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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1201 | 2024-09-17 |
Development of a tightly regulated copper-inducible transient gene expression system in Nicotiana benthamiana incorporating a suicide exon and Cre recombinase
2024-Oct, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.20021
PMID:39081031
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研究论文 | 开发了一种在Nicotiana benthamiana中紧密调控的铜诱导瞬时基因表达系统,结合了自杀外显子和Cre重组酶 | 引入自杀外显子HyP5SM/OsL5和Cre/LoxP作为额外的调控元件,增强了铜诱导系统的紧密性 | 铜诱导系统在调控某些测试的超敏细胞死亡反应时不够紧密 | 开发一种在Nicotiana benthamiana中紧密调控的瞬时基因表达系统 | Nicotiana benthamiana中的瞬时基因表达调控 | 植物功能基因组学 | NA | Agrobacterium介导的瞬时表达 | NA | 基因表达 | 涉及多种富含亮氨酸重复序列的蛋白质及其匹配的无毒因子 |
1202 | 2024-09-17 |
Mining unique cysteine synthetases and computational study on thoroughly eliminating feedback inhibition through tunnel engineering
2024-Oct, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.5160
PMID:39275998
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研究论文 | 通过数据库挖掘和计算研究,开发了一种新的代谢途径,用于高效生产L-半胱氨酸,并通过隧道工程彻底消除反馈抑制 | 通过半理性设计和隧道分析策略,成功消除了L-半胱氨酸对酶的反馈抑制,并提高了酶的催化效率 | NA | 开发新的代谢途径,用于高效生产L-半胱氨酸,并消除反馈抑制 | L-半胱氨酸的生产酶O-磷酸丝氨酸硫氢酶(OPSS) | 合成生物学 | NA | 分子对接、分子动力学模拟、随机加速分子动力学模拟、伞形采样模拟 | NA | 蛋白质结构 | 一种来自Acetobacterium sp.的O-磷酸丝氨酸硫氢酶(AsOPSS)及其变体 |
1203 | 2024-09-17 |
Plants against cancer: towards green Taxol production through pathway discovery and metabolic engineering
2024-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-024-00170-8
PMID:39279861
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综述 | 本文综述了通过途径发现和代谢工程实现绿色紫杉醇生产的进展 | 利用高通量测序、基因组装配、基因合成、分析技术和合成生物学方法,高效识别和工程化酶及代谢途径,生产天然和新颖的药物候选物 | 植物来源药物开发的挑战包括获取和培育源物种、代谢物结构复杂性和普遍低丰度 | 加速药物发现并解决紧迫的人类健康问题 | 植物天然产物及其在抗癌药物紫杉醇生物合成中的应用 | 代谢工程 | 癌症 | 高通量测序、基因组装配、基因合成、分析技术、合成生物学 | NA | 基因组数据 | NA |
1204 | 2024-09-17 |
Genome Mining and Biological Engineering of Type III Borosins from Bacteria
2024-Aug-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179350
PMID:39273298
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研究论文 | 本文研究了细菌中III型硼素的基因挖掘和生物工程 | 首次在细菌中发现III型硼素,并验证了KchMA的自甲基化活性,展示了其在合成生物学中的巨大潜力 | NA | 探索III型硼素的来源和潜力 | III型硼素及其在细菌中的生物合成途径 | 生物工程 | NA | 基因挖掘、生物化学实验、商业蛋白酶和AI辅助的合理设计 | NA | NA | NA |
1205 | 2024-09-17 |
Foods of the Future: Challenges, Opportunities, Trends, and Expectations
2024-Aug-23, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods13172663
PMID:39272427
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综述 | 本文综述了未来食品的挑战、机遇、趋势和期望 | 本文提出了未来食品安全的策略,并讨论了功能性食品、新型食品、合成生物学和3D食品打印等有前景的食品系统 | 本文主要基于现有科学证据和数据进行综述,未涉及具体实验或模型 | 探讨未来食品系统的可持续性,提出解决食品安全、健康和环境问题的策略 | 未来可持续食品、替代蛋白质来源和新型高效的食品系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1206 | 2024-09-17 |
The Long Road to a Synthetic Self-Replicating Central Dogma
2023-04-04, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.3c00023
PMID:36944355
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研究论文 | 本文讨论了构建能够自我复制的生物化学系统的关键目标,并探讨了当前系统的局限性和改进方向 | 本文提出了设计自我复制合成细胞模型的潜在修改方案 | 当前系统的局限性主要在于其大分子组成以及这些大分子如何利用驱动RNA和蛋白质合成所需的小分子 | 构建能够自我复制的生物化学系统 | 细胞外系统及其大分子组成 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1207 | 2024-09-17 |
The diversity of substrates for plant respiration and how to optimize their use
2023-04-03, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiac599
PMID:36573332
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综述 | 本文综述了植物呼吸底物的多样性及其优化利用的潜力 | 提出通过引入植物线粒体中目前不存在的酶,使丝氨酸和乙酸盐成为植物的直接呼吸底物,并比较了不同呼吸底物的能量产量、细胞内可用性及其在细胞分解代谢中的完全或部分氧化情况 | 文中提到的许多线粒体载体和分解代谢途径尚未被识别,这阻碍了对植物呼吸底物的全面理解 | 探讨如何优化植物呼吸底物的利用以提高作物产量 | 植物呼吸底物及其在线粒体内的运输和分解代谢途径 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1208 | 2024-09-17 |
Rhodopsin driven microbial CO2 fixation using synthetic biology design
2023-01, Environmental microbiology
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/1462-2920.16243
PMID:36221243
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1209 | 2024-09-17 |
Synthetic cell research: Is technical progress leaving theoretical and epistemological investigations one step behind?
