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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-03-05 |
PANoptosis as a drug discovery framework: integrating cell death architecture with clinical translation
2026-Mar-03, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00388-0
PMID:41776350
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综述 | 本文综述了PANoptosis(一种整合了凋亡、焦亡和坏死性凋亡的统一性炎症性细胞死亡程序)的分子架构、调控机制及其作为药物发现框架的临床转化潜力 | 提出了PANoptosis作为一个统一的细胞死亡程序的概念,并系统性地将其分子架构与临床转化策略(包括药物干预框架、生物标志物和临床极性-时机模型)相结合,为靶向细胞死亡通路治疗多种疾病提供了新范式 | NA | 阐明PANoptosis的分子机制,并构建一个整合了基础研究与临床转化的药物发现框架,以指导针对感染性、炎症性、肿瘤性和神经退行性疾病的治疗策略开发 | PANoptosis的分子架构(包括上游传感器、支架适配器和效应器)、其调控机制、以及在多种疾病(如感染、脓毒症、癌症、神经退行性疾病)中的作用 | NA | 感染性疾病, 脓毒症, 癌症, 神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 102 | 2026-03-04 |
High-performance bioimaging and biosensing via nucleobase-editing enzymes
2026-Mar-03, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs00678c
PMID:41773995
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综述 | 本文综述了核苷碱基编辑酶在生物成像和生物传感中的应用,包括其催化原理、集成模式及未来发展方向 | 将核苷碱基编辑酶重新用作可编程执行器,实现高特异性、高效扩增和生理条件兼容的生物传感与成像系统 | NA | 探讨核苷碱基编辑酶在生物传感和生物成像中的新兴应用,以提升诊断、治疗监测和合成生物学的平台性能 | 核苷碱基编辑酶(如脱氨酶、甲基转移酶/去甲基酶、DNA糖基化酶)及其在核酸、蛋白质和细胞过程监测中的应用 | NA | NA | 核苷碱基编辑技术,包括脱氨、甲基化/去甲基化、碱基切除等反应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 103 | 2026-03-04 |
Building AuxInYeast Synthetic Biology Strains for Biochemical Characterization of Maize Auxin Hormone Signaling Components
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108634
PMID:40074300
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研究论文 | 本文介绍了一种名为AuxInYeast的合成生物学工具,用于在酵母中构建玉米生长素信号通路组件,以进行生化表征 | 开发了AuxInYeast系统,作为植物合成生物学底盘,首次在酵母中重建玉米生长素信号通路,实现高通量定量分析 | 系统基于酵母环境,可能不完全模拟植物体内复杂调控网络,且仅针对玉米组件,通用性需进一步验证 | 构建合成生物学菌株,以生化表征玉米生长素激素信号通路组件 | 玉米生长素信号通路组件,包括受体、阻遏物、辅阻遏物、转录因子和响应元件 | 合成生物学 | NA | 流式细胞术、荧光蛋白标记 | NA | 生化数据、荧光信号数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酵母 | 生长素信号通路,包括受体-阻遏物复合物、转录激活级联和响应元件 | 农业, 工业生物技术 |
| 104 | 2026-03-04 |
Testing AuxInYeast Synthetic Biology Strains via Fluorescence Flow Cytometry
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108635
PMID:40074301
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研究论文 | 本文介绍了一种使用荧光流式细胞术测试AuxInYeast合成生物学菌株的协议,用于分析玉米生长素信号通路 | 开发了基于酵母异源表达平台的AuxInYeast系统,结合荧光流式细胞术实现高通量定量测量植物生长素信号通路组件 | NA | 工程化玉米生长和发育,通过合成生物学工具分析生长素激素信号通路 | 玉米生长素感知受体和荧光标记的阻遏蛋白 | 合成生物学 | NA | 荧光流式细胞术 | NA | 荧光数据 | 多个AuxInYeast菌株,具体数量未指定 | AuxInYeast系统 | 酵母 | 生长素感知和阻遏蛋白降解的生物传感器通路 | 农业 |
