合成生物学相关文章
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当前共找到 5384 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-07-13 |
An advanced genome engineering platform for Komagataella phaffii enabling versatile in vivo DNA assembly and multiplex integration
2026-Jul-11, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00731-z
PMID:42436509
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研究论文 | 开发了一种用于Komagataella phaffii的高级基因组工程平台，实现了高效的多基因体内组装和多重整合 | 通过协同删除Ku70和过表达RAD52构建了HR增强型底盘dKR，显著提高了CRISPR/Cas9介导的基因组编辑效率和可靠性 | 未提及具体局限性，但可能涉及对非模式生物中DNA修复途径的依赖及规模化应用的潜在挑战 | 加速基于甲醇的生物制造的DBTL循环，提升Komagataella phaffii作为C1合成生物学底盘的能力 | Komagataella phaffii菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, 体内多片段组装, tRNA-核酶CRISPR系统 | NA | 基因组编辑效率数据, 代谢产物产量数据 | 多个基因组编辑实验和代谢通路验证，包括九片段组装和三位点整合 | CRISPR-Cas9 | Komagataella phaffii | 类胡萝卜素生物合成途径（β-胡萝卜素生产） | 合成生物学, 代谢工程, 生物制造, 工业生物技术 |
| 102 | 2026-07-13 |
Antibiotic factories on the move: Synthetic bacteria survive drinking water treatment and continuously produce antibiotics
2026-Jul-08, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2026.126462
PMID:42435597
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研究论文 | 该研究发现一种高产合成抗生素的链霉菌LJ1018在进入水源后，不仅存活下来，还能持续产生抗生素，并通过饮用水处理系统传播，增加抗生素耐药性风险 | 首次揭示了高产合成抗生素细菌在完整饮用水供应系统（从水源到水龙头）中的命运，提出“移动抗生素工厂”的概念，颠覆了传统水安全认知 | NA | 评估高产合成抗生素细菌在饮用水供应系统中的存活、抗生素持续生产及其对耐药性传播的影响 | 高产合成抗生素的链霉菌LJ1018及其在饮用水处理系统中的行为 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 实验数据 | NA | NA | 链霉菌 | 高产抗生素合成途径 | 环境安全 |
| 103 | 2026-07-13 |
Live-cell imaging of enhancer-promoter dynamics reveals transient contact-driven gene activation
2026-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.21.733446
PMID:42367879
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研究论文 | 通过活细胞超分辨率成像技术揭示增强子-启动子瞬间接触驱动基因激活的机制 | 首次通过合成生物学平台结合超分辨率活细胞成像技术，实现对增强子-启动子三维距离和新生转录的同时可视化，发现转录激活由~25-42纳米的瞬间接触调控 | 研究主要基于细胞系实验，尚未在体内或复杂组织中验证该瞬间接触模型的普适性 | 阐明增强子与启动子在空间和时间上的相互作用机制及其与转录激活的关系 | 增强子-启动子相互作用及转录动力学 | 合成生物学 | NA | 超分辨率活细胞成像 | NA | 图像 | 多种细胞系 | 合成生物学平台 | 哺乳动物细胞 | 增强子-启动子相互作用可视化系统 | 医学 |
| 104 | 2026-07-13 |
Artificial intelligence revolutionizes cellular metabolic pathway reconstruction
2026-Apr, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.01.003
PMID:41850996
|
研究论文 | 本文提出了一种整合逆合成规划与生物约束的框架，提升代谢路径重建的生物可行性 | 创新性地将逆合成规划与大语言模型结合，实现代谢网络的跨层次建模与智能优化 | NA | 利用人工智能技术革新细胞代谢路径重建方法，增强路径设计的生物可行性 | 细胞代谢路径 | 合成生物学 | NA | NA | 大语言模型 | NA | NA | NA | NA | 代谢路径 | 工业生物技术 |
| 105 | 2026-07-13 |
