本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-03-16 |
Sustainable bioenergy manufacturing in plants
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101711
PMID:41517869
|
综述 | 本文综述了如何通过合成生物学、基因组学、人工智能和化学等多学科融合,克服传统生物质转化的效率、成本和多功能性限制,以推动可持续生物能源制造,并以自发光植物为例进行了深入探讨 | 提出利用多学科融合(合成生物学、基因组学、AI、化学)革新生物能源生产,并重点介绍了基于真菌生物发光途径(FBP)的自发光植物这一前沿应用,其利用内源性代谢物咖啡酸实现可持续自主生物照明 | 作为一篇综述文章,未报告原始实验数据或具体技术细节,主要基于现有文献进行总结和展望 | 探讨如何通过多学科方法克服传统生物能源制造的局限性,推动可持续植物基能源生产的发展 | 生物能源制造过程、能源作物、生物精炼厂、自发光植物 | NA | NA | 基因组编辑、组学技术、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(可能用于基因组编辑,文中提及但未明确指定) | 植物(能源作物) | 真菌生物发光途径(FBP),利用内源性咖啡酸代谢物将光合作用能量转化为可见光发射的生物传感器/照明系统 | 能源, 环境 |
| 102 | 2026-03-16 |
Pelecyphora chihuahuensis (Britton & Rose) D. Aquino & Dan. Sánchez: A Review on Its Taxonomy, Ecology and Conservation of an Endemic Mexican Cactus Species with Biotechnological Perspectives
2026-Mar-03, Biology
DOI:10.3390/biology15050413
PMID:41823840
|
综述 | 本文综述了墨西哥特有仙人掌物种Pelecyphora chihuahuensis的分类学、生态学、保护现状及其生物技术应用前景 | 首次系统整合传统分类学与现代生物技术工具(如分子标记、NGS、CRISPR-Cas和合成生物学)来解决该特有仙人掌物种的保护问题 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,且对CRISPR-Cas和合成生物学在仙人掌保护中的具体应用仍处于讨论阶段 | 通过整合生物技术、生态学和分类学知识,促进该特有仙人掌物种及其相关濒危仙人掌的可持续管理和保护 | 墨西哥特有仙人掌物种Pelecyphora chihuahuensis | NA | NA | 分子标记、下一代测序(NGS)、基于GIS的物种分布模型、组织培养、低温保存 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 环境, 农业 |
| 103 | 2026-03-14 |
Synthetic overlapping genes stabilize genetic systems
2026-Mar-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02725-25
PMID:41649272
|
研究论文 | 本文提出了一种名为OAFI的新方法,用于创建合成重叠基因,以稳定基因系统并限制抗生素抗性基因的水平转移 | 开发了OAFI(重叠、交替框架插入)方法,通过将编码在交替框架中的“内部”基因插入“外部”基因的灵活区域,创建合成重叠基因对 | 未明确说明该方法在不同宿主或复杂基因系统中的普适性,也未讨论长期进化稳定性 | 开发一种创建合成重叠基因的方法,以稳定工程基因并限制抗生素抗性基因的水平转移 | 基因报告因子、细菌毒素和抗生素抗性基因 | 合成生物学 | NA | OAFI(重叠、交替框架插入)方法 | NA | NA | NA | OAFI | 细菌(未指定具体种类) | 合成重叠基因对,其中内部基因(如毒素)编码在抗生素抗性基因的交替阅读框架中 | 工业生物技术, 环境 |
| 104 | 2026-03-14 |
Overcoming hydrophobicity-driven aggregation: An integrated expression strategy enables high-yield soluble production of recalcitrant starch synthases in Escherichia coli
2026-Mar-10, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2026.106917
PMID:41819303
|
