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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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101 | 2024-12-12 |
Regulation of daptomycin biosynthesis in Streptomyces roseosporus: new insights from genomic analysis and synthetic biology to accelerate lipopeptide discovery and commercial production
2024-Dec-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00024b
PMID:39279757
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研究论文 | 本文通过基因组分析和合成生物学方法,研究了Streptomyces roseosporus中达托霉素生物合成的调控机制,并探讨了加速脂肽类抗生素发现和商业化生产的新见解 | 本文通过比较低产和高产突变株的基因组序列,发现了高产株在启动子区域存在两个突变,这些突变可能通过翻译偶联机制影响达托霉素的生物合成。此外,本文还回顾了近期关于该启动子区域的研究,提出了通过代谢工程、合成生物学和定向突变来调控至少十个正负调控基因,以提高达托霉素产量的策略 | 本文主要基于基因组分析和合成生物学方法,未涉及具体的实验验证,因此其结论的实际效果需要进一步实验验证 | 研究达托霉素生物合成的调控机制,并探索通过合成生物学和代谢工程提高其产量和加速新型脂肽类抗生素的发现与商业化 | Streptomyces roseosporus中的达托霉素生物合成基因簇及其调控机制 | 合成生物学 | NA | 基因组分析,代谢工程,合成生物学 | NA | 基因组序列 | 两个菌株(野生型低产株和通过MNNG诱变的高产株) |
102 | 2024-12-12 |
Biomimetic Materials to Fabricate Artificial Cells
2024-Dec-11, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00241
PMID:39591535
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综述 | 本文综述了人工细胞的发展及其基于仿生材料构建的策略 | 讨论了从简单细胞支架到多隔室系统、从功能模块构建到关键代谢行为模拟,甚至到仿生通信网络的构建,代表了该领域的一个令人兴奋的进展 | 对当前领域的瓶颈进行了粗略分析 | 探讨人工细胞的研究及其未来发展,为开发各种生命启发的组装材料提供理论基础 | 人工细胞及其构建策略 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
103 | 2024-12-12 |
Ultrahigh yields of giant vesicles obtained through mesophase evolution and breakup
2024-Dec-11, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d4sm01109k
PMID:39618312
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研究论文 | 本文报道了一种通过脂质自组装和膜断裂途径获得超高产率巨型单层囊泡的新方法 | 发现了一种新的脂质自组装途径,称为“剪切诱导的碎片化”,能够实现超过50%的超高产率巨型单层囊泡 | NA | 探索和优化巨型单层囊泡的制备方法,以提高其产率和应用潜力 | 巨型单层囊泡及其在生物物理模型、软材料、合成生物学和生物医学应用中的应用 | NA | NA | 脂质自组装 | NA | 图像 | 包含3 mol% PEG2000-DSPE的脂质膜和不同脂质混合物 |
104 | 2024-12-12 |
Intron RPS25Ai, a Novel DNA Element, Has Global Effects on Synthetic Pathway Engineering by Empowering Protein Synthesis
2024-Dec-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c11278
PMID:39660479
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研究论文 | 研究探讨了内含子RPS25Ai作为一种新型DNA元件在合成途径工程中的潜力,展示了其在转录和翻译水平上的时空调控模式 | 首次揭示了内含子RPS25Ai在合成生物学中的多功能性,能够通过精确的剪接事件和转录后过程实现多层次的调控 | 研究主要集中在酵母细胞工厂中,尚未在其他生物系统中验证其效果 | 探索内含子作为新型生物DNA元件在合成生物学中的应用潜力 | 内含子RPS25Ai及其在酵母细胞工厂中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | 基因表达数据 | 内含子RPS25Ai在酵母细胞工厂中的应用,β-胡萝卜素产量增加了4.29倍 |
105 | 2024-12-12 |
Bacterial Metallostasis: Metal Sensing, Metalloproteome Remodeling, and Metal Trafficking
2024-Dec-10, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00264
PMID:39658019
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综述 | 本文综述了细菌中金属稳态的机制,包括金属感应、金属蛋白组重塑和金属运输 | 本文系统性地总结了金属感应蛋白和金属感应核糖开关的多样性,并定义了每个传感器超家族中的一般原则 | 本文指出了在金属稳态理解上仍存在的知识空白,并呼吁进一步的研究 | 探讨细菌中金属稳态的机制及其在生物学中的作用 | 细菌中的金属感应、金属蛋白组重塑和金属运输机制 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
106 | 2024-12-12 |
AuxSynBio: synthetic biology tools to understand and engineer auxin
2024-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103194
PMID:39255527
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综述 | 本文综述了植物激素生长素在合成生物学中的应用及其在植物生长发育中的关键作用 | 通过在酵母中重现信号通路和设计正交生长素受体对,深入理解生长素通路的调控机制 | NA | 探讨生长素在合成生物学中的双重角色,即作为研究对象和工具 | 植物激素生长素及其信号通路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
