了如何重新利用细菌分泌系统来设计活体疗法,以在疾病部位直接分泌治疗性蛋白质 | 通过工程化共生和益生性大肠杆菌,利用病原体来源的分泌系统来分泌治疗性蛋白质,以解决药物靶向递送的挑战 | 讨论了每种分泌系统的潜在优势和局限性,以及需要进一步研究的领域 | 设计基于合成生物学的活体疗法,用于靶向递送治疗性蛋白质到疾病部位 | 共生和益生性大肠杆菌,以及其分泌系统 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 细菌分泌系统工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 分泌系统设计,包括来自病原体的系统,用于分泌治疗性蛋白质载荷 | 医学 |
| 98 | 2026-03-04 |
Publisher Correction: Engineering modular and orthogonal genetic logic gates for robust digital-like synthetic biology
2026-Mar-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69313-3
PMID:41771868
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2026-03-06 |
Designing prokaryotic gene expression regulatory elements: From genomic mining to artificial intelligence-driven generation
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108781
PMID:41419171
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综述 | 本文系统回顾了原核生物基因表达调控元件的设计策略,从基因组挖掘到人工智能驱动生成 | 整合了生物物理模型和人工智能指导的理性设计方法,强调了深度生成模型在功能调控元件开发中的应用 | 未具体说明实验验证的局限性或数据可用性问题 | 优化微生物细胞工厂的生物生产,通过精细调控基因表达 | 原核生物基因表达调控元件 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、随机诱变、靶向诱变、深度生成建模 | 深度生成模型 | 序列数据 | NA | NA | 原核生物 | 基因表达调控元件,如启动子、核糖体结合位点等 | 工业生物技术 |
| 100 | 2026-03-05 |
Molecular recruitment and release using DNA host condensates
2026-Mar-03, Nanoscale horizons
IF:8.0Q1
DOI:10.1039/d5nh00586h
PMID:41774821
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研究论文 | 本文研究了利用DNA纳米星构建的人工生物分子凝聚体,通过整合适配体实现对目标生物分子的招募与释放 | 首次在DNA纳米星凝聚体中引入适配体实现靶向分子招募,并开发了通过互补寡核苷酸(kleptamer)控制分子释放的新机制 | 研究仅聚焦于链霉亲和素单一样本,未验证对其他生物分子的普适性;体内应用潜力尚未探索 | 开发可编程的人工生物分子凝聚体系统,实现靶向分子的可控空间组织与释放 | DNA纳米星构建的凝聚体、链霉亲和素蛋白、适配体与kleptamer寡核苷酸 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、适配体工程、相分离表征 | NA | 生物分子相互作用数据、相图数据、荧光成像数据 | 基于DNA纳米星构建的多种凝聚体构型(适配体位于不同位置) | DNA纳米星自组装、适配体设计 | 无细胞体系 | 基于适配体-kleptamer互补作用的分子捕获与释放开关 | 合成生物学、活性材料、合成细胞 |