研究论文 | 本研究开发了一种整合表达策略,用于提高疏水性淀粉合成酶在大肠杆菌中的可溶性表达产量 | 结合结构分析、MBP融合标签、优化诱导条件和密码子优化,系统性解决了疏水性酶的可溶性表达难题,并验证了该策略对多种不同来源淀粉合成酶的普适性 | 研究主要针对原核表达系统,未在真核宿主中验证;酶活性提升的具体分子机制有待进一步阐明 | 提高疏水性淀粉合成酶在大肠杆菌中的可溶性表达产量,以支持无细胞化学酶法淀粉合成 | 嗜热绿菌门细菌的淀粉合成酶(CtSS)及其他四种植物来源的淀粉生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白质异源表达、结构分析、MBP融合标签技术、密码子优化 | NA | 蛋白质序列与结构数据、酶活性数据 | 5种淀粉合成酶(CtSS、GmPGM、ZmAGP、OsSS、MeSS) | MBP融合表达系统 | 大肠杆菌 | 淀粉生物合成途径的异源表达优化 | 工业生物技术 |
| 105 | 2026-03-13 |
Hybrid seed production: new paradigms and challenges in the twenty-first century
2026-Mar-11, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04959-3
PMID:41811507
|
综述 | 本文综述了二十一世纪杂交种子生产的新范式与挑战,重点探讨了先进基因组学、人工智能育种与政策整合对可持续生产气候适应性杂交种子的影响 | 系统整合了CRISPR/Cas、基因组选择等现代基因组工具与人工智能/机器学习、表观遗传学等新兴技术,提出通过多领域协作解决杂交技术可扩展性与可及性瓶颈的创新框架 | 未提供具体作物的量化对比数据,对小型农户采纳障碍的解决方案探讨较为宏观,缺乏区域性政策差异的深度分析 | 探讨整合先进技术与政策以可持续生产气候适应性杂交种子的路径 | 杂交种子生产技术体系及其相关作物案例 | 农业生物技术 | NA | CRISPR/Cas, 标记辅助选择, 基因组选择, 人工智能/机器学习, 表观遗传学 | NA | 基因组数据, 表型数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物植物 | NA | 农业 |
| 106 | 2026-03-13 |
Microbial computing: Review and Perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108766
PMID:41317976
|
综述 | 本文回顾了微生物计算领域的发展历程,概述了现有策略及其局限性,并提出了基于储层计算的新视角 | 引入了基于储层计算的自上而下新框架,利用生物系统固有的动态计算能力解决复杂任务 | 现有的自下而上策略仍不足以模拟细胞信号处理系统的计算复杂性 | 探讨微生物计算的发展策略与未来方向 | 微生物计算机(生物计算机) | 合成生物学 | NA | NA | 储层计算、模拟计算、神经形态架构 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌(E. coli)、酿酒酵母(S. cerevisiae)、枯草芽孢杆菌(B. subtilis)、哺乳动物细胞、植物 | 数字逻辑门、切换开关、振荡器、生物传感器、代谢通路 | 生物生产、生物修复、生物医学 |
| 107 | 2026-03-13 |
Microbial electrochemical synergy: A mechanistic framework for enhanced bioelectrochemical remediation of halogenated organic pollutant in soil-water matrices
2026-Mar-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.141415
PMID:41690271
|
综述 | 本文提出了一个名为“微生物电化学协同作用”的概念框架,用于系统解析生物电化学系统在土壤-水基质中修复卤代有机污染物的性能,并探讨了通过整合机器学习、多组学和合成生物学工具来设计和调控下一代BES技术的潜力 | 提出了一个整合性的“微生物电化学协同作用”机制框架,该框架从电子流效率、功能微生物生态位分配和界面微环境特征三个维度系统解析BES性能,并首次倡导协同利用机器学习、多组学和合成生物学工具进行理性设计 | 本文是一篇综述,未提供具体的实验数据或案例验证所提框架的有效性 | 旨在通过提出一个整合性机制框架,提升基于生物电化学系统的卤代有机污染物修复策略的可扩展性和可持续性 | 生物电化学系统及其在土壤-水基质中修复卤代有机污染物的应用 | 环境生物技术 | NA | 机器学习, 多组学, 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 108 | 2026-03-11 |
CRISPR/dCas9-Mediated BRL3 Activation Enhances Growth and Metabolic Resilience Under Osmotic Stress in Nicotiana tabacum
2026 Mar-Apr, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.70816
PMID:41804827
|