| 105 | 2026-03-04 |
Advancing Genetic Code Expansion in Live Cells Through Metabolic Engineering
2026-Mar-02, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 本文综述了通过代谢工程在活细胞中推进遗传密码扩展(GCE)的进展,重点关注非标准氨基酸(nsAAs)的生物合成及其在合成生物学中的应用 | 整合代谢工程与GCE,实现nsAAs的生物合成,减少对化学合成补充的依赖,拓展蛋白质化学功能 | 现有GCE方法通常依赖细胞培养基中化学合成nsAAs的补充,这限制了其应用范围 | 克服GCE中nsAAs来源的限制,通过代谢工程实现nsAAs的生物合成,以促进合成生物学应用 | 遗传密码扩展(GCE)、非标准氨基酸(nsAAs)、活细胞中的蛋白质翻译 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、遗传密码扩展(GCE) | NA | NA | NA | NA | 活细胞(未指定具体宿主) | 生物合成途径设计,用于生产非标准氨基酸(nsAAs) | 医学、工业生物技术 |
| 106 | 2026-03-04 |
Engineering non-ribosomal peptide synthesis: tuning the antibiotics engine of the microbial world
2026-Mar-02, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615819
PMID:41771683
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法工程化非核糖体肽合成以优化抗生素生产的进展 | 聚焦于通过工程化前体代谢物、改变代谢流、引入强启动子和调控因子以及重定向代谢至生物合成基因簇,以提高非核糖体肽的产量和生物活性 | NA | 利用合成生物学优化非核糖体肽的合成,以增强其作为抗生素的医药应用 | 非核糖体肽合成酶及其产生的肽类抗生素 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成基因簇的工程化表达 | 医药 |
| 107 | 2026-03-03 |
Synthetic biology for heterologous expression and engineering of fungal polyketide synthases
2026-Mar-02, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00020c
PMID:41770117
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综述 | 本文综述了真菌聚酮合酶(PKS)的异源表达与工程化策略,包括宿主选择、工程策略及未来发展方向 | 系统总结了真菌PKS工程化的两大关键设计原则(宿主选择与工程策略),并提出了整合先进计算工具等未来方向 | NA | 探讨真菌聚酮合酶的异源表达与工程化方法,以拓展聚酮类天然产物的应用潜力 | 真菌聚酮合酶(PKS)及其产生的天然产物 | 合成生物学 | NA | 异源表达、点突变、结构域交换 | NA | NA | NA | NA | 酵母、丝状真菌 | 聚酮合酶工程化(包括起始单元选择、点突变、结构域交换) | 医药、农业、生物技术 |
| 108 | 2026-03-03 |
Molecular characterization following expression analysis of sugar transporters in passion fruit to explore their roles in fruit development and abiotic stress tolerance
2026-Mar, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-026-04707-0
PMID:41768418
|
研究论文 | 本研究通过全基因组分析鉴定百香果中的55个糖转运蛋白,探究其在果实发育和非生物胁迫耐受中的功能 | 首次在百香果中进行糖转运蛋白的全基因组鉴定,结合分子对接、动力学模拟和表达分析揭示其功能多样性及胁迫响应机制 | NA | 探索百香果糖转运蛋白在果实发育和非生物胁迫耐受中的潜在作用 | 百香果(Passiflora edulis)中的糖转运蛋白基因家族 | 植物分子生物学 | NA | 全基因组分析、RNA-seq、实时定量PCR、分子对接、分子动力学模拟 | NA | 基因组序列、RNA-seq数据、蛋白质序列 | NA | 合成生物学 | 百香果(植物) | 合成生物学指导的电路设计,用于开发多重非生物胁迫耐受的高糖百香果 | 农业 |
| 109 | 2026-03-02 |
Synthetic Biology and Metabolic Engineering of Microalgae for Sustainable Lipid and Terpenoid Production: An Updated Perspective