107 | 2024-12-12 |
Organelle-Specific Smart Supramolecular Materials for Bioimaging and Theranostics Application
2024-Nov-28, Topics in current chemistry (Cham)
DOI:10.1007/s41061-024-00483-8
PMID:39607460
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综述 | 本文总结了基于智能荧光团的特定细胞器有序纳米结构的制备方法,用于高效的生物成像和癌症治疗学应用 | 提出了通过刺激响应在特定细胞器中形成超分子纳米结构的方法,并应用于生物成像和治疗学 | 本文主要总结了现有方法和挑战,未提供具体实验数据或新方法的详细验证 | 探讨智能超分子材料在生物成像和治疗学中的应用 | 特定细胞器中的超分子纳米结构 | NA | 癌症 | 自组装 | NA | NA | NA |
108 | 2024-12-12 |
T7 phage-assisted evolution of riboswitches using error-prone replication and dual selection
2024-01-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52049-9
PMID:38287027
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研究论文 | 本文展示了利用T7噬菌体辅助进化技术,通过错误倾向复制和双重选择系统,成功进化了茶碱核开关 | 本文创新性地设计了T7AE技术,通过双重选择系统实现了对功能性核开关的有效筛选和富集 | NA | 开发一种新的技术来进化和改进基因开关,特别是基于非编码RNA的开关 | 茶碱核开关及其在T7噬菌体中的进化 | 合成生物学 | NA | 错误倾向复制 | NA | DNA | 65,536个工程化的T7噬菌体 |
109 | 2024-12-12 |
Harnessing synthetic biology to engineer organoids and tissues
2023-01-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.12.013
PMID:36608674
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学工程化类器官和组织的方法 | 本文引入了合成生物学工具,通过基因操作细胞通讯、粘附和细胞命运,以改进类器官模型和组织设计 | NA | 深入理解发育原理,改进类器官模型,并增强再生组织设计的能力 | 类器官和组织 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
110 | 2024-12-12 |
Quantifying heterologous gene expression during ectopic MazF production in Escherichia coli
2022-May-13, BMC research notes
IF:1.6Q2
DOI:10.1186/s13104-022-06061-9
PMID:35562780
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研究论文 | 本研究量化了在Escherichia coli中异位过表达MazF对异源基因表达的影响 | 首次量化了MazF过表达对异源蛋白表达的影响,并探讨了不同mRNA结构对表达的影响 | 研究结果表明MazF过表达会增加细菌群体的异质性,需要在实验中优化过表达的强度和持续时间 | 探讨MazF过表达对异源蛋白表达的影响 | Escherichia coli中异源蛋白的表达 | 合成生物学 | NA | 流式细胞术 | NA | 荧光蛋白表达水平 | 使用了包含ACA序列和不含ACA序列的mRNA作为报告基因 |
111 | 2024-12-11 |
Development of a specific biosensor for sesquiterpene based on SELEX and directed evolution platforms
2025-Feb-01, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2024.127186
PMID:39522280
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研究论文 | 本研究开发了一种基于SELEX和定向进化平台的特定生物传感器,用于检测倍半萜烯化合物amorpha-4,11-二烯 | 首次开发了一种对倍半萜烯amorpha-4,11-二烯具有特异响应的riboswitch生物传感器 | NA | 开发一种用于检测和调控小分子的生物传感器,应用于合成生物学中的菌株工程、途径调控和代谢优化 | 倍半萜烯amorpha-4,11-二烯 | 合成生物学 | NA | SELEX, 定向进化, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 序列数据 | 81,520个序列的高亲和力aptamer库 |
112 | 2024-12-10 |
Applied photosynthesis: An idea whose time has come
2025-Jan-01, Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics
DOI:10.1016/j.bbabio.2024.149525
PMID:39571881
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研究论文 | 本文探讨了通过材料科学、合成生物学和纳米材料工程的进步,利用生物混合设备捕获太阳能并驱动氢气生产、光伏、催化及生物传感的新途径 | 本文提出了利用生物混合设备重新部署光合机制,开发环保、高效替代传统太阳能技术的创新方法 | NA | 探索利用光合作用机制开发可持续能源技术的新途径 | 生物混合设备、光合机制、光活性色素、蛋白质工程 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、纳米材料制造 | NA | NA | NA |
113 | 2024-12-10 |
Microbial adaptation and genetic modifications for enhanced remediation in low-permeability soils
2024-Dec-07, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.177916
PMID:39647202
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综述 | 本文综述了在低渗透性土壤中通过微生物适应和基因工程增强生物修复效果的当前知识 | 本文整合了微生物和基因工程策略,设计了能够协同降解复杂土壤基质中污染物的定制微生物群落 | NA | 探讨在低渗透性土壤中增强生物修复效果的微生物适应和基因工程方法 | 低渗透性土壤中的微生物适应和基因工程 | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