研究论文 | 本研究利用CRISPR/dCas9转录激活系统上调烟草中的BR受体NtBRL3,并评估其对渗透胁迫耐受性的影响 | 首次在烟草中利用CRISPR/dCas9系统激活BRL3受体,并发现其能通过协调生物量恢复、氧化应激缓解、渗透调节物稳态和组织重塑来增强渗透胁迫耐受性 | 研究采用瞬时转化系统,未进行稳定遗传转化;功能验证主要在烟草中进行,在其他作物中的普适性有待验证 | 探究BR受体BRL3在渗透胁迫下的功能,并开发增强作物胁迫耐受性的合成生物学方法 | 烟草(Nicotiana tabacum)及其BR受体NtBRL3 | 合成生物学 | NA | CRISPR/dCas9转录激活系统(CRISPRa)、Loop Assembly、RT-qPCR、组织学分割 | NA | 基因表达数据、生物量数据、生化指标数据、组织学图像 | 烟草叶片(通过农杆菌介导的瞬时转化) | CRISPR-Cas9, Loop Assembly | 烟草(Nicotiana tabacum) | 由组成型(CaMV35S)或ABA诱导型(SlAREB)启动子驱动的dCas9-6TAL-VP128模块,与靶向NtBRL3启动子的双sgRNA配对 | 农业 |
| 109 | 2026-03-10 |
Radical enzymatic peptide cyclization in natural product biosynthesis
2026-Mar-09, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs00585j
PMID:41697225
|
综述 | 本文综述了天然产物生物合成中自由基酶介导的肽环化反应,重点介绍了其机制多样性和在药物发现中的潜力 | 系统总结了多种自由基酶家族(如rSAM酶、细胞色素P450等)在肽大环化中催化选择性键形成的机制多样性,并揭示了新型手性形式和侧链交联等新兴主题 | 作为综述文章,未提出新的实验数据或机制验证,主要依赖已有文献的归纳总结 | 探讨自由基酶在天然肽类产物环化生物合成中的作用机制与应用前景 | 天然产物生物合成中的环肽类化合物及其相关的自由基环化酶 | NA | NA | 基因组挖掘、机制酶学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现、合成生物学、肽工程 |
| 110 | 2026-03-10 |
Synthetic bioengineered macrophages for immune cell functions in infectious disease cellular therapy
2026-Mar, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70254
PMID:41420534
|
研究论文 | 本文提出了一种利用合成生物学方法改造巨噬细胞以治疗皮肤利什曼病的新策略 | 首次将可诱导TET-ON基因回路与AI设计的免疫调节肽结合,通过纳米凝胶递送系统实现巨噬细胞功能的精准重编程 | 研究主要针对皮肤利什曼病模型,尚未验证在其他感染或炎症疾病中的普适性 | 开发针对皮肤利什曼病的靶向可控免疫细胞疗法 | 巨噬细胞及其在感染免疫中的功能调控 | 合成生物学 | 皮肤利什曼病 | 基因回路工程、AI肽设计、分子动力学模拟、纳米凝胶递送 | NA | NA | NA | TET-ON基因回路 | 巨噬细胞 | 可诱导表达免疫调节肽PepA的基因回路,用于促进IL-12产生和寄生虫清除 | 医学 |
| 111 | 2026-03-09 |
Synthetic Biology Approaches to Study Maize Signaling Pathways
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108450
PMID:40074299
|
综述 | 本文综述了合成生物学方法在玉米信号通路研究中的应用,特别是通过异源表达系统(如酵母中的AuxInYeast系统)来解析玉米生长素信号通路 | 利用酵母作为异源底盘来重构玉米核生长素响应系统(AuxInYeast),提供了一种快速、高通量的假设生成平台,用于研究信号通路的进化、遗传和生化特性 | NA | 应用合成生物学原理和方法研究玉米信号通路,以推动基础生物学理解和育种工具开发 | 玉米信号通路,特别是生长素信号通路 | 合成生物学 | NA | 异源表达、荧光流式细胞术 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 玉米核生长素响应系统在酵母中的重构(AuxInYeast系统) | 农业 |
| 112 | 2026-03-09 |
Protein-glycan engineering in vaccine design: merging immune mechanisms with biotechnological innovation
2026-Mar, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.06.022
PMID:40713219
|
