合成生物学相关文章
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当前共找到 4041 篇文献，本页显示第 1221 - 1240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1221 | 2025-10-05 |
Preventing Multimer Formation in Commonly Used Synthetic Biology Plasmids
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00508
PMID:40101192
|
研究论文 | 调查常用合成生物学质粒中多聚体形成现象及其对电路可靠性的影响 | 首次系统评估四种常用质粒骨架在多聚体形成方面的差异，并开发出能避免多聚体形成的大肠杆菌MG1655基因敲除株 | 仅测试了两种大肠杆菌菌株和四种质粒骨架，未涵盖更广泛的宿主-质粒组合 | 优化质粒基础电路的完整性，防止多聚体形成对合成生物学电路的影响 | 四种常用合成生物学质粒骨架及其在大肠杆菌JM109和MG1655中的行为 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、基因敲除、菌株转化 | NA | 分子生物学实验数据 | 四种质粒骨架在两种大肠杆菌菌株(JM109和MG1655)中的测试 | 基因敲除 | 大肠杆菌JM109, 大肠杆菌MG1655 | 质粒基础合成生物学电路 | 工业生物技术 |
| 1222 | 2025-10-05 |
dFLASH; dual FLuorescent transcription factor activity sensor for histone integrated live-cell reporting and high-content screening
2025-Apr-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58488-w
PMID:40195317
|
研究论文 | 开发了一种名为dFLASH的双荧光转录因子活性传感器，用于活细胞报告和高通量筛选 | 开发了首个组蛋白整合的双荧光活细胞转录因子活性传感器系统，具有模块化设计和基因组整合特性 | NA | 开发用于活细胞转录因子活性检测和筛选的工具平台 | 缺氧诱导因子(HIF)、孕酮受体(PGR)和合成转录因子 | 合成生物学 | NA | 双荧光报告系统、高通量成像、CRISPRoff、全基因组CRISPR KO筛选 | NA | 荧光图像 | 1600种化合物的天然产物库 | CRISPRoff, CRISPR KO | 哺乳动物细胞 | 转录因子活性生物传感器 | 药物发现, 功能基因组学, 合成生物学 |
| 1223 | 2025-10-05 |
Advanced Strategies for Ultrasound Control and Applications in Sonogenetics and Gas Vesicle-Based Technologies: A Review
2025, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S507322
PMID:40433121
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综述 | 本文综述了基于合成生物学的超声控制系统在声遗传学和气囊泡技术中的最新进展与应用 | 系统总结了超声热效应和机械效应作为主要触发源，实现工程化细胞在靶向组织中进行声热或声机械遗传修饰的新策略 | NA | 深入理解超声效应与工程化细胞技术设计、组成和应用之间的关系 | 声遗传学技术和气囊泡技术 | 生物医学工程 | 癌症 | 超声控制技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 工程化细胞 | 声热启动子开关、声热瞬时受体电位通道、声机械激活 | 医学 |
| 1224 | 2025-10-05 |
Construction of a Calibration Curve for Lycopene on a Liquid-Handling Platform─Wider Lessons for the Development of Automated Dilution Protocols
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00031
PMID:39096303
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研究论文 | 本研究通过构建番茄红素在二甲基亚砜中的校准曲线，开发了自动化液体处理平台的稀释方案 | 开发了基于回归的实用框架来识别、评估和监控液体转移误差，并创建了可推广到其他自动化应用的灵活液体处理方法 | NA | 开发可靠的自动化液体处理方案，提高合成生物学实验的吞吐量和可重复性 | 番茄红素在二甲基亚砜中的校准曲线构建 | 合成生物学 | NA | 液体处理自动化 | 回归分析 | 实验数据 | NA | 液体处理平台 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1225 | 2025-10-05 |
Towards Self-regeneration: Exploring the Limits of Protein Synthesis in the Protein Synthesis Using Recombinant Elements (PURE) Cell-free Transcription-Translation System
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00304
PMID:39066734