2026-Mar, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70405
PMID:41117552
|
综述 | 本文是一篇关于微藻合成生物学与代谢工程用于可持续生产脂质和萜类化合物的最新进展的综述 | 整合并批判性评估了关键微藻模型(如莱茵衣藻、微拟球藻和三角褐指藻)的最新研究进展,重点介绍了加速设计-构建-测试-学习(DBTL)循环的新型遗传工具包、基因组规模代谢建模的突破,以及用于高价值化合物细胞器靶向生物合成的创新策略 | NA | 评估微藻合成生物学与代谢工程的最新进展,以推动其作为可持续生产脂质和萜类化合物的生物平台 | 微藻,特别是莱茵衣藻、微拟球藻和三角褐指藻等关键模型 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、基因组规模代谢建模 | NA | NA | NA | NA | Chlamydomonas reinhardtii, Nannochloropsis spp., Phaeodactylum tricornutum | 用于高价值化合物(如多不饱和脂肪酸和萜类)生物合成的代谢途径 | 食品, 燃料, 生物制造 |
| 110 | 2026-03-02 |
Ultrasound-Responsive Engineered Bacteria for Targeted Cancer Therapy: Strategies, Mechanisms, and Applications
2026-Mar-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523952
PMID:41764403
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综述 | 本文综述了超声响应型工程菌在肿瘤靶向治疗中的策略、机制与应用进展 | 聚焦于将外源性响应调控因子(如超声)与微生物疗法相结合,为肿瘤治疗提供更智能、精准的治疗策略 | NA | 总结工程菌在肿瘤治疗中的核心改造方法、作用机制及主要应用策略,并重点阐述超声与工程菌结合的形式与相互作用机制 | 工程菌及其与超声结合的系统 | 合成生物学 | 肿瘤 | 生物与物理化学方法的功能修饰与工程化 | NA | NA | NA | NA | 多种来源的细菌 | NA | 医学 |
| 111 | 2026-02-24 |
Construction and analysis of a cell factory for terpenoid biosynthesis in Pichia pastoris via metabolic engineering and metabolomics
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.015
PMID:41725898
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研究论文 | 本研究通过代谢工程和代谢组学方法,在毕赤酵母中构建并分析了一个用于萜类化合物生物合成的通用细胞工厂 | 开发了一种“即插即用”的细胞工厂,通过增强MVA途径表达和减少分支途径分流策略,实现了多种萜类化合物的高效合成,并利用系统生物学分析揭示了关键蛋白拷贝数增加对精氨酸等代谢途径的影响 | 菌株的鲁棒性和紧密调控的代谢网络限制了理性代谢工程改造的潜力 | 构建高效的微生物细胞工厂以实现萜类化合物的大规模生产 | 毕赤酵母作为宿主细胞,用于生产β-榄香烯、β-法尼烯、(+)-瓦伦烯、(-)-α-红没药醇等萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、代谢组学、系统生物学分析 | NA | 代谢物数据 | 不同工程菌株 | 代谢工程 | 毕赤酵母 | 增强MVA途径表达和减少分支途径分流的通用萜类化合物生物合成细胞工厂 | 医药、保健品、香料 |
| 112 | 2026-02-23 |
Energy-driven innovations in computational de novo protein engineering
2026-Mar, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.01.005
PMID:41570866
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综述 | 本文系统回顾了能量模型在计算从头蛋白质工程中的关键作用及其驱动创新的方式 | 提出了一个基于精度-成本-通量权衡的方法选择决策框架,并整合了经典力场、量子力学方法与AI驱动预测,为治疗性和工业蛋白质设计提供了协同的物理基础与数据驱动策略路线图 | NA | 推动计算从头蛋白质工程的发展,以设计具有定制功能的新型蛋白质 | 蛋白质 | 计算生物学 | NA | 分子动力学(MD)、热力学积分、蒙特卡洛采样、机器学习(ML)、深度学习(DL) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 医学, 合成生物学 |
| 113 | 2026-02-21 |
Gene insertion and transcriptional regulation of Escherichia coli based on CRISPR-associated transposases
