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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-08-27 |
A guide to Direct Pathway Cloning (DiPaC) for natural product discovery
2026-Aug-19, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20250016
PMID:42210810
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综述 | 本文是一篇关于直接途径克隆(DiPaC)技术的综述,重点介绍其在天然产物发现中的应用,包括技术原理、优势、应用案例和操作指南。 | 系统总结了DiPaC技术在不同天然产物类别中的应用,并提供了选择生物合成基因簇、扩增困难序列和组装策略的实用指导。 | 未提及具体局限性,但作为综述,可能缺乏对DiPaC技术本身潜在缺点的深入分析。 | 介绍DiPaC技术作为现代天然产物研究的关键工具,促进生物合成基因簇的克隆和重构。 | 生物合成基因簇(BGCs)及其编码的天然产物生物合成途径。 | 合成生物学 | NA | 长片段PCR、体外DNA组装 | NA | 基因组序列、生物信息学数据 | NA | DiPaC(直接途径克隆) | NA | 生物合成途径的克隆和重构,包括启动子交换、调控元件移除和模块化重建 | 药物发现、生物技术 |
| 102 | 2026-08-27 |
Probiotics unveiled: bridging general health benefits to the era of precision medicine
2026-Jul-17, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05143-1
PMID:42463603
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综述 | 本文综述了益生菌从一般健康促进剂向精准医学中个性化靶向疗法的转变,涵盖其作用机制及与新技术结合的应用前景。 | 将益生菌与心理生物学、下一代益生菌、改造菌株、人工智能和合成生物学技术相结合,提出个性化益生菌疗法的概念。 | 未提供具体的临床试验数据或实证研究结果,主要基于理论综述。 | 探讨益生菌在精准医学中的应用潜力,强调个性化治疗的必要性。 | 益生菌及其在宿主生理中的作用机制,以及与新兴技术的结合。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | 医学 |
| 103 | 2026-08-27 |
Duckweeds: from fundamental biology to a sustainable plant chassis for biotechnology
2026-Apr-16, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-026-00110-1
PMID:41989705
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综述 | 本文综述了浮萍(Lemnaceae)作为可持续生物技术平台的最新进展,涵盖其独特生物学、基因组解码、遗传工具开发及在分子农业中的应用。 | 强调浮萍的简化表观基因组有利于转基因表达,并整合了CRISPR-Cas9编辑等高效遗传工具,将其定位为优于烟草的下一代植物底盘。 | 从概念验证到工业应用仍需克服集成组学数据库、通用遗传工具包和可扩展培养等挑战。 | 评估浮萍作为可持续生物技术植物底盘的潜力,并推动其从基础研究向工业应用转化。 | 浮萍(Lemnaceae)植物。 | 合成生物学 | 不适用 | CRISPR-Cas9编辑,遗传转化 | 不适用 | 基因组数据,文献数据 | 不适用 | CRISPR-Cas9 | 浮萍(Lemnaceae) | 用于生产疫苗、治疗性蛋白质和高价值代谢物的代谢途径。 | 生物技术,农业,医药 |
| 104 | 2026-08-27 |
Biosynthesis of L-Pipecolic Acid and Its Hydroxylated Derivatives: Enzyme, Engineering, and Synthesis Method
2026-04, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70156
PMID:41532523
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综述 | 本文综述了L-哌啶酸及其羟基化衍生物的生物合成研究进展,涵盖酶工程、代谢工程及合成方法 | 系统总结了L-哌啶酸生物合成中的多种策略(包括酶级联、单酶策略和固定化酶策略),并重点强调了脯氨酸羟化酶的蛋白质工程在羟基化衍生物生产中的应用 | 未提及具体的局限性 | 探讨通过酶工程和合成生物学实现L-哌啶酸及其羟基化衍生物可持续高效生产的途径 | L-哌啶酸及其羟基化衍生物(羟基哌啶酸) | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢工程、蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物(具体种类未提及) | 生物合成途径(L-哌啶酸及羟基哌啶酸的生物合成) | 医药、工业生物技术 |