|
研究论文 | 本研究通过优化PURE无细胞转录翻译系统，显著降低非核糖体蛋白浓度并提高蛋白质合成效率，实现了向蛋白质自我再生的重要突破 | 将非核糖体PURE蛋白浓度降低97.3%的同时提高蛋白质合成效率，并发现6%葡聚糖在高度稀释配方中能显著提升蛋白质合成速率和总产量 | 原始PURE配方中拥挤剂效果不佳，研究主要关注非核糖体蛋白的自我再生 | 探索PURE无细胞系统中蛋白质自我再生的极限，推动通用生化构建器和活体合成细胞的开发 | PURE无细胞转录翻译系统中的蛋白质合成过程 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译系统 | NA | 生化实验数据 | NA | PURE系统 | 无细胞系统 | 蛋白质自我再生系统 | 工业生物技术,医药 |
| 1226 | 2025-10-05 |
Artificial Intelligence Methods and Models for Retro-Biosynthesis: A Scoping Review
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00091
PMID:39047143
|
综述 | 总结人工智能在逆生物合成路径设计中的方法和模型应用进展 | 系统梳理AI在逆生物合成领域的最新进展，涵盖基于反应模板和生成模型的多种技术路径 | 未明确说明具体数据规模或模型验证的局限性 | 促进符合绿色化学理念的生物生产路径规划 | 逆生物合成路径设计方法 | 合成生物学 | NA | 逆生物合成分析 | 生成模型 | 化学反应数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 1227 | 2025-10-05 |
Toward Practical Applications of Engineered Living Materials with Advanced Fabrication Techniques
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00259
PMID:39002162
|
综述 | 本文综述了工程活性材料（ELMs）的先进制造技术及其实际应用前景 | 系统整合了自下而上和自上而下的ELMs构建方法，强调合成生物学与材料科学的交叉融合 | NA | 探讨ELMs的制备方法、特性及其在医疗和环境保护等领域的实际应用 | 工程活性材料（ELMs）及其构建技术 | NA | NA | 3D生物打印、静电纺丝、内源性和外源性支架技术、活体组装 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 工程化活细胞 | 具有环境响应能力的生物传感系统，能够响应压力、pH、湿度、温度和光照等刺激 | 医学, 环境保护, 制造业 |
| 1228 | 2025-10-05 |
Development of a Recombineering System for the Acetogen Eubacterium limosum with Cas9 Counterselection for Markerless Genome Engineering
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00253
PMID:39033464
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于RecT重组酶和Cas9反选择的无标记基因组工程系统，用于乙酸杆菌Eubacterium limosum的精确基因编辑 | 开发了高效的寡核苷酸重组系统，结合Cas9反选择实现无疤痕、无标记的基因组点突变，解决了该菌株基因工程的主要瓶颈 | NA | 开发快速精确的基因组修饰工具，促进Eubacterium limosum的合成生物学和代谢工程应用 | 乙酸杆菌Eubacterium limosum及其基因组 | 合成生物学 | NA | 重组工程、Cas9反选择、基因组编辑 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9, RecT重组酶 | Eubacterium limosum | 重组酶系统与Cas9反选择系统的组合设计 | 能源, 环境, 医学 |
| 1229 | 2025-10-05 |
Chloroplast Cell-Free Systems from Different Plant Species as a Rapid Prototyping Platform
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00117
PMID:39028299
|
研究论文 | 开发了一种从多种植物物种制备高活性叶绿体无细胞基因表达系统的通用方案 | 建立了首个源自多种植物物种的叶绿体无细胞表达系统，可同时使用T7 RNA聚合酶和内源性叶绿体聚合酶 | NA | 开发快速原型平台以加速植物合成生物学和叶绿体工程研究 | 小麦、菠菜和杨树等不同植物物种的叶绿体 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达(CFE) | NA | 基因表达数据 | 23个5'UTR、10个3'UTR和6个叶绿体启动子 | NA | 小麦、菠菜、杨树 | 基因表达调控序列(启动子、UTR)的表征和原型设计 | 农业 |
| 1230 | 2025-10-05 |
Engineering a Novel Probiotic Toolkit in Escherichia coli Nissle 1917 for Sensing and Mitigating Gut Inflammatory Diseases
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00036
