合成生物学相关文章
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当前共找到 3054 篇文献，本页显示第 1241 - 1260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1241 | 2024-09-14 |
A precise and sustainable doxycycline-inducible cell line development platform for reliable mammalian cell engineering with gain-of-function mutations
2024-Sep-05, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.09.004
PMID:39242074
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR/Cas9技术的Tet-On3G诱导性主细胞系开发平台，用于精确和可持续的哺乳动物细胞工程 | 开发了一种名为ROSE的新平台，通过CRISPR/Cas9介导的位点特异性整合，实现了基因表达的精确调控和长期稳定性 | NA | 建立一种精确和可持续的基因表达调控系统，用于哺乳动物细胞工程 | 哺乳动物细胞系 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1242 | 2024-09-14 |
Limiting the Broadcast Range of a Secreting Cell during Intercellular Signaling Using Protease-Mediated Degradation
2024-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00042
PMID:38885472
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研究论文 | 研究如何通过蛋白酶介导的降解来限制分泌细胞在细胞间信号传递中的广播范围 | 提出了一种通过添加barrierpepsin来限制细胞在二维多细胞网络中α-因子信号响应范围的方法 | NA | 探索如何通过蛋白酶限制细胞间信号传递的广播范围，以实现更复杂的细胞网络功能 | 分泌细胞在细胞间信号传递中的广播范围 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 二维多细胞网络中的细胞 |
| 1243 | 2024-09-14 |
Partial RNA design
2024-06-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae222
PMID:38940170
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研究论文 | 本文提出了一种新的RNA设计范式——部分RNA设计，通过分离设计空间和目标，实现了对RNA序列和结构约束的精确控制 | 提出了部分RNA设计这一新范式，解决了现有RNA设计方法在搜索空间定义上的局限性 | NA | 开发一种新的RNA设计方法，以实现对RNA序列和结构约束的精确控制 | RNA序列和结构 | 生物技术 | NA | RNA设计 | libLEARNA算法 | RNA序列 | NA |
| 1244 | 2024-09-14 |
RiboDiffusion: tertiary structure-based RNA inverse folding with generative diffusion models
2024-06-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae259
PMID:38940178
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研究论文 | 本文提出了一种基于生成扩散模型的RNA逆折叠方法RiboDiffusion，用于从3D结构生成RNA序列 | RiboDiffusion利用图神经网络和Transformer模型，能够从3D RNA骨架结构生成RNA序列，并在序列恢复和多样性之间进行权衡 | NA | 解决RNA逆折叠问题，即从给定的结构约束中找到功能性RNA序列 | RNA序列和其3D结构 | 生物信息学 | NA | 生成扩散模型 | 图神经网络、Transformer | RNA序列和3D结构 | 不同长度和类型的RNA |
| 1245 | 2024-09-14 |
Marinobacter: A case study in bioelectrochemical chassis evaluation
2023-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14170
PMID:36464922
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综述 | 本文综述了Marinobacter属在生物电化学系统中的代谢和电化学潜力，并探讨了其在合成电微生物学应用中的优势和劣势 | 本文首次系统地评估了Marinobacter属作为生物电化学系统底盘生物的潜力 | 许多Marinobacter菌株的特性尚未充分表征，且基因操作工具箱相对不成熟 | 探讨Marinobacter属在生物电化学系统中的应用潜力，并为选择合适的底盘生物提供指导 | Marinobacter属的代谢和电化学特性 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1246 | 2024-09-14 |
A Synthetic Biology Approach for Vaccine Candidate Design against Delta Strain of SARS-CoV-2 Revealed Disruption of Favored Codon Pair as a Better Strategy over Using Rare Codons
2023-Feb-20, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines11020487
PMID:36851364
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法设计针对SARS-CoV-2 delta变种的疫苗候选物，发现破坏优选密码子对比使用稀有密码子更有效 | 提出了一种通过破坏优选密码子对来减弱SARS-CoV-2 delta变种病毒适应性的新策略 | NA | 开发针对SARS-CoV-2 delta变种的安全有效疫苗 | SARS-CoV-2 delta变种的结构基因及其密码子使用模式 | NA | COVID | 合成生物学 | NA | 基因序列 | NA |
| 1247 | 2024-09-14 |
Current Metabolic Engineering Strategies for Photosynthetic Bioproduction in Cyanobacteria
2023-Feb-11, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms11020455
PMID:36838420