| 105 | 2026-08-27 |
Over-Expression of a Phycocyanin-Interferon Fusion and Differential Cleaving Efficiency in Cyanobacteria (Synechocystis sp. PCC 6803)
2026-03, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70126
PMID:41388596
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研究论文 | 本研究在蓝藻(集胞藻PCC 6803)中过表达藻蓝蛋白-干扰素融合蛋白,并比较TEV和HRV蛋白酶的切割效率 | 首次在蓝藻中比较TEV和HRV 3C蛋白酶的切割效率,发现HRV蛋白酶更优,可整合到蓝藻合成生物学工具包中 | 未详细说明切割效率的具体量化数据或优化条件 | 评估蓝藻作为重组蛋白生产平台,并优化融合蛋白的切割与分离方法 | 人干扰素α-2(IFN)与藻蓝蛋白CpcB亚基的融合蛋白 | 合成生物学 | NA | 重组蛋白表达 | NA | 蛋白质数据 | NA | NA | 集胞藻PCC 6803 | 融合蛋白构建,含TEV或HRV蛋白酶切割位点 | 工业生物技术, 医药 |
| 106 | 2026-08-27 |
Emerging Chemical and Biological Materials Technologies in the Extraplanetary Environment
2026-Jan-12, Nano-micro letters
IF:31.6Q1
DOI:10.1007/s40820-025-01979-8
PMID:41521243
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综述 | 本文综述了在轨空间站、月球表面、火星及小行星等不同地外环境中,化学与生物纳米/微米/介观尺度制造技术的最新进展及其在太空探索中的应用。 | 系统性地整合了空间制造的历史演变与最新技术,并探讨了合成生物学和人工智能在克服微重力、资源有限及极端环境限制中的潜在应用。 | 未明确提及具体局限性,但作为综述,可能受限于现有技术成熟度和实验数据不足。 | 综述地外环境中化学和生物材料制造技术的研究现状、挑战及未来发展方向。 | 地外环境中的化学和生物纳米/微米/介观尺度制造技术及相关材料。 | 材料科学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 航空航天 |
| 107 | 2026-08-27 |
Exploring Fecal Microbiota Transplantation: Potential Benefits, Associated Risks, and Challenges in Cancer Treatment
2026-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.70455
PMID:41496455
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综述 | 本文综述了粪便微生物群移植在癌症治疗中的潜在益处、相关风险和挑战,重点探讨其增强免疫治疗疗效、恢复微生物组稳态及减轻癌症相关并发症的作用。 | 强调FMT在重新编程肿瘤微环境和增强免疫检查点抑制剂反应中的潜力,并探讨精准微生物群落和合成生物学等新兴创新策略。 | 标准化、监管框架和机制理解的不足以及病原体传播和免疫失调等风险限制了临床转化。 | 评估粪便微生物群移植在肿瘤学中的应用前景,并识别其临床整合所需的条件。 | 粪便微生物群移植在癌症治疗中的应用。 | 微生物组学 | 癌症 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 人类 | NA | 医学 |
| 108 | 2026-08-27 |
Receptor dimerization enables ligand discrimination through tunable response heterogeneity
2025-12, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013781
PMID:41336286
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研究论文 | 本研究通过数学模型分析配体-受体相互作用,发现受体二聚化(尤其是异源二聚化)能够通过群体水平的响应异质性编码配体身份,为配体判别提供新机制 | 首次提出配体判别可在群体层面通过响应异质性实现,引入局部缩放度量量化通路组分变异对细胞响应的影响,并揭示异源二聚体受体的功能优势 | 研究基于数学模型,缺乏实验验证;模型假设可能简化真实生物系统的复杂性 | 探究细胞如何通过受体架构在群体水平上区分不同配体信号 | 配体-受体相互作用系统,包括二聚化和异源二聚化受体,以及I型干扰素和Notch信号通路 | 系统生物学 | NA | 数学建模 | 数学模型(非特定机器学习模型) | 模拟数据 | 不适用(基于理论模型) | NA | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 109 | 2026-08-27 |