PMID:39115381
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于大肠杆菌Nissle 1917的模块化系统，用于检测和缓解肠道炎症疾病 | 首次在EcN中构建了包含NO传感器、分泌系统和抗TNFα纳米抗体库的集成系统，并建立了评估工程益生菌系统关键参数的数学模型 | 系统灵敏度有所降低 | 开发靶向特异性系统治疗炎症性肠病 | 工程化益生菌大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 酶联免疫吸附试验、体外试验 | 数学模型 | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 基于转录因子的NO生物传感器、1型溶血素分泌系统、抗TNFα纳米抗体治疗载体 | 医学 |
| 1231 | 2025-10-05 |
Bioinformatic Prediction and High Throughput In Vivo Screening to Identify Cis-Regulatory Elements for the Development of Algal Synthetic Promoters
2024-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00199
PMID:38986010
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研究论文 | 本研究通过生物信息学预测和高通量体内筛选方法，开发了适用于藻类的合成启动子 | 结合POWRS、STREME和PhyloGibbs算法预测顺式调控元件，并通过高通量筛选验证合成启动子活性 | 需要目标藻类物种具有测序的基因组和转录组数据集 | 开发适用于藻类生物技术的合成生物学工具 | 六种不同藻类物种的启动子区域和顺式调控元件 | 合成生物学 | NA | 下一代测序、荧光激活细胞分选、生物信息学分析 | NA | 基因组序列、转录组数据 | 4533个合成启动子，数百个转基因株系 | 合成生物学方法 | 藻类 | 合成启动子设计，包含1-3个顺式调控元件拷贝 | 工业生物技术,能源 |
| 1232 | 2025-10-05 |
Directed Evolution of Acoustic Reporter Genes Using High-Throughput Acoustic Screening
2024-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00283
PMID:38981096
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研究论文 | 本研究通过定向进化方法开发具有增强非线性超声散射信号的声学报告基因 | 建立了高通量半自动化声学筛选平台，首次将定向进化应用于声学报告基因的优化 | 研究主要针对细菌培养体系，在哺乳动物系统中的适用性需要进一步验证 | 开发性能更优的声学报告基因用于生物成像 | 气体囊泡(GVs)蛋白纳米结构及其编码基因 | 合成生物学 | NA | 定向进化、高通量声学筛选、非线性超声散射 | NA | 声学信号数据、蛋白质序列数据 | GvpA/B同源蛋白的扫描位点饱和突变库 | 定向进化 | 细菌 | 声学报告基因系统，基于气体囊泡的超声对比剂 | 医学成像、合成生物学 |
| 1233 | 2025-10-05 |
Variant Library Annotation Tool (VaLiAnT): an oligonucleotide library design and annotation tool for saturation genome editing and other deep mutational scanning experiments
2022-01-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab776
PMID:34791067
|
研究论文 | 开发了一个用于设计饱和基因组编辑实验的寡核苷酸文库工具VaLiAnT | 提供了一种新颖的基因组序列检索、突变和注释方法，支持cDNA和prime编辑文库生成 | NA | 开发用于饱和基因组编辑和深度突变扫描实验的寡核苷酸文库设计工具 | 基因组序列和遗传变异 | 生物信息学 | NA | CRISPR/Cas9, 饱和基因组编辑, 深度突变扫描 | NA | 基因组序列, 转录本注释 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 合成生物学, 进化遗传学, 宿主-病原体相互作用 |
| 1234 | 2025-10-05 |
Bioluminescence-Driven Optogenetics
2020-Nov-28, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life10120318
PMID:33260589
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综述 | 本文综述了生物发光作为生物光源在触发生理事件和控制细胞行为方面的新兴应用方法 | 探索了生物发光超越传统报告技术的潜力，将其作为控制细胞行为的生物光源 | NA | 探讨生物发光在合成生物学中的潜在应用 | 细胞和生物体水平的生理过程 | 合成生物学 | NA | 生物发光技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 生物发光驱动的光遗传学系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 1235 | 2025-10-05 |
Judging synthetic biology risks
