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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1181 | 2024-09-21 |
In Vivo Sampling of Intracellular Heterogeneity of Pseudomonas putida Enables Multiobjective Optimization of Genetic Devices
2023-06-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00009
PMID:37196337
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研究论文 | 本文研究了土壤细菌铜绿假单胞菌细胞内物理化学异质性对基因表达的影响,并通过随机插入DNA片段实现基因装置的多目标优化 | 利用细胞内异质性进行多目标优化,而不是抑制这种异质性 | NA | 研究细胞内异质性对基因装置表达的影响,并实现多目标优化 | 铜绿假单胞菌细胞内异质性及其对基因装置表达的影响 | 合成生物学 | NA | DNA随机插入技术 | NA | 基因数据 | 野生型和生物膜缺陷型铜绿假单胞菌的多个克隆 |
1182 | 2024-09-21 |
Synthetic Biology─High Time to Deliver?
2023-06-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00238
PMID:37322887
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评论 | 本文讨论了合成生物学领域面临的挑战和需要解决的问题 | NA | 本文指出合成生物学领域存在过度承诺和夸大宣传的问题,并强调需要更多基础信息来实现生命过程的设计和重设计 | 探讨合成生物学领域的发展方向和面临的挑战 | 合成生物学领域及其在生命科学、工程学和社会科学中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1183 | 2024-09-20 |
Pangenomic landscapes shape performances of a synthetic genetic circuit across Stutzerimonas species
2024-Sep-17, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00849-24
PMID:39166875
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研究论文 | 研究探讨了基因电路在不同Stutzerimonas物种中的性能差异,揭示了基因组结构和功能对底盘效应的影响 | 通过泛基因组分析和基因表达定量测量,揭示了核心基因组的差异表达是影响基因电路性能的主要因素 | 研究仅限于六个密切相关的非模式细菌宿主,可能无法完全代表所有微生物的情况 | 研究基因组和生理环境如何影响基因电路在不同微生物中的性能,以改进跨多样微生物的生物设计策略 | 六个密切相关的Stutzerimonas物种中的基因电路性能 | 合成生物学 | NA | 泛基因组分析 | NA | 基因表达数据 | 六个密切相关的Stutzerimonas物种 |
1184 | 2024-09-20 |
CRISPR/Cas9-based genome engineering in the filamentous fungus Rhizopus oryzae and its application to L-lactic acid production
2024-Sep, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400309
PMID:39295562
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研究论文 | 开发了一种适用于丝状真菌Rhizopus oryzae的高效CRISPR-Cas9基因编辑系统,并应用于L-乳酸生产 | 首次开发了适用于Rhizopus oryzae的CRISPR-Cas9基因编辑系统,并成功应用于代谢工程调控和合成生物学改造 | NA | 开发适用于Rhizopus oryzae的基因编辑工具,并应用于提高L-乳酸产量 | 丝状真菌Rhizopus oryzae及其基因组编辑 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因组数据 | NA |
1185 | 2024-09-20 |
Reshaping the yeast galactose regulon via GPCR signaling cascade
2023-12-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100647
PMID:37989311
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研究论文 | 本文利用G蛋白偶联受体(GPCR)信号通路重塑酵母半乳糖调节子,以提高酵母菌株的性能和生产力 | 通过合成转录因子将半乳糖调节系统与GPCR信号通路耦合,重构了GAL系统的动态范围、敏感性和响应时间,并使其对热休克产生响应 | NA | 利用合成生物学方法创建用户定义的代谢控制 | 酵母半乳糖调节子和GPCR信号通路 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 一系列工程酵母菌株 |
1186 | 2024-09-20 |
Special Issue "Synthetic Biology for Biosensing in Health and Environmental Applications"
2023-Oct-19, Biosensors
DOI:10.3390/bios13100937
PMID:37887130
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特刊 | 本特刊探讨了生物传感技术在健康和环境应用中的合成生物学方法 | NA | NA | 探讨生物传感技术在健康和环境应用中的合成生物学方法 | 生物传感器的生物感知元件,如酶、抗体、核酸或细胞 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1187 | 2024-09-20 |
Genetic and Environmental Factors Influencing the Production of Select Fungal Colorants: Challenges and Opportunities in Industrial Applications
2023-May-18, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof9050585
PMID:37233296