Deciphering plasmid replication dynamics: a computational approach to predict ColE1-like plasmid copy number
2025-07, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0783
PMID:40664234
|
研究论文 | 提出一种计算工具,通过机器学习模型预测ColE1样质粒拷贝数,强调启动子强度和RNA折叠动力学在复制起点中的作用 | 首次实现从复制起点序列计算预测质粒拷贝数的软件解决方案,突破现有模型缺失的局限 | 未明确提及具体限制,但模型依赖于从复制起点提取的特征,可能对非ColE1样质粒适用性有限 | 简化质粒拷贝数设计,改进合成生物学和工业应用中的质粒工程流程 | ColE1样质粒的复制起点序列及其拷贝数 | 机器学习 | NA | 机器学习 | 机器学习模型 | 序列数据 | 未提供具体样本数量 | NA | NA | 质粒复制起点 | 合成生物学、工业生物技术 |
| 110 | 2026-08-27 |
Creating a Halotolerant Degrader for Efficient Mineralization of p-Nitrophenol-Substituted Organophosphorus Pesticides in High-Saline Wastewater
2025-04, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28923
PMID:39821562
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,将异源生物降解途径整合至耐盐菌Halomonas cupida J9基因组,构建了能高效矿化对硝基苯酚取代有机磷农药的耐盐降解菌J9U-MP | 首次在耐盐底盘菌中整合包含七个基因的异源降解途径和报告基因,实现了在高盐低氧环境下对有机磷农药的完全矿化,并利用GFP进行实时监测 | 未提及 | 开发适用于高盐有机磷农药废水的耐盐降解菌,实现有机磷农药的高效生物修复 | 耐盐菌Halomonas cupida J9,构建的工程菌J9U-MP,甲基对硫磷及其降解中间体 | 合成生物学 | NA | PCR, RT-PCR, 气相色谱, 稳定同位素分析 | NA | 实验数据 | 50 mg/L甲基对硫磷和25 mg/L C-PNP样本,在含60 g/L NaCl废水中培养 | 基因组整合 | Halomonas cupida J9 | 异源降解途径(mpd/pnpABCDEF基因)和报告基因(VHb和GFP)整合至基因组 | 环境修复,工业废水处理 |
| 111 | 2026-08-27 |
Cleavable donor-assisted CRISPR/Cas9 system significantly improves the efficiency of large DNA insertion in Physcomitrium patens
2025-02, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70020
PMID:39981890
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研究论文 | 本研究开发了一种可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统,显著提高了苔藓植物Physcomitrium patens中大DNA片段的插入效率 | 开发了体内可切割(IVC)供体系统,通过供体两端含有Cas9核酸酶识别位点,实现体内线性模板的释放,相比标准环状供体显著提高大片段(5.8-11.1 kb)的敲入效率 | 研究局限于特定苔藓物种和特定基因组位点,尚未在作物中验证其适用性 | 提高CRISPR/Cas9介导的大DNA片段精确插入效率 | 苔藓植物Physcomitrium patens | 基因组编辑 | NA | CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | 基因序列数据 | 涉及4种DNA插入片段(5.8, 7.5, 11.1和7.4 kb)及2个sgRNA靶位点 | CRISPR-Cas9 | Physcomitrium patens(小立碗藓) | 体内可切割供体系统,包含两个Cas9核酸酶识别位点侧翼的同源模板 | 基础研究, 合成生物学, 农业 |
| 112 | 2026-08-27 |
Toward Increasing the Credibility of RNA Design
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4079-1_9
PMID:39312141
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研究论文 | 本文提出了一种扩展的RNA设计协议,通过加入3D结构预测和分析步骤来提高RNA设计的准确性。 | 在RNA设计过程中引入3D结构评估,作为序列优化后的关键验证步骤,以提升设计序列的可靠性。 | 未提及具体的局限性,可能包括计算成本和3D预测的准确性限制。 | 提高RNA设计(逆折叠)的可靠性和准确性,通过使用3D结构进行序列评估。 | RNA序列及其对应的二级结构。 | 生物信息学 | NA | RNA逆折叠,3D结构预测 | NA | RNA序列和结构数据 | 未明确指出样本数量。 | NA | NA | NA | 合成生物学,RNA纳米技术 |