2026-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149850
PMID:41628878
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研究论文 | 本研究基于CRISPR相关转座酶开发了可编程工具MUSCULAR-CAST,实现了多顺反子表达盒的高效基因组整合,并开发了基因抑制工具Tn-CRISPRi,用于合成生物学中的底盘菌株工程 | 开发了基于IF型CRISPR相关转座酶系统Tn6677的可编程工具MUSCULAR-CAST,能够高效整合不同大小的多顺反子表达盒,并基于其靶向模块开发了具有广泛PAM序列适应性的基因抑制工具Tn-CRISPRi | 未明确说明工具在其他宿主生物中的适用性或大规模工业应用中的稳定性验证 | 开发高效的基因组整合和转录调控工具,以促进合成生物学中微生物细胞工厂的构建 | 大肠杆菌(Escherichia coli) | 合成生物学 | NA | CRISPR相关转座酶系统 | NA | NA | 涉及多种多顺反子表达盒(1-10K)及17个基因的抑制实验 | CRISPR-Cas9, CAST系统 | 大肠杆菌 | 多顺反子表达盒整合系统、基因抑制调控回路 | 工业生物技术 |
| 114 | 2026-02-20 |
Genetically engineered pig-to-human liver xenotransplantation
2026-Mar, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.08.044
PMID:41076089
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研究论文 | 本文报道了世界首例将经过10个基因编辑的猪肝脏作为辅助器官移植给活体人类患者的异种移植手术,并分析了影响手术成功的关键因素 | 首次在活体人类中成功实施了基因编辑猪的辅助肝脏异种移植,实现了前所未有的171天存活期,并首次在活体受者中记录了异种移植相关血栓性微血管病 | 术后出现异种移植相关血栓性微血管病,最终患者因反复上消化道出血死亡,表明长期成功仍面临重大挑战 | 探索基因编辑猪肝脏异种移植作为人类肝移植桥梁方法的可行性 | 患有大型肝细胞癌且最初被认为不适合根治性切除的患者 | NA | 肝细胞癌 | 基因编辑 | NA | 临床监测数据(肝功能、代谢、凝血标志物)、免疫学和病理学分析数据 | 1例患者 | CRISPR-Cas9 | 猪 | 敲除异种抗原基因并敲入七个人类转基因以实现免疫和凝血相容性 | 医学 |
| 115 | 2026-02-20 |
Plant epidermis-derived secretory structures: from glandular trichomes to secretory cavities
2026-Mar, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70892
PMID:41517861
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综述 | 本文比较了植物表皮衍生的分泌结构(如腺毛和分泌腔)的发育调控机制及次生代谢物合成 | 通过对比腺毛和分泌腔的发育与次生代谢调控,为合成生物学应用提供基础知识 | NA | 探讨植物表皮衍生分泌结构的发育和次生代谢物合成的调控机制 | 植物表皮衍生的分泌结构,包括腺毛和柑橘油腺等分泌腔 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 116 | 2026-02-20 |
The mini revolution: application of mini-bioreactors in adaptive laboratory evolution
2026-Mar, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2025.2608012
PMID:41592901
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综述 | 本文系统探讨了微型生物反应器(工作体积低于0.5升)在适应性实验室进化(ALE)实验中的应用与优势 | 全面综合了微型生物反应器技术和操作策略的最新进展,特别强调了为ALE定制或专门设计的集成自动化、先进传感器和新型控制算法等创新 | NA | 为新手和经验丰富的研究人员提供关于微型生物反应器在ALE中当前技术局限性和未来方向的更新、深入资源 | 微型生物反应器及其在适应性实验室进化中的应用 | 合成生物学 | NA | 适应性实验室进化(ALE) | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 生物技术, 合成生物学, 微生物生态学, 基础进化研究 |
| 117 | 2026-02-20 |
Development of microbial chassis for production of fungal natural products
2026-Mar, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2025.2608895
PMID:41592899