2023, Frontiers in robotics and AI
IF:2.9Q2
DOI:10.3389/frobt.2023.1143196
PMID:37033673
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研究论文 | 本文探讨了合成细胞研究中实验进展与理论和认识论研究之间的差距 | 强调了合成细胞在理论探索中的重要性,并提出了对相关理论问题的初步探讨 | 文章主要为理论探讨,缺乏具体的实验数据支持 | 探讨合成细胞研究中理论与实验进展之间的不平衡问题 | 合成细胞的理论基础、行为模式及其在科学研究中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1210 | 2024-09-17 |
Focus on biosensors: Looking through the lens of quantitative biology
2021, Quantitative plant biology
DOI:10.1017/qpb.2021.10
PMID:37077214
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研究论文 | 本文探讨了基因编码荧光生物传感器(GEFBs)在定量生物学中的应用及其对数学建模的影响 | 本文介绍了合成生物学在加速生物传感器开发方面的进展,以及同时表达光谱兼容的生物传感器以量化信号网络中多个节点的方法 | NA | 研究生物传感器在定量分子和分子事件中的应用,并探讨其对数学建模的促进作用 | 基因编码荧光生物传感器(GEFBs)及其在细胞和时间尺度上的测量 | 定量生物学 | NA | 基因编码荧光生物传感器(GEFBs) | NA | 图像 | NA |
1211 | 2024-09-17 |
Synthetic biology: tools to design, build, and optimize cellular processes
2010, Journal of biomedicine & biotechnology
DOI:10.1155/2010/130781
PMID:20150964
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综述 | 本文综述了合成生物学在设计、构建和优化细胞过程方面的工具和方法 | 本文提出了将合成生物学分为三个层次的框架,并探讨了在这些层次上控制细胞系统的努力 | 本文主要集中在综述现有进展,未涉及具体的实验数据或技术细节 | 探讨合成生物学在优化细胞过程方面的潜力和未来研究方向 | 细胞过程及其与环境的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1212 | 2024-09-17 |
Biology by design: from top to bottom and back
2010, Journal of biomedicine & biotechnology
DOI:10.1155/2010/232016
PMID:21052559
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中从“自下而上”和“自上而下”两个角度开发新型生物系统的概念模型 | 提出了一个结合“自下而上”和“自上而下”方法的概念模型,用于设计和构建新型生物系统 | 目前工程生物学仍依赖大量试错,缺乏将基本“部件”有效连接成高阶网络的有效方法 | 开发新型生物系统以满足社会紧迫需求 | 生物化学转化、细胞设备和治疗药物以及扩展生命化学的方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1213 | 2024-09-16 |
Complex Coacervate Materials as Artificial Cells
2023-Mar-24, Accounts of materials research
IF:14.0Q1
DOI:10.1021/accountsmr.2c00239
PMID:37009061
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研究论文 | 本文探讨了复杂凝聚物材料作为人工细胞的应用,并介绍了其在模拟真核细胞胞质方面的优势 | 复杂凝聚物材料能够最准确地模拟真核细胞胞质的拥挤、粘稠和高电荷特性,为人工细胞研究提供了理想平台 | 目前的人工细胞模型在模拟生命过程方面仍存在局限,如缺乏拥挤的内部环境或动态性质 | 研究人工细胞的构建及其在模拟细胞功能方面的应用 | 复杂凝聚物材料及其在人工细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1214 | 2024-09-16 |
The Application of Metagenomics to Study Microbial Communities and Develop Desirable Traits in Fermented Foods
2022-Oct-21, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods11203297
PMID:37431045
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综述 | 本文综述了宏基因组学在发酵食品中微生物群落研究及其在开发理想性状中的应用 | 本文介绍了宏基因组学在发酵食品研究中的广泛应用,并探讨了其与合成生物学技术的结合,以解决食品行业中大量废物产生的问题 | NA | 研究发酵食品中的微生物群落及其在生产过程中的作用 | 发酵食品中的微生物群落及其代谢产物 | 宏基因组学 | NA | 高通量测序(HTS) | NA | 序列数据 | NA |
1215 | 2024-09-15 |
The total biosynthesis route of rosmarinic acid in Sarcandra glabra based on transcriptome sequencing