114 | 2024-12-10 |
Engineering microbial cell factories by multiplexed spatiotemporal control of cellular metabolism: Advances, challenges, and future perspectives
2024-Dec-05, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108497
PMID:39645209
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综述 | 本文综述了通过时空控制细胞代谢来构建微生物细胞工厂的最新进展,并讨论了未来的挑战和展望 | 探讨了时空控制系统在促进产品生物合成中的应用,并介绍了设计合成隔室在构建高性能微生物细胞工厂中的新方法 | 尚未提及具体的局限性 | 总结时空控制系统在定制高级细胞工厂中的应用,并讨论未来的挑战 | 微生物细胞工厂的时空控制系统和代谢过程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
115 | 2024-12-10 |
Modular Access to C2'-Aryl/Alkenyl Nucleosides with Electrochemical Stereoselective Cross-Coupling
2024-Dec-02, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202418806
PMID:39620453
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研究论文 | 本文报道了一种通过电化学镍催化交叉偶联反应合成高度功能化的C2'-α-芳基/烯基核苷的新方法 | 该方法提供了具有优异立体选择性、广泛底物范围和良好官能团兼容性的C2'-α-芳基/烯基核苷 | NA | 开发一种高效、模块化和选择性的方法来合成C2'-位置修饰的核苷 | C2'-α-芳基/烯基核苷及其在寡核苷酸中的应用 | 化学合成 | NA | 电化学镍催化交叉偶联反应 | NA | NA | 多种2'-溴核苷和(杂)芳基及烯基碘化物 |
116 | 2024-12-10 |
Synthetic biology of metabolic cycles for Enhanced CO2 capture and Sequestration
2024-Dec, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107774
PMID:39260160
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研究论文 | 本文描述了在Escherichia coli中使用改良的三羧酸循环(THETA循环)进行碳固定和氨基酸合成的研究 | 提出了THETA循环,这是一个改良的三羧酸循环,用于增强CO2捕获和封存 | NA | 研究改良的三羧酸循环在碳固定和氨基酸合成中的应用 | Escherichia coli中的THETA循环及其在碳固定和氨基酸合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 酶优化、路径重设计和异源表达 | NA | NA | NA |
117 | 2024-12-10 |
Toolbox of Characterized Genetic Parts for Staphylococcus aureus
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00325
PMID:38064657
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研究论文 | 本文报道了首个用于金黄色葡萄球菌的标准化遗传部件工具箱,包括来自多种细菌的启动子、核糖体结合位点、终止子和质粒复制子,用于精确控制基因表达 | 首次为金黄色葡萄球菌建立了标准化的遗传部件工具箱,并展示了其在理性设计和工程化中的应用 | NA | 开发适用于金黄色葡萄球菌的合成生物学工具 | 金黄色葡萄球菌的遗传部件 | 合成生物学 | NA | DNA组装策略 | NA | 基因表达数据 | 24个组成型启动子,金黄色葡萄球菌ATCC 12600 |
118 | 2024-12-09 |
Discovery, Biomanufacture, and Derivatization of Licorice Triterpenoids
2024-Dec-07, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08110
PMID:39644261
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综述 | 本文综述了甘草三萜的结构、来源、药理活性及其衍生化策略 | 首次全面总结了除甘草酸和甘草次酸之外的甘草三萜的特性,并利用drugCIPHER算法预测其药理活性 | 缺乏对甘草三萜在实际应用中的临床试验数据和长期效果的讨论 | 探讨甘草三萜的发现、生物制造及其衍生化策略 | 甘草三萜及其衍生物 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
119 | 2024-12-09 |
Engineering biology approaches to modulate bacterial biofilms
2024-Dec-05, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.11.002
PMID:39643528
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研究论文 | 本文探讨了利用工程生物学方法控制和改造细菌生物膜的最新进展 | 本文介绍了利用工程生物学方法赋予细菌生物膜新功能的创新方法 | NA | 探索利用工程生物学方法控制和改造细菌生物膜 | 细菌生物膜 | 合成生物学 | NA | 工程生物学方法 | NA | NA | NA |
120 | 2024-12-09 |
A rapid CAT transformation protocol and nuclear transgene expression tools for metabolic engineering in Cyanidioschyzon merolae 10D
2024-Dec-03, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.12.001
PMID:39638031
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的转化和筛选协议,用于在Cyanidioschyzon merolae 10D中进行代谢工程 | 提出了一个快速氯霉素抗性转化协议和核转基因表达工具包,用于Cyanidioschyzon merolae 10D的代谢工程 | NA | 促进Cyanidioschyzon merolae作为代谢工程和未来可持续生物技术生产的藻类系统 | Cyanidioschyzon merolae 10D的代谢工程 | 代谢工程 | NA | 荧光报告基因成像 | NA | NA | NA |