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综述 | 本文综述了蓝细菌在光合生物生产中的代谢工程策略 | 总结了最新的合成生物学工具和代谢途径工程策略，以提高有价值化合物的生产 | NA | 探讨蓝细菌在工业应用中的代谢工程优化策略 | 蓝细菌及其在生物产品生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 代谢途径工程 | NA | NA | NA |
| 1248 | 2024-09-14 |
Regulation of pSYSA defense plasmid copy number in Synechocystis through RNase E and a highly transcribed asRNA
2023, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2023.1112307
PMID:36876071
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研究论文 | 研究了蓝细菌Synechocystis中pSYSA防御质粒拷贝数的调控机制，揭示了RNase E和高度转录的反义RNA在其中的作用 | 发现了RNase E介导的pSYSA编码转录本的切割机制，以及与ColE1型质粒复制机制的相似性 | NA | 理解蓝细菌中天然质粒复制系统和CRISPR-Cas防御机制，以开发适用于合成生物学的质粒载体 | 蓝细菌Synechocystis sp. PCC 6803中的pSYSA质粒及其复制机制 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | RNA | NA |
| 1249 | 2024-09-14 |
Synthetic peptides for the precise transportation of proteins of interests to selectable subcellular areas
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1062769
PMID:36890909
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研究论文 | 本文首次报道了一组名为reflectins及其衍生肽在细胞内具有特定的分布偏好，并通过设计一系列reflectin衍生肽，展示了其在细胞内选择性定位的能力 | 本文创新性地利用reflectins的保守基序和灵活连接子作为构建模块，设计并表达了具有选择性细胞内定位的合成肽，并展示了其在核质定位调控中的精确时空应用 | NA | 研究旨在开发一种模块化、正交且经过充分表征的合成肽库，用于精确调控蛋白质的核质定位 | reflectins及其衍生肽在细胞内的选择性定位 | 生物材料设计 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1250 | 2024-09-13 |
Microalgal metabolic engineering facilitates precision nutrition and dietary regulation
2024-Nov-15, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.175460
PMID:39137841
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综述 | 本文综述了利用系统代谢工程优化微藻以实现精准营养和可持续饮食的方法 | 创新性地应用系统代谢工程，通过多组学分析和先进的代谢工程策略（如ZFNs、TALENs和CRISPR/Cas系统）优化微藻，提高生物活性化合物的生产 | NA | 探讨微藻在精准营养和可持续饮食中的应用潜力 | 微藻及其代谢产物 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、多组学分析、CRISPR/Cas系统 | NA | NA | NA |
| 1251 | 2024-09-13 |
Microbial biofilms as a platform for diverse biocatalytic applications
2024-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2024.131302
PMID:39173957
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综述 | 本文综述了微生物生物膜在多种生物催化应用中的潜力，特别是人工工程生物膜的应用 | 本文填补了人工工程生物膜在生物催化系统中应用的空白，并探讨了生物膜工程的策略 | 本文主要集中在综述和理论探讨，缺乏具体实验数据和案例研究 | 探讨微生物生物膜在生物催化应用中的潜力，特别是人工工程生物膜的应用 | 微生物生物膜及其在生物催化系统中的应用 | NA | NA | 基因修饰、合成生物学方法、生物膜形成过程的靶向操作 | NA | NA | NA |
| 1252 | 2024-09-13 |
Challenges to rhizobial adaptability in a changing climate: Genetic engineering solutions for stress tolerance
2024-Nov, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127886
PMID:39232483
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综述 | 本文综述了根瘤菌在气候变化下的适应性挑战及其在农业中的重要性，并探讨了通过基因工程提高根瘤菌耐受性的最新方法 | 本文总结了当前关于根瘤菌耐受性相关基因和通路的知识，并介绍了最新的基因工程方法，如合成生物学，以提高根瘤菌对环境变化的适应性 | 根瘤菌耐受性的遗传基础仍然了解不足 | 探讨气候变化对根瘤菌-植物共生关系的影响，并提出通过基因工程提高根瘤菌适应性的方法 | 根瘤菌及其与豆科植物的共生关系 | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
| 1253 | 2024-09-13 |
An expanded molecular and systems toolbox for imaging, mapping, and controlling local translation
2024-Oct, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2024.102523
PMID:39226865
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综述 | 本文综述了用于成像、映射和控制局部翻译的扩展分子和系统工具箱 | 本文介绍了用于可视化和映射生物分子组件及翻译过程的新技术，这些技术具有更好的空间和时间分辨率，且伪影更少 | NA | 探讨如何通过新技术更好地可视化和控制细胞内局部蛋白质翻译过程 | 细胞内局部蛋白质翻译过程及其相关生物分子组件 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1254 | 2024-09-13 |