| 113 | 2026-08-27 |
A Computational Approach for Designing Synthetic Riboswitches for Next-Generation RNA Therapeutics
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4079-1_13
PMID:39312145
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综述 | 本文介绍了一种用于设计合成核糖开关以应用于下一代RNA疗法的计算方法,并探讨了其在合成生物学和RNA治疗中的潜力 | 利用先进的计算技术设计合成核糖开关,以实现对疾病特异性代谢物的精准响应,从而推动RNA疗法的创新 | 摘要中未提及具体局限性 | 开发计算方法以设计合成核糖开关,用于下一代RNA治疗 | 合成核糖开关 | 计算生物学 | NA | 计算方法 | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | 核糖开关 | 医学, 合成生物学 |
| 114 | 2026-08-27 |
SHAPE Probing to Screen Computationally Designed RNA
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4079-1_12
PMID:39312144
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研究论文 | 提出一种结合SHAPE-MaP化学探测和定制软件流程的方法,用于高效筛选计算设计的RNA序列 | 开发了定制的软件套件shapemap tools,简化了大规模RNA设计序列的筛选流程,并解决了设计序列间可能仅有一个核苷酸差异带来的挑战 | 未明确提及具体限制,但可能包括对实验条件的要求和数据分析的复杂性 | 开发高效、准确的RNA设计筛选方法,以支持合成生物学和RNA疗法的发展 | 计算设计的RNA序列 | 合成生物学 | NA | SHAPE-MaP | NA | RNA结构探测数据 | 数千条RNA序列 | NA | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 115 | 2026-08-27 |
Directed evolution of material-producing microorganisms
2024-07-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2403585121
PMID:39042685
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研究论文 | 本文利用高通量定向进化平台增强产生材料的微生物适应性,并识别提高材料生产能力的遗传途径,以纤维素产生微生物为模型,成功分离出纤维素过量生产菌株 | 利用液滴微流控平台实现全微生物高通量定向进化,无需预先了解基因型-表型关联,并能揭示意外的基因型-表型联系,如蛋白酶复合体基因与纤维素形成能力的关系 | 文中未明确提及局限性,但可能受限于模型微生物的特异性以及随机突变池的规模 | 提高天然微生物生产材料的能力,开发可持续制造的新菌株,并揭示基因型-表型关联 | 产生纤维素的微生物(模型生物)及其随机突变体 | 合成生物学 | NA | 高通量定向进化,液滴微流控,测序 | NA | 序列数据,表型数据 | 初始突变体池包含40,000个随机突变体,最终筛选出少量纤维素过量生产菌株 | NA | 产生纤维素的细菌(具体未指明) | NA | 可持续制造,材料生产 |
| 116 | 2026-08-26 |
Reconstructing food colorants via synthetic biology: From microbial cell factories to sustainable biomanufacturing supply chains
2026-Oct-31, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.120221
PMID:42637367
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和代谢工程构建微生物细胞工厂,以可持续方式生产红、黄、蓝三原色食品着色剂的研究进展,并探讨了相关挑战与未来方向 | 系统性地从分子到系统层面评估了多尺度工程策略,并对比了全球监管框架,为生物基着色剂的工业化整合提供了综合视角 | 未涵盖所有食品着色剂类别,且对工业应用中的具体技术瓶颈(如成本、规模化)讨论有限 | 探讨微生物合成食品着色剂的技术进展、监管挑战及未来研究重点,以推动其工业化应用 | 微生物细胞工厂生产的红、黄、蓝色食品着色剂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物(如细菌、酵母等) | NA | 食品工业 |
| 117 | 2026-08-26 |
Innovations in Bacteriophage Genome Engineering for Combating Multidrug-Resistant Bacterial Infections