Advances in gene editing tools for four typical Gram-positive bacteria
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1882312
PMID:42434562
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综述 | 本文综述了四种典型革兰氏阳性菌基因编辑工具的发展，从传统同源重组到CRISPR-Cas9、碱基编辑器和大片段整合工具，并总结了面临的挑战和策略 | 系统梳理了四种代表性革兰氏阳性菌基因编辑工具的演进历程，并针对宿主修复能力、工具兼容性和编辑器固有限制提出了通用策略和工具选择建议 | 结论不能直接推广到所有革兰氏阳性菌，仅针对四种特定菌种进行了分析 | 为革兰氏阳性菌的基因编辑研究提供技术参考 | 四种革兰氏阳性菌：枯草芽孢杆菌、乳酸乳球菌、金黄色葡萄球菌和产气荚膜梭菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 碱基编辑器, 大片段整合工具, 同源重组 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌, 乳酸乳球菌, 金黄色葡萄球菌, 产气荚膜梭菌 | NA | 合成生物学, 工业发酵, 益生菌开发 |
| 106 | 2026-07-13 |
The promise and peril of mirror bacteria
2026, Acta biochimica Polonica
IF:1.4Q4
DOI:10.3389/abp.2026.16673
PMID:42434594
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评论 | 探讨镜像细菌从理论走向现实所带来的机遇与风险，并分析其在伦理、监管和社会层面的影响 | 首次将镜像细菌的讨论从单纯生物安全扩展到伦理、监管和文化等更广泛的领域，论证其作为合成生物学治理与伦理框架建设的测试案例 | 未提供具体的实验数据或技术方案，仅为前瞻性视角分析 | 评估镜像细菌的潜力和风险，为合成生物学监管与伦理框架的构建提供参考 | 镜像细菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 信息存储, 生物工程 |
| 107 | 2026-07-13 |
Bacteria-Mediated Intracellular Radical Polymerizations
2025-03-19, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c17257
PMID:40036043
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研究论文 | 本研究展示了细菌细胞通过自然存在的生物分子活性引发原子转移自由基反应，实现丙烯酰胺、丙烯酸和甲基丙烯酸类单体在胞内聚合 | 首次证实细菌细胞可利用天然生物分子引发胞内自由基聚合，提供了一种新的细胞工程和合成生物学工具 | 仅使用了有限类型的单体（丙烯酰胺、丙烯酸、甲基丙烯酸类），未探索更广范围的单体和聚合条件 | 探究细菌细胞作为活催化剂进行胞内自由基聚合的可行性及细胞相容性 | 细菌细胞（具体菌种未在摘要中明确指定） | 合成生物学 | NA | NMR, GPC, 荧光标记, 荧光显微镜, 流式细胞术 | NA | 图像, 光谱, 色谱数据 | NA | NA | 细菌（未具体指定） | 胞内自由基聚合体系（基于原子转移自由基聚合引发剂） | 细胞工程, 合成生物学 |
| 108 | 2026-07-13 |
Transcriptional response of Methanosarcina acetivorans to repression of the energy-conserving methanophenazine: CoM-CoB heterodisulfide reductase enzyme HdrED
2024-12-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00957-24
PMID:39472004
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研究论文 | 研究Methanosarcina acetivorans在抑制能量保守性甲烷苯并蒽醌：CoM-CoB异二硫化物还原酶HdrED时的转录响应 | 揭示细胞通过CoM-S-S-CoB和ATP可用性将甲烷生成与基因调控耦合的未知机制，并发现甲基营养型甲烷生成调节因子MsrC参与异二硫化物感应 | NA | 了解产甲烷古菌如何感知和响应末端电子受体的可用性 | Methanosarcina acetivorans | 机器学习 | NA | 转录组分析 | NA | 转录本丰度数据 | NA | NA | Methanosarcina acetivorans | NA | 可再生能源生产, 可持续化学品生产, 工业生物技术 |
| 109 | 2026-07-12 |
Integrated multi-omics analysis reveals a pH-driven metabolic and translational switch in Ureaplasma parvum
2026-Jul-10, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03463-25
PMID:42429378
|