PhysioFit: a software to quantify cell growth parameters and extracellular fluxes
2024-08-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae488
PMID:39073885
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研究论文 | 介绍了一种名为PhysioFit的开源软件，用于量化细胞生长参数和胞外通量 | PhysioFit可以与任何生长模型兼容，并且设计为可互操作，支持多种常见生长模型，并允许高级用户实现额外的模型 | NA | 开发一种能够量化生长参数和胞外通量的通用工具 | 细胞生长参数和胞外通量 | 生物信息学 | NA | Python编程 | NA | 时间序列数据 | NA |
| 1255 | 2024-09-13 |
Robustness and evolvability: Revisited, redefined and applied
2024-Aug-02, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105281
PMID:39098381
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研究论文 | 本文重新定义并应用了系统的鲁棒性和可进化性，提出了新的形式化定义和相应的度量方法，并使用进化算法在BNK模型系统中寻找不同类型的完美振荡器 | 本文提出了新的鲁棒性和可进化性的形式化定义和度量方法，比Wagner最初提出的度量方法更通用和更具代表性。此外，本文还提出了一种受NK系统启发的BNK数字建模方法，并应用于进化算法中 | NA | 重新定义和应用系统的鲁棒性和可进化性 | 系统的鲁棒性和可进化性，以及DNA合成噪声对DNA基生物传感器功能的影响和不同类型核酶的可进化性 | 合成生物学 | NA | 进化算法 | BNK模型 | NA | NA |
| 1256 | 2024-09-13 |
Enabling technology and core theory of synthetic biology
2023-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-022-2214-2
PMID:36753021
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综述 | 本文讨论了合成生物学领域的各种原理和技术进展 | 介绍了合成生物学的使能技术和核心理论的发展，包括基因组合成与组装、DNA存储、基因编辑等 | NA | 探讨合成生物学的使能技术和核心理论的进展 | 合成生物学的使能技术和核心理论 | 合成生物学 | NA | 基因组合成与组装、DNA存储、基因编辑、分子进化、功能蛋白从头设计、细胞和基因电路工程、无细胞合成生物学、人工智能辅助合成生物学 | NA | NA | NA |
| 1257 | 2024-09-13 |
Call for biotechnological approach to degrade plastic in the era of COVID-19 pandemic
2023-Mar, Saudi journal of biological sciences
DOI:10.1016/j.sjbs.2023.103583
PMID:36748033
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review | 本文综述了在COVID-19大流行背景下，利用生物技术方法降解塑料的潜力和挑战 | 本文提出了利用合成生物学、代谢工程和生物信息学方法来增强微生物降解塑料的能力 | 目前对基因、酶和细菌与塑料相互作用的研究不足 | 探讨如何利用现代生物技术增强微生物降解塑料的能力 | 研究对象包括塑料污染、微生物降解塑料的机制以及相关的生物技术方法 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、生物信息学 | NA | NA | NA |
| 1258 | 2024-09-13 |
Elucidation of the (R)-enantiospecific benzylisoquinoline alkaloid biosynthetic pathways in sacred lotus (Nelumbo nucifera)
2023-02-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-29415-0
PMID:36805479
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研究论文 | 研究揭示了神圣莲花中(R)-手性苯基异喹啉生物碱的生物合成途径 | 首次探索了神圣莲花中独特的苯基异喹啉生物碱生物合成途径，并鉴定了负责R-手性形成的酶 | 研究主要集中在酶的鉴定和初步功能验证，未深入探讨整个生物合成网络的调控机制 | 阐明神圣莲花中(R)-手性苯基异喹啉生物碱的生物合成途径 | 神圣莲花中的苯基异喹啉生物碱及其生物合成酶 | NA | NA | 酶标记实验、体外重组酶和植物蛋白提取物分析 | NA | NA | NA |
| 1259 | 2024-09-13 |
Bacterial Form II Rubisco can support wild-type growth and productivity in Solanum tuberosum cv. Desiree (potato) under elevated CO2
2023-Feb, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac305
PMID:36743474
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研究论文 | 本文描述了通过叶绿体转化技术将马铃薯中的天然Rubisco替换为细菌来源的Rubisco，以提高其光合作用效率 | 首次在作物中通过叶绿体转化技术替换Rubisco，并展示了在不同CO2浓度下马铃薯的产量和叶生物化学特性 | 研究仅限于特定品种的马铃薯和特定的CO2浓度，未探讨其他环境因素的影响 | 通过叶绿体转化技术改善作物光合作用，提高产量 | 马铃薯品种Desiree | NA | NA | 叶绿体转化技术 | NA | NA | 涉及不同CO2浓度的马铃薯植株 |
| 1260 | 2024-09-13 |
Current Landscape of Methods to Evaluate Antimicrobial Activity of Natural Extracts
2023-Jan-20, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules28031068
PMID:36770734
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综述 | 本文综述了评估天然提取物抗菌活性的传统和现代方法 | 本文介绍了新技术在提高分析能力、时间效率、灵敏度和可重复性方面的应用 | NA | 分析和比较评估天然提取物抗菌活性的传统和现代方法 | 天然提取物的抗菌活性 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |