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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1261 | 2024-09-13 |
Recent Advances in CRISPR-Cas Technologies for Synthetic Biology
2023-Jan, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.1007/s12275-022-00005-5
PMID:36723794
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas技术在合成生物学中的最新进展 | 介绍了CRISPR-Cas技术在基因组编辑、分子诊断和代谢生物技术中的应用 | NA | 总结CRISPR技术在合成生物学中的应用现状,并讨论其在微生物学中的发展 | CRISPR-Cas技术及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas技术 | NA | NA | NA |
1262 | 2024-09-13 |
PLATERO: A calibration protocol for plate reader green fluorescence measurements
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1104445
PMID:36741754
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PLATERO的校准协议,用于将板式读取器绿色荧光测量结果转换为参考荧光素的浓度单位 | PLATERO协议消除了测量设备的增益对数据的影响,并将荧光强度值转换为浓度单位,提供了一个单一的数学表达式,返回标准化、增益无关且可比较的数据 | NA | 开发一种校准协议,以标准化板式读取器荧光测量结果,并消除设备增益的影响 | 板式读取器绿色荧光测量数据 | 合成生物学 | NA | 荧光测量 | 校准模型 | 荧光数据 | NA |
1263 | 2024-09-13 |
Transcription factor-based biosensors for screening and dynamic regulation
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1118702
PMID:36814719
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综述 | 本文综述了基于转录因子的生物传感器在筛选和动态调控中的应用 | 讨论了实验和计算方法在改进和优化基于转录因子的生物传感器中的应用 | 目前基于转录因子的生物传感器在广泛应用中仍面临挑战 | 总结当前基于转录因子的生物传感器的知识,并提出未来研究方向 | 基于转录因子的生物传感器及其在生物生产筛选和遗传电路动态调控中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1264 | 2024-09-11 |
Systematic metabolic engineering enables highly efficient production of vitamin A in Saccharomyces cerevisiae
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.08.004
PMID:39247801
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研究论文 | 本文通过系统代谢工程在酿酒酵母中高效生产维生素A | 首次通过挖掘不同来源的β-胡萝卜素15,15'-单(双)加氧酶,并结合表达两种具有不同催化机制但催化性能相当的同工酶,显著提高了维生素A的产量 | NA | 研究在酿酒酵母中高效生产维生素A的方法 | 维生素A的生产 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
1265 | 2024-09-11 |
Engineered transcription activator-like effector dimer proteins confer DNA loop-dependent gene repression comparable to Lac repressor
2024-Sep-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae656
PMID:39077947
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研究论文 | 本文设计了基于目标序列可编程的转录激活因子样效应物二聚体(TALED)蛋白的抑制系统,并展示了其在DNA环依赖的细菌启动子抑制中的应用 | 本文首次展示了通过共价结合的TALED蛋白实现强效的DNA环依赖的细菌启动子抑制,并验证了DNA环结构显著增强启动子抑制效果 | 本文主要集中在E. coli中的实验验证,未来需进一步研究其在其他生物系统中的适用性 | 设计并验证一种新型的DNA环依赖的基因抑制系统,为合成生物学和治疗应用提供新工具 | 转录激活因子样效应物二聚体(TALED)蛋白及其在DNA环依赖的基因抑制中的应用 | 合成生物学 | NA | DNA环结构分析 | NA | DNA序列 | E. coli菌株 |
1266 | 2024-09-11 |
Induction of bacterial expression at the mRNA level by light
2024-Sep-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae678
PMID:39126322
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研究论文 | 本文利用光敏受体NmPAL在mRNA水平上诱导细菌表达,通过蓝光触发NmPAL结合破坏cis-抑制的mRNA状态,从而解除翻译起始的阻碍,上调基因表达 | 本文开发了一种名为riboptoregulator的光遗传学电路,能够在mRNA水平上进行基因表达调控,并能与现有基因调控电路结合,实现更精细和严格的基因表达控制 | NA | 开发一种在mRNA水平上进行光遗传学调控的新方法,以提高细菌基因表达的效率和精确性 | 细菌基因表达的调控机制 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | mRNA | NA |
1267 | 2024-09-10 |
Advances in the Structures, Pharmacological Activities, and Biosynthesis of Plant Diterpenoids
2024-Aug-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2402.02014
PMID:39081244
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综述 | 本文综述了植物二萜类化合物的结构、药理活性和生物合成途径 | 利用合成生物学将微生物工程化为“细胞工厂”以生产所需化合物 | NA | 探讨植物二萜类化合物的生物合成机制及其在微生物中的异源生产 | 植物二萜类化合物及其生物合成途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1268 | 2024-09-11 |
Synthetic biology-inspired cell engineering in diagnosis, treatment, and drug development
2023-03-11, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-023-01375-x
PMID:36906608
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综述 | 本文综述了合成生物学在细胞工程领域的最新进展及其在诊断、治疗和药物开发中的应用 | 介绍了合成生物学提供的遗传工具,用于重新编程和工程化细胞以提高性能、赋予新功能和多样化的应用 | 讨论了在临床实践中应用基因工程细胞的局限性和挑战 | 更新合成生物学在生物医学应用中的最新进展,并探讨未来的优化方向 | 合成生物学驱动的细胞工程在诊断、治疗和药物开发中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1269 | 2024-09-11 |
Exploring a chemical scaffold for rapid and selective photoaffinity labelling of non-ribosomal peptide synthetases in living bacterial cells
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0026
PMID:36633280
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研究论文 | 本文介绍了一种用于快速和选择性光亲和标记非核糖体肽合成酶(NRPSs)的化学支架,适用于纯化系统、粗生物样本和活细菌细胞 | 开发了一种基于三氟甲基苯基重氮的新型光亲和标记探针,能够在较短的紫外线照射时间内实现高选择性和敏感性的标记 | NA | 研究非核糖体肽合成酶(NRPSs)在细菌细胞中的生物学功能 | 非核糖体肽合成酶(NRPSs)及其在细菌细胞中的活性 | 化学合成生物学 | NA | 光亲和标记 | NA | 蛋白质 | NA |
1270 | 2024-09-11 |
Discovery, implications and initial use of semi-synthetic organisms with an expanded genetic alphabet/code
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0030
PMID:36633274
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综述 | 本文综述了通过扩展遗传字母表创建半合成生物体以生产下一代蛋白质疗法的发现、意义和初步应用 | 介绍了通过合成核苷酸形成非天然碱基对,并将其整合到DNA中以稳定维持、转录和翻译蛋白质的创新方法 | NA | 探讨扩展遗传字母表以生产具有不同功能的蛋白质的潜力 | 半合成生物体及其在生产下一代蛋白质疗法中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成核苷酸 | NA | NA | NA |
1271 | 2024-09-11 |
Orthoester formation in fungal meroterpenoid austalide F biosynthesis
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0037
PMID:36633279
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研究论文 | 研究揭示了真菌倍半萜austalide F的生物合成途径,特别是orthoester的形成机制 | 首次阐明了α-酮戊二酸依赖性加氧酶AstB和甲基转移酶AstL在orthoester形成中的作用 | NA | 揭示真菌倍半萜austalide F的生物合成途径 | 真菌倍半萜austalide F及其生物合成机制 | NA | NA | 异源基因表达 | NA | NA | NA |
1272 | 2024-09-11 |
Genome mining of cryptic bisabolenes that were biosynthesized by intramembrane terpene synthases from Antrodia cinnamomea
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0033
PMID:36633275
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研究论文 | 本文通过基因组挖掘方法,发现了一种来自Antrodia cinnamomea的真菌中的非典型UbiA型萜烯合酶,能够合成(+)-(,)-α-bisabolene,并揭示了其生物合成途径 | 首次发现真菌中的非典型UbiA型萜烯合酶能够合成bisabolene,并鉴定了相关的修饰酶 | NA | 揭示真菌中bisabolene的生物合成途径及其酶学机制 | Antrodia cinnamomea中的萜烯合酶及其生物合成途径 | 生物化学 | NA | 基因组挖掘 | NA | 基因组数据 | NA |
1273 | 2024-09-11 |
Success probability of high-affinity DNA aptamer generation by genetic alphabet expansion
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0031
PMID:36633272
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研究论文 | 本文研究了通过遗传字母扩展生成高亲和力DNA适配体的成功概率 | 引入了非天然碱基作为第五个字母,显著提高了DNA适配体对目标蛋白的亲和力 | 生成高亲和力UB-DNA适配体的成功概率仍需提高 | 评估生成高亲和力DNA适配体的成功概率,并探讨通过引入非天然碱基提高传统适配体亲和力的可能性 | 高亲和力DNA适配体及其生成方法 | NA | NA | 遗传字母扩展 | NA | NA | 多个UB-DNA适配体作为示例 |
1274 | 2024-09-11 |
A conserved SH3-like fold in diverse putative proteins tetramerizes into an oxidoreductase providing an antimicrobial resistance phenotype