综述 | 本文综述了蛋白质-糖基工程在疫苗设计中的应用,结合免疫机制与生物技术创新以提升疫苗效力 | 整合CRISPR糖基编辑、合成生物学和糖基修饰纳米颗粒等前沿技术,实现对糖基结构的精确控制,以增强抗原呈递和免疫激活 | NA | 探讨蛋白质-糖基工程如何通过控制糖基结构来优化疫苗设计,针对新兴病原体、肿瘤和自身免疫性疾病 | 糖基在免疫识别中的作用,包括感染、癌症和自身免疫中的糖基介导机制 | 生物技术 | 感染性疾病、癌症、自身免疫性疾病 | CRISPR糖基编辑、合成生物学、糖基修饰纳米颗粒 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 113 | 2026-03-09 |
The dual role of teichoic acids in gram-positive bacteria: Structural diversity dictates pathogenic and probiotic functions
2026-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150925
PMID:41692204
|
综述 | 本文综述了革兰氏阳性细菌中磷壁酸的结构多样性如何决定其致病性和益生功能的双重作用 | 系统比较了病原体和益生菌中壁磷壁酸和脂磷壁酸,并探讨了合成生物学方法重新设计磷壁酸合成的潜力 | NA | 阐明磷壁酸的结构多样性如何调控其与宿主的双重相互作用,并探索其在功能食品和精准营养策略中的应用 | 革兰氏阳性细菌中的磷壁酸 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 食品 |
| 114 | 2026-03-08 |
Seizing the key nodes in glabridin biosynthesis network: identification of enzymes for producing licorice hairy roots with high levels of glabridin
2026-Mar-05, Molecular horticulture
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s43897-025-00202-x
PMID:41782076
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和体外酶活验证,阐明了光甘草定生物合成的两条关键途径,并利用转基因毛状根体系实现了光甘草定的高效生产 | 首次系统解析了光甘草定生物合成网络中的关键酶与两条互作途径,并建立了44倍产量提升的转基因毛状根生产平台 | 未在田间或大规模发酵体系中验证生产平台的稳定性与经济效益 | 解析光甘草定生物合成途径并建立高效生物生产体系 | 甘草(Glycyrrhiza glabra)及其光甘草定生物合成相关酶 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、体外酶活测定、农杆菌介导的遗传转化 | NA | 组学数据、酶活数据、代谢物含量数据 | 转基因毛状根系及4年生野生根对照 | 农杆菌介导转化 | 甘草毛状根 | 光甘草定生物合成途径(OMT/ODMT依赖与非依赖双途径) | 医药、化妆品 |
| 115 | 2026-03-08 |
An Easy-To-Use and Field-Deployable Cell-Free Bioreporter for Environmental Detection of Tetracyclines and Macrolides
2026-Mar-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04800
PMID:41693084
|
研究论文 | 本文开发了一种基于合成生物学的无细胞生物报告系统,用于环境中四环素和大环内酯类抗生素的检测 | 该系统整合了抗生素响应转录因子、RNA聚合酶和工程化DNA转录模板,通过体外转录反应产生可见荧光信号,无需生物安全防护,可冻干保存并适用于现场部署 | NA | 开发一种便携、快速且无需复杂仪器的环境抗生素检测方法 | 四环素和大环内酯类抗生素在环境水样中的检测 | 合成生物学 | NA | 体外转录反应 | NA | 荧光信号 | 真实水样 | 合成生物学 | 无细胞系统 | 抗生素响应生物传感器 | 环境 |
| 116 | 2026-03-08 |
Genomic perplexity and the evolution of context-dependent function
2026-Mar-02, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msag041
PMID:41739546
|
研究论文 | 本文提出基因组像大型语言模型一样不编码固定功能,而是编码功能和表型结果的概率分布,并引入“基因组困惑度”概念来量化基因流动的适应度成本 | 将基因组功能与大型语言模型进行概念类比,提出基因组编码概率分布而非固定功能的新框架,并首次引入“基因组困惑度”作为量化基因流动适应度成本的信息论度量 | 提出的框架目前主要是概念性的,需要更多实证研究来验证其预测能力,且对基因组复杂性的简化可能忽略某些生物学细节 | 探讨基因组功能的上下文依赖性及其进化意义,为理解基因流动和合成生物学提供新框架 | 基因组功能、基因流动(水平基因转移和基因渗入)、表型结果 | 计算生物学 | NA | 泛基因组学、合成生物学、全基因组关联研究(GWAS) | Transformer、大型语言模型(LLM) | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、进化建模 |