2026-Oct, Foodborne pathogens and disease
IF:1.9Q3
DOI:10.1089/fpd.2024.0194
PMID:40216545
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综述 | 本文综述了噬菌体基因组工程的最新进展,旨在应对多重耐药细菌感染,重点介绍了CRISPR/Cas9、同源重组等工程技术及其应用 | 系统总结了利用CRISPR/Cas9、同源重组等先进基因组工程技术改造噬菌体,以增强其靶向性和宿主范围,为治疗多重耐药菌感染提供新思路 | 未详细讨论工程噬菌体在临床转化中的具体挑战,如体内稳定性、免疫反应等问题 | 探讨噬菌体基因组工程在克服多重耐药菌感染中的潜力和未来发展方向 | 多重耐药细菌及其噬菌体 | 合成生物学 | 多重耐药菌感染 | CRISPR/Cas9,同源重组 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | NA | 医学 |
| 118 | 2026-08-26 |
Directed evolution of functional intrinsically disordered proteins
2026-Sep, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-025-02128-3
PMID:41513854
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研究论文 | 本文提出一种定向进化方法,用于在活细胞中进化功能性的合成内在无序蛋白(synIDPs),并展示其在蛋白质电路调控和抗生素耐药性逆转中的应用。 | 首次系统性地开发了定向进化方法,用于进化具有不同相行为和热响应特性的合成内在无序蛋白,并引入了反选择方法以筛选作为溶解度标签的蛋白。 | 摘要未提及具体局限性。 | 开发一种系统性的定向进化方法,以克服设计功能性合成内在无序蛋白的挑战,并扩展其在合成生物学和生物技术中的应用。 | 合成内在无序蛋白(synIDPs)及其在活细胞中的相行为、热响应和溶解度特性。 | 合成生物学 | NA | 定向进化、反选择 | NA | 蛋白序列和表型数据 | NA | NA | 活细胞(具体未指明) | 蛋白质电路 | 合成生物学, 生物技术 |
| 119 | 2026-08-26 |
Probiotic-Derived Antimicrobial Proteins and Peptides: Molecular Mechanisms, Clinical Applications, and Future Therapeutic Perspectives
2026-Aug-24, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11180-x
PMID:42635917
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综述 | 本文综述了益生菌来源的抗菌蛋白和肽(PAPs)的分子机制、临床用途及未来治疗前景,重点介绍了其直接抗菌作用和宿主调节功能。 | 系统总结了PAPs的四类直接抗菌机制及其与宿主调节的双重功能,并探讨了合成生物学和人工智能等前沿技术在其开发和递送中的应用。 | PAPs的转化应用仍面临稳定性、可扩展性、安全性和监管分类等挑战,相关解决方案尚处早期阶段。 | 评估PAPs的抗菌机制、宿主调节效应及其在临床和食品等领域的应用潜力,并为未来开发提供方向。 | 益生菌(特别是乳酸菌)产生的抗菌蛋白和肽,如细菌素和酪蛋白水解片段。 | 微生物学、医学、蛋白质工程 | 感染性疾病(包括多重耐药病原体感染) | NA | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学、人工智能辅助发现 | 乳酸菌(作为产生菌) | NA | 医学、食品工业、生物技术 |
| 120 | 2026-08-26 |
SynBio 8.0: A Portrait of a Growing Canadian Ecosystem
2026-Aug-24, Canadian journal of microbiology
IF:1.8Q4
DOI:10.1139/cjm-2026-0122
PMID:42636477
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会议综述 | 本文总结了在加拿大滑铁卢大学举办的第八届年度加拿大合成生物学研讨会(SynBio 8.0)的主要观点和活动,展示了加拿大合成生物学领域的多样性和发展势头。 | 该会议涵盖了从生物制造、酶工程到环境微生物学、新工具开发和植物合成生物学等多个前沿主题,并创下了海报提交数量的纪录,反映了该领域的快速发展。 | 本文为会议综述,未提供具体研究数据或详细技术分析,主要基于会议讨论和演讲内容。 | 旨在展示加拿大合成生物学社区的现状、趋势和未来方向,强调跨学科合作和实际应用。 | 加拿大合成生物学社区的研究人员、学员和行业参与者。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本(会议记录、演讲摘要) | 约140名来自加拿大及国际的参会者 | NA | NA | NA | 工业生物技术, 环境, 农业, 材料 |