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0040
PMID:36633286
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研究论文 | 本文探讨了一种非催化蛋白折叠如何演变为具有生存必需的催化活性的潜在机制 | 首次揭示了SH3-like折叠在现代耐药组中出现的潜在进化路径 | NA | 研究DfrB酶及其同源物的结构和功能,揭示其催化活性和耐药性的机制 | DfrB酶及其同源物的SH3-like折叠 | 生物化学 | NA | 结构和生物物理表征 | NA | 蛋白质序列和结构数据 | 从数据库中识别的DfrB同源物 |
1275 | 2024-09-11 |
Allosteric inhibition of Staphylococcus aureus MenD by 1,4-dihydroxy naphthoic acid: a feedback inhibition mechanism of the menaquinone biosynthesis pathway
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0035
PMID:36633276
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研究论文 | 研究了1,4-二羟基萘甲酸对金黄色葡萄球菌MenD的变构抑制作用及其在甲萘醌生物合成途径中的反馈抑制机制 | 发现1,4-二羟基萘甲酸对MenD的变构抑制作用在不同属中是保守的机制 | NA | 探讨甲萘醌生物合成途径中的反馈抑制机制及其在不同属中的保守性 | 金黄色葡萄球菌MenD酶及其下游代谢物1,4-二羟基萘甲酸 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1276 | 2024-09-11 |
Crystal structures of 'ALternative Isoinformational ENgineered' DNA in B-form
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0028
PMID:36633282
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研究论文 | 研究了在B型结构中的人工DNA的晶体结构,特别是ALIEN DNA的结构特征 | 首次确定了含有非天然核苷酸对的ALIEN DNA在B型结构中的高分辨率晶体结构,并发现其具有比天然DNA更多的B型结构变体 | NA | 研究人工DNA在B型结构中的结构特征 | ALIEN DNA及其在B型结构中的晶体结构 | NA | NA | 晶体结构分析 | NA | 晶体结构数据 | 三个包含5'-CTTAAG的复合物,每个复合物含有16 bp的自互补双链寡核苷酸 |
1277 | 2024-09-11 |
On-demand biomanufacturing through synthetic biology approach
2023-Feb, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2022.100518
PMID:36636637
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法实现按需生物制造的进展,并提出了未来方向 | 利用合成生物学技术重新设计无细胞系统和活细胞,以实现便携式、现场和按需制造生物分子 | NA | 探讨通过合成生物学方法实现按需生物制造的潜力和未来方向 | 生物制药产品,包括蛋白质疗法、工程化蛋白质疫苗和单克隆抗体 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1278 | 2024-09-11 |
Computationally-guided design and selection of high performing ribosomal active site mutants
2022-12-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac1036
PMID:36484094
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研究论文 | 本文开发了一种计算方法,用于设计和筛选高活性的核糖体活性位点突变体 | 本文提出了一种新的计算方法,结合Rosetta stepwise Monte Carlo方法,用于设计和筛选核糖体RNA突变体,并展示了其在体内外的功能效果 | 本文的方法依赖于计算模拟和体外实验,尚未完全验证其在所有生物系统中的适用性 | 研究核糖体RNA突变对功能的影响,并为合成生物学中的核糖体重用提供新方法 | 核糖体RNA及其活性位点突变体 | 合成生物学 | NA | Rosetta stepwise Monte Carlo方法 | NA | 核糖体RNA序列 | 涉及多达30个突变体的核糖体RNA |
1279 | 2024-09-11 |
Improving plant productivity by re-tuning the regeneration of RuBP in the Calvin-Benson-Bassham cycle
2022-10, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.18394
PMID:35860861
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研究论文 | 本文探讨了通过重新调整卡尔文-本森-巴斯汉循环中RuBP的再生来提高植物生产力的潜力 | 本文展示了通过操纵RuBP再生来提高光合作用的潜力,并介绍了新的组学和合成生物学技术在提高光合作用和增加作物产量方面的未来机会 | NA | 提高植物生产力和作物产量 | 卡尔文-本森-巴斯汉循环中的RuBP再生 | NA | NA | 组学和合成生物学 | NA | NA | NA |
1280 | 2024-09-11 |
Alternative neural systems: What is a neuron? (Ctenophores, sponges and placozoans)
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1071961
PMID:36619868
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研究论文 | 本文探讨了神经系统的多样性,特别是早期分化动物中神经系统的不同进化路径 | 提出了神经元的重新定义,区分了真正的神经元与非突触连接的整合系统,并支持了神经元和突触的多重起源假说 | NA | 研究神经系统的多样性和进化路径 | 早期分化动物的神经系统,包括栉水母、海绵和扁形动物 | 神经科学 | NA | scRNA-seq和显微镜技术 | NA | 基因表达数据和显微图像 | NA |