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法开发微生物底盘以实现真菌天然产物的异源表达和高效生产 | 系统评估了不同微生物底盘的关键特性、途径重构策略以及优化途径通量以减少副产物的方法,为真菌天然产物的发现和生物合成提供了全面的异源表达平台构建指南 | NA | 开发用于真菌天然产物高效生产的微生物底盘系统 | 真菌天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、异源表达 | NA | NA | NA | NA | 多种微生物底盘 | 生物合成途径重构、代谢途径优化 | 医药 |
| 118 | 2026-02-17 |
Application of Biotechnology in Marine-Derived Fermented Foods: Technological Evolution and Future Prospects
2026-Mar, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70422
PMID:41693674
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综述 | 本文综述了现代生物技术在海洋源发酵食品中的应用进展、技术演变及未来展望 | 系统比较了新型生物技术与传统发酵技术的差异,并为海洋生物发酵产品的产业化提供了创新视角 | 讨论了生物技术在海洋源发酵食品应用中面临的挑战与限制 | 探讨现代生物技术在海洋源发酵食品领域的应用轨迹与发展方向 | 海洋生物资源(如鱼类、甲壳类、贝类、大型藻类)及其发酵食品 | NA | NA | 微生物组学、多组学分析、合成生物学、基因组编辑、精准发酵、测序技术、智能发酵控制 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 119 | 2026-02-15 |
Synergistic defense in cotton: Lignin-mediated barriers and JA/ET signaling pathways against Verticillium wilt
2026-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112943
PMID:41407016
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综述 | 本文综述了棉花通过木质素物理屏障与JA/ET信号通路协同防御黄萎病的机制 | 揭示了木质素介导的物理屏障与JA/ET信号通路的协同防御机制,并识别了关键调控因子GhBLH7-D06、GhKWL1和GbTCP20 | 不同棉花品种中通路的贡献度存在争议,且环境调控机制尚不明确 | 阐明棉花对黄萎病的协同防御机制,为开发持久广谱的抗病策略提供理论基础 | 棉花(Gossypium spp.)及其与黄萎病菌(Verticillium dahliae)的互作 | 植物病理学/合成生物学 | 植物病害(黄萎病) | 多组学分析(multi-omics) | NA | NA | NA | CRISPR | 棉花 | JA/ET信号通路与苯丙烷类代谢途径的协同调控网络 | 农业 |
| 120 | 2026-02-12 |
Over-Expression of a Phycocyanin-Interferon Fusion and Differential Cleaving Efficiency in Cyanobacteria (Synechocystis sp. PCC 6803)
2026-Mar, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70126
PMID:41388596
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研究论文 | 本研究利用蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803作为宿主,过表达藻蓝蛋白-人干扰素α-2融合蛋白,并比较TEV和HRV蛋白酶在切割融合蛋白中的效率 | 首次在蓝藻中稳定过表达功能性人干扰素α-2作为藻蓝蛋白融合体,并系统比较TEV和HRV蛋白酶在蓝藻系统中的切割效率,发现HRV蛋白酶优于TEV及其他近期测试的蛋白酶 | 研究仅针对特定蓝藻宿主和融合蛋白设计,未评估其他光合生物或不同融合策略的适用性,且切割效率可能受表达条件影响 | 开发蓝藻作为低成本重组蛋白生产平台,优化融合蛋白切割技术以提高蛋白分离效率 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803、藻蓝蛋白-人干扰素α-2融合蛋白、TEV和HRV蛋白酶切割位点 | 合成生物学 | NA | 重组蛋白表达、融合蛋白构建、蛋白酶切割分析 | NA | 实验数据 | 使用蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803作为宿主,涉及不同蛋白酶切割位点的构建体 | 融合蛋白构建、蛋白酶切割系统 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803 | 藻蓝蛋白CpcB β-亚基与人干扰素α-2的融合蛋白,包含TEV或HRV蛋白酶切割位点 | 工业生物技术、医药 |