2015-Jan-09, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaa5253
PMID:25573995
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1236 | 2025-10-05 |
Synthetic biology of multicellular systems: new platforms and applications for animal cells and organisms
2014-Dec-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb500358y
PMID:25524091
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1237 | 2025-10-05 |
Biofabrication of microstructured bacterial ecosystems using chaotic bioprinting: advancingin vitroresearch for microbial engineering
2025-May-29, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/add568
PMID:40334674
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研究论文 | 本文开发了一种混沌3D生物打印技术，用于制造具有微观结构的细菌生态系统，模拟自然微生物群落的空间组织 | 首次将混沌3D打印技术应用于细菌共培养系统的构建，实现了微米级精度的空间控制 | 研究仅使用了简化的肠道微生物模型，尚未在更复杂的自然微生物群落中验证 | 开发能够模拟自然微生物生态系统空间结构的体外研究平台 | 细菌共培养系统，特别是人类肠道微生物模型 | 合成生物学 | NA | 混沌3D生物打印，荧光显微镜，菌落计数，定量PCR | NA | 图像数据，微生物生长数据 | NA | 3D生物打印，Kenics静态混合器打印喷嘴 | 多种细菌菌株（包括严格厌氧菌） | 多层微观结构共培养系统，模拟自然微生物生态系统的部分隔离 | 医学，环境，合成生物学 |
| 1238 | 2025-10-05 |
dTAT1: An Unnatural Nucleoside Exhibiting Low Photocytotoxicity for Genetic Code Expansion
2025-May-29, The journal of physical chemistry letters
IF:4.8Q1
DOI:10.1021/acs.jpclett.5c00763
PMID:40401918
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研究论文 | 本研究评估了非天然核苷dTAT1在紫外光下的光物理特性和细胞毒性，发现其具有较低的光细胞毒性 | 首次系统研究dTAT1在紫外光激发下的三重态特性和活性氧产生机制，揭示其相比dTPT3具有更短的三重态寿命和更低的光细胞毒性 | 研究主要聚焦于光细胞毒性评估，对dTAT1在其他生理条件下的长期安全性研究不足 | 评估dTAT1非天然核苷的光细胞毒性特性，为安全遗传密码扩展提供依据 | dTAT1非天然核苷及其与dNaM形成的非天然碱基对 | 合成生物学 | NA | 紫外光激发、活性氧检测、光物理特性分析 | NA | 光谱数据、细胞毒性数据、量子产率数据 | NA | 遗传密码扩展技术 | 细胞培养系统 | 非天然碱基对dTAT1-dNaM，用于遗传信息存储和检索扩展 | 医学, 生物技术 |
| 1239 | 2025-07-07 |
Diverse lineages and adaptations of oxygen-adapted hydrogenases
2025-May-27, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2025.04.006
PMID:40436686
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research paper | 本文探讨了微生物中适应氧气的镍铁氢化酶的多样性和适应性 | 揭示了镍铁氢化酶在含氧环境中通过多种独立进化策略抵御氧气抑制的机制 | 未提及具体实验数据或样本量来支持这些适应性机制的普遍性 | 研究微生物氢化酶在含氧环境中的适应机制和进化历程 | 细菌和古菌中的镍铁氢化酶 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1240 | 2025-10-05 |
Multi-Layer Autocatalytic Feedback Enables Integral Control Amidst Resource Competition and Across Scales
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00575
PMID:40116396
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研究论文 | 提出一种多层自催化反馈策略，解决资源竞争和上下文依赖耦合对积分反馈控制的限制 | 开发多层自催化控制器实现群体水平积分反馈和多细胞积分器，控制功能通过多细胞群体间的协调相互作用涌现 | NA | 设计能够在资源竞争环境下实现鲁棒适应的合成生物控制系统 | 自催化积分反馈控制器、多细胞群体、工程微生物生态系统 | 合成生物学 | NA | 多层反馈策略、数学建模 | 积分反馈控制器 | NA | NA | NA | 微生物 | 自催化积分反馈控制器、多层反馈、群体水平控制电路 | 工业生物技术 |