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综述 | 本文综述了影响三种主要真菌色素(类胡萝卜素、黑色素和聚酮类色素)生产的遗传和环境因素,并探讨了其在工业应用中的挑战和机遇 | 本文强调了分子遗传学研究和环境条件调控在克服这些色素增值和大规模生产挑战中的作用 | NA | 探讨遗传和环境因素对真菌色素生产的影响及其在工业应用中的潜力 | 三种主要真菌色素(类胡萝卜素、黑色素和聚酮类色素) | NA | NA | 分子遗传学研究 | NA | NA | NA |
1188 | 2024-09-20 |
Metabolic Engineering and Synthetic Biology Approaches for the Heterologous Production of Aromatic Polyketides
2023-May-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24108923
PMID:37240269
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综述 | 本文综述了代谢工程和合成生物学在异源生产芳香聚酮类化合物中的最新进展 | 介绍了利用代谢工程和合成生物学策略在模型微生物中高效生产类型II和类型III聚酮类化合物的方法 | 讨论了未来在芳香聚酮类化合物生物合成中面临的挑战和前景 | 探讨代谢工程和合成生物学在异源生产芳香聚酮类化合物中的应用 | 类型II和类型III聚酮类化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
1189 | 2024-09-20 |
Optimized De Novo Eriodictyol Biosynthesis in Streptomyces albidoflavus Using an Expansion of the Golden Standard Toolkit for Its Use in Actinomycetes
2023-May-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24108879
PMID:37240225
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研究论文 | 本文介绍了在链霉菌中通过基因组编辑优化从头合成橙皮素的方法 | 开发了适用于放线菌的金标准工具包扩展,用于基因组编辑和异源生产橙皮素 | NA | 优化橙皮素在链霉菌中的异源生产 | 橙皮素及其在链霉菌中的生产 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 基因组数据 | NA |
1190 | 2024-09-20 |
Focus and Insights into the Synthetic Biology-Mediated Chassis of Economically Important Fungi for the Production of High-Value Metabolites
2023-Apr-27, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms11051141
PMID:37317115
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研究论文 | 本文讨论了通过合成生物学改造经济重要真菌底盘以生产高价值代谢物的新方法 | 利用合成生物学技术改造真菌底盘,以增强或添加生物来源的新化学实体的价值 | 真菌生物学和工程中的知识空白/障碍需要解决,以完全利用有价值的真菌菌株 | 探讨真菌生物基产品的新特性和创建高价值工程真菌菌株以促进产量、生物功能性和代谢物的社会经济价值 | 经济重要真菌及其高价值代谢物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1191 | 2024-09-19 |
Intracellular Construction of Organelle-like Compartments Facilitates Metabolic Flux in Escherichia coli
2024-Sep-18, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c06895
PMID:39230507
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研究论文 | 本文利用Wnt信号通路中的DIX结构域构建了细菌内的合成隔室,以增强代谢通量 | 首次使用DIX结构域及其相互作用基序构建了细菌内的合成隔室,显著增强了代谢通量 | NA | 研究在细菌内构建稳定的合成隔室以增强代谢通量的方法 | 大肠杆菌内的合成隔室及其对代谢通量的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1192 | 2024-09-19 |
Engineering Yarrowia lipolytica for Efficient Synthesis of Geranylgeraniol
2024-Sep-18, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c06749
PMID:39241196
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法改造Yarrowia lipolytica,高效合成Geranylgeraniol | 通过表达异源磷酸酶基因、增强前体供应和下调角鲨烯合成途径,实现了Geranylgeraniol的高效合成,创下了摇瓶中Geranylgeraniol产量的新纪录 | NA | 提高Geranylgeraniol的合成效率 | Yarrowia lipolytica | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1193 | 2024-09-19 |
RNA exon editing: Splicing the way to treat human diseases
2024-Sep-10, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102311
PMID:39281698
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综述 | 本文综述了RNA外显子编辑作为一种治疗策略,通过诱导合成RNA分子与内源性前mRNA目标之间的剪接,纠正致病突变,恢复功能性mRNA和蛋白质 | 本文介绍了RNA外显子编辑的新进展,包括在临床试验中的首次应用,以及如何利用现代合成生物学、下一代测序和生物信息学的进步,开发新的RNA外显子编辑分子 | NA | 探讨RNA外显子编辑在治疗人类疾病中的应用及其发展历程 | RNA外显子编辑技术及其在治疗遗传性疾病中的应用 | 基因治疗 | 遗传性疾病 | RNA剪接 | NA | NA | NA |
1194 | 2024-09-19 |