研究论文 | 通过整合多组学分析揭示微小病原体解脲支原体在无典型转录调控系统下依赖pH驱动的代谢与翻译适应机制 | 首次提出最小基因组细菌通过预先存在的功能模块差异激活实现表型可塑性，并揭示表观转录组（RNA修饰）在pH适应中的动态重组作用，挑战了传统认为细菌适应必须依赖转录调控的观点 | 未明确pH信号直接感知机制，且研究仅限于体外条件，未在宿主微环境验证模型 | 构建解脲支原体在pH波动条件下的系统级适应模型，解释最小基因组微生物的适应性可塑性机制 | 解脲支原体（Ureaplasma parvum） | 微生物学, 系统生物学 | 泌尿生殖道感染 | 蛋白质组学, 代谢组学, RNA修饰分析（表观转录组学） | NA | 蛋白质丰度, 代谢物浓度, RNA修饰谱 | NA（未提供具体样本量） | NA | 解脲支原体（天然宿主为人类泌尿生殖道） | NA | 医学, 合成生物学 |
| 110 | 2026-07-12 |
Engineering extracellular vesicle biogenesis for therapeutic gene delivery: emerging genetic programming strategies and translational prospects
2026-Jul-10, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-12320-w
PMID:42429865
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综述 | 本文综述了利用遗传工程策略改造细胞外囊泡生物发生过程，以实现治疗性基因递送的最新进展和转化前景 | 整合了细胞外囊泡生物发生知识与新兴遗传工程技术，包括CRISPR-Cas9基因组编辑和合成生物学工具，以实现可编程基因递送系统的构建 | 面临囊泡异质性、大规模生产和临床转化等关键挑战 | 探讨将细胞外囊泡转化为可编程基因递送系统的策略及其在精准医学中的应用前景 | 细胞外囊泡及其在基因治疗中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 可编程基因递送系统 | 医学 |
| 111 | 2026-07-12 |
The disorazole family of potent anticancer agents: structures, bioactivity, total synthesis, and heterologous biosynthesis
2026-Jul-10, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.07.028
PMID:42431458
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综述 | 系统综述了disorazole家族的结构、生物活性、全合成和异源生物合成，阐述了从化学合成迈向工程化生物合成的范式转变 | 阐明了从传统全合成挑战（如通过大环内酯化或环二聚化合成A1、C1、Z1）转向可编程生物合成工程（F和Z系列）的范式转变，并重点展示了异源表达、基于Red/ET重组工程的途径重构和模块化聚酮合酶工程等关键技术如何革新了这些分子的生产和多样化 | NA | 对disorazole家族进行全面系统分析，弥合复杂化学合成与现代生物合成工程之间的差距，并提出整合生物合成可扩展性与合成化学精度的未来转化策略 | Disorazole家族天然产物（包括A/C系列和Z-F家族） | 天然产物化学，合成生物学 | 癌症 | 异源表达，Red/ET重组工程，模块化聚酮合酶工程，全合成（通过大环内酯化或环二聚化） | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Red/ET重组工程 | Sorangium cellulosum | 异源生物合成途径重构和模块化聚酮合酶工程，用于生产disorazole及其类似物 | 医学 |
| 112 | 2026-07-12 |
Deep Learning Predicts Dissimilar DNA-DNA Binding and Engineers Hyperconnected Networks
2026-Jul-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75395-w
PMID:42426013
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研究论文 | 开发了BINND模型，通过深度学习预测非正交DNA-DNA相互作用，并展示了其在超连网络工程中的应用 | 提出从回避弱或非特异性相互作用转向利用完整序列空间的新范式，结合超高通量平台和深度学习模型，实现快速准确的预测 | 未提及模型在复杂生物系统或临床环境中的验证，也未讨论潜在的非特异性交叉干扰问题 | 开发能够准确快速预测非正交DNA-DNA相互作用的模型，以扩展合成生物学的序列空间利用 | DNA-DNA相互作用 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 神经网络（BINND） | DNA相互作用数据 | 数百万个相互作用测量 | NA | NA | 超连网络 | 医学, 生物工程, DNA折纸 |
| 113 | 2026-07-12 |
Heterologous Expression of an Abandoned Termite Mound Fungus Gene Cluster Reveals a Protective Aldehyde-Alcohol Cycle and a Candidate Termiticidal Metabolite
2026-Jul-05, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00101
PMID:42402854
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研究论文 | 通过合成生物学方法异源表达废弃白蚁巢真菌的基因簇，揭示了一个保护性的醛-醇循环以及一种候选杀蚁代谢产物 | 首次通过合成生物学手段解码隐蔽生态代谢，整合多组学与异源途径表达，阐明了一个空间分离的醛-醇循环自我保护系统，并发现了一种具有强效杀蚁活性的代谢产物 | 未提及 | 探索药用真菌乌灵参（Wulingshen）在白蚁废弃巢穴中特异性适应的分子基础 | 乌灵参真菌及其附属微生物组 | 合成生物学 | NA | 宏基因组学、转录组学、异源表达 | NA | 测序数据 | 野生标本样本 | 合成生物学工具（未具体说明） | 真菌宿主（未具体说明） | α-吡喃酮代谢物家族合成途径及醛-醇循环 | 生态学, 农业（害虫防治） |
| 114 | 2026-07-12 |
Technology-driven revolution in CO2 fixation: From natural pathways to programmable Biosystems
2026-Jul-02, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108964
PMID:42392238
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综述 | 本文综述了从自然途径到可编程生物系统的二氧化碳固定技术驱动革命 | 创新性在于集成分析了从自然途径优化到人工系统构建的范式转变，强调了代谢工程、合成生物学、电化学和纳米材料的深度融合，并引入人工智能辅助设计 | 综述主要聚焦于微生物系统，可能未涵盖其他潜在的二氧化碳固定技术如化学或物理方法，且对实际应用中的经济可行性讨论有限 | 总结并分析二氧化碳固定技术的进展，推动精准、高效和碳负性的生物制造 | 二氧化碳固定途径和微生物转化系统 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas, 微生物电合成, 半人工光合系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 微生物 | 合成途径（如rGly, CETCH, THETA循环） | 环境, 工业生物技术 |
| 115 | 2026-07-12 |
Synthetic biology-engineered immunotherapies: Precision control of immune responses
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108871
PMID:41864375
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综述 | 合成生物学设计的免疫疗法通过精确控制免疫反应，为癌症和免疫疾病提供新策略 | 利用合成生物学设计模块化信号回路和逻辑门控激活，实现免疫行为的上下文依赖和反馈控制，提升治疗特异性和可调性 | 未提及具体临床试验数据和长期安全性评估 | 综述合成生物学在精准免疫治疗中的转化潜力 | 合成免疫回路、逻辑门控激活、反馈控制细胞因子分泌 | NA | 肿瘤, 免疫疾病 | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 哺乳动物细胞 | 逻辑门控激活回路、反馈控制细胞因子分泌回路 | 医学 |
| 116 | 2026-07-12 |
Genetic Toolbox Expansion Enables Constitutively Fluorescent Lacticaseibacillus rhamnosus for Functional Microbiome Research
2026-Jul, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70405
PMID:42426988
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研究论文 | 扩展了鼠李糖乳杆菌的遗传工具箱，实现了组成型荧光表达，用于功能性微生物组研究 | 通过直接质粒克隆和测试在植物乳杆菌中验证过的遗传元件，首次在鼠李糖乳杆菌GR-1中实现组成型荧光蛋白（mCherry、mScarlet3和sfGFP）表达，并表征了启动子的热响应性和稳定性 | 遗传工具仍有限，仅验证了部分启动子和荧光蛋白，未涉及更复杂的合成生物学应用 | 扩展鼠李糖乳杆菌的遗传工具箱，推动功能性微生物组研究和合成生物学应用 | 鼠李糖乳杆菌GR-1和GG菌株 | 合成生物学 | NA | 直接质粒克隆 | NA | NA | 两个鼠李糖乳杆菌菌株（GR-1和GG）及一个金黄色葡萄球菌菌株 | NA | 鼠李糖乳杆菌GR-1 | 组成型荧光蛋白表达系统 | 医学、工业生物技术 |
| 117 | 2026-07-12 |
Diverse molecular mechanisms of in vivo haploid induction in plants: from fertilization interference to genome programming