2024-Oct, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2024.109016
PMID:39133982
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研究论文 | 本研究通过全长的转录组测序分析,揭示了Sarcandra glabra中迷迭香酸的完整生物合成途径 | 首次系统地揭示了Sarcandra glabra中迷迭香酸的完整生物合成途径,并鉴定了7种关键酶 | NA | 揭示Sarcandra glabra中迷迭香酸的生物合成机制 | Sarcandra glabra中的迷迭香酸生物合成途径及其关键酶 | NA | NA | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
1216 | 2024-09-15 |
Covalent recruitment of polymers and nanoparticles onto glycan-engineered cells enhances gene delivery during short exposure
2024-Sep-09, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc03666b
PMID:39263661
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研究论文 | 本文展示了通过在细胞表面精确工程化糖基,实现快速共价捕获聚合物/纳米颗粒复合物,从而在短时间内增强基因递送 | 通过细胞表面糖基的精确工程化,实现快速共价捕获聚合物/纳米颗粒复合物,显著加速基因递送过程 | NA | 研究通过细胞表面工程化增强非病毒基因递送效率的新方法 | 细胞表面糖基工程化、聚合物/纳米颗粒复合物、基因递送效率 | 合成生物学 | NA | 细胞表面工程化、聚合物/纳米颗粒复合物递送 | NA | 细胞、聚合物/纳米颗粒复合物 | NA |
1217 | 2024-09-15 |
Nucleated synthetic cells with genetically driven intercompartment communication
2024-Sep-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404790121
PMID:39186653
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研究论文 | 本文介绍了一种创建具有核样隔间的合成细胞的方法,这些隔间能够封装不同的生化混合物,并实现核与细胞质隔间之间的自主化学通信 | 本文首次实现了合成细胞中核样隔间与细胞质隔间之间的自主化学通信,并通过现场蛋白质表达膜蛋白来实现 | 本文未详细讨论该技术的实际应用和潜在风险 | 增强合成细胞的复杂性,实现隔间间的自主信号传递 | 合成细胞中的核样隔间与细胞质隔间 | 合成生物学 | NA | 现场蛋白质表达 | NA | 生化混合物 | NA |
1218 | 2024-09-15 |
Improvement and application of vacuum-infiltration system in tomato
2024-Sep, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae197
PMID:39257545
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研究论文 | 本文描述了一种改进的真空渗透系统在番茄果实和叶片中的应用 | 首次报道了在附着番茄果实中进行真空渗透,并成功应用于番茄生物技术研究 | NA | 提高番茄中瞬时表达系统的效率,并应用于番茄生物技术和合成生物学研究 | 番茄果实和叶片 | NA | NA | 真空渗透 | NA | NA | 涉及Micro-Tom番茄和商业品种'Emerald'及'Provence' |
1219 | 2024-09-15 |
Recent advances in producing food additive L-malate: Chassis, substrate, pathway, fermentation regulation and application
2023-04, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14206
PMID:36604311
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综述 | 本文综述了利用微生物方法生产食品添加剂L-苹果酸的最新进展,涵盖了微生物底盘、底物利用、合成途径、发酵调控和工业应用 | 本文强调了代谢工程策略和合成生物学工具的应用,结合对微生物生理学的深入理解,以提高工业L-苹果酸的生物合成 | NA | 探讨利用微生物方法实现环保且经济的L-苹果酸生物合成的可能性 | L-苹果酸的生物合成及其在工业中的应用 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
1220 | 2024-09-15 |
Improved production of class I lanthipeptides in Escherichia coli
2023-Mar-08, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d2sc06597e
PMID:36908960
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研究论文 | 本文报道了一种在Escherichia coli中异源表达I类羊毛硫肽的新系统 | 通过共表达产生生物的谷氨酰-tRNA合成酶(GluRS)和tRNA对,实现了完全脱水肽的生产,并展示了LanCL酶去除GSH加合物的功能 | NA | 提高I类羊毛硫肽在Escherichia coli中的生产效率 | I类羊毛硫肽及其相关酶 | 生物工程 | NA | 异源表达 | NA | NA | NA |