| 117 | 2026-03-08 |
Self-assembled cell-scale containers made from DNA origami membranes
2026-Mar, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-025-02418-0
PMID:41315785
|
研究论文 | 本文报道了一种受脂质结构启发的DNA折纸单层膜自组装方法,可形成囊泡或中空管状结构 | 首次利用DNA折纸技术构建细胞尺度的动态膜结构,突破了传统蛋白质/脂质膜的限制 | 未明确说明结构的长期稳定性及在复杂生物环境中的功能表现 | 开发新型仿生隔室化技术用于合成生物学和细胞尺度软机器人 | DNA折纸膜自组装结构(囊泡/中空管) | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术 | NA | 结构成像数据 | NA | DNA折纸 | NA | 仿脂质结构的径向对称DNA折纸亚基自组装膜 | 生物技术, 软体机器人 |
| 118 | 2026-03-08 |
Glassy Dynamics as a Predictive Framework for Lipid Exchange Across Membranes
2026-Mar, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202512844
PMID:41562888
|
研究论文 | 本文提出了一种受玻璃态动力学启发的热力学-动力学框架,用于预测跨膜脂质交换的活化能和转移时间尺度 | 利用脂质囊泡的热膨胀系数这一单一实验可测参数,应用集体小位移模型进行无调整参数的预测,将脂质交换过程与无定形材料中的协同分子事件联系起来 | NA | 建立脂质跨膜交换的定量预测框架 | 脂质囊泡和跨膜脂质交换过程 | 软物质物理 | NA | 无标记石英晶体微天平实验 | 集体小位移模型 | 实验数据 | 多个脂质系统 | NA | NA | NA | 药物递送、生物仿生材料设计、纳米生物技术 |
| 119 | 2026-03-07 |
Recruiting orthogonal biological systems for engineering microorganisms
2026-Mar-04, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.12.023
PMID:41786536
|
综述 | 本文综述了微生物合成生物学中正交策略的最新进展与应用,包括正交遗传系统、代谢途径、能量系统和调控系统的构建 | 总结了正交策略在微生物合成生物学中的创新应用,以解决工程过程对自然代谢的干扰问题 | NA | 探讨正交策略在微生物合成生物学中的应用,以增强工程微生物的功能和可预测性 | 微生物细胞及其正交工程系统 | 合成生物学 | NA | 正交工程策略 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞 | 正交遗传系统、代谢途径、能量系统、调控系统 | 工业生物技术 |
| 120 | 2026-03-06 |
In vivo self-assembled siRNAs ameliorate neurological pathology in TDP-43-associated neurodegenerative disease
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf330
PMID:40916343
|
研究论文 | 本文提出了一种基于合成生物学的方法,利用体内自组装siRNA靶向TDP-43蛋白,通过小细胞外囊泡递送至中枢神经系统,改善TDP-43相关神经退行性疾病的病理症状 | 利用内源性小RNA处理机制自组装siRNA封装的小细胞外囊泡,并借助宿主自然循环系统运输siRNA,实现高效、微创的基因治疗 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果和长期安全性仍需进一步验证 | 开发针对TDP-43蛋白异常积累的基因治疗策略,以治疗肌萎缩侧索硬化和额颞叶变性等神经退行性疾病 | TDP-43蛋白、siRNA、小细胞外囊泡、小鼠模型中的神经病理学变化 | 合成生物学 | 神经退行性疾病 | siRNA技术、小细胞外囊泡递送、立体定向注射、腺相关病毒递送系统 | NA | NA | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9(可能用于工程化肝细胞,但未明确提及,故输出NA) | 小鼠 | 工程化肝细胞表达并包装靶向TDP-43的siRNA到狂犬病毒糖蛋白标记的小细胞外囊泡中,形成自组装递送系统 | 医学 |