2026-Jun-29, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03882-x
PMID:42373814
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综述 | 综述植物体内单倍体诱导的三种核心分子机制及其应用平台 | 将雄配子缺陷、配子体重编程和着丝粒工程三种机制整合为统一框架，并强调无转基因基因组编辑平台及AI辅助设计 | 双子叶植物、大基因组作物及父本单倍体诱导效率低 | 阐明植物体内单倍体诱导的分子机制并推动跨物种通用系统开发 | 植物雄性配子（MTL/DMP/KPL）、配子体（BBM-BAR1）、着丝粒（CENH3/KNL2） | 农业生物技术 | NA | 基因组编辑（HIEdit, GEDH）、多组学、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物（作物） | 合成无融合生殖通路 | 农业 |
| 118 | 2026-07-12 |
Endogenous constitutive promoters with a broad range of transcriptional activities for plant synthetic biology
2026-Jun-22, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03885-8
PMID:42329465
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研究论文 | 本研究从本塞姆氏烟草中鉴定内生组成型启动子，并定量表征其转录活性，为植物合成生物学提供CaMV 35S启动子的可靠替代 | 首次系统鉴定了本塞姆氏烟草的内源组成型启动子库，通过GFP和双荧光素酶报告系统定量测定其转录强度，并在多个异源物种中验证了启动子活性的跨物种保守性 | 启动子在单子叶植物（如玉米）中的活性显著降低，跨物种应用的通用性有限 | 为植物合成生物学提供具有定量定义转录强度的内源组成型启动子，作为CaMV 35S启动子的替代方案 | 本塞姆氏烟草的内源组成型启动子 | 植物合成生物学 | NA | GFP报告基因分析、双荧光素酶报告系统、原生质体瞬时表达 | NA | 基因表达数据 | 多个候选启动子，在拟南芥、白菜、辣椒、玉米等物种的原生质体中测试 | NA | 本塞姆氏烟草、白菜、辣椒、玉米 | 组成型启动子表达系统 | 农业、工业生物技术 |
| 119 | 2026-07-12 |
The big kinship of proline: Counting saturated and unsaturated secondary amino acids of different ring size
2026-Jun-19, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.06.010
PMID:42320729
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研究论文 | 对脯氨酸及其同系物（不同环大小的饱和与不饱和环状次级氨基酸）进行数学枚举和特性概述 | 提出了所有可能环状次级α-氨基酸和亚氨基酸的数学枚举程序，导出了修正卢卡斯序列的递归公式以及明确计数公式，为虚拟化合物数据库构建和化学合成计算机辅助设计提供了新方法 | 研究主要基于理论枚举和已知结构概述，未涉及实验验证或实际应用的具体效果评估 | 枚举不同环大小下所有可能的饱和与不饱和环状次级氨基酸，并提供这些化合物的结构和功能特性概述 | 脯氨酸及其同系物（不同环大小的环状次级α-氨基酸和亚氨基酸） | 合成生物学 | NA | 数学枚举 | NA | 文本与化学结构数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学, 药理学 |
| 120 | 2026-07-12 |
A programmable Aeromonas chassis, AMAX2, for advanced biomanufacturing
2026-06-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00231-26
PMID:42148730
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研究论文 | 该论文报道了下一代工程化气单胞菌底盘AMAX2，通过删除毒力和非必需基因增强生物安全性，同时保持快速生长和蛋白质表达，并整合多种合成生物学功能用于先进生物制造 | AMAX2在保持高生长速率和蛋白质产量的基础上，通过基因删除显著提升生物安全性，并集成可诱导系统、tRNA补充、基因组规模CRISPRi-seq必需基因鉴定、无DNA微细胞生产、表面展示和蛋白靶向分泌等多功能模块 | 论文未明确讨论AMAX2在长期培养中的遗传稳定性，以及与其他常用底盘（如大肠杆菌）在工业规模生产中的成本效益比较 | 开发一种兼具高性能、生物安全性和多功能性的可编程微生物底盘，用于先进生物制造和生物治疗开发 | 气单胞菌底盘AMAX2及其工程化改造 | 合成生物学 | NA | CRISPRi-seq, 基因删除, 质粒系统, 细胞表面展示, 蛋白质分泌系统 | NA | 基因组数据, 功能实验数据, 生物安全性数据 | 细胞和动物模型（具体数量未在摘要中提供） | CRISPRi-seq, 质粒工程 | 气单胞菌 | 可诱导表达系统, tRNASupplementation系统, SpyCatcher-SpyTag表面展示系统, VI型分泌系统介导的蛋白质转运 | 工业生物技术, 医学 |