Laws of thought in living cells
2024-Sep-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.08.005
PMID:39241745
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研究论文 | 本文介绍了一种基于三态逻辑的生物计算平台TriLoS,旨在提高生物计算的复杂性 | TriLoS平台提供了一种扩展生物计算复杂性的解决方案,超越了原理验证阶段 | NA | 开发一种能够扩展生物计算复杂性的新型平台 | TriLoS三态逻辑合成平台 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1195 | 2024-09-19 |
Temporal epigenome modulation enables efficient bacteriophage engineering and functional analysis of phage DNA modifications
2024-Sep, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011384
PMID:39231196
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研究论文 | 研究利用NgTET酶暂时减少噬菌体DNA修饰,提高CRISPR-Cas系统介导的突变效率,并分析了这些修饰对噬菌体感染的影响 | 首次利用NgTET酶暂时减少噬菌体DNA修饰,提高CRISPR-Cas系统介导的突变效率,并揭示了这些修饰对噬菌体感染的影响 | NA | 探索噬菌体感染机制,提高CRISPR-Cas系统介导的突变效率 | 噬菌体DNA修饰及其对感染机制的影响 | NA | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | DNA | NA |
1196 | 2024-09-19 |
Progresses and challenges of engineering thermophilic acetogenic cell factories
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1476253
PMID:39282569
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综述 | 本文综述了嗜热乙酸菌作为微生物细胞工厂的进展和挑战 | 介绍了嗜热乙酸菌在可持续生物技术过程中的独特代谢能力 | 讨论了在嗜热乙酸菌中实施高效和复杂菌株工程策略的剩余挑战 | 总结嗜热乙酸菌在代谢工程和合成生物学方面的最新进展,并探讨其在工业相关化合物可持续生物生产中的潜力 | 嗜热乙酸菌及其在工业废弃气体转化为乙酸和生物量中的应用 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
1197 | 2024-09-19 |
Stimulus-Induced Relief of Intentionally Incorporated Frustration Drives Refolding of a Water-Soluble Biomimetic Foldamer
2023-12-20, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.3c09883
PMID:38054648
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研究论文 | 本文报道了首个动态水溶性仿生折叠体的合成、表征和分子动力学模拟,该折叠体在刺激下利用非共价网络中的挫败缓解来实现从褶皱结构到交错柱状结构的结构重排 | 首次探索了在动态折叠体中故意引入挫败非共价相互作用作为设计元素,并展示了其在刺激响应系统中的应用潜力 | NA | 探索挫败非共价相互作用在动态折叠体设计中的应用,并开发刺激响应系统 | 动态水溶性仿生折叠体 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | NA | NA |
1198 | 2024-09-19 |
Decoding enhancer complexity with machine learning and high-throughput discovery
2023-05-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-02955-4
PMID:37173718
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综述 | 本文综述了增强子组织的当前理解及其进化,重点讨论了影响序列-功能关系的关键因素 | 探讨了机器学习和合成生物学等技术进步如何为理解增强子复杂性提供新途径 | NA | 深入理解增强子的序列-功能关系及其复杂性 | 增强子的组织和进化 | 机器学习 | NA | 机器学习 | NA | DNA序列 | NA |
1199 | 2024-09-19 |
Precise, Orthogonal Remote-Control of Cell-Free Systems Using Photocaged Nucleic Acids
2023-05-03, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.3c01238
PMID:37074404
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研究论文 | 本文开发了一种使用光控核酸的细胞自由系统远程控制技术 | 本文创新性地开发了光控的细胞自由表达OFF开关,通过将硝基苄基和香豆素光笼连接到反义寡核苷酸上,实现了对细胞自由表达的精确控制 | NA | 开发一种精确、非侵入性的细胞自由系统远程控制技术 | 细胞自由表达系统 | 合成生物学 | NA | 光控技术 | NA | NA | NA |
1200 | 2024-09-19 |
Precision Tools in Immuno-Oncology: Synthetic Gene Circuits for Cancer Immunotherapy
2020-Dec-03, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines8040732
PMID:33287392
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综述 | 本文综述了合成生物学在癌症免疫治疗中的应用,特别是CAR-T细胞的基因工程改进 | 介绍了合成生物学在提高细胞疗法可靠性和安全性方面的创新方法 | 目前CAR-T细胞在实体瘤治疗中的应用效率较低,且临床使用的质量控制存在问题 | 探讨下一代基因电路在癌症免疫治疗中的应用前景 | CAR-T细胞及其在癌症免疫治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA |